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Cycle du Carbone

Carbone et quelques applications


biotechnologiques

Carbone et quelques
applications biotechnologiques

I : Le cycle du Carbone

II : Synthse dexopolysaccharides
microbiens

III : La mthanognse

I Le cycle du carbone : forme


simplifie

Processus arobie

Formes minrales

CO

Processus anarobie

CO2

HETEROTROPHES
Respiration, dcarboxylation,
fermentation
De trs nombreux micro-organismes

AUTOTROPHES
Organismes photosynthtiques,
algues vertes, cyanobactries

(CH2O)n
Formes organiques

I Le cycle du carbone :
CO2

Chimioautotrophes
mthanognes
phototrophes

CH4

H2 O
RESPIRATION

FERMENTATION

mthylotrophes

O2
Biomasse
microbienne

Animaux

NUTRITION

mthylotrophes

FERMENTATION

Excrtion
Mort / dgradation

NUTRITION
Htrotrophes
(Saprophytes)

NUTRITION

Algues,
Bactries,
plantes

CH4

mthanognes

Mort / dgradation

Rserve de
C organique
C organique

Production de la matire
organique

Fixation autotrophe

Cycle de Calvin / rubisco (phase obscure de la


photosynthse)
Cycle de loxaloactate (inverse du cycle de
Krebs)

Assimilation htrotrophe

Dgradation de la matire
organique : les polymres

Deux fonctions : nergie, structure


Dcomposition des polymres : variable
selon leurs structures

Amidon : facile, tout type de microorganisme


Cellulose, lignine : trs abondant mais peu de
microorganismes peuvent les dgrader

Arobiose : Trichoderma (moisissure), Cytophaga


(bactrie)
Anarobiose : Clostridium thermocellum (compostage)

Dgradation de la matire
organique : les monomres

Glucides :

Acides amins :

Glycolyse , Entner Doudoroff, HMP


Arobiose : dcarboxylation oxydative
Anarobiose : fermentations : divers produits
Transamination
Dsamination, dcarboxylation

Lipides

oxydation,
glycolyse (glycrol en arobiose)

II Les exopolysaccharides
microbiens

Homo ou htro polymres


Sous forme de capsule ou en gel (slime)
autour de la cellule
Rles :

Protection / dessiccation, systme immunitaire


(pathogne), virus, produits chimique
Facilite lattachement aux surfaces
Rserve de carbone et dnergie

Exemples dexopolysaccharides
microbiens
Alginate

Htropolymre linaire d'acide


L-guluronic et D-mannuronic
contenant quelques groupement
O-acetyl

Pseudomonas
Azotobacter vinlandii

Stabilisant IAA
texturant dans industrie papetire et
textile

Cellulose

Homopolymre : 1-4 glucane

Acetobacter xylinum

Peau artificielle temporaire :


traitement des brls et chirurgies
membrane acoustique
ingrdient alimentaire

Chitine

Homopolymre : N acetyl
glucosamine et ces drivs
dactyls (chitosane)

Paroi des champignons

Actuellement carapace des


crustacs
+ rapide d'extraire partir des
champignons
agent chlatant : conservateur et
clarifiant

Curdlane

Homopolymre : 1-3 glucane

Alcaligenes
Agrobacterium

Utiliser au japon comme agent


glifiant dans de nombreuses
prparations alimentaires (non
homologu en EU et US)

Leuconostoc
mesenterodes

Supplment plasmatique

Dextrane

Cas de la production de
xanthane

Xanthomonas campestris

Petit bacille Gram , arobie, mobile


Parasite de nombreuses plantes (riz,
choux, citron)
Producteur de xanthane (gomme)

Xanthane

Gel stable hautes tempratures


20.000 tonnes /an
Agent glifiant et stabilisant : (E415)
sauce salade, crme glace, pte
dentifrice, cosmtiques, peintures leau
Lubrifiant de forage

Schma de la production de
xanthane
Ralisation de l'inoculum (prculture)
Ensemencement 5% (v/v)
Fermentation

Milieu :riche
Fed Batch
STR 50 200 m3
dveloppement
de la
Facteur
limitant : N (D : 0.025
0.05 h-1)
biomasse
Aration
: 1 vvm
Source de C : amidon, dextrines,
mlasse, lactosrum, sirop de mas,

Source dN : casine, farine de


poisson, sels dammonium, peptones, corn
steep, ure,

Pasteurisation du mot
Ajout de solvants
Prcipitation de la gomme

Temprature : 28 30C
pH : 7
Dure : 3 jours

Recyclage du solvant

Centrifugation ou filtration
Purification de la gomme

Schage sur filtre rotatif ou vaporisation

dveloppement des
Mtabolite
proprits
des xanthanes
partiellement associ
25 50 g/L

Conditionnement

III La mthanognse et la
transformation des dchets

Biomasse valorisable

Plantes aquatiques & terrestres


Dchets animaux : fumier, lisier, fiente
Dchets humains : boues des stations, ordures
mnagres, matires de vidanges,
Dchets industriels

Techniques de valorisation

Conversion chimique ou enzymatique


Bioproduction
Fermentation

Arobie : compostage, formation de POU


Anarobie : mthanique, thanolique, ctobutyrique

Les tapes de la
fermentation anrobie
Macromolcules
Hydrolyse enzymatique

Clostridium
Bacillus

B acidognes
Hydrolyse et
acidogense

Monomres
B acidognes
Acides organiques,
alcools...

Actogense

B actognes
CO2 + H2

Actate
B Mthanognes
actoclastes
CH4 + CO2

B homoactognes

B mthanognes
hydrognophiles
CH4

Mthanogense

Bactries arobies
facultatives ou
anarobies

Bactries actognes

Homo-actognes :

Clostridium, Acetobacterium
Production uniquement dactate partir de de
CO2 ou de substrat carbon

Bactries syntrophes

Pression partielle en H2 trs basses

Vie en association avec bactries mthanognes


hydrophiles & bactries sulfatorductrices

Bactries sulfatorductrices

Exemples de ractions de
conversion dans les
cosystmes
Ractions anarobies
nergie libre G (kJ)
Bactries hydrolytiques

lactate+H2>propionate+H20

-79,9

glucose+4H20>2actate-+2HC03-+4H++4H2

-206,3

Bactries actognes productrices d'hydrogne

propionate-+3H20>actate-+HC03-+H++3H2

+76,1

butyrate-+2H20>2actate-+H++2H2

+48,1

thanol+H20>actate-+H++2H2

+9,6

Bactries mthanognes

HC03-+4H2+H+>CH4+3H20

-135,6

actate-+H20>CH4+HC03-

-31,0

Fermentation mthanique

Bactries autotrophes

Bactries htrotrophes

Homoactogne
Mthanognes hydrognophiles (tractus intestinal
des ruminants)
Mthanognes actoclastes (70% de la
production de biogaz)

Voies productrices dnergie chimique

quivalence nergtique
1,7 L d'alcool brler

1,15 L d'essence

0,94 m3 de gaz naturel

9,7 kW/h dlectricit

1 m3 de
mthane
8 570 kcal

2,1 kg bois

1 L de mazout

1,3 kg de charbon

1 kg de glucose = 814L de gaz : CH4 & CO2 (v/v)