INSTITUTO JOSE MARTI

LICENCIATURA EN MEDICINA GENERAL

MATERIA

BIOQUIMICA
DOCENTE

ING. KATIA CARMONA CARDENAS

ACIDOS NUCLEICOS

ESTUDIANTE

MARCO ANTONIO GARCIA CHAVIRA

GRADO Y GRUPO

2 C

Composicin de los cidos nucleicos Son biopolmeros formados por unidades llamadas monmeros, que son los nucletidos. Los nucletidos estn formados por la unin de: a) Una pentosa, que puede ser la D-ribosa en el ARN; o la D-2- desoxirribosa en el ADN

b) Una base nitrogenada, que puede ser: - Prica, como la Guanina (G) y la Adenina (A) - Pirimidnica, como la Timina (T), Citosina (C) y Uracilo (U)

C) cido fosfrico, que en la cadena de cido nucleico une dos pentosas a travs de una unin fosfodiester. Esta unin se hace entre el C-3de la pentosa, con el C-5de la segunda.

NUCLESIDOS A la unin de una pentosa con una base nitrogenada se le llama nuclesido. Esta unin se hace mediante un enlace -glucosdico. - Si la pentosa es una ribosa, tenemos un ribonuclesido. Estos tienen como bases nitrogenadas la adenina, guanina, citosina y uracilo.

- Si la pentosa es un desoxirribosa, tenemos un desoxirribonuclesido. Estos tienen como bases nitrogenadas la adenina, citosina, guanina y timina.

El enlace -glucosdico se hace entre el a) C-1de la pentosa y el N-9 de la base prica, como la guanina y la adenina. b) C-1de la pentosa y el N-1 de la base primidnica, como la timina y citosina

Los cidos nucleicos estn formados, como ya se ha dicho anteriormente, por la polimerizacin de muchos nucletidos, los cuales se unen de la siguiente manera: 3pentosa-5-fosfato---3-pentosa-5fosfato-----

Cada molcula tiene una orientacin definida, por lo que la cadena es 5-> 3.

Atendiendo a su estructura y composicin existen dos tipos de cidos nucleicos que son: a) cido desoxirribonucleico o ADN o DNA b) cido ribonucleico o ARN o RNA A.- ESTRUCTURA ADN. Est formado por la unin de muchos desoxirribonucletidos. La mayora de las molculas de ADN poseen dos cadenas antiparalelas ( una 5-3y la otra 3-5) unidas entre s mediante las bases nitrogenadas, por medio de puentes de hidrgeno.

La adenina enlaza con la timina, mediante dos puentes de hidrgeno, mientras que la citosina enlaza con la guanina, mediante tres puentes de hidrgeno. El ADN es el portador de la informacin gentica, se puede decir por tanto, que los genes estn compuestos por ADN. ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ADN Se trata de la secuencia de desoxirribonucletidos de una de las cadenas. La informacin gentica est contenida en el orden exacto de los nucletidos.

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el almacenamiento de la informacin gentica y el mecanismo de duplicacin del ADN. Fue postulada por Watson y Crick, basandose en: - La difraccin de rayos X que haban realizado Franklin y Wilkins

- La equivalencia de bases de Chargaff, que dice que la suma de adeninas ms guaninas es igual a la suma de timinas ms citosinas.

Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas cadenas son complementarias, pues la adenina de una se une a la timina de la otra, y la guanina de una a la citosina de la otra. Ambas cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3de una se enfrenta al extremo 5de la otra. Existen tres modelos de ADN. El ADN de tipo B es el ms abundante y es el descubierto por Watson y Crick. ESTRUCTURA TERCIARIA DEL ADN. Se refiere a como se almacena el ADN en un volumen reducido. Vara segn se trate de organismos procariontes o eucariontes: a) En procariontes se pliega como una super-hlice en forma, generalmente, circular y asociada a una pequea cantidad de proteinas. Lo mismo ocurre en la mitocondrias y en los plastos.

b) En eucariontes el empaquetamiento ha de ser ms complejo y compacto y para esto necesita la presencia de proteinas, como son las histonas y otras de naturaleza no histona (en los espermatozoides las proteinas son las protaminas). A esta unin de ADN y protenas se conoce como cromatina, en la cual se distinguen diferentes niveles de organizacin: - Nucleosoma - Collar de perlas - Fibra cromatnica

- Bucles radiales - Cromosoma. B.- DESNATURALIZACIN DEL ADN. Cuando la temperatura alcanza el punto de fusin del ADN, la agitacin trmica es capaz de separar las dos hebras y producir una desnaturalizacin. Este es un proceso reversible, ya que al bajar la temperatura se puede producir una renaturalizacin. En este proceso se rompen los puentes de hidrgeno que unen las cadenas y se produce la separacin de las mismas, pero no se rompen los enlaces fosfodiester covalentes que forman la secuencia de la cadena. La desnaturalizacin del ADN puede ocurrir, tambin, por variaciones en el pH.

Al enfriar lentamente puede renaturalizarse.

A.- ESTRUCTURA ARN Est formado por la unin de muchos ribonucletidos, los cuales se unen entre ellos mediante enlaces fosfodiester en sentido 5-3( igual que en el ADN ). Estn formados por una sola cadena, a excepcin del ARN bicatenario de los reovirus. ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ARN Al igual que el ADN, se refiere a la secuencia de las bases nitrogenadas que constituyen sus nucletidos.

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ARN Alguna vez, en una misma cadena, existen regiones con secuencias complementarias capaces de aparearse.

ESTRUCTURA TERCIARIA DE ARN Es un plegamiento, complicado, sobre al estructura secundaria.

B.- CLASIFICACIN DE LOS ARN. Para clasificarlos se adopta la masa molecular media de sus cadenas, cuyo valor se deduce de la velocidad de sedimentacin. La masa molecular y por tanto sus dimensiones se miden en svedberg (S). Segn esto tenemos: ARN MENSAJERO (ARNm) Sus caractersticas son la siguientes: - Cadenas de largo tamao con estructura primaria. - Se le llama mensajero porque transporta la informacin necesaria para la sntesis proteica. - Cada ARNm tiene informacin para sintetizar una proteina determinada. - Su vida media es corta. a) En procariontes el extremo 5posee un grupo trifosfato b) En eucariontes en el extremo 5posee un grupo metil-guanosina unido al trifosfato, y el el extremo 3posee una cola de poli-A

En los eucariontes se puede distinguir tambin: - Exones, secuencias de bases que codifican protenas - Intrones, secuencias sin informacin. Un ARNm de este tipo ha de madurar (eliminacin de intrones) antes de hacerse funcional. Antes de madurar, el ARNm recibe el nombre de ARN heterogeneonuclear (ARNhn ). ARN RIBOSMICO (ARNr) Sus principales caractersticas son: - Cada ARNr presenta cadena de diferente tamao, con estructura secundaria y terciaria. - Forma parte de las subunidades ribosmicas cuando se une con muchas proteinas. - Estn vinculados con la sntesis de proteinas.

ARN NUCLEOLAR (ARNn) Sus caractersticas principales son: - Se sintetiza en el nucleolo. - Posee una masa molecular de 45 S, que actua como recursor de parte del ARN r, concretamente de los ARNr 28 S (de la subunidad mayor), los ARNr 5,8 S (de la subunidad mayor) y los ARNr 18 S (de la subunidad menor) ARNu Sus principales caractersticas son: - Son molculas de pequeo tamao - Se les denomina de esta manera por poseer mucho uracilo en su composicin - Se asocia a proteinas del ncleo y forma ribonucleoproteinas pequeo nucleares (RNP pn) que intervienen en: a) Corte y empalme de ARN b) Maduracin en los ARNm de los eucariontes c) Obtencin de ARNr a partir de ARNn 45 S. ARN TRANSFERENTE (ARNt) Sus principales caractersticas son. - Son molculas de pequeo tamao - Poseen en algunas zonas estructura secundaria, lo que va hacer que en las zonas donde no hay bases complementarias adquieran un aspecto de bucles, como una hoja de trebol. - Los plegamientos se llegan a hacer tan complejos que adquieren una estructura terciaria - Su misin es unir aminocidos y transportarlos hasta el ARNm para sintetizar protenas.

El lugar exacto para colocarse en el ARNm lo hace gracias a tres bases, a cuyo conjunto se llaman anticodn (las complementarias en el ARNm se llaman codn). C.- SNTESIS Y LOCALIZACIN DE LOS ARN En la clula eucarionte los ARN se sintetizan gracias a tres tipos de enzimas: - ARN polimerasa I, localizada en el nucleolo y se encarga de la sinteis de los ARN r 18 S, 5,8 S y 28 S. - ARN polimerasa II, localizada en el nucleoplasma y se encarga de la sntesis de los ARN hn, es decir de los precursores de los ARNm - ARN polimerasa III, localizada en el nucleoplasma y se encarga de sintetizar los ARN r 5 S y los ARNm. Entre las principales funciones de estos cidos tenemos: - Duplicacin del ADN - Expresin del mensaje gentico - Transcripcin del ADN para formar ARNm y otros - Traduccin, en los ribosomas, del mensaje contenido en el ARNm a protenas.

NUCLESIDOS Y NUCLETIDOS Los nuclesidos son las molculas resultantes de la unin de una base nitrogenada y una pentosa. La unin se realiza mediante un enlace N-glucosdico que se establece entre el C1 de la pentosa y un nitrgeno de la base (el N1 si es pirimidnica y el N9 si es prica) con la prdida de una molcula de agua. Se nombran aadiendo al nombre de la base la terminacin osina si es una base prica, por ejemplo la adenosina, o la terminacin idina si se trata de una base pirimidnica, por ejemplo la citidina. Si la pentosa es la desoxirribosa, se aade el prefijo desoxi-; por ejemplo, desoxiadenosina o desoxicitidina.

Los nucletidos son los steres fosfricos de los nuclesidos. Se forman por unin de un nuclesido con una molcula de cido fosfrico en forma de in fosfato (PO43-), que le confiere un carcter fuertemente cido al compuesto. El enlace ster se produce entre el grupo alcohol del carbono 5 de la pentosa y el cido fosforico. Se nombra como el nuclesido del que proceden eliminando la a final y aadiendo la terminacin 5-fosfato, o bien monofosfato; por ejemplo, adenosn-5-fosfato o adenosn-5-monofosfato (AMP).

FUNCIONES DE LOS CIDOS NUCLEICOS En 1953, James Watson y Francis Crick, descubrieron la estructura tridimensional de uno de estos cidos, concretamente del cido desoxirribonucleico (ADN). Posteriormente se describi como se produca la duplicacin, transcripcin y traduccin.

Duplicacin del ADN La vida de los seres vivos es muy variable, por tanto para que esta no se extinga ha de haber un momento en se reproduzcan, lo cual lleva implcito la formacin de copias del ADN del progenitor o progenitores . Se dieron muchas hiptesis sobre como se duplicaba el ADN hasta que Watson y Crick propusieron la hiptesis semiconservativa (posteriormente demostrada por Meselson Y Stahl en 1957), segn la cual, las nuevas molculas de ADN formadas a partir de otra antigua, tienen una hebra antigua y otra nueva.

MECANISMO DE DUPLICACIN DEL ADN EN PROCARIONTES

Hay que recordar que es circular y ocurre en tres etapas: 1 etapa: desenrrollamiento y apertura de la doble hlice.en el punto ori-c. Intervienen un grupo de enzimas y proteinas, a cuyo conjunto se denomina replisoma * Primero: intervienen las helicasas que facilitan en desenrrollamiento * Segundo: actuan las girasas y topoisomerasas que eliminan la tensin generada por la torsin en el desenrrollamiento. * Tercero: Actuan las proteinas SSBP que se unen a las hebras molde para que no vuelva a enrollarse.

2 etapa. sntesis de dos nuevas hebras de ADN. * Actuan las ADN polimerasas para sintetizar las nuevas hebras en sentido 5-3, ya que la lectura se hace en el sentido 3-5. * Intervienen las ADN polimerass I y III, que se encargan de la replicacin y correccin de errores. La que lleva la mayor parte del trabajo es la ADN polimerasa III * Actua la ADN polimerasa II, corrigiendo daos causados por agentes fsicos. La cadena 3-5es leida por la ADN polimerasa III sin ningn tipo de problemas ( cadena conductora). En la cadena 5-3 no puede ser leida directamente, esto se soluciona leyendo pequeos fragmentos ( fragmentos de Okazaki ) que crecen en el sentido 5-3y que ms tarde se unen . Esta es la hebra retardada,llamada de esta forma porque su sntesis es ms lenta.

La ADN polimerasa III es incapaz de iniciar la sntesis por s sola, para esto necesita un cebador (ARN) que es sintetizado por una ARN polimerasa (=primasa). Este cebador es eliminado posteriormente. 3 etapa: correccin de errrores. El enzima principal que actua como comadrona (R. Shapiro) es la ADN polimerasa III, que corrige todos los errores cometidos en la replicacin o duplicacin. Intervienen otros enzimas como: * Endonucleasas que cortan el segmento erroneo. * ADN polimerasas I que rellenan correctamente el hueco. * ADN ligasas que unen los extremos corregidos

DUPLICACIN DEL ADN EN EUCARIONTES Es similar a la de los procariontes, es decir, semiconservativa y bidireccional. Existe una hebra conductora y una hebra retardada con fragmentos de Okazaki. Se inicia en la burbujas de replicacin (puede haber unas 100 a la vez)

Intervienen enzimas similares a los que actuan en las clulas procariontes y otros enzimas que han de duplicar las histonas que forman parte de los nucleosomas. Los nucleosomas viejos permanecen en la hebra conductora.

Expresin del mensaje gentico. Transcripcin La informacin contenida en la secuencia de nucletidos del ADN poda generar proteinas; sin embargo el ADN est en el ncleo y las proteinas se sintetizan en los ribosomas, los cuales estn situados en el citoplasma. El intermediario result ser un ARNm. Las etapas del proceso son:

TRANSCRIPCIN EN PROCARIONTES. En ella podemos distinguir las siguientes fases: a) Iniciacin: la ARN polimerasa se une a un cofactor que permite su unin a una regin del ADN llamada promotor, la cual posee una secuenciaa TATAAT TTGACA.

b) Elongacin: la ARN polimerasa recorre la hebra de ADN hacia su extremo 5 sintetizando una hebra de ARNm en direccin 5-3 c) Finalizacin: presenta dos variantes. En una interviene un cofactor "p" y en otra no interviene dicho cofactor. El proceso fiinaliza al llegar a una secuencia rica en G y C (zona llamada operador). El ADN vuelve a su forma normal y el ARNm queda libre. d) Maduracin: si lo que se forma es un ARNm no hay maduracin, pero si se trata de un ARNt o ARNr hay procesos de corte y empalme.

TRANSCRIPCIN EN EUCARIONTES Hay que tener en cuenta dos cosas: - Existen tres tipos de ARN polimerasa I, II y III. - Los genes estn fragmentados en zonas sin sentido o intrones y zonas con sentido o exones. Antes ha de madurar y eliminar los intrones.

- Desempaquetamiento de las histonas. En la trascripcin de eucariontes se distinguen las siguientes fases: a) Iniciacin: la ARN polimerasa II se une a una zona del ADN llamada promotor (posee secuencias CAAT y TATA) b) Elongacin: la sntesis continua en sentido 5-3. Al poco se aade una caperuza (metilguanosn trifosfato) al extremo 5. c) Finalizacin: parece que est relacionado con la secuencia TTATTT. Ahora interviene un poli-A polimerasa que aade una cola de poli-A al pre-ARNm (ARNhn). d) Maduracin: se produce en el ncleo y la hace un enzima llamada RNPpn, que elimina los nuevos intrones (I) formados. Posteriormente las ARN ligasas empalman los exones (E) y forman el ARNm.

El cdigo gentico

El cdigo gentico viene a ser como un diccionario que establece una equivalencia entre las bases nitrogenadas del ARN y el leguaje de las protenas, establecido por los aminocidos. Despus de muchos estudios (1955 Severo Ochoa y Grumberg; 1961 M.Nirenberg y H. Mattaei) se comprob que a cada aminocido la corresponden tres bases nitrogenadas o tripletes (61 tripletes codifican aminocidos y tres tripletes carecen de sentido e indican terminacin de mensaje).

El cdigo gentico tiene una serie de caractersticas: - Es universal, pues lo utilizan casi todos los seres vivos conocidos. Solo existen algunas excepciones en unos pocos tripletes en bacterias. - No es ambigo, pues cada triplete tiene su propio significado

- Todos los tripletes tienen sentido, bien codifican un aminocido o bien indican terminacin de lectura. - Est degenerado, pues hay varios tripletes para un mismo aminocido, es decir hay codones sinnimos. - Carece de solapamiento, es decir los tripletes no comparten bases nitrogenadas. - Es unidireccional, pues los tripletes se leen en el sentido 5-3. Traduccin o sntesis de protenas Tiene lugar en los ribosomas, de una forma muy similar en procariontes y eucariontes. Comprende las siguientes etapas: a) Iniciacin. Comienza por el triplete iniciador del ARNm (AUG), que est prximo a la caperuza 5'. Este triplete va precedido de la secuencia AGGAGG (secuencia de ShineDalgarno ) que es la zona de unin con el ribosoma. Se forma el complejo de iniciacin con los factores de iniciacin (FI) y la energa suministrada por el GTP, la subunidad menor del ribosoma reconoce la caperuza y se une al ARNm en la zona proxima al triplete o codn iniciador. Esta caperuza aporta el ARNt iniciador que a su vez aporta el aminocido metionina. Este ARNtcontiene un triplete complementario al AUG, es decir el UAC, llamado anticodn (la protena sintetizada contiene en su extremo el aminocido metionina) Una vez encajado el ARNt-metionina, se liberan los FI y dejan paso a la subunidad mayor del ribosoma, formandose as el ribosoma completo y funcional. En l hay dos sitios claves: - Sitio P (sitio peptidil) ocupado por el ARNt-metionina - Sitio A (sitio aminoacil) que est libre para recibir un segundo ARN t (slo el que su anticodn coincida con el del codn del ARNm) cargado con un nuevo aminocido.

b) Elongacin de la cadena peptdica: es un proceso catalizado por el enzima peptidil transferasa, el cual, mediante enlaces peptdicos va uniendo aminocidos a la cadena peptdica. Cada vez que llega un aminocido ocurre un proceso cclico de elongacion.

c) Fin de la sntesis de la cadena peptdica: ocurre cuando aparece uno de los codones de terminacin ( UAA,UAG,UGA ). En este momento un factor proteico de terminacin (RF) se une al codn de terminacin e impide que algn ARNt con otro aminocido (ARNtaminoacil) se aloje en el sitio A. En este momento se produce la hidrlisis de la cadena peptdica y se separan las dos subunidades del ribosoma.

BIBLIOGRAFIA. BIOQUIMICA ILUSTRADA, Campbell Anthony BIOQUIMICA, Antonio Pea BIQUIMICA MEDICA, Jhon W. Baynes