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Grupo 1 Capasso, Daro Nicols Bauelos, Carolina Paula Saracino, Mara Priscila Lell, Marianela

TRABAJO PRCTICO N2 Gentica de poblaciones con Populus


Evolucin. Departamento de Ecologa, Gentica y Evolucin, UBA, FCEN. POBLACIN QUE SE ENCUENTRA EN CONDICIONES DE HARDY-WEINBERG (HW).

Figura 1: Cambios en las frecuencias genotpicas a lo largo de las generaciones, para una frecuencia allica p=0,2.

Figura 2: Cambio en la frecuencia allica (p) a lo largo de las generaciones. En este caso, se simularon 6 frecuencias iniciales distintas.

Figura 3: p en funcin de la frecuencia allica (p).

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Figura 4:

w (fitness poblacional medio) en funcin de la frecuencia allica (p).

Para que la poblacin simulada se encuentre dentro de las condiciones de HW se deben ajustar los siguientes parmetros en el panel de control del Populus: 1.1) Las tres clases genotpicas deben tener el mismo fitness, dicho de otro modo WAA=WAa = Waa=1, en cuyo caso no estara actuando ninguna fuerza evolutiva sobre la poblacin; por lo tanto el coeficiente de seleccin (s) es s=0. En este modelo, las frecuencias genotpicas se mantienen constantes a lo largo de las generaciones en proporciones fr (AA)= p2, fr (Aa)= 2pq y la fr (aa)= q2. En estas simulaciones, se simularon 130 generaciones.

1.2) p representa la diferencia entre la frecuencia allica p de la generacin siguiente (t+1) y la frecuencia allica p de la generacin anterior (t). En una poblacin, bajo condiciones de HW, no actan fuerzas evolutivas, por lo tanto las frecuencias allicas se mantienen constantes de una generacin a la otra y en consecuencia p=0. 1.3) El fitness poblacional medio ( w ) es igual a 1 y es constante para todo p. Esto ocurre ya
que en dicha poblacin no actan fueras evolutivas y el fitness de las tres clases genotpicas es mximo e igual a 1, por lo tanto w =1. Las condiciones para que una poblacin se encuentre en condiciones de HW son:

Debe ocurrir panmixia (apareamiento aleatorio) No actan fuerzas evolutivas sobre la poblacin en estudio El tamao de la poblacin es infinito (o al menos suficientemente grande) La poblacin est aislada

SELECCIN SOBRE UN ALELO DELETREO CON DISTINTOS GRADOS DE DOMINANCIA En el modelo de seleccin contra un alelo recesivo los valores de fitness para las distintas clases genotpicas, (en donde acta un s=0,2 y el grado de dominancia del alelo a es mnimo, h=0) son los siguientes: Genotipos Fitness AA 1 Aa 1 aa 0,8

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Figura 5: Cambio de la frecuencia allica (p) en funcin del tiempo. El s (coeficiente de seleccin) utilizado fue de 0,2.

Figura 6: Cambios en las frecuencias genotpicas a lo largo de las generaciones para una poblacin en la que se seleccionan negativamente a los homocigotos recesivos con un s=0,2. La frecuencia p inicial de la cual parti la simulacin fue de 0,2.

Figura 7: p en funcin de la frecuencia allica (p), en una poblacin en la cual los homocigotos recesivos son seleccionados negativamente con un s=0,2.

Figura 8:

w (fitness poblacional medio) en funcin de la frecuencia allica (p), en una poblacin en la


cual los homocigotos recesivos son seleccionados negativamente con un s=0,2.

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Figura 9: Cambio en la frecuencia allica (p) a lo largo de las generaciones, en una poblacin en la cual los homocigotos recesivos son seleccionados negativamente con un s=0,2. En este caso, se simularon 6 frecuencias iniciales distintas.

En el caso de que el alelo a sea letal los valores de fitness del modelo son los siguientes:

Genotipos Fitness

AA 1

Aa 1

aa 0

El fitness relativo de la clase genotpica aa es nulo y h=0.

Figura 10: Cambio de la frecuencia allica (p) en funcin del tiempo. El s (coeficiente de seleccin) utilizado fue de 1.

Figura 11: Cambios en las frecuencias genotpicas a lo largo de las generaciones para una poblacin en la que se seleccionan negativamente a los homocigotos recesivos con un s=1.La frecuencia p inicial de la cual parti la simulacin fue de 0,2.

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Figura 12: p en funcin de la frecuencia allica (p), en una poblacin en la cual los homocigotos recesivos son seleccionados negativamente con un s=1.

Figura 13:

w (fitness poblacional medio) en funcin de la frecuencia allica (p), en una poblacin en


la cual los homocigotos recesivos son seleccionados negativamente con un s=1.

Figura 14: Cambios en las frecuencias genotpicas a lo largo de las generaciones para una poblacin en la que se seleccionan negativamente a los homocigotos recesivos con un s=1. La frecuencia p inicial de la cual parti la simulacin fue de 0,2. NO SERIAN FRECUENCIAS ALELICAS???

Para un alelo a letal, con h=1 y s=1, se obtienen los siguientes valores de fitness: Genotipos Fitness AA 1 Aa 0 aa 0

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Figura15: Cambio en la frecuencia allica (p) a lo largo de las generaciones. En este caso, se parti de una frecuencia inicial p=0,2.

Figura 16: Cambios en las frecuencias genotpicas a lo largo de las generaciones, para una frecuencia allica p=0,2.

Figura 17: p en funcin de la frecuencia allica (p).

Figura 18:

w (fitness poblacional medio) en funcin de la frecuencia allica (p), en una poblacin en


la cual s=1 y h=1.

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En el modelo, en el cual el grado de dominancia del alelo a no es mnimo (h0), por ejemplo h= 0,3 y s=0,2; se obtiene:

Genotipos Fitness

AA 1

Aa 0,06

aa 0,8

Figura 19: Cambio en la frecuencia allica (p) a lo largo de las generaciones. En este caso, se parti de una frecuencia inicial p=0,2.

Figura 20: p en funcin de la frecuencia allica (p).

Figura 21:

w (fitness poblacional medio) en funcin de la frecuencia allica (p), en una poblacin en la


cual s=0,2 y h=0,3.

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Figura 22: Cambios en las frecuencias genotpicas a lo largo de las generaciones, para una frecuencia allica p=0,2.

2.1) Para un alelo letal p es mximo en la primera generacin independientemente de h, ya que es donde ocurre la mayor mortandad de homocigotos recesivos aa. Luego, el alelo aa queda enmascarado en los heterocigotas, por lo que la disminucin del p es ms gradual. La pendiente de la curva p vs p representa la velocidad con la que se pierde el alelo a en la poblacin. 2.2) Para un alelo letal totalmente dominante el anlisis se reduce a una generacin por que en esa sola generacin se mueren todos los homocigotas recesivos y los heterocigotas.
2.3) Cuando h=0 y s<1, p=0 solo cuando p=0 p=1. Estos puntos se consideran como equilibrios triviales, por que el sistema alcanz un punto final en el cual no hay ms diversidad allica sobre la cual puede operar la seleccin natural. 2.4) Para que desaparezcan los homocigotas recesivos aa se necesitara que la seleccin operase con un s=1 y un h>0. La seleccin natural eliminara el alelo a con el tiempo por que no queda enmascarado en los heterocigotas. 2.5) Independientemente del valor de h y s, la poblacin tiende a perder el polimorfismo inicial, ya que si existen diferencias entre los fitness de las distintas clases genotpicas, el polimorfismo inicial se pierde a lo largo del tiempo si las condiciones de seleccin se mantienen.

HETEROSIS O VENTAJA DEL HETEROCIGOTA En el modelo general de heterosis seleccin a favor del heterocigota, la distribucin de los valores de fitness es: Genotipos Fitness AA 1-t Aa 1 aa 1-s

Si s=t=0.5, segn el modelo se obtiene:

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Si s=0,2 y t= 0,5, se obtiene:

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3.1) Cuando los homocigotas poseen el mismo fitness existen tres equilibrios distintos en la poblacin y el punto de equilibrio estable corresponde a p=0,5, ya que la seleccin tiende a maximizar el fitness medio poblacional. 3.2) El punto de equilibrio solo depende de los coeficientes de seleccin s y t. Los valores iniciales de la frecuencia allica p no influyen en el punto de equilibrio. 3.3) En el caso de que los homocigotos posean distinto fitness, la curva de p vs p tiene forma de una sinusoidal deformada, ya que la seleccin natural ve de modo diferencial a las clases genotpicas AA y aa. 3.4) La curva se torna mucho ms asimtrica cuanto mayor es la diferencia entre s y t. 3.5) El fitness medio mximo nunca alcanza 1, ya que la clase genotpica con un fitness de 1 son los heterocigotas, que al cruzarse dan origen a nuevos homocigotas y como el fitness de estos ltimos es menor a 1, el fitness medio poblacional nunca puede llegar a 1.

SELECCIN CONTRA LOS HETEROCIGOTAS

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Grupo 1 Capasso, Daro Nicols Bauelos, Carolina Paula Saracino, Mara Priscila Lell, Marianela En el modelo de seleccin contra los heterocigotos, los valores de fitness se distribuyen de la siguiente manera: Genotipos Fitness AA 1+t Aa 1 aa 1+s

Si t=s= 0.5, se obtiene:

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Grupo 1 Capasso, Daro Nicols Bauelos, Carolina Paula Saracino, Mara Priscila Lell, Marianela 4.1) i) Cuando los homocigotas tienen el mismo xito reproductivo, el punto de equilibrio p=0,5 es un punto de equilibrio inestable. Cualquier fluctuacin con respecto a dicho punto, terminar fijando uno u otro alelo en la poblacin. ii) Se cumple que las frecuencias genotpicas se estabilizan en P=R=0.25 y Q=0.5, solo si la frecuencia inicial es exactamente igual a p*=0.5.

iii) Se cumple que w f (p) es simtrico y mnimo cuando p*=0.5, y sus valores mximos son independientes del s escogido. 4.2) Cuando existe desventaja del heterocigota, en la poblacin se terminara fijando uno u otro alelo, esto depende de las frecuencias iniciales de los genotipos. NO DEPENDE DEL FITNESS DE CADA GENOTIPO??? 4.3) En todos los casos analizados bajo este modelo, el fitness medio poblacional mximo es siempre 1. Esto se debe a que en la poblacin slo permanece uno de los tipos de homocigotas, ya que los heterocigotas son barridos por la seleccin natural.

Ejercicio 5 12

Grupo 1 Capasso, Daro Nicols Bauelos, Carolina Paula Saracino, Mara Priscila Lell, Marianela Ambiente 1
genotipo nacimientos adultos Fitness absoluto Fitness relativo AA 160 90 0.09 0.2 AB 480 450 0.45 1 BB 360 300 0.3 0.67 TOTAL 1000 840

Ambiente 2
genotipo nacimientos adultos Fitness absoluto Fitness relativo AA 160 150 0.15 0.38 AB 480 400 0.4 1 BB 360 340 0.34 0.85 TOTAL 1000 890

PREGUNTA EL FITNESS ABSOLUTO NO SE CALCULA COMO EL N DE ADULTOS/NNACIMIENTOS ???? Ambiente 1 Frecuencia inicial del alelo A=p= 0,4; entonces q=1-p=0,6; que es la frecuencia inicial del alelo B. Ambiente 2 Frecuencia inicial del alelo A=p= 0,4; entonces q=1-p=0,6; que es la frecuencia inicial del alelo B. 2) Grficos para el ambiente 1

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Grficos para el ambiente 2

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Para el ambiente 1, la frecuencia de p disminuye en las primeras generaciones y luego se mantiene constante a lo largo del tiempo. El alelo A no desparecer de la poblacin por que se encuentra en los heterocigotas que poseen un fitness absoluto de 1 y cuando estos se cruzan dan origen a homocigotas de ambas clases. Debido a ello, el fitness medio poblacional mximo nunca llega al valor de 1, no se termina fijando ninguna variante allica y la poblacin mantiene el polimorfismo. Para el ambiente 2, ocurre una situacin similar a la del ambiente 1. La frecuencia de p disminuye drsticamente durante las primeras generaciones y luego se mantiene constante a lo largo del tiempo. Debido a ello, el fitness medio poblacional mximo nunca llega al valor de 1, no se termina fijando ninguna variante allica y la poblacin mantiene el polimorfismo.

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