Biologa

Introduccin al Curso

Qu tanta biologa necesita un Ingeniero?

El entrenamiento para desarrollar la capacidad de identificar las necesidades de la ingeniera en la generacin de nuevas tecnologas basadas en el uso de los principios biolgicos. El entrenamiento para facilitar la lectura y comprensin de informacin proveniente de disciplinas distintas a la ingeniera. La comprensin bsica de los principios biolgicos en trminos de las diferentes escalas de la organizacin biolgica, desde el mbito celular pasando por el ser humano hasta el nivel del ecosistema. Familiarizarse con el lenguaje de la biologa. Conocer las herramientas de investigacin en la bsqueda de la informacin biolgica.

Mdulo 1
El diseo de la vida y sus implicaciones en la ingeniera

El vocablo Biologa

l termino Biologa se deriva de las voces griegas Bios = vida y Logos = tratado. Da nombre a la disciplina cientfica que se ocupa de los organismos vivos, animales vegetales, cualquiera que sea su categora taxonmica: desde el ms pequeo solo visible por el microscopio electrnico como los fagos hasta los ms grandes como los animales y las plantas en general. La biologa estudia la forma y las funciones de los organismos vivos y las interacciones de cada uno de ellos con los otros y con el ambiente que los rodea.

La teora Celular

En trminos funcionales la estructura independiente ms pequea que desempea las funciones de la vida es la Clula.

Cul es el alcance de la biologa?

Son mltiples los campos de estudio de la biologa entre ellos pueden citarse algunos a manera de ejemplo: los detalles ntimos del cerebro humano, el funcionamiento de los sistemas reproductores de los organismos, la composicin de los genes.

Bioingeniera

Tendencia actual que surge en las dos ltimas dcadas con un gran impulso, es la interfase entre los sistemas biolgicos y la ingeniera

Tema 1.1 La lgica celular y molecular de la vida.

Introduccin

Perspectivas de la biologa en la ingeniera

La frontera artificial entre la biologa y la ingeniera gradualmente se deshace y por ende, sus lmites se expanden traslapndose y fusionndose para dar origen a la bioingeniera. Esta disciplina tuvo su origen, principalmente, en las aplicaciones mdicas, sin embargo su horizonte es cada vez ms amplio comprendiendo ahora mltiples mbitos de la tecnologa.

Un ejemplo: Biomineralizacin

Entre ellos un ejemplo muy ilustrativo es la aplicacin de los principios biolgicos en la minera. La biomineralizacin es un proceso natural llevado a cabo por los organismos vivos para producir distintos minerales con el fin de endurecer o robustecer diferentes tejidos finos.

Biomineralizacin

En la actualidad una gran diversidad de organismos contina produciendo esqueletos mineralizados con una historia que data desde hace 550 millones de aos. Otros ejemplos incluyen los depsitos de cobre, hierro y de oro que involucran a organismos ms simples, las bacterias. Consecuentemente la biomineralizacin de ser un proceso biolgico natural, es ahora utilizada como una nueva herramienta tecnolgica

Estromatolitos

Biofilme

Agregacin compleja de microorganismos (bacterias) en una matriz adherente y protectora, que al crecer sobre un substrato mineral absorber distintos materiales del mismo.

Biomimtica (biomimicry)

Los procesos y las estructuras de los organismos vivos que actualmente son utilizados en diversas aplicaciones tecnolgicas, forman los pilares para una nueva disciplina que emerge de la frontera entre la ingeniera y la biologa

El origen del velcro

Arctium lappa

Ganchos del velcro

Binica

Es la aplicacin de los principios de los sistemas biolgicos a modelos ingenieriles con el fin de crear dispositivos especficos.

Subtema 1.1.1 Los niveles de organizacin de la vida y la diversidad.

Organizacin de la vida

Todas las formas vivas muestran una organizacin en compartimientos y con base en un ordenamiento. Todos los procesos y las estructuras biolgicas estn dispuestos en categoras o niveles, que se expresan de acuerdo a su complejidad formando un espectro biolgico o de vida.

Espectro biolgico o Niveles de organizacin de la vida

Biomoleculas, Subunidades celulares u organelos, La clula, Los tejidos, Los rganos, Los sistemas, El individuo, Las poblaciones (especie), La comunidad, El ecosistema, La biosfera.

Diversidad biolgica

Los complejos patrones de organizacin de la vida permiten la diferenciacin de la misma como una caracterstica ms, expresndose en una multiplicidad de formas vivas

Diversidad biolgica

Alfa diversidad

Beta diversidad

Gamma diversidad

Taxonoma

Sistemas que identifican y clasifican a los organismos agrupndolos en categoras. Sistema Taxonmico general:

Dominio, Reino, Filo, Clase, Orden, Familia, Gnero y Especie.

Categora: Dominio

Tres grupos:

Dominio Bacteria, Dominio Archea Dominio Eucaria.

Dominios: Bacteria y Archea

Estn compuestos por organismos unicelulares con muy pocas estructuras internas. Una de las caractersticas principales de dichos organismos es la ausencia de membrana nuclear, ambos dominios son llamados Procariontes.

Dominio: Eucaria

Amplia gama de organismos unicelulares a pluricelulares cuyas clulas poseen una estructura celular ms compleja y su ncleo s presenta una membrana nuclear que los separa del citoplasma, estos organismos son llamados Eucariontes. 4 grupos o reinos principales llamados: reino Protista, reino Animalia, reino, Fungi, reino Plantae.

Reino: Protista

Todos los eucariontes unicelulares (excepto las levaduras las cuales son reconocidas en el reino Fungi) y tambin de las algas multicelulares.

Reino: Plantae

Todos los organismos que tienen pared celular de celulosa y que obtienen su energa por fotosntesis.

Reino: Fungi

Los organismos tienen clulas con paredes de quitina y obtienen su energa por medio de la liberacin de enzimas digestivas hacia el medio externo reabsorbiendo los productos de la digestin y las secreciones.

Reino: Animalia

Organismos cuyas clulas no poseen pared celular y obtienen su energa por ingestin de otros organismos que luego digieren internamente.

Subtema 1.1.2 La dimensin celular: caractersticas estructurales de la clula y sus aplicaciones en ingeniera.

Teora Celular

La clula, es el nivel de organizacin de la vida que representa a la unidad ms pequea que puede expresarse completa e independientemente como un ser vivo. El concepto de la teora celular se ha modernizado:

Principios de la Teora Celular

Los seres vivos estn formados por clulas. La clula es la unidad anatmica de la materia viva y una clula puede ser suficiente para constituir un organismo. La vida se encuentra estructurada en complejos patrones de organizacin, agrupndose en niveles que permiten la diferenciacin. Todos los organismos responden a estmulos del ambiente expresando una sensibilidad. Las funciones vitales de los organismos ocurren dentro de las clulas, o en su entorno inmediato, controladas por sustancias que ellas secretan y estn basadas en el uso de energa, la suma de la energa qumica utilizada es llamada metabolismo. La clula es capaz de mantener condiciones internas estables mediante mecanismos de homeostasis. Todas las clulas proceden de clulas preexistentes, por divisin de stas (Omnis cellula e cellula).La clula contiene la informacin hereditaria para el control del funcionamiento y para la transmisin de la informacin a las siguientes generaciones permitiendo su reproduccin y el crecimiento. Todos los organismos interactan con otros organismos y con el ambiente en forma que influyen en su sobre vivencia y en consecuencia los organismos son capaces de adaptarse y evolucionar.

Tamao de las Clulas

La mayora de las clulas son relativamente pequeas y una de las principales razones es la difusin de las substancias hacia dentro y fuera de las mismas. La tasa de difusin es afectada por un gran nmero de variables que incluyen la disponibilidad del rea superficial, la temperatura, el gradiente de concentracin de las substancias y la distancia.

Procariontes (Bacterias)

Son los organismos ms simples y como ya se apunt sus clulas son pequeas, con el citoplasma rodeado por una membrana plasmtica y contenidos en una pared celular rgida, sin compartimientos interiores de tal manera que las reacciones no estn compartamentalizadas y el ADN, las enzimas y otros constituyentes celulares tienen acceso a todas las partes de la clula operando como una unidad simple.

Pared celular

Constituida de un peptidoglicano, compuesto de una matriz de carbohidratos con uniones de pequeas unidades de polipptidos. La clase Mollicutas, comnmente llamadas micoplasmas, es la excepcin con respecto a la presencia de pared celular,

Clasificacin de las bacterias

Dos grupos basados en las diferencias de las propiedades de la pared celular detectadas por el procedimiento de la tincin de Gram

Las bacterias Gram positivas: tienen una capa simple y gruesa de peptidoglicano en la pared celular que retiene el tinte violeta en la tincin de gram, causando que las clulas teidas aparezcan de color morado (azul a violeta). Las bacterias Gram negativas, son aquellas que han evolucionado a una pared celular de multicapas que no retiene el tinte violeta (color rojizo a rosado).

Importancia de las bacterias

Importancia industrial y econmica de las bacterias es sumamente amplia y comprende desde aplicaciones biotecnolgicas como los procesos de fermentacin en la elaboracin de cerveza, panificacin, quesos, mantequillas, etanol, acetona, cidos orgnicos, enzimas, sntesis de vitaminas, perfumes, productos farmacuticos y agroqumicos, biogs, extraccin de productos mineros, entre muchos otros, hasta procesos de bioremediacin ambiental y en el control biolgico de plagas.

Ejemplos

Acetona

Eucariontes

Las clulas eucariticas son ms complejas que las procariticas y el sello distintivo es la compartamentalizacin, el cual es desarrollado por un extenso sistema de membranas. Este sistema de membranas forma los conocidos organelos en los cuales pueden llevarse de manera simultnea e independiente numerosos procesos bioqumicos. Todas las clulas eucariticas estn soportadas por un andamiaje interno de protenas, el Citoesqueleto.

Ncleo

El organelo ms grande y ms fcilmente visible de la clula eucaritica es el Ncleo, regularmente se localiza hacia el centro de la clula y es el centro de informacin de la misma

Componentes del ncleo

Lugar donde se lleva a cabo la sntesis del ARN ribosomal. Dos membranas dobles de fosfolpidos separan al ncleo del citoplasma. El ADN, responsable de la informacin hereditaria contenido en filamentos lineales llamados Cromosomas, Junto con protenas asociadas conforman la estructura llamada Cromatina empacados con las protenas llamadas Histonas, las cuales envuelven al ADN formando los Nucleosomas, parecidos a las cuentas de un collar.

Nucleolo

Por otra parte, antes de que las clulas realicen la sntesis de protenas, primero deben construir un gran nmero de Ribosomas. Cientos de copias de genes que codifican al ARN ribosomal son colocados en paquetes en el cromosoma facilitando la formacin de los mismos y sta tarea se realiza en la regin llamad Nuclolo.

Ribosomas

Los ensamblajes moleculares ms complejos de la clula. Cada ribosoma est compuesto de dos subunidades y cada subunidad est compuesta de una combinacin de ARN ribosomal y protenas y las subunidades se unen slo hasta que se inicia la sntesis de protenas. El proceso de sntesis de protenas es muy complejo y requiere de distintas formas de ARN: ARN mensajero, ARN de transferencia. Los ribosomas se encuentran en forma libre en el citoplasma y tambin formando parte del sistema de membranas internas.

Sistema de membranas

El sistema de membranas internas es el responsable de la formacin de compartimientos en la clula. La estructura ms grande de membranas internas es llamada Retculo Endoplasmico. Su composicin es lpido-proteica. Cada membrana del retculo endoplasmico tiene una superficie de cara al citosol y otra de cara al interior de la cavidad. El retculo endoplasmico puede ser liso o rugoso en funcin de la cantidad de ribosomas sobre su superficie.

Sntesis de protenas

En los ribosomas tiene lugar la sntesis de protenas y los ribosomas adheridos al RER depositan las cadenas polipeptdicas recientemente sintetizadas en el espacio interior del retculo. En el retculo endoplasmico liso probablemente se lleve a cabo la sntesis de otras molculas tales como grasas, fosfolpidos, y esteroides, y tambin puede originar las membranas que componen al aparato de Golgi.

Aparato de Golgi

Apilamiento de sacos planos y alargados rodeados por membranas. El Aparato de Golgi funciona en la recoleccin, empacado y distribucin de molculas sintetizadas en un sitio y utilizadas en otro sitio de la clula.

Lisosomas

Algunas de las vesculas formadas en el aparato de Golgi permanecen en el interior de la clula en forma de Lisosomas. Estas contienen gran cantidad de enzimas digestivas con capacidad para catalizar el rpido desdoblamiento de protenas, carbohidratos, cidos nucleicos y lpidos. En las clulas eucariticas los lisosomas inducen la digestin de los organelos viejos reciclando los componentes moleculares.

Vacuolas

Otras estructuras derivadas del sistema de membranas son las Vacuolas. El ejemplo ms conspicuo es la gran vacuola central de las clulas de las plantas, la funcin particular de esta, es mantener el equilibrio osmtico (agua) o tonicidad de la clula.

Mitocondrias

Tienen forma esfrica o de bastn, constituidas por dos membranas: una externa lisa y una interna plegada con numerosas capas llamadas Crestas. Las crestas presentan dos compartimientos: el espacio intermembranas, entre las dos membranas mitocondriales y la matriz, formada por la cavidad de la membrana interna. Sobre la superficie de la membrana interna y embebida en ella estn las protenas que realizan el metabolismo oxidativo, donde la energa de las macromolculas es usada para producir ATP.

Cloroplastos

Las clulas de las plantas contienen de unos cuantos a cientos de Cloroplastos. Estos contienen la Clorofila. Estn formados por una doble membrana y son ms grandes y complejos que las mitocondrias. Sus compartimientos formados por la membrana interna estn cerrados y son llamados Grana. Las membranas en forma de disco que constituyen a los grana son denominados Tilacoides y en su superficie est la clorofila. Los tilacoides estn rodeados por una matriz, el Estroma con las enzimas utilizadas en la sntesis de la glucosa durante la fotosntesis.