METABOLISMO ENERGTICO BACTERIANO

Metabolismo
Reacciones de mantenimiento (catabolismo): Energa Anabolismo: biosntesis Poder reductor Precursores metablicos

Produccin de ATP

Fosforilacin a nivel de sustrato (fermentaciones)

Fosforilacin oxidativa (respiraciones) Fotofosforilacin (fotosntesis)

Reacciones redox exergnicas G0'= - nFE0'

F = cte. de Faraday = 96,6 kJvolt1equivalentes--1 E0' es la diferencia entre los potenciales de reduccin del donador y del aceptor

Torre de electrones

Transportadores de electrones
FAD

Hem

Coenzima Q
NAD

Tipos de metabolismos energticos

Bacterias fottrofas Bacterias quimitrofas

 C Esqueleto macromolculas (normalmente tambin aportan O e H, salvo el CO2). Probablemente todos los organismos puedan fijar CO2 en pequeas cantidades Se reserva la denominacin de Auttrofos para los organismos que usan CO2 como fuente nica o principal de C (se requiere gran cantidad de E para esto). La mayora de los auttrofos son fotosintticos, algunos oxidan molculas inorgnicas para obtener E. Hetertrofos usan molculas orgnicas preformadas y reducidas para obtener C y E.

Fuentes de carbono, electrones y energa

Fuente de carbono Hetertrofos: compuestos orgnicos Auttrofos: C02 Fuente de energa: Fottrofos: luz Quimitrofos: oxidacin de compuestos orgnicos o inorgnicos Fuente de electrones Littrofos: compuestos inorgnicos reducidos Organtrofos: compuestos orgnicos

PrincipalesTipos Nutricionales de Microorganismos

Fuente de C, E y e Microorg represent

Cadenas de transportadores de electrones y fuerza protn motriz

Cadenas de transportadores de electrones y fuerza protn motriz

NADH deshidrogenasas, unidas a la cara interna de la membrana. Aceptan tomos de H a partir del NADH, y se los ceden a las flavoprotenas Flavoprotenas (Fp, un tipo de riboflainas), dotadas de grupos FAD o FMN. Pueden acepar tomos de H, pero a su vez ceden electrones. Protenas no hmicas de Fe-S (Fe/S protenas). Algunas poseen agrupamientos de Fe2S2 (como la ferredoxina) y otras Fe4S4. Transportan solamente electrones. Quinonas. Son molculas muy hidrofbicas, inmersas en la membrana, capaces de moverse dentro de ella. Sirven como aceptores de tomos de H, pero slo ceden electrones. En bacterias podemos encontrar dos principales tipos de quinonas: ubiquinona (UQ)menaquinona (MQ), ms frecuente en bacterias Gram-positivas. Citocromos (protenas hmicas con Fe quelado). Sufren oxidacin y reduccin por prdida y ganancia de un electrn cada vez, a travs del Fe del centro de la molcula. Los citocromos son de varias clases, segn el tipo de grupo hemo (ej. tipo a, b, c, etc), y a veces forman complejos fuertes con otros citocromos (ej., cit bc1) o con Fe/S-protenas.

F0 complejo integral de membrana, trasloca protones. La subunidad a es la encargada de canalizar los protones a travs de la membrana, mientras que las dos subunidades b sobresalen hacia el lado citoplsmico, interaccionando con la F1. Las 12 subunidades de c se disponen formando una especie de cilindro transmembranoso, capaz de rotar en ambos sentidos. F1 constituye la porcin intracitoplasmtica, dotada de los sitios catalticos. La parte ms saliente de F1 consta de 3 subunidades alternando con 3 subunidades . La traslocacin de unos 3 o 4 protones a travs de F0 est acoplada, por medio de grandes cambios conformacionales, a la sntesis de una molcula de ATP mecanismo de catlisis rotacional: El que los 3-4 protones entren por F0 (probablemente a travs de la protena a) provoca la rotacin del cilindro de c12, lo que supone una torsin que se transmite a la F1 a travs de las protenas . lo que a su vez provoca un cambio conformacional en las subunidades .El cambio conformacional en las subunidades permite que a ellas se una ADP y Pi. El trabajo realizado por el sistema se usa para producir entonces el ATP, volviendo las a su configuracin original, preparadas para un nuevo ciclo de sntesis de ATP.La funcin de b2 es equivalente a la del estator del motor: sirven para evitar que las y se muevan cuando se produce la torsin de .

Siderforos
Ferricromo: hodroxamato cclico producido por hongos Enterobactin: catecolato cclico producido por E. coli

El in Fe+++ forma complejo con tres grupos siderforos Aquaquelina: porcin proteica de unin a Fe

QUIMIOLITOTROFA
En los quimiolitotrofos, el donador de electrones es una molcula inorgnica reducida. Esta capacidad slo ha evolucionado en ciertos grupos de procariotas Quimiolitotrofos tpicos: son por lo general respiradores aerobios Fijan CO2 por el ciclo de Calvin, disponen de reservas de RuBisCo
Bacterias del hidrgeno (facultativas) (oxidan el H2 hasta H2O) Alcalgenes eutrophus, Pseudomonas facilis, Aquaspirillum autotrophicum, etc Nitrobacter (pasan Fe2+ a frrico, Fe3+) Thiobacillus ferrooxidans, lixiviacin de sulfuros (S2-) y azufre elemental (S0) cido sulfrico (SO4H2) Thiobacillus thiooxidans, Sulfolobus acidocaldarius respiran NH3 para convertirlo en NO2Nitrosomonas respiran NO2- para convertirlo en NO3Nitrobacter

del hierro del azufre

Nitrificantes

oxidadoras de amoniaco (nitrosas) oxidadoras del nitrito (ntricas)

FUENTE DE ENERGIA Y NUTRICIN

Las Bacterias del azufre toman compuestos de este como el sulfuro de hidrgeno, azufre elemental y el tiosulfato, como fuente de energa. Las Bacterias del hierro son un grupo especializado de Littrofos que son capaces de usar el hierro reducido como nica fuente de energa.

CARACTERSTICAS
Las bacterias oxidantes del azufre y de sulfuros suelen ser litotrficas y producen sulfato. Con excepcin de sulfolobus los littrofos sulfurosos restantes son: Eubacterias y Fologenticamente pertenecen a las bacterias prpuras.

CARACTERSTICAS
Pueden

distinguirse dos amplias clases ecolgicas : Las que viven en pH neutro Las que viven en pH cido Las bacterias oxidantes del azufre tambin son capaces de catalizar la oxidacin del sulfuro.

CARACTERSTICAS
La mayor parte de las bacterias oxidantes del hierro tambin oxidan el azufre y son acidoflicas obligadas Las ferruginosas transforman compuestos solubles de hierro en compuestos insolubles

PRINCIPALES GNEROS
Del azufre: Thiobacillus Thiosphera Thiomicrospira Thermotrix Beggiatoa Sulfolobus

PRINCIPALES GNEROS
Del hierro: A pH neutro: Gallionella ferruginea Sphaeritillus natans Leptothrix ochracea A pH cido Thiobacillus ferroxidans

El Thiobacillus feroxidans vive en un ambiente en que el cido sulfrico es el cido dominante y estn presentes grandes cantidades de sulfato.

HABITATS DE ALGUNAS BACTERIAS

HABITATS DE ALGUNAS BACTERIAS

Bacterias oxidantes del azufre como las Beggiatoa se encuentran en la naturaleza en habitats ricos en H2S

Lixiviacin de minerales
Obtencin de Zn, Co, Ni, Mo, Sb, Co, Pb etc, a partir de minerales de baja riqueza (sulfuros metlicos) para transformarlos en los SO4= metlicos solubles en agua por accin de bacterias oxidadoras de hierro y azufre.

A cielo abierto, el agua se filtra a travs de gruesas capas de material rocoso que contiene el mineral desmenuzado. Se recoge la solucin que contiene las sales sulfatadas y a partir de all se obtienen los metales por procesos de concentracin y precipitacin. La disolucin de los sulfuros tiene lugar por varios procesos: oxidacin bacteriana de los compuestos reducidos de azufre o azufre metlico a cido sulfrico y del hierro ferroso a frrico, como as tambin por oxidacin qumica, que requiere sulfrico o hierro. Las bacterias aseguran suministros de sulfrico y la regeneracin del hierro frrico.

HABITATS DE ALGUNAS BACTERIAS

Organismos termfilos extremos como el sulfolobus se desarrolla en hbitats volcnicos a temperaturas sobre 90C y a valores de pH de 1-5 a condiciones anaerobias.

Yellowstone, Sulfolobus

Mecanismo de generacin de ATP en quimiolitotrofos

Los electrones extrados del donador exgeno (inorgnico) pasan a una cadena transportadora de electrones hasta un aceptor final (que suele ser el oxgeno en los litotrofos tpicos, y que es nitrito en los anammox), generando una fuerza protnmotriz que se transforma en ATP por ATP-sintasas.

A excepcin del H2, los dems donadores inorgnicos de electrones tienen un potencial de reduccin E0 menor que el del NADH, por lo que la oxidacin de estos donadores inorgnicos slo puede generar energa, pero no poder reductor de modo directo. Para obtener poder reductor emplean transporte inverso de electrones

Flujo inverso de electrones (genera poder reductor)

Flujo de electrones en la cadena de transporte de Nitrobacter. A la derecha: La fuerza protn motriz se produce cuando los electrones son transportados desde el NO2 hasta el O2 y se acopla con la generacin de ATP. A la izquierda: parte de la fpm se utiliza para forzar electrones a fluir desde el nitrito hasta el NAD+. Se utilizan para ello el citocromo c y cuatro complejos ms: 1: NADH-Ubiquinona oxidoreductasa, 2: ubiquinol-citc oxidoreductasa, 3:nitrito oxidasa y 4: citocromo aa3 oxidasa.

oxidacin anaerobia del amoniaco (ANAMOX)

Proceso que acopla en anaerobiosis la oxidacin del amoniaco con la reduccin de los nitritos, produciendo nitrgeno molecular y agua (NH4+ + NO2N2 + 2 H2O) Brocadia anammoxidans, del phylum de los Planctomicetos (compartim con membrana; pared proteica). Auttrofas, aunque carecen de ciclo de Calvin, an se desconoce el mecanismo de fijacin del CO2.

Generacin de energa por oxidacin del azufre

a) Oxidacin directa de sulfito

CTE y fosforilacin oxidativa

b) Formacin de adenosina 5-fosfosulfato (APS)

Produccin de ATP por fosforilacin a nivel de sustrato

CTE y fpm

Arqueas metanognicas

Capaces de obtener energa acoplando la oxidacin del hidrgeno molecular con el uso de CO2 como aceptor de electrones 4H2 + CO2 CH4 + 2H2O Fijan autotrficamente el carbnico, aunque por rutas especiales diferentes al ciclo de Calvin.

a: Sulfolobus y bacterias verdes del azufre

PEP

Gucosa-P

Bacterias anaerbicas quimiolitotrficas

Dador inorg. de e
H2 + CO2 CH4 H2 + CO2 CH3-COOH H2 + SO4= SH2

Grupo
Resp. de carbonatos, metanognicas Resp. de carbonatos, acetognicas Resp. de sulfatos, sulfurognicas

Especies
Methanobacterium thermoautotrophicum Acetobacterium woodii Desulfovibrio desulfuricans, Desulfobacterium autotrophicum

H2 + S0 SH2
H2 + NO3- N2

Resp del azufre, sulfurognicas

Resp de nitratos, desnitrificacin

Desulfuromonas acetoxidans
Paracoccus denitrificans

FOTOFOSFORILACIN
Produce tambin un gradiente electroqumico de protones a ambos lado de una membrana, el cual a su vez alimenta ATP-sintasas. Estrictamente hablando, la fotosntesis alude a la fotoautotrofa, es decir, la combinacin de fototrofa o captacin de esa energa lumnica (obtenida en la fase luminosa) con su empleo para fijar el CO2 (autotrofa) hasta material celular (fase oscura). Existen procariotas fottrofos que captan la energa de la luz, pero emplean materia orgnica como fuente de carbono, por lo que se denominan fotoheterotrofos.

COMPONENTES DEL APARATO FOTOSINTTICO

Fotosistemas: catalizan la conversin de la energa de la luz, capturada en molculas excitadas de clorofila o bacterioclorofila en una forma til de energa. Estn constituidos por complejo antena (con pigmentos captadores de luz) y centro de reaccin (con las clorofilas o bacterioclorofilas fotoactivas). Los centros de reaccin suelen estar situados dentro de estructuras membranosas (tilacoides en cianobacterias, cromatforos o invaginaciones de MC en bacterias prpuras o la propia membrana citoplsmica en bacterias anoxignicas verdes y heliobacterias). Cadenas transportadoras de electrones: situadas en membranas estn ligadas de forma estrecha al centro de reaccin, crean una fuerza protn-motriz.

Principales molculas implicadas

Clorofilas y bacterioclorofilas (pueden formar parte tanto de los pigmentos antena como de los centros de reaccin) Carotenoides. Forman parte del complejo antena, funcin principal de proteccin. Ficobiliprotenas (complejo antena en Cianobacterias) Feofitinas y bacteriofeofitinas. Son similares a las respectivas (bacterio)clorofilas, excepto que no estn queladas con Mg++. Actan como aceptores inmediatos del electrn que pierde cada (bacterio)clorofila del centro de reaccin.

Estructura de la clorofila

Pigmentos accesorios

FOTOFOSFORILACIN ACCLICA
El flujo de electrones sirve para generar f.p.m. y por lo tanto ATP, y equivalentes de reduccin [NAD(P)H+H+] que hacen falta para la fijacin del CO2. Esos electrones deben de proceder de una fuente exgena para poder regenerar la forma basal del pigmento fotoactivo. bacterias purpreas (o rojas) -transporte inverso de electrones bacterias verdes del azufre heliobacterias

Fotofosforilacin en Cianobacterias

FOTOFOSFORILACIN CCLICA

Esquema del funcionamiento del fotosistema de la bacteria purprea Rhodopseudomonas viridis

Los dadores externos No regeneran la bacterioclorofila, la produccin de equiv de reduccin no va ligada a fase luminosa Fijan CO2 por Ciclo de Calvin

FOTOFOSFORILACIN ACCLICA
Chlorobium limicola, bacteria verde del azufre Tanto la produccin de equivalentes de reduccin como la fotofosforilacin son resultado de la fase luminosa (el aceptor estable de e, FeS, tiene potencial suficientemetne electronegativo para refucir NAD+). Fijacin de CO2 por ciclo reductivo de cidos tricarboxlicos MK: menaquinona Fd: ferredoxina

FOTOFOSFORILACIN CCLICA

Heliobacterias
Las heliobacterias (bacterias esporulantes fototrofas) al igual que las bacterias verdes, tienen como primer aceptor estable de electrones una Fe/S protena con potencial redox suficientemente bajo (DE0' = -0.5 V) como para reducir NAD+. Por lo tanto, su poder reductor deriva igualmente de la reaccin luminosa. La regeneracin de la bacterioclorofila oxidada es mediante un aceptor exgeno orgnico (son fotoheterotrofos, y parece que no son capaces de fijar CO2).

Carctersticas de los sistemas fotosintticos microbianos

Halobacterium salinarium
Capacidad de sntesis de ATP mediada por la luz, pero sin implicacin de clorofilas ni fijacin de CO2. Cuando estas bacterias se encuentran en condiciones de baja aireacin (bajas tensiones de O2), sintetizan una cromoprotena especial llamada bacteriorrodopsina, que forma parches de color prpura en sus membranas citoplsmicas.

Bacteriorrodopsina, incluye la molcula retinal fotosensitiva (en prpura) y los aa involucrados en el transporte inico, bombeo de H+ (flechas: igual direccin, nmeros: igual secuencia)

Retinal (el mismo de la rodopsina retiniana de los vertebrados), es un carotenoide C20 que puede absorber la luz y catalizar la transferencia de protones a travs de la membrana. Se encuentra unido como una base de Schiff a una lisina de la bacteriopsina (porcin proteica)

Heterotrofa

Estados del catabolismo

Componentes de las cadenas de transporte respiratorio NADH deshidrogenasas cara interna de MC. Aceptan tomos de H a partir del NADH, y se los ceden a las flavoprotenas Flavoprotenas (Fp, un tipo de riboflainas), dotadas de grupos FAD o FMN. Pueden acepar tomos de H, pero a su vez ceden electrones. Protenas no hmicas de Fe-S (Fe/S protenas). Algunas poseen agrupamientos de Fe2S2 (como la ferredoxina) y otras Fe4S4. Transportan solamente electrones. Quinonas, muy hidrofbicas, inmersas en la membrana, capaces de moverse dentro de ella. Sirven como aceptores de tomos de H, pero slo ceden electrones. En bacterias podemos encontrar dos principales tipos de quinonas: ubiquinona (UQ)menaquinona (MQ), ms frecuente en bacterias Gram-positivas. Citocromos (protenas hmicas con Fe quelado). Sufren oxidacin y reduccin por prdida y ganancia de un electrn cada vez, a travs del Fe del centro de la molcula. Los citocromos son de varias clases, segn el tipo de grupo hemo (ej. tipo a, b, c, etc), y a veces forman complejos fuertes con otros citocromos (ej., cit bc1) o con Fe/S-protenas.

Cadenas respiratorias
Ramificaciones (a nivel de citocromos terminales)

Flexibilidad en la transferencia de electrones

Ej: Cuando Azotobacter (fijador aerobio de N2) crece fijando nitrgeno molecular, usa una ramificacin que gasta muchsimo oxgeno como aceptor final (aunque el rendimiento en ATP es menor); con ello logra evitar que el oxgeno pase al citoplasma, con lo que protege a la nitrogenasa de la inactivacin por oxgeno.

Cadenas respiratorias
P. ej., si E. coli dispone de oxgeno lo usar como aceptor final de electrones, pero dependiendo de su concentracin recurrir a una u otra rama. (A su vez, esto puede estar relacionado con la fase de crecimiento: en la fase exponencial, cuando hay todava suficiente nivel de O2, se usa una rama, mientras que en fase estacionaria, cuando el nivel de O2 ha bajado, se usa la otra). El mismo E. coli y otras bacterias anaerobias facultativas, en un ambiente sin oxgeno pero con presencia de nitratos puede usar estos aceptores alternativos con las correspondientes variantes en los citocromos terminales.

RESPIRACIONES ANAEROBIAS

Aceptor prod. reducido Procariotas (Ejemplos) NO3- NO2- N2 NO3- NO2SO42- S0 SH2 fumarato succinato CO2 CH4 Fe3+ Fe2+ Pseudomonas, Bacillus (desnitrificacin) Enterobacterias Sulfatorreductoras (Desulfovibrio, Desulfotomaculum) Anaerbicos estrictos Enterobacterias Arqueas metanognicas Alteromonas, Shewanella, Geobacter

 El uso de nitratos, sulfatos y CO2 como aceptores finales de electrones se denomina metabolismo disimilativo (o desasimilativo) para distinguirlo del asimilativo (nutricional). El producto reducido se excreta al ambiente de la bacteria. El uso disimilativo de nitrato se llama desnitrificacin NO3- NO2- (nitrito) NO (xido ntrico) N2O (x. nitroso) N2

Las enzimas que catalizan esta ruta son reprimidas por el oxgeno molecular y se inducen (en ausencia de oxgeno) por el nitrato Los productos intermediarios se acumulan cuando el NO3- est en exceso y la concentracin de dadores de H limita la transformacin.
Nitrato hasta nitrito: se lleva a cabo por la nitrato-reductasa disimilatoria (semejante al citocromo terminal, citocromo-oxidasa) de cadenas que usan oxgeno molecular como aceptor. Es de localizacin intramembranosa. En las bacterias Gram-negativas la nitrito-reductasa es de localizacin periplsmica. Las nitritoreductasas de Pseudomonas constan de citocromos c+d1. La xido ntrico-reductasa es un complejo de citocromo b+c integral de membrana. La xido nitroso-reductasa es una enzima de localizacin periplsmica.

Cadena de transporte de electrones de Paracoccus denitrificans El nitrato es reducido a N2 por la accin colectiva de 4 reductasa que reciben electrones de la CoQ y elcitocromo c. FP: flavoprotenas; MD: metanol deshidrogenasa; Nar: nitrato reductasa; Nir: nitrito reductasa; Nor: oxido ntrico reductasa; Nos: oxido nitroso reductasa La cadena de transporte de electrones aerbica es similar a la de mitocondrias.

El uso disimilatorio del sulfato: sulfatorredutoras (Desulfovibrio, Desulfotomaculum). Para que el sulfato (SO42-) pueda recibir los electrones, primero se tiene que activar con ATP (mediante la ATPsulfurilasa), formndose la adenosina-fosfo-sulfato (APS). La parte sulfato de la APS recibe dos primeros electrones y se reduce (por la APS-reductasa) hasta sulfito (SO32-), con liberacin de AMP. Luego el sulfito es reducido (aceptando otros seis electrones) hasta sulfuro (S2-) mediante la sulfito-reductasa. La mayora de sulfatorreductoras son quimiorganotrofos, pero algunos pueden usar tambin H2 como donador de electrones (quimiolitotrofos).

Otros aceptores inorgnicos de e

El manganeso mangnico (Mn4+) puede ser reducido por algunas bacterias, como la ya citada Shewanella putrefaciens cuando crecen respirando acetato y otros sustratos orgnicos. El clorato (ClO3-) El selenato (SeO42-) se puede reducir a selenito (SeO32-) y posteriormente a selenio metlico (Se0). Se ha aprovechado esta reaccin para descontaminar aguas que llevaban estos compuestos txicos (biorremedio). El arseniato (AsO42-) es un compuesto muy txico, y puede ser reducido junto con el sulfato por la bacteria sulfatorreductora Desulfotomaculum, formndose un complejo mineral de arsnico y sulfuro (trisulfuro de arsenio, As2S3), que precipita. Este ejemplo de biomineralizacin se est intentando aprovechar para detoxificar suelos y aguas contaminados.

Respiracin aerbica

Cadena de transporte de electrones aerbica de Paracoccus denitrificans

Gluclisis

Va de las pentosas

Funciones catablicas y anablicas: NADPH como dador de e en biosntesis Eritrosa 4P para sntesis de aa aromticos y vit B6 Ribosa 5P componente de cidos nucleicos Produccin de ATP Transcetolasa

Transaldolasa

Va de Entner-Doudoroff
Pseudomonas, Rhizobium, Azotobacter, Agrobacterium, E. faecalis

La mayora de las bacterias presentan va glucoltica y va de las pentosas. En algunas la va glucoltica puede ser sustituida por la va de ED (por ausencia de fosfofructokinasa).

Ciclo de Krebs o TCA

Complejo piruvato deshidrogenasa

Uso de piruvato o derivados como aceptores internos de e para reoxidar NADH. Proceso anaerbico en el que el sustrato se oxida slo parcialmente y se produce fosforilacin a nivel de sustrato.

Fermentacin

1-Lactobacillus, Streptoccocus, Bacillus 2- Levaduras, Zymomonas 3- Propionibacterium 4-Enterobacter, Serratia, Bacillus 5- Bacterias entricas: E. coli, Proteus, Salmonella 6- Clostridium

Fermentacin heterolctica

Fosfocetolasa

Tipo de fermentacin

Producto(s)

Fermentacin lctica

Lactato

Fermentacin alcohlica

etanol, CO2

Fermentacin cida-mixta

etanol, succinato, acetato, formiato, lactato, CO2, H2

Fermentacin butilngliclica

butilnglicol, CO2

Fermentacin aceto-butrica

acetato, acetona, butirato, butanol, etanol, CO2, H2

Utilizacin del citrato por O. oeni

Rendimiento de ATP por oxidacin aerbica de la glucosa en eucariotas

Ciclo del Azufre

Ciclo del Nitrgeno

Ciclo del Carbono