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ECOLOGIA MICROBIANA

Ciencia que estudia específicamente las


interrelaciones entre los microorganismos y su
entorno biótico y abiótico.
Existen factores que pueden limitar a los
microorganismos:

AGUA

PRESION ENERGIA

NUTRIENTES TEMPERATURA
Las relaciones microbianas pueden ser:

• NEUTRALISMO: Organismos muy diferentes en sus


necesidades de crecimiento no compiten
NEUTRAS

• MUTUALISMO: Dependen metabólicamente uno del otro


• COMENSALISMO: Uno se beneficia y el otro ni se perjudica
POSITIVAS ni se beneficia.

• PARASITISMO: Daña o vive a expensas de otro organismo


• ANTAGONISMO: Cuando un organismo afecta
NEGATIVAS adversamente el medio en el que vive el otro.
MICROBIOTA DEL SUELO Y EL AGUA
Los suelos y las aguas varían en su estructura
física, composición de nutrientes, temperatura y
potencial de agua. Todos estos factores se
combinan para influir en los tipos y número de
microorganismos presentes en cada caso.
Roca expuesta a la
intemperie
• El crecimiento mas importante se da en la
rizosfera (suelo que rodea las raíces).
• Un pequeño agregado de suelo contiene
microambientes muy diferentes y diferentes
tipos de microorganismos.
• La actividad microbiana depende de la
disponibilidad del agua, que es variable y
depende de: (a) la composición del suelo, (b)
la lluvia, (c) el drenaje, (d) la cubierta vegetal.
• El agua permanece en el suelo : (a) adsorvida
sobre superficies, (b) libre formando láminas o
películas entre las partículas del suelo.
Solución del suelo: Es el agua del suelo con diversos
materiales disueltos.
En terrenos bien drenados el aire penetra con
facilidad y la concentración de O2 es alta.
En suelos encharcados, el O2 disponible es el
disuelto en el agua y es pronto consumido por los
microorganismos.
Este tipo de suelo se vuelve pronto anóxico, por lo
que experimenta profundos cambios en sus
actividades biológicas.
El número de microorganismos del suelo y su
actividad dependen del equilibrio entre los
nutrientes presentes (orgánicos e inorgánicos).
La disponibilidad de agua es lo que más influye
en la actividad microbiológica que tiene lugar en
la superficie del suelo, mientras que en el
interior del suelo la disponibilidad de nutrientes
es el factor principal.
En muestras tomadas a 300 m se han aislado una
gran variedad de microorganismos.
Tienen actividades metabólicas bajas, inferiores a
las que tienen en sus hábitat naturales.
Comparado con los microorganismos de las capas
superiores del suelo, la importancia biogeoquímica
de los microorganismos de ambientes profundos
puede ser mínima. No obstante pueden causar la
mineralización de compuestos orgánicos y liberar
productos a las aguas subterráneas.
Los organismos fotótrofos oxigénicos producen
nuevo material orgánico y O2. Cuando la actividad
quimioorganotrófica es muy elevada, la materia
orgánica lleva al agotamiento de O2 y a condiciones
anóxicas.

La actividad biológica de un ecosistema acuático


depende de la tasa de producción primaria que
llevan a cabo los organismos fototróficos.
Los recursos y las condiciones ambientales
afectan la actividad de los productores
primarios. Hay mayores tasas en los ríos y
manantiales.

En los mares abiertos hay baja concentración de


nutrientes para el fitoplancton y por lo tanto
baja productividad.
Las zonas costeras tienen alta producción
primaria y son los mejores lugares para el
crecimiento y recolección de pescados y
mariscos.
Relaciones con el oxígeno en lagos y ríos
Concentración de O2 en el aire 21%, su solubilidad en el agua es
limitada.
El intercambio entre el O2 disuelto y el O2 atmosférico en las grandes
masas de agua es lento.
La producción fotosintética significativa de O2 en mares y lagos se lleva
a cabo sólo en las capas superficiales, donde hay luz disponible.
La materia orgánica que no se consume en estos estratos superiores va
a parar al fondo, donde se descompone por la acción de MOs
facultativos, que utilizan el O2 disuelto en el agua.
En los lagos, cuando se ha consumido el O2 disuelto, las capas mas
profundas se vuelven anóxicas donde sólo pueden crecer bacterias
anaeróbicas y organismos microaerofílicos. Se produce un cambio del
metabolismo respiratorio al fermentativo y al metanogénico.
Metanogénesis 4H2 +CO2 CH4 + 2H2O
Las plantas como hábitat microbianos
• La temperatura de las plantas varía mucho tanto a
lo
largo del día como del año.
• Los sistemas de comunicación interna del vegetal
están muy poco desarrollados la
trasferencia de microorganismos dentro de la
planta es ineficiente.
• Las partes de las plantas que emergen del suelo
están sujetas a frecuentes desecaciones.
• La raíces principal zona de actividad
microbiana en los vegetales.
Interacción con las raíces de las plantas

Las raíces de las plantas son hábitat propicios para el desarrollo de


microorganismos.
Las interacciones entre los microorganismos del suelo y las raíces de
las plantas satisfacen requerimientos nutricionales básicos para las
plantas y para las comunidades microbianas asociadas a ellas.
Rizosfera: porción del suelo directamente influenciada por las raíces de las
plantas. Zona de interacción única y dinámica entre raíces de plantas y
microorganismos del suelo.
Rizoplano: superficie de la raíz que esta comprendida dentro de la rizosfera.
Rizovaina: cilindro relativamente estrecho de suelo que se adhiere a las
raíces.
Presencia de numerosos organismos en
mayor densidad que en el suelo:
bacterias, hongos (micorrícicos o no),
algas y una micro y mesofauna
(protozoos, nematodes, insectos y
ácaros).
􀂄 Estabilidad de las partículas de suelo:
acción mecánica de las raíces y acción
agregante de los exudados de los
diferentes organismos presentes
(plantas y microorganismos).
Las raíces de las plantas tienen una influencia directa en la
composición y densidad de la microbiota.
􀂄 Relación R/S: 5-20.
􀂄 Depende de cada planta y de su estado de madurez.
􀂄 Mayor proporción de microorganismos Gram (-), móviles, de
crecimiento rápido (aporte de materiales orgánicos).
Microorganismos auxótrofos.
􀂄 Mayor actividad microbiana: menores tiempo de generación y
aumento en la velocidad de transformación de nutrientes
(mineralización, desnitrificación).
􀂄 Cambios sucesivos a lo largo del desarrollo de la planta.
Efecto de los exudados de la raíz sobre las poblaciones microbianas
a) Azúcares, aminoácidos, ácidos orgánicos, lípidos, vitaminas,
proteínas (enzimas), etc. Las poblaciones bacterianas de la
rizosfera presentan requerimientos nutritivos distintos de las
poblaciones en suelo sin raíces. Fuente de energía para la fijación
de nitrógeno.
b) Atrayentes. Tienen como misión atraer y favorecer el
establecimiento de bacterias u hongos simbióticos o
favorecedores para el vegetal. La exudación de atrayentes es
especialmente intensa durante los primeros estadios de la vida del
vegetal, de forma que se colonizen sus raíces rápidamente.
Influencia directa de los microorganismos sobre las plantas
a) Reciclado y la solubilización de los nutrientes minerales. Pueden
aumentar la disponibilidad de nutrientes inorgánicos: liberando
fosfatos solubles (apatita), producción de agentes quelantes de
Fe y Mn, etc. Pueden crear déficit de los minerales:
inmovilización, desnitrificación.
b) Síntesis de vitaminas, aminoácidos, auxinas, citoquinas y
giberelinas. Compuestos químicos que estimulan el crecimiento
de las plantas y muestran antagonismo hacia patógenos
potenciales de plantas (antibióticos)
c) Síntesis de sustancias alelopáticas (antagónicas) que inhiben el
crecimiento de otras plantas.
Micorrizas
Asociación mutualista entre las raíces de la mayoría de las plantas (tanto
cultivadas como silvestres) y ciertos hongos del suelo.
􀂄 Simbiosis prácticamente universal, casi todas las especies vegetales
son susceptibles de ser micorrizadas y puede estar presente en la
mayoría de los hábitat naturales.
􀂄 Posición ecológica especial: el hongo esta adentro y afuera del
hospedador
􀂄 El hongo coloniza la raíz de la planta y le proporciona nutrientes
minerales y agua, que extrae del suelo por medio de su red externa de
hifas, mientras que la planta suministra al hongo sustratos
energéticos y carbohidratos que elabora a través de la fotosíntesis.
􀂄 Difiere de la asociación rizosférica por presentar una mayor
especificidad y organización de la relación hongo planta.
Representación esquemática de los distintos tipos de
micorriza y las estructuras típicas formadas.
Ectomicorriza
3% de las plantas conocidas forman este tipo de
micorrizas, entre las que destacan: pinos,
abedul, haya, roble, eucaliptos, etc.
􀂄 El hongo (ascomicete o basidiomicete) forma
una vaina externa pseudoparenquimatosa que
constituye más del 40% del peso seco de la
estructura combinada hongo-raíz.
􀂄 Los hongos suelen tener temperatura óptima
de crecimiento entre 15-30 ºC y ser acidófilos.
􀂄 Las hifas fúngicas penetran en los espacios
intercelulares de la epidermis, sin invadir las
células vivas.
􀂄 Se altera la morfología de la raíz. Mayor
resistencia a patógenos.
Endomicorriza orquidioides o de ovillo

Penetración no patógena en el córtex de la


raíz por hifas fúngicas septadas que
forman ovillo.
􀂄 Hongos: Armillaria mellea y Rhizotocnia
solani.
􀂄 Representan el tercer tipo mas importante
de micorrizas, ya que estas plantas son
dependientes en estado juvenil
de su hongos simbiontes. Una vez que la planta
crece y fotosintetiza, generalmente se
independiza del hongo.
􀂄 Puede derivarse en una relación parásita.
Endomicorriza vesículo arbuscular
No causa cambios macroscópicos en la morfología de la raíz.
􀂄 Son las de mayor importancia y más ampliamente
distribuidas (tanto a nivel geográfico como dentro del
Reino Vegetal).
􀂄 Los hongos pertenecen a la clase Zigomicetes que
producen unas estructuras conocidas como arbúsculos
que son las estructuras responsables de la transferencia
bidireccional de nutrientes entre los simbiontes.
􀂄 La colonización del hongo se extiende por la epidermis y el
parénquima cortical, nunca penetra en la endodermis ni
en los tejidos vasculares y meristemáticos.
􀂄 En las plantas las MA producen un incremento en la
absorción de nutrientes minerales del suelo y un
aumento de la resistencia de la planta al estrés hídrico y
a la salinidad.
􀂄 Aplicación en agricultura y reforestación.
Fijación biológica de nitrogeno
Reducción de N2 a NH4+ por la enzima nitrogenasa.
􀂄 Después de la fotosíntesis, la ruta metabólica más importante para el mantenimiento
de la vida en la Biosfera.
􀂄 El oxígeno es el mayor inhibidor.
􀂄 Puede ser llevado a cabo por unos pocos grupos de seres vivos, todos ellos
procariotas.
􀂄 Puede ocurrir en forma libre o estableciendo relaciones simbióticas con otros
organismos.
􀂄 La relación simbiótica rizobiáceas–leguminosas es el que ha sido estudiado
ampliamente y en mayor profundidad.
􀂄 Se desarrolla un órgano mixto, normalmente en la raíz, el nódulo simbiótico, en el que
se proporciona un entorno de oxígeno controlado, así como los nutrientes necesarios
para que la bacteria pueda efectuar el proceso de fijación.
Simbiosis rizobios y leguminosas.
Géneros Rhizobium, Bradyrhyzobium y Azorhizobium.
􀂄 Heterótrofos, habitantes del suelo (no dominantes) y no fijan
nitrógeno en forma libre.
􀂄 La asociación entre rizobios y las leguminosas es específica.
􀂄 Mesófilo, rango de tolerancia 5-40ºC, sensibles a pH ácidos, los
nitratos y nitritos inhiben la formación del nódulo.

Proceso de formación del nódulo


1- Comunicación química planta-bacteria
􀂄 Quimiotaxi positiva a los exudados de la raíz.
􀂄 Flavonoides secretados por las plantas inducen la expresión de
gene de nodulación (nod).
􀂄 Los productos de la expresión de los genes nod provocan la
curvatura de los pelos radicales y la división de las células
meristemáticas.
2- Infección: formación del canal de infección
􀂄 Los rizobios o los pelos radicales producen
poligalacturonasa que despolimeriza la pared
de las células vegetales y permiten la
invasión.
􀂄 Se desarrolla un tubo de infección rodeado
de membrana celular y pared celulósica con
células de Rhizobium en una matriza
polisacárida.
􀂄 El tubo de infección penetra y atraviesa el
cortex de la raíz.
3- Maduración del nódulo
􀂄 Los rizobios producen el tejido capaz de fijar nitrógeno,
células de tamaño y formas poco usuales “bacteroides”, que
no pueden multiplicarse independientemente.
􀂄 Células vegetales no infectadas que intervienen en la
transferencia de metabolitos entre la planta y el bacteriode.
􀂄 Leghemoglobina (color rojo): transportador de electrones,
suministra oxígeno a los bacteroides y protege al sistema
nitrogenasa del oxígeno.
Hemo: bacteroide.
globina;: planta
Nitrogenasa reductasa
Codificada por nifH Dinitrogenasa
Interacciones con las estructuras aéreas
de las plantas
Microorganismos epífitos: bacterias heterótrofas y fotosintéticas, hongos, líquenes y algas.
􀂄 Están directamente expuestos a los cambios climáticos: radiaciones solares intensas,
desecación, temperaturas extremas.
􀂄 Microorganismos pigmentados o con paredes especiales.
􀂄 Formas de resistencia.
􀂄 Sucesiones estacionales
􀂄 Ambientes efímeros: flores, frutos, etc.
􀂄 Entre los microorganismos de la superficie de las plantas se dan interacciones positivas y
negativas.
􀂄 También existen relaciones mutualistas con las estructuras aéreas de las plantas
􀂄 Relación simbiótica fijadora de nitrógeno: Azolla (helecho acuático) y Anabaena
(cianobacteria). No sensible a los abonos nitrogenados, pH bajos y salinidad.
􀂄 Hongos endófitos (crecen intracelularmente) ej: Acremonium lolii y césped (Lolium perenne):
producción de alcaloides que protegen de hervíboros.
􀂄 Bacterias que provocan formación de hielo (patógenos condicionales).
SIGNOS Y SINTOMAS
Síntoma: Es el resultado final de la interacción patógeno-
planta, que implica una distorsión de la actividad normal
de la planta. Este funcionamiento anormal se manifiesta
como síntoma.

Signo: Presencia visible del patógeno

Síndrome: Conjunto de síntomas, que ocurren secuencialmente


en una enfermedad (Complejo de Síntomas).
Ej. Pratylenchus sp: (Clorosis, achaparramiento, necrosis,
pudrición)
CLASIFICACIÓN DE LOS SÍNTOMAS
I. De acuerdo a su distribución en el hospedante
A. Generales
Comprometen a toda la planta
Ej. Enanismo, Marchitamiento,

Ralstonia solanacearum
B. Locales
Se manifiestan en un área limitada del tejido del
hospedero

a b

a. Tizón foliar en maíz por Helminthosporium turcicum


b. Nódulos de Meloidogyne en raíz de nabo
c. Pudrición apical por deficiencia de calcio
II. De acuerdo al modo de acción del patógeno
A. Primarios
Son el resultado de la acción directa del patógeno sobre
el tejido invadido

B. Secundarios
Son el resultado de efectos fisiológicos originados por el
patógeno en órganos distantes no invadidos por él
Ej. Marchitez por pudrición radicular

Son el resultado de la acción de organismos considerados


como saprófitos secundarios
III. DE ACUERDO A SU TAMAÑO
A. Microscópicos
Solo es posible observarlos microscópicamente en
cortes histológicos

B. Macroscópicos
Se pueden observar a simple vista, y pueden ser:
a. Síntomas Pre - necróticos
Preceden a la muerte de la célula

b. Síntomas Necróticos
Asociados a muerte celular. Puede ser de parte del
tejido o de todo el tejido de un órgano.
(Restringida/completa).
A. SÍNTOMAS PRE - NECRÓTICOS
1. Amarillamiento
Pérdida de color verde normal, por destrucción de
clorofila
Deficiencia de luz, calcio

Hojas de jazmín con amarillamiento


2. Enrojecimiento
Pérdida generalizada del color verde normal por destrucción de la
clorofila, manifestándose los pigmentos rojos
Deficiencia de fósforo
Alternaria alternata

Vid

Maíz
3. Marchitez
Pérdida de turgencia de la planta
Fusarium oxysporum, Meloidogyne incognita
Ralstonia solanacearum, Verticillium alboatrum
B. SÍNTOMAS NECRÓTICOS

1. Cancros
Lesión necrótica, hundida en el centro, con los bordes
levantados y corchosos o suberificados, se observan en la
corteza de las ramas, troncos, raíces o frutos
Rhizoctonia solani: Cuello de frejol y algodón
Phytophthora citrophthora: Tallo de cítricos
2. Chupadera
Lesiones hundidas de color marrón, ubicadas a la altura del cuello
de las plántulas
Rhizoctonia solani, Fusarium solani, Pythium spp
3. Muerte regresiva
Necrosis descendente que se inicia en parte apical de ramas y ramillas: P.
cinnamomi--- Pudrición de raíces del palto
Tylenchulus semipenetrans: Nematodo de los cítricos

Antracnosis del mango Roña del mango Antracnosis fruto

Sarna del mango Muerte regresiva de las ramas


4. Momificación
Deshidratación de tejidos muertos de órganos carnosos que no es
seguida por el ataque secundario de organismos

Manzano

Duraznero: Monilinia fruticola


5. Abolladuras
Muerte de tejido suculento justo debajo de la epidermis de
frutos, tubérculos, resultando en depresiones en la superficie. Ej.
Taphrina deformans en durazno
6. Pudrición
Desintegración de tejidos, puede ser seca o húmeda, algunas
van acompañadas de la producción de olores característicos.

a b

a. Por fitonematodos
b. Por hongos
7. Escaldadura (Ampolladura)
El tejido se presenta hundido y la epidermis levantada, el tejido
adyacente esta necrosado
Rynchosporium secalis: Escaldadura de la cebada, arroz
8. Mancha necrótica
Zona de tejido decolorido o muerto, en el limbo de hojas o
en la superficie de frutos; poseen forma, tamaño, color,
borde y distribución variable
9. Quemado
Resecamiento violento y bronceado de grandes áreas indefinidas
de hojas o frutos
Quemado por helada
10. Tizón:
Similar al quemado, pero involucrando la totalidad de
hojas, brotes o ramas : P. infestans

.
12. Perforación o cribado:
Perforación del limbo foliar en áreas limitadas y
generalmente pequeñas , en la zona de las manchas
Ej. Hojas de vid presentando cribado ocasionado por el
hongo de la antracnosis
13. Estría necrótica
Manchas necróticas en forma de línea
Mancha por Alternaria en caña de azúcar
14. Anillo necrótico
Mancha necrótica de forma anular
Phytphthora nicotianae var. parasitica
Rhizoctonia solani
15. Pústula
Rotura de epìdermis por presión interna que ejercen los
patógenos que se desarrollan internamente: Royas
C. SÍNTOMAS ATRÓFICOS
Se caracterizan por hipoplasia y/o hipotrofia de los tejidos, lo
que resulta en órganos de menor tamaño. También agrupan a
la subproducción de clorofila

C.1. Subproducción de clorofila


1. Clorosis: Coloración verde pálido o amarillenta por
desarrollo subnormal de clorofila
2. Estrías cloróticas
Se refiere a la presencia en las hojas de líneas sin
clorofila, de color amarillo a blanco

Hoja de rosal

Rayado foliar bacteriano:


Pseudomonas rublilineans Virus del rayado del maíz
3. Mosaico
Alternancia de zonas cloróticas con zonas verdes
normales, de bordes indefinidos: VMT, BMV
4. Aclareo de nervaduras: BMV
5. Anillo clorótico:
Presencia en las hojas de líneas sin clorofila, de color
amarillo a blanco, formando dibujos a veces circulares
6. Mancha clorótica :

Xanthomonas campestris

Mildiu de la vid
7. Halo clorótico
Zona clorótica que rodea a las manchas
c.2. Subdesarrollo de órganos

1. Enanismo
Tamaño subnormal de la planta o de alguno de sus
órganos. Virus, nematodos
2. Aborto:
Detención en el desarrollo de un órgano después de una
diferenciación parcial

Aborto de frutos de ciruelo.


3. Arrosetamiento
Acortamiento de entrenudos
Hoja de vid
D. SÍNTOMAS HIPERTRÓFICOS
1. Encrespamiento
Hipertrofia de células del parénquima o limbo, permaneciendo las
nervaduras normales
Ej.: Deformación de hoja de papa por PVX
2. Abarquillamiento
Mayor crecimiento de nervaduras, células del parénquima
con crecimiento normal
3. Escoba de brujas
Proliferación anormal de raíces, flores o tallos
4. Sarna o costra
Lesiones +/- circulares ligeramente levantadas, resquebrajadas, en
superficie de frutos, tallos, hojas, tubérculos
Ej. : Streptomyces scabies, Venturia. inaequalis
5. Callo
Tejido de cicatrización suberificado que se forma en el
bode de un cancro o herida

Esta herida en el tronco del


Palo Borracho está a punto En este caso el callo ha
de cerrarse por el desarrollo cerrado completamente
de tejido. (Callo) esta herida del tronco.
6. Agallas / Tumor
Sobrecrecimiento o tumor formado por células poco
diferenciadas: Hiperplasia, hipertrofia
Ej.: Meloidogyne incognita, Agrobacterium tumefasciens
Spongospora subterranea
7. Epinastia:
Curvatura hacia abajo de las hojas, por sobrecrecimiento de las
células del haz
8. Filodia
Transformación de tejido floreal en foliar por acción de factores
ambientales, fitoplasmas, etc
9. Fasciación
Aplanado de órganos tales como tallos, hojas o flores
E. ESPECIALES O COMPLEJOS
Por su naturaleza no se les puede ubicar en ninguna clasificación

1. Exudación
2. Formación de Tubérculos aéreos
3. Deformación de órganos:
Virus, nematodos, bacterias, hongos, fitoplasmas
4. Antocianescencia
Aumento de pigmentos antociánicos, manifestándose los
pigmentos rojos
Ej.: Duraznero con coloraciones rojizas por ataque de
Taprina deformans.
5. Enrollamiento
Curvamiento anormal de brotes u hojas, por sus bordes, hacia
adentro o hacia fuera
6. Virescencia (Verdeamiento)
Color verde de órganos que no sintetizan clorofila
7. Descortezamiento
Desprendimiento de la corteza de especies leñosas
SIGNOS
1. Micelio Penicillium sp

Sclerotium rolfsii

Botrytis cinerea
2. Exudaciones
3. Rhizomorfos
Armillaria mellea, A. ostoyae
4. Esclerocios
R. solani, Sclerotium rolfsii, Claviceps purpurea
5. Royas
6. Carbones: Ustylago maydis
7. Quistes de Globodera
8. Oidium
9. Mildiu
10. Fumagina

11. Basidiocarpos