PROTEMICA

Aluna: Patrcia Santos Barbosa Disciplina: Bioqumica 4

Introduo

Proteoma indica as protenas expressas em um genoma ou tecido. Enquanto o genoma representa a soma de todos os genes de um indivduo, o proteoma altera com o estado de desenvolvimento, do tecido ou mesmo sob as condies nas quais o indivduo se encontra. A anlise das protenas necessria, pois o estudo dos genes pelo sequenciamento deles no pode prever a estrutura dinmica das protenas, uma vez que ao nvel das protenas que muitos dos processos de uma clula ocorrem, onde processos de doenas inicialmente acontecem e aonde muitos frmacos atuam. Sendo assim, protemica o mtodo direto para identificar, quantificar e estudar as modificaes ps-traducionais das protenas em uma clula, tecido ou mesmo organismos. A protemica visa o estudo da estrutura, funo e o controle dos sistemas biolgicos pela anlise das vrias propriedades das protenas, incluindo tambm os estudos da identidade, quantidade, atividade e estrutura das protenas expressas por uma clula.

Metodologias

Os dados gerados por anlise protemica alcanam alguns objetivos: a) esclarece protenas envolvidas em rotas metablicas relacionadas aos diferentes processos celulares; b) identifica novos alvos farmacolgicos e marcadores biolgicos, relacionados doenas; c) identifica molculas bioativas a partir de extratos biolgicos naturais, levando ao desenvolvimento de novos frmacos; d) caracteriza respostas celulares ( drogas, doenas e mudanas ambientais). A eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida (2DE) em conjunto com a espectrometria de massa so as duas tecnologias mais usadas atualmente para anlise de proteoma. A primeira aplicada para separao, deteco e quantificao das protenas e a espectrometria de massa para identificao das protenas graas aos grandes avanos da bioinformtica. 1. Eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida (2DE)

A eletroforese consiste em separar, sob a influncia de um campo eltrico, molculas que possuem cargas. A velocidade de migrao depende de alguns fatores, como tamanho, forma e carga eltrica da molcula. A eletroforese bidimensional consiste em duas etapas bsicas: 1- Focalizao Isoeltrica (IEF); 2-Eletroforese desnaturante em gel de poliacrilamida (SDSPAGE). Na primeira etapa, as molculas migram sob a ao de um campo eltrico em um gel contendo um gradiente de pH. A migrao se interrompe ao atingirem seu ponto isoeltrico. aplicada a molculas que possam ser tanto positivamente ou negativamente carregadas (anfotricas). Na segunda etapa, as protenas separadas pela IEF so submetidas a uma eletroforese desnaturante em gel de poliacrilamida (SDS-PAGE), onde so separadas de acordo com suas massas moleculares. 2. Espectrometria de massa H vrias tcnicas para identificar uma protena, como por exemplo, o sequenciamento da protena atravs da degradao por Edman, sequenciamento qumico espectrometria de massa, entre outros. Uma das tcnicas mais utilizadas para a identificao das protenas a anlise do fingerprinting da massa precisa de um nmero de peptdeos derivados da mesma protena. Para tal, as protenas de interesse so recortadas do gel, so fragmentadas (obteno dos peptdeos), geralmente por digesto trptica, e os fragmentos so analisadas no espectrmetro de massa auxiliados por programas de informtica desenvolvidos por vrios grupos.

Concluso

A protemica utiliza-se de as ferramentas de estudo do genoma para identificar as protenas expressas, permitindo fazer estudos comparativos. Os mtodos para anlise do proteoma utilizam tcnicas de eletroforese, cromatografia e espectrometria de massa. Desse modo, a protemica representa uma forma de estudo de processos metablicos em sistemas vivos para melhor entender o funcionamento de uma clula ou tecido a nvel molecular.

Bibiografia

1. Ciero, L. D.; Bellato, C. M. Biotecnologia Cincia & Desenvolvimento - n 29 2. Silva, A. M. S.; Corra, G. C.; Reis, E. M. Sade & Ambiente em Revista, Duque de Caxias, v. 2, n. 2, p. 1-10, jul - dez 2007.