Qumica Orgnica

Edio Paula Yurkanis Bruice 4a

Captulo 23
Aminocidos, peptdeos e protenas

Irene Lee Case Western Reserve University Cleveland, OH 2004, Prentice Hall

 Peptdeos e protenas so polmeros de aminocidos unidos por ligaes amida.

Aminocidos de cadeia aliftica

O +H3N CH H C O+H 3N CH CH 3 O C O-

glicina
O
O

alanina
O

+H 3N
+H 3N CH CH CH 3 C CH 3 O-

CH CH 2 CH CH 3

O-

+H 3N

CH CH

C CH 3

O-

CH 3

CH 2 CH 3

valina

leucina

isoleucina

Aminocidos que contm hidroxila

O +H 3N CH CH 2 OH C O+H 3N CH CH CH 3 O C OH O-

serina

treonina
O

Aminocidos que contm enxofre

O

+H 3N
+H 3N CH CH 2 SH C O-

CH CH 2 CH 2 S

O-

cistena

CH 3

metionina

Aminocidos cidos
O +H 3N CH CH 2 C OO C O-

O +H 3N CH CH 2 CH 2 C OO C O-

cido asprtico

cido glutmico
O

Amidas de aminocidos cidos

O +H 3N CH CH 2 C NH 2 O C O+H 3N CH CH 2 CH 2 C NH 2 O C O-

asparagina

glutamina

Aminocidos bsicos
O +H 3N CH CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 NH 3+ C O+H 3N CH CH 2 CH 2 CH 2 NH C NH 2 NH 2+ O C O-

lisina

arginina

Aminocidos que contm um benzeno

O +H 3N CH CH 2 C O+H 3N CH CH 2

O C O-

OH

fenilalanina

tirosina

Aminocidos heterocclicos
O +H 3N CH CH 2 C O-

O C O-

O +H 3N CH CH 2 C O-

+H 2N
N NH

HN

prolina

histidina

triptofano

Configurao de aminocidos

Propriedades cido-base de aminocidos

Um aminocido nunca pode existir como uma substncia no carregada.

 Alguns aminocidos tm hidrognios ionizveis em suas cadeias laterais.

 O ponto isoeltrico (pI) de um aminocido o pH no qual no h carga lquida.

 O pI de um aminocido que tem uma cadeia lateral ionizvel a mdia dos valores de pKa dos grupos similarmente ionizantes.

 Uma mistura de aminocidos pode ser separada por eletroforese com base em seus valores de pI.

Ninhidrina usada para detectar aminocidos individuais.

 Uma mistura de aminocidos pode tambm ser separada com base em suas polaridades.

 Cromatografia de troca inica pode ser usada para fazer a separao preparativa de aminocidos.

Resinas carregadas negativamente se ligam seletivamente a aminocidos carregados positivamente.

Cromatografia de troca inica

Ctions ligam-se mais fortemente a resinas de troca catinica. nions ligam-se mais fortemente a resinas de troca aninica. Um analisador de aminocidos um instrumento que automatiza a cromatografia de troca inica.

Resoluo de misturas racmicas de aminocidos

Formao de um peptdeo

Ligao peptdica

Formao de ligaes dissulfeto

Dissulfetos podem ser reduzidos a tiis.

 A ponte dissulfeto contribui para a forma global de uma protena.

 Uma vez que aminocidos tm dois grupos funcionais, surge um problema quando se tenta fazer uma determinada ligao peptdica.

Estratgia de sntese de uma ligao peptdica especfica

 Aminocidos podem ser adicionados extremidade Cterminal crescente pela repetio destas duas etapas.

 Quando o nmero desejado de aminocidos tiver sido adicionado cadeia, o grupo protetor no aminocido Nterminal removido.

Uma estratgia melhorada de sntese de peptdeos

 A primeira etapa na determinao da seqncia de aminocidos, em um peptdeo ou uma protena, reduzir quaisquer ligaes dissulfeto.

 A prxima etapa determinar o nmero e tipos de aminocidos no peptdeo ou na protena.

protena

HCl 6 N

aminocidos

100C 24 h

 O aminocido N-terminal de um peptdeo ou protena pode tambm ser determinado pela degradao de Edman.

 Um determinado PTH-aminocido pode ser identificado por cromatografia usando padres conhecidos.

 O aminocido C-terminal do peptdeo ou da protena pode ser identificado pelo tratamento da protena com a carboxi-peptidase.

 O brometo de cianognio hidrolisa a ligao amida no lado C de um resduo de metionina.

Estrutura secundria de protenas

A estrutura secundria descreve a conformao dos segmentos do esqueleto da cadeia peptdica ou protica. Trs fatores determinam a escolha da estrutura secundria:

Planaridade regional ao redor de cada ligao peptdica.

Maximizao do nmero de grupos peptdicos que participam na ligao hidrognio. Separao adequada entre grupos R muito prximos.

 A -hlice estabilizada por ligaes hidrognio.

Prolinas so hlices quebradoras.

Dois tipos de folha pregueada

 A maioria das protenas globulares tm conformaes espiraladas.

 A estrutura terciria de uma protena o arranjo tridimensional de todos os tomos na protena.

 A estrutura terciria definida pela estrutura primria.

As interaes estabilizantes incluem ligaes hidrognio, interaes eletrostticas e interaes hidrofbicas.

Ligaes dissulfeto so as nicas ligaes covalentes que podem se formar quando uma protena se dobra. Protenas que tm mais de uma cadeia peptdica so denominadas oligmeros.