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BIOQUIMCA

ES UNA DISCIPLINA DISTINTA EN

EL ENFASIS QUE LE DA A LAS ESTRUCTURAS DE


LAS BIOMOLCULAS Y LAS REACCIONES QUE
STAS LLEVAN A CABO, EN LAS ENZIMAS Y EN
LA NATURALEZA DE LA CATLISIS

BIOLGICA,

EN LA ELUCIDACIN DE LAS VAS METABLICAS


Y SU CONTROL Y EN LOS PRINCIPIOS QUE LOS
PROCESOS DE LA VIDA PUEDAN ENTENDERSE A
TRAVS DE LAS LEYES DE LA QUMICA.

DIVERSIDAD BIOLGICA
An
cuando
la
diversidad
de
los
microorganismos es asombrosa, presentan una
similaridad sorprendente en su bioqumica.
Ejemplos:
La informacin hereditaria est codificada y se
expresa casi de forma idntica en todas las formas
celulares.
Las
series
de
reacciones
bioqumicas
(vas
metablicas) de los procesos bsicos, as como la
estructura de las enzimas que las catalizan son casi
idnticas.
Ello sugiere que las formas conocidas de vida
descienden de un solo ancestro, en el cual se

(b) rgano: Piel

Ejemplo de
la
organizaci
n jerrquica
de las
estructuras
biolgicas

(a) Organismo: Ser Humano


1m

(c) Tejido: Epidermis


(d) Clula: Clula basal

(g) Macromolcula: Citocromo C


(e) Organelo: Mitocondria
(f) Ensamble supramolecular:
membrana mitocondrial interna

Lpido

Protena

BIOMOLCULAS, ESTRUCTURAS SUPRAMOLECULARES


Y ORGANELOS CELULARES
Los estudios anatmicos y citolgicos han mostrado que los organismos
multicelulares son organizaciones de rganos, los cuales estn hechos
de tejidos que consisten de clulas en donde existe una jerarqua
estructural en la organizacin molecular de stas. Las clulas contienen
organelos subcelulares tales como el ncleo, mitocondria, lisosomas,
cloroplastos,

etc.

Estos

organelos

consisten

de

ensamblajes

supramoleculares tales como membranas, ribosomas o fibras, los


cuales son grupos organizados de macromolculas. Estas estn unidas
entre s por un nmero grande de enlaces no covalentes relativamente
muy

dbiles.

Las

macromolculas

consisten

monomricas unidas por enlaces covalentes.

de

subunidades

BIOELEMENTOS
1. Elementos mayoritarios
- Estn presentes en porcentajes superiores al 0,1 % y
aparecen en todos los seres vivos.
a. Bioelementos primarios (C, H, O, N /// P, S)
- Principales constituyentes de las biomolculas. En
conjunto 95% de la materia viva (C 20 %, H 9.5%, O 62 %
y N 2,5 %).
b. Bioelementos secundarios (Na, K, Ca, Mg, Cl)
- En conjunto 4,5% de la materia viva.
2. Oligoelementos (Fe, Mn, I, F, Co, Si, Cr, Zn, Li, Mo)
- Presentes en porcentajes inferiores al 0,1%, no son los
mismos en todos los seres vivos. Son indispensables para el
desarrollo armnico del organismo.

SOLUCIONES ACUOSAS
LAS ESTRUCTURAS DE LAS PROTENAS, CIDOS NUCLEICOS,
MEMBRANAS LIPDICAS Y CARBOHIDRATOS COMPLEJOS RESULTAN
DIRECTAMENTE DE SUS INTERACCIONES CON SU MEDIO AMBIENTE
ACUOSO.
A. ESTRUCTURA E INTERACCIONES

-Radio de Van der Waals del O = 1.4

(0.14 nm)
-Radio de Van der Waals del H = 1.2
(0.12 nm)

Puente de Hidrgeno
0.177 nm
Enlace covalente
0.0965 nm

-Fuerzas de atraccin no covalentes


en donde el radio de electrones de
uno de los tomos atrae al otro
(distancia de aproximacin ms
cercana).
Forma un dipolo permanente
Constante dielctrica = (3.34
X 10-30 Cm)
Coulombiosmetro

El agua como solvente:

Tiende a formar enlaces de hidrgeno


Tiene carcter dipolar.

Molculas capaces de formar puentes de hidrgeno


hacen a estas molculas hidroflicas.
Ejemplos:
Aceptor de
hidrgeno
Donador de hidrgeno

EL AGUA ES UN SOLVENTE EXCELENTE PARA


LOS COMPUESTOS INICOS.
NaCl + H2O

CUBIERTAS DE HIDRATACIN:
La formacin de las cubiertas de hidratacin es energticamente
favorable.
La constante dielctrica del agua disminuye
Disminuyen las fuerzas carga+- carga- ya que el Na+ y Cl- evitan que
estas cargas se unan.

MOLECLAS ANFIPTICAS:
MUESTRAN PROPIEDADES HIDROFBICAS E
HIDROFLICAS.
EJEMPLOS: CIDOS GRASOS.
Cabeza polar
hidroflica

Cabeza polar
hidroflica

En soluciones aguosas pueden formar lo cualquiera de


las siguientes:

Monocapa
en la
superficie

Micela

Vescula
s de
bicapa
lpdica

IONIZACIN DEL AGUA, CIDOS Y BASES DBILES


Salto de protn

H 2O

H+ + OH-

2H2O

H3O+ + OH-

La ionizacin del agua se


puede medir por su
conductividad elctrica.
Un protn del ion hidronio
salta y se une a una
molcula de agua vecina
y as sucesivamente; de
esta manera se explica la
alta movilidad de H+
comparado con Na+ o K+.

pH DEL AGUA
CIDO: SUBSTANCIA CAPZ DE DONAR PROTONES
BASE: SUBSTANCIA CAPZ DE ACEPTAR PROTONES
HOH

H+ + OH-

Kd =

[H+] [OH-]
[HOH]

Kd =

(10-7) (10-7)
55.6

Kw =

[H+] [OH-] = (10-7) (10-7) = 1 X 10-14

pKw = pH+ + pOH- = 14


1
pH = -log [H+] = Hlog
+

1
pOH = -log [OH-] = logOH

CLASIFICACIN DE LOS CARBOHIDRATOS


MONOSACRIDOS: Azcares simples que no
pueden ser hidrolizados a unidades ms pequeas
bajo condiciones suaves.
OLIGOSACRIDOS: Azcares compuestos que
producen 2 a 6 molculas de azcares simples con
hidrlisis.
POLISACRIDOS: Grupo de compuestos que
producen un gran nmero de monosacridos con
hidrlisis.

CARBOHIDRATOS: Estructura y Funcin Biolgica


Carbohidratos Sacridos (del latn, dulce); (CH2O)n Muchos azcares
no siguen esa regla; por ejemplo, deoxiribosa, sacarosa,
aminoazcares, etc.
Los carbohidratos se pueden definir como polihidroxialdehdos o
polihidroxicetonas o como substancias que producen algunos de estos
compuestos con hidrlisis.

MONOSACRIDOS
Los monosacridos son slidos cristalinos, incoloros, muy solubles en
agua, pero insolubles en solventes no polares; la mayora presenta
sabor dulce.
FRMULA EMPRICA: Cx(H2O) y donde x 3.
El esqueleto de los monosacridos es una cadena de carbn de enlace
sencilla, no ramificada; un tomo de carbono contiene un doble enlace
con el oxgeno para formar el grupo carbonilo -C=O; cada uno de los
otros carbones tiene grupo hidroxilo -C-OH.
Si el grupo carbonilo est al final de la cadena: el monosacrido es un
polihidroxialdehdo y se llama aldosa.
Si el grupo carbonilo est en otra posicin, el monosacrido es una
polihidroxicetona y se llama cetosa.

MONOSACRIDO
Tres tomos de carbono (es el ms sencillo) se les dice triosas:

gliceraldehdo (aldosa)
(aldotriosa)
4
5
6
7

tomos
tomos
tomos
tomos

de
de
de
de

carbonos:
carbonos:
carbonos:
carbonos:

dihidroxiacetona (cetosa)
(cetotriosa)
tetrosas (aldotetrosas y cetotetrosas)
pentosas (aldopentosas y cetopentosas)
hexosas (aldohexosas y cetohexosas)
heptosas (aldoheptosas y cetoheptosas)

Ejemplos de monosacridos

D-ribosa
(RNA)

2-deoxiribosa
(DNA)

D-glucosa
aldohexosa

D-fructosa
cetohexosa

ISOMERISMO
Estereoisomerismo: Ocurre en un compuesto orgnico en
el cual un tomo de carbono es sustituido por cuatro
tomos o grupos diferentes. Los grupos estn colocados
sobre el tomo de carbono de tal manera que una forma
es imagen en el espejo de la otra.

D-gliceraldehdo

L-gliceraldehdo

Aquellos compuestos que son una imagen en el espejo se


les conoce como enantimeros.
Las propiedades fisicoqumicas de los dos miembros del
par de enantimeros son idnticas. Tienen el mismo:
punto de ebullicin
punto de fusin
solubilidad en solventes
Diferencia: Uno de los miembros del par de enantimeros
desviar un plano de luz polarizada en direccin de las
manecillas del reloj dextrorotatorio o (+), Su ismero
de imagen al espejo o enantimero desviar el plano de
luz polarizada en sentido opuesto a las manecillas del
reloj levorotatorio (-).

DIASTEROISMEROS

DIASTERMEROS
(misma frmula
emprica), no son enantimeros uno del otro y por lo tanto,
tienen diferentes solubilidades, diferentes rotaciones especficas
y en general diferentes propiedades fisicoqumicas.
EPMEROS son aqullos en donde slo difieren en uno de los
tomos de carbono asimtrico en la configuracin de los
azcares.
H

CO

CO

CO

HO
HO
H
H

C H

C OH

C OH

CH2 OH

D-Manosa
Galactosa

C OH

HO C H

H C OH

H C OH

CH2 OH
H

D-Glucosa

C OH

HO C H

HO C H

H C OH

CH2 OH
H

D-

FORMAS CCLICAS
Generalmente se han considerado a los azcares como
simples aldehdos o cetonas con estructuras de cadenas
abiertas.
Muchos azcares llevan acabo la sntesis de Killiani
(cianihidrinas) con dificultad, aunque para el caso de los
aldehdos, esta reaccin es muy rpida.
La glucosa y otras aldosas fallan en la prueba de Schiff
para aldehdos.
La glucosa slida es inerte al O2, mientras que los
aldehdos son rpidamente autoxidables.

Esto se debe a la ciclacin de las molculas de glucosa, debido a los


ngulos de los tomos de carbn tetradrico. Esto es, los extremos de
la cadena de 6 tomos de carbono de la glucosa tienden a
aproximarse uno de otros.
El anillo se forma debido a que los aldehdos son capaces de formar
hemiacetales con los alcoholes.

Proyecciones de Fischer

Proyecciones
de Haworth
Mutorotacin

MUTAROTACIN
La capacidad que tienen los azcares para que sus
diferentes configuraciones cclicas y abiertas estn en
equilibrio, esto es, anmero , y abierta.

MUTOROTACIN
-D-Ribofuranosa
-D-Ribopiranosa
La capacidad que tienen los azcares para que sus diferentes
configuraciones cclicas y abiertas estn en equilibrio, esto es,
anmero , y abierta.
D-Ribosa

-D-Ribofuranosa

-D-Ribopiranosa

Anmeros de la Glucosa

-D-Glucosa

-D-Glucosa

MONOSACRIDOS DERIVADOS
GLICSIDOS
Son sustancias no reductoras que por hidrlisis cida o
enzimtica dan uno o ms azcares y un componente no
azucarado llamado aglicona o genina. Desempean
funciones muy importantes en los seres vivos y una gran
cantidad de los glicsidos que producen las plantas se
emplean como medicamentos.
La accin farmacolgica est asociada a la genina
El papel del azcar es ayudar a la solubilidad

Los azcares cidos son aquellos monosacridos


en los cuales alguno o varios de sus radicales
hidroxilo (-OH) han sido oxidados para dar lugar a un
grupo carboxilo.

cidos Urnicos

cido D-Glucurnico
GlcUAc

cido D-Galacurnicocido D-Manurnico


GalUAc
ManUAc

Amino azcares

-D-Galactosamina
2-amino-2-deoxi -D-galactopiranosa
GalN

-D-cido N-acetil-murmico
2-aminoacetil-2-deoxi 3-lactic-3-deoxi -D-glucopiranosa
NAM

Azcares fosfato y nuclesidos

-D-Glucosa 6-fosfato D-Gliceraldehdo 3-fosfato


Glc6P
Gly3P

Adenosina

Identificacin de azucares

OLIGOSACRIDOS
De los oligosacridos (2 a 6 azcares
simples),
los
disacridos
son
los
carbohidratos ms abundantes en la
naturaleza.
En el enlace glicosdico, el carbono
anomrico est unido a cualquier otro
grupo hidroxilo de la siguiente molcula
del monosacrido.

Los disacridos pueden diferir en:


1) Monosacridos que los forman
2) El tipo de enlace ( o )
3) Los carbonos involucrados en el
enlace

CH2OH
H
OH

H
OH
H

OH

OH

HOH2C

-D-Glucosa

CONDENSACIN

CH2OH

OH
OH

OH

-D-Fructosa

HIDRLISIS

CH2OH
HHO

H
OH

H
OH
H

CH2OH

H
OH

-D-Glucosa

O HOH2C

OH

OH

-D-Fructosa

SACAROSA
Este disacrido est ampliamente distribuido en la naturaleza
en los jugos, semillas, frutas, flores y races de las plantas.
La miel de abeja contiene sacarosa y sus productos hidrolizados.
Principales fuentes comerciales de este disacrido son la caa
de azcar y el betabel.
Es un disacrido no reductor formado por D-glucosa y Dfructosa, no da reaccin con reactivos de Tollens, Benedict o
Fehling.

-D-fructofuranosil- -D-glucopiransido
Fru(21 )Glc

-(1,2)--enlace glucosdico

LACTOSA
Es un disacrido reductor presente en la leche de la
mayora de los mamferos que al hidrolizarse produce
D-glucosa y D-galactosa,

4-O-(-D-galactopiranosil)--D-glucopiranosa
Gal(14)Glc

-(1,4)-enlace glucosdico

TREALOSA
Dos molculas de glucosa unidas por el
carbono 1 por tanto es un disacrido NO
REDUCTOR
Se encuentra en insectos,
plantas.
Funcin: reserva y transporte.

-D-Glc (1 1)-D-Glc

hongos

DISACRIDOS POR HIDRLISIS


MALTOSA, dos molculas de Glc unidas por enlace
1-4, disacrido REDUCTOR, producto de la
hidrlisis de la Amilosa.
ISOMALTOSA, dos molculas de Glc unidas por
enlace 1-6, disacrido REDUCTOR, producto de
la hidrlisis de la Amilopectina.
CELOBIOSA, dos molculas de Glc unidas por
enlace 1-4, disacrido REDUCTOR, producto de
la hidrlisis de la Celulosa.

MALTOSA
Es un disacrido reductor proveniente de la hidrlisis
del almidn y est formado por 2 molculas de glucosa

4-O-(-D-glucopiranosil)- -D-glucopiranosa
Glc(14)Glc
-(1,4)-enlace glucosdico

ISOMALTOSA
Es un disacrido reductor proveniente de la hidrlisis
del almidn y est formado por 2 molculas de glucosa

6-O-(-D-glucopiranosil)- -D-glucopiranosa
Glc(16)Glc

CELOBIOSA
Es un disacrido producido por la hidrlisis de la
celulosa y est formado por 2 molculas de glucosa

4-O-(-D-glucopiranosil)- -D-glucopiranosa
Glc(1 4)Glc

QUITOBIOSA
Es un disacrido producido por la hidrlisis de la
quitina y est formado por 2 molculas de N-Acetilglucosamina

HO

4-O-(-D-N-Acetilglucosaminopiranosil)-D-N-Acetilglucosaminopiranosa
NAcGlc(1 4)NAcGlc

RAFINOSA
Una molcula de galactosa unida por su carbono
anomrico a una molcula de sacarosa, por tanto es
un trisacrido NO REDUCTOR.
Se produce exclusivamente en plantas.

POLISACRIDOS
Tambin conocidos como glicanas son productos
de multicondensacin de los monosacridos o de
sus derivados, unidos entre s por medio de
enlaces glicosdicos.
La D-glucosa es el monosacrido ms abundante
en los polisacridos presentes en la naturaleza.

Clasificacin de polisacridos segn su composicin de azcares:


HOMOPOLISCARIDOS: Aquellos polisacridos cuya unidad
monomrica sea de un slo tipo de monosacrido.
HETEROPOLISACRIDOS: Aquellos polisacridos que estn
compuestos por 2 o ms monosacridos diferentes como
unidades monomricas.
Homopolisacridos

No Ramificado Ramificado

Heteropolisacridos

No Ramificado

Ramificado

ESTRUCTURA DE POLISACRIDOS
PRIMARIA: Secuencia de los monosacridos
constituyentes, es importante establecer el
enlace y configuracin anomrica de todos los
residuos, as como el enlace de cualquier
substituyente.
SECUNDARIA: Relacin
residuos de la molcula.

espacial

de

dos

TERCIARIA: La regularidad en la estructura


primaria
y
secundaria
lleva
a
una
configuracin estrica regular.
CUATERNARIA: Interacciones entre cadenas
por medio de uniones no covalentes.

ESTRUCTURA PRIMARIA

ESTRUCTURA SECUNDARIA

ESTRUCTURA TERCIARIA

ESTRUCTURA CUATERNARIA

Clasificacin de polisacridos segn su funcin:

RESERVA:
Almidn (plantas y algunas bacterias)
Glucgeno (animales y hongos)
ESTRUCTURALES:
Celulosa (pared celular de plantas)
Quitina (pared celular de insectos y de
algunos hongos)
Peptidoglicanas (paredes celulares de
bacterias)
Agarosa (paredes celulares de algas)
Glicosoaminoglicanas (matriz extracelular)

ALMIDN
El almidn ocurre como grnulos microscpicos en las races,
tubrculos y semillas de las plantas.
Cuando los grnulos de almidn se resuspende en agua y se
calientan, stos se hinchan y producen una suspensin coloidal
de la cual se han obtenido dos componentes: amilosa (10 - 20
%) y amilopectina (80- 90 %).
Grnulos de almidn

La amilosa consiste de un polmero lineal de


ms de 1000 unidades de D-glucosa unidas entre si
por enlaces -glicosdicos entre el C-1 de una
unidad con el C-4 de la unidad siguiente. Unidad de
disacrido: maltosa.

La amilopectina tienen una estructura semejante a la


amilosa (enlaces 1:4), con la excepcin que presenta
ramificaciones. La ramificacin se lleva a cabo entre el C-6
de una unidad de glucosa y el C-1 de la otra unidad, y esta
ramificacin ocurre cada 20 a 25 residuos de glucosa. Peso
molecular aproximado de 1 - 6 millones de daltones.

GLUCGENO
El glucgeno presenta una estructura muy
semejante a la amilopectina, esto es enlaces 1:4 y
ramificaciones 1:6, sin embargo, las cadenas del
glucgeno estn altamente ramificadas. Esto es, se
presenta una ramificacin cada 8-12 residuos. Peso
molecular alrededor de 100 millones de daltones.

Grnulos de glucgeno

GLUCGENO

AMILOPECTINA
- Amilasa

De 20 a 25
residuos

- Amilasa

- Amilasa
- Amilasa
- Amilasa

Punto de ramificacin
Ramificacin
Extremo no reductor
Extremo reductor

De 8 a 12
residuos

Glucgeno o amilopectina

Ramificacin
Ramificacin (16)

Extremo
no reductor

Cadena principal

Extremo
reductor

CELULOSA
(pared celular de plantas)
La celulosa est compuesta de unidades lineales
de D-glucopiransido unidas por enlaces 1:4.

Cadenas
de celulosa
Microbrillas Paredes Celulares
Clulas

Microbrillas de
celulosa en la pared
celular de la planta

El enlace
-glicosdico y la configuracin de las
molculas de glucosa permite que diferentes cadenas de
celulosa se unan entre s por medio de puentes de
hidrgeno formando fibrillas del polisacrido lo que
favorece que la pared celular de las plantas sea muy
rgida.
Glc(1 4)Glc

QUITINA
La quitina est compuesta de unidades lineales de D-N-Acetilglucopiransido unidas por enlaces , 1:4. Al igual con lo que sucede
en la celulosa el enlace -glicosdico y la configuracin de las
molculas de N-Acetil-glucosamina permite que diferentes cadenas
de quitina se unan entre s por medio de puentes de hidrgeno
formando fibrillas del polisacrido lo que favorece que el
exoesqueleto de los insectos y la pared celular de los hongos que la
contienen sea muy rgida.

POLISACRIDOS DE PARED CELULAR DE BACTERIAS


PEPTIDOGLICANAS

Las paredes celulares de las bacterias son rgidas, porosas y


proveen proteccin fsica a la clula. La pared celular de las
bacterias Gram positivas y negativas contienen un polisacrido
denominado peptidoglicana.

Glicosaminoglicanos
Glicosaminoglicanas (mucopolisacridos). Polisacridos largos
no ramificados, compuestos de unidades repetitivas de
disacrido cargados negativamente en los cuales uno de estos
es N-Acetilgalactosamina o N-Acetilglucosamina, unidos a Dglucoronico o L-iduronico y generalmente unidos a un grupo
sulfato.
Funcin: Formacin de matriz para mantener junto los
compuestos proteicos de la piel y tejidos conectivo. Proveen
viscosidad, adhesin y fuerza de tensin a la matriz
extracelular.

El cido hialurnico es un mucopolisacrido cido formado


por la repeticin de un disacrido formado por el cido
glucurnico y la N- acetil glucosamina, unidos entre s por
enlaces glucosdicos (1-- 3) y los disacridos mediante enlaces
(1-- 4). Se hidrata fcilmente y de l dependen los cambios en
la viscosidad y la permeabilidad de la sustancia fundamental del
tejido conectivo. La enzima que hidroliza los enlaces es la
hialuronidasa reduciendo la viscosidad y con ello aumenta la
permeabilidad del tejido.

La heparina es un mucopolisacrido acdico sulfatado,


resultado de la repeticin del disacrido formado por del cido
glucurnico sulfatado (cido idurnico) unido a una glucosamida
6-sulfato mediante enlace glucosdico a(1-- 4). Los disacridos
tambin se unen entre s por enlace glucosdico a(1-- 4).

El condroitn sulfato A, es la unidad disacrida repetitiva del


cido glucurnico con la N-acetil galactosamina 4 sulfato
mediante enlace a(1-- 3). Los disacridos se unen con enlace
glucosdico a(1-- 4) y forman a su vez la condromucina
componente de la sustancia fundamental del cartlago.

GLICOCONJUGADOS:
GLICOPROTENAS
PROTEOGLICANOS
GLICOLPIDOS

Glicoprotenas: Son protenas, algunas de cuyas Ser/Thr o


Asn llevan unido covalentemente oligosacridos complejos,
de gran variedad estructural, que sirven a menudo como sitios
de reconocimiento entre protenas.

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