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Estructura y replicacin

del material Tema


gentico
6: Estructura 1

Dr. Antonio Barbadilla

Objetivos tema 6:
Estructura y replicacin del material
gentico
Debern
Debern quedar
quedar bien
bien claros
claros los
los siguientes
siguientes puntos:
puntos:
Cmo
se descubri
descubri la
la naturaleza
naturaleza qumica
qumica del
del
Cmo se
material
material hereditario
hereditario
La
composicin qumica
qumica de
de los
los cidos
cidos nucleicos
nucleicos
La composicin
La
estructura 3D
3D del
del DNA:
DNA: naturaleza
naturaleza
La estructura
complementaria
complementaria yy antiparalela
antiparalela de
de la
la doble
doble cadena
cadena
del
del cido
cido desoxirribonucleico
desoxirribonucleico (DNA)
(DNA)
La
extraordinaria capacidad
capacidad explicativa
explicativa del
del
La extraordinaria
modelo
modelo del
del DNA
DNA de
de la
la funcin
funcin biolgica
biolgica
fundamental
fundamental de
de esta
esta molcula
molcula
La
La replicacin
replicacin semiconservativa
semiconservativa
Enzimologa
de la
la replicacin
replicacin
Enzimologa de
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 2

La transformacin bacteriana en
Streptococcus pneumoniae (Griffith 1928)
Rugosa

Muerte por neumona

Cepa resistente

Lisa

Dr. Antonio Barbadilla

No muere
3

Muere
Tema 6:
Estructura 3

Cul es el Principio transformante?

Principio
Rugosa

Lisa

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 4

Colin MacLeod

El elemento transformante
es el DNA (1944)

Maclyn McCarty
Oswald
Avery

Ver animacin
experimento
tranformacin
bacteriana
Dr. Antonio Barbadilla

Slo DNA produce transformacin


Tema

6: Estructura 5

Experimento de Alfred Hershey y Martha


Chase con fagos (1952)

Bacterifago T4
El DNA es el
material
infeccioso
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 6

Componentes de los cidos nucleicos


adenina
timina
guanina
citosina

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 7

Reglas de Chargaff

1. Proporcin de purinas = Proporcin de pirimidinas


A+G=C+T
2.

A=T

3.

G=C

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 8

1953. Ao culminante:
J. Watson y F. Crick resuelven la
estructura tridimensional del DNA
(Nature 171: 737-738)
Watson y yo hemos
encontrado el
secreto de la vida

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 9

1953. Ao culminante:

Dos lneas de evidencia:


Reglas de Chargaff
Fotografas de difraccin de rayos X

Dr. Antonio Barbadilla

10

Tema 6: Estructura 10

Significado reglas de Chargaff

Dr. Antonio Barbadilla

11

Complementariedad de las bases


Tema 6: Estructura 11

Difraccin de rayos X

Hemoglobina
Linus Pauling
Dr. Antonio Barbadilla

12

Tema 6: Estructura 12

Interpretacin del patrn difraccin de rayos X del DNA

Rosalind E.
Franklin

Dr. Antonio Barbadilla

13

Crick

Tema 6: Estructura 13

Modelo en metal
del DNA

J. Watson y F. Crick
Concluyen: La estructura del DNA es una

doble hlice, formada por cadenas orientadas


en direcciones opuestas (antiparalelas). La
estructura se mantiene gracias a enlaces de
hidrgeno entre las bases nitrogenadas que se
encuentran orientadas hacia el interior de las
Tema 6: Estructura 14
14 cadenas

Dr. Antonio Barbadilla

Dr. Antonio Barbadilla

15

Doble hlice, formada


por cadenas orientadas
en direcciones opuestas
(antiparalelas).

La estructura se mantiene gracias


a enlaces de hidrgeno entre las
bases nitrogenadas que se
encuentran orientadas hacia el
interior de las cadenas

Tema 6: Estructura 15

Desnaturalizacin del DNA


Separacin de las dos hebras por calor
Una mayor proporcin G-C tiene una mayor
temperatura de desnaturalizacin (fusin)
Porcentaje G + C

100
80
60
40
20

Dr. Antonio Barbadilla

70

80

90

100 110

Temperatura de fusin (desnaturalizacin)


16

Tema 6: Estructura 16

Dr. Antonio Barbadilla

17

Hlices levgiras y dextrgiras


Tema 6: Estructura 17

Dr. Antonio Barbadilla

18

DNA-B dextrgira

Tema 6: Estructura 18

Ver
Ver artculo
artculo
Nature
Nature
1953
1953
Dr. Antonio Barbadilla

19

Tema 6: Estructura 19

Dr. Antonio Barbadilla

20

Tema 6: Estructura 20

La estructura del DNA suministra una


explicacin
asombrosamente
simple del fenmeno de la herencia
La estructura explica:
La naturaleza de la secuencia lineal de los genes
(informacin digital cuaternaria en secuencias
unidimensionales de monmeros A,T,G,C)
El mecanismo de replicacin exacta de los
genes
La naturaleza qumica de las mutaciones
Por qu la mutacin, la recombinacin y la
expresin gnica son fenmenos separables a
nivel molecular

Dr. Antonio Barbadilla

21

Tema 6: Estructura 21

Esencial a la relacin
ntima entre estructura
molecular y funcin
gentica del DNA es el
concepto de molde
La complementariedad de las
bases nitrogenadas permite que
la secuencia de una cadena
sencilla de DNA acte como un
molde para la formacin de una
copia complementaria de DNA
(replicacin) o de mRNA
(transcripcin)

Dr. Antonio Barbadilla

22

Tema 6: Estructura 22

Y ahora las declaraciones de Watson y


Crick sobre el ADN. Esto es para m la
prueba verdadera de la existencia de Dios
Salvador Dal

Antes pensbamos que nuestro futuro


estaba en las estrellas. Ahora sabemos que
est en nuestros genes.
James Watson
Dr. Antonio Barbadilla

23

Tema 6: Estructura 23

Una estructura
tan bonita tena,
por fuerza, que
existir
Dr. Antonio Barbadilla

24

Tema 6: Estructura
24
J. Watson

Una estructura
tan bonita tena,
por fuerza, que
existir
Dr. Antonio Barbadilla

25

J. Watson

Tema 6: Estructura 25

El DNA
contiene informacin
digital cuaternaria en
secuencias unidimensionales
de monmeros A,T,G,C
(cristal
aperidico)
26
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 26

Hay grandeza en esta concepcin de la


vida,... que mientras este planeta ha ido
girando segn la constante ley de la
Hay
grandeza
esta
concepciny de
gravitacin,
seen
han
desarrollado
se la
estn
vida,... que mientras
este
ha ido
desarrollando,
a partir
deplaneta
una molcula
girando segn
la constante
ley de
helicoidal
asombrosa,
infinidad
delaformas
gravitacin,
han desarrollado
y se estn
cada
vez mssebellas
y maravillosas
desarrollando, a partir de
un comienzo
Charles
Darwintan
sencillo, infinidad de formas cada vez ms
bellas y maravillosas
Charles Darwin
Dr. Antonio Barbadilla

27

Tema 6: Estructura 27

Dr. Antonio Barbadilla

28

Tema 6: Estructura 28

Replicacin del DNA

Dr. Antonio Barbadilla

29

Tema 6: Estructura 29

25 de Abril 1953

It has not escaped our notice that the


specific pairing we have postulated
immediately suggests a possible
copying mechanism for the genetic
material.

Dr. Antonio Barbadilla

30

Tema 6: Estructura 30

Posibles modelos de replicacin

Dr. Antonio Barbadilla

31

Tema 6: Estructura 31

Replicacin del DNA


Semiconservativa: una cadena sirve de molde para una
nueva cadena
El experimento de M. Meselson y F. Stahl (1958)
demuestra que la replicacin es semiconservativa

Mathew Meselson

Frank Stahl

Dr. Antonio Barbadilla

32

Tema 6: Estructura 32

Dr. Antonio Barbadilla

33

Tema 6: Estructura 33

Replicacin del DNA

Enzimas que sintetizan (replican) el DNA


E. coli
DNA polimerasa I (rellena huecos y repara)
DNA polimerasa II y III (funcin principal en
la sntesis)
Aade bases en ambas cadenas en la
direccin 5 3
Requiere un 3 OH final
Eucariotas
5 polimerasas
y principal en replicacin
, y exonucleasas
Correccin de pruebas: actividad 3 5
exonucleotdica. Sustituye bases mal emparejadas
(10-5) por correctas (10-7); mecanismos de reparacin

Dr. Antonio Barbadilla

adicionales la reducen hasta 10-10

34

Tema 6: Estructura 34

Las polimerasas
conocidas aaden
nucletidos
solamente en la
direccin 5 3

Dr. Antonio Barbadilla

35

Tema 6: Estructura 35

Dr. Antonio Barbadilla

36

Tema 6: Estructura 36

Por qu no hay una enzima que


polimerice en la direccin 3-> 5?
No funcionara la correccin de errores por
falta de un trifosfato que suministre la
energa de enlace covalente azcar-fosfato

Dr. Antonio Barbadilla

37

Tema 6: Estructura 37

Adicin 53

Dr. Antonio Barbadilla

38

Tema 6: Estructura 38

OH

PP

OH

OH
3

PP

+ H2O

P
39

OH

OH

PP

OH
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura 39

Adicin 35
(hipottica)

Dr. Antonio Barbadilla

40

Tema 6: Estructura 40

OH

P
P

OH

+ H2O

P
PP

OH

PP

P PP

OH

P
PP

41

P
PP

OH

OH
Dr. Antonio Barbadilla

Adicin 35
(hipottica)

Tema 6: Estructura 41

Correccin de errores

Dr. Antonio Barbadilla

42

Tema 6: Estructura 42

OH

PP

POH

OH
3

PP

+ H2O

P
43

OH

OH
Dr. Antonio Barbadilla

Adicin 53

Tema 6: Estructura 43

OH

P
P
PP

44

POH

Dr. Antonio Barbadilla

OH

Adicin 35
(hipottica)
Tema 6: Estructura 44

Replicacin del DNA (2)


Replicacin: continua (cadena adelantada, cebador
slo inicio) y discontinua (cadena retrasada)
Discontinua
Cebador (pequeo RNA 2-60 nucletidos
aadido por enzima primasa o RNA pol que
provee 3 OH.
Fragmento de Okazaki por DNA pol III
(1500 bp en procariotas y 150 en eucariotas)
Pol I elimina cebador 3 -> 5 y llena huecos
(gap)
Ligacin (DNA ligasa, enlace fosfodister)
Dr. Antonio Barbadilla

45

Tema 6: Estructura 45

Dr. Antonio Barbadilla

46

Tema 6: Estructura 46

Dr. Antonio Barbadilla

47

Tema 6: Estructura 47

Polimerasa III

Polimerasa I

Dr. Antonio Barbadilla

48

Tema 6: Estructura 48

Por qu el cebador es RNA?

El cebador es ms proclive al error, por


lo que debera eliminarse y el RNA
puede detectarse y eliminarse
fcilmente por la DNApol I

Dr. Antonio Barbadilla

49

Tema 6: Estructura 49

Replicacin del DNA (3)


El replisoma: complejo enzimtico de la
replicacin que coordina la sntesis de las
dos cadenas, maquinaria molecular
Dmero de la DNA pol III (ncleos
catalticos)
Primosoma: formado por dos enzimas
Primasa
Helicasa (desenrolla el DNA)
Protena de unin a cadena sencilla, ssb
(Unin Y, estabiliza el DNA de cadena
sencilla)
Topoisomerasas tipo I (rotura una cadena)
y II (rotura de dos cadenas) junto a DNA
ligasa -> Relajacin del superenrollamiento

Dr. Antonio Barbadilla

50

Tema 6: Estructura 50

El replisoma: una maquinaria de replicacin extraordinaria

Dr. Antonio Barbadilla

51

Tema 6: Estructura 51

El replisoma: una maquinaria de replicacin extraordinaria

Dr. Antonio Barbadilla

52

Tema 6: Estructura 52

El replisoma: una maquinaria de replicacin extraordinaria


DNA pol III + abrazadera beta -> Enzima procesiva

Dr. Antonio Barbadilla

53

Tema 6: Estructura 53

El replisoma: una maquinaria de replicacin extraordinaria

Dr. Antonio Barbadilla

54

Tema 6: Estructura 54

Topoisomerasas

Dr. Antonio Barbadilla

55

Tema 6: Estructura 55

Replicacin del DNA (4)


Origen de replicacin:
Secuencia reconocida (Ori C en E. coli) por
protenas iniciadoras. Varios orgenes en
eucariotas
La replicacin es bidireccional

Horquilla
replicacin

Dr. Antonio Barbadilla

56

Tema 6: Estructura 56

En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orgenes de


replicacin (~500 en levaduras y 60000 en mamferos). Cada
unidad de replicacin es un replicn. La replicacin es
bidireccional

Dr. Antonio Barbadilla

57

Tema 6: Estructura 57

En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orgenes de


replicacin (~500 en levaduras y 60000 en mamferos). Cada
unidad de replicacin es un replicn. La replicacin es
bidireccional

Dr. Antonio Barbadilla

58

Tema 6: Estructura 58

Links de inters
Watson-Crick original paper (1953 Nature)
Trabajos estelares del descubrimiento de la doble
hlice
DNA: el secreto de la vida (Animacin)
Celebracin 50 aniversario descubrimiento de la dobl
e hlice en la UAB
DNA Structure
The Search for DNA - The Birth of Molecular
Biology
Image Library of Biological Macromolecules - DNA
DNA berkeley
DNA Learning Center
Beginner's guide to Molecular Biology
Glosario de Gentica molecular
DNA Replication
Animacin de la replicacin
Dr. Antonio Barbadilla

59

Tema 6: Estructura 59

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