Gentica

Dr. Ricardo Guzmn Aburto Residente 3er ao de psiquiatra.

 La variacin en el nmero de copias (CNV) se define como el segmento de ADN igual o mayor de 1 kb cuyo nmero de copias es variable si se compara con un genoma de referencia. Hasta 2004 se pensaba que la variacin en el genoma, incluyendo inserciones, deleciones, inversiones, translocaciones estaba asociada a enfermedades y que los SNPs (polimorfismo de un solo nucletido) eran la mayor fuente de variacin gentica entre individuos. Sin embargo, ese mismo ao se public el primer mapa genmico con variacin del nmero de copias en individuos sanos.

 Actualmente hay indicios de que las CNV aparecen no solo a lo largo del genoma de humanos, sino tambin en primates, roedores, moscas, perros, pollos y vacas. Aun as, salvo en humanos y ratones, poco se sabe sobre cmo las CNV contribuyen a la variacin fenotpica y susceptibilidad a las enfermedades. Para averiguarlo, se pueden usar diversas tcnicas, destacando la hibridacin genmica comparada (CGH)

 Scherer,et.al de la genetista de la Universidad de Toronto, buscaron las CNVs utilizando tecnicas de barrido del genoma basadas en microarreglos que son capaces de encontrar cambios que tienen una longitud de al menos 1.000 bases (nucleotidos). Encontraron un promedio de 70 CNVs con un tamano promedio de 250.000 nucleotidos en cada muestra de ADN En total, el grupo identifico 1.447 CNVs distintas que de forma colectiva cubrian cerca del 12 por ciento del genoma humano y del seis al 19 por ciento de cualquier cromosoma -mucho mas diseminado de lo que se pensaba antes-.

 El descubrimiento de tan grande variacin de ADN le da un enfoque completamente nuevo al estudio de enfermedades genticas.

La mayora de la investigacin se ha centrado en alteraciones pequenas, llamadas polimorfismos de un solo nucleotido (SNPs, por sus siglas en ingles).

 Las diferencias del genoma consisten en variaciones de 1400 regiones que son variables. Entre dos personas puede haber hay de promedio unas 100 regiones del genoma que son distintas en el numero de copias. Corresponde a 20 millones de letras del alfabeto del genoma, que comparado con el numero total de letras del genoma que tiene 3200 millones. si tomamos la totalidad de estas regiones abarcara unas 360 millones de letras, entre las 270 personas o sea un 12 % del genoma y eso es lo que diferencia a toda la poblacin humana a nivel global.

Mutaciones
En gentica se denomina mutacin gentica, mutacin molecular o mutacin puntual a los cambios que alteran la secuencia de nucletidos del ADN. No confundir con una mutacin gnica que se refiere a una mutacin dentro de un gen.

Estas mutaciones en la secuencia de ADN pueden llevar a la sustitucin de aminocidos en las protenas resultantes. Un cambio en un solo aminocido puede no ser importante si es conservativo y ocurre fuera del sitio activo de la protena.

 Mutacin por sustitucin de bases: Se producen al cambiar en una posicin un par de bases por otro (son las bases nitrogenadas las que distinguen los nucletidos de una cadena). Distinguimos dos tipos que se producen por diferentes mecanismos bioqumicos:
Mutaciones transicionales o simplemente transiciones, cuando un par de bases es sustituido por su alternativa del mismo tipo.

 Mutaciones transversionales o transversiones, cuando un par de bases es sustituida por otra del otro tipo.
Por ejemplo, la sustitucin del par AT por TA o por CG.

Mutaciones de corrimiento , cuando se aaden o se quitan pares de nucletidos alterndose la longitud de la cadena.
Si se aaden o quitan pares en un nmero que no sea mltiplo de tres (es decir si no se trata de un nmero exacto de codones), las consecuencias son especialmente graves, porque a partir de ese punto, y no slo en l, toda la informacin queda alterada. Hay dos casos:

 Mutacin por prdida o delecin de nucletidos: En la secuencia de nucletidos se pierde uno y la cadena se acorta en una unidad.

Mutacin por insercin de nuevos nucletidos: Dentro de la secuencia del ADN se introducen nucletidos adicionales, interpuestos entre los que ya haba, alargndose correspondientemente la cadena. Mutaciones en los sitios de corte y empalme (Splicing)

ADN codificante
La informacin gentica de un genoma est contenida en los genes, y al conjunto de toda la informacin que corresponde a un organismo se le denomina su genotipo. Un gen es una unidad de herencia y es una regin de ADN que influye en una caracterstica particular de un organismo (como el color de los ojos, por ejemplo). Los genes contienen un "marco de lectura abierto" (open reading frame) que puede transcribirse, adems de secuencias reguladoras, tales como promotores y enhancers, que controlan la transcripcin del marco de lectura abierto.

ADN no codificante.
El ADN del genoma de un organismo puede dividirse conceptualmente en dos:
el que codifica las protenas (los genes) el que no codifica.

En muchas especies, slo una pequea fraccin del genoma codifica protenas. Por ejemplo, slo alrededor del 1,5% del genoma humano consiste en exones que codifican protenas (20.000 a 25.000 genes), mientras que ms del 90% consiste en ADN no codificante

 El ADN no codificante (tambin denominado ADN basura o junk DNA) corresponde a secuencias del genoma que no generan una protena (procedentes de transposiciones, duplicaciones, translocaciones y recombinaciones de virus, etc.), incluyendo los intrones.

 Hasta hace poco tiempo se pensaba que el ADN no codificante no tena utilidad alguna, pero estudios recientes indican que eso es inexacto.

Entre otras funciones, se postula que el llamado "ADN basura" regula la expresin diferencial de los genes.

 La presencia de tanto ADN no codificante en genomas eucariticos y las diferencias en tamao del genoma entre especies representan un misterio que es conocido como el enigma del valor de C. Recientemente, un grupo de investigadores de la Universidad de Yale ha descubierto una secuencia de ADN no codificante que sera la responsable de que los seres humanos hayan desarrollado la capacidad de agarrar y/o manipular objetos o herramientas.

 Por otro lado, algunas secuencias de ADN desempean un papel estructural en los cromosomas: los telmeros y centrmeros contienen pocos o ningn gen codificante de protenas, pero son importantes para estabilizar la estructura de los cromosomas. Algunos genes no codifican protenas, pero s se transcriben en ARN: ARN ribosmico, ARN de transferencia y ARN de interferencia (ARNi, que son ARN que bloquean la expresin de genes especficos)

 . La estructura de intrones y exones de algunos genes (como los de inmunoglobulinas y protocadherinas) son importantes por permitir los cortes y empalmes alternativos del pre-ARN mensajero que hacen posible la sntesis de diferentes protenas a partir de un mismo gen (sin esta capacidad no existira el sistema inmune, por ejemplo).

 Algunas secuencias de ADN no codificante representan pseudogenes que tienen valor evolutivo, ya que permiten la creacin de nuevos genes con nuevas funciones. Otros ADN no codificantes proceden de la duplicacin de pequeas regiones del ADN; esto tiene mucha utilidad, ya que el rastreo de estas secuencias repetitivas permite estudios de filogenia.

Traduccin Gentica
La traduccin es el segundo proceso de la sntesis proteica (parte del proceso general de la expresin gnica). La traduccin ocurre tanto en el citoplasma, donde se encuentran los ribosomas, como tambin en el retculo endoplasmtico rugoso (RER). Los ribosomas estn formados por una subunidad pequea y una grande que rodean al ARNm. En la traduccin, el ARN mensajero se decodifica para producir un polipptido especfico de acuerdo con las reglas especificadas por el cdigo gentico.

 Es el proceso que convierte una secuencia de ARNm en una cadena de aminocidos para formar una protena.

Es necesario que la traduccin venga precedida de un proceso de transcripcin.

El proceso de traduccin tiene cuatro fases:
Activacin iniciacin Elongacin terminacin

 En la activacin, el aminocido (AA) correcto se une al ARN de transferencia (ARNt) correcto. Aunque tcnicamente esto no es un paso de la traduccin, es necesario para que se produzca la traduccin. El AA se une por su grupo carboxilo con el OH 3' del ARNt mediante un enlace de tipo ster. Cuando el ARNt est enlazado con un aminocido, se dice que est "cargado".

 La iniciacin supone que la subunidad pequea del ribosoma se enlaza con el extremo 5' del ARNm con la ayuda de factores de iniciacin (FI), otras protenas que asisten el proceso. La elongacin ocurre cuando el siguiente aminoacilARNt (el ARNt cargado) de la secuencia se enlaza con el ribosoma adems de con un GTP y un factor de elongacin.

 La terminacin del polipptido sucede cuando la zona A del ribosoma se encuentra con un codn de parada (sin sentido), que son el UAA, UAG o UGA.

Cuando esto sucede, ningn ARNt puede reconocerlo, pero el factor de liberacin puede reconocer los codones sin sentido y provoca la liberacin de la cadena polipeptdica.