Composicin qumica de una clula bacteriana

% del peso total celular Agua Iones inorgnicos Azucares y precursores Aminocidos y precur. Nucleotidos y precur. Acidos grasos y prec. Otras pequeas molec. Macromolculas (prot.,ac.nucleic y polisac.)

70 1 1 0,4 0,4 1 0,2 26

Tipos de cada molcula 1 20 250 100 100 50 ~300 ~ 3000

Alanina

Acido Asprtico

Arginina

EL AMINOACIDO La formula general de un aminocido es

tomo carbono

H
grupo amino

NH2

C R

COOH

grupo carboxilo

grupo cadena lateral

R es uno de los 20 diferentes cadenas laterales. A pH 7 tanto el grupo amino como el carboxilo estn ionizados H + NH3 C R COO

El aminocido ALANINA. En la clula, donde el pH es cercano a 7, los aminocidos libres existen en su forma ionizada; pero cuando es incorporada en una cadena polipeptdica, y las cargas en los grupos aminos y carboxlicos desaparecen. Un modelo de balones y bastones y un modelo de Van der Waals son mostrado a la derecha de la formula estructural. Para alanina, la cadena lateral es un grupo CH3.

LOS AMINOCIDOS ESENCIALES

ARGININA
FENILALANINA

Los diez aminocidos esenciales. Estos aminocidos no pueden ser sintetizados por las clulas animales y deben ser suministrados por la dieta

HISTIDINA
ISOLEUCINA METIONINA LEUCINA LISINA

VALINA
TREONINA TRIPTOFANO

Familia de aminocidos
Los aminocidos comunes son agrupados de acuerdo a si su cadena lateral son cidos Bsicos Polar no cargados No polares Estos 20 aminocidos son nombrados por abreviaciones de tres o una letra

Aminocidos no polares y polares sin carga

Aminocidos aromticos y polares

Estereoismeros de los -aminocidos

ISOMEROS OPTICOS

El tomo de carbono es asimtrico, lo cual permite la formacin de dos isomeros de imgenes de espejo (-o estereo), D y L

Las protenas consisten exclusivamente de L-aminocidos

1
+ H

1 Ka

HA
A

-log H+ = -log Ka + log

HA

(Ver archivo flash)

La carga de la cadena lateral de un aminocido depende del pH

 cidos carboxlicos pierden H+ en solucin acuosa para formar un ion cargado negativo, que es denotado con el sufijo ato como en aspart ato y glutam ato. Una comparable situacin existe para las aminas, que en solucin acuosa toman H+ para formar un ion cargado positivamente (el cual no tiene un nombre especial). Estas reacciones son rpidamente reversible y la cantidad de las dos formas, cargada y no cargada, dependen del pH de la solucin. A pH altos el cido carboxlico tiende a estar cargado y las aminas descargadas. A pH bajo ocurre lo contrario, los cidos carboxlicos estn descargados y las aminas estn cargadas. El pH en el cual la mitad de los cidos carboxlicos o aminas estn cargados es conocido como el pK de esa cadena lateral del aminocido. En la clula el pH es cercano a 7 y casi todos los cidos carboxlicos y aminas estn en su forma totalmente cargadas.

Aminocidos con cadenas laterales polares no cargadas son relativamente hidroflicos y estn usualmente en el exterior de una protena, mientras las cadenas laterales de aminocidos no polares tienden a juntarse en el interior. Aminocidos con cadenas laterales cidos y bsicos son muy polares y ellos son casi siempre encontrados en el exterior de las protenas El cdigo de una letra en orden alfabtico: A = Ala C = Cys D = Asp G = Gly H = His I = Ile M = Met N = Asn P = Pro S = Ser T = Thr V = Val

E = Glu
F = Phe

K = Lys
L = Leu

Q = Gln
R = Arg

W = Trp
Y = Tyr

Formacin de un pptido

Rotacin alrededor de los enlaces en una cadena polipeptdica

 Una pequea parte de una protena mostrando cuatro aminocidos. Cada aminocido es unido al siguiente por un enlace covalente, uno de los cuales es mostrado en amarillo. Una protena tambin es referido como polipptido. Las cadenas laterales de los aminocidos son mostrados en rojo y los tomos de un aminocidos (cido glutmico) son mostrados en una caja gris