Pech- Santiago Edar Onam

Septiembre 2011
Antecedentes

El primer cristal de protena fue la hemoglobina en 1864 por
Hoppe-Seyler. Y fue reconocido con un descubrimiento
excepcional y valioso.

Todava se argumenta que la cristalografa es una verdadera
ciencia, cuyos productos afecta en los campos de la
biotecnologa, la biologa molecular y la medicina.

Y se resuelve a una nica conformacin, lo que lleva una
descripcin incompleta de los datos cristalogrficos y a un alto
grado de imprecisin derivada de la incapacidad para adaptarse
a esa conformacin.
Continua


La cristalizacin es un proceso en el que se realiza
un cambio de fase, pasando el sistema de un estado
de no equilibrio al estado de equilibrio.

Existen dos faces la nucleacin
y el crecimiento.


Purificacin de
la protena
Cristalizar
Difraccin
Resolucin de
Faces
Afinamiento
Modelo
Validacin y
anlisis Isomorfa
Remplazo molecular
Anmala
Patrones de
Difraccin
Mapa de densidad
Electrnica
Introduccin
La cristalografa de rayos-X, es usada comnmente
para determinar la estructura tridimensional de las
biomolculas.

Consecuentemente, todos los modelos estructurales
de protena tienen asociado con ellos un error
significativo.


Los grandes errores son a menudo un resultado de
interpretaciones diferentes de regiones con alta
movilidad o conformaciones mltiples, donde
adquieren interpretaciones no fiables.

La resolucin de la estructura es importante porque
se pueden generar errores como resultado de una
mala interpretacin de mapas de densidad
electrnica.

Continua
Alta
Media
Baja
Continua
La magnitud de la variacin observada en el mapa de
densidad electrnica, implica que muchos de los
anlisis estructurales y las comparaciones pueden ser
defectuosos.

Haciendo hincapi en el carcter dinmico de las
protenas.

Calidad de los Datos
Usualmente los cristales de protenas contienen un
montn de solvente (30-70%) y esto significa que los
cristales son susceptibles a daos por rayos-X,
aumento de desorden dentro de la red cristalina.

Asignar correctamente la simetra del grupo espacial
del cristal durante la difraccin es importante.

Continua
En general, vale la pena colectar tantos datos como
sea posible.

Una medida estadstica de la calidad de los datos es
el factor Rmerge de confiabilidad.

Modelado y afinamiento

Un modelo contiene las coordenadas atmicas, el
valor de ocupacin y factor trmico de vibracin
(factor-B).

Esta determinado por la relacin de seal/ruido
(I/sI), la integridad y la redundancia.

Continua
Propensos a contener errores experimentales por una
mala interpretacin del mapa de densidad
electrnica.

Modernos procedimientos cristalogrficos utilizan
rutinas automticas para aadir molculas de agua a
la estructura.
Continua
El refinamiento de modelos estructurales con los
datos de difraccin de rayos-x se mide por una
fiabilidad de los Factores (R-Factor).

Rfree: Juzgar el exceso de ajuste.
Rcryst: Juzgar el modelo estable.

El ajuste parece ser mejor de lo que pudiera ser
Conclusiones
La cristalografa de rayos-X es una poderosa
herramienta para comprender la funcin biolgica.

Muchas de los objetivos de las drogas son las
protenas de membrana, que pueden ser difcil de
cristalizar.

La estructura de la protena en el cristal puede tener
conformaciones muy diferentes en solucin.


Una validacin adecuada y la deposicin de la
estructura, los datos y los archivos de origen son
esenciales para su calidad del modelo estructural.

Anlisis de geometra
Plegamiento de la cadena principal
Cadena de interacciones lateral por puentes de
hidrogeno
Continua


Es importante tener en cuenta que cada modelo
estructural de protena es en hecho una familia de
estructuras.
Continua