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Acidos Nucleicos (bioqumica y

biofsica)

IBt/UNAM

Nomenclatura.
Reactividad del
esqueleto.
Desnaturalizacin.
Dao y reparacin.
Enzimologa bsica de
Acidos Nucleicos.
Secuenciacin y sntesis
de Acidos Nucleicos.

IBt/UNAM

Acidos Nuclicos
(estructuras)
Papel moderno de DNA y
RNA.
Fuerzas que intervienen.
Flexibilidad y
polimorfismo del DNA.
Topologa.
Acidos Nuclicos y
Genomas.

IBt/UNAM

Acidos Nucleicos
Bioqumica y Biofsica

Acidos Nucleicos (bioqumica y


biofsica)
IBt/UNAM

Nomenclatura.
Notacin. Tipos
de bases. RNA vs.
DNA

Acidos Nucleicos (Seccin

Acidos Nucleicos (bioqumica y


biofsica)
IBt/UNAM

Tautomera
Bases Raras

Acidos Nucleicos (Seccin

Acidos Nucleicos (bioqumica y


biofsica)
IBt/UNAM

Reactividad del
esqueleto.
H+, OH- (RNA vs. DNA).
Fragilidad mecnica y
sus implicaciones.

Acidos Nucleicos (Seccin

Acidos Nucleicos (bioqumica y


biofsica)
IBt/UNAM

Reactividad del
esqueleto.
Despurinacin.
Metilacin.
Desaminacin.
Implicaciones de
sustitucin en
anillo en la
reactividad del
esqueleto.

Acidos Nucleicos (Seccin

Acidos Nucleicos (bioqumica y


biofsica)
IBt/UNAM

Desnaturalizacin. Tm (Composicin de bases, efecto de


sal).

Acidos Nucleicos (Seccin

Acidos Nucleicos (bioqumica y


biofsica)
IBt/UNAM

Desnaturalizacin. UV. Hipercromicidad

Acidos Nucleicos (Seccin

Acidos Nucleicos (bioqumica y


biofsica)
Hibridacin. Fenmeno notable.
Utilizacin.

IBt/UNAM

PNA

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Hibridacin multiple en chips

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Secuenciacin y sntesis de
Acidos Nucleicos.
Sntesis: Problema bsico resuelto (fase
slida, grupos protectores,
automatizacin. Dinmica de la sntesis
comercial). DNA vs. RNA.
Secuenciacin: Mtodos originales.
Mtodo actual. Mtodos futuros.

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Sntesis Qumica de DNA

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Secuenciacin
Enzimtica
Estado del arte:
electroforesis capilar

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Desarrollos futuros

Degradacin enzimtica (procesiva) de moleculas


individuales. Depende de la deteccin de una sola
molcula
Deteccin electroqumica (canales en membranas)
del paso de una sola molcula.

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Dao y reparacin.
Enzimologa importante. Motor
de la evolucin.

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Enzimologa bsica de Acidos Nucleicos.


Nucleasas (inespecficas, restriccin,
dependientes de estructura o estado). Nick. Gap.
Fosfatasas, cinasas.
Ligasas
Metilasas.

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Papel moderno de DNA y RNA. (Papel


primitivo. Por qu la pregunta?)
Estructura clsica del DNA. (Cmo
sabemos que es as? Watson y Crick fu un
modelo satisfactorio.)
Medidas.
Complementaria.
Antiparalela.
Implicaciones de la estructura propuesta.

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Libertad Conformacional

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Estructura de Acidos
Nuclicos: Fuerzas que
intervienen.

(Sern las mismas que en protenas?).


Hidrofobicidad y apilamiento (stacking).
Puentes de hidrgeno
(complementaridad estrica y
direccin). Implicaciones que perfilan
estructuras alternativas.
Fuerzas electrostticas. Realmente
desestabilizan. (Pensar consecuencias)
Acidos Nucleicos (Seccin

Stacking
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin

Apareamiento de Bases
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Flexibilidad y
polimorfismo del DNA.
DNA A.
DNA Z.
DNA H.
Bending y kinking.
Polimorfismo e interaccin protenaDNA. (Contenido informacional de los
surcos).
Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

DNA B

DNA A

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

DNA B

DNA A

Acidos Nucleicos (Seccin

DNA Z
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Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Telmeros

Acidos Nucleicos (Seccin

Interaccin Protena-DNA
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin

Topologa.
IBt/UNAM

Loops. Cruciformes.

Lineal vs. circular (crculos efectivos).


Superenrrollamiento.

Acidos Nucleicos (Seccin

Superenrrollamiento
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin

Superenrrollamiento
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin

Superenrrollamiento
IBt/UNAM

Al disminuir L, se facilitan
los procesos de replicacin
y transcripcin.

Acidos Nucleicos (Seccin

Superenrrollamiento
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Estructura de RNAs (tRNA y


rRNA)

RNA de transferencia
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin

RNA ribosomal
IBt/UNAM

Acidos Nucleicos (Seccin

IBt/UNAM

Acidos Nuclicos y
Diversidad de Genomas
tipos y tamaos.
Avance sostenido de la ciencia genmica

Acidos Nucleicos (Seccin