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O:
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Imagens do
espao
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Sistema de segmentao interativa do
ventrculo esquerdo em sequncias de imagens
de ressonncia magntica (Cine MR)
Thiago Bilanche
Introduo
Isolamento de estruturas complexas como cmaras cardacas no
uma tarefa simples
Cine MR
Intensidade de cada pixel na imagem no depende somente do tipo
de tecido
Interferncia do paciente pela movimentao
Problema: Obteno de dados quantitativos utilizados em
alguns processos de diagnose depende da estimativa do
volume das cmaras cardacas do VE
Introduo
Desenhos de contorno
Preenchimento das regies desejadas
A primeira abordagem do processo de segmentao tem sido a
extrao das estruturas de forma manual
Muito Trabalhoso
Introduo
Ferramentas grficas de edio de fatias
Preenchimento e contorno de regies

Outra abordagem foi a utilizao de sistemas grficos
Alto consumo de tempo,
so pouco reproduzveis
e so sujeitos a variao.
Introduo
Soluo: Utilizao de tcnicas automatizadas de
anlises de imagens apresenta um grande
potencial para o auxilio do processo de
segmentao.
Introduo
Ranganath (1995) Modelo de contornos ativos ou snakes
Furuie et al (1996) Prope a segmentao do VE atravs de um
mtodo de expanso de balo
Hansen e Higgins (1997) Prope um mtodo baseado na
transformao de watershed
Mtodos
Objetivo
Neste trabalho props-se o desenvolvimento de um sistema
interativo d extrao de estruturas cardacas utilizando o
mtodo Watershed, implementado atravs de conceitos de
morfologia matemtica.
Metodologia
Um segmento um conjunto de pixels formado por uma regio homognea na imagem,
cercada por regies no homogneas ou por outros segmentos com diferentes nveis mdios
de cinza
Mtodo Watershed com Marcadores (Divisor de guas)
O mtodo de segmentao Watershed calcula o gradiente para todos os pixels da
imagem. Imagine que os valores de gradientes formem uma superfcie topogrfica com
vales e montanhas. As regies mais baixa seria as de menor gradiente e as regies mais
altas de maior gradiente.
Metodologia
Super-segmentao
Mnimos correspondem a rudos, estruturas
menores ou descontinuidade da imagem.
H um problema:
Houston,
Temos um problema
Metodologia
Uma das abordagens para evitar o problema da super-segmentao
realizao do mtodo Watershed atravs de marcadores, elementos
que so utilizados para fornecer uma informao adicional a respeito
das estruturas que sero segmentadas e a partir do quais linhas
divisoras sero inferidas.
Marcadores
Sequncias de aes:

1. A imagem pr-processada para remoo de rudos;
2. O gradiente da imagem computado;
3. A imagem de marcadores computada;
4. O watershed a partir dos marcadores computado na imagem do gradiente;
Metodologia
Metodologia de Projeto
Procedimentos so providos atravs de uma biblioteca de morfologia
matemtica, atravs desse ambiente, bibliotecas de procedimentos de imagens
implementadas em C tornam-se automaticamente acessveis pelas linguagens
Tcl/Tk e MATLAB.

Para desenvolvimento da interface foi utilizado a ferramenta de programao
Tcl/Tk

A execuo do sistema pode ser realizado tanto em plataformas unix como em
MS-Windows
Metodologia
Marcadores Parmetros
Imagens
Originais
Pr-
processamento
Segmentao
Ps-
processamento
Imagens
Segmentadas
Clculos
Resultados
Quantitativos
Resultados
Tela principal do sistema
interativo de segmentao
sobreposta pela janela de
zoom e pela janela de grfico
da variao volumtrica.
Resultados
Manipulao dos resultados
Volume sanguneo em cada fase do ciclo cardaco
Volume stroke
Volume de batimentos


Diferena de volume entre a
distole e a sstole
Resultados
Armazenamento dos resultados de segmentao feito pelo sistema:

Gravao de imagens binrias correspondente as imagens segmentadas

Gravao dos marcadores definidos pelo operador

Resultados
Resultados da segmentao em diferentes imagens
utilizando dois marcadores;
Resultados da segmentao em diferentes imagens
utilizando vrios marcadores;
Resultados
Testes comparativos:
1. Comparao dos resultados obtidos pelo sistema com os resultados da
segmentao manual
2. Avaliao do erro absoluto no clculo de volume ao longo das fases do
ciclo cardaco
3. Realizao de testes de reprodutibilidade, visando analisar as variaes
de segmentao entre um mesmo operador e diferentes operadores
4. Comparao entre segmentao de um mesmo exame com diferentes
formas de considerar os msculos papilares
5. Comparao das fraes de ejeo


Discusso
#Comparao dos resultados obtidos pelo sistema com os resultados
da segmentao manual:
Foram obtidos valores de erros aceitveis.
Como ilustrao foi apresentado o pior caso do conjunto, exame cujo a mdia
dos erros nas trs segmentaes realizadas foi 0,20 e o melhor caso, cuja
mdia foi de 0,08


Discusso
#Avaliao do erro absoluto no clculo de volume ao longo das fases
do ciclo cardaco

H uma perda de informao a respeito da localizao dos pixels na imagem binria resultante
da segmentao.
Discusso
#Realizao de testes de reprodutibilidade, visando analisar as
variaes de segmentao entre um mesmo operador e diferentes
operadores
As medidas obtidas mostram que a variabilidade mdia relativamente baixa
o que constitui um ponto bastante positivo para o sistema.


No se conta com medidas de variabilidade intra-operador e inter-operadores
associadas a segmentao manual, mas estima-se que a reprodutibilidade no
caso manual seja bem menor que a encontrada no caso do mtodo em questo,
pois a segmentao manual depende apenas da habilidade do operador.
Discusso
Comparao entre segmentao de um mesmo exame com diferentes
formas de considerar os msculos papilares
A segmentao seguindo a tendncia do mtodo (incluso de msculos papilares
que encontram-se no interior da cavidade e excluso dos msculos que
encontram-se prximos borda) no est muito distante da segmentao
incluindo os msculos papilares (que a mais prxima da segmentao manual).
Discusso
Comparao das fraes de ejeo
Um erro localizado em uma fatia pode levar presena de picos ou vales no
grfico da variao volumtrica, que so erroneamente interpretados como
sstole ou distole.
Concluso
A principal contribuio resultante deste trabalho foi a disponibilizao
de um sistema interativo de segmentao de imagens provenientes de
Cine MR. O sistema encontra-se operacional, podendo ser executado
nas plataformas Windows e Unix. Outra contribuio importante do
trabalho foi a anlise dos resultados da segmentao atravs da
realizao dos testes sistemticos, o que trouxe dados significativos
para a avaliao do sistema proposto. Uma contribuio adicional foi a
validao da adequao do mtodo Watershed a este tipo de aplicao
bem como a viabilidade da metodologia de projeto utilizada.
Obrigado