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SOLUCIONES TIPO SOLITON EN

UN MODELO PARA LA
DESNATURALIZACION DEL ADN

Fernando Ongay Larios


Facultad de Ciencias
Universidad Autnoma del Estado de
Mxico

Marzo 2011

Estructura de la pltica
Primera parte
Desnaturalizacin del ADN
Solitones
Segunda parte: Anlisis de un modelo

Desnaturalizacin del
ADN

James D. Watson y Francis H. C.


Crick

Molcula del ADN


El ADN es un polmero, compuesto de

unidades denominadas nucletidos.


Un nucletido est hecho de un grupo fosfato
+ un azcar + una base nitrogenada.
El ADN est formado de dos cadenas o hebras
dextrgiras enrolladas alrededor de un eje
formando una hlice doble de 20A de
dimetro ("la doble hlice").

Las bases nitrogenadas (Adenina (A), Timina (T),

Guanina (G) y Citosina (C)) se encuentran apiladas


en el interior de la doble hlice, en planos
perpendiculares a su eje. La parte exterior se
compone de los grupos fosfato y azcares.
Las bases de una de las cadenas estn unidas
mediante puentes de hidrgeno con las bases
nitrogenadas de la otra cadena o hebra, uniendo
ambas cadenas.
A se une a T con dos puentes de hidrgeno.
G se une a C con tres puentes de hidrgeno.

Desnaturalizacin
La desnaturalizacin del ADN es una
separacin de la doble hlice, que ocurre
porque los enlaces o puentes de hidrgeno se
rompen.
Las cadenas del cido nucleico vuelven a
unirse (renaturalizarse) una vez que las
condiciones "normales" se restauran.

Transcripcin
del ADN
La burbuja de
transcripcin es
una apertura de
ADN
desnaturalizado
de 18 pares de
bases,
donde
empieza
a
sintetizarse
el
ARN.

Replicacin del ADN


Es el mecanismo que permite al ADN
duplicarse (es decir, sintetizar una copia
idntica). De esta manera de una molcula
de ADN nica, se obtienen dos o ms
"clones" de la primera.

Solitones

Un poco de historia

En el ao de 1834, el ingeniero escocs John Scott-Russell


report el primer solitn (great waves of translation).

Russell observ que se levant una ola en la proa de una


barcaza en un canal y ``fue deslizndose a gran velocidad
hacia delante, formando una nica ondulacin de gran
altura; una montaa de agua, redondeada y bien
diferenciable, que continu su recorrido por el canal, sin
variar aparentemente su forma o reducir la velocidad'.

Ecuacin de Korteweg-de Vries (KdV)


En 1895 Diederick Johannes Korteweg y su estudiante Gustav de
Vries presentaron la ecuacin en derivadas parciales no lineal
que captura la esencia de este fenmeno

El segundo trmino es de dispersin (lineal) y el tercero es


nolineal.

Zabusky y Kruskal
En 1965 Norman Zabusky, de los Bell Lab, y Martin Kruskal, de

Princeton, trabajaron numricamente una discretizacin de la ecuacin


de KdV. Descubrieron la existencia de un tipo de ondas localizadas
muy especiales, que exhiban un comportamiento tipo partcula. Es
decir, cuando dos de estas ondas interactan, salen de la colisin con
su identidad intacta, y solamente con un pequeo cambio de fase. Las
llamaron ondas solitrnicas, pero como este trmino ya se usaba en
patentes industriales, tomaron el nombre de solitones. Este trmino
fue elegido para estar en concordancia con el nombre de las partculas
elementales, tales como electrn, protn, fotn, etc.
Como un comportamiento tipo partcula era inusual en ondas no
lineales, y sus colegas buscaron entender a estos solitones. Como
resultado de sus esfuerzos, dos aos ms tarde encontraron un
mtodo para resolver la ecuacin KdV, que explicaba la dinmica del
solitn.

Zakharov y Shabat
En 1971, dos investigadores de la Academia

de Ciencias de la URSS, Vladimir Euguenievich


Zakharov ( Sajarov) y Aleksei Borisovich
Shabat, descubrieron que otra ecuacin
interesante tambin tiene soluciones de tipo
solitn: la que hoy conocemos como ecuacin
no lineal de Schrdinger (nls).

Solitones pticos.
En 1973, Akira Hasegawa y Frederick Tappert (dos

investigadores de los Laboratorios Bell),


encontraron que tericamente era posible
transmitir pulsos luminosos de cortsima duracin
sin ninguna dispersin a travs de fibras pticas
con ciertas caractersticas, y que la propagacin de
tales pulsos estaba gobernada por la ecuacin nls.
El descubrimiento de Hasegawa y Tappert
constituy el lazo de unin entre las matemticas
de los solitones con la tecnologa de las fibras
pticas.

Solitones everywhere
Se han podido estudiar solitones en sistemas

tan diferentes como las atmsferas de los


planetas, cristales, plasmas, fibras de vidrio,
redes nerviosas y aparatos electrnicos.

Concepto de Solitn
Solitn es una onda solitaria en forma de un

pulso, que es capaz de trasladarse sin cambio


de forma y sin prdidas de energa, y adems
es capaz de conservar su estructura despus de
un choque con su semejante, es decir, con
comportamiento tipo partcula.
As, un solitn es una onda solitaria que
preserva asintticamente su forma y velocidad
en interacciones no lineales con otras ondas
solitarias o con otras perturbaciones
localizadas.