13.

Aminocidos

Aminocidos
Grupo amino (protonado)

Grupo carboxilo (disociado)

COO H 3N
Cadena lateral

C H R
Carbono a

Aminocidos: estereoisomera

COOH H 2N C H R

CHO HO C H CH2OH

L-Alanina

L-Gliceraldehido

Aminocidos: estereoisomera

COO+

COOH C NH3+ CH3

H 3N C H CH3

L-Alanina

D-Alanina

COO
+

COOH 3N C H H C CH3 CH2 CH3

H3 N C H H C OH CH3

L-Treonina

L-Isoleucina

Aminocidos alifticos o neutros, 1

COO H 3N
+ -

COO H 3N
+

COOH 3N + C H CH H 3C CH3

C H H

C H CH3

Glicina Gly, G NE

Alanina Ala, A NE

Valina Val, V E

Aminocidos alifticos o neutros, 2

COOH 3N + C H CH2 CH H 3C CH3

Leucina Leu, L E

COOH 3N + C H CH H 3C CH2 CH3

Isoleucina Ile, I E

Aminocidos alifticos

Su caracterstica fundamental es la hidrofobicidad de la cadena lateral (con excepcin de G) Suelen ocupar el interior de las protenas globulares, donde contribuyen a la estructura global de la protena debido al efecto hidrofbico (micela proteica) Reactividad qumica muy escasa Glicina tiene un destacado papel estructural: suele ser invariante en series filogenticas

COO-

COOH 3N
+

COOH3 N+ C H CH2

H 3N +

C H CH2

C H CH2

Fenilalanina Phe, F E

OH

Tirosina Tyr, Y NE

NH

Triptfano Trp, W E

Aminocidos aromticos

Aminocidos aromticos
La presencia de sistemas aromticos hace que absorban luz UV en torno a 280 nm; la absorcin UV de las protenas se debe a su contenido en estos aminocidos F y W son hidrofbicos

COOH 3N
+

C H CH2OH

Serina Ser, S NE

COOH 3N + C H CH3 H C OH

Treonina Thr, T E

Hidroxiaminocidos

Hidroxiaminocidos
El grupo -OH de la serina es fundamental en el centro activo de muchas enzimas (serin proteinasas, p.e.) Forma enlaces glicosdicos con oligosacridos en ciertas glicoprotenas El grupo -OH tanto de S como de T es susceptible de fosforilacin: importante modificacin postraduccional que regula la actividad de muchas protenas

Tioaminocidos
COOH 3N + C SH H CH2

Cistena Cys, C NE

COOH 3N + C H CH2 CH2 S CH3

Metionina Met, M E

Tioaminocidos

Importante papel estructural de la cistena por la posibilidad de formar enlaces disulfuro con otro residuo de cistena La cistena participa en el centro activo de muchas enzimas La metionina es el aminocido iniciador de la sntesis de protenas (codon AUG)

Aminas secundarias (Iminocidos)

COO NH2
+

Prolina Pro, P NE

Prolina
Importante papel estructural: su presencia dificulta la formacin de estructura secundaria Por esa misma razn suele ser invariante en series filogenticas

Como tal o modificado por hidroxilacin (4-hidroxiprolina) es muy abundante en el colgeno

Aminocidos dicarboxlicos y amidas

COOH 3N + C H CH2 COOH 3N + COOC H CH2 CONH2

COOC H CH2 CH2 COOH 3N+

COOC H CH2 CH2 CONH2

H 3N +

c.Asprtico Asp, P NE

Asparragina Asn, N NE

c.Glutmico Glu, E NE

Glutamina Gln, Q NE

Aminocidos dicarboxlicos y sus amidas

Todos ellos son importantsimos intermediarios en el metabolismo nitrogenado, sobre todo E y Q

Forman parte del centro activo de las glicosidasas y de las serin enzimas (trada SHD)
Proveen a la protena de superficies aninicas que sirven para fijar cationes (p.e., Ca++)

COOH 3N + C H CH2 CH2 CH2 CH2 NH3

+

COOH 3 N+ C H CH2 CH2 CH2 NH

+

COOH 3N + C H CH2 NH+ HN

Lisina Lys, K E
H2 N C

Arginina Arg, R E(?)

NH2

Histidina His, H E

Aminocidos dibsicos

Aminocidos dibsicos
Lisina sirve para formar intermediarios covalentes en catlisis enzimtica (bases de Schiff) Lisina es el aminocido que une determinadas coenzimas a la estructura de la protena

Arginina es un importante intermediario en el ciclo de la urea

Histidina forma parte del centro activo de muchas enzimas, debido al carcter nuclefilo del imidazol Histidina contribuye al tamponamiento de los medios biolgicos por tener un pKa cercano al pH intracelular

Clasificacin de aminocidos segn polaridad

Aminocidos apolares o hidrofbicos: - A, V, L, I, F, W, M, P Aminocidos polares sin carga elctrica: - G, Y, S, T, C, N, Q Aminocidos polares con carga elctrica: - Aninicos (-): D, E - Catinicos (+): K, R, H

Cadenas laterales con carga elctrica

Arginina Asprtico (c.) Cistena Glutmico (c.) Histidina Lisina Tirosina

12.48 3.86 10.78 4.25 6.00 10.53 10.57

+ + + -

H N

O HC SH C

H N HC SH

O C

CH2

CH2

O C C CH2 S S CH2 C H N

N H C O

COO+

H 3N C H CH2 SH

Cistena

COO+

COOH3N CH

H3N CH

CH2 S S CH2

Cistina

Aminocidos no proteicos: intermediarios metablicos

COO+

COO+

COO+

COO+

H3N C H CH2 CH2 CH2 NH3+

H3N C H CH2 CH2 CH2 NH

H3N C H CH2 CH2 SH

H3N C H CH2 CH2OH

O C NH2

Homocistena

Homoserina

Ornitina

Citrulina

Aminocidos no proteicos: DOPA

COO+

H 3N C H CH2

Catecolaminas

Hormonas tiroideas
HO OH

L-DOPA (dihidroxifenilalanina)

Melanina

w-Aminocidos

COOCH2 CH2 NH3

+

COOCH2 CH2 CH2 NH3+

GABA g-Aminobutirato

b-Alanina

Modificaciones postraduccionales, 1

COOH HO C H2C NH2+ CH2 HC COO+

H3 N C H CH2 CH2 H C OH CH2 NH3+

+

COOH3N C H CH2 HC COOCOO-

4-hidroxiprolina

4-carboxiglutmico
5-hidroxilisina

COO+

Modificaciones postraduccionales, 2

H3N C H CH2 CH2

H
-

CH2

H CH2 CH2 C COONH3+

OOC C CH2 CH2 NH3+ N+ CH2 CH2 CH2 CH2

Desmosina

H C NH3+ COO-

Titulacin de aminocido neutro

14

12

III
10

pH
6

II
4

0 0 1

I
2

Base aadida (uu. arbitrarias)

I
COOH H3N+ C H CH3
H 3N +

II
COOC H CH3

III
COOH 2N C H CH3

pH < pKC pH < pKN

pH > pKC pH < pKN

pH > pKC pH > pKN

Titulacin de aminocido dicarboxlico

14

12

IV
10

pH

III
6 4

II I

0 0 1 2 3

Base aadida (uu. arbitrarias)

I
COOH H3N+ C H CH2 COOH

II
COOH 3N + C H CH2 COOH H 3N +

III
COOC H CH2 COO-

IV
COOH 2N C H CH2 COO-

pH < pKC pH < pKL pH < pKN

pH > pKC pH < pKL pH < pKN

pH > pKC pH > pKL pH < pKN

pH > pKC pH > pKL pH > pKN

Titulacin de aminocido dibsico

14

IV
12

10

III

pH
6

II

0 0 1 2

I
3

Base aadida (uu. arbitrarias)

I
COOH H3N+ C H (CH2)4 NH3+

II
COOH 3 N+ C H (CH2)4 NH3+

III
COOH 2N C H (CH2)4 NH3+

IV
COOH 2N C H (CH2)4 NH2

pH < pKC pH < pKN pH < pKL

pH > pKC pH < pKN pH < pKL

pH > pKC pH > pKN pH < pKL

pH > pKC pH > pKN pH > pKL

SYSMEHFRWGKPV a-MSH (hormona estimulante de los melanocitos) SYSMEHFRWGKPVGKKRRPVKVYPDAGEDQSAEAFPLEF ACTH (Hormona corticotropa)

CYIQNCPLG

Oxitocina

CYFQNCPRG
CYFQNCPKG

Arginin-Vasopresina
Lisin-Vasopresina

Hormonas peptdicas

TRH (Hormona liberadora de tirotropina)

NH2 O O NH NH O N NH
Piroglutamil-histidil-prolinamida

CO N

CH2

ECA
DRVYHPFHL Angiotensina I HL

DRVYHPF
Angiotensina II

RPPGFSPFR KRPPGFSPFR

Bradiquinina Kalidina

Pptidos vasoactivos

Neurotransmisores peptdicos

YGGFL

(Leucin-encefalina)

YGGFM (Metionin-encefalina)