Definicin: Se define como mutacin a todo cambio hereditario en la
secuencia de bases del ADN (o ARN) que no resulte de la incorporacin de material gentico exgeno. Dicho cambio puede manifestarse o no fenotipicamente. Las mutaciones se pueden clasificar por la forma en que ocurren o por la alteracin en el genotipo que producen. SELECCIN Definicin: En un cultivo puro hay varios miles de clulas mutantes para cualquier gen, que consideremos, por lo tanto un cultivo grande de bacterias tiene una gran variabilidad potencial, dispuesta a intervenir en respuesta directa a los cambios ambientales . Esto significa que ninguna poblacin grande de bacterias es genticamente pura. Las selecciones se hacen con antibiticos, temperatura, presin osmtica, etc. ADAPTACIN Definicin: Puede ser de origen gentico o no, las de origen gentico, consisten en la accin de seleccin sobre las variaciones heredables. Las no heredables o fisiolgicas consisten en una adecuacin fenotpica directa. La clula sufre un cambio fisiolgico no heredable en respuesta directa al ambiente. Los microorganismos mediante tcnicas especificas sufren cambios en el genotipo o fenotipo que las hacen aptas para desarrollarse. MUTACIN ESPONTNEA E INDUCIDA 1. Mutacin espontnea: se produce de forma natural o normal en los individuos. 2. Mutacin inducida: se produce como consecuencia de la exposicin a agentes mutagnicos qumicos o fsicos.
MUTACIONES GNICAS 1. Sustituciones de bases: cambio o sustitucin de una base por otra en el ADN. 2. Transiciones: cambio de una purina (Pu) por otra purina, o bien cambio de una pirimidina (Pi) por otra pirimida. 3. Transversiones: cambio de una purina (Pu) por una pirimidina (Pi) o cambio de una pirimidina (Pi) por una purina (Pu). 4. Inserciones o adiciones y deleciones de nucletidos: se trata de ganancias de uno o ms nucletidos (inserciones o adiciones) y de prdidas de uno o ms nucletidos (deleciones). Tienen como consecuencia cambios en el cuadro o pauta de lectura cuando el nmero de nucletidos ganado o perdido no es mltiplos de tres. 5. Duplicaciones: consiste en la repeticin de un segmento de ADN del interior de un gen. 6. Inversiones: un segmento de ADN del interior de un gen se invierte, para ello es necesario que se produzcan dos giros de 180 , uno para invertir la secuencia y otro para mantener la polaridad del ADN. 7. Transposiciones: un segmento de un gen cambia de posicin para estar en otro lugar distinto del mismo gen o en otro lugar del genoma. Tipos de mutaciones gnicas Resultados y ejemplos en el ADN en el ADN Transiciones PuPu o PiPi: ATGC, GCAT , CGTA y TACG Transversiones PuPi o PiPu: ATCG,A T TA , GCTA, GCCG, TAGC, T A AT, CGAT y CGGC En la protena En la protena Mutacin silenciosa Tripletes que codifican para el mismo aminocido: AAG(arg)CGG(arg) Mutacin neutra Tripletes que codifican para aminocidos equivalentes distintos. AAA(lys)AGA(arg). Ambos son aminocidos bsicos Mutacin cambio de sentido Aparece un nuevo triplete que codifica para un aminocido de distinto tipo. La protena pierde su funcin. Mutacin sin sentido Aparece un triplete de terminacin o FIN: CAG(gln)UAG(FIN) Mutacin cambio de fase o pauta de lectura Adicin o delecin de un nico par de nucletidos o de varios pares de nucletidos, siempre que no sean mltiplo de tres MUTACIN SILENCIOSA Una mutacin silenciosa es cualquier alteracin en la secuencia de nucletidos del ADN que no produce cambio en el fenotipo estudiado. Imaginemos que la caracterstica externa o fenotipo analizado es simplemente la funcin de un enzima, es evidente que existen mutaciones en la secuencia de nucletidos del ADN que no producen cambios en la secuencia de aminocidos, pero tambin hay mutaciones en el ADN que producen cambios en la secuencia de aminocidos que no alteran la funcin del enzima analizado. Ambas tipos de mutaciones son silenciosas, ya que ninguna altera la funcin del enzima. MUTACIONES ESPONTNEAS Las principales causas de las mutaciones que se producen de forma natural o normal en las poblaciones son tres: Errores durante la replicacin. Lesiones o daos fortuitos en el ADN. Los elementos genticos transponibles.
ERRORES EN LA REPLICACIN Vamos a considerar tres tipos de errores durante la replicacin del ADN: La tautomera: las bases nitorgenadas se encuentran habitualmente en su forma cetnica y con menos frecuencia aparecen en su forma tautomrica enlica o imino. Las formas tautomricas o enlicas de las bases nitrogenadas (A*, T*, G* y C*) muestran relaciones de apareamiento distintas: A*-C, T*- G, G*-T y C*-A. El cambio de la forma normal cetnica a la forma enlica produce transiciones. Las mutaciones de cambio de fase o pauta de lectura: se trata de inserciones o deleciones de uno o muy pocos nucletidos. Segn un modelo propuesto por Streisinger, estas mutaciones se producen con frecuencia en regiones con secuencias repetidas. En las regiones con secuencias repetidas, por ejemplo, AAAAAAAAAAA..., o por ejemplo, ATATATATATATATAT...., durante la replicacin se puede producir el deslizamiento de una de las dos hlices (la hlice molde o la de nueva sntesis) dando lugar a lo que se llama el "apareamiento errneo deslizado". El deslizamiento de la hlice de nueva sntesis da lugar a una adicin, mientras que el deslizamiento de la hlice molde origina una delecin Deleciones y duplicaciones grandes: las deleciones y duplicaciones de regiones relativamente grandes tambin se han detectado con bastante frecuencia en regiones con secuencias repetidas. En el gen lac I de E. coli se han detectado deleciones grandes que tienen lugar entre secuencias repetidas. Se cree que estas mutaciones podran producirse por un sistema semejante al propuesto por Streisinger ("Apareamiento errneo deslizado") o bien por sobrecruzamiento desigual. Del sobrecruzamiento desigual hablaremos ms adelante en el curso.
LESIONES O DAOS FORTUITOS EN EL ADN Pueden darse tres tipos de daos fortuitos en el ADN: Despurinizacin: rotura del enlace glucosdico entre la base nitrogenada y el azcar al que est unida con prdida de una Adenina (A) o de una Guanina (G). Como consecuencia aparecen sedes Apurnicas. Existe un sistema de reparacin de este tipo de lesiones en el ADN. Este tipo de lesin es la ms recurrente o frecuente: se estima que se produce una prdida de 10.000 cada 20 horas a 37C. Desaminacin: consiste en la prdida de grupos amino. La Citosina (C) por desaminacin se convierte en Uracilo (U) y el Uracilo empareja con Adenina (A) producindose transiciones: GCAT. El Uracilo (U) no forma parte del ADN, existindo un enzima llamada glucosidasa de uracilo encargada de detectar la presencia de U en el ADN y retirarlo. Al retirar el Uracilo (U) se produce una sede apirimidnica. La 5-Metil-Citosina (5-Me-C) por desaminacin se convierte en Timina (T). La Timina (T) es una base normal en el ADN y no se retira, por tanto estos errores no se reparan. Este tipo de mutacin tambin genera transiciones. Daos oxidativos en el ADN: El metabolismo aerbico produce radicales superoxido O2, perxido de hidrgeno H2O2 e hidroxilo. Estos radicales producen daos en el ADN, y una de las principales alteraciones que originan es la transformacin de la Guanina (G) en 8-oxo-7,8-dihidro-desoxiguanina que aparea con la Adenina (A). La 8-oxo-7,8-dihidro-desoxiguanina recibe el nombre abreviado de 8-oxo-G. Esta alteracin del ADN produce transversiones: GCTA. La Timidina se convierte en Glicol de timidina.
TRANSPOSONES EN BACTERIAS La existencia de transposones o elementos genticos mviles se demostr en bacterias. En bacterias existen dos tipos de elementos genticos mviles: Tipos de transposones: Transposn Simple, Secuencia de Insercin o Elemento de Insercin (IS): los transposones simples contienen una secuencia central con informacin para la transposasa y en los extremos una secuencia repetida en orden inverso. Esta secuencia repetida en orden inverso no es necesariamente idntica, aunque muy parecida. Cuando un transposn simple se integra en luna determinado punto del ADN aparece una repeticin directa de la secuencia diana (5-12 pb). Transposn Compuesto (Tn): contienen un elemento de insercin (IS) en cada extremo en orden directo o inverso y una regin central que adems suele contener informaciin de otro tipo. Por ejemplo, los Factores de transferencia de resistencia (RTF), poseen informacin en la zona central para resistencia a antibiticos (cloranfenicol, kanamicina, tetraciclina, etc
Tipos de transposicin: En general se distinguen dos tipos o formas de transposicin: Transposicin conservativa: el transposn sale de la sede donadora que queda vaca y se incorpora en una nueva sede (sede receptora). No aumenta el nmero de copiasz del transposn en el interior de la clula. Transposicin replicativa: el transposn permanece en la sede donadora y mediante un mecanismo combinado de replicacin y recombinacin se incorpora en la sede aceptora. Aumenta el nmero de copias del transposn en el interior de la clula.
MUTACIONES INDUCIDAS MECANISMOS DE MUTAGNESIS
Los principales mecanismos por los que se producen las mutaciones son los siguientes: 1. Remplazar una base en el ADN. 2. Mutgenos que alteran las bases produciendo emparejamientos errneos especficos. 3. Agentes de tipo intercalante. 4. Mutgenos que producen prdida del emparejamiento especfico.
1. Remplazar una base en el ADN: Los anlogos de bases son compuestos qumicos que pueden remplazar a una base determinada. Por ejemplo, el 5-Bromouracilo (5BU) es anlogo de la Timina (T) y puede remplazarla. El 5BU en su forma cetnica empareja con la Adenina (A) mientras que en su forma enlica (5BU*) empareja con la Guanina (G). El 5BU es ms inestable y produce transiciones. La 2-Aminopurina (2AP) es anlogo de la Adenina (A) y puede remplazarla. La 2AP aparea con la Timina (T) pero en su forma imno (2AP*) empareja con la Citosina (C). Esta alteracin produce transiciones.
2. Mutgenos que alteran las bases produciendo emparejamientos errneos especficos: existen varios tipos de agentes mutagnicos que alteran las bases nitrogenadas produciendo emparejamientos errneos 3. Agentes alquilantes: como el EMS que aade radicales etilo y produce transiciones GCAT. La NG aade radicales metilo y produce tambin transiciones GCAT. 4. Hidroxilamina (HA): produce especficamente transiciones GCAT. 5. Iones bisulfito y cido nitroso: producen desaminacin. El cido nitroso transforma la Citosina (C) en Uracilo (U), el Uracilo (U) empareja con la Adenina (A) produciendo transiciones. La desaminacin de las Adenina (A) la convierte en hipoxantina (H) que empareja con la Citosina (C) produciendo transiciones. 6 Agentes de tipo intercalante como la Proflavina, Naranja de acridina y Compuestos ICR: son compuestos con estructuras planas que se meten o intercalan entre las bases nitrogenadas del ADN produciendo adiciones o deleciones de un solo par de nucletidos
Mutgenos que producen prdida del emparejamiento especfico: estos mutgenos daan muchas bases nitrogenadas y producen como consecuencia un bloqueo de la replicacin del ADN. La mayora de los compuestos cancergenos producen este tipo de alteraciones. Debido a la gran cantidad de alteraciones que producen en el ADN como primera medida se produce un bloqueo de la replicacin y se ponen en marcha un sistema de emergencia denominado abreviadamente SOS para reparar los daos y permitir que la clula se replique y pueda seguir viviendo. El sistema SOS consta de al menos tres genes denominados recA, umuC y umuD. Este sistema produce un relajamiento de la especificidad de apareamiento de la ADN polimerasa III de E. coli. Algunos ejemplos de esta situacin son: Luz ultravioleta (UV): produce dmeros de pirimidinas. Cuando hay dos pirimidinas sucesivas en la misma hlice la luz UV hace que se produzcan puente de hidrgeno entre ambas. Los ms frecuentes son los dmeros de Timinas. Aflatoxina B1: se une a la Guanina (G) modificndola de manera que la Guanina modificada se separa del azcar al que estaba unida produciendo una sede apurnica. El sistema SOS pone habitualmente en la sede apurnica una Adenina (A) dando lugar a transversiones. Es un potente carcingeno. Benzopireno: es un producto resultante de los motores de combustin y es un potente carcingeno
REPARACIN DE LOS DAOS EN EL ADN
Cono hemos venido viendo hasta el momento, existen muchos agentes fsicos y qumicos que pueden producir lesiones en el ADN. Por tanto, deben existir mecanismos que permitan prevenir y reparar los daos que se producen en el material hereditario tanto de forma espontnea como los inducidos. Como ya hemos visto cuando hablamos de la replicacin del ADN, la propia ADN polimerasa III posee la subunidad que tiene una funcin correctora de pruebas que permite detectar cuando la ADN polimerasa ha introducido un nucletido que no es el correcto y retirarlo. Este es un primer mecanismo que evita que se produzcan mutaciones durante la replicacin. Adems de este mecanismo existen otros que previenen posibles daos y que reparan las lesiones producidas: Sistemas que evitan los errores antes de que ocurran. Reparacin directa de las lesiones en el ADN. Sistemas de reparacin por escisin. Reparacin posterior a la replicacin. SISTEMAS QUE EVITAN LOS ERRORES ANTES DE QUE OCURRAN
Superxido dismutasa: este enzima convierte los radicales superxido en perxido de hidrgeno. Catalasa: este enzima convierte el perxido de hidrgeno en agua. Gen mutT: este gen codifica para un enzima que impide la incorporacin de la 8-oxo-G al ADN. Este enzima hidroliza el trifosfato de la 8-oxo-G a la forma monofosfato. REPARACIN DIRECTA DE LAS LESIONES EN EL ADN Fotorreactivacin: sistema de reparacin directa de los daos producidos por la luz UV. La luz UV produce dmeros de pirimidinas, fundamentalmente dmeros de Timinas. El enzima Fotoliasa codificada por el gen phr reconoce en la oscuridad los dmeros de Timina y se une a ellos, y cuando se expone a la luz (mediante un fotn) deshace el dmero de Timinas. Transferasa de grupos alquilo (metilo o etilo): elimina los gupos alquilo producidos por el EMS o por NG. El enzima metiltransferasa transfiere el grupo metilo de la O-6-metilguanina a una cistena (cys) d SISTEMAS DE REPARACIN POR ESCISIN
Reparacin de los daos de la luz UV (Endonucleasa uvrABC): La Endonucleasa uvrABC es una escilnucleasa codificada por los genes uvrA, uvrB y uvrC que corta el ADN. La Helicasa II de ADN separa las dos hlices y retira 12 nucletidos. La ADN polimerasa I rellena el hueco producido por la Helicasa II y la Ligasa sella los extremos. Reparacin AP: reparacin de las sedes apurnicas o apirimidnicas. La llevan a cabo las Endonucleasas AP de la clase I que cortan por el extremo 3' y las de la clase II que cortan por el extremo 5'. Una exonucleasa elimina una pequea regin que contiene entre dos y 4 nucletidos, la ADN polimerasa I rellena el hueco y la Ligasa sella los extremos. Reparacin mediante glucosidasas: estas enzimas detectan las bases daadas y las retiran rompiendo el enlace N-glucosdico con el azcar. Como consecuencia se origina una sede AP que se repara de la forma indicada anteriormente (reparacin AP). La Glucosidasa de Uracilo elimina el Uracilo (U) del ADN. La Glucoxidasa de Hipoxantina, elimina la Hipoxantina (H) del ADN. Adems de estas dos glucosidasas existen otras diferentes. Sistema GO: dos glucosidasas producto de los genes mutM y mutY actan conjuntamente para eliminar las lesiones que produce la 8-oxo-G (GO). REPARACIN POSTERIOR A LA REPLICACIN
Reparacin de apareamientos incorrectos: la reparacin de apareamientos incorrectos posterior a la replicacin requiere la existencia de un sistema que sea capaz de realizar las siguientes operaciones: Reconocer las bases mal apareadas. Determinar cual de las dos bases es la incorrecta. Eliminar la base incorrecta y sintetizar. Esta reparacin la realizan los productos de los genes mutH, mutL, mutS y mutU. Adems, para distinguir la hlice de nueva sntesis de la hlice molde y as saber eliminar la base incorrecta, el sistema consiste utiliza el hecho de que la hlice de nueva sntesis tarda un cierto tiempo en metilarse la Adenina (A) de la secuencia GATC, mientras que la A de la secuencia GATC de la hlice molde ya est metilada. El enzima que reconoce la secuencia GATC metilando la A que contiene es la Metilasa de Adenina
Reparacin por recombinacin:
Cuando la ADN polimerasa III encuentra un dmero de Timina (T) producido por luz UV no sabe que nucletido poner saltando la regin y dejando un hueco. Como consecuencia esa regin queda como ADN de hlice sencilla. Debido a que la luz UV produce muchos dmeros de Timina, se produce un bloqueo en la replicacin y para evitar que la clula muera y pueda replicarse se dispara el sistema de emergencia SOS. La puesta en marcha del sistema SOS comienza porque el ADN de hlice sencilla activa a la protena RecA que a su vez interacciona con la protena LexA. La protena LexA es un represor de los genes uvrA, uvrB, uvrD, sulA y sulB. Todos estos genes tienen en el promotor una secuencia denominada caja SOS. La protena LexA normalmente impide la transcripcin o expresin de los genes citados anteriormente, pero cuando interacciona con la protena RecA deja de impedir la expresin de estos genes, pudindose sintetizar las protenas correspondientes y reparar los daos producidos por la luz UV REVERSIN
Restauracin total o parcial del fenotipo normal (apariencia externa, actividad proteica) a partir de un individuo mutante. Reversin genotpica: se produce por causas genticas. Reversin fenotpica: se produce por causas no genticas (ambientales). 1 mutacin 2 mutacin Individuo Normal Mutante Revertiente Fenotipo mutante Reversin Fenotipo normal
La reversin es una 2 mutacin que restaura total o parcialmente el fenotipo normal a partir de un individuo mutante. Al individuo que recupera el fenotipo normal por medio de esta 2 mutacin se le denomina Revertiente. REVERSIN GENOTPICA
La reversin genotpica se puede conseguir de dos maneras: Retromutacin (en sentido estricto): consiste en recuperar la secuencia exacta de nucletidos en el ADN. Mutacin supresora: es una mutacin secundaria que restaura total o parcialmente la funcin prdida. RETROMUTACIN
Consiste en recuperar la secuencia exacta de nucletidos en el ADN, un ejemplo de esta situacin sera: AAA (lys)GAA(glu)AAA(lys). A veces tambin se habla de retromutacin en sentido funcional, de manera, que se recupera la actividad enzimtica normal pero no se recupera la secuencia original de nucletidos en el ADN, por ejemplo: UCC(ser)UGC(cys)AGA(ser). Sin embargo, el concepto de retromutacin funcional no se diferencia del concepto de mutacin supresora y puede inducir a error. MUTACIN SUPRESORA
Es una mutacin secundaria que restaura total o parcialmente la funcin prdida.