MICROORGANISMOS

SUBSUBCELULARES
O
FORMAS ACELULARES
MICROBIANAS
TAMAO DE LOS SERES VIVOS
PRIONES
-El trmino PRI ON es usado para describir el agente infeccioso
responsable de varias patologas neurodegenerativas letales encontradas en
los mamferos.
-La palabra deriva de PROTEINACEOUS INFECTIOUS PARTICLE,
definicin propuesta por Stanley B. Prusiner.
-Este agente infeccioso consiste nicamente en una protena (PrP), carente
de genoma y cidos nucleicos.
-Normalmente estn en las membranas neuronales de los mamferos sin
causar enfermedad alguna, pero se sabe que un cambio conformacional de
su estructura terciaria puede provocar la aparicin de la enfermedad.
-Estas protenas en su forma patgena se multiplican exponencialmente al
ponerse en contacto con las protenas normales, ya que les inducen el
cambio conformacional que las vuelve infecciosas.
-La aparicin de estos desordenes estructurales en las protenas, pueden ser
transmisibles, heredados, o incluso espordicos, es decir, sin evidencias de
transmisin ni herencia.
-Las enfermedades a prion son denominadas colectivamente como
ENCEFALOPATAS ESPONGIFORMES TRANSMISIBLES, las
conocidas hasta ahora son fatales, afectan al sistema nervioso y se cree
que tambin a los msculos.
-Estas enfermedades pueden incubarse durante aos o incluso dcadas en
humanos, de ah que inicialmente se las conociera como "virus lentos".
-Estos agentes son capaces de propagarse dentro de un mismo husped
causando una lesin espongitica (las clulas parecen esponjas).
-Son resistentes a tratamientos inactivantes de cidos nuclicos.
-El agente es muy pequeo, mucho ms que cualquier virus conocido,
con un peso total de 27.000 a 30.000 daltons.
-El agente carece de cido nucleco entre sus elementos, y esta compuesto
exclusivamente de protenas.
- Las proteasas y el fenol, produce extractos poco infectivos.
-Los agentes destructores de cidos nucleicos, como las nucleasas y
radiacin ultravioleta, no tiene efecto alguno sobre la infecciosidad.
Inactivacin de M.O. acelulares por radiacin UV a 254nm
Agente Infeccioso D
37
(J /m
2
)*
Bacterifago T2 4
Bacterifago S13 20
Bacterifago f X174
20
Virus del sarcoma de Rous
150
Poliomavirus
240
Virus de la leucemia de Friend
500
Virus de la leucemia murina
1400
Viroide de los tubrculos fusiformes de la patata
5000
PRION del "scrapie" (encefalitis espongiforme de las ovejas)
42000
*D
37
es la dosis de radiacin que permite una Supervivencia del 37%.
ESTRUCTURA MOLECULAR DEL PRION
PRIONES
SECUENCIA DE LA INFECCION POR PRIONES
Estructura de los priones

ESTRUCTURA DEL PRI ON.

La protena PrP est constituida por cuatro regiones de estructura secundaria
llamadas H1, H2, H3 y H4, en estas regiones se identifican tres zonas de
hlice-a llamadas A, B y C, y dos de hoja-b, llamadas S1 y S2.
La protena PrP
c
(hoy solo PrP) contiene un 40% de hlice-alfa y muy
poca proporcin de hoja-beta, mientras que la PrP
Sc
(forma mutante) se
compone de un 30% de hlice alfa y un 45% de hoja beta. Esta dualidad
hlice-a / hoja-b, parece localizarse principalmente en la regin 106-126
(del aa 106 al aa 126 de la protena), que en forma de pptido sinttico
es un neurotxico potente.

La isoforma mutante (PrP
Sc
) difiere de la normal (PrP) en:
- Alto contenido en hlices beta.
- Es insoluble en detergentes, formando agregados amorfos.
- Sufre una proteolisis limitada que genera una forma truncada agregante
y que retiene la infectividad.
- Requiere un tratamiento desnaturalizante previo para la eliminacin de
la membrana.
- Localizacin extracelular predominantemente.
Nomenclatura.
Para simplificar la terminologa se ha sugerido que la isoforma PrP que
provoca la enfermedad, sea llamada PrP
Sc
, sin mencionar el origen del
prion. Para aadir especificidad un mutante o variante de PrP puede ser
anotado entre parntesis.

Ejemplos:
-El prin encontrado en el ratn I/Ln, que posee una variante del gen PrP
con F en el codon 108 y V en el 189, se identifica como MoPrP(108F,
189V)Sc.
-El prin encontrado en un judo-libio paciente de CJD (Creutzfeldt
Jacob Disease), homozigtico para la mutacin de K en el codn 200 se
identific como HuPrP(200K)Sc.
-En situaciones de heterozigosis y en las que el alelo que determina la
forma PrP es desconocido, se usa HuPrPSc o HuPrPCJD o la enfermedad
de la que se trate.
VIROIDES
Presentes solo en vegetales.
Descubiertos en la dcada del 70 del siglo XX. Su descubrimiento por T. O.
Diener (en 1971) acarre la modificacin del paradigma establecido a finales
del siglo XIX que consideraba a los virus como los sistemas biolgicos
mnimos.
Los viroides, ARNs circulares, son estructural, funcional y evolutivamente
distintos de los virus, y constituyen actualmente el peldao inferior de toda
la escala biolgica: son parsitos moleculares en la frontera de la vida, lo que
les confiere un gran inters bsico.
Estas molculas han sido estudiadas extensivamente desde el punto de vista
estructural, mientras que los mecanismos relacionados con su proceso
infectivo permanecen an desconocidos.
Las interacciones que ocurren entre el ARN viroidal y el entorno celular de
la planta es un campo con un alto potencial de desarrollo en el mundo de los
viroides.
Los viroides son los patgenos de vegetales conocidos ms pequeos,
inducen enfermedades en especies de vegetales cultivadas de importancia
econmica.
Debido a que los viroides no codifican para ninguna protena deben
necesariamente reclutar protenas y vas metablicas del vegetal para
completar su ciclo infeccioso.
El inters del estudio de los viroides esta ligado al mbito de la patologa
vegetal como agentes causales de enfermedades de inters econmico.
Los ARNs de algunos viroides contienen ribozimas de cabeza de martillo
que intervienen en su proceso replicativo.
Estas ribozimas, las ms sencillas que se han descrito, tienen un enorme
potencial biotecnolgico como "ribonucleasas de restriccin" para
degradar selectivamente cualquier ARN.
La presencia de estas ribozimas, junto a otros datos derivados del
anlisis de secuencias, apoyan la hiptesis de que los viroides son
molculas antiqusimas, en cierto modo fsiles vivientes del mundo
precelular de ARN que se postula existi inicialmente en la Tierra con
anterioridad a nuestro mundo actual basado en el ADN y las protenas.
Infeccin por viroides
METODOS
DE
ESTUDIO
NANOBIOS
DOMINIO ARCHAEA
- Termoflicas extremas
- Haloflicas extremas
- Metanognicas
Clasificacin

Se consideran 3 grandes grupos:

1. Euryarchaeota, que comprende los Metanognicos(nicas que viven en
todos los sitios) y los Halfilos(los ms evolucionados, realizan fotosintesis).
2. Crenarchaeota, son termfilos. Caracterizadas por su habilidad para tolerar
los extremos de temperatura y acidez.
3. Korarchaeota, termfilos an no aislados. Son los ms primitivos. Un
grupo acerca del cual se conoce muy poco

Dentro de esos tipos principales existen algunos subtipos:
-Metangenas: arqueas que producen metano como un producto de desecho de
su "digestin", o proceso de elaboracin de energa.
-Halfilas o halobacterias: las que viven en ambientes salados.
-Termfilas o hipertermfilas: que viven en temperaturas extremadamente
altas.
-Psicrfilas: que viven en temperaturas muy bajas.

MEMBRANA CITOPLASMTICA:
-Resisten altas temperaturas por contener
ISOPRENOIDES de C
15
a C
30:
carotenoides y
caroteno y geranilgeraniol. Enlaces de tipo eter (en
otros m.o, existen enlaces ester) : diteres y
tetrateres del glicerol.
-Los principales tipos de lpidos son los diteres de
glicerol. En algunos teres las cadenas laterales
(fentanil) se unen entre s por enlaces covalentes
formando una monocapa en lugar de la bicapa
caracterstica de las membranas presentan una
estructura en bifitanilo, siendo ms estables y
resistentes, siendo habituales por lo tanto en las
hipertermfilas.
-Tienen pigmento bacteriorrodopsina conjugada
con molcula de retinal que absorbe luz a 570 nm
que cataliza transferencia de protones a travs de la
membrana. Esto otorga el color prpura.
Estructura de la
bacteriorrodopsina
PARED CELULAR
-Presentan el Pseudopeptidoglicano constituido por N-acetilglucosamina ms N-
acetiltalosaminurnico unidos por enlaces (1 3). Este enlace los hace
insensibles ala Lisozima. Existen a.a. entrelazados en esta estructura
(Methanobacterium).
-Puede existir polisacridos: galactosamina, c. glucornico. Acetatos. No fosfatos
ni sulfatos. Estructura relacionada a la Condroitina no sulfatada (Methanosarcina).
-En extremad. Haloflicos puede contener glucosa, manosa, galactosa, en forma
neurtra o aminada. Abundantes c. Urnicos y acetato, azcares sulfatados
(Halococcus).
-En Halobacterium, extrem.haloflica y extrem.termoflica, la p.c. contiene
glucioprotenas, CHs. Tipo hexosas (glucosa, glucosamina, galactosa, manosa) y
pentosas (ribosa, arabinosa). Hay a.a. acdicos (cargados negativamente) como
Aspartato-Glutamato qwue equilibran concentracin de iones de sodio en el m.o.
-En otras consta de protenas y glicoproteinas.
ARCHAE EXTREMADAMENTE TERMOFILICAS
-Requieren metablicamente compuestos reducidos de azufre.
-Desarrollan a altas tempertaturas.
-En suelos y aguas calentados geotrmicamente con S y la mayor parate
de sp. Metabolizan Azufre de alguna forma. El azufre se forma del H2S
geotrmico por oxidacin con O
2
o por reaccin con el SO
2
(gas
volcnico).
-Ambientes calientes, terrestres, manantiales ricos en S, depsitos de lodos
y terrenos de hasta 100C y ser medianamente o extremadamente cidos
por la produccin de H
2
SO
4
por oxidacin del H
2
S y S.
-Los ambientes donde desarrollan se denominan SOLFATARA ricos en S
y calientes con pH de 5-8.
-Son organotrofos o litotrofos. Requieren S como aceptor de electrones y
metabolizar luego pequeos peptidos,glucosa y almidn (Thermococcus y
Thermoproteus en anaerobiosis y Sulfolobus en aerobiosis).
ESPECIES TERMOFILICAS EXTREMAS


- Archeoglobus: Con Coenzimas de metangenos. Desarrrolla
entre los 64 a 92 C. Reduce sulfato.
-Methanopyrus: 100-115C a 2000 mts de profundidad donde
el agua est a 350C, produce metano de H2 + CO2.
-Thermoplasma, sin pared celular, semejante a Micoplasmas
bacterianos, desarrolla a 55C y a pH de 2.0, vive de
compuestos orgnicos extrados de desechos calients del
carbn.


ARCHAEA EXTREMADAMENTE HALOFILICAS
-Propios de ambientes salinos, lagos salados, en superficie de alimentos
salados, en todo ambiente hipersalino.
-Requieren altas concentraciones de sal. La mayora desarrolla bien entre
17 a 23 % de sal (3 4 M NaCl), con un promedio de 8.8 % de sal(1.5 M
NaCl) se consigue un desarrollo bastante aceptable. Casi todos pueden
incluso desarrollar en 32 % de sal (5.5. M NaCl).
-Son organotrfos. Resisten antibiticos. Azerobios. Solo Halobacterium es
anaerobio que reduce nitratos, azcares y tiosulfato, utiliza S como
aceptor de electrones.
-Con pigmento prpura (Rodopsina) que da lugar a la FLORACION al
desarrollar altas densidades de biomasa de estos m.o.
-Utilizan a.a., como fuente de energa y vitaminas. Oxidan CHs y presentan
citocromos a,b,c.Requieren altas cantidades de sodio para desarrollar. Los
Ribosomas necesitan altos niveles de Potasio para su estabilidad.
-La sntesis de ATP es mediada por la luz, en este sistema no participan
pigmentos de clorofila.
-El pigmento bacteriorrodopsina est conjugada con molcula de retinal que
absorbe luz a 570 nm y cataliza la transferencia d protones a travs de la
membrana. Otorga color prpura.
-Existe una membrana d bactriorrodopsina con 25% de lpidos y 65 % de
protenas, insertada sobre la membrana citoplasmtica.
-Se los encuentra tambin en alimentos como salchichas, pescados marinos,
cerdo salado, embutidos, etc.

REPRESENTANTES:
Halobacterium, Halococcus,
Haloferax, Haloarcula,
Natronobacterium, Natrococcus.
ARCHAEA METANOGENICOS
- Producen metano en condiciones anaerbicas. Las auttrofas
combinan aspectos de biosntesis y bioenergtica.
- Los sustratos pueden ser:
-CO
2
(bixido de carbono)
-CO (monxido de carbono)
-HCOOH (formato)
-CH
3
OH (etanol)
-CH
3
NH
3
(metilamina) o dimetilamina o trimetilamina
-CH
3
SH (metilmercaptano)
-(CH
3
)
2
S (doimetilsulfuro)
-CH
3
COOH (Actico)
- Todos utilizan NH
4
+
como fuente de Nitrgeno y pueden fijar nitrgeno
molecular.
- Requieren de Ni (trazas) como componente de una importante coenzima
metangena que es el FACTOR F430. Tambin necesitan Fe y Co.
-Presentan enzimas hidrogenasa y monxido deshuidrogenasa.
-Presentan Coenzimas nicas:
- F420,absorbe luz a 420 nm y fluoresce con luz verde, interrelaciona con
hidrogenasa y con NADP
+
reductasa.
- F430, no fluoresce, forma parte del sistema de la metilreductasa
-Metanofurano, catalaiza el paso de CO
2
a formato.
-Metanopterina,de fluorescencia azul brillante, se asemeja al c.flico.
-Coenzima M, particpa en la etapa final de la formacin del CH
4
.
-La HS-HTTP (7-mercaptoheptanoiltreonina fosfato), participa en la etapa
final d ela metanognesis catalizada por el sistema de la metilreductasa.
METABOLISMO
-Varias son organotrficas.
-En extrem.halofilicas y extrem.termoflicas la glucosa se catabolizapor la
via de Entner Duodoroff dando lugar a 2 ceto-3 desoxi-6 fosfogluconato.
-La gluconeognesis selleva a cabo a partir de precursores no CHs y a lo
inverso de las etapas del EMP.
-El catabolismo oxidante se realiza por el ciclo de los c. Tricarboxlicos.
-Las cadenas de transporte de electrones con citocromos a, b y c (en
holoflicos extremos) y con citocromo a(emn termoflicos extremos).
-Las ATPasas estn unidos a la membrana otorgando la fuerza motriz
protnica que lleva a cabo la sntesis de ATP.
-Erxiste especies auttrofas, donde el CO
2
se incorpora por via del Acetil
CoA o por un mecanismos inverso al de los c. Tricarboxlicos
(Sulfolobus). Los Halobacterium fijan CO
2
por el ciclo de Calvin.
GENETICA
-Material nuclear con una sola molcula de ADN ccc.
-Con bajo contenido de ADN en comparacin a las bacterias.
-Con ARN polimerasa constituida por 8 polipptidos.
-Presentan Caja TATA, en el inicio de la transcripcin y que es
reconocida por la ARN polimerasa II.
-Tambin presentan la Caja Pribow rica en A-T
-Hay secuencias Shine-Dalgarno que se fijan al ribosoma 70S


Pyrodictium
Methanopyrus
Methanococcus


Sulfolobus
Fotografias de ambientes termoflicos del Yellowstone National Park, USA.
izq: Octopus Spring, der: Obsidian Pool. En estos ambientes se ha aislado Sulfolobus que es un termfilo extremo que se
encuentra en manantiales cidos productos de calentamiento por volcanes, y suelos con temperaturas entre 60 - 95 C y
pH 1 a 5.

DOMINIO BACTERIA
Cianobacterias
Bacterias
PARED CELULAR Y
MEMBNRANA
CITOPLASMATICA
BACTERIANAS
GRAMPOSITIVA
GRAMNEGATIVA
PARED DE GRAMNEGATIVAS
TRANSPORTE A TRAVES DE LA MEMBRANA CITOPLASMATICA
POLIMERO F (GLUCOSAMINDISACARIDO)
CAPA DEL LIPOPOLISACARIDO
CADENAS ITERATIVAS O REPETIDORAS
PARED DE UNA BAAR
MEMBRANA CITOPLASMATICA
CAPSULA BACTERIANA
FLAGELO BACTERIANO
ARREGLOS FLAGELARES
FLAGELO
PILI
ESPORA BACTERIANA
CICLO MADURACION
DE UNA ESPORA
Estafilococos Estreptococos Diplococos Tetradas Sarcinas
Bacilos Cocobacilos Espirlos
MORFOLOGIA BACTERIANA
REPRODUCCION BACTERIANA POR BIPARTICION
CONJUGACION
VIAS FERMENTATIVAS
6 C
EMP
WD
ED
3 C PIRUVATO
EMP
ATP ATP ALDOLASA
6C 6C-P 1,6 di-P 6C 3C-P + 3C-P
NADH + H
+

NAD


3-P GA 1-P DHA GLICEROL
CO
2
Pi

ETANOL Acetaldehido PIRUVATO ACETIl CoA
NADH + H
+


NAD
+
NADH + H
+
NAD
+


LACTATO

W.D.
Fosfocetolasa
Oxidacin
6C + P 6 fosfogluconato 5C-P 3C-P + 2C-P

CO
2


LACTATO ETANOL



E.D.

6C 3 desoxi-2 ceto-6 fosfogluconato 2 PIRUVICO ETANOL + CO
2


-1er PIRUVICO a partir del C 1 de la 6C
-2do. PIRUVICO a partir del C 4 de la 6C
.
Hyp Ala Trp
Thr Gli Ser PIRUVATO Leu Lis
Cis Cis Ile Leu
Trp Trp Phe

Acetil CoA Acetoacetil CoA

Arg
alfa Pro
CETOGLUTARATO Glu His
Gln

OXALACETATO
TCA
Asn Asp
Met
FUMARATO SUCCINIL CoA Val
Ile
Phe Trp

ANABOLISMO O REACCIONES BIOSINTETICAS
- SUSTANCIAS ESTRUCTURALES : Pared celular, cpsula, glicocalix,etc.
- TOXINAS : Generalmente. Exotoxinas solubles. Bacterias toxignicas.
- EXOENZIMAS : De variada actividad. Coadyuvan accin patgena. Algunas de
uso industrial y teraputico.
- ANTIBIOTICOS : Sustancias de bajo peso molecular. Inhiben o destruyen a
otros microorganismos. Producidos por Actinmicetos: Streptomyces,
Nocardia, por otras bacterias como Bacillus polimixa.
- VITAMINAS : Bacterias de la poblacin intestinal normal, producen Vitamina K
(coagulacin sangunea) y vitaminas del Complejo B.
- PIGMENTOS : Sustancias coloreadas. Si el pigmento se retiene en citoplasma
son CROMOFORAS, si el pigmento se difunde por el sustrato o medio de
crecimiento son PANCROMOFORAS. De diversos colores: Rojo (Serratia
marcescens ), Verde azulado o piocianina (Pseudomonas aeruginosa),
Verde amarillento o fluorescena (Pseudomonas fluorescens), etc .
- BACTERIOCINAS : Sustancias glucolipidoprotecas complejas , PM elevado,
letales para otras especies bacterianas. Marcadores epidemiolgicos. Ejm:
Colicinas (E. coli) , vibrocinas ( Vibrio), klebocinas (Klebsiella) piocina
(Pseudomonas), estreptococinas (Streptococcus), etc.
- MICROCINAS : Sustancias antimicrobianas. PM bajo,moderado o alto.Txicos.
TIPOS TROFICOS
Leucotrhrix
Epulopiscium fishelsoni Bacillus
Streptococcus
Agalla del roble - Agrobacterium
Podredumbre basal de la planta de
papa ocasionada por Erwinia
Manchas en hojas de duraznero
provocadas por Xanthomonas arboricola
pv pruni. Observese la distribucin sobre
la nervadura y parte inferior de la hoja en
coincidencia con los lugares en que se
acumula el agua de lluvia.
Zooglea saliendo de los haces vasculares de una papa
afectada por Pseudomonas solanacearum.
Mancha e "V" en hoja de repollo ocasionada por
Xanthomonas ampestris.
Lesiones en fruto de durazno
ocasionadas por Xanthomonas
arboricola pv pruni.

Materia
fecal
Aguas
de
cloaca
Plantas,
verduras
y frutas

Pacientes
hospitales

Poblacin
general

Productos
crnicos

Resistencia
bacteriana
Antibiticos
en
alimentacin
animal
Transferencia de bacterias resistentes y
de genes de resistencia dentro de un ecosistema