Protenas

a) Funciones de las protenas:

Catlisis.
Estructura.
Movimiento.
Defensa.
Regulacin.
Transporte.
Almacenamiento.
Respuesta a agresiones.

Desde un punto de vista qumico, existen dos grandes grupos de protenas:

A) Protenas simples: formadas exclusivamente por aminocidos, como es el caso
de la ubiquitina, una proteasa intracelular formada por 53 AA.
B) Protenas conjugadas: que contienen adems de la cadena polipeptdica un
componente no aminoacdico llamado grupo prosttico, que puede ser un azcar
(glucoprotenas), un lpido (liporpotenas), o simplemente un in inorgnico
(metaloprotenas).
La protena en ausencia de su grupo prosttico no es funcional, y se
llama apoprotena. La protena unida a su grupo prosttico es funcional, y se llama
holoprotena (holoprotena = apoprotena + grupo prosttico).
Son protenas conjugadas la hemoglobina, la mioglobina, los citocromos, las
protenas G, etc.

b) Estructura proteica.
Niveles de organizacin estructural:
Estructura Primaria.
Estructura Secundaria.
Estructura Terciaria.
Estructura Cuaternaria.

Estructura Primaria.
Corresponde a la secuencia lineal de los aminocidos, incluyendo la
posicin de los puentes disulfuro.
Determina la estructura de la protena.
Mutacin: alteracin de la secuencia de ADN que codifica para la
secuencia de aminocidos de una protena. Son acontecimientos
espontneos y aleatorios.
Mutaciones conservadas: Alteracin de un aminocido por otro con la
cadena lateral semejante. Muchas veces no se afecta la funcin de la
protena (Ej: sustitucin de Leucina por Isoleucina).
Mutaciones silentes: No cambian la secuencia de aminocidos de la
protena.
Resduos variables: Aminocidos que aparentemente realizan papeles
inespecficos en el polipeptido. Su mutacin muchas veces no afecta la
funcin de la protena.

Alteracin en la estructura primaria: Enfermedades Moleculares.

Drepanocitosis (anemia falciforme): Esta enfermedad es consecuencia de la
mutacin de un nico aminocido de la cadena de la Hemoglobina A. Debido a la
sustitucin de Glu por Val en el aminocido 6 de la cadena la protena alterada
(HbS) se agrega para formar estructuras en forma de varilla en el estado
desoxigenado, los eritrocitos adoptan una forma de hoz y son susceptibles a
hemlisis, causando una anemia grave. Adems, la capacidad de unin de
Oxgeno es reducida.

Estructura secundaria.
Plegamiento de los aminocidos en la secuencia lineal.
Los tipos de estructura secundaria ms comunes son la hlice y la lmina
Estn estabilizados por puentes H entre los grupos C=O y N-H del esqueleto
polipeptdico.

Hlice

Se forman enlaces H entre el grupo N-H de

cada aminocido y el grupo C=O del
aminocido que se encuentra 4 resduos ms
adelante.
Los grupos R de los aminocidos se extienden
hacia fuera de la hlice.

Hoja plegada Conjunto de cadenas

Se forman cuando se alinean de lado dos o ms segmentos de cadenas
polipeptdicas.
Cada segmento individual se denomina cadena .
En lugar de estar enrollada, cada cadena est totalmente extendida.
Las lminas plegadas estn estabilizadas por enlaces H que se forman entre
los grupos N-H y C=O del esqueleto polipeptdico de las cadenas adyacentes.
Existen 2 tipos: paralelas y antiparalelas.
Lminas plegadas paralelas: Las cadenas estn colocadas en la misma
direccin.
Lminas plegadas antiparalelas: las cadenas estn ubicadas en direcciones
opuestas. Son ms estables que las lminas plegadas paralelas.
En ocasiones se observan lminas plegadas paralelas y antiparalelas
mezcladas.

Lminas plegadas antiparalelas

Lminas plegadas paralelas

Las lminas plegadas paralelas y antiparalelas pueden estar mezcladas

Vueltas
Son una secuencia de 4 aminocidos
que revierten completamente la
direccin de la cadena polipeptdica.
Esto ocurre va unin de puentes H
entre los residuos 1 y 4.

Estructuras supersecundarias

Unidad Meandro

Unidad

Barril

Llave griega

Unidad

Estructura Terciaria.
Es la conformacin tridimencional nica que adopta cada protena para
plegarse en su estructura nativa con actividad biolgica.
Se produce como consecuencia de interacciones entre las cadenas laterales
en la estructura primaria.
Los polipptidos en general se pliegan de forma que los residuos de
aminocidos distantes en la estructura primaria quedan cerca.
En las protenas globulares debido a su naturaleza compacta la mayora de
las molculas de agua quedan excluidas del interior de la protena permitiendo
las interacciones entre los grupos polares y apolares.
Los dominios son segmentos estructurales independientes en las protenas y
que poseen funciones especficas. Segn sus elementos de estructura
secundaria que estn presentes, se encuentran los dominios , dominios ,
dominios y dominios

Dominios representativos de las protenas.

Presente en la protena de
unin a retinol humana

Interacciones no covalentes que estabilizan la estructura terciaria

Estructura Terciaria de la Protena Adenilato quinasa.

Modelo espacial: Determina el volumen

Ocupado y la forma espacial.

Modelo de cintas

Estructura cuaternaria.

Adoptan esta estructura polipptidos con varias subunidades.

Subunidad: Cadena polipeptdica que se pliega de manera independiente y
que es capaz de interaccionar con otras cadenas polipeptdicas o
subunidades.
Oligmeros: Protenas con varias subunidades, en las que alguna o todas
las subunidades son idnticas.
Razones por las cuales existen protenas con varias subunidades:
a) La sntesis de subunidades aisladas es mas eficaz para aumentar la longitud
de una nica cadena polipeptdica.
b) En los complejos supramoleculares, como las fibras de colgeno, la
sustitucin de componentes ms pequeos gastados o daados puede
realizarse de manera ms eficaz.
c) Las interacciones complejas de varias subunidades sirven para regular la
funcin biolgica de una protena ( Ej. Alosterismo).
Las subunidades polipeptdicas se mantienen unidas entre si a travs de
interacciones no covalentes ( interacciones hidrofbicas, electrostticas,
enlaces de Hidrgeno) y covalentes ( puentes disulfuro).

Estructura terciaria y cuaternaria de la Hemaglutinina

Denaturacin de protenas.
Es la prdida de la estructura tridimencional de una protena, sin incluir la ruptura
de los enlaces peptdicos.
La molcula denaturada puede perder de manera total o parcial su funcin
biolgica.
Puede ser un proceso irreversible o reversible.
Puede ser causada por agentes fsicos o qumicos.

Denaturacin reversible: Experimento de Anfinsen.

La estructura tridimensional de un pptido est dada por la secuencia polipeptdica.

Agentes denaturantes:
cidos y bases fuertes: Debido a la protonacin de las cadenas laterales y
alteracin de puentes H y enlaces disulfuro.
Disolventes Orgnicos: Los disolventes orgnicos hidrosolubles como el Etanol
intervienen con las interacciones hidrofbicas, ya que interaccionan con los grupos
R apolares y forman enlaces H con el agua y los grupos polares de la protena.
Detergentes: Rompen las interacciones hidrofbicas, para que se desplieguen las
protenas en cadenas polipeptdicas extendidas.
Agentes reductores: En presencia de Urea los agentes reductores como Mercaptoetanol convierten los puentes disulfuro en grupos sulfhidrilo. La Urea
rompe los enlaces hidrgeno y las interacciones hidrofbicas.
Concentracin salina: La unin de los iones salinos a los grupos ionizables de la
protena disminuye la interaccin entre los grupos con carga opuesta sobre la
molcula proteica. Las molculas de agua entonces pueden formar esferas de
solvatacin alrededor de estos grupos. A altas concentraciones de sales las
molculas de protenas precipitan.
Iones metlicos pesados: Los metales pesados como Hg++ y Pb++afectan de
varias maneras la estructura proteica, rompiendo puentes salinos.
Cambios de temperatura: Al aumentar la temperatura aumenta la velocidad de
vibracin molecular, rompindose las interacciones dbiles.
Agresin mecnica: Las acciones de agitacin y trituracin rompen las fuerzas
que mantienen la estructura proteica.

Hidrlisis proteica o protelisis.

.- Es la degradacin de las protenas (Ruptura del enlace peptidico).

.- En la clula la hidrlisis proteica es catalizada por enzimas.