ORGANIZACIN DE GENOMA

PROCARIOTA Y EUCARIOTA

GENOMA
PROCARIOTA

Ejemplo de tamao de genomas: nuclear

Especies

Eucariotas
Arabidopsis thaliana
Caenorhabditis elegans
Drosophila melanogaster
Homo sapiens
Sacharomyces cerevisiae

Bacteria
Escherichia coli
Mycoplasma genitalium
Streptococcus pneumoniae
Vibrio cholerae

Tamao del
genoma (Mb)

Numero de
genes

125
97
180
3200
12.1

25 500
19 000
13 600
35 000
5 800

4.64
0.58
2.16
4.65

4 400
500
2300
4 100

TAMAO DE LOS GENOMAS

Compartimento

Dimensiones

Acido
nucleico

0.008 x 0.3 m

RNAss

2 m

0.07 m
dimetro

DNAds

11 m

Fago T4

0.065 x 0.1 m

DNAds

55 m

E. coli

1.7 x 0.65 m

DNAds

1.3 mm

3.0 x 0.5 m

Aprox. 10
copias DNAds

50 m

6 m dimetro

46 copias
DNAds

1.8 mts

Virus mosaico
tabaco
Adenovirus

Mitocondria
(humana)

Ncleo (humano)

Longitud

DNA Cromosomal
DNA circular
cerrado
Superenrrollado.

No hay porcesamiento del

ARNm
La transcripcin est
ligada a la traduccin.

EMPAQUETAMIENTO DEL GENOMA BACTERIANO

Organizacin del
cromosoma
eucaritico

19

Empaquetamiento del DNA

Una de las caractersticas comunes de la organizacin del material
gentico es su alto grado de compactacin: masa compacta que
ocupa un espacio bien delimitado.
El genoma humano tiene unas 3.000 megabases (1-2m) y un
ncleo ocupa unas 6m.

20

Empaquetamiento del DNA

Doble hlice
Nucleosoma (Octmero de Histonas)
Solenoide (Histona H1)

Composicin del Cromosoma

(Cromatina)

Protenas : bsicas -> histonas

cidas -> no histonas (~30%)

DNA

RNA (1%)

Tasa de empaquetamiento: 1:50.000-100.000

21

Contenido en moles % de
Histona

N
residuos

Pm
Lys

Arg

Lys/Arg

Modificacin

Fosforilacin

H1

213

21.000

27,7

1,4

19,78

H2A

129

13.900

10,9

9,3

1,17

H2B

125

13.774

15,2

6,1

2,49

Fosforilacin,
acetilacin
Fosforilacin,
acetilacin

V.

evolutivo

Acetilacin,
H3

135

15.273

9,6

13,3

0,72

metilacin

0,1

fosforilacin
Acetilacin,
H4

102

11.236

10,8

13,7

0,79

metilacin
fosforilacin

cambio

0,06

Mdula ("core") del Nucleosoma

Formacin del Solenoide

(papel de la histona H1)

Empaquetamiento del DNA

24

Empaquetamiento del DNA

25

Niveles de empaquetamiento del Genoma

Eucariota

ORGANIZACIN DEL MATERIAL HEREDITARIO

SECUENCIAS:

NICAS,
REPETIDAS,
MODERADAMENTE REPETIDAS Y
ALTAMENTE REPETIDAS

Tipos de secuencias de los organismos

eucariticos

Human genome
3200 Mb

Genes and gene-related

Sequences 1200 Mb

Genes
48 Mb

pseudogenes

37.5%

Intergenic DNA
2000 Mb

Related
Sequences
1152 Mb

Gene
fragments

Introns,
UTRs

Microsatellites
90 Mb
LINEs
640 Mb

UTR= untraslated regions

LTR= Long terminal
repeats

Other
Intergenic
Regions
600 Mb

Interspersed
Repeats
1400 Mb

LTR elements
250 Mb

SINEs
420 Mb

DNA transposons
90 Mb

Organizacin del genoma humano

Various
510 Mb

DNA de copia simple/nica/no repetitivo

La proporcion depende de los organismos:
Procariotes = 100%
Eucariotas inferiores = 80%
Animales superiores = 50-70%

RNA no codificante
5% secuencia de genes

5% secuencia de control

Proteinas celulares
Control de la expresion de
genes

Pseudogenes y otras
secuencias relacionadas:
Convencional pseudogenes
Pseudogene procesado
Genes truncados
Fragmento de genes

DNA repetitivo
Son secuencias de DNA que aparecen en copias multiples
e.g. costituyen entre 40 y 50% del genoma total humano
Las secuencias repetidas unidades de repeticin tienen tamaos diversos y cada
una se encuentra de forma idntica o casi idntica muchas veces en el genoma.
El nmero de copias de la unidad de repeticin varia desde unos cientos o miles
(DNA moderadamente repetitivo) hasta cientos de miles (DNA altamente repetido).
La distribucin puede ser en forma dispersa por todo el genoma o en forma
agrupada.

Distribucin del DNA

Repetido

DNA repetitivo codificante

1. DNA repetitivo codificante agrupado

2. DNA repetitivo codificante disperso

Familias multigenicas de genes dispersos
Estos son localizados de forma dispersa por el genoma, a menudo en
cromosomas distintos
Son genes que codifican protenas de funciones diversas: enzimticas,
reguladoras, de almacenamiento, estruturales, etc.
E.g. la familia de aldolasa comprende 3 genes funcionales y 2
pseudogenes, repartidos en 5 cromosomas.
Los genes de actina forma otra familia con 4 genes y al menos 16
pseudogenes.

DNA repetitivo no codificante

Representa entre 20-40% del DNA genmico
total
Se divide en dos categorias:
moderadamente repetitivo (se ubica en
forma dispersa)
altamente repetitivo (es agrupado)

1. DNA altamente repetitivo y agrupado: satelite

Esta formado por unidades pequeo tamao (250 pb) repetidas en tandem en miles y un millon de
veces, con lo que el bloque abarca cientops de Kb
o incluso varias Mb.
Ubicacin en las regiones heterocromtidas
Ricas A-T
2. DNA moderadamente repetido y disperso
Este tipo de DNA se distribuye a lo largo del
cromosomas
Numero de repeticiones no muy elevado 100 -

a. Bloques dispersos de repeticiones en tandem:

DNA minisatelite
Formado por repeticiones de 10-65 pb regrupadas en tandem formando
bloques relativamente grandes, de cientos a miles de repeticones
Repartidos en todo el genoma
Ricas en G-C
DNA microsatelite
Unidad de repeticin es menor a 7pb, se presentan agrupadas en tandem
en bloques de hasta 50 repeticiones
Dispersa en todo el genoma
Alto polimorfismo

b. Repeticiones dispersas
Secuencias SINE (Short Interspersed Nuclear
Elements- Elementos nucleares dispersos cortos)
Secuenias LINE (Long Interspersed Nuclear
Elements- Elementos nucleares dispersos largos)
LTR (long terminal repeats)
DNA transposon

Minisatlite telomrico
SINE-1
Preferentially in
light G bands

Satlite clsico

Microsatlit
e

Minisatlite
hipervariable

DNAr

Localizacin cromosmica de los distintos tipos de DNA repetido.