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Flujo de la información

genética y su regulación
Jesús Jacob Cruz Orato
Regulación de la expresión génica en eucariotas
2
Regulación de la expresión génica en eucariotas
3

Regulación transcripción:
•Interacción elementos cis y factores trans
•Elementos cis: promotores, intensificadores (enhancers) y
silenciadores
Regulación de la expresión génica en
eucariotas
4 Regulación transcripción:
•Interacción elementos cis y factores trans
Factores trans: factores de transcripción con dos dominios. Unión
DNA e Inicio transcripción (algunos deben unirse antes a la RNA pol)
•Dominios unión al DNA (diferentes clases)
Motivo dedo de zinc Motivo hélice-giro-hélice
Motivo cremallera de leucina Motivo puños de cobre
Regulación de la expresión génica en eucariotas
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Regulación de la expresión génica en eucariotas
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Regulación transcripción:
Interacción elementos cis y factores trans
Factores trans: factores de transcripción con dos dominios. Unión DNA
e Inicio transcripción (algunos deben unirse antes a la RNA pol)
Hormonas esteroides
Regulación de la expresión génica en eucariotas
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Regulación transcripción:

Remodelamiento de la cromatina
por proteínas y activación génica:
código de las histonas (colas de
histonas cuyos residuos de lisina
pueden modicarse mediante la
unión de grupos acetilo y metilo)
Regulación de la expresión génica en eucariotas
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Regulación transcripción:
•Metilación del DNA en las regiones reguladoras de un gen que se
hereda (herencia epigenética)-> Impronta parental (Parental
imprinting)

Metiltransferasa

Citosina Metil-Citosina
Regulación de la expresión génica en eucariotas
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Regulación transcripción:
•Regulación postranscripcional
•Procesamiento alternativo

•RNA interference, microRNAs (miRNA)

Procesamiento alternativo
Regulación de la expresión génica en eucariotas
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Regulación transcripción:
•Regulación postranscripcional
•Procesamiento alternativo
•RNA interference, microRNAs (miRNA)

microRNAs
Etapas de la transcripción
•Iniciación:
•Secuencias promotoras (se une la RNA polimerasa)
•Procariotas: Secuencias consenso Pribnow (-10
pb) y región -35 pb
•Eucariotas: Caja TATA (-25 pb) y CAAT (-70 pb)

•Elongación:
•5’->3’
•Enrollamiento aguas arriba (5’) y desenrollamiento
aguas abajo (3’) del DNA

•Terminación:
•Dependiente del factor Rho
•Independiente de Rho
Terminación: DNA Palíndrome
estructura secundaria
Terminación:
mecanismo intrínseco ->
DNA Palíndrome,
estructura tallo-bucle

Región 3’ no traducida de ~ 40 bases (3’UTR)


Estructura del gen y el mensajero procariota
Transcripción Eucariotas

RNAs Polimerasa en Eucariotas


• 1- Existen tres tipos de RNA polimerasa

La I, la II y la III
• RNA polimerasa I, 13 subunidades. Se localiza en el
núcleo y en el nucleolo. -> Síntesis de rARN 45S.

• RNA polimerasa II, 12 subunidades. Se localiza en el


nucleoplasma. -> Síntesis de los hnRNA (transcrito
primario), los precursores de los mRNA.

• RNA polimerasa III, 17 subunidades. Se localiza en el


nucleoplasma. -> Síntesis rRNA 5S y tRNA.
Flujo de la
información en
eucariotas
Duplicar ADN
antes de
división recular

1000 x segundo
8h - 10 días

1
Cada célula
1 original y 1
hija heredan 1
recién
doble hélice
sintetizada
de DNA

6.5 millones Copiar


en ADN Célula usa DNA nucleótidos a
patrón cadena
complementaria
utilizan una variedad de
enzimas y proteínas
cinco ADN
polimerasas
α,β,γ,δ,3

Síntesis de DNA 
añaden
nucleótidos Comple
mentarios al molde.
Requiere
energía

requieren de
solo agregan Pueden corregir,
una cadena
Necesitan un molde nucleótidos al o revisar su
preexistente o
extremo 3' trabajo
un cebador
Lugares específicos  Múltiples
origen de replicación (100,000) =
replicones

Proteínas especializadas
reconocen el origen, se unen
a este sitio y abren el ADN

Horquillas de replicación
en conjunto  burbujas
de replicación
1

proteínas de unión a cadenas


permite el avance de las horquillas de
sencillas cubren las cadenas de ADN
replicación "desenrollando" el ADN
separadas cerca de la horquilla de
(rompiendo los puentes de hidrógeno
replicación, impidiéndoles volver a unirse
entre los pares de bases nitrogenadas)
en una doble hélice
hace un cebador de ARN, un corto segmento
Las¿cómo
ADN polimerasas
es que la ADN
solo polimerasa
agrega nucleótidos
añade elen de ácido nucleico complementario al molde,
el extremo
primer3'nucleótido
de cadenaenADNunaexistente,
horquilla de
utilizan - que proporciona un extremo 3' con el que la
OH libre
replicación
y añaden nueva?
un nucleótido ADN polimerasa puede trabajar (5-10
nucleótidos)
ADN
polimerasa
trabajan en
la horquilla 2 ADN siempre es
antiparalela una
cadena corre en
solo pueden dirección 5' a 3',
1 mientras que la
hacer ADN
otra corre de 3' a 5
en dirección
5' a 3'

1.- ADN polimerasa 2.- corre de 5' a 3'


las dos cadenas nuevas, que
se mueve en la alejándose de la
también son antiparalelas se
misma dirección horquilla  se
producen ligeramente
que la horquilla de producen
diferentes
replicación fragmentos
mantiene a las moléculas de ADN enzima impide que la doble hélice de
polimerasa III en su lugar al sintetizar ADN.
ADN que está por delante de la
impide que la ADN polimerasa de la cadena
rezagada se vaya flotando cuando vuelve a horquilla de replicación se enrolle
comenzar en un nuevo fragmento Okazaki. demasiado cuando se abre el ADN
ADN polimerasa 1 elimina los cebadores sella las brechas que permanecen
de ARN y los sustituye por ADN después de reemplazar los cebadores
Acumuladas 
cambios permanentes
División descontrolada

Ocurren todo el tiempo 


suelen detectarse y
repararse por
mecanismos de
corrección y reparación
del ADN
ADN polimerasa
puede revisar su
trabajo
Muchosun
primero, errores se
complejo
corrigen
proteico con lade
(grupo
revisión, pero
proteínas) algunos
reconoce
y seseune
escapan
a la base
mal apareada

Un segundo
sucede complejo
después de
corta
queelseADN
ha cerca
hechode
laADN
pareja errónea
nuevo, su y
otras enzimas
función cortany
es eliminar usan el
el nucleótido
reemplazar las bases reconocimiento de
incorrecto junto con mellas (rupturas en
mal apareadas
un segmento de ADN las cadenas
circundante sencillas) presentes
solo en el ADN
recién sintetizado
reparar daños en el
ADN al revertir la formará pareja
reacción química con timina (T)
que los causó

daño al ADN: implica


solo un grupo extra de
átomos que se unen
al ADN mediante una
reacción química
detectar y
eliminar ciertos
tipos de bases formará pareja con adenina
dañadas puede causar una mutación

grupo de
enzimas
glicosilasas tiene
un papel clave

detecta y elimina
un tipo específico
de base dañada
eliminar y reemplazar bases
dañadas

una helicasa abre el


detecta y corrige tipos de ADN para formar una
daño que distorsionan la doble burbuja
hélice del ADN

radiación UV puede causar


que la citosina y la timina
reaccionen con bases vecinas
que también sean C y T
Causado por factores
ambientales como la
radiación de alta
energía

pueden perderse
grandes segmentos de
cromosomas y los cientos
de genes que contienen

Dos vías que participan


en la reparación desordenado y l resulta en
la pérdida, o adición, de tiende a producir
unos cuantos nucleótidos una mutación,
en el sitio de corte
se utiliza la información
del cromosoma
homólogo que coincide
con la del dañado (o de
una cromátida hermana
si el ADN se ha copiado)

más limpia que la unión


de extremos no
homólogos y no suele
causar mutaciones
DEL DND AL RNA
Transcripción y traducción son mecanismos Una célula puede
con los cuales las células leen, o expresan las cambiar (o regular) la
instrucciones genéticas de sus genes. expresión de cada uno de
sus genes.
Primer paso: leer la parte que necesita  Copiar un
determinado fragmento del DNA
La RNA polimerasa debe Se requieren proteínas adicionales
reconocer en dónde llamadas “factores generales de
empezar y dónde acabar transcripción”

Empaquetamiento del DNA en nucleosomas


y en forma de cromatina de orden superior
Facilitan la colocación del RNA
polimerasa sobre el promotor

Ayuda a separar las dos hebras


de DNA

Liberan la RNA polimerasa del


promotor para que pueda
elongar el RNA al acabar la
transcripción

TF II (transcription factor for


polimerasa II)
Promotor Secuencia
terminadora
TFIIH TATA box de la cadena
DNA Helicasa
Hidroliza ATP
y desenrrolla ARN
DNA Polimerasa TFIID
Proteínas II
estabilizadoras

La RNA polimerasa permanece sobre el


TFIIH
Cuando
fosforila
la la
ARNSer5
polimerasa
en la “cola”
empieza
de la ARN
la
promotor sintetizando pequeñas cadenas de
polimerasa,
elongaciónañadiéndole
los demás fosfatos.
factores En
deese
RNA hasta que sufre cambios para separarse
momento
transcripción
la ARN sepolimerasa
separan delseADN
desprende
para
del promotor y pasar a la fase de
empezar delunpromotor.
nuevo proceso.
elongación.
Lisis de la proteína
activadora
La RNAp se desplaza por el Factores de elongación
ADN de manera evitan que la RNAp se
espasmódica, a veces disocie del DNA antes de
rápido, a veces lento. alcanzar el final del gen.

Complejos remodelantes de
cromatina que rescatan
RNAp atrapadas.
La adición de la caperuza
es la primera modificación
de los pre-mRNA eucariotas.
Se da en el extremo 5’ por
tres enzimas.

Ayuda al RNA a ser


procesado correctamente y
exportado. Además ayuda
en la traducción de los
mRNA en el citosol.
El pre-mRNA tiene que madurar,
y se hace retirando los intrones

La organización exones-intrones
facilitan la aparición de nuevas
proteínas útiles para la célula
hablando evolutivamente.

Cada transcripción de un
mismo gen puede madurar de
más de una forma, lo que
permite un juego de proteínas
diferentes.
La coordinación de la transcripción con la maduración resulta en
Hay dos momentos de maduraciones hechos por diferentes
especial importante para impedir que el proceso se salte exones
espliceosomas, eliminando diferentes partes de intrones.
de forma inadecuada.
Cuando la RNAp alcanza el final del
gen, un mecanismo asegura que el
tremo 3’ del pre-mRNA sea procesado
de forma adecuada, o sea,
añadiéndole la cola polia, añadiendo
200 nucleótidos de A al extremo 3’.

Factor F estimulador de la escisión (CstF)


y facotr de especiticidad de la escisión
y la poliadenilación (CPSF). Además de
una poli-A polimerasa.
Solo el RNA
madura
Los residuos
es útil,
serán
los
retenidos
pre-mRNAen el
procesados
núcleo y de
degradados
manera aberrantepor el
no
exosoma
solo sonnuclear
inútiles,
si no(contiene
que puedes
exonucleasas).
llegar a ser
peligrosos.
Al procesarse una molécula de RNA, pierde y gana ciertas
¿Cómo la célula distingue entre las poco frecuentes moléculas de
proteínas, marcándola de que su proceso fue exitoso. Por ejemplo,
mRNA maduro que debe conservar y la abrumadora cantidad de
la caperuza, complejos de unión al exón y proteínas de unión a poli-
desechos del procesamiento del RNA?
A marcan el proceso exitoso.
CODÓN. Un codón AUG actúa como codón de inicio tanto como
al aminoácido Metionina.

Los codones del mRNA no codifican directamente los aminoácidos


que especifican. Depende de moléculas adaptadoras que
reconocen y se unen al codón, y por otro región al aminoácido.
tARN Ribosomas
Cada ribosoma tiene un sitio de
unión para el mRNA y tres sitios
La tRNA sintetasa de unión al tRNA, los sitios A, P y E
se encarga de (aminoacil-tRNA, peptidil-tRNA y
unir los expulsión). Cuando no se ocuán
aminoácidos las subunidades están
correspondientes disociadas.
al tRNA,
teniendo en
cuenta que
coincida con el
anticodón
En cada ciclo, entran y salen
del ribosoma dos factores de
elongación, que hidrolizan GTP
a GDP. Son EF1 y EF2. Sin ellos
la síntesis se vuelve lenta,
ineficiente y poco precisa.

Codones de paro marcan el


fin de la traducción: UAA, UAG
o UGA. “Factores de
liberación” se unen al
ribosoma que tenga codón de
paro deteniendo el proceso.