UNIDAD NMERO 3

ENZIMAS: BASES TERMODINMICAS DE SU MECANISMO DE ACCIN

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Qu es una enzima?

Las enzimas son compuestos qumicos orgnicos de naturaleza proteica que aceleran la velocidad de una reaccin qumica termodinmicamente posible.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Qu significa este concepto?

Las enzimas aceleran la velocidad de una reaccin qumica por que se comportan como catalizadores orgnicos (biocatalizadores). La catlisis es el proceso mediante el cual se acelera la velocidad de una reaccin qumica.
Cuando se hace referencia a que la reaccin debe ser termodinmicamente posible, se destaca el hecho que en el sistema donde ocurre la reaccin qumica existe suficiente energa til (energa de activacin) para realizar el trabajo que implica convertir el sustrato en producto.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Qu es la termodinmica?
La termodinmica es la rama de la fsica que estudia los fenmenos energticos y los intercambios de energa entre la materia. La termodinmica naci como consecuencia del estudio de las mquinas de vapor, pero durante el siglo 20 se observ que poda aplicarse a los sistemas orgnicos.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Qu significa energa til suficiente dentro del sistema para realizar un trabajo?
S
Estado inicial

Estado final

Si dejamos caer una bola, evidentemente ir hacia abajo sin ninguna ayuda. El trabajo en este sistema, est representado por el movimiento que hace la bola desde el estado inicial (S) hasta el estado final (P). Para realizar este trabajo, hace falta cierta cantidad de energa til dentro del sistema. Ntese que en ste sistema hay suficiente energa til que permite la caida de la bola. La energa til en este sistema est representada por la energa gravitatoria que ejerce una atraccin de la bola hacia abajo.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Qu pasara si saliramos al espacio, fuera de la atraccin gravitatoria de la tierra?

S
Estado inicial

P
Estado final

Evidentemente, la bola no caera.No existe suficiente energa til en el sistema en forma de energa gravitatoria para realizar el trabajo, es decir, que la bola caiga hacia la tierra (la bola esta fuera del campo gravitarorio de la tierra).

Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Si hay suficiente sistema.

energa

en

el

Estado inicial

Se dice que la reaccin acontecer de forma espontnea. Es decir, que S se convertir en P sin ninguna otra ayuda que la energa til del sistema.

Caida espontnea

Estado final

Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Consideremos ahora el caso inverso

Estado final

Habr energa suficiente en el sistema Para que se realice el trabajo que se plantea en la grfica? Es decir, que la bola suba espontneamente hacia la mano?

Estado inicial

Evidentemente, NO No hay energa libre suficiente, en forma de energa ANTI-gravitatoria para hacer que la bola suba hasta la mano espontneamente. Esto quiere decir, que esta reaccin en este sistema, es una reaccin irreversible.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

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En conclusin:
Una reaccin es termodinmicamente posible cuando hay suficiente energa libre ( til) para realizarla. Cuando la reaccin es termodinmicamente posible, est implcito el hecho que esta reaccin ser espontnea.

Si en el sistema no hay suficiente energa til despus de la conversin del sustrato a producto, la reaccin ser irreversible.

Si en el sistema hay suficiente energa til, la reaccin puede ser reversible, es decir, que el producto puede volverse a convertir en sustrato.

P
Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Volvamos a la termodinmica: Las leyes.

Primera ley de la termodinmica o ley de la conservacin de la energa:
La energa no se crea ni se destruye solo se transforma (de una forma de energa a otra)

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Primera ley de la termodinmica o ley de la conservacin de la energa:

La energa no se crea ni se destruye solo se transforma (de una forma de energa a otra)
Esta ley presenta de forma implcita dos ideas: 1. Si la energa nunca se cre y no puede ni destruirse ni acabarse, se deduce que la cantidad de energa total del universo es constante. Esto quiere decir, que el contenido energtico del universo no ha cambiado desde que fue creado (desde el Big Bang) hasta nuestros das, esto es, desde hace unos 15.000.000.000 de aos. 2. A pesar que el contenido energtico del universo es constante, entre un momento y otro acontecen transformaciones de una forma de energa a otra. Para mantener estable la energa total, es de prever que durante las transformaciones de una forma a otra de energa, algunas aumentarn, lo que ser compensado con la disminucin de otras formas de energa.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

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La energa no se crea ni se destruye(siempre ha sido y ser la misma cantidad)

Esquemticamente este proceso puede representarse de la siguiente manera:
Obsrvese que la cantidad de energa total en el universo antes y despus de mucho tiempo, es la misma

15.000.000.000 de aos

Contenido energtico total del universo en el momento de su creacin

Contenido energtico total del universo en la actualidad Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Solo se transforma.en otras formas energticas manteniendo el contenido total inalterable..

Esquemticamente este proceso puede representarse de la siguiente manera:
Obsrvese que la cantidad de energa total en el universo antes y despus de mucho tiempo, es la misma

25 % potencial
50 % lumnica

25 % cintica

15.000.000.000 de aos
20 % lumnica 50 % calrica 20 % otras 20 % calrica

Durante los primeros instantes del universo, todo era luz y calor.. en esencia, solo energa calrica y lumnica

En la actualidad la distribucin y tipos de energa son diferentes ( y ms diversos) a las observadas al inicio de la creacin del universo
Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Segunda ley de la termodinmica.

La entropa de todos los procesos del universo (y del universo mismo) tiende siempre a incrementarse hasta alcanzar el equilibrio, el cual representa el estado de mximo desorden.
Esto quiere decir que cualquier sistema dentro del universo, e incluso, todo el universo tiende a desordenarse espontneamente, buscando as el equilibrio.
El desorden se va incrementando en la medida que la energa til (que se encarga de mantener organizado un sistema) va disminuyendo. La cada de la energa til, tal como lo expresa la primera ley de termodinmica es seguida por el incremento de otras formas energticas que no son tiles para realizar un trabajo determinado en el sistema. Si consideramos que el sistema usa la energa til para mantenerse organizado, la disminucin de sta ocasionar desorden..Cuando el desorden sea mximo se habr establecido el equlibrio. Por lo tanto, los sistemas orgnicos estn adaptados para mantener la energa til en niveles ptimos para mantenerse ORGANIZADOS
Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Segunda ley de la termodinmica.

La lucha del orden contra el desorden(donde inevitablemente siempre gana el desorden)
El orden, implica alto grado de energa tilpero esta energa se utiliza para mantenernos organizados. De esta forma, como la energa til tiende a disminuir cuando se realiza el trabajo llamado organizarnos debemos producir todos los das ms energa til para reponer la invertida. Y as, la vida de cualquier ser vivo transcurre en una lucha contra la segunda ley de termodinmica..Nos alimentamos para extraer de los alimentos la energa potencial presente en los enlaces qumicos y guiarla hacia los enlaces de alta energa del ATP. Luego, al hidrolizar los enlaces de alta energa del ATP se liberan cantidades inmensas de energa libre que pueden utilizarse para realizar un trabajo, representado por las innumerables reacciones qumicas que requieren esa energa para poder llevarse a cabo.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Segunda ley de la termodinmica.

La lucha del orden contra el desorden(donde inevitablemente siempre gana el desorden, que en nosotros recibe el nombre de muerte)
Lamentablemente, despus de algn tiempo de luchar contra la segunda ley, todos los seres vivos experimentan la llamada muerte. Todas las clulas se desorganizan: las membranas se rompen, las mitocondrias y otros organelos se disgregan y todo el contenido celular se combina con el entornoLos lpidos se peroxidan, las protenas se hidrolizan a sus aminocidos y los carbohidratos se oxidan.se establece un equlibrio entre el interior de la clula y su exterior. Este hecho es extremadamente anmalo, pues lo que abunda dentro de la clula usualmente es escaso en el medio ambiente. La salud implica alto grado de orden y un gran desequilibrio con el medio externo. La muerte implica un alto grado de desorden y un equilibrio perfecto con el medio. Ya no existe suficiente energa libre para mantener un alto grado de organizacin.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

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La vida y la muerte..Segn la termodinmica

Este proceso puede representarse esquemticamente de la siguiente manera:
Bajo grado de energa no utilizable Niez alto grado de energa no utilizable

30 - 40 aos 60 aos 70 80 aos

Muerte

Alto grado de energa til

La vida, implica un alto grado de orden que solo puede lograrse con altas dosis de energa til. Esta energa til debe mantenerse estable en el tiempo. De esta forma estamos adaptados para tener un Metabolismo que genere altas cantidades de energa til en forma de ATP.

La muerte implica el desorden mximo. El individuo no puede transformar de forma eficiente la energa que le ofrece Su entorno, as que progresivamente acumula menos energa til hasta un punto en el que no puede mantenerse ordenado. Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Bases termodinmicas del mecanismo de accin de las enzimas

Para que un sustrato A se transforme en el producto B debe existir cierta cantidad de energa libre (til) en el sistema que se pueda realizar este trabajo qumico:

A
Alta cantidad de energa libre

B
Baja cantidad de energa libre

y todos los procesos qumicos transcurren desde un punto de alta energa libre hasta uno de baja energa libre. Obsrvese como la flecha, que indica el sentido de la reaccin, tiene un solo sentidoEsto es, que la reaccin es irreversible. El compuesto B no puede tranformarse en el compuesto A porque hay muy poca energa libre para realizar este trabajo.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Bases termodinmicas del mecanismo de accin de las enzimas

Ntese tambin que la conversin de A en B es un proceso espontneo, debido a que la cantidad de energa libre es suficiente para realizar los cambios qumicos que caracterizan la reaccin. Al final puede apreciarse una cada en la energa libre. Como la energa libre no se pierde, es obvio que se ha transformado en otras formas energticas, quiz potencial dentro de la molcula B

A
A

B
0

100 Alta cantidad de energa libre

Baja cantidad de energa libre

No hace falta aadir calor al sistema, ni ninguna otra forma de energa Pero el hecho de que ocurra la reaccin, no nos da informacin alguna de la velocidad con la que sta acontece. En los seres vivos es importante que muchas reacciones ocurran adecuadamente..pero tambin es importante que ocurran rpidamente.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Cmo podemos aumentar la velocidad de una reaccin qumica?

En lneas generales se puede aumentar la velocidad de la reaccin de dos maneras: 1. Incrementando la cantidad de energa libre para realizar el trabajo, hecho que incrementa la pendiente entre el estado inicial y el final. Esto puede hacerse con calor.

A
500 Incremento en la cantidad de energa libre
A

B
Mayor velocidad por incremento de la pendiente (vase la pendiente en la diapositiva anterior)
Baja cantidad de energa libre 0
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Cmo podemos aumentar la velocidad de una reaccin qumica?

En lneas generales se puede aumentar la velocidad de la reaccin de dos maneras: 2. Manteniendo la cantidad de energa til constante, la nica manera de aumentar la velocidad de la reaccin es utilizando de forma ms eficiente la energa til del sistema. Esto puede hacerse gracias al uso de una ENZIMA

A
100
A

B
Baja cantidad de energa libre 0

ENZIMA
Alta cantidad de energa libre

Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Cmo una enzima puede optimizar el uso de la energa libre en el sistema para as aumentar la velocidad de una reaccin?.... Considere estos dos sistemas
Cantidad de Energa til: 100 Kcal Cantidad de Energa til: 100 Kcal

A
Sistema 1

A
Sistema 2

B
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo es la misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1 emplear menos energa que el individuo del sistema 2 para realizar el trabajo.
Cantidad de Energa til: 100 Kcal Energa utilizada para realizar el trabajo: slo 10 Kcal. Cantidad de Energa til: 100 Kcal Energa utilizada para realizar el trabajo: 100

Kcal

A
Sistema 1

A
Sistema 2

B
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo es la misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1 emplear menos energa que el individuo del sistema 2 para realizar el trabajo.
Energa til: 100 Kcal Energa utilizada: 100 Kcal Total

100 100 0

Cantidad de Energa til: 100 Kcal Energa utilizada para realizar el trabajo: 100

Kcal

A
Sistema 2

Conclusin: solo se puede Tirar una piedra con la cantidad de energa disponible

B
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo es la misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1 emplear menos energa que el individuo del sistema 2 para realizar el trabajo.

Cantidad de Energa til: 100 Kcal Energa utilizada para realizar

el trabajo: 10

Kcal

Energa til: 100 Kcal Energa utilizada: 10 Kcal Total

A
La palanca en este sistema es equivalente a la enzima en un sistema qumico. Un elemento que permite el ahorro energtico y el uso del excedente para realizar Ms trabajo

100 10 90

Conclusin: se pueden tirar nueve piedras ms con la cantidad de energa sobrante

Sistema 1

B B B B B B B B B
Dr. Valmore Bermdez Pirela

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Cuales son las principales caractersticas de una enzima?

1. Son compuestos termolbiles.

2. Son reciclables, por lo que..

3. Se necesitan en baja cantidad. 4. Su actividad, es decir, la velocidad de la catlisis puede regularse.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Cuales son las principales caractersticas de una enzima?

5. Tienen una gran afinidad por un solo sustrato o por un grupo de sustratos emparentados estructuralmente.
6. Tienen una gran especificidad por un solo sustrato o por un grupo de sustratos emparentados estructuralmente.

Dr. Valmore Bermdez Pirela