En los organismos se encuentran cuatro tipos diferentes de molculas orgnicas en gran
cantidad: carbohidratos, lpidos, protenas, nucletidos y cidos nucleicos.
Todas estas molculas contienen carbono, hidrgeno y oxgeno. En esencia, la qumica de los organismos vivos es la qumica de los compuestos que contienen carbono o sea, los compuestos orgnicos. El carbono es singularmente adecuado para este papel central, por el hecho de que es el tomo ms liviano capaz de formar mltiples enlaces covalentes. El carbono puede combinarse con otros tomos de carbono y con tomos distintos para formar una gran variedad de cadenas fuertes y estables y de compuestos con forma de anillo (aromticos)
Las molculas orgnicas derivan sus configuraciones tridimensionales primordialmente de sus esqueletos de carbono. Una caracterstica general de todos los compuestos orgnicos es que liberan energa cuando se oxidan. Entre los tipos principales de molculas orgnicas importantes en los sistemas vivos estn los carbohidratos, los lpidos, las protenas y los nucletidos.
Los carbohidratos son la fuente primaria de energa qumica para los sistemas vivos. Los ms simples son los monosacridos ("azcares simples").
Los monosacridos pueden combinarse para formar disacridos ("dos azcares") y polisacridos (cadenas de muchos monosacridos).
Los lpidos son molculas hidrofbicas que, como los carbohidratos, almacenan energa.
Los lpidos son importantes componentes estructurales. Incluyen las grasas y los aceites, los fosfolpidos, los glucolpidos, las ceras, y el colesterol y otros esteroides.
Las protenas son molculas muy grandes compuestas de cadenas largas de aminocidos, conocidas como cadenas polipeptdicas.
A partir de slo veinte aminocidos diferentes (algunos son sintticos) usados para hacer protenas se puede sintetizar una inmensa variedad de diferentes tipos de molculas protenicas, cada una de las cuales cumple una funcin altamente especfica en los sistemas vivos. Los nucletidos son molculas complejas formadas por un grupo fosfato, un azcar de cinco carbonos y una base nitrogenada.
Son los bloques estructurales de los cidos desoxirribonucleico (DNA) y ribonucleico (RNA), que transmiten y traducen la informacin gentica.
Los nucletidos tambin desempean papeles centrales en los intercambios de energa que acompaan a las reacciones qumicas dentro de los sistemas vivos.
El principal portador de energa en la mayora de las reacciones qumicas que ocurren dentro de las clulas es un nucletido que lleva tres fosfatos, el ATP (adenosin trifosfato).
CARBOHIDRATOS
Los carbohidratos son las molculas fundamentales de almacenamiento de energa en la mayora de los seres vivos y forman parte de diversas estructuras de las clulas vivas.
Los carbohidratos -o glcidos- pueden ser molculas pequeas, (azcares), o molculas ms grandes y complejas. Hay tres tipos principales de carbohidratos, clasificados de acuerdo con el nmero de molculas de azcar que contienen. Los monosacridos como la ribosa, la glucosa y la fructosa, contienen slo una molcula de azcar.
El gliceraldehdo, la ribosa y la glucosa contienen, adems de los grupos hidroxilo, un grupo aldehdo, que se indica en violeta; se llaman azcares de aldosa (aldosas).
La dihidroxiacetona, la ribulosa y la fructosa contienen un grupo cetona, indicado en pardo, y se llaman azcares de cetosa (cotosas). Los disacridos consisten en dos molculas de azcar simples unidas covalentemente. Ejemplos familiares son la sacarosa (azcar de caa), la maltosa (azcar de malta) y la lactosa (azcar de la leche). Los polisacridos como la celulosa y el almidn, contienen muchas molculas de azcar simples unidas entre s. Los polisacridos (polmeros con monmeros) como la celulosa y el almidn, contienen muchas molculas de azcar simples unidas entre s. La quitina en los insectos y crustceos. Cutina en plantas, glucgeno y glicgeno. La celulosa se compone de molculas de glucosa unidas mediante enlaces beta glucosdicos y puede constar hasta de 8000 molculas de glucosa.
El almidn tambin con unidades de glucosa (en forma de maltosa) unidas por enlaces alfa glucosdicos. La amilosa con unas 300 glucosas y la amilopectina de unas 1000. Los lpidos son un grupo general de sustancia orgnicas insolubles en solventes polares como el agua, pero que se disuelven fcilmente en solventes orgnicos no polares, tales como el cloroformo, el ter y el benceno.
Tpicamente, son molculas de almacenamiento de energa, usualmente en forma de grasa o aceite, y cumplen funciones estructurales, como en el caso de los fosfolpidos glucolpidos y ceras.
A diferencia de muchas plantas, como la de la papa, los animales slo tienen una capacidad limitada para almacenar carbohidratos. En los vertebrados, cuando los azcares que se ingieren sobrepasan las posibilidades de utilizacin o de transformacin en glucgeno, se convierten en grasas.
De modo inverso, cuando los requisitos energticos del cuerpo no son satisfechos por la ingestin inmediata de comida, el glucgeno y posteriormente la grasa son degradados para llenar estos requerimientos.
El hecho de que el cuerpo consuma o no sus propias molculas de almacenamiento no guarda ninguna relacin con la forma molecular en que la energa ingresa en l.
La cuestin estriba simplemente en la cantidad de caloras que se libera cuando se degradan estas molculas. Clasificacin de los lpidos Una molcula de grasa est formada por tres cidos grasos unidos a una molcula de glicerol (de aqu el trmino "triglicrido").
Las largas cadenas hidrocarbonadas que componen los cidos grasos terminan en grupos carboxilo (-COOH), que se unen covalentemente a la molcula de glicerol.
Las propiedades fsicas de una grasa, como por ejemplo su punto de fusin, estn determinadas por las longitudes de sus cadenas de cidos grasos y dependen tambin de si las cadenas son saturadas o no saturadas.
Los cidos grasos pueden estar saturados, es decir, no presentar enlaces dobles. Tambin pueden estar insaturados, es decir, tener tomos de carbono unidos por enlaces dobles.
Las cadenas rectas de los cidos grasos saturados permiten el empaquetamiento de las molculas, produciendo un slido como la manteca o el cebo.
En los grasos insaturados, los dobles enlaces provocan que las cadenas se doblen; esto tiende a separar las molculas, produciendo un lquido como el aceite de oliva o de girasol. Componentes de una grasa Algunas plantas tambin almacenan energa en forma de aceites, especialmente en las semillas y en los frutos.
Las grasas y los aceites contienen una mayor proporcin de enlaces carbono-hidrgeno ricos en energa que los carbohidratos y, en consecuencia, contienen ms energa qumica.
En promedio, las grasas producen aproximadamente 9,3 kilocaloras por gramo, en comparacin con las 3,79 kilocaloras por gramo de carbohidrato, o las 3,12 kilocaloras por gramo de protena.
Tambin, dado que las grasas son no polares, no atraen molculas de agua y, as, no estn "embebidas" en stas, como ocurre en el caso de glucgeno.
Teniendo en cuenta el factor hdrico, las grasas almacenan seis veces ms energa gramo por gramo que el glucgeno, y ste es indudablemente el motivo por el cual, en el curso de la evolucin, llegaron a desempear un papel fundamental en el almacenamiento de energa.
Los lpidos, especialmente los fosfolpidos y los glucolpidos, tambin desempean papeles estructurales extremadamente importantes. Al igual que las grasas, tanto los fosfolpidos como los glucolpidos estn compuestos de cadenas de cidos grasos unidas a un esqueleto de glicerol. En los fosfolpidos, no obstante, el tercer carbono de la molcula de glicerol no est ocupado por un cido graso, sino por un grupo fosfato, al que est unido habitualmente otro grupo polar.
La molcula de fosfolpido est formada por dos cidos grasos unidos a una molcula de glicerol, como en las grasas, y por un grupo fosfato (indicado en color lila) unido al tercer carbono del glicerol.
Tambin contiene habitualmente un grupo qumico adicional, indicado con la letra R. Las "colas" de cido graso son no polares y por lo tanto, hidrofbicas; la "cabeza" polar que contiene a los grupos fosfato y R es soluble, hidroflica ).
Los grupos fosfato estn cargados negativamente. Como resultado, el extremo fosfato de la molcula es hidroflico, mientras que las porciones de cido graso son hidrofbicas.
Dado que los fosfolpidos tienen cabezas solubles en agua y colas insolubles en ella, tienden a formar una pelcula delgada en una superficie acuosa, con sus colas extendidas por encima del agua.
Rodeados de agua, se distribuyen espontneamente en dos capas, con sus cabezas hidroflicas (amantes del agua) extendidas hacia afuera y sus colas hidrofbicas (con aversin al agua) hacia adentro. Esta disposicin, la bicapa lipdica, constituye la base estructural de las membranas celulares. Al formar una bicapa, los componentes hidrofbicos de los fosfolpidos quedan "protegidos" del agua, excepto en los bordes, en donde quedan expuestos.
Esta ordenacin da una cierta inestabilidad a esa membrana, haciendo que sta se pliegue sobre s misma y forme vesculas.
Esta disposicin de las molculas de fosfolpido, con sus cabezas hidroflicas expuestas y sus colas hidrofbicas agrupadas, forman la base estructural de las membranas celulares. En los glucolpidos ("lpidos con azcar"), el tercer carbono de la molcula de glicerol no est ocupado por un grupo fosfato, sino por una cadena de carbohidrato corta.
Dependiendo del glucolpido particular, esta cadena puede contener, en cualquier lugar, entre uno y quince monmeros de monosacrido.
Al igual que la cabeza de fosfato de un fosfolpido, la cabeza de carbohidrato de un glucolpido es hidroflica, y las colas de cidos grasos son, por supuesto, hidrofbicas.
En solucin acuosa, los glucolpidos se comportan del mismo modo que los fosfolpidos. Tambin son componentes importantes de las membranas celulares en las que cumplen funciones de reconocimiento celular (glicoclix de la membrana).
Las ceras tambin son una forma de lpido. Son producidas, por ejemplo, por las abejas para construir sus panales.
Tambin forman cubiertas protectoras, lubricantes e impermeabilizantes sobre la piel, el pelaje y las plumas y sobre los exoesqueletos de algunos animales. En las plantas terrestres se encuentran sobre las hojas y frutos.
Las ceras protegen las superficies donde se depositan de la prdida de agua y aslan del fro a los tejidos internos.
El colesterol pertenece a un grupo importante de compuestos conocidos como esteroides.
La molcula de colesterol est formada por cuatro anillos de carbono y una cadena hidrocarbonada.
La testosterona, hormona sexual masculina, sintetizada a partir del colesterol por clulas de los testculos, tambin tiene la estructura caracterstica de cuatro anillos, pero carece de la cola hidrocarbonada.
Aunque los esteroides no se asemejan estructuralmente a los otros lpidos, se los agrupa con ellos porque son insolubles en agua.
Al igual que el colesterol, todos los esteroides tienen cuatro anillos de carbono unidos y varios de ellos tienen una cola.
Adems, muchos poseen el grupo funcional -OH, que los identifica como alcoholes.
El colesterol se encuentra en las membranas celulares (excepto en las clulas bacterianas); aproximadamente el 25% (en peso seco) de la membrana de un glbulo rojo es colesterol.
Su presencia da rigidez a las membranas y evita su congelamiento a muy bajas temperaturas. Tambin es un componente principal de la vaina de mielina, la membrana lipdica que envuelve a las fibras nerviosas de conduccin rpida, acelerando el impulso nervioso.
El colesterol es sintetizado en el hgado a partir de cidos grasos saturados y tambin se obtiene en la dieta, principalmente en la carne, el queso y las yemas de huevo. Las altas concentraciones de colesterol en la sangre estn asociadas con la arterosclerosis, enfermedad en la cual el colesterol se encuentra en depsitos grasos en el interior de los vasos sanguneos afectados.
Las hormonas sexuales y las hormonas de la corteza adrenal (la porcin ms externa de las glndulas suprarrenales, que se encuentran por encima de los riones) tambin son esteroides.
Estas hormonas se forman a partir del colesterol en los ovarios, testculos, corteza suprarrenal y otras glndulas que las producen.
Las prostaglandinas representan un grupo de lpidos, derivados de los cidos grasos, y tienen acciones hormonales. Los veinte aminocidos diferentes (o 25 incluidos algunos obtenidos en laboratorio) que forman parte de las protenas varan de acuerdo con las propiedades de sus grupos laterales (R).
Cada aminocido contiene un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH) unidos a un tomo de carbono central.
Un tomo de hidrgeno y el grupo lateral estn tambin unidos al mismo tomo de carbono. Esta estructura bsica es idntica en todos los aminocidos.
Los grupos laterales pueden ser no polares (sin diferencia de carga entre distintas zonas del grupo), polares pero con cargas balanceadas de modo tal que el grupo lateral en conjunto es neutro, o cargados, negativa o positivamente.
Los grupos laterales no polares no son solubles en agua, mientras que los grupos laterales polares y cargados son solubles en agua.
A partir de estos relativamente pocos aminocidos, se puede sintetizar una inmensa variedad de diferentes tipos protenas, cada una de las cuales cumple una funcin altamente especfica en los sistemas vivos.
Los aminocidos se unen entre s por medio de enlaces peptdicos. La secuencia de aminocidos se conoce como estructura primaria de la protena y de acuerdo con esa secuencia, la molcula puede adoptar una entre varias formas.
Los puentes de hidrgeno entre los grupos C=O y NH tienden a plegar la cadena en una estructura secundaria repetida, tal como la hlice alfa o la hoja plegada beta.
Las interacciones entre los grupos R de los aminocidos pueden dar como resultado un plegamiento ulterior en una estructura terciaria, que a menudo es de forma globular e intrincada.
Dos o ms polipptidos pueden actuar recprocamente para formar una estructura cuaternaria. En las protenas fibrosas, las molculas largas entran en interaccin con otras largas cadenas de polipptidos, similares o idnticas, para formar cables o lminas.
El colgeno y la queratina son protenas fibrosas que desempean diversos papeles estructurales.
Las protenas globulares tambin pueden cumplir propsitos estructurales.
Los microtbulos, que son componentes celulares importantes, estn compuestos por unidades repetidas de protenas globulares, asociadas helicoidalmente en un tubo hueco.
Otras protenas globulares tienen funciones de regulacin, de transporte y de proteccin.
La representacin corresponde a la hlice alfa. La hoja plegada beta, en la que los pliegues se forman por la existencia de puentes de hidrgeno entre distintos tomos del esqueleto del polipptido; los grupos R, unidos a los carbonos, se extienden por encima y por debajo de los pliegues de la hoja.
Dada la variedad de aminocidos, las protenas pueden tener un alto grado de especificidad.
Un ejemplo es la hemoglobina, la molcula transportadora de oxgeno de la sangre, compuesta de cuatro cadenas polipeptdicas (dos pares de cadenas), cada una unida a un grupo que contiene hierro (hemo).
La sustitucin de un determinado aminocido por otro en uno de los pares de cadenas altera la superficie de la molcula, produciendo una enfermedad grave, en ocasiones fatal, conocida como anemia falciforme. Cromosomas y cidos nucleicos La informacin que dicta las estructuras de la enorme variedad de molculas de protenas que se encuentran en los organismos est codificada en molculas conocidas como cidos nucleicos.
La informacin contenida en los cidos nucleicos es transcripta y luego traducida a las protenas. Son las protenas las molculas que finalmente ejecutarn las "instrucciones" codificadas en los cidos nucleicos.
As como las protenas estn formadas por cadenas largas de aminocidos, los cidos nucleicos estn formados por cadenas largas de nucletidos.
Un nucletido, sin embargo, es una molcula ms compleja que un aminocido. Est formado por tres subunidades: un grupo fosfato, un azcar de cinco carbonos y una base nitrogenada.; esta ltima tiene las propiedades de una base y, adems, contiene nitrgeno.
La subunidad de azcar de un nucletido puede ser ribosa o bien desoxirribosa. Como puede verse, la diferencia estructural entre estos dos azcares es leve.
En la ribosa, el carbono 2 lleva un tomo de hidrgeno por encima del plano del anillo y un grupo hidroxilo por debajo del plano; en la desoxirribosa, el grupo hidroxilo del carbono 2 est reemplazado por un tomo de hidrgeno. Los nucletidos pueden unirse en cadenas largas por reacciones de condensacin que involucran a los grupos hidroxilo de las subunidades de fosfato y de azcar.
En la figura se muestra una molcula de RNA que, como se observa, est formada por una sola cadena de nucletidos.
Las molculas de DNA, en cambio, constan de dos cadenas de nucletidos enrolladas sobre s mismas, formando una doble hlice.
La ribosa es el azcar en los nucletidos que forman cido ribonucleico (RNA) y la desoxirribosa es el azcar en los nucletidos que forman cido desoxirribonucleico (DNA ).
Hay cinco bases nitrogenadas diferentes en los nucletidos, que son los pilares de construccin de los cidos nucleicos.
Dos de ellas, la adenina y la guanina, se conocen como purinas. Las otras tres, citosina, timina y uracilo se conocen como pirimidinas.
La adenina, la guanina y la citosina se encuentran tanto en el DNA como en el RNA, mientras que la timina se encuentra slo en el DNA y el uracilo slo en el RNA.
Aunque sus componentes qumicos son muy semejantes, el DNA y el RNA desempean papeles biolgicos muy diferentes. Las bases nitrogenadas son cinco: El DNA es el constituyente primario de los cromosomas de las clulas y es el portador del mensaje gentico.
La funcin del RNA es transcribir el mensaje gentico presente en el DNA y traducirlo a protenas.
El descubrimiento de la estructura y funcin de estas molculas es hasta ahora, indudablemente, el mayor triunfo del enfoque molecular en el estudio de la biologa.
Los nucletidos, adems de su papel en la formacin de los cidos nucleicos, tienen una funcin independiente y vital para la vida celular.
Cuando un nucletido se modifica por la unin de dos grupos fosfato, se convierte en un transportador de energa, necesario para que se produzcan numerosas reacciones qumicas celulares.
La energa contenida en los glcidos de reserva como el almidn y el glucgeno, y en los lpidos, viene a ser como el dinero depositado a plazo fijo; no es asequible fcilmente.
La energa de la glucosa es como el dinero en una cuenta corriente, accesible, pero no tanto como para realizar todas las operaciones cotidianas. La energa en los nucletidos modificados, en cambio, es como el dinero de bolsillo, disponible en cantidades convenientes y aceptado en forma generalizada. El principal portador de energa, en casi todos los procesos biolgicos, es una molcula llamada adenosn trifosfato o ATP. El DNA es el constituyente primario de los cromosomas de las clulas y es el portador del mensaje gentico. La energa en los nucletidos modificados, en cambio, es como el dinero de bolsillo, disponible en cantidades convenientes y aceptado en forma generalizada.
El principal portador de energa, en casi todos los procesos biolgicos, es una molcula llamada adenosn trifosfato o ATP. La nica diferencia entre el ATP y el AMP (adenosn monofosfato) es la unin de dos grupos fosfato adicionales.
Aunque esta diferencia en la frmula puede parecer pequea, es la clave del funcionamiento del ATP en los seres vivos. Los enlaces que unen los tres grupos fosfato son relativamente dbiles, y pueden romperse con cierta facilidad por hidrlisis. Los productos de la reaccin ms comn son el ADP -adenosn di fosfato- un grupo fosfato y energa.
Esta energa al desprenderse, puede ser utilizada para producir otras reacciones qumicas. Con la adicin de una molcula de agua al ATP, un grupo fosfato se separa de la molcula. Los productos de la reaccin son el ADP, un grupo fosfato libre y energa. Alrededor de unas 7 Kcaloras de energa se liberan por cada mol de ATP hidrolizado. La reaccin puede ocurrir en sentido contrario si se aportan las 7 Kcaloras por mol necesarias. Las enzimas son molculas de protenas que tienen la capacidad de facilitar y acelerar las reacciones qumicas que tienen lugar en los tejidos vivos, disminuyendo el nivel de la "energa de activacin" propia de la reaccin.
Se entiende por "energa de activacin" al valor de la energa que es necesario aplicar (en forma de calor, electricidad o radiacin) para que dos molculas determinadas colisionen y se produzca una reaccin qumica entre ellas.
Generalmente, las enzimas se nombran aadiendo la terminacin "asa" a la raz del nombre de la sustancia sobre la que actan.
Las enzimas no reaccionan qumicamente con las sustancias sobre las que actan (que se denominan sustrato), ni alteran el equilibrio de la reaccin.
Solamente aumentan la velocidad con que estas se producen, actuando como catalizadores.
La velocidad de las reacciones enzimticas dependen de la concentracin de la enzima, de la concentracin del sustrato (hasta un lmite) y de la temperatura y el PH del medio.
Hay enzimas que necesitan la participacin de otros compuestos qumicos no proteicos, denominados cofactores, para poder actuar realmente como enzimas.
Estos compuestos pueden ser: el grupo prosttico, como por ejemplo el grupo hemo de la hemoglobina, o una coenzima, como la coenzima A o el fosfato de piridoxal.
A la parte proteica sin el cofactor se le llama apoenzima, y al complejo enzima-cofactor holoenzima.
Tambin existen enzimas que se sintetizan en forma de un precursor inactivo llamado proenzima.
Cuando se dan las condiciones adecuadas en las que la enzima debe actuar, se segrega un segundo compuesto que activa la enzima.
Por ejemplo: el tripsingeno segregado por el pncreas activa a la tripsina en el intestino delgado, el pepsingeno activa a la pepsina en el estomago, etc.
Las enzimas actan generalmente sobre un sustrato especfico, como la ureasa, o bien sobre un conjunto de compuestos con un grupo funcional especfico, como la lipasa o las transaminasas.
Una enzima no modifica la energa libre, ni la constante de equilibrio, sino que disminuye la energa de activacin de la reaccin. La parte de la enzima que "encaja" con el sustrato para activarlo es denominada centro activo, y es el responsable de la especificidad de la enzima.
En algunos casos, compuestos diferentes actan sobre el mismo sustrato provocando una misma reaccin, por lo que se les llama isoenzimas.
Debido al gran nmero de enzimas conocidas en la actualidad, se ha adoptado una clasificacin y nomenclatura ms sistemtica, en la que cada enzima tiene un nmero de clasificacin que la identifica.
1.Oxidorreductasas. Reacciones de transferencia de electrones.
2. Transferasas. Transferencia de grupos funcionales. Ej. UDP-glucosa-fructosa- glucotransferasa.
3. Hidrolasas. Reacciones de hidrlisis. Ej. lipasa, proteasa, celulasa.
4. Liasas. Adicin a dobles enlaces. Ej. carboxilasa, fenilalanina amonioliasa.
5. Isomerasas. Reacciones de isomerizacin. Ej. fosfoglucosa isomerasa.
6. Ligasas. Se conocan como sintetasas. Participan en la formacin de enlaces con hidrlisis de ATP.