CATALISIS

CATALISIS
Un mecanismo es un conjunto de pasos en una reaccin qumica
mediante el cual un sustrato se transforma en un producto

1. Mecanismos catalticos
Las enzimas consiguen velocidades catalticas significativamente
superiores debido a que sus lugares activos poseen estructuras que
estn singularmente adecuadas para favorecer la catlisis.

1.1. Factores contribuyen a la

catlisis enzimtica
A) Los efectos de proximidad y tensin
B) Los efectos electrostticos
C) La catlisis acido bsica
D) La catlisis covalente

A) Efectos de proximidad y tensin

Para que tenga lugar una reaccin
bioqumica
el
sustrato
debe
acercarse a los grupos funcionales
catalticos dentro del lugar activo

Las velocidades de las reacciones

intramoleculares son mucho mayores
que
las
de
las
reacciones
intermoleculares, en las que la difusin
del sustrato reduce el tiempo que se
emplea en el estado de transicin y hace
ms lenta la reaccin

B) Efectos electrostticos
La distribucin de carga en el lugar
activo relativamente anhidro puede
influir sobre la reactividad qumica del
sustrato.

Una unin ms eficaz del sustrato

disminuye la energa libre del estado
de transicin, lo cual acelera la
reaccin.

C) Catlisis acido bsica

D) Catlisis covalente
En algunas enzimas un grupo nuclefilo
de una cadena Jateral forma un enlace
covalente inestable con el sustrato

Una clase de enzimas denominada serina proteasas

utllizan el grupo - CH2 - OH de la serina como
nuclefiJo para hidrolizar los enlaces peptdicos

Durante el Plimer paso, el nuclefilo ataca al grupo carbonilo.

Al formarse el enlace ster, se rompe el enlace peptdico. El
intermediario acil-enzima resultante es hidrolizado por el agua
en una segunda reaccin

Funcin de los cofactores en la catlisis enzimtica

METALES

Las cadenas laterales de los

aminocidos del lugar activo son
las responsables principales
de catalizar las transferencias de
protones en las sustituciones
nuclefilas. Para catalizar otras
reacciones, las enzimas requieren
cofactores no proteicos, es
decir, cationes metlicos y
coenzimas. Se presentan las
propiedades estructurales y
las reactividades qumicas de cada
grupo.

metales
de transicin

(p. ej., Fe2+ y Cu2+)

Debido a sus estructuras

electrnicas, los metales de
transicin suelen participar
en la catlisis.

metales alcalinos
y alcalinotrreos

(p. ej., Na+,

K+, Mg2+ Y Ca2+).

los metales o alcalinosterreos y

alcalinotrreos
con
poca
frecuencia forman complejos
fuertes con las protenas

Los iones metlicos proporcionan una concentracin elevada de cargas positivas que
es especialmente til para la unin de las molculas pequeas Debido a que los
metales de transicin actan como cidos de Lewis (aceptores de pares electrnicos),
son eficaces electrfilos.

(Las cadenas laterales de los aminocidos son malas

electrfilas debido a que no pueden aceptar pares de electrones sin compartir.) Debido
a que sus valencias dirigidas les permiten interaccionar con dos o ms ligandos,
los iones metlicos ayudan al sustrato a orientarse dentro del lugar activo.

Como
consecuencia, el complejo sustrato-ion metlico polariza al sustrato y estimula la
catlisis. Por ejemplo, cuando el cofactor z' de la anhidrasa carbnica polariza
6.4. Catlisis
una molcula de agua, se forma un grupo Zn2+-OH unido. El grupo OH (que actacomo nuclefilo)
ataca al CO2 y lo convierte en HCO)":

Coenzimas

La mayora de las
coenzimas derivan
de las vitaminas se
dividen en dos
clases

hidrosolubles

Liposolubles.

Existen dos
formas
coenzimticas
del cido
nicotnico

el dinucletido
de nicotinamida
y adenina
(NAD)

dinucletido de
nicotinamida y
adenina fosfato
(NADP)

Estas coenzimas se
encuentran en sus
formas
oxidadas
(NAD+ y NADP+)
Y
sus
formas
reducidas (NAOH y
NAOPH)
Las estructuras del
NAO+ y del NAOP+
contienen adenosina y
el derivado N-ribosilo
de la nicotinamida, que
estn unidos a
travs de un grupo
pirofosfato

Las enzimas que requieren NAOPH normalmente catalizan reacciones de biosntesis.

Un nmero pequeo
de deshidrogenasas pueden utilizar NAOH o NAOPH.)
La alcohol deshidrogenasa cataliza la oxidacin reversible del etanol para formar
acetaldehdo:

flavoprotenas.

Las flavoprotenas son

un grupo diverso de
catalizadores,que
actan
como
deshidrogenasas,
oxidasas e hidroxilasas.

La riboflavina (vitamina
B2)

es un componente de
dos
coenzimas:
mononucletido
de flavina (FMN) y
dinucle6tido de flavina
y adenina(FAD)

Estas enzimas,
que
catalizan
reacciones
de
oxidacin-reduccin, utilizan el
grupo isoaloxacina
del FAD o el FMN como donador o
aceptor de dos tomos de hidrgeno

El FMN Y el FAD actan

como grupos prostticos
firmemente unidos en una
clase de
enzimas
denominadas
flavoprotenas.

Efectos de la temperatura y del pH

sobre las reacciones catalizadas por
las enzimas

Cualquier factor ambiental que distorsione la estructura

proteica puede alterar la actividad enzimtica. Las enzimas son
especialmente sensibles a las variaciones de la temperatura y
del pH.

PH
La concentracin de ion hidrgeno
afecta a las enzimas de diversas
formas.
La actividad cataltica est relacionada
con el estado inico del lugar activo.
Las variaciones de la concentracin de
ion hidrgeno pueden afectar a la
ionizacin de los grupos del lugar
activo.

un sustrato contiene un grupo

ionizable, un cambio del pH puede
alterar su capacidad para unirse al
lugar activo.
Los cambios drsticos del pH
frecuentemente conducen a la
desnaturalizacin.

Mecanismos detallados de
la catlisis enzimtica

Se han estudiado ms de 2000 enzimas,

cada una de las cuales posee una estructura,
una especificidad de sustrato y un
mecanismo de reaccin nicos. Cada
mecanismo de reaccin est afectado por los
factores estimulantes de la catlisis de la
temperatura y del pH.

QUIMOTRIPSINA

Es una protena de 27 000 D que

pertenece a las serina proteasas. Los
lugares activos de todas las serina
proteasas contienen un conjunto
caracterstico de residuos de
aminocido.
El residuo de serina del lugar activo
desempea un papel especialmente
importante en los mecanismos
catalticos de este grupo de enzimas.
Las serina proteasas
se inhiben de forma irreversible por
el diisopropilfluorofosfato (DFP). En
las enzimas inhibidas por el DFP, el
inhibidor est unido de forma
covalente slo a la Ser 195 y no a
ninguna de ias otras 29 serinas.

ALCOHOL
DESHIOROGENASA

Recuerde que la alcohol

deshidrogenasa,
una enzima que se encuentra en la
mayora de las clulas eucariotas
cataliza la oxidacin reversible de
un alcohol para formar un aldehdo:

En esta reaccin, en la que se eliminan dos electrones

y dos protones, la coenzima NAO acta como aceptor
electrnico.

El lugar activo de la alcohol deshidrogenasa contiene dos

residuos de cistena (Cys 48 y Cys 174) y un residuo de histidina
(His 67), todos ellos coordinados con un ion Zn. Tras la unin del
NAO+ al lugar activo, entra el sustrato etanol y se une al Zn2+
como anin alcoholato (Fig. 6.20b). El efecto electrosttico del
Zn2+ estabiliza el estado de transicin. Al descomponerse el
intermediario, se transfiere el ion hidruro desde el sustrato al
anillo de nicotinamida del NAD+ Tras liberarse el producto
aldehdo del lugar activo, el NADH tambin se disocia.

REGULACION ENZIMTICA

Las miles de reacciones qumicas de las clulas catalizadas por enzimas estn organizadas en
diversas rutas bioqumicas (o metablicas).
Los seres vivos han producido mecanismos sofisticados para regular las rutas bioqumicas.

Mantenimiento de un estado
ordenado. La regulacin de cada
ruta da lugar a la produccin de las
sustancias que se requieren para
mantener la estructura y funcin
de la clula

Conservacin de la energa.
Las clulas controlan
constantemente las reacciones
que generan energa, de forma
que consumen los nutrientes
suficientes para satisfacer sus
requerimientos energticos

Respuesta a las variaciones

ambientales. Las clulas pueden
realizar ajustes relativamente rpidos
de las variaciones de temperatura,
pH, fuerza inica y concentracin de
nutrientes debido a que pueden
aumentar o disminuir las velocidades
de reacciones especficas

MODIFICACION
COVALENTE
Algunas enzimas se regulan por la interconversin reversible entre sus formas
activa e inactiva. Muchas de estas enzimas poseen residuos especficos que
pueden estar fosforilados y desfosforilados. Varias enzimas se sintetizan y
almacenan en forma de precursores inactivos denominados proenzimas o
zimgenos

REGULACION
ALOSTERICA
Estas enzimas reguladoras normalmente catalizan el primer paso de la ruta Las
clulas utilizan la regulacin alostrica para responder de forma
eficaz a determinadas variaciones de las condiciones
intracelulares, las clulas utilizan la regulacin alostrica para
responder de forma eficaz a determinadas variaciones de las
condiciones intracelulares esta puede aumentar o disminuir la
unin del sustrato a esa enzima

COMPARTIMENTALIZACIO
N

Es un mecanismo que utilizan las clulas para

controlar las reacciones bioqumicas, desempea un
papel clave en los procesos metablicos, el
confinamiento de determinadas biomolculas
dentro de un compartimiento es crucial para el
acoplamiento de reacciones desfavorecidas con
reacciones energticamente favorables.
Las clulas utilizan varias estrategias para
compartimentalizar los procesos bioqumicos, que
van desde la asociacin de molculas enzimticas
en complejos multiproteicos al uso de
compartimientos rodeados por membranas
fcilmente identificables