ADN

ESTRUCTURA Y PROPIEDADES

DOCENTE:
Dra. Martha Vergara Espinoza
ALUMNA:
Olivos Serrepe Paola Y.

Estructura del DNA

Molculas
de
gran
tamao
habitualmente
compuestas
de
dos
cadenas o hebras de
polinucletidos
enrolladas entre s para
formar una doble hlice
de 2.0 nm de dimetro.
Cada cadena contiene los
desoxirribonuclesidos
de purina y pirimidina
unidos mediante puentes
fosfodister.

Segmento de una cadena de un polinucletido que muestra dos nuclesidos,

desoxiguanosina y timidina, conectados por un enlace fosfodister entre los
carbonos 3 y 5 de azcares desoxirribosa adyacentes.

Dos azcares desoxirribosa

adyacentes se conectan mediante
una molcula de cido fosfrico unida
por enlaces ster al grupo 3
hidroxilo de un azcar y al 5
hidroxlo del otro .
Existe una separacin entre cada par
de bases de 0.34 nm .

La purina adenina (siempre se aparea

con la pirimidina timina (T) mediante
dos enlaces hidrgeno .La purina
guanina (G) se aparea con la citosina
(C) por tres enlaces de hidrgeno.

Modelo tridimensional de la
estructura del DNA

Hay 10 pares de bases

por cada vuelta de la
espiral helicoidal .
Cada vuelta de la hlice
tiene una longitud de 3.4
nm
La hlice es dextrgira
Los
dos
ejes
son
antiparalelos
Un
extremo
de
cada
cadena tiene un grupo 5hidroxilo expuesto , en el
que suele haber fosfatos
ligados , mientras que el
otro extremo tiene un
grupo 3 hidroxilo libre.

Organizacin del DNA en las

clulas
El DNA est organizado en forma
de un crculo cerrado en casi todos
los procariotas.
El DNA parece mucho ms
organizado en la cromatina
eucaritica y se asocia a diversas
protenas, entre las cuales las ms
destacadas son las histonas.
Histonas que son protenas
bsicas, de pequeo tamao, ricas
en los aminocidos lisina
,arginina ,o ambos

 H1,H2A,H2B,H3 Y
H4.Ocho molculas
de histona (dos
H2A,H2B , H3 Y
H4 ) forman un
elipsoide de unos
11 nm de longitud
y de 6.5 a 7 nm de
dimetro .

Complejo de histonas y DNA se le

denomina nucleosoma

Aspectos Generales

NIVELES ESTRUCTURALES

ESTRUCTURA PRIMARIA: Unin de numerosos

nucletidos mediante enlaces fosfodister .
ESTRUCTURA SECUNDARIA Para el DNA este
nivel estructural viene definido por la asociacin
de dos cadenas polinucletidicas a travs de las
bases
nitrogenadas
que
sobresalen
del
esqueleto azcar fosfato.
ESTRUCTURAS TERCIARIA : Se engloban bajo
este
trmino
genrico
todas
aquellas
estructuras tridimensionales que surgen a partir
de los niveles primario y secundario .

ESTRUCTURA PRIMARIA

Presencia de cadenas generalmente largas, formadas por la

unin de nuclesidos mediante enlaces covalentes 3-5fosfodister. Por tanto, la unidad monomrica es el
nucletido, o nuclesido monofosfato .

Dentro de este nivel estructural tiene distintas formas de

representacin

FORMAS DE REPRESENTACIN LINEAL

FRMULA
COMPLETA
Enlaces fosfodister entre
nuclesidos consecutivos
(uniones azcar fosfato)
y
la
situacin
perpendicular al esqueleto
de
los
enlaces
Nglicosdicos
(uniones
azcar
base).
Para
mantener la orientacin 5> 3, se sita el extremo 5
en la parte superior y
extremo 3 OH en la
inferior.

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL B-DNA

Anlisis por difraccin de

rayos x

Proporcin de bases
nitrogenadas: Reglas de Chargaff

Relacin entre bases

En prcticamente todas las
especies, el contenido de A se
aproxima al de T, y el contenido de
G al de C :

Relacion entre purinas y

pirimidinas

Relacin entre aminobases y

oxobases
(A + C) / (T+G) =1

6 aminopurinas (A) + 4 aminopirimidinas (C) = 6 oxopurinas (G) + 4

oxopirimidinas (T)

Caractersticas del Modelo de Watson y Crick: Forma

B del DNA

Complementariedad
La estructura qumica de las
bases permite la formacin de
enlaces
por
puente
de
hidrgeno
(dos
tomos
electronegativos, como N y O,
comparten
un
tomo
de
hidrgeno). En concreto, dos
nucletidos
pueden
interaccionar
de
forma
especfica
mediante
dichos
enlaces y se habla de bases
complementarias , pares de
bases o apareamiento de
bases
Esto quiere decir que siempre

Antiparalelismo de las dos hebras

Si una avanza de 5
a 3. Se dice que
las hebras tienen
polaridad opuesta
o que son
antiparalelas.
El concepto de
antiparalelismo
va ,pues ,
estrechamente
ligado al de

Diferencias en la secuencia de ambas hebras

Helicidad y carcter dextrgiro

Pares de bases sucesivos van

girando unos con respecto a
otros ( concretamente ,34.6
en el B DNA ) .Como
consecuencia
de
la
acumulacin de estos giros ,
las hebras de DNA adoptan
una disposicin helicoidal
( es decir ,cada hebra
describe una hlice ) y la
cadena de doble hebra es
una doble hlice
Geomtricamente, una hlice
sea sencilla o doble, puede
ser de dos tipos

Parmetros cuantitativos de la doble hlice:

Carcter anfiptico y estabilidad de la doble hlice

Situacin de los fosfatos y carcter

hidroflico

Coplanariedad, apilamiento de las bases y carcter hidrofbico.

Las
bases
purnicas
y
pirimidinicas
de
ambas
cadenas
se
encuentran
dirigidas hacia el interior de la
doble hlice ,superpuestas ,
formando
un
apilamiento
similar a un montn de
monedas

Superficie de la molcula: Surcos en el DNA

El entrelazado de las
dos
hebras
antiparalelas produce
una estructura que
tiene
dos
surcos
helicoidales distintos
entre
las
cadenas
azcar fosfato .Surco
mayor y menor esto
resulta
de
la
geometra de los pares
de bases .

Significado biolgico: idoneidad para la replicacin

La replicacin procede de una

manera lgica ,con dos procesos : (a)
la separacin de las dos hebras y (b)
la sntesis ,a partir de ellas como
molde ,de otras dos cadenas
complementarias .

Variaciones en la estructura del DNA

Distintas de la forma B de Watson y Crick

como son:
Aqullas que, manteniendo la estructura
helicoidal de doble hebra, presentan una
conformacin diferente: formas A y Z.
Las variaciones conformacionales de
carcter local en torno a la estructura B.

Forma A del DNA, en comparacin con la forma B

La
reduccin
de
la
humedad relativa por
debajo del 75 % (por
ejemplo, en disoluciones
muy concentradas, es
decir
deshidratadas)
hace que el B-DNA tienda
a transformarse como
ejemplo de la flexibilidad
de la molcula ,a otra
conformacin
,denominada A-DNA .

 La superficie de la molcula es
tambin diferente , el surco
mayor es ms estrecho que en
la forma B y muy profundo ,
mientras que el surco menor
casi no se aprecia por ser
ancho y poco profundo .
Mientras que la forma B puede
acomodar en su surco menor
una columna de molculas de
agua , el surco superficial de la
forma A no ofrece espacio
suficiente
,esta
diferencia
explica, al menos en parte ,
por qu la deshidratacin
favorece la forma A.

Forma Z del DNA, en comparacin con las formas B y A

Giro a izquierdas o levgiro.
Hlice Z es la ms estrecha
( 1.84 nm de dimetro )
La ms larga ,mayor distancia
entre bases : 0.38 nm .
Tiene mayor nmero de pares
de bases por vuelta (12), lo
cual supone una mayor
rotacin por base (30 ) y un
mayor paso o longitud de una
vuelta de hlice (4.56 nm ) .
Bases puricas y pirimidicas
alternantes con frecuencia en
el mismo lado.

 La disposicin en zig zag del

esqueleto de la forma Z del
DNA se aprecia de forma
ptima en este modelo de
varillas, donde los grupos
fosfato se han unido con una
lnea verde hipottica .Se
muestra
,
a
efectos
comparativos ,cmo el BDNA
no
presenta
esta
ordenacin , sino que su
esqueleto
describe
una
hlice contnua .Obsrvese
que el Z-DNA es el nico con
hlice en sentido levgiro

Variantes locales de la estructura secundaria del B-DNA

Un palndromo es una palabra
o frase o verso que suena
igual leyndola del derecho o
del revs ; por ejemplo
RADAR.
Este termino se aplica a
regiones
del
DNA
con
repeticiones
invertidas
de
secuencia de bases .
Son autocomplementarias.
Forman
Horquillas
o
cruciformes
Repeticin especular.No forma
horquilla
ni
estructura
cruciforme

Tienen un significado especial por varias razones:

A) Ser lugares diana de las enzimas de

restriccin (herramientas experimentales
para escindir cidos nucleicos en la
tecnologa del DNA recombinante).
b) Actuar como centros reguladores de la
expresin gnica
c) Dar lugar a la estructuras secundarias
peculiares en DNA y RNA ,etc

 Cuando
est
implicada
uncamente una de
las hebras del DNA
(o del ARN) se
denomina
estructura
en
horquilla.
Cuando
estn
implicadas las dos
hebras
de
un
dplex de DNA , la
estructura
se
denomina

Repeticiones de Secuencia
Se emplea cuando en un
DNA hay repeticin de
una secuencia ( unidad
de repeticin ) , leda
siempre en el mismo
sentido
.No
son
palndromos porque no
se cumple el criterio de
igualdad de secuencias
ledas en sentido opuesto
, ni hay centro de
simetra por lo que no se
habla de mitades .

H-DNA : TRIPLE HLICE

Formada por 3
hebras : una triple
hlice
Se forman en
regiones ricas en
pirimidinas
secuencia (CT)n en
una hebra y ricas en
purinas secuencia
(AG)n en la hebra
complementaria

PROPIEDADES FISICOQUMICAS DE LOS CIDOS NUCLEICOS

PROPIEDADES EN DISOLUCIN
Las cadenas polinucleotdicas de DNA y RNA son
hidrofilicas debido a la posibilidad de formacin de
enlaces hidrgeno con el agua por parte de los
numerosos grupos fosfato y OH libres del azcar a lo
largo del esqueleto .
Por otro lado ,a pH fisiolgico los grupos fosfato (pKa
prximo a 6) se ionizan casi por completo , haciendo
que las molculas de DNA Y RNA se comporten como
cidos y tengan numerosas cargas negativas .Debido a
este carcter polianinico , los cidos nucleicos se
encuentran casi siempre neutralizados por interaccin
inica con las cargas positivas de otras molculas .

REACTIVIDAD
En general , los cidos nucleicos son
quimicamente muy estables
,especialmente en el caso del DNA
.Ello se debe a que la desoxirribosa
carece de grupos reactivos , el 4
OH est comprometido en el cierre
del anillo y los 3 OH y 5 OH
estn formando enlaces fosfodister .

HIDRLISIS QUMICA DE LOS CIDOS NUCLEICOS.

Los cidos fuertes escinden tanto los enlaces

fosfodister entre nuclesidos como los enlaces
N-glicosdicos de cada nucletido . sirven para
analizar la composicin de bases de un cido
nucleico , pero no para determinar su secuencia.

 Los cidos dbiles respetan los enlaces

fosfodister , pero tienden a romper la unin Nglicosdica ms lbil con purinas que con
pirimidinas , por lo que se puede conseguir (por
ejemplo , a pH =3) escindir selectivamente las
bases purnicas ,dando lugar a los denominados
cidos apurinicos.
De cierto inters para estudiar parcialmente la
secuencia de DNA .

HIDRLISIS ALCALINA
El medio bsico afecta de distinta
manera a los enlaces fosfodister ,
hidrolizando los del RNA pero no los
del DNA, los enlaces N-glicsidicos
son resistentes .

El DNA , al contrario que el RNA , es resistente a la hidrlisis en medio

alcalino .Ello se debe a la ausencia de grupos 2-OH en las unidades de
desoxirribosa

ABSORCIN EN EL ULTRAVIOLETA
La similitud en el valor mximo de
absorbancia de las distintas bases puede
utilizarse no slo para detectar y
cuantificar las bases , los nuclesidos y los
nucletidos ,sino especialemnte para
determinar la concentracin de los cidos
nucleicos
(260 nm para cidos nucleicos y 280 nm
para protenas ) ambos absorben en cierta
medida a las dos longitudes de onda .

Referencias Bibliogrficas
Luque ,J. y A.Herrez.(2008).Biologa molecular
e ingeniera gentica.Conceptos,Tecnicas y
Aplicaciones en ciencias de la
salud.Ed.Elseiver.Madrid.469 99.
Lehninger.D.L.Nelson y M.M.Cox.
(2006).Principios de Bioqumica .4
edicin.Ediciones Omega.279-287.
Prescott,L,J.Harley,D.Klein.
(2004).Microbiologa.5 edicin.Ed.Mc Graw
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