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METBOLISMO PRIMARIO

Bioqumica Aplicada

METABOLISMO MICROBIANO
Los ingenieros debemos ver la clula como un micro-reactor. METABOLISMO: conjunto ordenado de reacciones qumicas que permiten a la clula obtener energa y poder reductor, as como sintetizar macromolculas.

Tipos de metabolismo
metabolismo primario. Implica producir la energa, y nuevas molculas que necesita para sus acciones vitales de supervivencia y reproduccin.

metabolismo secundario. La formacin de productos es consecuencia de una serie de reacciones internas que la clula realiza como una forma de defensa contra condiciones adversas.

BASES DEL METABOLISMO PRIMARIO


La clula es mucho ms que un simple reactor por que tiene la particularidad de generar su propia energa y al mismo tiempo de reproducirse a gran velocidad (aproximadamente cada 20 minutos en bacterias, como E. coli). Toda clula viva debe realizar entre otras las siguientes funciones: Asimilacin de nutrientes y excrecin de los productos metablicos. Desdoblamiento de molculas grandes y sntesis de los componentes celulares (protenas, lpidos, nucletidos, etc). Movimientos, contracciones y otras funciones fsicas propias de cada tipo de clula. Reproduccin.

FASES DEL METABOLISMO:


ANABOLISMO : Formacin o sntesis de compuestos qumicos (Biosntesis)

ENERGA + molc. Pequeas

molc. complejas

CATABOLISMO : Degradacin o descomposicin de compuestos Combustibles (H de C, grasas) CO2 + H2O + ENERGA

REACCIONES ANABLICAS (SNTESIS)

METABOLISMO

consumen

ENERGA

liberan

REACCIONES CATABLICAS (DEGRADACIN)

PRINCIPIOS DE BIOENERGETICA (Termodinmica Bioqumica)


Procesos endergnicos: se manifiestan durante los procesos anablicos; requieren que se le aada energa a los reactivos (sustratos o combustibles metablicos Procesos exergnicos: se libera energa como resultado de los procesos qumicos (ej, el catabolismo de macromolculas) Las reacciones endergnicas se llevan a cabo con la energa liberada por las reacciones exergnicas.

Acople catabolismo-anabolismo
MOVIMIENTO OSMOSIS FUENTES DE ENERGA ADP

CATABOLISMO

ATP CALOR PRODUCTOS PRECURSORES

ANABOLISMO

TRANSPORTADORES DE ENERGA
La energa en la clula se transporta como energa qumica (ATP)

Estructura del ATP

Estructura del ATP

HIDRLISIS DEL ATP


ATP + H2O ADP + Pi

ATP + H2O AMP + PPi PPi + H2O 2 Pi

ATP como moneda de intercambio de energa


MOVIMIENTO TRANSPORTE ACTIVO BIOSNTESIS AMPLIFICACIN DE SEALES

ATP

ADP

OXIDACIN DE MOLCULAS COMBUSTIBLES


FOTOSNTESIS

COMPUESTOS RICOS EN ENERGA :

Compuestos ricos en energa : Adenosina trifosfato ( ATP ) Guanosina trifosfato ( GTP ) Acetil fosfato cido 1,3-difosfoglicrido cido fosfoenolpirvico ( PEP )

El ATP Y EL TRANSPORTE DE ENERGA


Ciertas coenzimas, como el ATP transportan energa desde los procesos exergnicos a los enderg-nicos

exergnica

endergnica

TRANSPORTE DE ELECTRONES
Muchos procesos qumicos celulares de gran importancia: fotosntesis, respiracin celular, etc. son procesos de oxidacin-reduccin. As, por ejemplo la glucosa se oxida al perder electrones en la respiracin celular, mientras que el oxgeno los capta y se reduce.

Ciertas coenzimas actan transportando estos electrones desde las sustancias que se oxidan a las que se reducen: los transportadores de electrones

PODER REDUCTOR: NAD+


Sitio reactivo

El poder reductor se refiere a la capacidad de ciertas biomolculas de actuar como donadoras de electrones en reacciones metablicas.

NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLETIDO

PODER REDUCTOR: NAD+


El NADH (Nicotidamina Adenina Dinucletido reducido) es un complejo multienzimtico que cataliza la transferencia de electrones a la coenzima Q en la cadena respiratoria por la va de la flavo-proten-NADHdeshidrogenasa. El NADH es indispensable para muchas reacciones metablicas y se encuentra en todas las clulas del organismo En realidad, cuanto ms una clula tiene de NADH disponible y ms puede producir energa para funcionar eficazmente. El NADH es la forma en la que se recogen los electrones procedentes de muchos sustratos diferentes a travs de la accin de las deshidrogenasas NAD- dependientes

PODER REDUCTOR:

+ NADP

PODER REDUCTOR: FAD


El FADH2 (Flavn Adenin Dinucletido reducido) no es un verdadero nuclotido, ya que no contiene el resto de azcar pentosa sino el azcar-alcohol llamado ribitol. Acta como grupo prosttico de las enzimas de oxidacin-reduccin conocidos como flavoprotenas. stas funcionan en la degradacim oxidativa del piruvato, de los cidos grasos y los aminocidos, as como en el proceso de transporte electrnico.

PODER REDUCTOR: FAD


FLAVINA ADENINA DINUCLETIDO

REACCIONES REDOX
NAD+ y FAD transportan 2 e-:
NAD+ + 2 H+ + 2 e- NADH + H+

FAD + 2 H+ + 2 e- FADH2

TRANSPORTE DE NUTRIENTES
Sucede a travs de la membrana celular. Los lpidos restringen el paso de sustancias solubles en agua (polares). El agua es una excepcin por tener un pequeo volumen molecular

MEMBRANA CELULAR

Tipos de transporte
Difusin pasiva Mecanismos de transporte Difusin facilitada Transporte activo: (cambio conformacional, translocacin de grupos)

Difusin

Transporte activo
Requiere gasto de energa para transportar la molcula de un lado al otro de la membrana. Ocurre contra el gradiente de concentracin. La clula utiliza ATP como fuente de energa.

FUENTES DE MATERIA Y ENERGIA


Segn las fuentes de carbono y de energa pueden ser:

Por fuentes de carbono:


Auttrofos. Fuente de C, el CO2 Hetertrofos. Molculas carbonadas complejas

Por fuentes de energa.


Fottrofos. Fuente de E la luz Quimitrofos. Fuente de E qumica. Descomposicin de molculas reducidas

Combinaciones
Los quimiolitoauttrofos obtienen energa de la oxidacin de compuestos inorgnicos y carbono de la fijacin del CO2. Ejemplos:

bacterias nitrificantes, bacterias oxidantes del azufre, bacterias oxidantes del hierro,etc.

Los fotolitoauttrofos obtienen energa de la luz y carbono de la fijacin del CO2, usando compuestos inorgnicos como equivalentes reductores. Ejemplos: Cyanobacteria (agua como
equivalente reductor), Chlorobiaceae, Chromaticaceae (sulfuro de
hidrgeno).

Combinaciones
Los quimiolitohetertrofos obtienen energa de la oxidacin de compuestos inorgnicos, pero no pueden fijar CO2. Ejplo: algunos
Nitrobacter spp., Wolinella (con hidrgeno como equivalente reductor), algunas bacterias oxidantes del hidrgeno.

Los fotoorganotrfos
obtienen energa de la luz y el carbono y los equivalentes reductores de compuestos orgnicos.

Clasificacin segn la obtencin de energa y materia


ENERGA
Fotolitotrofos de la luz

MATERIA
sustancias inorgnicas las plantas verdes

Fotoorganotrofos

de la luz

sustancias orgnicas bacterias purpreas

Quimiolitotrofos o quimiosintticos

procesos qumicos

Sustancias inorgnicas bacterias frricas,sulfurosas, nitrificantes y nitrosificantes

Quimioorganotrofos

procesos qumicos

sustancias orgnicas los animales y los hongos.

Tipos Nutricionales
Tipo Fuente de energa
Luz

Fuente de carbono

Ejemplos

Fotoautotrofas

CO2

Algas y cianobacterias Algas y bacterias fotosintticas Pocas bacterias

Fotoheterotrofas

Luz

Compuestos orgnicos Compuesto inorgnicos: H2, NH3, NO2, H2S, CO2 Compuesto orgnicos: glucosa

Quimioautotrofas o Litotrofas

Qumica

Quimioheterotrofas o Heterotrofas

Qumica

La mayora de bacterias

I.- CATABOLISMO ORGANOTROFO


Los seres vivos necesitan de un consumo constante de energa, que las clulas emplean en forma de energa qumica. Los organtrofos obtienen su energa (ATP), de la oxidacin de molculas orgnicas. Sustratos: glucosa, lpidos, protenas Degrada sustratos orgnicos por diferentes rutas:
gliclisis, va pentosa fosfato, va hexosamonofosfato (de Warbur-Dickens) , va de Entner-Duodoroff

Segn el aceptor final de electrones Puede ser:


Fermentacin. Respiracin: aerobio, no aerobio.

Se transforma a Priruvato Lactato Sntesis de glucgeno

GLICOLISIS

GLUCOGENESIS

Vas Metablicas de Glucosa

Degradacin de glucgeno

GLUCOGENOLISIS

Sntesis de glucosa
Va pentosa fosfato

GLUCONEOG ENESIS

GLICLISIS
Va principal de utilizacin de la glucosa El metabolismo de Glucosa se interrelaciona con el metabolismo de lpidos y protenas

Conjunto de Reacciones Qumicas Glucosa aerobias Piruvato Lactato

Glucosa

anaerobia

QUIMITROFOS (quimiorgantrofos)
1) Fermentacin En la cual el proceso redox ocurre en ausencia de aceptores de electrones terminales. La obtencin de energa es poca, ya que el piruvato no est oxidado totalmente.

2) Respiracin (en general) En la cual hay un aceptor terminal de electrones. La glucosa est totalmente oxidada a CO2 por lo tanto se obtiene ms energa

Fermentacin
Metabolismo antiguo HETERTROFO Energa de la oxidacin parcial de un compuesto orgnico usando intermediarios orgnicos como donadores y aceptores de electrones (NAD/NADH2). No existen aceptores externos (como O2) ni sistemas membranales de transporte. Todo el ATP se forma por fosforilacin de substrato. La gluclisis o "ruptura de la glucosa" es un proceso universal, es decir ocurre en todos los tipos celulares. Esto hace suponer que es muy antiguo en la evolucin, ya que se lleva a cabo en el citoplasma todas las clulas :procariontes, eucariontes, auttrofas o hetertrofas.

Fermentacin
Gluclisis + Reduccin del sustrato final. En procariontes 3 tipos de gluclisis: Embden-Meyerhof (bacteria y eucariontes como Saccharomyces). Va Heterolctica Entner-Doudoroff El resultado de la fermentacin depende de la reduccin del sustrato final de la gluclisis.

Modelo de fermentacin

Agente oxidante (toma electrones)

Pierde electrones la energa liberada se usa para formar ATP

Gana electrones

Agente reductor (dona electrones)

1.1. GLICOLISIS Va EmbenMeyerhof


Es un proceso que ocurre en la mayor parte de organismos. Esto hace suponer que es muy antiguo en la evolucin, se lleva a cabo en el citoplasma todas las clulas : procariontes, eucariontes, auttrofas o hetertrofas. Consiste, bsicamente, en la particin de una molcula de glucosa, un compuesto de seis carbonos, en dos molculas de cido pirvico, un compuesto de tres carbonos. Esta ruptura o degradacin de la glucosa implica la liberacin de energa qumica contenida en los enlaces de la molcula.

1.1. GLICOLISIS
Esta ruta presenta las siguientes caractersticas: - Se lleva a cabo en el citosol. - Se da en todas las clulas. - No requiere de oxgeno (Ruta anaerbica). - Todos los intermediarios entre glucosa y piruvato estn fosforilados. - Se lleva a cabo en 10 pasos (hasta piruvato) cada uno catalizado por una enzima diferente. - Tiene un rendimiento neto de 2 ATP.

1.1. GLICOLISIS
La glucolisis, tambin denominada glicolisis o ruta de Embden-Meyerhoff, es la secuencia metablica en la que se oxida la glucosa. Consiste de nueve reacciones enzimticas que producen dos molculas de piruvato y dos equivalentes reducidos de NADH, los que, al introducirse en la cadena respiratoria, producirn cuatro molculas de ATP.

Glicolisis
ENZIMAS: 1. Hexoquinasa 2. Glucosa fosfato isomerasa 3. Fosfofructoquinasa 4. Aldolasa 5. Triosa fosfato isomerasa 6. Gliceraldehido 3 fosfato deshidrogenasa 7. 3 fosfoglicerato quinasa 8. Mutasa 9. Enolasa 10. Piruvato quinasa

1 2 3

4
5 6 7 8

9
10

Glicolisis Fase I
ENZIMAS: 1. Hexoquinasa 2. Glucosa fosfato isomerasa 3. Fosfofructoquinasa 4. Aldolasa 5. Triosa fosfato isomerasa

Glicolisis Fase II
ENZIMAS: 6. Gliceraldehido 3 fosfato deshidrogenasa 7. 3 fosfoglicerato quinasa 8. Mutasa 9. Enolasa 10. Piruvato quinasa

10

VA FOSFOGLUCONATO

Produce ribosa-5-Fosfato para sntesis de Ac. Nucleicos; Muchos azcares con carbonos 6 (triosas, pentosas, heptosas) brindan la oportunidad de dar energa y convertirse luego en gliceraldehido o fru-6- P . Esta ruta propicia la formacin de NADPH2 agentes reductores ms importantes de la clula sntesis de colesterol hormonas

ATP ADP+Pi Glucosa Mg+2

Va alternativa Fru-6- P

ATP ADP
<ahora Fructo-6-Fosfato si es quinasa sustrato> Enzima limitante de Aldolasa la Velc. Va Glicoli.

Glu-6-P P Fosfoglucolisomerasa

Mg+2

Mg+2

Fru-1,6 Bi

P Permite la particin forma triosas fosfato

Hexoquinasa

En hgado es una enzima muy activa, fosforila en posicin 6 a la glucosa; es una enzima universal de organismos vivos. Requiere ATP y Mg+2 y trabaja a conc. Bajas de glucosa.

1 Glu 2(GA3 P] GA 3 P NAD+ Es el nico que continua la va metablica Oxidacin y fosforilasa del GA3 P a pH 7.3 fisiolgico estn ionizados . . Se denominan Sales Es la 1ra. Rx va Glicoltica donde se forma ATP Pasa a la sangre, hgado y es captado donde es convertido a glucosa Gluconeo-gnesis Lactato Ac. Lctico 2 PG Glicerato H2O NAD+

Di OHA P Triosa Fosfato isomerasa Inhibidores -Arseniato -Hg -Ac. Monoico Actico

Gliceraldebido Pi 3-P +2 deshidrogenasa Mg

NADH2

VIA GLICOLITICA Funciona en todos los organismos vivos animales y vegetales eucarioticos y procarioticos. Todas las enzimas estn en el Citosol.

Ac. 1.3 DPG 1.3 DP Glicerato Difosfogli- Mg+2 ceroquinasa APD Fosforizacin a nivel del ATP sustrato 3P Glicerato

Este Proceso ocurre 2 veces Ac. 3PG

Fosfoglicero -mutasa Mg+2


Ac. 2PG

Glicolisis 1mol Glucosa 2ml Ac. lctico Inhibidor Complejo; Fluoruro Fosfato unido al Mg Todas las Isoenzimas requieren Mg La fosferilzacin de Glu es irreversible. Enolasa

Mg+2

Ac. Fosfoenol Piruvico Fosfoenol Piruvato

NADH2 Mg+2 Mn

Deshidrogenasa lctica

Piruvato Quinasa
ADP

Tiene el mayor potencial energtico de todos los componentes tiene enlace fosfato de alta energa

ATP

Ac. Piruvico Piruvato

Rx de Fosforilacin a Nivel del Sustrato

C. Krebs.

Reduccin piruvato a Lactato es en escasa conc. O2.; permite a la Gliclisis seguir funcionando

Ac. Lctico NAD+ NADH2 Deshidrogenasa Lctica Piruvato deshidrogenasa Ac. Fosfoerol Piruvato Quinasa Ac. Pirvico Pirvico Piruvato ADP ATP COOH C=0 HSGA CO2 Descarboxilacin oxidativa del Piruvato

H3CO-CO N SCoA
NAD NADH2 Acetil coenzima A

CH3
piruvato

CICLO DE KREBS

Si NADH2 no fuera reoxidado la gliclisis anaerobia podra de tenerse cuando todo NAD existente en el citosol se hubiese reducido.

Rendimiento Energtico Va Glicoltica


Ac 1, 3, DPG Ac 3, PG

Va glicoltica
Glu

4 ATP generado

2 ATP

Fosfogliceroquinasa

2 ATP

Piruvato quinasa Ac. Pirvico

Ac. Fosfoenol pirvico Fosforilar glucosa Fosforilar Fruc - 6


P

Se consumen 2 ATP

...

Rendimiento Neto ATP en Glicolisis = 2 ATP

Proc. Exergnico Glu 2 Lactatos AG = - 47 Kcal/mol


Proc. Endergnico 2ADP + 2Pi 2ATP + 2H2O G = +14.6 Kcal/mol

Glu + 2ADP + 2Pi 2 Lactatos + 2ATP + 2H2O

47 Kcal Libera en

Degradar glucosa

100%

14,6 Kcal Necesita absorber Para Fosforilar y formar ATP X = 31.06%

Rendimiento energtico
FASE I:
2ATP BALANCE ATPs:

G
C6

2 G3P
2 ADP
2 C3P

-2 ATP

FASE II:
2 Pi 4 ADP

2 G3P
2 C3P

2P
2 C3

+4 ATP NETO : +2 ATP

4 ATP

Mecanismos de generacin de energa


Mecanismos de sntesis de ATP

Compuestos ricos en energa que intervienen en la fosforilacin a nivel de sustrato


Compuesto
Acetil CoA Propionil CoA Butiril CoA Succinil CoA Acetifosfato Butirilfosfato 1,3-bisfosfoglicerato Carbamilfosfato Fosfoenolpiruvato Adenosina fosfosulfato (APS) N10-formiltetrahidrofolato Energa de hidrlisis del ATP

Energa libre de hidrlisis G0 (kJ/mol)


-35.7 -35.6 -35.6 -35.1 -44.8 -44.8 -51.9 -39.3 -51.6 -88 -23.4 -31.8

Destino del piruvato


La clula debe regenerar el NADH---NAD+
Fermentacin Respiracin

DESTINO DEL PIRUVATO

Glucosa
Reduccin

Lactato

Piruvato Transaminacin
Carboxilacin Alanina Oxalacetato Descarboxilacin Oxidativa

Acetil Co A

Fermentacin alcohlica

Fermentacin lctica

Fermentacin acido-mixta

Fermentacin butanodiolica

Fermentacin propinica

Diferentes rutas de fermentacin


GLUCOSA

cido succnico

cido pirvico

cido actico + cido frmico

Acetona Acetil CoA cido frmico

cido actico

Alcohol etlico

cido actico

CO2

H2

Embden-Meyerhof
De Butadienol

Homolctica

Del cido propinico


De cidos mixtos

Butanol-acetona

1.2. VIA PENTOSA FOSFATO Funciones y significacin biolgica. Las clulas necesitan pentosas (ribosa-5-P) para la sntesis de cidos nucleicos y de coenzimas y poder reductor (NADPH) para la biosntesis de cidos grasos y otros compuestos. Estas molculas se obtienen degradando glucosa-6-P por la va de las pentosas-P Las principales funciones de la va de las pentosas fosfato son: -generar NADPH y - sintetizar azcares de cinco carbonos (PENTOSAS-P).

1.2. VIA PENTOSA FOSFATO


Va de: fosfogluconato. hexosamonofosfato A nivel celular, se efecta en el citoplasma Por esta va, uno de los tomos de carbono de la glucosa es removido como CO2 y se producen dos moles de NADPH Entonces, la ruta de la pentosa fosfato es una ruta metablica, en la cual se sintetizan pentosas (monosacridos de 5 carbonos) y se genera poder reductor en forma de NADPH. La ruta puede dividirse en dos fases: 1)La fase oxidativa, en que se genera NADPH, y ribosa (reacciones irreversibles) 2)La fase no oxidativa en que se sintetizan pentosasfosfato (y otros monosacridosfosfato) (Reacciones reversibles).

VA PENTOSA FOSFATO

Relacin entre la glucolisis y la ruta de las pentosas

Relacin glicolisis- pentosa-P

1.3. Va de fosfocetolasa

1.4. Va Entner- Duodoroff

Ruta catablica en Zymonona mobilis

La va

de Entner-Doudoroff de fermentacin. La reaccin general

es

Glucose -------> 2 ethanol + 2 CO2 + 1 ATP (net).

Zymonona mbilis
Tiene capacidad de produccin de bioetanol. Originalmente fue aislado de las bebidas alcohlicas, de palma africana, el mexicano pulque, y como un contaminante de la sidra y la cerveza en Europa. Z. mobilis degrada azcares a piruvato utilizando la va de EntnerDoudoroff.

ventajas de Z. mobilis ms de S. cerevisiae :


Mayor absorcin de azcar y rendimiento de etanol (hasta 2,5 veces ms alta). Produccin de biomasa inferior Mayor tolerancia al etanol de hasta 16% (v / v) No requiere la adicin controlada de oxgeno durante la fermentacin Susceptibilidad a las manipulaciones genticas.

Produccin de tequila

Produccin de tequila
A pesar de estas ventajas, varios factores impiden el uso comercial de Z. mobilis en produccin de etanol. El obstculo ms importante es que su gama de sustrato se limita a la glucosa , fructosa y sacarosa . De tipo salvaje Z. mobilis no pueden fermentar azcares C5 como xilosa y arabinosa que son componentes importantes de hidrolizados lignocelulsicos. A diferencia de E. coli y levadura, Z. mobilis no pueden tolerar los inhibidores txicos presentes en los hidrolizados lignocelulsicos tales como cido actico y varios compuestos fenlicos. La concentracin de cido actico en hidrolizados lignocelulsicos puede ser tan alta como 1,5% (w / v), que es muy por encima del umbral de tolerancia de Z . mobilis.

Deficiencias Z. mobilis
Varios intentos se han hecho para disear Z. mobilis para superar sus deficiencias inherentes. Cepas resistentes al cido actico de Z. mobilis se han desarrollado por ingeniera metablica, tcnicas de mutagnesis o mutacin adaptativa. Sin embargo, cuando estas cepas de ingeniera metabolizan azcares mixtos en presencia de inhibidores, el rendimiento y la productividad son mucho ms bajos, evitando de este modo su aplicacin industrial. Una caracterstica interesante de Z. mobilis es que su membrana plasmtica contiene hopanoides , compuestos pentacclicos similares a eucariotas esteroles . Esto le permite tener una extraordinaria tolerancia al etanol en el medio ambiente, alrededor del 13%.

II. ORGANOTROFO AEROBIO


RESPIRACION Proceso por el cual se transfiere electrones a un aceptor final externo. Este proceso ocurre en las mitocondrias de la mayora de las clulas eucariotes o en la membrana celular de las clulas procariotes Puede ser: Aerobia Anxica. La respiracion aerobia, hace uso del O2 como aceptor ltimo de los electrones desprendidos de las sustancias orgnicas. Es la forma ms extendida de respiracin, propia de la mayora de las bacterias y de los organismos eucariotas.

Opciones

Respiracin y fermentacin

Estructura de mitocondria

Reduccin
Transportador de electrones

Oxidacin

Reduccin La generacin de energa, es producto de reacciones de oxidoreduccin. Se oxida el NADH y se reduce el O2

Respiracin aerobia
Es una combustin controlada del sustrato. Gluclisis + Ciclo de Krebs o del cido Tricarboxlico (TCA)
COMBUSTIN RESPIRACIN
E

E
C

C C C C C C

GLUCOSA

CCC CC CCC CC
E
C C

CC CC

Respiracion celular

FASE I FASE II

FASE III

Coenzima-A. (Co-A)
Mercaptol------ac. Pantotenico- Adenina 3P

Respiracin celular. fase 1


El PIRUVATO de la gluclisis, es transformado en el citosol, en una molcula de 2 Carbonos denominada Acetil Coenzima A, liberando una molcula de dixido de carbono (CO2). La acetil coenzima A ingresa dentro de la mitocondria atravesando la membrana.

PIRUVATO 3C
NAD+ NADH+ H + HS- CoA

CO2

ACETIL - S - CoA 2C

Fase 2. Ciclo de Krebs


Se realiza en la Mitocondria. El ciclo de Krebs (de los cidos tricarboxlicos o del cido ctrico) es una va metablica presente en todas las clulas aerobias, es decir, las que utilizan oxgeno como aceptor final de electrones en la respiracin celular. Esta intimamente ligado a la Cadena Respiratoria Este ciclo aporta poder reductor (NADH2) a la cadena respiratoria y libera CO2 Funcin principal: oxidar completamente acetil CoA h hasta CO2 y H2O. El ciclo de Krebs tambin proporciona precursores para muchas biomolculas, como ciertos aminocidos. Por ello se considera una va anfiblica, es decir, catablica y anablica al mismo tiempo.
Enzimas que participan estn en la Matriz mitocondrial. Succinato Deshidrogenasa que est membrana mitocondrial.

1 Sntesis Citrato
2 NADH2 HSCoA CO2 2 Piruvato
Piruvato Deshidrogenasa

Coenzima A HSCoA 2 Acetil CoA Citrato

Isomerizacin Citrato a Isocitrato Deshidrogenacin y 3descarboxilacin del Isocitrato CO2

NAD

NADH2 Oxalacetato

Isocitrato
NAD NADH2 3ATP 3ATP

Deshidrogenacin de Malato a Oxalacetato

NADH2

NAD Malato

O2

Fijacin de 1 mol de H2O

H2O Fumarato FADH2 FAD

cetoglutarato 4Deshidrogenacin NAD tiva NADH2 cetoglutarato 3ATP CO2 Succinil CoA succ GDP+Pi 5 Desacilacin CoA GTP

Succinato

Deshidrogenacin del Succinato

1 Sntesis Citrato Forma Citrato + HSC.A

El C.K. se inicia con la condensacin acetil CoA con el oxalacetato

Citrato Sinteasa cataliza la condensacin del: Monoflor acetil CoA con Acetil CoA + Oxalacetato Citroil CoA Citrato H2O HSCoA

Citrato Sinteasa es una enzima importante en la regulacin del cido.

2 Isomerizacin Citrato a Isocitrato Se realiza en 2 etapas: Citrato Cis-aconitato Isocitrato

H2O

H2O

3 Deshidrogenacin y Descarboxilacin del Isocitrato Se realiza en 2 etapas: NAD Isocitrato NADH2 Oxalsuccinato

CO2
Cetoglutarato

Se produce NADH2 que interreacciona con la Cadena Respiratoria y se libera 1 mol CO2 4 Descarboxilacin Oxidativa Cetoglutarato Cetoglutarato + NAD+HSCoA Succinil CoA + CO2 + NADH2 Succinil CoA contiene enlace de alta energa Se libera 2 molcula de CO2 Se produce NADH2 que interreacciona con la Cadena Respiratoria.

5 Desacilacin Succinil CoA Succinil CoA. Pierde CoA por accin de la succini CoA sinteasa que cataliza ruptura enlace tioester rico en Enga. Puente en succinil CoA. La ruptura del Enlace tioester est asociada a la fosforilacin GDP. Formacin GTP, es un ejemplo de fosforilacin a nivel de sustrato. Succinil CoA + GDP + Pi Succinato GTP

Es la nica Rx del C.K. donde se produce un enlace fosfato de Alta Energa directamente. GTP + ADP Nucleosido difosfato Quinasa ATP + GTP

Presdente en casi todos los tejidos

A este nivel se sintetiza 1 mol ATP

6 Deshidrogenacin del Succinato


Aceptar de H2 el FAD grupo prosttico de la enzima que transfiere los H2 a CoA y sigue la cadena respiratoria. En la transferencia H2 se sintetiza 2ATP. La succinato deshidrogenasa se halla fuertemente unida a membrana interna de la Mitocondria a diferencia de las dems enzimas que estn en la Matriz Mitocondrial.

7 Fijacin de un mol H2O


Fumarato + H2O Malato

8 Deshidrogenacin del Malato a Oxalacetato


Requiere cofactor NAD o que se reduce NADH2 e interacciona con cadena Respiratoria. El Oxalacetato se condensa acil CoA y comienza un nuevo ciclo.

Reaccin Global del Ciclo de Krebs


Acetil CoA + 3NAD + FAD + 2H2O + GDP + Pi 2CO2 + HSCoA + 3NADH2 + FADH2 + GTP X c/mol acetil CoA se libertan 2CO2 Estos 2 carbonos liberados no son de la acetil CoA sino del oxalacetato.

En c/vuelta C.K. hay 4 RX Oxido Reduccin 1 Descarboxilacin oxidativa del Isocitrato 2 Descarboxilacin oxidativa del - Cetoglutarato 3 Oxidacin del Malato 4 Oxidacin del Succinato forma forma forma forma NADH2 NADH2 NADH2 FADH2

Cont Rx Global del Ciclo de Krebs


Se forma enlace Fosfato de alta energa en forma de GTP en la descilacin Sucinil CoA catalizada por succinil CoA sinteasa.

c/NADH2 que interacciona con Cad. Respiratoria se forma 3ATP 3ATP * 3NADH = 9 ATP c/FADH2 que interacciona con Cad. Respiratoria se forma 2 ATP = 2ATP En la fosforilacin ADP a expensas GTP se forma 1 ATP = 1 ATP

..

9 ATP+2ATP+1ATP = 12 ATP que se forman en cada vuelta del C. Krebs Se consumen 2H2O 1H2O sntesis del citrato 1 H2O Hidratacin del Fumarato

Gluclisis

TCA

NADH+ El dinucletido de nicotinamida y adenina (abreviado NAD+ en su forma oxidada y NADH en su forma reducida), es una coenzima, formada por dos nucletidos unidos a travs de sus grupos fosfatos. Su funcin principal es la transferencia de electrones.

El conjunto de reacciones del ciclo ATC se resume en: Acetil-CoA + 3H2O + 3NAD+ + FAD+ + ADP + Pi

2CO2 + CoA + 3NADH2 + FADH2 + ATP


El total ser el doble del indicado en esta reaccin

El ciclo de Krebs es una ruta anfiblica: participa en procesos catablicos y anablicos. El ciclo proporciona 5cetoglutarato y oxalacetato para la sntesis de glutamato y aspartato respectivamente, entre otras molculas fundamental es para la clula

Fase 3. transporte de electrones. Respiracin


Los electrones del NADH2 son transferidos de manera secuencial a travs de una serie de protenas transportadoras de la membrana celular. Esta es la cadena de transporte de electrones. Los electrones son transportados a un aceptor terminal como: El oxgeno (en la respiracin aerbica) Nitrato, sulfato (en la respiracin anxica).

transporte de electrones. Respiracin


La cadena respiratoria usa los hidrgenos de alta energa (H+) liberados durante el ciclo de Krebs y los hace pasar de una enzima a otra para hacer que pierdan gradualmente la energa hasta que logran una energa lo suficientemente baja para que estos hidrgenos se unan al oxgeno y formen agua como producto final de todo el ciclo. A medida que los hidrgenos van perdiendo energa simultneamente se van formando ATP almacenando la energa liberada. El transporte se realiza a travs de una serie de reacciones de xido-reduccin. Cada reaccin hace intervenir a dos constituyentes de la cadena respiratoria con potenciales redox diferentes.

transporte de electrones. Respiracin


Las protenas transportadoras estn agrupadas en tres grandes complejos. Cada grupo posee un potencial redox ms positivo que el anterior; los electrones descienden en cascada desde el NADH2 hacia los grandes complejos de enzimas, situados en niveles energticos cada vez menores, hasta finalmente ser transferidos al oxgeno.

Cadena Respiratoria Mitocondrial Hay un conjunto de compuestos de estructura qumica muy variable que se encuentran ubicados o adheridos a la membrana mitocondrial interna. Aqu a travs de procesos de xido Reduccin se realiza la transferencia de H2 y/o hacia el oxgeno con desprendimiento de energa que se aprovecha para la sntesis de ATP (Fosforilacin Oxidativa)

CADENA RESPIRATORIA MITOCONDRIAL


(Fe-s) Centros Fe-S se intercalan para formar compuestos cambian de . valencia . . participan en el transporte de

Complejo I: NADH reductasa


ADP + Pi ATP

Complejo III: Citocromo Reductasa

Complejo IV: Citocromo Oxidasa ADP + Pi ATP


Cit (a+a3) Fe+3 Cu Cit (a+a3) Fe+2 Cit (a+a3) Fe+3

ADP + Pi ATP
Cit b Fe+2 (Fe-S) Cit b Fe+3 2H+ Cit C1 Fe+3 Cit C1 Fe+2

Ac. lctico Ac. pirvico

NAD+ NADH2

FMNH2 8(Fe-S) FMN 2(Fe-S)

CoQ

Cit C Fe+2 Cit C Fe+3 H2O

O2-

CoQH2

O2 atmf.

Complejo II Soccinato Reductosa


INHIBIDORES En esta parte Hay Inhibidores como: Roterona Amital Barbitricos Picridicina Inhiben la formacin del Complejo I y del Complejo II Son compuestos que se unen a la cadena respiratoria, cortando o inhibiendo la cadena al impedir el transporte de En esta parte se unen inhibidor-8 como: CNCO Azida Na SH2 Antimicina Malonato

Citocromos: Son protenas que tienen al grupo Hemo como grupo prosttico. Hemo=Tetrapirrol ciclico con Fe Citocromo C es el ms dbilmente unido Slo transportan uno a la vez

El Fe acta en el transporte
Absorben VIS (400-600nm) Se modifican segn su estado xido reduccin.

Torre de Electrones

Transporte a travs de membrana. Generacin de potencial protnico. Cada NADH que llega a la cadena respiratoria cede una pareja de electrones, que en su transporte liberan energa suficiente para bombear 6 H+ desde la matriz al espacio intermembrana. Si los electrones proceden del FADH2 slo se bombean 4 H+.

Hiptesis quimiosmotica
Sostenida por Mitchell, puede explicar la sntesis de ATP en la mitocondria. La energa liberada por el transporte de electrones se utiliza para bombear protones desde la matriz, al espacio intermembrana. De esta manera se genera un gradiente electroqumico de protones que ejerce una fuerza protonmotriz. Debido a la impermeabilidad de la membrana interna, el retorno de protones a la matriz slo puede hacerse a travs de la ATPsintetasa. Esta protena utiliza la energa acumulada en el gradiente de H+ para fosforilar el ADP y transformarlo en ATP . El resultado es la fosforilacin oxidativa.

Fosforilacin oxidativa
Proceso por el cual los electrones se transfieren desde el NADH2 y FADH2 al O2 a travs de tres complejos proteicos de la membrana mitocondrial interna

Rendimiento energtico

Resumen de catabolismo organtrofo de la glucosa

Metabolismo y actividad fsica


El objetivo final del metabolismo en los musculos es la sntesis de ATP, necesario para el trabajo del musculo . El almacenamiento de ATP en los msculos es limitado ( para unos minutos), y el ATP se agota y se renueva unas 5000 veces al da. La glicolisis cataboliza la glucosa a partir del glucgeno. La gliclisis es mas rpida que la respiracin aerbica, y la la fosforilacin oxidativa. Durante el ejercicio debido a una falta de oxgeno (anaerobiosis), se produce cido lctico. Dopaje uso de esteroides anablico-andrognicos

RESPIRACIN ANXICA
Respiracin anaerobia o anxica: no interviene el oxgeno, y se emplean otros aceptores finales de electrones, generalmente minerales.

Ejemplo: Oxidacin del amoniaco

CATABOLISMO DE LIPIDOS (triglicridos)


Los triglicridos (grasas y aceites) ingeridos en la alimentacin, son hidrolizados por las lipasas intestinales hasta glicerol y cidos grasos libres:

Catabolismo de los lpidos

cido graso

Glicerina

cido graso

Glicerina 3 cidos grasos

cido graso

Lpido

Catabolismo de los lpidos


El glicerol es absorbido como tal y rpidamente sufre transformacin a dihidroxiacetona fosfato.

La 3-fosfo dihidroxiacetona (3 P DHA) formada, entra a la va glicoltica y se oxida hasta piruvato que luego pasar a Acetil CoA

Oxidacin de glicerina
Glicerina Glicerina quinasa ------- Mg+2 ADP NAD Glicerina fosfato deshidro genasa ------------- NADH2

+ ATP

+ Glicerina3 fosfato

+ Glicerina -3 fosfato

+ Fosfato de dihidro acetona

Todos los compuestos de esta reaccin entran a la va glucoltica.

oxidacin de los cidos grasos

La oxidacin de los cidos grasos se realiza en dos etapas. En la primera, el carbono 3 (carbono beta) es oxidado y se eliminan 2 tomos de carbono de la cadena hidrocarbonada del cido, formndose Acetil-CoA. En la segunda etapa, el Acetil-CoA es oxidado hasta CO2 y H20 a travs del ciclo de Krebs y la fosforilacin oxidativa.

Oxidacin de los cidos grasos

Catabolismo de protenas
Las protenas son demasiado grandes para atravesar las membranas Los microorganismos excretan proteasas que hidrolizan las protenas exgenas a pptidos. Proteasas Peptidasas Protenas----- Pptidos------- Aminocidos Procesos posteriores: Eliminacin del grupo amino y la oxidacin del esqueleto carbonado.

a) Oxidacin del esqueleto carbonado


Los esqueletos carbonados de los diversos aminocidos que forman el conjunto bsico de 20 son canalizados hacia la formacin de siete molculas: piruvato, acetil-CoA, acetoacetil-CoA, a-cetoglutarato, succinil-CoA, fumarato y oxalacetato Mediante estas rutas catablicas diferentes se obtienen: cido pirvico, acetil-CoA u otros intermediarios del ciclo de Krebs. Estos compuestos pueden oxidarse completamente dando CO2 y H2O, o utilizarse para la sntesis de glucosa y cidos grasos que posteriormente sern utilizados como combustibles.

b) Eliminacin del grupo amino


Dos etapas: transaminacin y desaminacin oxidativa. Transaminacin: Transfiere el grupo amino del aminocido a un cetocido, ( ac. Cetoglutrico) que se transforma en cido glutmico, por accin de transaminasas. As, se recogen los grupos aminos de distintos aminocidos en uno slo, el cido glutmico. Desaminacin oxidativa: a continuacin, el cido glutmico, por accin de la glutamato deshidrogenasa, sufre una oxidacin; los hidrgenos son recogidos por el NAD+ o NADP+, que se reducen, y se libera el grupo amino en forma de amoniaco, regenerndose al -cetoglutrico que podr ser utilizado en nuevas transaminaciones. El amoniaco de convierte en sales de amonio.

RESUMEN DE ORGANOTROFOS

Almidn Glucosa 6C

Azcares complejos

Rutas de otros compuestos en la respiracin aerbica

Glicerol 3C Gliceraldehdo 3 P 3C Aminocidos 3C cido Lctico 3C cido pirvico 3C

cidos Grasos

Aminocidos 2C

Acetil CoA 2C

Alcohol 2C

Otros aminocidos de ms de 3C

Ciclo de los cidos tricarboxlicos

ANABOLISMO
Son los procesos del metabolismo que tienen como resultado la sntesis de componentes celulares a partir de precursores de baja masa molecular, por lo que recibe tambin el nombre de biosntesis. En estos procesos se consume energa. Los seres vivos utilizan estas reacciones para formar, por ejemplo, protenas a partir de aminocidos. Mediante los procesos anablicos se crean las molculas necesarias para formar nuevas clulas.

Ejemplos del Anabolismo:


Fotosntesis, Sntesis de protenas, Sntesis de carbohidratos, Formacin de glucosa a partir de piruvato. Gluconeogenesis, Sntesis de DNA a partir de nucletidos.

Gluconeogenesis. Es un mecanismo de sntesis de glucosa. La gluconeognesis es omnipresente, presente en las plantas, animales, hongos, bacterias y otros microorganismos. El proceso es altamente exergnico. Por ejemplo, la va que conduce de piruvato a la glucosa-6-fosfato requiere 4 molculas de ATP y 2 molculas de GTP.

GLUCONEOGENESIS

Sintesis de cidos grasos


En la etapa preparatoria, se produce malonil-CoA a partir de acetil-CoA. El malonil-CoA, aporta dos de sus tres tomos de carbono al esqueleto carbonado del cido graso en crecimiento.

Sntesis de cidos grasos


Por accin enzimtica se condensan un acetil-ACP y un malonil-ACP (derivado del anterior), por lo que se juntan 4 carbonos de golpe.

En los ciclos siguientes ya solo se aadir un malonil-ACP, por lo que se irn aadiendo carbonos de dos en dos. El producto final del proceso es siempre cido palmtico, un cido graso saturado de 16 carbonos. A partir de l, una vez transportado al retculo endoplasmtico, pueden sintetizarse otros cidos grasos.
8 Acetil-CoA + 14 (NADPH + H+) + 7 ATP cido palmtico (C16) + 8 CoA + 14 NADP+ + 7 (ADP + Pi) + 6 H2O

Relacin catabolismo- anabolismo


El catabolismo, produce las molculas precursoras, ATP y poder reductor (NADHH o NADHP) para el anabolismo

TRABAJO PRACTICO 2
Uso potencial de Zimonona mbilis, en produccin de bioetanol. Accin txica del cianuro. Bioqumica de la degradacin microbiana del cianuro. Bioqumica de la produccin de glicerol y alcoholes superiores en bebidas alcohlicas.