Micro Suelo 1

Microbiologa del suelo
Mara Cecilia Arango Jaramillo
El suelo:
Un biotopo, prcticamente ignorado
EL SUELO
Es el principal medio en el que
crecen las plantas.

Es el soporte fsico que
continuamente les proporciona:

Los nutrientes inorgnicos El agua El entorno gaseoso adecuado para los sistemas radicales.
Los nutrientes inorgnicos
que utilizan las plantas provienen de la atmsfera y de la meteorizacin de las rocas de la corteza terrestre.
Meteorizacin de la corteza terrestre

Los minerales son compuestos
inorgnicos que normalmente estn formados por dos o ms elementos en proporciones de peso determinadas
Ejemplo:
El cuarzo( SiO2 ) La calcita (CaCO3).
Las rocas se dividen en tres grupos
segn su origen y formacin:

gneas
Granito, basalto, cuarzo, feldespato
Sedimentarias
esquistos, areniscas, piedra caliza
Metamrficas
Areniscascuarcita,
Esquisto pizarra
Piedra caliza mrmol
Procesos de meteorizacin desintegracin fsica y descomposicin qumica de los minerales y las rocas superficiales producen los materiales inorgnicos que formarn los suelos
Los suelos tienen
diferente origen y composicin Por lo tanto la microfauna asociada a ellos tambin
La meteorizacin implica procesos:

Mecnicos
congelamiento y descongelacin calentamiento y enfriamiento,

Qumicos
El agua se introduce entre las partculas, y los materiales solubles se disuelven en ella.
Biolgicos
CO2 de la respiracin y otras sustancias descomponen Mara Cecilia Arango Jaramillo las rocas
Meteorizacin mecnica
El agua y el viento transportan fragmentos de roca a grandes distancias desgaste que las fracciona en partculas ms pequeas Mara Cecilia Arango Jaramillo
Meteorizacin qumia (corrosin)
Disuelven cidos materiales H2O + NO2 (NO3) menos solubles

H2O + SO2
Meteorizacin orgnica-biolgica
Los cidos producidos por
plantas y las bacterias pueden afectar las rocas.
La formacin del suelo puede ocurrir en:

El mismo sitio donde la roca es
meteorizada
Pueden ser transportados a otros sitios
por :
La gravedad El viento El agua Los glaciares.
Materia orgnica del suelo
Origen de la materia orgnica del suelo:

Bacterias, hongos, algas, lquenes, musgos y plantas que crecen sobre o entre los minerales y las rocas erosionadas Plantas y animales muertos
Los microbios en el suelo

Contribuyen a la Controlan la formacin de materia disponibilidad de orgnica muchos nutrientes importantes para la convierten en cido las plantas carbnico o cidos orgnicos disuelven rocas.
La actividad
microbiana es limitada por el agua (sequa,humedad ) y estado de los nutrientes
La actividad
microbiana es clave en la productividad de los suelos.
Los microbios pueden existir varios
cientos de metros por debajo de la superficie de la Tierra
Los mecanismos de sobrevivencia
an no se conocen
Seccin vertical del suelo:

Variaciones en el color Cantidad de materia orgnica viva o muerta (incluye microorganismos) Porosidad Estructura Grado de meteorizacin.
Horizontes del suelo

Horizonte A
Horizonte B Horizonte C
Horizonte A:
Capa superior del
Contiene la mayor
suelo La regin ms superficial y de mayor actividad fsica qumica y biolgica.
parte del material orgnico del suelo, vivo o muerto:

Grandes cantidades de partes de plantas y hojas muertas Insectos y otros artrpodos pequeos Lombrices de tierra Organismos descomponedores Nemtodos
O2, N2, CO2

Desechos orgnicos Lluvia O2, NH3, CH4, H2S
Inorgnicos granulados Residuos orgnicos, humus Agua (inundado, mojado) Gases (disueltos y difusos)
Suelo: Horizonte A Rocas, silicatos
Capa de agua
Sistemas biolgicos (races, insectos, microobios)
En un gramo de suelo del horizante A pueden haber:

2500 millones de bacterias
+ medio milln de hongos
+
50 000 algas
+
30 000 protozoos
Horizonte B:
Regin de acumulacin
El horizonte B:
Contiene mucho
Algunos materiales
menos material orgnico y est menos meteorizado que el horizonte superior. Hay pocos microorganismos
del horizonte A, llegan al B por filtracin del agua a travs del suelo:
xido de hierro Partculas arcillosas Pequeas cantidades de material orgnico
Horizonte C:
Compuesto por rocas y
minerales fragmentados y meteorizados de los cuales se ha formado el suelo verdadero de los horizontes superiores. Los microorganismos son escasos.
Composicin del suelo

Los suelos estn
Poro Pelcula de Agua
formados de Materia orgnica materia slida y Arena O2 espacio poroso CO2, H2S, El espacio poroso CH4 es ocupado por Arcilla diferentes proporciones de aire y agua, Hifa dependiendo de Bacterias las condiciones de Mara Cecilia Arango Jaramillo humedad.
Los fragmentos de roca y minerales en el
suelo varan en tamao:
Partcula
Dimetro en micrmetros Arena gruesa >200 - 2000 Arena fina >20 - 200 Limo 2 - 20 Arcilla <2
Los suelos estn divididos segn su
textura:
Arenoso arcillosos: 35% o ms de
arcilla y 45% o ms de arena

Limo-arcillosos: 40% de arcilla y 40%
o ms de limo
Margosos o francos: contienen igual
proporcin de arena, limo y arcilla. Ideales para la agricultura.

La textura del
suelo influye en las comunidades de microorganismos porque de ella depende la aireacin y la disponibilidad de agua
Intercambio de catinico
Los nutrientes
Cl inorgnicos para Cl HCO3 microorganismos + NO 3 + K + Na Na y plantas estn SO4-2 OH presentes en la Ca+ + Arcilla - Na+ solucin del OH + + -2 suelo como Ca SO4 Na+ iones. K+ H+
HCO3NO3- HCO3-
OH-
Intercambio catinico: Los cationes apresados por las partculas de arcilla Partculas de pueden: arcilla: Ser reemplazados por componentes otros cationes esenciales de Ser liberados a la los suelos solucin del suelo para productivos. ser tomados por plantas y microorganismos.
Los aniones (NO3-,
El fosfato, no puede
SO4-2, HCO3-, y OH-) son lixiviados del suelo ms rpidamente que los cationes ya que no pueden fijarse a las partculas de arcilla.
ser arrastrado, ya que:

Forma precipitados insolubles Es absorbido o adsorbidoen la superficie de compuestos que contienen hierro, aluminio y calcio.
La acidez o
Los suelos varan
basicidad del suelo est relacionada con la disponibilidad de nutrientes inorgnicos para el crecimiento de plantas y microbios.
mucho en su pH, y muchos microorganismos tienen un estrecho margen de tolerancia.
La gente
desconoce que cuando tiene un gramo de tierra en el hueco de la mano, tiene entre un milln y mil millones de seres vivos en esa mano.
Una muestra de suelo contiene: Insectos pteros Arcnidos Sobretodo filamentos de hongos y de bacterias.
La cuenta de
La riqueza de
grmenes por suspensindilucin muestra ms de un milln de grmenes por gramo de tierra arable
especies y la complejidad de la delgada capa cultivable condicionan la vida sobre la tierra, del mismo modo que la fotosntesis.
Ciclo de la materia orgnica

CO2
Fotosntesis
Restos vegetales desaparecen bajo la accin de la microfauna y la Cada de ramas, microflora del hojas, frutos.. suelo
Microfauna del suelo
Microorganismos del suelo

Mineralizacin Humificacin
CO2
Fotosntesis
Amontonamiento de
acculas de varios centmetros.
Cada de ramas, hojas, frutos.. Acidez frena actividad microbiana Acumulacin Microfauna del suelo
Mineralizacin
Descomponedores casi ausentes: hongos y bacterias

Humificacin
Papel de la microfauna del suelo:

Disgregacin de la materia orgnica Diseminacin de la microflora
http://www.aecientificos.es/ElSuelo.html
Disgregacin de la materia orgnica
Reutilizacin por otros organimos Multiplicacin de la microflora de las heces Heces
microfauna
Seleccionan los alimentos para los microbios Aumentar las superficies de ataque para los microbios.
Diseminacin pasiva Transporte accidental en la superficie del cuerpo
Invasin por los microbios del suelo
Reincorporacin de microorganismos al suelo
Diseminacin activa ELECCIN con las heces de la TRFICA: microflora Rgimen intestinal alimentario
Plantas y
Los residuos
microflora: organismos complementarios, en la mineralizacin de la materia orgnica
orgnicos no consumidos van a ser degradados por la microflora. Son los hongos, en primer lugar, los que van a atacar a la materia orgnica fresca, y en el siguiente orden
Mineralizacin de la materia orgnica

Descomposicin de hojas (Sucesin) Tiempo (las fases pueden ser simultneas)
Hongos: Hongos glucfilos celulolticos: utilizacin de metabolismo las de la celulosa sustancias hidrosolubles
Hongos lignolticos : degradacin de la lignina
Bacterias: transforman residuos fngicos y productos no consumidos por las hifas. Mara Cecilia Arango Jaramillo
Plantas y microorganismos
son complementarios: unos fabrica materias carbonadas, otros libera minerales
CAPA VEGETAL DEL SUELO Materia inorgnica Materia orgnica
Microorganismos CO2 Hojas de las plantas

Mara Cecilia Arango Jaramillo Fotosntesis
H 2O
Material mineral no utilizado por los microorganismos

Races de las plantas
Proteccin de los microorganismos ante desequilibrios ambientales

Cuando se aade materia orgnica a
los suelos agrcolas, las bacterias consumen todo el carbono disponible. Consecuencia: rarefaccin, e incluso desaparicin, de los microorganismos.
Para estos casos, la naturaleza ha
creado sistemas de proteccin para que los microorganismos Mara Cecilia Arango Jaramillo sobrevivan
Estructuras de proteccin de los hongos

Clamidospora: clula latente, con
pared gruesa y cuyo contenido es rico en reservas Esclerote: esfera cuyo envoltorio externo est constituido de hifas muertas de pared gruesa, y el centro de filamentos vivos ricos en reservas, en estado latente.
Estructuras de proteccin delas bacterias

Las (Gram+)
Las Gram- estn
Susceptibles Forman agregados
forman endosporas.
desprovistas de mecanismos de resistencia
de sobrevivir biolgicos cuando las condiciones son muchos aos en condiciones desfavorables La actividad celular y las desfavorables. divisiones, se hacen ms lentas. Mara Cecilia Arango Jaramillo
Numerosos
procariotas para las condiciones protegerse exudan ambientales llegan a en su superficie ser desfavorables polisacridos que se adhieren a lminas de arcilla. Desaparecen cuando las condiciones Son estructuras pedolgicas vuelven que permiten la a ser adecuadas supervivencia de las bacterias
Se forman cuando
Estas formaciones
tienen un dimetro que vara de 10 a 1000 mm y pueden contener varios miles de grmenes.
Los polisacridos tienen varias funciones:

La superficie de bacterias y arcillas tienen
cargas elctricas negativas, mientras que los azcares son neutros, tienen por tanto un papel aislante. agua, evitan evaporacin en perodos secos.
Los azcares tienen tendencia a retener
Constituyen reservas. En ausencia de alimentos, las bacterias toman el carbono necesario para el mantenimiento de las funciones vitales esenciales. Mara Cecilia Arango Jaramillo
Para los microorganismos del
suelo vivir en el espacio interagregado (poros) y el agregado mismo (granos) tiene implicaciones importantes
Este es el
En el espacio interagregado las condiciones son drsticas: La humedad y la aireacin varan muy rpidamente.
microhabitat colonizado por las bacterias Gram+, que poseen la facultad de producir endosporas. hongos y las de los actinomicetos, son muy resistentes a la desecacin.
Las esporas de los
Por el
condiciones de contrario, el anaerobiosis. agregado En este medio tan mismo es estable viven o recorrido slo sobreviven las bacterias por finos Gram-. capilares de alrededor 2 Aunque sensibles a las mm de modificaciones dimetro, que ambientales, permanecen slo permiten vivas en suelos secos una circulacin durante ms de un ao lenta de aire y gracias a la proteccin de Mara Cecilia Arango Jaramillo de agua. los agregados
Aparecern rpidamente
La composicin qumica y fsica de los agregados es variable.

El suelo es un medio muy
heterogneo
Est constituido de un
mosaico de microhabitats cuya composicin biolgica vara cualitativa y cuantitativamente en funcin del tiempo, y de la fuente trfica disponible.
Unos agregados
pueden formarse que colonizan estos alrededor de citina, microhabitats desarrrollndose en difieren igualmente su seno los llamados tanto por su citinolticos. morfologa, como por Otros encerrarn sus requerimientos residuos de lignina ecologicos. permitiendo el crecimiento de los ligninolticos. Mara Cecilia Arango Jaramillo
Los microorganismos
Influencia del ambiente del suelo en las poblaciones de microorganismos

Nunca se dan condiciones Aunque los ambientales idnticas: microorganismos Las que favorecen la son ubicuos, en reproduccin de un pocas situaciones microorganismo, o existen poblaciones permiten la iguales. sobrevivencia de otro, pueden ser desfavorables para la existencia continuada de un tercero. Mara Cecilia Arango Jaramillo
El suelo de un pinar
Los suelos
cultivados y de jardn tienen abundancia de oxgeno y agua y son ricos en nutrientes aportados por las fertilizaciones
suele ser muy cido y su contenido en principios nutritivos es bajo Los terrenos pantanosos estn inundados, tienen poco oxgeno y contienen abundante materia orgnica en descomposicin.
Mara Cecilia Arango Jaramillo Estas diferencias se reflejan en la microflora
Para comprender la influencia de
los factores que afectan la microflora del suelo es necesario: Conocer las condiciones normales de crecimiento de los microorganismos Los efectos que las condiciones extremas ejercen sobre los distintos grupos.
Factores que afectan en mayor grado a las

poblaciones de microorganismos
pH DEL SUELO AcidezAlcalinidad TEMPERATURA
POBLACIONES DE MICROORGANISMOS
DISPONIBILIDAD DE TCNICAS DE OXGENO, AGUA Y MANEJO DEL SUSTANCIAS SUELO NUTRITIVAS Mara Cecilia Arango Jaramillo
Consideremos estos factores separadamente, pero deberemos tener en cuenta que de ordinario son interdependientes.
Temperatura (Psicrfilos, Mesfilos y

Termfilos).
TEMPERATURA DE CRECIMIENTO DE LOS MICROORGANISMOS Tipo de microorganismo Psicrfilas Alrededor 20o C 25 a 37o C 5a30o C Achromobacter Temperatura Temperatura ptima s lmite Ejemplo de microorganismo
Mesfilas
5 a 45o C
Staphylococcus , Mayora de los hongos.
Termfilas
Superior a 45o C
Desulfovibrio, Thermoactinomyce s, Algunas algas Mara Cecilia Arango Jaramillo verdes azules
40 a 80o C
Fermentacin del estircol: La temperatura puede elevarse hasta 65 o C, destruyendo todos los microorganismos, excepto a los termfilos, como el Bacillus calfactor , Thermoactinomyces spp y los hongos termfilos.
En suelos del piso trmico tropical y
premontano son ms frecuentes: Fusarium, Aspergillus y Rhizopus
Penicillium crece mejor en suelos ms
fros.
REQUERIMIENTOS NUTRITIVOS
Utilizacin de energa lumnica Oxidacin quimioautotrfica de
materias inorgnicas Respiracin hetertrofa de materia orgnica Fermentacin de materia orgnica

Existe competencia entre
los microorganismos por utilizacin de los nutrientes orgnicos e inorgnicos.
En el suelo la
materia orgnica fcilmente utilizable por los microorganismos es ordinariamente reducida, lo que limita su velocidad de multiplicacin.
Al aadir al suelo materiales frescos, estircol o desechos vegetales

el nmero de microorganismos aumenta rpidamente los nutrientes se agotan poblacin de microorganismos vuelva nivel anterior.
Como un microorganismo determinado no puede utilizar igualmente todos los substratos su incidencia y proporcin varan de acuerdo con las situaciones
Opionibacterium
acta como barrendero de medios nutritivos parcialmente degradados por microorganismos.
En el rumen utiliza
cido lctico y glucosa producidos por las bacterias celulticas y las del cido lctico.
Lactobacillus
compite eficazmente cuando existen Crece bien en la carbohidratos leche y en el rumen simples pero es pero no en el suelo. incapaz de metabolizar sustancias como lignina.
Otros microorganismos degradan lignina y Pero no en leche, celulosa donde compiten con microorganismos sobrevivien en el suelo como Bacillus y y en el manto en Lactobacillus descomposicin de los bosques
En una poblacin mixta solo unos
pocos microorganismos son capaces de metabolizar una sustancia determinada, como insecticidas y herbicidas, estos microbios se ven libres de competencia.
Los auttrofos no
compiten por nutrientes orgnicos con otros microorganismos. Slo compiten por luz.
Desarrollo de
Nitrosomonas y Nitrosobacter es limitado por compuestos nitrogenados apropiados.
OXGENO
Los requerimientos de oxgeno de los microorganismos varan:
Aerobios
Anaerobios
Microanaerobios Anaerobios
facultativos
El oxgeno
determina el desarrollo de poblaciones de microorganismos en detrimento de otras.
En el ensilado, los forrajes son
comprimidos y recubiertos para: Establecer condiciones de anaerobiosis con el fin de promover el crecimiento de microorganismos anaerobios tiles o microaerfilos como Lactobacillus Mientras se impide el desarrollo de los que tienden a descomponer el forraje (pudricin).
En suelos poco aireados
hay competencia por el uso del oxgeno El oxgeno es disponible y ello puede esencial para llevar a un descenso en la muchos microorganismos proporcin de microorganismos aerobios fijadores de En consecuencia nitrgeno. disminuye la fijacin de nitrgeno y tambin de la velocidad de degradacin de la materia orgnica.
El nivel de aporte de oxgeno
tambin determina la forma de metabolizacin de los nutrientes.

Los anaerobios facultativos metabolizan los
polisacridos aerobicamente en presencia de oxgeno, descomponiendolos hasta dixido de carbono y agua con alta liberacin de energa. Cuando no hay oxgeno lo hacen anaerobicamente, mediante el proceso de fermentacin, en el cual la degradacin slo es parcial y con poca liberacin de energa.
pH
El pH ptimo para la Con pocas
mayora de las bacterias, algas y protozoos est alrededor de 7.
excepciones estos microorganismos no crecen por debajo de un pH de 4 o por encima de un pH 9.
Los
Thiobacillus,
actinomicetos y las algas son sensibles a los cidos y su pH ptimo est entre 7.5 y 8.
Acetobacter y la bacteria fijadora de nitrgeno Beijerinckia, son capaces de crecer y multiplicarse a pH entre 2.5 y 3.5.
El pH ptimo para
os hongos son
las levaduras y los hongos vara entre 3.1 y 6.0, mientras sus pH extremos de crecimiento son 1.6 y 9.5.
resistentes a los cidos Algunas especies de hongos crecen a pH entre 1.6 y 2.0
En suelos con pH
mayores a 7 predominan las bacterias, en especial los actinomicetos, y en menor proporcin los hongos. micorrizas.
El efecto del pH afecta el desarrollo de los microorganismos:

Cuando el pH baja: Declina el nmero de bacterias Mientras sube el de levaduras, hongos y bacterias resistentes a la acidez.
A pH extremadamente bajos la
proporcin de bacterias puede disminuir hasta el 60%.
La acidez del
En suelos cidos suele
suelo influencia las bacterias de los ndulos de la raz de las leguminosas
envolverse la semilla en una capa de cal, que neutraliza la acidez circundante, promueve la multiplicacin de Rhizobium y permite buena nodulacin de la leguminosa husped.
AGUA
Todos los
microorganismos necesitan agua, aunque sus requerimientos varan.
Las formas
Las endosporas
vegetativas de las bacterias son menos resistentes a la desecacin que los hongos o los actinomicetos.
termoestables producidas por las bacterias, como Bacillus y Clostridium, son resistentes a la desecacin.
Las bacterias
esporuladas, los actinomicetos y los hongos son los contaminantes ms frecuentes del aire porque son resistentes a la desecacin.
En los materiales de
Los suelos
potencial osmtico alto el agua es poco asequible a los microorganismos.
salinizados suelen tener presiones osmticas altas que inhiben el crecimiento de la mayora de los microorganismos y races, exceptuando los halfilos.
El exceso de agua en el suelo
suele causar encharcamiento y prdida de oxgeno en los capilares del suelo lo cual hace que disminuyan los microorganismos aerobios y aumenten los anaerobios.
Tcnicas de manejo del suelo
Las poblaciones de microorganismos del suelo, se pueden:

Disminuir o erradicar por perturbaciones
importantes del suelo

Favorecer con prcticas adecuadas.
FACTORES LIMITANTES DE LA
MICROBIOTA DEL SUELO
Erosin y baja disponibilidad de nutrientes Fertilizacin mineral y correctivos Presencia de antagonistas, parsitos y
depredadores Temperatura y pH extremos Extremos en los contenidos de aire y humedad

Textura del suelo y concentraciones
txicas de metales pesados Uso de plaguicidas, especialmente los de amplio espectro. Desinfeccin, fumigacin y esterilizacin del suelo Inundaciones y malos drenajes
Aradas profundas, volteo del suelo y
solarizacin. Sistemas de produccin y explotacin del suelo (monocultivo, cultivos intesivos sin manejo adecuado, minera a cielo abierto).
PRCTICAS QUE FAVORECEN LA DENSIDAD Y LA ACTIVIDAD DE LOS MICROORGANISMOS

Mantenimiento de la biodiversidad
dentro de los cultivos y en las fincas. Coberturas vegetales, abonos verdes y alcolchados Inoculacin de suelos y semillas con microorganismos y eliminacin de competidores.
Incorporacin de compost,
fracciones lquidas y slidas de biodigestores, humos, excretas, restos de cosechas y otros residuos vegetales Agentes naturales de control: control biolgico, plaguicidas botnicos, control cultural.

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Mara Cecilia Arango Jaramillo

Mara Cecilia Arango Jaramillo

crecen las plantas.

continuamente les proporciona:

Los nutrientes inorgnicos

Meteorizacin de la corteza terrestre

Las rocas se dividen en tres grupos

segn su origen y formacin:

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Los suelos tienen

diferente origen y composicin Por lo tanto la microfauna asociada a ellos tambin

Mara Cecilia Arango Jaramillo

La meteorizacin implica procesos:

congelamiento y descongelacin calentamiento y enfriamiento,

Meteorizacin qumia (corrosin)

Disuelven cidos materiales H2O + NO2 (NO3) menos solubles

Los cidos producidos por

plantas y las bacterias pueden afectar las rocas.

Mara Cecilia Arango Jaramillo

La formacin del suelo puede ocurrir en:

Materia orgnica del suelo

Origen de la materia orgnica del suelo:

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Los microbios en el suelo

microbiana es limitada por el agua (sequa,humedad ) y estado de los nutrientes

microbiana es clave en la productividad de los suelos.

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Los microbios pueden existir varios

cientos de metros por debajo de la superficie de la Tierra

Los mecanismos de sobrevivencia

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Seccin vertical del suelo:

Horizontes del suelo

Mara Cecilia Arango Jaramillo

suelo La regin ms superficial y de mayor actividad fsica qumica y biolgica.

parte del material orgnico del suelo, vivo o muerto:

Mara Cecilia Arango Jaramillo

O2, N2, CO2

Suelo: Horizonte A Rocas, silicatos

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Sistemas biolgicos (races, insectos, microobios)

En un gramo de suelo del horizante A pueden haber:

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Compuesto por rocas y

Composicin del suelo

Los fragmentos de roca y minerales en el

suelo varan en tamao:

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Los suelos estn divididos segn su

arcilla y 45% o ms de arena

proporcin de arena, limo y arcilla. Ideales para la agricultura.

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Los aniones (NO3-,

ser arrastrado, ya que:

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Los suelos varan

mucho en su pH, y muchos microorganismos tienen un estrecho margen de tolerancia.

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Ciclo de la materia orgnica

Microorganismos del suelo

acculas de varios centmetros.