cido nucleicos

Transcripcin y expresin gnica

Biologa NS-Diploma BI

Idea Fundamental: La informacin

almacenada en forma de cdigo en el
ADN se copia en el ARNm.
 Expresin de la informacin gentica
Como ya se ha visto, la informacin gentica se conserva y pasa de una
clula a su descendencia.
Los genes de ADN tienen escasa accin directa sobre el funcionamiento
del organismo, son las protenas las molculas responsables de la
actividad biolgica y las que confieren a cada organismo sus
peculiaridades.

Por tanto, debe existir algn

mecanismo que haga
posible que
los genes
expresen su informacin
para que se formen la
protenas.
El flujo de la informacin
gentica fluye del ADN al
ARNm (transcripcin) y
desde ste a las protenas
(traduccin).
 Proceso de transcripcin
Concepto: Proceso que consiste en la sntesis de ARNm copiado de las
secuencias de bases del ADN por la ARN polimerasa. Una definicin
algo ms amplia sera la sntesis de una cadena de cualquier tipo de
ARN que tiene la secuencia complementaria de una cadena de ADN
que acta como molde.
Cadena sentido

Cadena antisentido
(molde)

En este proceso se forma una cadena

de ARN cuya secuencia de bases
nitrogenadas es la misma que la de una
de las hebras de la doble hlice de ADN
(cambiando la T por U), denominada
cadena sentido (codificante) y que no La enzima que cataliza el
se transcribe. La otra cadena de ADN se proceso de
denomina cadena antisentido (molde) transcripcin se
denomina ARN polimerasa.
y es la que se transcribe.
 ARN POLIMERASA
La ARN polimerasa presenta las siguientes
caractersticas:
- Se fija a regiones especficas del ADN (promotores) que ni se
transcriben ni se traducen, pero que indican el punto de comienzo de la
trancripcin.
- Ella misma abre y desenrrolla la doble hlice sin necesidad de la
intervencin de enzimas helicasas.
- A diferencia de la ADN polimerasa, no necesita un cebador o primer
para inicar la transcripcin.
- Utiliza como sustratos ribonucletidos trifosfato de A, G, C y U.
- Une ribonucletidos monofosfato
mediante enlace fosfodiester,
siempre en sentido 5-3 (el
extremo 5 del ribonucletido libre
se une al extremo 3 de la molcula
de ARN en crecimiento).
- Utiliza una de las cadenas de
ADN, la antisentido, como molde.
 Transcripcin en procariotas
Existe una nica ARN polimerasa que
fabrica los tres tipos de ARN (mensajero,
ribosmico y transferente).
Est formada por dos subunidades alfa,
una beta y una beta.

Para reconocer la secuencia

promotora, donde se fija y
comienza la transcripcin, se une
al factor sigma, que le provoca
un cambio de conformacin capaz
de reconocer estas secuencias
promotoras.
El promotor se encuentra en la
cadena sentido e indica dnde
debe comenzar la transcripcin y
qu hebra acta como molde.
Transcripcin en procariotas
La transcripcin finaliza cuando la ARN polimerasa
llega a una zona del ADN (seal de terminacin)
donde se une al factor rho.
El ARNm producido se utiliza directamente para la
sntesis de protenas. De hecho, la traduccin
comienza antes de que la transcripcin.
acab

Los y ARNt sufren un proceso de maduracin

ARNrpara ser funcionales.
 Esquema general de la transcripcin

(no se necesitan helicasas)

Al igual que la replicacin, la transcripcin

se da en el sentido 5 - 3.
 Transcripcin en eucariotas
Es ms complejo el proceso e
intervienen diversos factores
Adems, existen tres
proteicos.
ARN polimerasas, cada una
formada por varias subunidades:
- ARN polimerasa I: Se encuentra
en el nucleolo y transcribe los genes
que originan 3 de los 4 ARNr.
- ARN polimerasa II: Se encuentra
en el nucleoplasma y transcribe los
genes que originan los ARNm.
- ARN polimerasa III: Se encuentra
http://www.csun.edu
en el nucleoplasma y transcribe los
genes que originan los ARNt y el
Video1
cuarto de los ARNr.
Las secuencias promotoras, ricas en A y T
(cajas TATA), indican el lugar de comienzo de la
transcripcin en la cadena sentido, y al igual
que en procariotas, se necesitan una serie de
factores basales de la transcripcin.
 APLICACIN: El promotor es ADN no codificante
No todas las secuencias de nucletidos en el ADN codifican o llevan
informacin para la sntesis de polipptidos, solo las denominadas
secuencias codificantes.
En el genoma se encuentran algunas regiones del ADN no codifican
para la sntesis de protenas (secuencias no codificantes) pero
tienen otras funciones importantes, como las que producirn los
ARNt y ARNr.

Caractersticas Genoma humano

Tamao del genoma 3000 106 pb
Nmero de genes 25 000
Secuencia de copia nica < 50%
Parte del genoma que codifica a protenas 2%

Algunas secuencias no codificantes juegan un importante papel en la

regulacin de la expresin gnica, como los potenciadores y los
silenciadores.
APLICACIN: El promotor es ADN no codificante
El promotor es un ejemplo de ADN no codificante con una funcin.
El promotor es una secuencia
localizada cerca del extremo 5 de
un gen, siendo la regin a la que
se une la ARN polimerasa para la
sntesis de ARN.

El promotor es una secuencia de
ADN que no se transcribe pero
que juega un importante papel en
la transcripcin, dado que posee
secuencias a la que se unen
factores de transcripcin que
ayudan a la ARN polimerasa a
colocarse en el sitio de iniciacin
de la transcripcin.

IMAGEN: es.slideshare.net/jessyaneth
 Secuencias de ADN no codificante
En el genoma, especialmente de los eucariotas, son comunes las
secuencias repetitivas.

Existen dos tipos de secuencias repetitivas: secuencias moderadamente

repetitivas y altamente repetitivas (ADN satlite), que en conjunto,
ambos tipos de secuencias constituyen ms del del genoma
50%
humano.
Estas
secuenci
as
repetitiv
as son
abundan
tes
ADN en polimerasa II no puede
los
sustituir el cebador de ARN en
telmer
el extremo del telmero por
os
ADN, en de que se
(extrem lugar
peridan genes casa
os de los en
pierden IMAGEN: www.rundiary.co.kr
replicacin,
cromoso se estas
secuencias repetititivas.
mas),
 APLICACIN: Anlisis de ADN
En las regiones cromosmicas
intergnicas, especialmente cerca
de los centrmeros, existen
repeticiones polimrficas
siempre en parejas, es decir, una
en cada cromosoma homlogo.

En el locus de un polimorfismo, se
localiza un nmero diferente de
repeticiones en tandem de
una
misma secuencia de nucletidos.
Estas repeticiones pueden ser regiones
variables de 9-80 nucletidos repetidas en
tndem (VNTRs) o bien pequeas
repeticiones en tndem de 2-8 nucletidos
(SNTs).
patrn de VNTRs y
Cada persona hereda el
SNTRs de sus padres, en un cromosoma
materno y otro paterno.
 APLICACIN: Anlisis de ADN
En el anlisis de ADN (DNA profile) se usan
repeticiones en tandem, es decir, se hace uso de estas
variaciones o polimorfismos consistentes en secuencias
repetidas de ADN.
La probabilidad de que 2 personas que no son genticamente idnticas
tengan la misma huella de ADN es extremadamente improbable.
muchos
Los marcadores
alelos diferentes
polimrficos
con cientos
usados
o miles
en elde anlisis
genotipos.
de ADN tienen
Los genetistas deducen el linaje
paterno mediante el anlisis de

del cromosoma
pequeas Y, en
repeticiones mientras
tndem que
deducen el materno a partir del
anlisis de variaciones en
nucletidos individuales que se
encuentran en localizaciones
especficas el ADN
en
mitoconcrial, denominadas
regiones hipervariables.
 APLICACIN: Anlisis de ADN
El siguiente ejemplo muestra dos locus (A y B) en dos
locus consisten de individuos.
una VNTR Ambos
con la secuencia repetida en tndem GC
(locus A) y AGCT (locus B).

Si se trata el ADN de
ambos individuos con
enzimas de restriccin
que cortan el ADN en
las regiones sealadas
con una flecha, y
posteriormente
se
realiza una
electroforesis en gel
de agarosa, se pueden
separar los distintos
fragmentos en funcin
de su tamao. Web2

El patrn de bandeo obtenido para los VNTR es especfico y caracterstico

de cada individuo, lo que permite su distincin.
 Secuencias altamente repetitiva y TdC
Las secuencias altamente repetitivas fueron una vez categorizadas como
ADN basura, ya que exista una considerable presuncin de que no
tenan ninguna funcin. En qu grado afectan las etiquetas y categoras
usadas en la bsqueda del conocimiento a esos mismos conocimientos que
obtenemos?

IMAGEN: thebiobangtheory.wordpress.com

IMAGEN: sociedad.elpais.com
 Regulacin de la expresin gnica
Mientras que algunas protenas siempre son necesarias para la
supervivencia de un organismo, y por tanto deben sintetizarse
continuamente, otras solo se necesitan en ciertos momentos y en ciertas
cantidades, por lo que su expresin debe estar regulada.

Las fluctuacin de los factores externos regula la expresin gnica en

procariotas, siendo el ejemplo mejor conocido el opern de la
lactosa.
Los genes responsables
de la absorcin y
metabolizacin de la
lactosa en E. se
coli
expresan cuando
l
lactosa est presente
a
en el medio IMAGEN: luisbiolomol.blogspot.com.es
extracelular, pero no en
su ausencia.
En presencia de lactosa (inductor), se desactiva una protena represora,
pero una vez la lactosa ha sido
degradada, dicha protena vuelve a
reprimir la expresin de los genes del metabolismo de la lactosa.
 Regulacin de la expresin gnica
La expresin de los genes eucariotas, al igual que en los procariotas,
tambin se regula en respuesta a variaciones en las condiciones
ambientales. Sin embargo, la regulacin de la expresin gnica en
eucariotas juega un papel crucial en la diferenciacin celular y el
proceso de desarrollo, donde se expresan unos genes pero no otros.
La expresin gnica es regulada
por protenas que se unen a
secuencias de bases especficas
del ADN.

Un enhancer o potenciador es una

corta secuencia de ADN que puede
unirse con protenas (factores de
transcripcin) para incrementar la
expresin de un gen o grupo de
genes, mientras que un silenciador
es una secuencia de ADN que puede
unirse con protenas para disminuir
la tasa de transcripcin de un gen.
IMAGEN: escuelasecundaria3villagesellbiologia.blogspot.com.es
 Regulacin de la expresin gnica
Los enhancers y los silenciadores no tienen por qu estar localizados
cerca de la regin promotora de los genes sobre los que actan, ni
siquiera en el mismo cromosoma.

Sin embargo, un tercer tipo

de secuencias de ADN
denominadas elementos
prximos al promotor, se
encuentran cerca de la
regin promotora y se unen IMAGEN: www.csun.edu

con protenas que son

necesarias para el inicio de
la transcripcin.

Video3
Impacto del medioambiente en la expresin gnica
En los ltimos aos se ha generado un gran debate acerca de si el
fenotipo o comportamiento humano debera atribuirse al ambiente o a la
herencia. Algunos estudios, se han basado en el estudio de gemelos
que
han crecido separados.
La influencia del ambiente sobre la
expresin de algunos caracteres es
inequvoca, pudindose afirmar que el
medio ambiente de una clula y de
un organismo influyen sobre la
expresin gnica.
Un ejemplo de ello lo constituye la
produccin de pigmentacin en la
piel
tras la exposicin al sol en los humanos.
El color de la piel se debe a la cantidad
presente del pigmento melanina,
producida por los melanocitos (clulas
cuya
de la produccin
piel) y est controlada por varios
genes que se heredan independientemente

(herencia polignica).
Regulacin de la expresin gnica y desarrollo embrionario
Durante el desarrollo embrionario, el
embrin posee una distribucin desigual de

patrn del sustancias

morfgenos, desarrolloquetisular, es el decir,
gobiernan
establecen dnde se formar la cabeza, el
abdomen, las extremidades, etc.
IMAGEN: www.lance-ufrj.org

IMAGEN: courses.biology.utah.edu

Su efecto se expande desde una fuente localizada, formando un

gradiente de concentracin del morfgeno a lo largo de un tejido
en desarrollo, provocando diferentes patrones de expresin gnica y por
tanto, diferentes destinos de las clulas embrionarias dependiendo de su
posicin en el embrin.
Regulacin de la expresin gnica y desarrollo embrionario
La protena Bicoid es un
morfgeno cuya distribucin
en un
embri temprano
Drosophila sigue un
de
gradiente de concentracin
n a lo
largo del eje anteroposterior.
gradiente de
Este
concentracin establece la
posicin y la orientacin del eje
anteroposterior del animal.
Mutantes del gen bicoid
carecen de este gradiente de
concentracin, afectando a la
formacin de la cabeza y otras
estructuras en la regin
anterior del animal.

IMAGEN: courses.biology.utah.edu
Regulacin de la expresin gnica y desarrollo embrionario
Las clulas madre embrionarias se
caracterizan por ser
es decir, que
pluripotenciales,
tienen la capacidad de
desarrollarse en tejido
cualquier
del organismo.
Sin embargo, a medida que las
clulas se
diferencian
(comprometen o especializan),
pierden esa capacidad.
La prdida de pluripotencia de las
clulas madre embrionarias
durante su diferenciacin en tipos
celulares concretos se acompaa
del silenciamiento y la activacin
selectivos de subconjuntos
genes, procesos
especficos de
por la
parte
IMAGEN: http://www.uco.es metilacin y en
mediados demetilacin de ADN.
 Expresin gnica en eucariotas
La regulacin de la expresin gnica tiene lugar a varios niveles. En
procariotas, la mayora de esta regulacin tiene lugar a nivel del proceso de
transcripcin (regulacin transcripcional), mientras que en los eucariotas,
tiene lugar adems una modificacin posterior del ARN (regulacin post-
transcripcional).

IMAGEN: scykness.wordpress.com

Un ejemplo de regulacin transcripcional se

encuentra en los nucleosomas, que ayudan
a regular la transcripcin en eucariotas.
Las histonas poseen unas prolongaciones o
colas que salen fuera del corazn del
nucleosoma, pueden modificarse
que IMAGEN: umb.libguides.com
qumicamente.
 Expresin gnica en eucariotas
Esta modificacin qumica de las colas de las histonas
que forman los nucleosomas, constituye un importante factor
a la hora de determinar si un gen se expresar o no.
Las histonas pueden sufrir diferentes tipos de modificacin, como son
la adicin de un grupo acetilo, grupo metilo o de un grupo fosfato.
As por ejemplo, el aminocido lisina
en las colas de las histonas, presenta
normalmente una carga positiva, que
mediante atraccin electrosttica se
une a las cargas negativas del ADN
formando una estructura
muy
condensada que inhibe
la
transcripcin.
Sin embargo, la acetilacin de la lisina
por la enzima histona acetil-
transferasa neutraliza dicha carga
positiva, permitiendo un menor grado
de condensacin, lo que conlleva unos
IMAGEN: nature.com
mayores niveles de transcripcin.
 Expresin gnica en eucariotas
Por el contrario, la adicin de grupos metilos (metilacin) en las colas por
la enzima histona metil-transferasa, provoca una mayor condensacin
de la cromatina, impidiendo que el ADN pueda ser transcrito.

Web5/6

IMAGEN: en.wikipedia.org

Por tanto, la modificacin qumica de las colas de las histonas puede

aumentando o disminuyendo la accesibilidad
activar o desactivar genes,
del gen a los factores de transcripcin.
HABILIDAD: Anlisis de cambios en el patrn de
metilacin del ADN
Otro ejemplo de regulacin transcripcional de la expresin gnica en
eucariotas lo constituye la adicin de grupos metilos al ADN.
Mientras que la
metilacin de las
IMAGEN: http://www.cmaj.ca
histonas puede
promover o inhibir la
transcripcin, la
metilacin directa
del ADN tiende a
disminuir la
expresin gnica.

La activacin del equivocado en el momento equivocado puede

gen causar estragos en la clula. Para evitarlo, los organismos dependen de
la metilacin del ADN para mantener desactivados a los genes que no
necesitan.
El nivel de metilacin del ADN vara a lo largo del tiempo de vida y se ve
afectados por diversos factores (dieta, ambiente, etc.)
 HABILIDAD: Anlisis de cambios en el patrn de
metilacin del ADN

IMAGEN: http://www.cmaj.ca

La metilacin del ADN es un IMAGEN: http://geneticamolecularunlar.wikispaces.com

proceso epigentico, por el que las

enzimas ADN-metiltransferasas
aaden grupos metilo (-CH ) al
3
carbono 5 de las citosinas de la
cadena recin sintetizada durante la
replicacin del ADN, mantenindose
as la memoria del estado metilado

en la molcula hija de ADN.

 HABILIDAD: Anlisis de cambios en el patrn de
metilacin del ADN
La siguiente imagen muestra un
mapa de regiones cromosmicas
con diferente patrn de metilacin
en gemelos de 3 y 50 aos.

El color rojo es indicativo de

hipometilacin, mientras que el
color verde de hipermetilacin.
Niveles similares de metilacin se
manifiestan por un color amarillo,
dado que presenta iguales niveles
de verde y rojo.
1) Cul es el patrn que puede
concluirse?
2) A qu puede deberse este
patrn?

IMAGEN: http://www.pnas.org/content/102/30/10604/F3.expansion.html
 NATURALEZA CIENCIAS: Bsqueda de
patrones,
tendencias y discrepancias: Epigentica
La modificacin qumica de la cromatina, ya sea mediante
ende, en el fenotipo
acetilacin, manifestado
fosforilacin por el
o metilacin deindividuo.
las colas de las histonas,
o bien mediante la metilacin del ADN,tienen unmodificaciones
Estas impacto sobrequmicas
la expresin gnica, y por se denominan factores
epigenticos, y la suma de
todos estos factores se
conoce como epigenoma.
La epigentica es el estudio
de modificaciones en la
expresin de genes no
que
obedecen a una alteracin de
la secuencia del ADN y que
son heredables, es decir, una
vez adquiridos una
en
generacin, pueden
Video4
heredarse por la siguiente.
 NATURALEZA CIENCIAS: Bsqueda de
patrones,
Los diferentes tipos celulares tienen un distinto patrn de metilacin del
ADN, tendencias
de manera que y discrepancias:
cada tejido producirEpigentica
un juego especfico de
protenas acorde a la funcin de dicha clula.
Cuando una clula se divide, las nuevas clulas que se originan heredan el
patrn de metilacin en el ADN de la clula progenitora, el cul, a su vez,
puede verse modificado por el medio ambiente.
Sin embargo, cuando un
espermatozoide fecunda a
un vulo, el cigoto formado
sufre un proceso de
desmetilacin del ADN en
todo su genoma
inmediatamente despus
de la fecundacin. Este
proceso de borrado del
epigenoma del nuevo
se denomina IMAGEN: learn.genetics.utah.edu/content/epigenetics/inheritance/
individuo
reprogramacin.
NATURALEZA CIENCIAS: de
Bsqueda
patrones, tendencias y discrepancias:
Epigentica
Sin embargo, un 1% del epigenoma no
es eliminado en los mamferos, formando
lo que se conoce como "imprinting".
Para la mayora de los genes, heredamos
dos copias funcionales (un alelo del
padre y otro de la madre), pero de los
"imprinted genes", heredamos una sola
copia funcional. Dependiendo del gen,
ser la copia del padre o de la madre la
que sea epigenticamente silenciada
mediante metilacin del ADN durante la
formacin del vulo o el espermatozoide.

http://learn.genetics.utah.edu/content/epigenetics/imprinting
 NATURALEZA CIENCIAS: Bsqueda de
patrones,
tendencias
desencadenar y discrepancias:
cambios Epigentica
hereditarios en factores epigenticos.
Cada vez hay ms evidencias de que el medio ambiente
puede

IMAGEN: en.wikipedia.org
 Modificacin post-transcripcional en eucariotas
Adems de la regulacin de la expresin gnica a nivel transcripcional
mediante la modificacin qumica de las colas de las histonas en los
nucleosomas, o la metilacin directa del ADN, las clulas eucariticas
modifican el ARNm tras la transcripcin, es decir, llevan a cabo una
modificacin post-transcripcional.

En los procariotas, el proceso de

transcripcin y de traduccin est
acoplado, al ocurrir ambos en el
citoplasma, pero en los eucariotas, el
ARN transcrito en el ncleo debe viajar
al citoplasma para su traduccin.
Esta separacin de ambos procesos
permite que el ARN sintetizado pueda
someterse a una modificacin post-
transcripcional antes de que la versin
madura abandone el ncleo.

IMAGEN: gtac.davidson.edu
 Modificacin post-transcripcional en eucariotas
Una de estas modificaciones post-transcripcionales que ocurre en los
eucariotas tiene lugar en los extremos del ARN que se sintetiza.
Al ARNm que se est transcribiendo,
se le aade en el extremo 5 un
capuchn de metil guanosina
trifosfato, que sirve para evitar la
inmediata degradacin del ARNm por
las nucleasas del ncleo, y adems es
reconocida por los ribosomas como
lugar de inicio de la traduccin.
Una vez finalizada la transcripcin, se
le aade en el extremo 3 de 100-
200 nucletidos de adenina (cola
poli-A), cuya funcin es la de
intervenir en el proceso
de
transporte del ARNm
maduracin y
fuera del ncleo.

En eucariotas es necesaria la maduracin de los tres tipos de ARN.

 Maduracin del ARNm en eucariotas
Otra de las modificaciones post-transcripcionales que ocurre
en los
eucariotas consiste en la eliminacin de los intrones del ARN sintetizado
(maduracin del ARN).
El ARN eucaritico precisa de
la eliminacin de intrones para
formar el ARNm maduro. El
sintetizado
ARNm recien
(transcrito primario) no es
funcional, al contener intrones

intercalados entre los exones.

El proceso de maduracin
(splicing) consiste en la
eliminacin de intrones por las
enzimas ribonucleoprotenas
pequeas nucleares (RNPpn)
y la unin de los exones por las
enzimas ARN ligasas.
 Maduracin del ARNm en eucariotas
No siempre se une cada exn con su exn anterior en la secuencia,
que en ocasiones, se pueden sinodar mecanismos distintos de corte y
empalme a partir de un mismo ARNm transcrito primario, lo que origina
cadenas de ARNm con secuencias distintas.
Esto significa que un mismo gen eucariota que contiene varios
exones puede dar lugar a protenas diferentes segn el orden en el
que se unan los exones durante la maduracin. Es decir, el empalme o
unin del ARNm aumenta el nmero de protenas diferentes que
puede producir un organismo.
 Maduracin del ARNm en eucariotas
Aunque se crea que un gen siempre codificaba para un mismo
polipptido, con el tiempo se han descubierto muchas excepciones,
provocando un cambio de paradigma. As, la protena tropomiosina en
los mamferos, que se encuentra codificada por un gen que contienen

funcin delsu
11 exones, tejido
ARNmenprimario
el que se produce,
sufre distinto dando
procesolugar a 5 formasendiferentes
de maduracin

(isoformas) de la protena.

Ms del 90% de los genes humanos

experimentan esta maduracin o
splicing alternativo, por el que se
producen diferentes protenas a partir
de un gen, en ocasiones llegando
incluso a centenares o
miles de
variantes. El caso ms extremo que
se conoce es el del gen Dscam de
Drosophila, a partir del que pueden
generarse ms de 38.000 variantes,
importantes para la generacin de la
identidad celular en el IMAGEN: http://pendientedemigracion.ucm.es
establecimiento de redes neuronales.
Esquema general de la transcripcin en eucariotas

Animacin3
 HABILIDAD: Deducir la secuencia de bases de
ADN a partir de la secuencia de ARNm
Dada la siguiente secuencia de ARN mensajero:

Indique la secuencia de ADN bicatenario que sirvi de molde para este ARN
mensajero, indicando cul de las cadenas es sentido y cul antisentido.
Dada la siguiente secuencia de ARN mensajeroIndique la secuencia
de ADN bicatenario que sirvi de molde para este ARN mensajero,
indicando cul de las cadenas es sentido y cul antisentido.
 Epigentica y TdC
Dos gemelos genticamente idnticos que poseen los mismos genes,
cuando son pequeos son muy parecidos, pero sin embargo, al crecer
por separado y someterse a diferentes ambientes, natural y/o cultural,
llegan a ser individuos totalmente diferentes.
Todava continua el
debate acerca de la
importancia
relativa de las
cualidades innatas
de un individuo
frente a las
cualidades
adquiridas a travs
de diferentes
experiencias.
Es importante
la ciencia
para
intentar responder
esta cuestin?
IMAGEN: es.slideshare.net/lae01/modulo-2la-inteligencia-tradicional