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BIOQUMICA AMBIENTAL

Ing.Qum.Carlos Altamirano C.
BIOQUIMICA AMBIENTAL

La Bioqumica.- Es la ciencia que estudia las propiedades orgnicas de los componentes celulares
(Biomolculas) y las reacciones qumicas (metablicas) que los transforman y organizan para mantener a los
organismos en su equilibrio fisiolgico o condicin vital.

Bioqumica Ambiental.- Estudia todos los aspectos bioqumicos metablicos en los seres vivos y la
interaccin que puedan producirse entre las sustancias xenobiticas dispersas en el medio (contaminantes
ambientales) y los organismos que en l habitan. Relacin de la bioqumica ambiental con otras ciencias:
Biologa celular y molecular, Ecologa, Gentica, Qumica y Bioqumica; Toxicologa, Bioqumica Clnica,
Patologa.

Xenobitico: Es todo compuesto qumico que no forme parte de la composicin de los organismos vivos.
Suelen ser contaminantes (concentracin en exceso) de determinados ambientes y generalmente ejercen
algn tipo de efecto sobre los seres vivos, aunque no tengan toxicidad aguda.
Unidad bioqumica y diversidad celular.

Los seres vivos presentan una serie de caractersticas comunes y una enorme diversidad de formas. Su
composicin qumica, su organizacin celular y sus funciones de nutricin, relacin y reproduccin son
caractersticas comunes a todos ellos, si bien para llevarlas a cabo disponen de gran diversidad de estructuras
que son resultado de otra caracterstica comn, su capacidad de adaptacin y por tanto de evolucin. Es decir, la
diversidad, es una caracterstica ms de la materia viva, como lo es su unidad. El estudio de los seres vivos se
puede basar en sus caractersticas (composicin, organizacin y funciones), pero tambin en considerar los
niveles de organizacin de la materia viva que se corresponden con los grados de complejidad creciente:
molecular, celular, pluricelular y de poblaciones.
Estructura y funcin del ecosistema

En la figura se concibe a la Tierra como integrada por grandes esferas de material vivo y sin vida.
La atmsfera (aire), hidrosfera (agua) y litosfera (suelo) constituyen el componente abitico o sin
vida. La biosfera contiene todo lo que tiene vida en la Tierra. Toda interseccin de la biosfera con
las esferas sin vida, seres vivos y sus demandas del medio ambiente abitico constituyen un
ecosistema.

Ejemplifican esto ecosistemas naturales (lago, pradera, bosque y desierto)


Grandes esferas terrestres de materiales vivos y sin
vida.

Componentes sin vida: La atmsfera, hidrosfera y


litosfera
Componentes vivos: La biosfera contiene todos los
seres vivos .
La ecosfera: Es la interseccin de las esferas
abiticas y del componente bitico.
Los compuestos orgnicos de los seres vivos

La gran variedad de compuestos orgnicos que contienen los seres vivos no se clasifican desde un punto
de vista qumico, sino a partir de criterios muy simples, tales como su solubilidad o no en agua, su
estructura, etc. Siguiendo estos criterios se clasifican en :

- Carbohidratos esencialmente funciones energticas y estructurales

- Lpidos, esencialmente funciones energticas y estructurales

- Protenas, funcin enzimticas y estructurales

- cidos nucleicos son los responsables de la informacin gentica biocatalizadores las enzimas, las
vitaminas y las hormonas. Distribucin de los componentes moleculares de la clula
El metabolismo celular

El trmino metabolismo se refiere al conjunto de reacciones qumicas que se producen en la clula y


tiene tres funciones especficas.

1.- Obtener energa qumica del entorno y almacenarla, para luego usarla en diferentes funciones
celulares.

2.- Convertir los nutrientes exgenos en unidades precursoras de los componentes macromoleculares de
la clula bacteriana.

3.- Formar y degradar molculas necesarias para cumplir funciones celulares especficas, por ejemplo:
movilidad y captacin de nutrientes.
El sol la mayor fuente de energa

La temperatura promedio de la Tierra se determina por un


equilibrio entre la energa proveniente del Sol y la energa
que la Tierra irradia hacia el espacio. La energa que se
irradia al espacio se emite en forma de radiacin infrarroja.
La atmosfera absorbe parte de esta radiacin infrarroja.
Los gases responsables de esta absorcin se llaman gases
de efecto invernadero; sin ellos, la Tierra no seria habitable.
El metabolismo se produce por secuencias de reacciones catalizadas enzimticamente y se divide en:
Anabolismo
Proceso por el cual la clula eucariota y/o procariota sintetiza sus propios componentes, se conoce como
anabolismo y resulta en la produccin de nuevo material celular; tambin se denomina biosntesis. La
biosntesis es un proceso que requiere energa, por lo tanto las clulas deben ser capaces de obtenerla de
su entorno para sus actividades metablicas ( crecer y eventualmente, multiplicarse ).
Catabolismo
El conjunto de reacciones degradativas de los nutrientes para obtener energa o para convertirlos en
unidades precursoras de la biosntesis.
Ejemplo de Anabolismo:

LA FOTOSNTESIS
Ejemplo de Catabolismo:

Formula qumica C6H12O6

LA GLUCLISIS

Formula qumica C3H4O3


Metabolismo bacteriano

Es el conjunto de reacciones qumicas que ocurren en la clula.


Funciones:

Obtener energa qumica del entorno

Convertir los nutrientes exgenos

Formar y degradar molculas


Metabolismo bacteriano

Los nutrientes producen energa por reacciones de oxidacin-reduccin.

La energa qumica generada se transforma en una forma


biolgicamente til (ATP); obtenido por 2 procesos diferentes:
fosforilacina nivel del substrato y fosforilacinoxidativa.

Dichos procesos incluyen la Fermentacin y la Respiracin


As, hemos visto dos tipos de transformaciones qumicas que ocurren simultneamente en la bacteria, por
lo tanto el metabolismo es el resultado colectivo de ambas reacciones. Las catablicas resultan en la
liberacin de la energa qumica contenida en los nutrientes, mientras que las anablicas la consumen.
Por lo tanto, la energa liberada como resultado de las reacciones de oxidacin reduccin del catabolismo,
debe ser almacenada y transportada de alguna manera. Una de ellas es como compuestos con uniones
fosfato de alta energa; dichos compuestos luego se usan como intermediarios en la conversin de la
energa conservada en trabajo til.
El compuesto fosfato de alta energa ms importante en los seres vivos es el trifosfato de adenosina (ATP).
ste se genera en la clula bacteriana por dos procesos diferentes:

a).- Fosforilacin a nivel del substrato

b).- Fosforilacin oxidativa.


Balance energtico

a).- Fermentacin:-Aceptor final de e-compuesto orgnico-1 glucosa/2 ATP

b).- Respiracin: -Aceptor final de e-compuesto inorgnico-1 glucosa/38


Fermentacin

Reaccin en la que algunos tomos de la fuente de energa (donador de electrones) se reducen,


mientras otros se oxidan (ox-red) y la energa se produce por fosforilacina nivel de sustrato.

La molcula dadora y aceptorade e-, son compuestos orgnicos.

Este proceso no es capaz de oxidar completamente el substrato inicial a CO2, por lo que piruvato
es convertido en cido lctico, cido propinico, etc.

Los e-generados pasan a coenzimas que contiene NAD, luego NADH cede e-a piruvato para que
se mantenga el equilibrio oxido-reduccin
Metabolismo oxidativo y fermentativo de la Saccharomyces cerevisiae
Va de la
Glucolisis
Conversin del Piruvato a Etanol
Fermentacin etanlica
de Procariota
Zymomonas mobilis
empleandoVa de
Entner - Doudoroff
Respiracin

Es el proceso por el cual un substrato es oxidado completamente a CO2 y H2O, con participacin de
una cadena de e-ubicada en la MP.

Respiracin aerbica: aceptor final exgeno (oxgeno)

Respiracin anaerbica: aceptor final exgeno (compuesto inorgnico: nitrato, fumarato, sulfato, etc.)

Piruvatoes oxidado completamente a CO2 mediante el ciclo de Krebs

Los e-del NADH del ciclo de Krebsson transferidos al oxgeno para regenerar NAD a travs de un
sistema transportador; conservando energa liberada durante ese transporte en forma de ATP por
Fosforilacin Oxidativa
Regulacin de Metabolismo

Cada reaccin metablica est regulada no slo con respecto a otras reacciones sino tambin con respecto a la
concentracin de nutrientes en el medio. La regulacin se realiza a diferentes niveles:

Regulacin de la actividad enzimtica a travs de: enzimas alostricas, inhibicin por retro alimentacin,
activacin alostrica, y cooperatividad.

Regulacin de la sntesis de enzimas por: induccin enzimtica y represin por productos finales
Requerimientos nutritivos

Podemos clasificar los nutrientes en las siguientes categoras:

1.-Macronutrientes: carbono, hidrgeno, oxgeno y nitrgeno.

2.-Micronutrientes: cobalto, cobre, manganeso, fsforo, etc.

3.-Factores de crecimiento :incapaz de sintetizarlos, ej. Vit. B, aminocidos, etc.


GRUPOS NUTRICIONALES
Requerimientos fsicos y qumicos

Oxgeno:

1.- Aerobios estrictos: requiere O2 como aceptor terminal de electrones, no proliferan en su


ausencia.

Ej. Mycobacterium bovis.

2.- Microaerofilos: O2 a niveles muy bajos (12%). No proliferan en la superficie de un medio


slido.

Ej. Haemophillussuis

3.- Anaerobios estrictos: no emplean O2 para su metabolismo, obtienen su energa de reacciones


fermentativas.

Ej. Clostridiumtetani
Requerimientos fsicos y qumicos

Anaerobios aerotolerantes : pueden crecer en presencia o ausencia O2, pero la energa la obtienen por
fermentacin.

Ej. Bacterias acidolcticas.

Anaerobios facultativos: proliferan mediante procesos oxidativos, utilizando O2 como aceptor terminal de
electrones, o en anaerobiosis, empleando reacciones de fermentacin para obtener energa.

Ej. Streptococcus, E. coli


Clasificacin en funcin del requerimiento de oxgeno
Clasificacin en funcin de la Temperatura
Clasificacin en funcin del pH ptimo
Condiciones osmticas y disponibilidad de agua

-Halfilos: altas concentraciones salinas

-Osmfilos: altas concentraciones de azcar

-Xerfilos: ambientes muy secos

La concentracin de solutos con actividad osmtica dentro de la clula bacteriana es superior a la


concentracin del exterior celular, a excepcin de Mycoplasma la mayora tiene tolerancia osmtica.
La clasificacin nutricional de un organismo

Se realiza segn tres criterios importantes: el origen del carbono, la fuente de energa y los donadores de
electrones:
Fuente de energa: Se refiere al mtodo empleado por el organismo para producir ATP, que se requiere para
aprovisionar de combustible los caminos anablicos de biosntesis de los componentes de la clula.

Un organismo es fotoauttrofo cuando utiliza luz como fuente de energa, mientras que es quimioauttrofo
cuando obtiene la energa de reacciones con compuestos qumicos.

Fuente reductora o donador de electrones:


Se refiere a los compuestos donadores de electrones que se utilizarn en la biosntesis (por ejemplo, en forma
de NADH o NADPH).
Organtrofo se denomina as a un organismo cuando utiliza compuestos orgnicos como fuente de electrones.
Littrofo cuando utiliza compuestos inorgnicos como fuente de electrones.

Fuente del carbono: Se refiere a la fuente del carbono usada por el organismo para su crecimiento y desarrollo.

Un organismo se denomina hetertrofo si usa compuestos orgnicos procedente de otros organismos y


auttrofo si su fuente del carbono es el dixido de carbono (CO2).
Los organismos organotrofos son a menudo tambin hetertrofos, y as usan compuestos orgnicos como
fuente de electrones y de carbono al mismo tiempo.
los organismos litotrofos son a menudo tambin auttrofos, con fuentes inorgnicas de electrones y dixido de
carbono como fuente inorgnica del carbono.
Microorganismos Quimilittrofos