LIC. CARLOS A.

MEDINA PANTA

Friedrich Miescher, trabajando en el laboratorio de Flix Hoppe-Seyler, en el Castillo de Tbingen (Alemania), descubri en 1869 el ADN, al que llam nuclena

Me parece que va a emerger una completa familia de estas nuclenas que contienen fsforo que quiz merezca igual consideracin que las protenas

Hoy conocido como nucleoprotenas, en 1872 mostro que las cabezas aisladas de espermatozoides contenan un compuesto acido, conocido ahora como acido nucleico.

LOS NUCLEOTIDOS
Son biomolculas pequeas, compuestas por C, H, O,

N y P. Estas molculas de bajo peso molecular participan en una amplia variedad de procesos qumicos. Se pueden encontrar en la clula: - Constituyendo los cidos nucleicos (precursores monomricos) - Libres como fuente ubicua de alta energa

AZUCAR (PENTOSA) COMPONENTES DE LOS NUCLEOTIDOS

BASE NITROGENADA

ACIDO FOSFORICO

Azcar
El azcar, en el caso de los cidos desoxirribonucleicos

(ADN) es la 2-desoxi-D-ribosa y en el caso de los cidos ribonucleicos (ARN) es la D-ribosa.

Bases Nitrogenadas
Las bases nitrogenadas que forman parte de los cidos

nucleicos son de dos tipos, pricas y pirimidnicas.

 Las bases pirimidnicas (derivadas de la pirimidina) son:

Timina (2,6-dihidroxi-5-metilpirimidina o tambin llamada 5-

metiluracilo) Citosina (2-hidroxi-6-aminopirimidina) Uracilo (2,6-dihidroxipirimidina).

 Las bases pricas derivadas de la purina (fusin de un anillo pirimidnico y uno de imidazol) son la

Adenina (6-aminopurina) y la Guanina (2-amino6-hidroxipurina).

 Las bases pirimidnicas (derivadas de la pirimidina) son:

Timina (2,6-dihidroxi-5-metilpirimidina o tambin llamada 5-

metiluracilo) Citosina (2-hidroxi-6-aminopirimidina) Uracilo (2,6-dihidroxipirimidina).

cido fosfrico
Une dos pentosas a travs de una unin fosfodiester. Esta unin se hace entre el C-3de la pentosa, con el C5de la segunda.

Conformacin de un Nucletido
En la purinas, la unin se realiza con el nitrgeno 9 y en las pirimidinas con el nitrgeno 1. El enlace entre el carbono 1 del azcar y el nitrgeno de la base se denomina enlace glucosdico.

FUNCIONES DE LOS NUCLETIDOS

Estas molculas cumplen TRES funciones cruciales:

TRANSPORTAN ENERGA (NUCLETIDOS NO NUCLEICOS) ACTAN COMO COENZIMAS Y PARTICIPAN EN REACCIONES METABLICAS (NUCLOTIDOS NO NUCLEICOS) TRANSMITEN LOS CARACTERES HEREDITARIOS (CIDOS NUCLEICOS)

TRANSPORTAN ENERGA
Cada nucletido puede contener : Un grupo de cido fosfrico (monofosfato: AMP), Dos grupos fosfato (difosfato:ADP) o Tres grupos fosfato (trifosfato: ATP)

Los nucletidos (gracias a los enlaces fosfoster) , son fuentes preferidas en las clulas para la transferencia de energa. Los nucletidos se encuentran en un estado estable cuando poseen un solo grupo de acido fosfrico. Cada grupo de fosfato adicional que posea un nucletido se encuentra en un estado ms inestable y el enlace del fosfato tiende a romperse por hidrlisis y liberar la energa que lo une al nucletido.

ACTAN COMO COENZIMAS Y PARTICIPAN EN REACCIONES METABLICAS

TRANSMITEN LOS CARACTERES HEREDITARIOS

Para cumplir esta funcin, los nuclotidos se polimerizan formando polinucletidos en forma de cadena, llamados cidos nucleicos.

NUCLEOTIDO Y NUCLEOSIDO

La unin de la base nitrogenada a la pentosa recibe el nombre de NUCLESIDO y se realiza a travs del carbono 1 de la pentosa y los nitrgenos de las posiciones 1 (pirimidinas) o 9 (purinas) de las bases nitrogenadas mediante un enlace de tipo Nglucosdico. La unin del nuclesido con el cido fosfrico se realiza a travs de un enlace de tipo ster (se forma por esterificacin) entre el grupo OH del carbono 5 de la pentosa y el cido fosfrico, originando un Nucletido.

Nomenclatura
BASES pricas Adenina (A) Guanina(G) BASES pirimidnicas Citosina (C) Timina (T) Uracilo NUCLESIDO Adenosina Guanosina NUCLESIDO Citidina Timidina Uricidina NUCLETIDO Adenilato Guanilato NUCLETIDO Citidinato Timidinato Uridilato

dCMP

dTMP

dAMP

dGMP

Estructura de los desoxirribonucletidos

CMP

UMP

AMP

GMP

Estructura de los ribonucletidos

 Los cidos nucleicos son macromolculas, polmeros

formados por la repeticin de monmeros llamados nucletidos, unidos mediante enlaces fosfodiester. Se forman, as, largas cadenas o polinucletidos, lo que hace que algunas de estas molculas lleguen a alcanzar tamaos gigantes (de millones de nucletidos de largo).
SON COMPUESTOS DE ELEVADO PESO MOLECULAR, ES DECIR MACROMOLCULAS

 Nuclesido = Pentosa + Base nitrogenada.

Nucletido = Pentosa + Base nitrogenada + cido fosfrico.

Polinucletido = Nucletido + Nucletido + Nucletido + ....

 Los nucletidos se unen entre si para formar largas cadenas de

polinucletidos, esta unin entre monmeros nucletidos se realiza mediante enlaces fosfodister entre los carbonos de las posiciones 3 de un nucletido con la 5 del siguiente.

Polinucletido

TIPOS DE ACIDOS NUCLEICOS

ADN (cido desoxirribonucleico). Sus nucletidos tienen desoxirribosa como azcar y no tiene uracilo
ARN (cido ribonucleico).Sus nucletidos tienen ribosa y no tienen timina

Funciones de los cidos Nucleicos

SNTESIS DE PROTINAS ESPECFICAS DE LA

CLULA
ALMACENAMIENTO, REPLICACIN Y TRANSMISIN

DE LA INFORMACIN GENTICA (Son las molculas que determinan lo que es y hace cada una de las clulas vivas)
La funcin principal del ARN es servir como

intermediario de la informacin que lleva el ADN en forma de genes y la protena final codificada por esos genes.

EL ADN
El cido desoxirribonucleico,

frecuentemente abreviado como ADN, es un tipo de acido nucleico, una macromolcula que forma parte de todas las clulas. Contiene la informacin gentica usada en el desarrollo y el funcionamiento de los organismos vivos conocidos y de algunos virus, siendo el responsable de su transmisin hereditaria.

ADN : polmero lineal formado por desoxirribonucletidos de A, G, C, T

ESTRUCTURA 1aria : es la secuencia de nucletidos

ESTRUCTURA 2aria : es la estructura espacial que adoptan los nucletidos

Tema 6: cidos nucleicos

ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ADN

Extremo 5 Es la secuencia de nucletidos, unidos por enlaces fosfodister en sentido 5-3.

Adenina

La cadena presenta dos extremos libres: el 5 unido al grupo fosfato y el 3 unido a un hidroxilo. Cada cadena se diferencia de otra por: > Su tamao > Su composicin. > Su secuencia de bases.

Citosina

Guanina

La secuencia se nombra con la inicial de la base que contiene cada nucletido:

ACGT
GEN: informacin contenida en una porcin de ADN que lleva la informacin necesaria para que los aminocidos se unan en un determinado orden formando la estructura 1aria de una protena.

Timina
Extremo 3

 ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN

Hemos encontrado el secreto de la vida! Hemos encontrado el secreto de la vida!

J.Watson

F.Crick

Son macromolculas encargadas de:

Almacenar informacin gentica Transmitir informacin gentica del ncleo a citoplasma de padres a hijos Expresar la informacin gentica

Existen 2 tipos de cidos Nucleicos:

ADN ARN

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN: ANTECEDENTES

En 1950 se conocan solo algunos datos acerca de la estructura 2 del ADN: Chargaff: analiz muestras de R.Franklin y Wilkins: con ADN de distintas especies y experimentos de difraccin de concluy que en toda cadena de rayos X concluyeron que el ADN ADN, la proporcin de bases era una molcula larga y rgida. pricas es igual a la de Existan 2 periodicidades pirimidinas:

A=T y G=C
Si bien en la proporcin exacta de estas bases es distinta en cada especie.

(detalles estructurales repetidos) a 0.34 y a 3.4 nm

A Sp 1 Sp 2 35% 20%

T 35% 20%

G 15% 30%

C 15% 30%

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN: ANTECEDENTES

La proporcin de Adenina es igual a la de Timina A=T

Estudios de Erwin Chargaff

La proporcin de Guanina es igual a la de Citosina G=C La proporcin de bases pricas (A+G) es igual a la de bases pirimidnicas (T+C) (A+G) = (T+C) La proporcin entre (A+T) y (G+C) es caracterstica de cada organismo, tomando valores diferentes segn la especie

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN: ANTECEDENTES

Estudios de DIFRACCIN DE RAYOS X (Maurice Wilkins Rosalind Franklin)

Las bases pricas y pirimidnicas se encuentran unas sobre otras, apiladas a lo largo del eje del polinucletido a una distancia de 3,4 . Las bases son estructuras planas orientadas de forma perpendicular al eje (Astbury, 1947). El dimetro del polinucletido es de 20 y est enrollado helicoidalmente alrededor de su eje. Cada 34 se produce una vuelta completa de la hlice. Existe ms de una cadena polinucleotdica enrollada helicoidalmente (Wilkins et el. 1953, Frankling y Gosling, 1953).

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN: ANTECEDENTES

La ciencia y la vida ni pueden ni deben estar separadas. Para m la ciencia da una explicacin parcial de la vida. Tal como es se basa en los hechos, la experiencia y los experimentos Estoy de acuerdo en que la fe es fundamental para tener xito en la vida, pero no acepto tu definicin de fe, la creencia de que hay vida tras la muerte. En mi opinin, lo nico que necesita la fe es el convencimiento de que esforzndonos en hacer lo mejor que podemos nos acercaremos al xito, y que el xito de nuestros propsitos, la mejora de la humanidad de hoy y del futuro, merece la pena de conseguirse. As se expresaba Rosalind Franklin hacia 1940, cuando tena veinte aos, en una carta a su padre con quien, como buena e inteligente hija, discrepaba en varias cuestiones.

Rosalind Franklin con su hermana Jenifer (1930).

Un mundo de hombres? Antes de trabajar con el ADN, Rosalind estudi la porosidad del carbn y tras obtener su doctorado se especializ en la tcnica de difraccin de rayos X, la que luego sirvi para obtener una fotografa ya clebre, que Maurice Wilkins mostr indiscretamente a un joven americano, James Watson que en colaboracin con el britnico Francis Crick, estaba obsesionado por vencer a su compatriota Linus Pauling en la carrera por descifrar la estructura del ADN. Pese a ser la cientfica que obtuvo los datos que permitieron definir que el ADN tiene estructura de doble hlice, no fue premiada con el Nobel. Haba fallecido en 1958, cuatro aos antes de que la Academia Sueca reconociese la importancia del descubrimiento..

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN: FORMA B (modelo de Watson y Crick)

2 nm

Es una doble hlice de 2 nm de dimetro

Armazn fosfoglucdico

Las bases nitrogenadas se encuentran en el interior Las parejas de bases se encuentran unidas a un armazn formado por las pentosas y los grupos fosfato

0,34 nm 3,4 nm

Par de bases nitrogenadas

El enrollamiento es dextrgiro y plectonmico.

Cada pareja de nucletidos est situada a 0,34 nm de la siguiente y cada vuelta de doble hlice contiene 10 pares de nucletidos

Las dos cadenas son antiparalelas y complementarias (A-T y C-G).

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN

Extremo 5 Extremo 3

Extremo 3

Extremo 5

SON ANTIPARALELAS

COMPLEMENTARIEDAD DE BASES

Las bases siempre son complementarias (A con T) y (C con G)

Las bases de ambas cadenas se mantienen unidas por enlaces de hidrgeno

Adenina

Timina 2 Enlaces de hidrgeno

Guanina

Citosina 3 Enlaces de hidrgeno

El nmero de enlaces de hidrgeno depende de la complementarieda d de las bases

A=T

GC

4.- Estructuras alternativas a la doble hlice

Configuracin de Watson y Crick = FORMA B

forma de mayor inters biolgico por ser la que se encuentra al estudiar el ADN en disolucin forma en que normalmente interacciona el ADN con las protenas del ncleo

FORMA A
se obtiene por deshidratacin de la B (slo en condiciones de laboratorio) doble hlice dextrgira + ancha y + corta que la forma B, pares de bases 20o respecto al eje

FORMA Z
aparece cuando alternan muchos nucletidos de G y C (GCGCGCGCGC). Presente en algunos virus hlice LEVGIRA enrollada en ZIGZAG, + larga y + estrecha que la forma B

ADN-A

ADN-B

ADN-Z

Reconoces estas estructuras?

ADN-A
Sentido de giro de la hlice Forma y tamao Surco mayor Surco menor Dimetro de la hlice Pares de bases/vuelta Dextrgiro Ms ancha y corta Estrecho Profundo Amplio No profundo 2,55 nm 11

ADN-B
Dextrgiro Intermedia Amplio Profundidad media Estrecho Profundidad media 2,37 nm 10,4 0,34 nm 3,54 nm 34,6 1,2

ADN-Z
Levgiro Ms estrecha y larga Sin profundidad Estrecho Profundo 1,84 nm 12 0,53 nm (GC) 0,41 nm (CG) 4,56 nm 30 9

Distancia entre pares de bases 0,23 nm Paso de hlice o vuelta completa Rotacin por residuo Inclinacin de los pares de bases 2,53 nm 32,7 19

5.- Funcin biolgica del ADN ADN es el almacn de la informacin gentica y la molcula encargada

de transmitir a la descendencia las instrucciones necesarias para construir todas las protenas presentes en un ser vivo Las 3 funciones bsicas del ADN pueden resumirse en:

ALMACENAR

TRANSMITIR REPLICACIN DEL ADN

EXPRESAR

 Estructura terciaria

 En la cromatina, la doble hlice de ADN se enrolla

alrededor de unas molculas proteicas globulares, las histonas, formando los nucleosomas. Cada nucleosoma contiene 8 histonas y la doble hlice de ADN da dos vueltas a su alrededor (200 pares de bases). El conjunto, si no est ms empaquetado an, forma una estructura arrosariada llamada collar de perlas.

 Ahora bien, los nucleosomas pueden empaquetarse

formando fibras de un grosor de 30 nm (fibra de 30 nm). Segn el modelo del solenoide las fibras se forman al enrollarse seis nucleosomas por vuelta alrededor de un eje formado por las histonas H1

 Los siguientes niveles de empaquetamiento no estn

an aclarados del todo pero, parece ser, que cada fibra se volvera a enrollar formando un bucle (cada bucle tendra 50 millones de pares de bases) Seis bucles se empaquetaran asocindose a un " esqueleto nuclear" producindose un rosetn, 30 rosetones formaran una espiral y 20 espirales formaran una cromtida.

Del DNA al Cromosoma

"Cuentas de rosario" de la cromatina Un rosetn (6 bucles)

Una vuelta de espiral (30 rosetones)

Fibra de 30 nm DNA

Un bucle (50 X 106 pb)

Dos cromtidas (de 2 X 10 vueltas de espiral)

Tipos de ADN
VIRUS PROCARIOTAS EUCARIOTAS

Cadena nica Cadena doble

Circular Circular Enrollado Desnudo

Cadena doble
Enrollado

Desnudo

Unido a protenas (Histonas) formando nucleosomas

El cido ribonucleco se forma por la polimerizacin de ribonucletidos. Estos a su vez se forman por la unin de: a) Un grupo fosfato. b) Ribosa, una aldopentosa cclica y c) Una base nitrogenada unida al carbono 1 de la ribosa, que puede ser citocina, guanina, adenina y uracilo. Esta ltima es una base similar a la timina.

 En general los ribonucletidos se unen entre s,

formando una cadena simple, excepto en algunos virus, donde se encuentran formando cadenas dobles. La cadena simple de ARN puede plegarse y presentar regiones con bases apareadas, de este modo se forman estructuras secundarias del ARN, que tienen muchas veces importancia funcional, como por ejemplo en los ARNt (ARN de transferencia).

Se conocen tres tipos principales de ARN y todos ellos participan de una u otra manera en la sntesis de las protenas. Ellos son: ARN mensajero (ARNm) ARN ribosomal (ARNr) ARN de transferencia (ARNt).

 Consiste en una molcula lineal de nucletidos (monocatenaria), cuya secuencia de bases es complementaria a una porcin de la secuencia de bases del ADN. El ARNm dicta con exactitud la secuencia de aminocidos en una cadena polipeptdica en particular. Las instrucciones residen en tripletes de bases a las que llamamos codones. Son los ARN ms largos y pueden tener entre 1000 y 10000 nucletidos

 Este tipo de ARN una vez transcripto, pasa al nucleolo

donde se une a protenas. De esta manera se forman las subunidades de los ribosomas. Aproximadamente dos terceras partes de los ribosomas corresponde a sus ARNr.

 Este es el ms pequeo de todos, tiene aproximadamente 75 nucletidos en su cadena, adems se pliega adquiriendo lo que se conoce con forma de hoja de trbol plegada. El ARNt se encarga de transportar los aminocidos libres del citoplasma al lugar de sntesis proteica. En su estructura presenta un triplete de bases complementario de un codn determinado, lo que permitir al ARNt reconocerlo con exactitud y dejar el aminocido en el sitio correcto. A este triplete lo llamamos anticodn.

Molcula de ARNt

PROBLEMAS SOBRE ACIDOS NUCLEICOS

Dada una hebra simple de DNA 3'-TACCGAGTAC-5' construya la cadena de ADN complementaria y la cadena de RNAm que se formara de esta banda. 2. Si una molcula de una doble hlice de DNA tiene un contenido G+C del 56%, cules son los porcentajes de las cuatro bases (A, T, G y C) de esta molcula? 3. Un DNA de cadena sencilla tiene la siguiente composicin de bases A=26%, G=31%, T=23% y C=20%. Cual ser la proporcin de bases en una cadena complementaria de RNA obtenida
1.

4. Supngase que la cantidad de T de una especie

bacteriana es del 20% del total de las bases de su ADN. Cul es la proporcin de cada una de las otras bases? 5. Si la relacin A+G/T+C es del 0.7 en una hebra de ADN, se desea saber cuanto vale esta proporcin en la hebra complementaria y en la molcula completa. 6. En un fago cuyo material hereditario es ADN monocatenario se encuentran las siguientes proporciones: A/T=0.5, A/G=0.25 y G/C=2. Calcular la proporcin relativa de bases pricas y pirimidnicas.

7. Supn que la relacin A+G/C+T en una cadena

simple de ADN vale 1. Cunto valdr dicha relacin en una cadena doble resultante de la replicacin?