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ESTUDIO DE LA BIODIVERSIDAD
Blg Rmulo Loayza Aguilar Chimbote, junio 2011
escalas
biogeogrfica
pas
regin medir la heterogeneidad numero de especies abundancia poblacional ecosistemas
ecosistemas y comunidades
establecer patrones
diversidad gentica
diversidad de versiones de los genes (alelos) y de su distribucin, base de las variaciones interindividuales (genotipos)
funcin
mantener un reservorio de condiciones -de variacin- de respuesta al medio, que permita la adaptacin y la supervivencia
Brachionus caudatus
B. caudatus personatus
B. caudatus apsteini
la variacin heredable es la materia prima de la evolucin y la seleccin natural y, por tanto, constituye en ltima instancia el fundamento de toda la biodiversidad observable actualmente
la diversidad gentica depende de la historia evolutiva de la especie, del nivel de endocra de la poblacin, de su aislamiento reproductivo y de la seleccin natural a favor o en contra de la heterosis, etc.
la diversidad gentica surge en el mbito molecular, ntimamente ligada a los cidos nucleicos
morfometra
mtodos inmunolgicos
diversidad especfica
la variedad de especies existentes en una regin
diversidad de la
macrofauna acutica
las zonas con menores variaciones estacionales suelen ser ms ricas que aquellas con estaciones muy marcadas
las zonas con topografa variada mantienen ms especies que las uniformes
componentes alfa, beta y gamma de la biodiversidad de escarabajos copro-necrfagos en un paisaje integrado por tres comunidades
si solo se dispusiera de fondos para proteger una cordillera, debera elegirse la 2: mayor diversidad total
si solo se dispusiera de fondos para proteger una montaa, debera elegirse una de la regin 1: mayor diversidad local
Semana octava
diversidad alfa
playa 1 R
playa 2
R B
A
N D K C H E
A
D E C H F
playa 1
= 11
IF
playa 2
=7
(1)
diversidad alfa
(2)
es la forma ms sencilla de medir la biodiversidad la forma ideal de medir S haciendo un inventario completo del nmero total de especies (S)
cualitativo y cuantitativo
comunidades
la riqueza especfica aumenta con la complejidad estructural del hbitat (praderas, desiertos, reas pelgicas, tienen menor riqueza especfica que comunidades complejas como los bosques)
existe correlacin entre la productividad y la riqueza especifica a lo largo de algunos gradientes de latitud y altitud, pero esta relacin no es lineal, pues algunos de los ecosistemas mas productivos: e.g.: estuarios presentan baja riqueza especfica
la riqueza especfica de muchos taxa est correlacionada con la estructura de las comunidades vegetales
la predacin puede aumentar la riqueza especfica si los predadores consumieran a las especies dominantes por el contrario puede limitar la riqueza especifica si impiden que las especies vulnerables se instalen o mantengan
especies
Balanus peruvianus
playa 1 ni
84
playa 2 ni
48
Perumytilus purpuratus
Thais chocolata Fissurella crassa Littorina peruviana Crepidula sp. Bursa sp. Lithophaga sp. Semimitylus algosus Nassarius sp. Cthamalus sp. Nmero total de individuos (N) Numero total de especies (S)
265
4 5 50 8 10 9 35 8 15 493 11
62
1 3 0 0 2 58 56 0 0 230 7
ndices
a. Riqueza de especies (S)
nmero total de especies obtenido por un censo de la comunidad imposible contar todas las especies las estimaciones se basan en muestras: cuadrantes, transeptos, trampas, dragados, estaciones fotogrficas
para las playas 1 y 2 (tabla 1), la riqueza especfica ( puntual) de la fauna macrobentonica es 11 y 7 especies, respectivamente
promedio = media de valores puntuales correspondientes a distintos lugares del mismo tipo
de comunidad dentro de un paisaje
prom = (i=1...nai) / n
11 + 7 2
DMg =
S = nmero de especies N = nmero total de individuos de la muestra
DMg
7 1 ln (230) 5,44
DMg
valores inferiores a 2,0 son considerados como zonas de baja biodiversidad y valores cercanos a 5,0 son considerados como indicativos de alta biodiversidad
Dm =
S = nmero de especies N = nmero total de individuos de la muestra
S N
ndice
playa 1
playa 2
11 Dm 493 0,495
230
0,461
Dm
d. ndice de Gleason
DG =
S = nmero de especies N = nmero total de individuos de la muestra
S log N
ndice
playa 1 11 2,693
DG
DG
4,085
grupo taxonmico
densidad (ind. m-2) estacin 1 10 10 10 estacin 2 15 15 15 estacin 3 20 20 20 estacin 4 30 30 30 estacin 5 50 50 0 estacin 6 100 0 0
F. crassa
L. peruviana Crepidula sp. Bursa sp. Lithophaga sp. S. algosus Nassarius sp. S N DMg Dm DG
10
10 10 10 10 10 10 10 100 1,95 1,00 5,00
15
15 15 5 5 0 0 8 100 1,52 0,80 4,00
20
10 10 0 0 0 0 6 100 1,09 0,60 3,00
10
0 0 0 0 0 0 4 100 0,65 0,40 2,00
0
0 0 0 0 0 0 2 100 0,22 0,20 1,00
0
0 0 0 0 0 0 1 100 0 0,1 0,5
A: todas excepto 1 especie son raras B: todas las especies son comunes Diversidad riqueza diversidad = riqueza + equitabilidad
Semana novena
2 estructura
a. modelos paramtricos
asociar aspectos especficos: estructura y funcin, como nichos ecolgicos y estadios sucesionales
realizar comparaciones objetivas entre diferentes comunidades o para una misma comunidad en diferentes tiempos
la comunidad cuenta con una cantidad total finita de un recurso limitante la abundancia de cada especie es proporcional a la fraccin del recurso que puede utilizar u ocupar cada especie utiliza una fraccin K de los recursos disponibles
BS: broken stick GS: geometric series LN: log-normal LS: log series
agregada
aleatoria
implica la ausencia total de interacciones entre los individuos y con el medio
uniforme
es el resultado de interacciones negativas entre los miembros de la poblacin, tales como la competencia o el comportamiento agresivo intraespecfico indica la presencia de interacciones entre los individuos, o entre los individuos y el medio: interacciones sociales, como la organizacin para la bsqueda del alimento o la crianza; el modo reproductivo predominante en la poblacin; comportamientos defensivos, o aprovechamiento de parches de alta calidad y despoblamiento de zonas pobres
para que la probabilidad de encontrar un individuo sea la misma en todo los puntos del espacio, es necesario que todo este espacio ofrezca las mismas condiciones
la presencia de un individuo no debe afectar la presencia de otro, es decir, los individuos no deben presentar ningn tipo de atraccin o segregacin
100
80 60 40 20 0
la biodiversidad no depende slo de la riqueza de especies sino tambin de la dominancia relativa de cada una de ellas
100
abundancia relativa (%)
80 60 40 20 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
playa 1 playa 2
10
especies
cuanto mayor es el grado de dominancia de algunas especies y de rareza de las dems, menor es la biodiversidad de la comunidad
10 11
especies
especies raras son aquellas que se encuentran en nmero suficientemente bajo y representan un problema de conservacin, y en algunos casos, pueden encontrarse amenazadas de extincin
especies
playa 1 ni %
17,0 53,8 0,8 1,0 10,1 1,6 2,0
playa 2 ni
48 62 1 3 0 0 2
%
20,9 27,0 eje Y: abundancia relativa
elaborar figura
84 265 4 5 50 8 10
100
80 60 40 20 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
playa 1 playa 2
9 35
8 15 493 11
1,8 7,1
1,6 3,0 100
58 56
0 0 230 7
25,2 24,3
0,0 0,0 100
10
11
especies
eje X: especies en orden de importancia
100
100
80 60 40 20 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 especies
80 60 40 20 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 especies
mxima equidad
100
80 60 40 20 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 especies
equidad moderada
100
100
80 60 40 20 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 especies
80 60 40 20 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 especies
mxima dominancia
100
completa dominancia
80
75%
60 40
20
no dominancia
25%
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 especies
especies
ni
P. purpuratus B. peruvianus L. peruviana S. algosus Cthamalus sp. Bursa sp. Lithophaga sp. 265 84 50 35 15 10 9
playa 1
ab. rel.
53,8 17,0 10,1 7,1 3,0 2,0 1,8
especies
ab. acu.
100,0 46,0 29,0 18,9 11,8 8,8 6,8 P. purpuratus Lithophaga sp. S. algosus B. peruvianus F. crassa Bursa sp. T. chocolata L. peruviana Crepidula sp. Nassarius sp.
playa 2 ni
62 58 56 48 3 2 1 0 0 0 ab. rel. 27,0 25,2 24,3 20,9 1,3 0,9 0,4 0,0 0,0 0,0 ab. acu. 100,0 73,0 47,8 23,5 2,6 1,3 0,4 0,0 0,0 0,0
Crepidula sp.
Nassarius sp. F. crassa T. chocolata N S
8
8 5 4 493
1,6
1,6 1,0 0,8 100 11
5,0
3,4 1,8 0,8
Cthamalus sp.
N S
0
230
0,0
100 7
0,0
100
playa 1 playa 2
80 60 40 20 0 1 2 3 4 5 6 especies 7 8 9 10 11
escala logartmica
ind. m-2
84
265 4 5 50 8 10 9 35 8 15 493 11
g m-2
89,3
124,5 11,2 4,3 25,7 5,6 11,6 25,8 56,1 6,4 25,7 386,2 P. purpuratus B. peruvianus L. peruviana
especies
ind. m-2
265 84 50
g m-2
124,5 89,3 25,7
S. algosus
Cthamalus sp. Bursa sp. Lithophaga sp. Crepidula sp. Nassarius sp. F. crassa T. chocolata
35
15 10 9 8 8 5 4
7,1
3,0 2,0 1,8 1,6 1,6 1,0 0,8
18,9
11,8 8,8 6,8 5,0 3,4 1,8 0,8
56,1
25,7 11,6 25,8 5,6 6,4 4,3 11,2
14,5
6,7 3,0 6,7 1,5 1,7 1,1 2,9
38,1
23,6 16,9 13,9 7,2 5,7 4,0 2,9
100
numero biomasa
80 60 40 20 0
1 2 3 4 5 6 e spe c i e s 7 8 9 1 11
100 80 60 40 20 0 1
numero biomasa
100 80 60 40 20 0
numero biomasa
5 6 7 especies
10
11
10
11
especies
comunidad no perturbada
b. modelos no paramtricos
a. Chao 1 a2 2b
hace un ajuste de las especies que se pueden esperar, dada la cantidad de especies raras presentes en los individuos censados, haciendo una relacin entre el numero de especies encontradas y el numero de especies representadas por uno o dos individuos (singleton y doubleton
Chao 1 = S
a ndices de dominancia
S = pi
es la probabilidad de que dos individuos tomados al azar de una muestra sean de la misma especie
S =
ni(ni 1)
N (N - 1)
es un ndice estructural de dominancia pudindose calcular la diversidad como 1-S
playa 2
7 230
48 x 47 + 62 x 61 + 1 x 0 + 3 x 2 + + 0 x 0 230 x 229
0,334 0,495
0,236
grupo taxonmico
Estacin 2 15 15
Estacin 3 31 31
Estacin 4 1 1
Estacin 5 0 0
10 10
Thais chocolata
Fissurella crassa Littorina peruviana Crepidula sp. Bursa sp. Lithophaga sp. Semimitylus algosus Nassarius sp.
10
10 10 10 10 10 10 10
15
15 15 5 5 5 5 5
31
1 1 1 1 1 1 1
1
1 1 1 1 1 1 91
0
0 0 0 0 0 0 100
0,0909
0,1162
0,282
0,827
1,000
se basa en la teora de las probabilidades: cules son las probabilidades de que dos ejemplares seleccionados al azar en una comunidad correspondan a la misma especie?
valores de S
Nmax
un incremento en el valor de este ndice se interpreta como un aumento en la dominancia y una disminucin de la equidad
256
S 493
62 230
mxima dominancia = 1
0,5192
0,2696
mxima equitatividad
grupo taxonmico
Estacin 2 15 15
Estacin 3 31 31
Estacin 4 1 1
Estacin 5 0 0
10 10
Thais chocolata
Fissurella crassa Littorina peruviana Crepidula sp. Bursa sp. Lithophaga sp. Semimitylus algosus Nassarius sp.
10
10 10 10 10 10 10 10
15
15 15 5 5 5 5 5
31
1 1 1 1 1 1 1
1
1 1 1 1 1 1 91
0
0 0 0 0 0 0 100
0,1
0,15
0,31
0,91
(N U)
(N N)
493 285,62
D 493 - 493
0,44
grupo taxonmico
Estacin 2 15 15
Estacin 3 31 31
Estacin 4 1 1
Estacin 5 0 0
10 10
Thais chocolata
Fissurella crassa Littorina peruviana Crepidula sp. Bursa sp. Lithophaga sp. Semimitylus algosus Nassarius sp.
10
10 10 10 10 10 10 10
15
15 15 5 5 5 5 5
31
1 1 1 1 1 1 1
1
1 1 1 1 1 1 91
0
0 0 0 0 0 0 100
0,75975
0,71827
0,51379
0,09945
H' = diversidad (bits ind.-1) S = nmero de especies pi = proporcin del nmero de individuos de la especie i con respecto al total (ni/N)
H entre cero (una sola especie) y el log S (todas las especies representadas por el mismo nmero de individuos)
frmula resumida de H
H =
C N
base logaritmo 2
valores para transformacin de H en diferentes unidades
e 10
cualidades de H
a mayor S, mayor H a mayor uniformidad, mayor H
el valor mximo de la H se obtiene cuando todas las especies tienen la misma frecuencia, mientras que el mnimo es de observarse cuando todas las especies estn representadas por un solo individuo
Grupo taxonmico
Balanus peruvianus
Perumytilus purpuratus Thais chocolata
20
20 20 20 20 5 100
Hmax = log2 S
Hmax=
log 5 log2 5
Hmax=
Valores de Shannon-Weiner (H) bits ind.-1 >3 2-3 > 1,31 0,88 - 1,30 bel nat > 0,91 0,61 - 0,90 decit
1-2
<1
0,44 - 0,87
< 0,43
0,31 - 0,60
< 0,30
perturbacin severa
perturbacin critica
Especies
Balanus peruvianus Perumytilus purpuratus Thais chocolata Fissurella crassa Littorina peruviana Crepidula sp. Bursa sp.
ni
84 265 4 5 50 8 10
log ni
1,9243 2,4232 0,6021 0,6990 1,6990 0,9031 1,0000
ni log ni
161,6395 642,1602 2,4082 3,4949 84,9485 7,2247 10,0000
Lithophaga sp.
Semimitylus algosus Nassarius sp. Cthamalus sp.
9
35 8 15
0,9542
1,5441 0,9031 1,1761
8,5882
54,0424 7,2247 17,6414
493
999,3727
H =
C N
H =
combina de manera mas lgica el numero de especies y la distribucin de los organismos dentro de cada especie
asume que todos los individuos de la muestra al azar proceden de una poblacin infinitamente grane
b2 ndice de Pielou
H Hmax
mide la proporcin de la diversidad observada con relacin a la mxima diversidad esperada
J =
J =
J = 0,6392
J = 63,92 %
Grupo taxonmico Balanus peruvianus Perumytilus purpuratus Thais chocolata Fissurella crassa Littorina peruviana S N
H =
C N
H =
Hmax =
2,321928
es til cuando toda la poblacin ha sido censada o cuando la aleatoriedad de la muestra no puede garantizarse (e.g.: cuando las especies son atradas diferencialmente al objeto de captura
HB =
especies
a b c d e S=5
ln N! - ln ni!
N
nmero individuos
5 5 5 5 5 N = 25
su valor es menor al del ndice de ShannonWiener porque no hay incertidumbre: describe una coleccin conocida
ln ni !
4,79 4,79 4,79 4,79 4,79
HB = HB =
ln 25! - ln 5!
25
1,362 bel nat
= 23,95
base logaritmo 2
e
10
2,302585
1
bel nat
decit
formula general
HB =
1 N
logb
HB =
C N
base logaritmo
2 e 10
unidades
bits ind.-1 bel nat decit
E =
HBmax =
1 N
log N!
([N / S])s - r ([N / S] + 1)r!
r = N S(N/S)
ni
84
log ni !
Perumytilus purpuratus
Thais chocolata Fissurella crassa Littorina peruviana Crepidula sp.
265
4 5 50 8 10 9 35 8 15 1,3802 2,0792 64,4831 4,6055 6,5598 5,5598 40,0142 4,6055 12,1165
HB =
Bursa sp. Lithophaga sp. Semimitylus algosus Nassarius sp. Cthamalus sp.
493
HB =
3,321928 493
E =
HB
HBmax
HBmax =
1 N
log N!
([N / S])s - r ([N / S] + 1)r!
r = 493 11 x 45 r = 21690
Semana decima
Diversidad beta
mide el grado de particin del ambiente en parches o mosaicos biolgicos, es decir, mide la contigidad de hbitat diferentes en el espacio, o en el tiempo
cambio de composicin entre hbitat, entre comunidades o a lo largo de algn gradiente ambiental
= / prom
especies que se ganan o se pierden a lo largo de un gradiente
mide la diferencia entre reas de estudio en trminos de la variedad de especies que contienen
b abcdef d
e f
a b fabcde c d f b d a abcdef f c e
e Regin 1
c b
d
a abcdefc e
prom 6 6 nulo
junto con la diversidad alfa constituyen una medida del grado de heterogeneidad biolgica en el rea de estudio
abcdef a e
e fabcde
Regin 2
abcdef c
abcdef b
prom
2 6 alta
cuantitativos
Sorensen Morisita-Horn
Diversidad
ndices de reemplazo de especies
Complementaridad
12 sp.
18 sp.
6 especies comunes
tipos
disimilaridad binarios (cualitativo): presencia/ausencia
6 sp.
6 sp.
12 sp.
similaridad