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catalisadores
classificao
especificidade e mecanismos de ao
regulao enzimtica
inibidores e aplicaes
1833:
Payen e Persoz: descobriram a converso do amido em acar pela saliva.
1850:
Louis Pasteur concluiu que leveduras catalisam a converso de
acares em lcool.
1878:
Friedrich Wilhelm Khne cunha o nome "enzima",
"en" = dentro e "zyme" = levedura.
1897:
Buchner descobriu que extratos de levadura podiam converter o acar em
lcool, e que fermentos eram molculas.
1926:
J.B.Sumner cristaliza a primeira protena, urease, e demonstra que a
atividade enzimtica uma caracterstica de molculas definidas.
enzima
Composto B (produto)
Reao
catalisada
pela enzima
Composto A (substrato)
Centro ativo
ou
stio cataltico
de uma enzima a poro
da molcula onde ocorre a
atividade cataltica
Teoria da catlise
Considere as reaes:
A + B
v1
v-1
v1 = v-1
Teoria da catlise
Energia
Estado de transio
Energia
de
ativao
Substrato (S)
Reao no
catalisada
quantidade de energia
que preciso fornercer aos
reagentes para a reao ocorrer
Estado de transio ou
complexo ativado:
Reao
catalisada
Produto (P)
Progresso da reao
E + S
ES
P + E
representa o
estado de
transio
Enzima
Anidrase carbnica
H 2 O2
Velocidade na
ausncia de enzima
Velocidade da
reao catalisada
Reaes/segundo
Reaes/segundo
1.3 X 10 1
1.0 X 106
7.7 X 106
4.3 X 10 6
3.0 X 10 9
1.0 X 10 11
1.7 X 10 -13
4.300
578
60
95
1.0 X 109
1.9X 1011
6.0 X 1012
5.6 X 1014
Poder
cataltico
H 2O + O2
Triosefosfato isomerase
Carboxipeptidase A
AMP nucleosidase
Nuclease de estafilococos
2)
3)
Aumento da reatividade dos reagentes: as cadeias laterais (R) dos aminocidos da enzima ou
co-fatores e coenzimas podem interagir diretamente com os substratos, dando-lhes carga eltrica
ou polarizando-os, tornando-os quimicamente mais reativos, ou ainda cedendo ou transferindo
certas funes qumicas.
4)
Induo de deformao fsica no substrato, por contacto com as cadeias laterais (R) dos
aminocidos das enzimas, que desestabilizam a molcula do substrato e facilitam o rompimento de
laos covalentes
lento
A hidrlise
no enzimtica
de uma ligaolento
rpido
peptdica lenta
e requer
condies
drsticas de pH e
gua,
temperatura um dos substratos
Sem catlise
Catlise cida
rpido
Catlise bsica
Muito
rpido
Catlise
cido-bsica
Cadeias
laterais de
aminocidos
no stio ativo
de uma
enzima
hidroltica
cofator
coenzima
Enzima
holozima
Apoenzima
parte proteica
ativa
Grupo
Prosttico
inativa
Coenzima
Reao com
Vitamina
Biocitina
CO2
Biotina
Coenzima A
Grupos acil
c. Pantotnico
Coenzima B12
H e grupos alquil
Vitamina B12
FAD, FMN
xido-reduo
Riboflavina
NAD, NADP
xido-reduo
Niacina
Fosfato de piridoxal
Grupos aminos
Piridoxina
Pirofosfato Tiamina
Grupos aldedos
Tiamina
Tetrahidrofolato
unidades C
cido flico
Grupo reativo
no stio ativo
Intermedirio
covalente
Quimotripsina
Elastase
Esterases
Trombina
Tripsina
Papana
Gliceraldedo-3-PO4
desidrogenase
Fosfatase alcalina
Fosfoglicomutase
Fosfoglicerato mutase
Succinil-CoA sintase
Aldolase
Descarboxilases
Enzimas dependentes
de piridoxal fosfato
1. xido-redutases
( Reaes de xidoreduo).
Transferncia de eltrons
Se uma molcula se
reduz, h outra que se
oxida.
2. Transferases
(Transferncia de grupos
funcionais)
grupos aldedo
gupos acila
grupos glucosil
grupos fosfatos (quinases)
3. Hidrolases
(Reaes de hidrlise)
4. Liases
(Adio a ligaes duplas)
Entre C e C
Entre C e O
Entre C e N
5. Isomerases
(Reaes de isomerizao)
6. Ligases
(Formao de laos
covalentes com gasto de
ATP)
Entre C e O
Entre C e S
Entre C e N
Entre C e C
Modelo Chave-Fechadura
Formas rgidas
Modelo Chave-Fechadura
E e S se deformam, para
otimizar o encaixe
Mecanismo de ao da quimotripsina,
quimotripsina
um exemplo tpico de uma serino proteinase
Enzima interage
com substratos
aromtcos
Trade cataltica
Ser His - Asp
A Ser-195 transfere H+
para His-57 formando um
estado de transio
tetradrico com o
substrato. O Asp-102
estabiliza o prton na His57 fazendo uma ligao
inica
A H2O transfere H+
para a His-57 e OH
para o substrato,
formando um segundo
estado de transio
tetradrico
O H+ transferido da His-57
de volta para a Ser-195. A
outra poro do substrato
liberada da enzima, que
retorna ao estado inicial
pH
temperatura
2. Tempo da reao
3. Concentrao dos reagentes
a enzima
o substrato
co-fatore(s)
pH timo=6,8
pH timo=9,9
50-
0-
Pouca energia
para a reao
acontecer
Desnaturao
trmica da
protena
Ao contrrio da curva em
forma de sino no caso da
atividade enzimtica versus
pH, a enzima s est
desnaturada em
temperaturas acima da
temperatura tima.
3. Concentrao:
da enzima
do substrato
de co-fatore(s)
A [substrato] cai na mesma razo em que a
[produto] aumenta em funo do tempo.
A enzima existe sob duas formas: enzima
livre E e complexo enzima-substrato ES. No
incio da reao, a [E] livre cai e a do
complexo [ES] aumenta e atinge um mximo,
em que no h mais [E] livre no meio. Nessa
situao (indicada no retngulo cinza), diz-se
que a enzima est saturada (s existe no
complexo ES). A velocidade da reao a
mxima.
concentrao
2. Tempo da reao
tempo
Na dcada de 1950:
Michaelis e Menten formularam as bases da cintica enzimtica, para explicar como a
concentrao do substrato [S] afeta a velocidade da reao v, conforme se observa
no grfico abaixo.
A velocidade da reao apresenta trs regies de comportamento diferente, a medida
que se aumenta a concentrao do substrato:
-parte a: v aumenta proporcionalmente
com aumentos de S.
-parte b: v aumenta no proporcionalmente com aumentos de S.
-parte c: v no aumenta mais, tendendo
a um valor mximo (Vmax),
sendo independente da [S]
O grfico mostra um conjunto de reaes
que esto acontecendo simultneamente,
conforme as equaes abaixo:
Vf = k1 [ES]
[E]+[S]
Vd= k-1 [E]+[S] + k2 [E]+[P]
[ES]
[ES]
sendo KM = k-1+ k2
k1
Constante de Michaelis-Menten
Vo=Vmax
Vmax = Vmax.[S]
2
2
Km + [S]
Vmax.Km + Vmax.[S] = 2Vmax.[S]
KM = k-1+ k2
Vmax.Km = Vmax.[S]
k1
Km = [S]
1.
Km alto
2.
Km baixo
Tang
=KM/Vmax
-1 =
Km
-1 = Km . 1
Vmax Vmax [S]
1
[S]
y = a . x + b
equao
de reta
Onde:
a = coef. angular = Km/Vmax
(tangente ngulo alfa)
b = coef. linear = 1/Vmax
(intercepto no eixo y)
A velocidade da reao
somente proporcional
[E]
quando a enzima est
saturada, ou seja, reao
de ordem zero (independe)
em relao a [S]
Eficincia cataltica
Kcat/Km
- k2 ou kcat (constante cataltica) mede o poder
cataltico da enzima
v = k2 Etotal + [P]
[ES]
k2 = Vmax (s-1)
[Etotal]
Para calcular kcat considera-se que toda a E existe como ES, e que v=Vmax
Substratos
Z-Lys-OMe
Z-(Ala)2-Tyr-Lys-OMe
kcat
KM
(seg-1)
(mM)
Razo
kcat/ KM
101
106
0.23
0.08
1
3
Z-Tyr-Gly-OMe
Z-(Ala)2-Ala-OMe
0.6
10
23
2
1
190
Z-Ala-OMe
Z-(Ala)2-Ala-OMe
6.7
73
153
0.43
1
3900
35
QUIMOTRIPSINA
18
STIO ATIVO
SUBSTRATO
S4
S3
S2
S1
S1
P4
P3
P2
P1
P1
STIO
CATALTICO
LIGAO
SUSCEPTVEL
O stio ativo de uma enzima proteoltica em geral uma fenda onde se localizam os
resduos de aminocidos (S) dotados de capacidade cataltica. O resduo de aminocido da
enzima que efetua a clivagem do substrato designado S1, e sucessivamente esquerda na
seqncia primria da enzima, ficam os resduos S2, S3, S4, etc. De maneira anloga, os
resduos de aminocidos da enzima direita de S1 so designados com S1, S2, S3, etc.
O resduo cataltico S1 da enzima cliva o substrato proteico no resduo P1, determinando sua especificidade primria. esquerda e direita de P1 na seqncia do substrato
proteico, esto os resduos P2, P3, etc, e P1, P2, etc, respectivamente.
A figura acima explica os dados da tabela no slide anterior. O encaixe da enzima com
a molcula do substrato melhora quando outros resduos, alm de S1 e P1, interagem. Na
tabela, os substratos com resduos P2 a P4 proporcionaram melhores parmetros, mostrando
que as interaes que esses realizam com a enzima influenciam sua atividade enzimtica.
Inibidores:
2.
Alosteria:
ativadores e inibidores
cooperatividade
3.
Modulao covalente
Ativao de zimognios
Fosforilao e defosforilao
Inibidores irreversveis:
Compostos orgnicos clorados ou fosforados so bons exemplos de inibidores enzimticos irreversveis,
pois reagem com o resduo S1 de serino-enzimas, formando um complexo irreversvel. Uma das enzimas
altamente sensvel a esses compostos a acetilcolinesterase, responsvel pela metabolizao do
neurotransmissor acetilcolina em neurnios centrais e perifricos.
Este o mecanismos de ao dos inseticidas organofosforados, como o malathion e o parathion. Tanto a
acetilcolinesterase de insetos como de mamferos so igualmente inibidas por essas drogas. Contribue
para a toxicidade desses inseticidas a longa meia vida que esses apresentam no ambiente.
Inseticidas
organofosforados
dose letal: 3-13 mg/Kg, oral
Acetilcolinesterase complexada com sarin ou gs dos nervos (dose letal 0,01 mg/kg, oral), um
organofosforado altamente txico e voltil, que reage com o resduo de Ser ativo da enzima.
E
E
Enzima +
H3C
SO2F
F-
diisopropilfluorofosfato
enzima inibida
PMSF
phenylmethane
sulphonyl fluoride
No laboratrio, serino-enzimas podem ser identificadas por serem eficientemente inibidas por
compostos organofosforados menos txicos como o diisopropilfluorofosfato (DFP) ou o fluoreto
de fenilmetilenosulfonila (PMSF).
Diferentes compostos so utilizados em laboratrio para identificar o mecanismo cataltico de
enzimas, baseado em reaes especficas para as cadeias laterais de aminocidos que podem
fazer parte do stio ativo dessas.
Neurotropic factors
PEDF F1
neuroserpin I-1
PN1 E2
Alzheimer disease
alfa1-ACT A3
Hormone transport
CBG A6
TBG A7
PCI A5
A Superfamlia das
Serpinas
Inflammation &
Complement activation
maspin B5
PI14 I2
Prohormone conversion
alfa1-ACT A3
alpha1-PI A5
alpha1-ACT A3
KAL A4
ov-serpins B*
Blood pressure regulation
Renal development
AGT A8
AGT A8
megsin B7
Sperm development
PCI A5
angiogenesis
PEDF - F1
maspin- B5
ATIII - C1
PAI1 C5
fibrinolysis
Coagulation
PCI A5
ATIII C1
HCFII D1
PAII E1
alphaPI A1
alpha1- ACT A3
PAI E1
PN1 E2
HSP47 H1
PAI1 C5
PAI2 B2
alpha2-AP F2
apoptosis
alpha1-PI A5
alpha1-ACT A3
ov-serpins B*
Microbial infection
B-cell development
serpinas inibitrias
centerin B9
C1 Inh G1
ov-serpins B*
serpinas no inibitrias
Inibidores:
2.
Alosteria:
ativadores e inibidores
cooperatividade
3.
Modulao covalente
Ativao de zimognios
Fosforilao e defosforilao
Inibio competitiva
I
E
S
IS
S
SS
P
I
S
S
E
E
I
Inibio incompetitiva
Inibidores:
2.
Alosteria:
ativadores e inibidores
cooperatividade
3.
Modulao covalente
Ativao de zimognios
Fosforilao e defosforilao
Ativador alostrico
Inibidor alostrico
Grfico V x S
(Michaelis-Menten)
uma curva sigmide
Carbamoil
aspartato
N- Carbamoil
+H
PO-4
aspartato
PO42-
pirimidinas
Sem efetores
alostricos
A ligao de CTP s
subunidades regulatrias fecha
o acesso aos stios ativos nas
subunidades catalticas.
ativa
CTP
inativa
CTP
Inibidores:
2.
Alosteria:
ativadores e inibidores
cooperatividade
3.
Modulao covalente
Fosforilao e defosforilao
Ativao de zimognios
fosfato
Fosforilao - Defosforilao
substrato
fosfatase
inativa
quinase
ativa
modulao PO
4
covalente
transporte
Enzima 1
cAMP
Enzima 4
Enzima 2
membrana
alosteria
alosteria
Sntese RNAm
indutor
Enzima 3
Sntese
ribossomal
repressor
Inibidores:
2.
Alosteria:
ativadores e inibidores
cooperatividade
3.
Modulao covalente
Fosforilao e defosforilao
Ativao de zimognios
quimotripsina
VIA INTRNSECA
PK
XII
A Coagulao Sanguinea
resultado da ativao de
uma cascata de zimognios
de serino-proteinases.
HMWK
Superfcie-
XI
VIA EXTRNSECA
XIIa
IX
XIa
Superfcie
-
IX
Leso
vascular
IXa
IXa
VIIa
VII
Fator tissular
VIIIa
X
X
Xa
Va
V
Va
Trombina (IIa)
Protrombina (II)
VIA COMUM
Fibrinognio (I)
Fibrina (Ia)
XIIIa
Cogulo de
fibrina
FIBRINLISE
Uroquinase
tPA
Plasminognio
Plasmina