BIOQUMICA II

INTRODUCCIN

COMPORTAMIENTO TICO DEL ESTUDIANTE

-Puntualidad en los horarios de clases, no se permitir el ingreso de los estudiantes que lleguen atrasados. -Los trabajos y exmenes producto de la copia o plagio, sern anulados. -Mantener apagados los celulares. -Respeto a la palabra de las otras personas. -La copia de exmenes ser severamente sancionada, y dependiendo podra ser motivo de la prdida automtica del semestre. -Respeto en las relaciones docente-alumno y alumno-alumno. -Se prohbe a los estudiantes el uso de gorras, capuchas u otros objetos que les cubran la cabeza, mientras duren las clases y rindan las evaluaciones. -Los deberes y trabajos asignados debern ser entregados el da correspondiente. No se aceptarn solicitudes de postergacin. -Todo trabajo que se entregue deber estar correctamente respaldado con las citas bibliogrficas respectivas. -Custodiar los bienes personales e institucionales.

OBJETIVOS TERMINALES Y CAPACITANTES A. Objetivos Terminales y Capacitantes 1. rea Cognoscitiva a) Determinar el alcance de la informacin necesitada para adquirir el conocimiento en la bioqumica. b) Usar informacin efectivamente para aplicar la bioqumica en la evaluacin de un problema metablico en el organismo. c) Incorporar a su propia base de conocimientos la informacin seleccionada. d) Describir las caractersticas de la materia viva, la funcin especfica de cada componente, la manera en que los organismos vivos extraen y transforman la energa del medio ambiente y el fenmeno de la reproduccin dados los conceptos bsicos de la clula. e) Explicar la simplicidad que gobierna la organizacin molecular de las clulas vivas y describir la estructura y funcin de las biomolculas dadas las propiedades qumicas y fsicas de las macromolculas. f) Explicar la biosntesis y la degradacin de protenas, hidratos de carbono y lpidos en las clulas vivas conocidas las estructuras de las macromolculas. g) Explicar cmo es que se transmite la informacin gentica en las clulas vivas conocidos los procesos de replicacin, transcripcin y traduccin.

PRCTICAS DE BIOQUMICA II
# 1 2 3 4 5 6 TEMAS DE LAS PRCTICAS

INTEGRANTES DE LOS GRUPOS

FECHA EJECUCIN
2013-04-16 2013-04-23 2013-04-30 2013-05-07 2013-05-14 2013-05-21 2013-05-28

7 8

9 10

POLINEURITIS EN AVES SEPARACIN DE PROTENAS EXTRACCIN Y CARACTERIZACIN DE FOSFOLPIDOS AISLAMIENTO Y CARACTERIZACIN DE LAS PROTENAS DE LA SOYA INTRODUCCIN A LA ENZIMOLOGA: Factores que afectan a la actividad enzimtica DOSIFICACIN DE PROTENAS: Determinacin de protenas por el mtodo de Biuret Dosificacin de protenas por absorcin en el ultravioleta DETERMINACIN DE GLUCGENO HEPTICO PRODUCCIN DE PIRUVATO Y ACETALDEHDO DURANTE LA FERMENTACIN DE LA GLUCOSA POR LEVADURA CAPACIDAD TAMPN Y DIGESTIN SALIVAL METABOLISMO CON ANIMAL http://www.bioquimica.dogsleep.ne ENTERO: t/Laboratorio/Plummer/Chp10b.pdf Efecto del ayuno sobre el metabolismo de la rata
CURSO DE BIOQUMICA II QUINTO NIVEL B 2013-04-02

2013-06-04 2013-06-11

2013-06-18 2013-06-25 PLUMMER,D. Bioqumica Prctica

PRCTICAS DE BIOQUMICA II
# 1 2 3 4 5 6 TEMAS DE LAS PRCTICAS POLINEURITIS EN AVES 2013-04-17 2013-04-24 SEPARACIN DE PROTENAS 2013-05-08 EXTRACCIN Y CARACTERIZACIN DE FOSFOLPIDOS 2013-05-15 AISLAMIENTO Y CARACTERIZACIN DE LAS PROTENAS DE LA SOYA 2013-05-22 INTRODUCCIN A LA ENZIMOLOGA: 2013-05-29 Factores que afectan a la actividad enzimtica DOSIFICACIN DE PROTENAS: 2013-06-05 Determinacin de protenas por el mtodo de Biuret Dosificacin de protenas por absorcin en el ultravioleta 2013-06-12 DETERMINACIN DE GLUCGENO HEPTICO 2013-06-19 PRODUCCIN DE PIRUVATO Y ACETALDEHDO DURANTE LA FERMENTACIN DE LA GLUCOSA POR LEVADURA 2013-06-26 CAPACIDAD TAMPN Y DIGESTIN SALIVAL METABOLISMO CON ANIMALENTERO: http://www.bioquimica.dogsleep.net/Labora 2013-07-03 Efecto del ayuno sobre el metabolismo torio/Plummer/Chp10b.pdf PLUMMER,D. de la rata Bioqumica Prctica CURSO DE BIOQUMICA II QUINTO NIVEL A 2013-04-03 INTEGRANTES DE LOS GRUPOS FECHA EJECUCIN

7 8

9 10

Este Cdigo de tica para las instituciones de educacin superior se basa en los principios generales de responsabilidad, honestidad, solidaridad, verdad, libertad, equidad, perseverancia, tolerancia y dignidad.

PRINCIPIOS ESTABLECIDOS EN EL CDIGO DE TICA PARA LAS INSTITUCIONES DE EDUCACIN SUPERIOR

Responsabilidad.- Se define como el cumplimiento de las obligaciones lo que implica la obligacin de

responder por los actos propios, la palabra dada o la fe empeada.

Honestidad.- Es la virtud de la sinceridad, rectitud en el nimo y proceder. Solidaridad.- Entendida como la fraternidad, el apoyo mutuo y la vocacin de servicio para enfrentar los
problemas de todo orden.

Verdad.- Se la concibe como una bsqueda permanente, para ser honrados, justos y dignos con todos aquellos
que ponen su confianza en el trabajo acadmico y la gestin social de la educacin superior.

Libertad.- Ejercitada como garanta para definir sus estatutos, reglamentos, formas de organizacin y
funcionamiento y al mismo tiempo para formar hombres y mujeres libres que sean capaces de contribuir a un desarrollo con solidaridad y armona social.

Equidad.- Establecida como el compromiso de garantizar oportunidades iguales a todas las personas, de
mantener un criterio democrtico y libre de toda clase de discriminacin, de igualdad de oportunidades y trato justo a todos los actores y usuarios sin distingo de raza, color, religin, nacionalidad, sexo, edad, discapacidad o condicin.

Perseverancia.- Se la plantea como condicin de conocer, comprender y persistir con paciencia, tenacidad y
firmeza en la construccin de la tica de la educacin superior principalmente. Tolerancia.- Se la define como requisito esencial que garantiza los principios de igualdad, de participacin social, de pluralidad y democracia adems que fortifica la diversidad cultural, educativa y espiritual de los pueblos.

Dignidad.- Se la determina como consecuencia y solvencia en el pensamiento, investigacin y accin, por

cuanto este principio aglutina todos los dems de dicho cdigo que pretende constituirse como un elemento de 6 identidad institucional y personal que asegure la calidad y la excelencia en las instituciones de educacin superior.

LEY ORGNICA DE EDUCACIN SUPERIOR Art. 207.- Sanciones para las y los estudiantes, profesores o profesoras, investigadores o investigadoras, servidores o servidoras y las y los trabajadores.Las instituciones del Sistema de Educacin Superior, as como tambin los Organismos que lo rigen, estarn en la obligacin de aplicar las sanciones para las y los estudiantes, profesores o profesoras e investigadores o investigadoras, dependiendo del caso, tal como a continuacin se enuncian. Son faltas de las y los estudiantes, profesores o profesoras e investigadores o investigadoras:

a) Obstaculizar o interferir en el normal desenvolvimiento de las actividades acadmicas y culturales de la institucin;

b) Alterar la paz, la convivencia armnica e irrespetar a la moral y las buenas costumbres; c) Atentar contra la institucionalidad y la autonoma universitaria; d) Cometer actos de violencia de hecho o de palabra contra cualquier miembro de la comunidad educativa, autoridades, ciudadanos y colectivos sociales; e) Deteriorar o destruir en forma voluntaria las instalaciones institucionales y los bienes pblicos y privados; f) No cumplir con los principios y disposiciones contenidas en la presente Ley y en el ordenamiento jurdico ecuatoriano; y, g) Cometer fraude o deshonestidad acadmica.

LEY ORGNICA DE EDUCACIN SUPERIOR Art. 103.- Examen Nacional de evaluacin de carreras y programas acadmicos.Para efectos de evaluacin se deber establecer un examen para los estudiantes de ltimo ao, de los programas o carreras. El examen ser complementario a otros mecanismos de evaluacin y medicin de la calidad. Este examen ser diseado y aplicado por el Consejo de Evaluacin, Acreditacin y Aseguramiento de la Calidad de la Educacin Superior. El Examen estar centrado en los conocimientos establecidos por el programa o carrera respectiva. En el caso de que un porcentaje mayor al 60% de estudiantes de un programa o carrera no logra aprobar el examen durante dos aos consecutivos, el mencionado programa o carrera ser automticamente suprimido por el Consejo de Evaluacin, Acreditacin y Aseguramiento de la Calidad de la Educacin Superior;..

REGLAMENTO DE RGIMEN ACADMICO:

CAPTULO IX:

Art. 38.- El primer da de clase de la asignatura, el docente entregar y explicar a los estudiantes el plan analtico y el sistema de evaluacin a aplicarse durante el perodo acadmico, para su seguimiento y evaluacin.

ENCUADRE DEL CURSO

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. Horarios de clases Control del dictado de clases Control de la asistencia Programa analtico: Terico Prctico Bibliografa Presentacin del profesor Actividades previstas evaluacin Prueba diagnstica

DOCUMENTOS:

Gua metodolgica para escribir informes Gua de Prcticas Folletos de los contenidos tericos Diapositivas de todos los captulos Bibliografa especializada

HORARIOS DE CLASES BIOQUMICA II Semestre: Marzo-Agosto/2013 Nivel: Quinto B Aula: FC-503

HORAS 07h00 08h00 08h00 09h00 09h00 10h00 10h00 11h00 11h00- 12h00 12h00-13h00

LUNES

MARTES

MIERCOLES

JUEVES

VIERNES

Bioqumica II Bioqumica II Bioqumica II Bioqumica II Bioqumica II

Consultas Consultas

HORARIOS DE CLASES BIOQUMICA II Semestre: Marzo-Agosto/2013 Nivel: Quinto A Aula: FC-506

HORAS 07h00 08h00 08h00 09h00 09h00 10h00 10h00 11h00 11h00- 12h00 12h00-13h00

LUNES

MARTES

MIERCOLES

JUEVES

VIERNES

Consultas Consultas

Bioqumica II Bioqumica II Bioqumica II Bioqumica II Bioqumica II

BIOQUMICA II

INTRODUCCIN A LA

QUINTO NIVEL

BIOQUMICA Y FARMACIA ESPOCH

La Bioqumica es una ciencia que estudia la composicin qumica de los seres vivos, especialmente las protenas, carbohidratos, lpidos y cidos nucleicos, adems de otras pequeas molculas presentes en las clulas y las reacciones qumicas que sufren estos compuestos (metabolismo) que les permiten obtener energa (catabolismo) y generar biomolculas propias (anabolismo). La bioqumica se basa en el concepto de que todo ser vivo contiene carbono y en general las molculas biolgicas estn compuestas principalmente de carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre. Es la ciencia que estudia la base qumica de la vida: las molculas que componen las clulas y los tejidos, que catalizan las reacciones qumicas del metabolismo celular como la digestin, la fotosntesis y la inmunidad, entre otras muchas cosas. Podemos entender la bioqumica como una disciplina cientfica integradora que aborda el estudio de las biomolculas y biosistemas. Integra de esta forma las leyes qumico-fsicas y la evolucin biolgica que afectan a los biosistemas y a sus componentes. Lo hace desde un punto de vista molecular y trata de entender y aplicar su conocimiento a amplios sectores de la Medicina (terapia gnica y Biomedicina), la agroalimentacin, la farmacologa

La Bioqumica constituye un pilar fundamental de la biotecnologa, y se ha consolidado como una disciplina esencial para abordar los grandes problemas y enfermedades actuales y del futuro, tales como el cambio climtico, la escasez de recursos agroalimentarios ante el aumento de poblacin mundial, el agotamiento de las reservas de combustible fsil, la aparicin de nuevas formas de alergias, el aumento de cncer, las enfermedades genticas, la obesidad La Bioqumica es una ciencia experimental y por ello recurrir al uso de numerosas tcnicas instrumentales propias y de otros campos, pero la base de su desarrollo parte del hecho de que lo que ocurre en vivo a nivel subcelular se mantiene o conserva tras el fraccionamiento subcelular, y a partir de ah, podemos estudiarlo y extraer conclusiones

UNA CRONOLOGA DE LA BIOQUMICA

No 1

DESCUBRIMIENTOS
Descubri el oxgeno y demostr que el es consumido por los animales y producido por las plantas.

AO
1770 a 1774

AUTOR(S)
Priestley

2
3 4

Se aisl el glicerol y los cidos ctrico, mlico, lctico y rico, a partir de fuentes naturales. Se aisl la urea a partir de la orina Se demostr que la luz es necesaria para la produccin de oxgeno por las plantas. El prob tambin que las plantas usan el dixido de carbono.
Se demostr que los animales requieren del oxgeno, reconoci que la respiracin consiste en oxidacin, midi por primera vez el consumo de oxgeno por el ser humano, y reconoci que la fermentacin alcohlica es fundamentalmente un proceso qumico. Se anunci la teora atmica. Se descubre la actividad ptica. Se sintetiza el primer compuesto orgnico a partir de componentes inorgnicos: la urea a partir de cianato de plomo y amonio

1770 a 1786
1773 1779 a 1796

Scheele
Roulle Ingenhouz

1780 a 1789

Lavoisier

6 7 8

1804 1815 1828

Dalton Biot Wohler

9
10 11 12

Se desarrollaron tcnicas de anlisis cuantitativo y las aplic a sistemas biolgicos.

Enuncian que todos los organismos vivos estn compuestos por clulas (Teora celular) Se enunci la primera ley de la termodinmica y su aplicabilidad a los organismos vivos.

1830 a 1840 1838 1842 1850 a 1855

Liebig Schleiden y Schwann Mayer Bernard

Se aisl el glucgeno a partir del hgado, mostr que el era convertido en glucosa sangunea, y se descubri el proceso de la gluconeognesis.
Prob que la fermentacin era provocada por microorganismos, y demoli la hiptesis de generacin espontnea.

13

1854 a 1864

Pasteur

14
15

16 17
18 19 20 21 22

Se publica la teora sobre la evolucin de las especies. Por primera vez se cristaliz una protena, la hemoglobina. Mendel public sus experimentos, que llevaron a los principios de la segregacin y distribucin independiente de los genes.
Se asla la nuclena (DNA) en el ncleo de una clula.

1859 1864 1866 1871 1872 1876 1877 1893 1897 1897 a 1906

Charles Darwin Hoppe - Seyler Juan Gregorio Mendel Federico Miescher Pfluger

23
24

25
26 27

28 29 30 31

Se prob que el oxgeno es consumido por todos los tejidos de los animales. Se identifica los microorganismos intervinientes en la elaboracin del pan. Se propone el trmino de enzima y hace distincin entre enzimas y bacterias. Se prob que las enzimas son catalizadores. Se descubre que la fermentacin alcohlica poda ocurrir en extractos de levaduras desprovistos de clulas. Se prob que la beriberi es una enfermedad por carencia alimentar y que el componente hidrosoluble de las pelculas de arroz poda curarla. Demostraron que las protenas son polipptidos. Mostraron las necesidades de fosfato en la fermentacin alcohlica y concentraron la primera coenzima, la cozimasa, que, como se mostr ms tarde, era el NAD+. Se deduce la oxidacin de los cidos grasos. Mostraron que el cido lctico es formado cuantitativamente a partir de la glucosa durante la contraccin anaerbica del msculo. Se mostr el efecto del pH sobre la accin enzimtica. Las unidades fundamentales de la herencia biolgica reciben el nombre de genes. Descubrieron las deshidrogenasas.
Se postul la existencia de una enzima respiratoria para la activacin del oxgeno, descubri su inhibicin por el cianuro, y mostr la necesidad de hierro para la respiracin celular. Desarrollaron una teora cintica de la accin enzimtica. Aislaron y estudiaron la clorofila Se obtienen acetona, butanol y glicerina empleando microorganismos.

Kuhne Ostwald Eduard Buchner Eijkman

1902 1905

Emil Fischer y Hofmeister Harden y Young

1905 1907

Knoop Fletcher y Hopkins

1909 1909 1912 1912 1913 1913 1914

Sorensen

Batelli y Stern Warburg Michaelis y Menten Wilstatter y Stoll

32
33 34

35 36 37 38 39 40

41 42 43 44 45

46
47 48 49 50 51

Mostr que la xeroftalmia en ratas era causada por la carencia de vitamina A. Mostr que la carencia de vitamina D ocasionaba el raquitismo. Realizan las primeras medidas de la eficiencia quntica de la fotosntesis. Efectuaron importantes aportes en la teora de la cintica enzimtica. Se descubre que la actividad del gen est relacionada con su posicin en el cromosoma. Se determin la estructura de los mononucletidos y se demostr que ellos son los bloques constructivos de los cidos nucleicos. Se invent la ultracentrfuga para la determinacin de la velocidad de sedimentacin de las protenas. Se cristaliz por primera vez una enzima, la ureasa, y prob que ella era una protena. Aislaron la vitamina B1 (Tiamina) de las pelculas del arroz. Demostraron la mutacin de genes por los rayos X. Se demostr que el ergosterol era un precursor de la vitamina D. Aislaron la vitamina C Se deduce la naturaleza ferro-porfirnica de la enzima respiratoria. Aislaron el ATP y fosfocreatina de extractos de msculo. Se descubri que la fosforilacin es acoplada con la respiracin. Descubrieron el ciclo de la urea. Demostraron la existencia de intermediarios fundamentales en la gluclisis y fermentacin.

1917 1922 1922 1925 1925 1925 a 1930

McCollum McCollum Warburg y Negelein Briggs y Haldane

Levene

1925 a 1930 1926 1926 1927 1927

Svedberg Sumner Jansen y Donath Muller y Stadler Windaus

1928 a 1932
1928 a 1933 1929 1931 1933 1933

Szent - Gyorgyi, Waugh y King Warburg

Fiske y Subbarow Engelhardt Krebs y Henseleit Embden y Meyerhof

52 53 54

55 56

57
58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68

Se aisl la pepsina y tripsina y se prob su naturaleza proteica. Deducen la estructura de la vitamina B1. Usaron por primera vez istopos como marcadores en el estudio del metabolismo intermediario de hidratos de carbono y lpidos Cristaliz por primera vez un virus (mosaico del tabaco) Mostraron el efecto cataltico de los cidos dicarboxlicos sobre la respiracin. Postul el ciclo del cido ctrico (Ciclo de Krebs)
Se observ que las suspensiones de cloroplastos desprovistas de clulas producan oxgeno, cuando eran iluminadas en presencia de un aceptor de electrones. Descubrieron las reacciones de Transaminacin. Demostraron la accin reversible de la glucgeno fosforilasa. Postul el papel central del ATP en el ciclo de transferencia de energa. Se descubre que cada gen codifica una nica protena. Teora UN GEN- UNA ENZIMA. Demostraron que la transformacin bacteriana es causada por el DNA. Aplic por primera vez mtodos espectrofotomtricos sensibles a las interacciones enzima -substrato. Desarrollaron la cromatografa de particin y la aplicaron al anlisis de aminocidos. Determin por primera vez la secuencia de aminocidos en una protena, la -lactoglobulina, por mtodos qumicos y microbiolgicos. Aslan y caracterizan la coenzima A Refinaron un mtodo de centrifugacin diferencial para el fraccionamiento celular.

1930 a 1933 1935 1935

Northrop
Williams y col. Schoenheimer y Rittenberg Stanley Szent - Gyorgyi H. Krebs Hill

1935 1935 1937 1938 1938 1939 1939 a 1941 1940 1943 1943 1941 a 1944 1945 1947 a 1950 1948

Braunstein y Kritzmann C. Cori y G.Cori Lipmann Beadle y Tatum Avery , MacLeod y McCarthy Chance Martin y Synge Brand

Lipmann y Kaplan Hogeboom, Schneider y Palade

69

70
71

Descubrieron que el ciclo de los cidos tricarboxlicos, la oxidacin de los cidos grasos y la fosforilacin oxidativa, ocurren en la mitocondria. Descubrieron las equivalencias de bases del DNA Perfeccionaron el mtodo de secciones ultrafinas y mtodos de fijacin para la microscopa electrnica de las estructuras intracelulares. Anuncian la estructura en doble hlice del DNA Se completa la determinacin de la secuencia de aminocidos de las cadenas A y B de la insulina. Se identifican 23 pares de cromosomas en las clulas del cuerpo humano. Se descubri la DNA-polimerasa Se introducen nuevos antibiticos producidos por organismos. Se postula el Dogma Central de la Biologa Se confirma experimentalmente que la replicacin del DNA ocurre de forma semiconservativa.
Se describe el analizador automtico de aminocidos.

1948 a 1950

Kennedy y Lehninger

1950 a 1953 1952 a 1953

Chargaff y colaboradores Palade, Porter y Sjostrand James Watson y Francis Crick Sanger y Thompson

72 73

1953 1953

74 75 76 77 78 79 80 81 82 83

1956 1956 1950 a 1960 1958 1958 1958 1958 a 1959 1961 1961 1961 a 1968 Kornberg

F. Crick Meselson y Stahl Stein, Moore y Spackan

Weiss, Hurwitz y otros

Descubren la RNA polimerasa dirigida por el DNA Desciframiento de las primeras letras del cdigo gentico. Propusieron una teora para la accin y funcin de las enzimas alostricas. Se asla 1-ATPasa de las mitocondrias y reconstituyen la fosforilacin oxidativa en vesculas submitocondriales.

Jacob, Monod y Changeux Racker y colaboradores

84

En este perodo se elucid las principales vas metablicas para la biosntesis y degradacin de los aminocidos, purinas, pirimidinas, cidos grasos, carbohidratos complejos, lpidos y compuestos terpenoides.

1950 a 1965

Varios autores

85
86

Se descifra el cdigo gentico completo del DNA. Se crea la primera molcula de DNA recombinante en el laboratorio: genes de una especie son introducidos de otras especies y funcionan correctamente.
Brasil inicia un programa para sustituir el petrleo por alcohol producido por levaduras. La Conferencia de Asilomar evala los riesgos biolgicos de las tecnologas de DNA recombinante, y agrupa una moratoria de los experimentos con estas tecnologas. Se fund Genentech Incorporated, primera empresa de ingeniera gentica.

1966 1972

Nirenberg, Khorana y Ochoa

87
88

1973 1975

89 90
91

Se fabric con xito una hormona humana en una bacteria. Se clon el gen de la insulina humana.
El Tribunal Supremo de los Estados Unidos de Amrica dictamina que se pueden patentar los microbios obtenidos mediante ingeniera gentica.

1977 1978 1980 1981

92 93
94

Primer diagnstico prenatal de una enfermedad humana por medio del anlisis del DNA.
Se crea el primer ratn transgnico, llamado "superratn", insertando el gen de la hormona del crecimiento de la rata en vulos de ratona fecundados. Se produce insulina utilizando tcnicas de DNA recombinante. Se inventa la tcnica PCR (reaccin en cadena de la polimerasa), que permite copiar genes especficos con gran rapidez. Es una tcnica muy poderosa para producir millones de copias de una regin especfica de DNA, que permite analizarla tan rpido como se puede purificar una sustancia qumica. PCR ha sido el instrumento esencial en el desarrollo de tcnicas de diagnstico, medicina forense y la deteccin de genes asociados con errores innatos del metabolismo.

1982

1983

95
96

Creacin de las primeras plantas transgnicas.

Se inicia el empleo de interferones en el tratamiento de enfermedades vricas. Se utiliza por primera vez la "huella gentica" en una investigacin judicial en Gran Bretaa. Se autorizan las pruebas clnicas de la vacuna contra la hepatitis B obtenida mediante Ingeniera Gentica. Propuesta comercial para establecer la secuencia completa del genoma humano,

1984 1985

97 98

1986 1987

Proyecto Genoma Humano.

99 Comercializacin del primer anticuerpo monoclonal de uso teraputico. Se patenta por primera vez un organismo producido mediante ingeniera gentica, un ratn. Se crea la organizacin HUGO para llevar a cabo el Proyecto Genoma Humano: identificar todos los genes del cuerpo humano. Comercializacin de las primeras mquinas automticas de secuenciacin del DNA. Primer tratamiento con xito mediante terapia gnica en nios con trastornos inmunolgicos (nios burbuja). Se ponen en marcha numerosos protocolos experimentales de terapia gnica para intentar curar enfermedades cancerosas y metablicas. Se comercializa en California el primer vegetal modificado genticamente, un tomate, y se autoriza en Holanda la reproduccin del primer toro transgnico. Se completan las primeras secuencias de genomas de bacterias. 1988 Universidad de Harvard

100 101

1989 1990

102
103 104

1994 1995 1996 1997 2001 Ian Wilmut y colaboradores

105 106
107

Por primera vez se completa la secuencia del genoma de un organismo eucaritico, la levadura de cerveza Bilogos escoceses clonan al primer mamfero, la oveja Dolly.
Se publica el mapa provisional del genoma humano.

Se detecta una enzima que tiene relacin directa con las auxinas para el crecimiento de las plantas.

2002

1990: Andrew Simon Bell, David Brown y Nicholas Kenneth Terrett patentan un compuesto dilatador de los vasos sanguneos, el sildenafil citrato, comercializado con el nombre de Viagra, que es empleado
para tratar la disfuncin erctil.

1995: Edward Lewis, Christiane Nsslein-Volhard y Eric Wieschaus reciben el premio Nobel por sus
descubrimientos concernientes al control gentico de las etapas tempranas del desarrollo embrionario. 1995: J. Craig Venter y sus colegas publican la primera secuencia completa del genoma de un organismo de vida libre: Haemophilus influenzae.

2000: Arvid Carlsson, Paul Greengard y Eric Kandel reciben el premio Nobel por sus descubrimientos
sobre la transduccin de seales en el sistema nervioso y en especial por la caracterizacin de la transmisin sinptica lenta y la memoria de corto plazo a travs de fosforilacin y defosforilacin de protenas.

2000: Thomas A. Steitz, Nenad Ban, Paul Nissen y colegas resuelven mediante cristalografa de rayos X,
la estructura tridimensional de la subunidad mayor del ribosoma.

2000: Andr Rosenthal y Yoshiyuki Sakaki, quienes encabezan el Proyecto del Genoma Humano,
mapean la secuencia completa del cromosoma 21, el ms pequeo de los cromosomas humanos.

2000: J. Craig Venter y sus colegas publican la secuencia completa del genoma de Drosophila
melanogaster.

LEHNINGER, A.L.: 2006. Bioqumica. Las bases moleculares de la estructura y funcin celular. Omega. Barcelona.

ESQUEMA BSICO DE UN PROTOCOLO DE INVESTIGACIN EN BIOQUMICA

1) 2) 3) 4) 5)

TEMA ANTECEDENTES DE LA INVESTIGACIN IMPORTANCIA BIOQUMICA DEL TEMA OBJETIVOS A LOGRAR DESARROLLO DEL TEMA:
a) b) c) d) e) f) g) h) i) ESTRUCTURA DEL MATERIAL GENTICO (DNA) GENOMA, PROTEOMA, CROMOSOMAS Y CROMATINA REPLICACIN Y TRANSCRIPCIN DEL DNA BIOSNTESIS DE PROTENAS O TRADUCCIN MUTACIONES PUNTUALES INHIBIDORES DE LA BIOSNTESIS DE PROTENAS CDIGO GENTICO REGULACIN DE LA EXPRESIN GNICA DNA-RECOMBINANTE

6) 7) 8) 9)

OBSERVACIONES-DISCUSIN CONCLUSIONES REFERENCIAS BIBLIOGRFICAS ANEXOS Fecha de entrega: 2013-04-03

Curso de Bioqumica II Sexto nivel A Rbba, marzo/2013

SUGERIDO POR WATSON Y CRICK.

REPLICACIN DEL DNA, CONFORME LO

LAS HEBRAS COMPLEMENTARIAS SON SEPARADAS Y CADA UNA DE ELLAS SIRVEN DE MOLDE PARA LA SNTESIS DE UNA HEBRA HIJA COMPLEMENTARIA.

BIOSNTESIS DE PROTENAS

(Iniciacin)

BIOSNTESIS DE PROTENAS (Elongacin)

BIOSNTESIS DE PROTENAS

(Terminacin)

El cdigo gentico nos indica que cada aminocido est especificado por su correspondiente triplete o codn del RNA mensajero.

DNA RECOMBINANTE

PRESENTACIN DEL PROFESOR

ESTUDIOS Y TTULOS OBTENIDOS
o o o o o o o o Dr. Carlos Donoso Fernndez Ttulo de doctor en Bioqumica y Farmacia Graduado en la Universidad Central del Ecuador Quito Diploma al Mejor Egresado Becario de la UNESCO (Concurso nacional) Curso de Postgrado en la UNIVERSIDAD DE SAO PAULO BRASIL Pasanta en la Escuela Paulista de Medicina, Productos Naturales Departamento de Farmacologa, Sao Paulo - Brasil Ttulo acadmico : Mster en BIOTECNOLOGA.

CARGOS OCUPADOS
o o o o o o o o Decano de la Facultad de Ciencias Vicedecano (tres ocasiones) Vocal Principal Docente del Consejo Directivo de la Facultad de Ciencias Director de la ESCUELA DE POSTGRADO DE LA ESPOCH Director de la Escuela de Bioqumica y Farmacia Profesor en la Facultad de Ciencias Qumicas-Universidad Central del Ecuador Profesor de las ctedras de Bioqumica I y II en la Facultad de Ciencias de la ESPOCH. Asistente de ctedra (Qumica Analtica) en la Facultad de Ciencias QumicasUniversidad Central del Ecuador

OTROS
o o o

Algunas publicaciones cientficas Algunos proyectos de investigacin Participacin de algunos cursos nacionales e internacionales

ESTRATEGIAS DE APRENDIZAJE:
En este mdulo el estudiante desarrolla las siguientes capacidades: -Liderazgo, toma de decisiones y trabajo en equipo, realizando los proyectos en base a problemas reales de Bioqumica. -Manejo de instrumentos y equipos que permiten medir dimensiones fsicas y elementos bioqumicos. -Tiene una formacin de hbitos de puntualidad y responsabilidad en la entrega de los informes escritos como producto de las actividades desarrolladas en los proyectos. -Valores: honestidad, colaboracin, responsabilidad, respeto, solidaridad y su capacidad de crtica, reflexiva y tolerante para el desarrollo de un proyecto cuando ste tiene un desarrollo de trabajo colaborativo. -Se fomenta el uso de TICs en la bsqueda de informacin para cada uno de los temas del mdulo y para las situaciones que se le presenten en el desarrollo del proyecto y de stas incentivar una toma de decisiones ms acertada. -Participa e integra en el desarrollo organizado de un trabajo en grupo, previendo las tareas y tiempos, as como recursos para conseguir los resultados deseados. -Comunicacin oral y escrita: con la lectura de artculos e informacin relacionada Bioqumica y metabolismo, y con diversos procesos, los cuales son discutidos y analizados en clase. Presentacin de proyectos al inicio y final en seminarios finales con otros mdulos y con otros equipos dentro del mismo mdulo. -Impulsar al estudiante para el uso de tcnicas de bioseguridad para el cuidado personal y del trabajo en equipo dentro del laboratorio.

COMPETENCIAS:
-El trabajo est relacionado con la capacidad de observacin, planeacin, solucin y resolucin de problemas, comunicacin oral y escrita. -El estudiante desarrolla la capacidad que le permite distinguir y separar las partes de un todo hasta llegar a conocer sus principios o elementos. -El estudiante desarrolla la capacidad de estructurar una sntesis, analiza problemas y toma decisiones pertinentes.

Unidad I:

INTRODUCCIN A LA BIOQUMICA
Realizar el encuadre del curso. Planificacin del curso. Mtodos de evaluacin de los crditos tericos y prcticos. Bibliografa recomendada. La lgica molecular de los organismos vivos.- Caractersticas de los seres vivos. Mtodos y objetivos de la Bioqumica. Desarrollo histrico de la Bioqumica. Relacin con otras ciencias y panormica actual.

Unidad II: INTRODUCCIN AL METABOLISMO Y BIOENERGTICA

Conocer como los organismos vivos producen y transfieren la energa qumica dentro de la clula.Anabolismo y catabolismo.- Caractersticas y regulacin de las vas metablicas.Bioenergtica.- Energa libre de Gibbs: significado termodinmico y aplicacin a los sistemas biolgicos.- Cuantificacin y caractersticas de la energa libre.- Funcin del ATP en el metabolismo.- Estructura y funcin del ATP como moneda de cambio energtico.Reacciones de hidrlisis del ATP.- Funcin del ATP en el metabolismo.- Reacciones acopladas.- Reacciones de transferencia de fosfatos. Concepto de carga energtica.- Procesos de xidoreduccin en el metabolismo.- Transformaciones redox en el metabolismo.- Estructura y caractersticas de los transportadores electrnicos.

Unidad III: LA RESPIRACIN CELULAR

Fundamentos moleculares de la funcin respiratoria.- La respiracin y los procesos oxidativos.- Esquema general de las oxidaciones biolgicas.- Cambios energticos en las reacciones redox.La respiracin celular como proceso metablico.Terminologa.Representacin.- Procesos que integran la respiracin celular.- Ubicacin subcelular.

Unidad IV: METABOLISMO DE HIDRATOS DE CARBONO

Gliclisis Introduccin.- Etapas de la va glicoltica.- Fermentacin y respiracin.- Formacin de acetil-CoA.- Balance energtico para la gliclisis.- Regulacin de la gliclisis.- Alimentacin de la secuencia glicoltica a travs de otros hidratos de carbono.- Conversin del piruvato a acetil-CoA. El Ciclo de Krebs Concepto e importancia.- Caractersticas generales.- Descubrimiento del ciclo del cido Tricarboxlico.Reacciones principales.- Destino de los cofactores reducidos.- Balance energtico del ciclo.- Localizacin intracelular de las enzimas del cido tricarboxlico.- Secuencia del ciclo de Krebs y su naturaleza anfiblica.Balance energtico.- Regulacin del ciclo.- Relaciones metablicas.- Ciclo del cido Glioxlico.

El Transporte de electrones Concepto e importancia.- Localizacin.- Complejos respiratorios.- Componentes fundamentales de cada complejo.- Balance energtico.- Secuencia del transporte electrnico.- Balance energtico.- Vinculacin con los otros procesos.- Utilizacin inmediata de la energa.- Formacin del gradiente de protones.- Inhibidores del transporte de electrones.
La Fosforilacin oxidativa Concepto e importancia.- Localizacin subcelular.- Dependencia del transporte de electrones.- Mecanismo de la fosforilacin.- Regulacin de la fosforilacin.- Inhibidores y desacopladores. Integralidad de la respiracin celular El proceso respiratorio en su conjunto.- Acoplamiento de los tres procesos.- Regulacin de la respiracin.Papel del ADP en la respiracin.- Importancia metablica de la respiracin celular.- Efectos provocados por las substancias que alteran la respiracin celular.

La glicemia como seal metablica La glicemia como indicador del estado energtico del organismo.- Concepto e importancia.- Valores normales.- Homeostasis de la glicemia.- Procesos que aportan glucosa a la sangre.- Procesos que sustraen glucosa de la sangre. Aporte endgeno de glucosa Principales glcidos de la dieta.- Importancia diettica de los glcidos.- Digestin y absorcin de los glcidos.- Distribucin de los glcidos por la sangre.- Aporte endgeno de glucosa. Aporte exgeno de glucosa La glucognesis.- Concepto e importancia.- Principales reacciones.- Regulacin de la glucognesis.La glucognesis heptica y muscular.- Balance entre la sntesis y la degradacin del glucgeno. Consumo de glucosa: La Glucogenlisis.- Concepto e importancia.- Principales reacciones.- Regulacin glucogenlisis.- Balance entre la sntesis de degradacin del glucgeno. de la

Control de la glicemia Control hormonal de la glicemia.- Ciclo hormonal.- Hormonas hipoglicemiantes.- Estructura y funcin de la insulina.- Efecto de la insulina sobre los procesos relacionados con la glicemia.- Hormonas hiperglicemiantes.- Estructura y funcin del glucagn y de la adrenalina.- Efectos de las hormonas sobre los procesos relacionados con la glicemia. Alteraciones de la glicemia Hiperglicemia.- Causas y consecuencias.- Hipoglicemia.- Causas y consecuencias. Gluconeognesis Introduccin.- Secuencia.- Regulacin.- Precursores gluconeognicos. Metabolismo del glucgeno Precursores.- Secuencia.- Su regulacin en hgado y msculo esqueltico de acuerdo con su funcionalidad. Va de las pentosas fosfatos y generacin de la energa poder reductora:. Introduccin.- Secuencia.Regulacin.- Precursores. Biosntesis de aminoazcares.- Biosntesis de glucoconjugados. Precursores.- Secuencia.Reacciones.- Regulacin.

Unidad V:
METABOLISMO DE LOS COMPUESTOS LIPDICOS
Concepto e importancia.- Digestin y absorcin de grasas.- Oxidacin de los cidos grasos.- Balance energtico global.- Oxidacin de los cidos grasos insaturados.- Cuerpos cetnicos.- Biosntesis de los cidos grasos.- Biosntesis de triacilgliceroles.- Biosntesis de fosfoglicridos.- Biosntesis del colesterol.Biosntesis de lipoprotenas y su funcin transportadora de grasas entre distintos tejidos.- Relacin con el metabolismo de carbohidratos en distintas situaciones fisiolgicas. Disturbios genticos en el metabolismo de los lpidos complejos.

Unidad VI:
METABOLISMO RELACIONADOS DE LOS AMINOCIDOS Y COMPUESTOS

Concepto e importancia.- Digestin de protenas. Degradacin oxidativa de los aminocidos.- Ligacin con el ciclo de Krebs.- Sntesis de aminas biolgicamente activas. Transporte y eliminacin del in amonio.- Ciclo de la urea.- Formacin de cido rico.- Destino de los esqueletos carbonados de los aminocidos.- Biosntesis de los aminocidos esenciales y no esenciales.- Regulacin de la biosntesis de los aminocidos.- Metabolismo del glutatin y su funcin.Metabolismo del grupo hemo.

Unidad VII:
METABOLISMO DE NUCLETIDOS
Introduccin.- Accin de endonucleasas y fosfodiesterasas.- Visin global de la sntesis de novo y las rutas de salvamento de la sntesis de nucletidos. Degradacin de los nucletidos.- Nucleotidasas, nucleosidasas y nucletido fosforilasas.- Degradacin de las bases pricas.- Reacciones y caractersticas de las enzimas implicadas.- Productos de la va: urato y cido alantico.- Degradacin de las bases pirimidnicas.- Rutas de salvamento para la sntesis de nucletidos.- PRPP: estructura, reaccin de sntesis y su regulacin.- Fosforribosiltransferasas: reaccin que catalizan; sndrome de LeschNyhan. Sntesis de novo de bases pricas y pirimidnicas.- Obtencin de NTPs: adenilato quinasa, NMP quinasas, NDP quinasas.- Metabolismo de desoxirribonucletidos.- Rutas de rescate de desoxirribonucletidos.- Reduccin de los ribonucletidos por la ribonucletido reductasa.- Biosntesis de los desoxirribonucletidos de timina.Aplicaciones mdicas del metabolismo de nucletidos.

Unidad VIII: INTEGRACIN DEL METABOLISMO

Introduccin.- Sentido de la integracin del metabolismo.Niveles de regulacin.- Perfiles metablicos de rganos y tejidos.- Regulacin del metabolismo energtico segn la ingesta.- Acciones de las principales hormonas.Respuestas al estrs metablico.- Mecanismos de regulacin de la masa corporal: la leptina.

Fotosntesis.1. Introduccin. Importancia de los procesos fotosintticos; organismos auttrofos y hetertrofos; aspectos termodinmicos de la fotosntesis.Procesos primarios de la fotosntesis.Pigmentos y transportadores electrnicos. 2. Organizacin estructural y funcional de los fotosistemas. 3. Esquema de las reacciones luminosas; fotlisis del agua. 4. Procesos secundarios de la fotosntesis. Fijacin del carbono en plantas. Ciclo de Calvin.

Champe, P.; Harvey, R.; Ferrier, D. 2006. Bioqumica. Tercera edicin. Mc Graw Hill. Mxico. 603p.

REFERENCIAS BIBLIOGRFICAS Cursos de Bioqumica I y II

1) Berg, J.M., Tymoczko, J.L. & Stryer, l. 2008. Bioqumica. (6 edicin). Editorial Revert. Barcelona. 2) Champe, P.; Harvey, R.; Ferrier, D. 2006. Bioqumica. Tercera edicin. Mc Graw Hill. Mxico. 603p. 3) Devlin, T.M. 2004. Bioqumica (4 edicin). Editorial Revert 4) Lehninger, A.; Nelson, D. L. & Cox M. M. 2006. Principios de Bioqumica, 4 edicin. Editorial Omega. Mxico. 5) Murray, R.; Mayes, P.; Granner, D.; Rodwell, V. Bioqumica de Harper. Manual Moderno. Mxico. 2001. 740 p. 6) Lozano Terruel, J.A.; Tudela Serrano, J. Prcticas de Bioqumica: Experimentacin y Simulacin. Coleccin Ciencias de la Vida. Sntesis. Madrid (1988). 7) Mathews, C.K.; Van Holde, K.E & Ahern, K.G. 2002. Bioqumica. 3 edicin. Addison Wesley. 8) McKee & McKee. Bioqumica. 2006. La base molecular de la vida. 3 Edicin. McGraw-Hill Interamericana. 9) Plummer, D. 1981. "Bioqumica Prctica" Ed. Mc Graw Hill Latinoamericana. Mxico.

EVALUACIN CURSO DE BIOQUMICA II Perodo: Marzo -Agosto/2013

ACTIVIDADES A EVALUAR
PRIMER PARCIAL SEGUNDO PARCIAL TERCER PARCIAL EVALUACIN PRINCIPAL

SUSPENSIN

Exmenes Lecciones Tareas Individuales Informes de prcticas Fichas de Observacin Trabajo en equipo Trabajo de Investigacin Portafolios Aula Virtual Otros
TOTAL

4 1

4 1

12

20

2 3 2 1

2 2

8 PUNTOS

10 PUNTOS

10 PUNTOS

12 PUNTOS

20 PUNTOS

ACTIVIDADES Y TAREAS PREVISTAS DEL CURSO DE BIOQUMICA II

ACTIVIDADES FORMAS TAREAS DEL PROFESOR TAREAS DEL ALUMNO
Asimila y toma apuntes. Plantea dudas y cuestiones complementarias. Retiene los mensajes

EVALUA CIN

HORAS PRESEN CIALES

Desarrollo de la teora

Clases Magistrales, conferencias

Explica los fundamentos tericos

PRUEBAS ESCRITAS

60

Resolucin de problemas

Explicacin de los mtodos cuantitativos para resolver problemas bioqumicos

Explica los fundamentos Asimila, toma apuntes y plantea dudas. tericos y resuelve Explica y comprende problemas tipos y dudas los procedimientos

PRUEBAS ESCRITAS

10

Prcticas de laboratorio

Trabajos en grupos, discusin e interpretacin de los resultados experimentales

Presenta los objetivos y la Realiza los metodologa, orienta el experimentos, plantea dudas y elabora trabajo y realiza el los informes seguimiento

NFORMES DE LAS PRCTICAS, PRUEBA ESCRITA

30

Seminarios, talleres, ensayos grupales

Seminarios sobre temas Presenta los objetivos, especficos, orienta el trabajo y realiza Exposiciones de notas el seguimiento cientficas

Trabaja en grupo, TRABAJOS DE presenta oralmente el CURSO, trabajo. EXPOSICIONE Contesta a las S, preguntas de compaeros y profesor SEMINARIOS

12

Tutoras personalizadas Consultas, deberes Bsquedas en la red y

Orienta y resuelve dudas Orienta la bsqueda e indica las necesidades

Recibe orientacin personalizada

Busca elementos

Molculas Biolgicas
Introduccin:

Muchas veces nos resulta difcil aceptar que los seres vivos son sistemas qumicos. Su diversidad de formas, su habilidad para reproducirse, de reaccionar ante los estmulos y; en el caso de nuestra especie, de experimentar emociones, sentimientos, nos induce a ubicarnos lejos del mundo de los slidos, lquidos y gases que la qumica describe. Pero en realidad todo lo que ocurre en los seres vivos obedece a las leyes de la qumica y de la fsica. La estructuracin y regulacin de la qumica de la vida, descansa en gran medida en grandes polmeros o macromolculas que en general, consisten en largas cadenas de subunidades unidas por enlaces covalentes. La variada interaccin entre estas macromolculas permite a clulas y organismos crecer, reproducirse y realizar todas sus actividades. Las propiedades de los compuestos orgnicos, as como sus funciones biolgicas, estn determinadas por su estructura. Cuando pensamos en las sustancias que nos rodean o que utilizamos habitualmente o que forman parte de los organismos vivos, visualizamos que muchos son compuestos orgnicos, que tienen diferentes propiedades y aplicaciones, que solo pueden entenderse en base a la diversidad de sus estructuras.

Surgen entonces preguntas: Por qu el azcar de mesa se disuelve en agua y el aceite no? Por qu los jabones ejercen su accin limpiadora? Por qu los cidos nucleicos forman dobles hlices? Por qu una protena debe ordenarse espacialmente de una determinada manera para cumplir su funcin? Por qu los fosfolpidos estn presentes en las membranas? Por qu la celulosa es un polisacrido estructural y el almidn es un polisacrido de reserva? Para contestar estas preguntas debemos comprender los conceptos bsicos de la qumica orgnica: cmo se unen el carbono con los distintos elementos, la polaridad de los enlaces, la polaridad de las molculas, las fuerzas intra e intermoleculares, la isomera, la capacidad de oxidarse o reducirse de las diferentes molculas, sus propiedades cido-base, la disposicin espacial de los tomos en una molcula. Estos conocimientos nos permitirn explicar mecanismos biolgicos complejos, como el transporte de oxgeno en sangre, el transporte a travs de la membrana y la capacidad de reconocimiento de una enzima.

OBJETIVO GENERAL:
La asignatura busca en su contexto dotar al estudiante de conocimientos y aptitudes para un desarrollo profesional de actitud crtica, emotiva, reflexiva, en las distintas facetas de ejecucin profesional relacionada al mbito metablico en las reas de Bioqumica Clnica, Alimentos o Farmacia. Adicionalmente debe alcanzar una aptitud humana y social para desarrollarlo en circunstancias a las que tenga que enfrentar y que guarden relacin con el campo en estudio, puesto que no debe descuidar su entorno social.

1. OBJETIVOS DE CARCTER GENERAL DE LOS CURSOS DE BIOQUMICA I y II

1)Utilizar apropiadamente el lenguaje de la Bioqumica; 2)Comprender las estructuras y propiedades de los componentes de la materia viva, as como la forma de interactuar para dar origen a estructuras supramoleculares organizadas; 3)Relacionar las estructuras de las mismas con la funcin biolgica que desempean; 4)Comprender el contexto fsico, qumico y biolgico en el que opera cada biomolcula, reaccin o ruta; 5)Conocer de qu manera almacena, transmite y expresa un organismo la informacin que necesita para crecer y reproducirse; 6)Analizar los principales procesos que permiten a los seres vivos adquirir y utilizar energa para mantener su existencia; 7)Entender los principios generales de regulacin e integracin de las principales rutas metablicas;

8)Desarrollar el estilo de pensamiento cientfico.

2. OBJETIVOS DE CARCTER METODOLGICO 1)Llevar a la prctica protocolos experimentales diversos; 2)Habituarse al uso de los materiales, equipos e instrumental bsico del laboratorio bioqumico; 3)Analizar los datos experimentales y elaborar el informe con los datos obtenidos de las prcticas; 4)Aplicar tcnicas espectrofotomtricas a la determinacin de enzimas, protenas y azcares;

5)Conocer y aplicar tcnicas cromatogrficas de separacin de sustancias;

6)Utilizar aplicaciones informticas para el estudio de biomolculas; 7)Emplear mtodos cuantitativos para resolver problemas bioqumicos; 8)Conocer riesgos y precauciones en el manejo del material de laboratorio.

3.2. Objetivos instructivos: 3.2.1. Objetivos tericos

1) Identificar las rutas catablicas, anablicas y anfiblicas de los diferentes componentes moleculares de la clula. 2) Conocer el intercambio de materia y energa. 3) Identificar la energa qumica en los procesos catablicos y el consumo de la misma en los procesos anablicos 4) Constatar que los hidratos de carbono son fuente de energa 5) Identificar y clasificar las formas de regulacin metablica. 6) Constatar que los lpidos son fuente de energa. 7) Verificar que los productos de degradacin pueden seguir caminos anablicos, identificando la interrelacin de los caminos metablicos. 8) Explicar que los aminocidos y por ende protenas, en determinadas circunstancias pueden usarse como fuente de energa. 9) Identificar la utilidad de los aminocidos en el ambiente metablico celular. 10)Comprender la diversidad metablica de los seres vivos e identificar los procesos comunes en todos ellos. 11)Comprender que todo el metabolismo es desarrollado por complejos enzimticos biosintetizados por las clulas.

3.2.2. Objetivos prcticos

1) Realizar balances energticos de las distintas biomolculas. 2) Localizar las interrelaciones entre los caminos metablicos. 3) Concientizarse y localizar que las alteraciones fisiolgicas estn en relacin o interactan con procesos metablicos alterados. 4) Interpretar procesos metablicos en el mbito clnico, de la industria de procesamiento de alimentos y el campo farmacutico. 5) Familiarizarse con el lenguaje y terminologa para la comprensin de la Bioqumica y otras asignaturas afines. 6) Relacionar los conocimientos metablicos, con conocimientos previos a esta asignatura y otras asignaturas afines. 7) Relacionar los conocimientos metablicos con mtodos de anlisis, que pueden ser tiles en un momento dado, de nivel crtico, curiosidad e imaginacin del estudiante. 8) Realizar proyecciones sociales en relacin a modificar, transformar o crear ciencia y tecnologa en el perfil de la bioqumica clnica, alimentos y farmacia.

UNA INTERRELACIN RECPROCA ENTRE LA BIOQUMICA Y MEDICINA HA ESTIMULADO LOS AVANCES MUTUOS. LOS PROCESOS BIOQUMICOS NORMALES CONSTITUYEN LA BASE DE LA SALUD. LA INVESTIGACIN BIOQUMICA HA MODIFICADO LA NUTRICIN Y LA MEDICINA PREVENTIVA. TODAS LAS ENFERMEDADES TIENEN UNA BASE BIOQUMICA. LOS ESTUDIOS BIOQUMICOS CONTRIBUYEN AL DIAGNSTICO, PRONSTICO Y TRATAMIENTO DE LAS ENFERMEDADES.

INTERROGANTES???:

1) Por qu ocurren los fenmenos? 2) De dnde surgen los seres vivos? 3) De qu estn hechos los organismos vivos? 4) Cmo se transforman unas en otras? 5) Cmo producir cambios en la naturaleza, en los objetos, en las cosas?
EN CADA CULTURA DIERON RESPUESTAS, SUS RESPUESTAS PROPIAS, DE ACUERDO CON EL ESTADO DE DESARROLLO SOCIAL, MATERIAL, INTELECTUAL, EXISTENCIAL DE CADA POCA.

LA BIOQUMICA ACTUAL PUEDE RESPONDER CADA UNA DE ESTAS INTERROGANTES.

OBJETO DE ESTUDIO DE LA BIOQUMICA

1) Cules son las estructuras de los componentes de la materia viva? 2) En qu concentracin se encuentran? 3) Cules son sus propiedades?
4) Cmo interaccionan y porqu se transforman?

5) Por qu los seres vivos son estructuras muy ordenadas?

6) Cmo los seres vivos obtienen la energa y la utilizan?

7) Cmo se transmite la informacin gentica?

LA LGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIVOS

Los seres vivos estn constituidos de molculas desprovistas de vida.
Los organismos vivos presentan atributos, los cuales no son encontrados en los aglomerados de la materia inanimada.

CARACTERSTICAS IDENTIFICADORAS DE LOS ORGANISMOS VIVOS

Caracterstica1
LOS ORGANISMOS VIVOS SON COMPLEJOS Y ALTAMENTE ORGANIZADOS
LAS CLULAS PRESENTAN ESTRUCTURAS INTERNAS CONSTITUIDAS DE MUCHOS TIPOS DE MOLCULAS COMPLEJAS.

Caracterstica2
CADA COMPONENTE DE UN ORGANISMO VIVO, PARECE TENER UNA FUNCIN ESPECFICA
Ej. ALAS, OJOS, HOJAS, MEMBRANA, NCLEO, MITOCONDRIA PROTENAS, CIDOS NUCLEICOS

EL ATRIBUTO MAS SOBRESALIENTE DE LOS O.V. ES SU CAPACIDAD DE EFECTUAR AUTOREPLICACIN PRECISA.

LOS ORGANISMOS VIVOS TIENEN LA CAPACIDAD DE EXTRAER Y TRANSFORMAR LA ENERGA DE SU MEDIO CIRCUNDANTE.

Caracterstica4

Caracterstica3

LA BIOQUMICA Y LA CONDICIN VITAL

S LOS ORGANISMOS VIVOS SON CONSTITUIDOS DE MOLCULAS INTRNSECAMENTE INANIMADAS,POR QU LA MATERIA VIVA DIFIERE TAN RADICALMENTE DE LA MATERIA NO VIVA, QUE TAMBIN CONSISTE INTRNSECAMENTE DE MOLCULAS INANIMADAS?

EL OBJETIVO PRIMORDIAL DE LA BIOQUMICA ES:

DETERMINAR CMO LOS AGREGADOS DE MOLCULAS INANIMADAS QUE CONSTITUYEN LOS SERES VIVOS INTERACTAN ENTRE S, PARA MANTENER Y PERPETUAR LA CONDICIN VITAL

GENEALOGA DE LA BIOQUMICA
Medicina Fisiologa: Investigaciones iniciales de la composicin qumica de la sangre, orina, tejidos, de sus variaciones normales y patolgicas. Qumica Orgnica: Estudios iniciales de las estructuras de los compuestos orgnicos naturales.

MEDICINA -FISIOLO GA

QUMICA ORGNI CA

BIO QU

MICA

ORIGEN DE LA BIOQUMICA La Bioqumica surgi como una ciencia autnoma y poderosa, poseedora de mtodos experimentales para predecir los procesos biolgicos.
Dos hechos fueron los responsables:

1. Reconocimiento de los sistemas multienzimticos como unidades catalticas.

2. La hereditariedad, uno de los aspectos ms fundamentales de la biologa, tiene una base molecular.

CAMPOS DE INVESTIGACIN DE LA BIOQUMICA

1. 2. 3. 4. 5. 6.

La diferenciacin celular y de los organismos. El origen de la vida y la evolucin. Comportamiento y memoria. Enfermedades humanas. DNA-Recombinante Genoma Humano

LA LGICA MOLECULAR DE LA CONDICIN VITAL LA BIOLOGA ES QUMICA

FILOSOFA DE TRABAJO

TODOS LOS FENMENOS BIOLGICOS SON EN LTIMO ANLISIS, DE NATURALEZA MOLECULAR

LAS MOLCULAS CONSTITUYENTES DE LOS SERES VIVOS, NO SOLAMENTE SE AJUSTAN A TODOS LOS PRINCIPIOS FAMILIARES DE FSICA Y QUMICA QUE GOBIERNAN EL COMPORTAMIENTO DE TODAS LAS MOLCULAS, SINO QUE TAMBIN SE RIGEN POR OTRO CONJUNTO DE PRINCIPIOS QUE, COLECTIVAMENTE, SON LLAMADOS DE LGICA MOLECULAR DE LA CONDICIN VITAL.

ESOS PRINCIPIOS DEBEN SER ENCARADOS COMO UN CONJUNTO DE REGLAS BSICAS QUE GOBIERNAN LA NATURALEZA, FUNCIN E INTERACCIONES DE LOS TIPOS ESPECFICOS DE MOLCULAS ENCONTRADAS EN LOS ORGANISMOS VIVOS, Y QUE LES ATRIBUYE LA CAPACIDAD DE AUTO-ORGANIZACIN Y DE AUTOREPLICACIN.
NO TODOS ESOS PRINCIPIOS HAN SIDO IDENTIFICADOS, Y ALGUNOS DE ELLOS FUERON COMPRENDIDOS PARCIALMENTE. POR ESTAS RAZONES ES MS APROPIADO HABLAR DE ESOS PRINCIPIOS COMO AXIOMAS.

AXIOMAS DE LA LGICA MOLECULAR DE LA CONDICIN VITAL

1 2

EXISTE UNA SIMPLICIDAD BSICA EN LA ORGANIZACIN MOLECULAR DE LA CLULA. EL CONJUNTO DE ORGANISMOS VIVOS POSEEN UN SLO ANCESTRO COMN.

3
4 5 6 7 8 9 10 11

LA IDENTIDAD DE CADA ESPECIE DE ORGANISMO ES MANTENIDA GRACIAS A QUE POSEE UN CONJUNTO DISTINTO DE CIDOS NUCLEICOS Y PROTENAS.
EXISTE UN PRINCIPIO BSICO DE ECONOMA MOLECULAR EN LOS SERES VIVOS. LOS ORGANISMOS VIVOS CREAN Y MANTIENEN SU ORDENACION ESENCIAL A EXPENSAS DE SU ENTORNO, EL CUAL SE TORNA, POR ESO, MAS DESORDENADO. LAS CLULAS VIVAS FUNCIONAN COMO MQUINAS ISOTERMAS. LA ESPECIFICIDAD DE LAS INTERACCIONES MOLECULARES EN LAS CLULAS RESULTA DE LA COMPLEMENTARIEDAD ESTRUCTURAL DE LAS MOLCULAS QUE INTERACCIONAN. SECUENCIAS DE REACCIONES CATALIZADAS POR ENZIMAS, PROPICIAN LOS MEDIOS PARA LA TRANSFERENCIA DE ENERGA QUMICA EN LOS PROCESOS PRODUCTORES PARA LOS CONSUMIDORES DE ENERGA. LAS CLULAS SON CAPACES DE REGULAR SUS REACCIONES METABLICAS Y LA BIOSNTESIS DE SUS ENZIMAS, PARA ALCANZAR MXIMA EFICIENCIA Y ECONOMA. LOS SMBOLOS EN QUE LA INFORMACIN GENTICA ES CODIFICADA EN EL DNA SON DE DIMENSIONES SUBMOLECULARES. LA INFORMACIN UNIDIMENSIONAL DEL DNA ES TRADUCIDA EN COMPONENTES TRIDIMENSIONALES DE LOS ORGANISMOS VIVOS A TRAVS DE LA TRADUCCIN DE LA ESTRUCTURA DEL DNA EN ESTRUCTURA PROTEICA.

RESUMEN DE LA LGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIVOS

UNA CLULA VIVA ES UN SISTEMA ABIERTO, ISOTRMICO, DE MOLCULAS ORGNICAS, QUE SE AUTO-ESTRUCTURA, SE AUTO-AJUSTA Y SE AUTOREPLICA, OPERANDO DE ACUERDO CON EL PRINCIPIO DE LA ECONOMA MXIMA DE PARTES Y PROCESOS; EL PROMUEVE MUCHAS REACCIONES ORGNICAS CONSECUTIVAS INTERLIGADAS PARA LA TRANSFERENCIA DE ENERGA Y PARA LA SNTESIS DE SUS PROPIOS COMPONENTES, POR MEDIO DE CATALIZADORES ORGNICOS QUE EL PROPIO PRODUCE.

 INTRODUCCIN A LA BIOQUMICA

LA BIOQUMICA ES UNA CIENCIA QUE NACI EN EL SIGLO XX, Y DURANTE TODO ESTE TIEMPO SLO HA PODIDO IR ACUMULANDO UNA GRAN CANTIDAD DE CONOCIMIENTOS FACTUALES, FUNDAMENTALMENTE A TRAVS DE LOS EXPERIMENTOS.

LA BIOQUMICA PERMITE FUNDAMENTAR Y CONOCER ASPECTOS RELACIONADOS CON LA ETIOLOGA Y PATOGENIA DE LAS ENFERMEDADES, AS COMO CON EL DIGNSTICO Y TRATAMIENTO.

EL PROPSITO DE LA BIOQUMICA CONSISTE EN DESCRIBIR Y EXPLICAR EN TRMINOS MOLECULARES, TODOS LOS PROCESOS QUMICOS DE LAS CLULAS VIVAS.

LAS ENFERMEDADES SON MANIFESTACIONES DE ANOMALAS DE MOLCULAS, REACCIONES QUMICAS O PROCESOS.

SALUD
OMS
SALUD ES UN ESTADO DE BIENESTAR FSICO, MENTAL Y SOCIAL COMPLETO Y NO NICAMENTE LA AUSENCIA DE ENFERMEDAD O DOLENCIA.

ENFOQUE BIOQUMICO DE SALUD:

SITUACIN EN DONDE LAS MILES DE REACCIONES INTRA Y EXTRACELULARES QUE OCURREN EN EL CUERPO, PROCEDEN A VELOCIDAD ACORDES CON SUPERVIVENCIA MXIMA EN EL ESTADO FISIOLGICO

INTERRELACIN DE LA BIOQUMICA CON LAS OTRAS CIENCIAS

El conocimiento de la Bioqumica es fundamental para todas las ciencias de la vida.

FISIOLOGA:
ESTUDIO DE LAS FUNCIONES CORPORALES.

ESTUDIO DE LAS ENFERMEDADES` CON CRITERIOS BIOQUMICOS.

PATOLOGA:

TOXICOLOGA:
LOS VENENOS ACTAN SOBRE REACCIONES O PROCESOS BIOQUMICOS.

GENTICA:
BIOQUMICA DE LOS CIDOS NUCLEICOS

BIOQUMICA

DE SLIDOS CONOCIMIENTOS DE BIOQUMICA Y FISIOLOGA.

FARMACOLOGA Y FARMACIA: REQUIEREN

PRINCIPALES CAUSAS DE ENFERMEDADES

1 AGENTES FSICOS: Traumatismo mecnico, temperaturas extremas, cambios repentinos de la presin, radiacin, choques elctricos. AGENTES QUMICOS Y FRMACOS: Ciertos compuestos txicos,
agentes teraputicos, etc.

2 3

AGENTES BIOLGICOS: Virus, Rickettsias, bacterias, hongos, formas

superiores de parsitos.

AUSENCIA DE OXGENO: Falta de suministro sanguneo, deficiencia de

la capacidad sangunea para transportar oxgeno, envenenamiento de las enzimas oxidativas.

5 6

GENTICA: Alteraciones congnita o moleculares. REACCIONES

autoinmunolgicas.

INMUNOLGICAS:

Anafilaxis,

enfermedades

7
8

DESEQUILIBRIO NUTRICIONAL: Deficiencias de nutrientes, exceso de

alimentos.

DESEQUILIBRIO ENDCRINO: Deficiencias o excesos de hormonas

RESUMEN DE LOS AVANCES MS IMPORTANTES EN BIOQUMICA

1

DETERMINACIN DE LAS ESTRUCTURAS DE MUCHAS BIOMOLCULAS

ELUCIDACIN, AL MENOS PARCIAL, LAS FUNCIONES DE MUCHAS BIOMOLCULAS. DESARROLLO DE LA TECNOLOGA DEL DNA RECOMBINANTE. AISLAMIENTO Y ESTABLECIMIENTO DE LA FUNCIN DE LOS PRINCIPALES ORGANELOS CELULARES. ANLISIS DE LAS ESTRUCTURAS Y FUNCINES DE ENZIMAS Y RIBOZIMAS. DELINEAMIENTO DE LAS VAS METABLICAS Y SUS FUNCIONES. DETERMINACIN DE LOS PRINCIPIOS MS IMPORTANTES DE LA REGULACIN METABLICA. DETERMINACIN DE LOS PRINCIPIOS MS IMPORTANTES DE LA BIOENERGTICA.

2 3

7
8

10 11

APROXIMACIONES DETALLADAS DE LA ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LA MEMBRANA. ELUCIDACIN DE LOS MECANISMOS GENERALES DE LA ACCIN HORMONAL. APROXIMACIONES DETALLADAS DE LAS BASES MOLECULARES DE MUCHAS ENFERMEDADES.

QUEDA POR RESOLVER:

1

ESTABLECIMIENTO DE LAS BASES BIOQUMICAS DEL DESARROLLO Y DIFERENCIACIN DEL ENCFALO, AS COMO LA FUNCIN DE STE. AUNQUE SE CONOCE MUY POCO DEL MATERIAL GENTICO, CASI NADA SE SABE DE LOS MECANISMOS QUE ACTIVAN O DESACTIVAN LOS GENES EUCARIOTAS DURANTE EL DESARROLLO. ENTENDER COMO SE DIFERENCIAN LAS CLULAS Y COMO SE TRANSFORMAN EN CANCEROSAS. EL CONOCIMIENTO DE EL CRECIMIENTO CELULAR NORMAL Y MALIGNO- AS COMO DE SUS REGULACINES TODAVA ES MUY LIMITADO. VIRTUALMENTE NADA SE SABE DE LAS BASES BIOQUMICAS DE LOS FENMENOS NEURALES COMPLEJOS, COMO EL ESTADO DE CONCIENCIA Y LA MEMORIA. SE DISPONE DE MUY POCA INFORMACIN SOBRE LOS MECANISMOS DE LA SECRECIN CELULAR. A PESAR DE ALGN PROGRESO SE DESCONOCEN LAS BASES MOLECULARES DE CASI TODAS LAS ENFERMEDADES GENTICAS LA SECUENCIA DEL GENOMA HUMANO TENDR UN IMPACTO ENORME SOBRE LA BIOLOGA HUMANA Y MEDICINA.

VAS METABLICAS Y TRANSFERENCIA ENERGTICA GENERALIDADES DEL METABOLISMO

Contenido:

1) 2) 3) 4) 5) 6) 7) 8) 9)

Metabolismo y nutrientes Ciclos de materia y energa Bioenergtica y metabolismo Catabolismo y anabolismo. Vas y rutas metablicas. Catabolismo aspectos generales Reacciones energticas acopladas Regulacin celular de rutas metablicas Aproximacin experimental en el estudio de una va metablica.

Objetivos
El estudiante ser capaz de:
1) Dar el concepto de metabolismo. 2) Nombrar tres funciones bsicas del metabolismo. 3) Dar el concepto de catabolismo y anabolismo, as como su acoplamiento energtico. 4) Diferenciar entre catabolismo y anabolismo. 5) Explicar la necesidad de distintas rutas para anabolismo y catabolismo. 6) Establecer un esquema general del metabolismo, indicando las distintas etapas del mismo. 7) Describir los distintos tipos de reacciones que se dan en una va metablica. 8) Nombrar tres ventajas inherentes a la organizacin de una ruta metablica en mltiples etapas. 9) Explicar con un ejemplo el concepto de reacciones acopladas energticamente. 10) Hacer un esquema global del catabolismo indicando las principales etapas distintivas. 11) Nombrar los distintos niveles de regulacin que se pueden dar en una ruta metablica. 12) Nombrar cuatro factores que puedan controlar la velocidad de cada etapa en un ruta metablica.

ORIGEN DE LOS METABOLITOS PRIMARIOS Y SECUNDARIOS

VAS METABLICAS Y TRANSFERENCIA ENERGTICA

SIGNIFICADO ETIMOLGICO

ETIMOLGICAMENTE LA PALABRA METABOLISMO PROCEDE DEL GRIEGO METABOL () QUE SIGNIFICA CAMBIO, TRANSFORMACIN.

DEFINICIN

EL METABOLISMO INTERMEDIARIO SE LO DEFINE COMO LA SUMA TOTAL DE TODAS LAS REACCIONES ENZIMTICAS QUE OCURREN EN LA CLULA

METABOLISMO
EL METABOLISMO ES UNA INTEGRACIN ALTAMENTE COORDINADA, EN EL CUAL MUCHOS MECANISMOS DE SISTEMAS MULTIENZIMTICOS INTERRELACIONADOS PARTICIPAN, INTERCAMBIANDO MATERIA Y ENERGA ENTRE LA CLULA Y SU MEDIO CIRCUNDANTE.

FUNCIONES DEL METABOLISMO

1) PRODUCIR ENERGA QUMICA A PARTIR DE LAS MOLCULAS COMBUSTIBLES O DE LA LUZ SOLAR ABSORBIDA.

2) CONVERTIR NUTRIENTES EXGENOS EN BLOQUES CONSTRUCTIVOS (MONMEROS PRIMARIOS), PRECURSORES DE COMPONENTES MACROMOLECULARES DE LAS CLULAS. 3) REUNIR TALES MONMEROS PRIMARIOS EN PROTENAS, CIDOS NUCLEICOS, LPIDOS Y OTROS COMPUESTOS CELULARES.
4) FORMAR Y DEGRADAR LAS BIOMOLCULAS REQUERIDAS EN LAS FUNCIONES ESPECIALIZADAS DE LAS CLULAS.

METABOLISMO
Objetivos
1) 2) IDENTIFICAR LOS ORGENES DE LOS NUTRIENTES Y DE LA ENERGA DE LAS CLULAS VIVAS. CONOCER LAS PRINCIPALES ESTRATEGIAS METABLICAS QUE LOS SERES VIVOS UTILIZAN PARA LA OBTENCIN Y USO DE LA ENERGA.

3)

CONOCER LAS PRINCIPALES VAS POR LAS CUALES LOS COMPONENTES CELULARES SON SINTETIZADOS Y DEGRADADOS.
LAS VAS DE TRANSFERENCIA DE LA ENERGA CELULAR.

4)

TIPOS DE METABOLISMO:
1. METABOLISMO AUTTROFO FOTOSINTTICO: LA FUENTE DE CARBONO PROCEDE DEL ANHDRIDO CARBNICO (CO2) Y LA ENERGA DE LA LUZ SOLAR. 2. METABOLISMO AUTOTROFO QUIMIOLITOTRFICO: LA FUENTE DE CARBONO TAMBIN PROCEDE DEL CO2 , PERO LA ENERGA PROCEDE DE REACCIONES QUMICAS EXOTRMICAS INORGNICAS. 3. METABOLISMO HETERTROFO: LA FUENTE DE CARBONO PROCEDE DE MOLCULAS ORGNICAS Y LA ENERGA PROCEDE DE LA OXIDACIN DE ESTS MOLCULAS ORGNICAS ABSORBIDAS A TRAVS DE LA MEMBRANA PLASMTICA.

FUENTES DE CARBONO Y ENERGA PARA LA VIDA CELULAR

De acuerdo a las fuentes de carbono las clulas se pueden dividir en dos grupos:

Clulas autotrficas
(Que se alimentan por s mismas).
Utilizan el dixido de carbono como la nica fuente de carbono y a travs de este construyen los esqueletos carbnicos de todas las biomolculas orgnicas Ej. Clulas fotosintticas y algunas bacterias

Clulas heterotrficas:
(Que reciben alimentos de otros).
No pueden utilizar el dixido de carbono, y requieren obtener el carbono a partir de su ambiente, en forma reducida y relativamente compleja como la glucosa.
Ej. Clulas de los animales superiores y la mayora de microorganismos

FUENTES DE ENERGA Y CARBONO PARA EL METABOLISMO

Pueden ser divididas en dos clases principales:

CLULAS HETEROTRFICAS

AERBICOS: Usan el oxgeno molecular como el ltimo aceptor de electrones provenientes de sus donadores orgnicos de electrones.
ANAERBICOS: En vez del oxgeno, usan otras molculas como aceptores de electrones.
Ciertos organismos llamados facultativos pueden vivir tanto aerbica, como anaerbicamente Los organismos incapaces de utilizar el oxgeno se denominan anaerbicos restrictos.

CICLOS DEL CARBONO Y OXGENO

CICLO DEL CARBONO ES ENORME. SE ESTIMA QUE SE RECICLA 3,5 x 1011 TONELADAS DE CO2 ANUALMENTE

EJEMPLOS DE CLULAS CON MAYOR GRADO DE AUTO-SUFICIENCIA

(Algas verdes azules)

CO2

1 2 3 4

Fuentes de carbono Fuentes de nitrgeno Fuentes de energa Fuentes de electrones

Nitrgeno atmosfrico Luz solar Agua

EL FLUJO DE ENERGA EN LA BIOSFERA

ENERGA SOLAR FOTOSNTESIS ENERGA QUMICA (ATP, NADPH, GLUCOSA)

2
3

CONTRACCIN

TRANS PORTE

BIOSN TESIS

LA ENERGA SOLAR ES EL ORIGEN DE TODAS LAS FORMAS DE ENERGAS ENCONTRADAS EN LAS CLULAS

Energa disipada (calor, entropia)

METABOLISMO
Est dividido en dos fases

CATABOLISMO
Fase degradativa del metabolismo

ANABOLISMO
Fase biosinttica del metabolismo

FASES DEL METABOLISMO:

Conjunto de las reacciones de biosntesis necesarias para el crecimiento de nuevas clulas y el mantenimiento de todos los tejidos.
Las reacciones anablicas incluyen la biosntesis enzimtica de los cidos nucleicos, los lpidos, los polisacridos y las protenas; todos estos procesos necesitan la energa qumica suministrada por el ATP.

ANABOLISMO
O FASE BIOSINTTICA

CATABOLISMO O FASE DEGRADATIVA

El catabolismo implica la degradacin de las molculas qumicas complejas (glcidos, lpidos y protenas) en sustancias ms sencillas (cido actico, amonaco, cido lctico, dixido de carbono o urea), que constituyen los productos de desecho expulsados del cuerpo a travs de los riones, el intestino, los pulmones y la piel.
En dicha degradacin se libera energa qumica que es almacenada en forma de ATP hasta que es requerida por los diferentes procesos anablicos.

METABOLISMO INTERMEDIARIO
Se utiliza este trmino para designar los precursos qumicos del metabolismo. Los intermediarios del metabolismo son llamados metabolitos.

CATABOLISMO Y ANABOLISMO

En bioqumica, una ruta metablica o va metablica es una sucesin de reacciones qumicas que conducen de un substrato inicial a uno o varios productos finales, a travs de una serie de metabolitos intermediarios. Por ejemplo, en la ruta metablica que incluye la secuencia de reacciones:

A es el sustrato inicial, E es el producto final, y B, C, D son los metabolitos intermediarios de la ruta metablica.

Tipos de rutas metablicas

Normalmente metablicas: se distinguen tres tipos de rutas

Rutas catablicas. Son rutas oxidativas en las que se libera energa y poder reductor y a la vez se sintetiza ATP. Por ejemplo, la gluclisis y la -oxidacin. En conjunto forman el catabolismo. Rutas anablicas. Son rutas reductoras en las que se consume energa (ATP) y poder reductor. Por ejemplo, gluconeognesis y el ciclo de Calvin. En conjunto forman el anabolismo. Rutas anfiblicas. Son rutas mixtas, catablicas y anablicas, como el ciclo de Krebs, que genera energa y poder reductor, y precursores para la biosntesis.

LAS TRES ETAPAS DEL METABOLISMO OXIDATIVO DE GLCIDOS, GRASAS Y PROTENAS:

PRIMERA ETAPA: LOS CARBONOS DE ESTAS MACROMOLCULAS DAN LUGAR A MOLCULAS DE ACETIL-COA DE DOS CARBONOS, E INCLUYE LAS VAS CATABLICAS DE AMINOCIDOS (P. ej. DESAMINACIN OXIDATIVA, -OXIDACIN DE CIDOS GRASOS Y GLUCLISIS). SEGUNDA ETAPA: La ACETIL-CoA INGRESA ENTONCES A LAS MITOCONDRIAS PARA PARTICIPAR EN UNA SERIE DE REACCIONES BIOQUMICAS DE OXIDACIN QUE ES EL CICLO DE KREBS O CICLO DEL CIDO CTRICO, CONSIDERADO EL EMBUDO DEL METABOLISMO, CONSISTEN OCHO REACCIONES ENZIMTICAS TODAS LAS REACCIONES CATABLICAS DE LA RESPIRACIN AEROBIA.

TERCERA ETAPA: ES LA FOSFORILACIN OXIDATIVA, CUYO PRODUCTO FINAL SON LAS COENZIMAS NADH+ Y FADH2 REDUCIDAS AL SER CARGADAS DE ELECTRONES, EN LA CUAL EL PODER REDUCTOR GENERADO, SE EMPLEA PARA LA SNTESIS DE ATP, SEGN LA TEORA DEL ACOPLAMIENTO QUIMIOSMTICO, COMO SE PUEDE APRECIAR EN EL ESQUEMA ANTERIOR.

BIOENERGTICA
CICLO DEL ATP

BIOENERGTICA: Campo de la Bioqumica relacionado con la transformacin y empleo de la energa por la clula.

Los organismos vivos obtienen su energa a partir del medio circundante.

CLULAS HETEROTRFICAS: Obtienen energa de los nutrientes. CLULAS FOTOSINTTICAS: Obtienen su energa a partir de los rayos provenientes del sol.

Esas formas de energas son transformadas por las clulas en energa qumica en forma de ATP (Adenosina-trifosfato), que funciona como transportar de energa para los procesos celulares que dependen de un suplemento energtico.

BIOENERGTICA:
MULTITUD DE TRANSFORMACIONES QUMICAS OCURREN DURANTE LA VIDA DE LOS SISTEMAS BIOLGICOS, LAS CUALES PROVEEN DE LA ENERGA NECESARIA PARA MANTENER LA ESTRUCTURA DE LA CLULA Y COORDINAR SUS ACTIVIDADES.

ATP
La adenosina trifosfato (abreviado ATP, y tambin llamada adenosn-5'-trifosfato o trifosfato de adenosina) es una molcula utilizada por todos los organismos vivos para proporcionar energa en las reacciones qumicas. Tambin es el precursor de una serie de coenzimas esenciales como el NAD+ o la coenzima A. El ATP es uno de los cuatro monmeros utilizados en la sntesis de ARN celular. Adems, es una coenzima de transferencia de grupos fosfato que se enlaza de manera no-covalente a las enzimas quinasas (co-sustrato). El ATP es un nucletido trifosfato que se compone de adenosina (adenina y ribosa, como -Dribofuranosa) y tres grupos fosfato. Su frmula molecular es C10H16N5O13P3. La estructura de la molcula consiste en una base purina (adenina) enlazada al tomo de carbono 1' de un azcar pentosa. Los tres grupos fosfato se enlazan al tomo de carbono 5' de la pentosa. Los grupos fosforilo, comenzando con el grupo ms cercano a la ribosa, se conocen como fosfatos alfa (), beta () y gamma (). El ATP es la principal fuente de energa para la mayora de las funciones celulares. Esto incluye la sntesis de macromolculas como el ADN, el ARN y las protenas. Tambin desempea un papel fundamental en el transporte de macromolculas a travs de las membranas celulares, es decir, en la exocitosis y endocitosis. Debido a la presencia de enlaces ricos en energa (entre los grupos fosfato son los enlaces anhdrido del cido), esta molcula se utiliza en los seres vivos para proporcionar la energa que se consume en las reacciones qumicas. De hecho, la reaccin de hidrlisis de la adenosina trifosfato en adenosina difosfato y fosfato es una reaccin exergnica donde la variacin de entalpa libre estndar es igual a 30,5 kJ/mol. Por el contrario, la reaccin de sntesis de la adenosina trifosfato a partir de adenosina difosfato y fosfato es una reaccin endergnica donde la variacin de entalpa libre estndar es igual a +30,5 kJ/mol. La reaccin de hidrlisis del ATP en adenosn monofosfato (y pirofosfato) es una reaccin exergnica donde la variacin de entalpa libre estndar es igual a -42 kJ/moL. La energa se almacena en los enlaces entre los grupos fosfato.

Hidrlisis del ATP

Se puede representar as: A-P~P~P Donde ~ son los enlaces anhdrido de cido, que son de alta energa. En la hidrlisis del ATP se est hidrolizando uno de esos enlaces anhdrido de cido. Esto libera gran energa, concretamente 7,7 kcal/mol. Es decir: G = -7,7 kcal/mol o lo que es lo mismo, aproximadamente - 31 KJ/mol Es una reaccin muy exergnica. Su es 11. As se comprende que el ATP tiene tendencia a hidrolizarse de forma natural y liberar energa.

Donde se necesita energa, el ATP es el principal encargado de donarla, rompindose el enlace fosfato. Pero ser preciso resintetizar otra vez el ATP, en otros procesos, generndose un ciclo sin fin en los seres vivos. En los procesos OXIDATIVOS se libera energa, parte de la cual es utilizada para la sntesis de ATP:
ADP + Pi --------------------------> ATP (

G0' = +7.3 kcal/mol)

Otros procesos, por contra, precisan un aporte de energa, suministrada por el ATP, con lo que existe un ciclo del ATP en muchos procesos biolgicos.

Su estructura es responsable de su capacidad como intermediario energtico en las reacciones biolgicas, ya que le confiere un

G0' muy negativo para su hidrlisis. Por ello, el ATP posee una elevada capacidad de transferencia de restos fosfato

CICLO DEL ATP

EL ATP ES UN INTERMEDIARIO QUMICO QUE CONECTA LOS PROCESOS QUE LIBERAN ENERGA CON AQUELLOS QUE REQUIEREN APORTE DE ENERGA. SU PAPEL EN LAS CLULAS ES ANLOGO AL DEL DINERO EN LAS RELACIONES COMERCIALES: SE PRODUCE: REAC. EXERGNICAS SE CONSUME: REAC. ENDERGNICAS

CICLO DEL ATP

Trabajo qumico

Trabajo osmtico

Trabajo mecnico

Trabajo qumico

- Cules son las caractersticas estructurales que hacen del ATP un compuesto rico en energa? - Por qu es necesaria en la clula un molcula como el ATP?

Cul es la intensidad del ciclo del ATP?, Qu tan rpido ocurre?

El ciclo del ATP ocurre continuamente en

todas las clulas. Este ciclo se completa tan rpidamente, que 10 millones de nuevas molculas de ATP son producidas en cada clula cada segundo!!!

En qu tipos de trabajos las clulas usan el ATP?

La energa qumica liberada al romperse los enlaces de los grupos fosfato, se usa para tres tipos de trabajos celulares: 1.El ATP provee energa para las funciones mecnicas de la clulas. Por ejemplo energa para mover cilios o flagelos. Una clula muscular necesita energa para contraerse durante los movimientos. 2.El ATP provee energa para el transporte de iones y molculas (transporte activo) a travs de la membrana celular. 3.El ATP provee energa durante los procesos de biosntesis de molculas orgnicas.

ATP
ATP, ADP, AMP: presentes en todas las formas de vida, desempean las mismas funciones universalmente en el citosol, mitocondria y ncleo. pH 7: ATP y ADP forman aniones con carga mltiple, pues sus grupos fosfatos estn ionizados completamente. Fluido celular: ATP y ADP se unen al magnesio presente formando complejos. Durante el metabolismo en las clulas, la concentracin de ATP permanece relativamente constante en el estado estacionario; su velocidad de formacin se iguala con la de escisin. El grupo fosfato terminal del ATP experimenta un proceso continuo de separacin y sustitucin a partir del conjunto de fosfato inorgnico.

Conversin de energa en clulas biolgicas

Acople de reacciones exergnicas (G 0) y endergnicas (G > 0)
La energa liberada de la oxidacin de los alimentos se almacena en la molcula de ATP, la cual tiene capacidad de hidrolizarse, perder un grupo fosfato terminal y formar ADP: ATP (aq) + H2O ADP (aq) + Pi- (aq) + H3O+(aq)
Pi- : fosfato inorgnico (por ej. H2PO4-)

A 37oC (310 K):

Go = - 30.5 kJ/mol Ho = - 20 kJ/mol So = + 34 J/K mol

TERMODINMICA Y SERES VIVOS

Los organismo vivos NO experimentan incremento en su desorden interno o entropa, cuando metabolizan sus elementos nutritivos, sino el ENTORNO durante el PROCESO VITAL. Los organismo vivos CONSERVAN su ordenacin interna consumiendo energa libre de los elementos nutritivos de su entorno o de la luz solar, al que devuelven en cantidad igual pero degradada, la mayor parte en forma de calor, que se disipa en el resto del universo.

Campo de la Bioqumica relacionado con la transformacin y empleo de la energa por la clula.

BIOENERGTICA:

EN UNA REACCIN QUMICA PUEDE CALCULARSE LA VARIACIN DE ENERGA LIBRE ESTNDAR

Cada reaccin la posee. Es una constante para cada reaccin que puede calcularse a partir de la constante de equilibrio de la reaccin en condiciones estndar.

CLCULO DE LA VARIACIN DE ENERGA

LIBRE ESTNDAR DE UNA REACCIN .
Keq y variacin de energa libre estndar
Cuando Keq es Mayor a 1 1 Menor a 1 G NEGATIVA CERO POSITIVA Direccin DERECHA EQUILIBRIO IZQUIERDA

ATP COMO RESERVORIO DE ENERGA

Las clulas acostumbran a guardar la energa necesaria para sus reacciones en ciertas molculas, la principal es el ATP.

1.

ATP + H2O > ADP + Pi Go' = -7,3 Kcal/mol (exergnica)

ADP + H2O > AMP + Pi Go' = -7,3Kcal/mol (exergnica)

2.

3. Para sintetizar ATP (adenosn-trifosfato) a partir de ADP (adenosndifosfato) se debe suministrar por lo menos una energa superior a 7,3 Kcal. Las reacciones que, tpicamente suministran dicha energa son las reacciones de oxidacin.

4. El ATP es usado como donante de energa en muchas reacciones anablicas (de sntesis) acoplndose a las mismas en manera tal que el G sea negativo y la reaccin se produzca espontneamente.

LEYES DE LA TERMODINMICA
1. Ley en cualquier transformacin qumica o fsica la cantidad total de energa del universo permanece constante

2. Ley todos los cambios fsicos o qumicos tienden a evolucionar en el sentido que la energa til experimente una degradacin irreversible hacia una forma al azar, desordenada llamada entropa.

EL INCREMENTO DE ENTROPIA DEL UNIVERSO DURANTE LOS PROCESOS BIOLGICOS, COMO ES IRREVERSIBLE, PROPORCIONA LA FUERZA IMPULSORA Y LA DIRECCIN A TODAS LAS ACTIVIDADES BIOLGICAS.

Los organismos vivos producen ENTROPIA constantemente en sus alrededores como contribucin para mantener su propio orden interno.