David L. Nelson and Michael M.

Cox

Lehninger Principles of Biochemistry

Fourth Edition Chapter 3 e 4: Amino Acids, Peptides, and Proteins

Copyright 2004 by W. H. Freeman & Company

hemoglobina; soroalbumina colgeno; queratinas Miosina e actina Anticorpos Hormnios Ovalbuminas e protenas em sementes

Aminocidos, so 20 os proteicos

Carbono alfa

cidos proteicos so alfa-aminocidos : no carbono 2 da cadeia, carbono alfa, se mino. Os 20 aminocidos proteicos se diferenciam pelo grupo R.

aracterstica dos aminocidos proteicos?

Estereoisomeria nos aminocidos:

s aminocidos proticos so todos da configurao L, determinada pela comparando com a configurao do L- gliceraldeido, molcula de referncia para a determinao da onfigurao das molculas biolgicas.

L- gliceraldedo L- aminocido

2) Que significa os aminocidos proteicos serem da configurao L?

Classificao dos grupos R quanto polaridade em pH 7,0, pH celular

minocidos todos so polares. A classificao do grupo R portante pois a interao desses grupos na cadeia proteica tm a conformao da protena, importante para sua funo R R R R R apolares ou alifticos apolares aromticos polares mas no carregados polares carregados positivamente polares carregados negativamente

os os os os os

o se classificam os grupos R dos aminocidos?

4) Quantos so os aminocidos com grupo R apolares.5) Qual aminocido no apresenta C quiral. 6) Qual aminocido o N esta na forma imino? 7) Quais os 3 aminocidos com cadeia alifatica ramificada.

8) Quantos so os aminocidos com grupo R polares sem carga em pH 7? 9) Qual a funo quimica presente no grupo R de cada aminocido, que os torna polar?

Aminocidos aromticos

10) Os 3 aminocidos apresentam grupos polares ou apolares? D o nome dos 3 aminocidos

13

Peptdeos e Protenas, nomenclatura

Cadeias laterais

Amino terminal

Ligaes peptdicas

Carboxi terminal

Seril-glicil-tyrosil-alanil-leucina ou SerGlyTyrAlaLeu ou S - G - T A - L

A nomenclatura comea pelo residuo de aminocido da extremidade alfa amino(extremidade amino terminal), que escrita esquerda e termina com o residuo de aminocido com o grupo alfa-carboxila(extremidade carboxi terminal), escrito direita.

14) Como foi convencionado a nomenclatura das proteinas?

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Classificao das protenas

Na conformaes de uma protena ocorre vrios nveis estruturais chamados estrutura secundria, terciria e quaternria que dependem da estrutura primria

NVEIS DE ORGANIZAO ESTRUTURAL DE PROTENAS:

Estrutura Estrutura Estrutura Estrutura Primria Secundria Terciria Quaternria

A estrutura primria seqncia de aminocidos unidos por ligaes peptdicas, a seqncia esta codificada na seqncia dos nucleotidios do DNA . A estrutura primria que determina a conformao da protena. Estrutura secndria padre em hlice, folhas, e alas entre aminoacidos em sequncia da cadeia.; mantida por ligaes de hidrognio entre o grupo carbonila e o N amida da ligao peptdica. Esstrutura terciria como os blocos (domnios) de estrutura secundria se agrupam para formar monomros, conformao globular da cadeia peptidica, ocorre vrios tipos de interaes entre os grupos R dos aminocidos Estrutura quaternria como 2 ou mais monomros se agrupam para formar oligomros

erenciar os quatro nveis estruturais das protenas

 definida pela sequncia dos nucleotidios do DNA(gene)

Conceitue estrutura primria de uma

Estrutura Secundria e seus dois tipos principais

Alfa-hlice

Folha pregueada

n+3

Defina estrutura secundria e d os 3 tipos principais encontrados nas protenas.

Estrutura Terciria Resulta de dobras na estrutura da protena provocadas por interaes entre os grupos R dos aminocidos.

Ligaes que mantm a Estrutura Terciria

Interaes inicas ou salinas Ligaes covalentes Pontes de hidrognio Interaes hidrofbicas Foras de Van der Waals Interaes hidrofbicas Pontes dissufeto Pontes de hidrognio Desnaturao perda da conformao nativa de uma protena, podendo levar a perda a sua atividade biolgica.

A seqncia dos aminocidos na cadeia protica determina a conformao das protenas.

14) Por que alterao do pH, e elevao da temperatura, no devem ocorrer no meio celular?

Interaes eletroestticas

15)Que desnaturao de uma protena? 16) Conceitue as interaes acima.

Qual a funo das protenas acima?Quais so as estruturas secundrias observadas em cada molcula.

Perda irreversvel da estrutura espacial da protena, causada pelo calor ou por influncia qumica

Desnaturao

Protenas simples e Protenas conjugadas

Algumas protenas apresentam outros grupamentos qumicos alm de aminocidos, so chamados de grupos prostticos, esto ligados firmemente protena fazendo parte de sua estrutura : Lipoprotenas contem lipdios, glicoprotenas contem carboidratos, fosfoproteinas contem grupos fosfatos, flavoprotenas contem nucleotidio da flavina e metaloproteinas contem ons metlicos.

15) Conceitue grupos prostticos. D um exemplo.

oxigenio

Classificao das protenas