obtener múltiples copias de un fragmento de un ácido nucleico mediado por un enzima (ADN polimerasa) y a partir de unas secuencias de iniciación de síntesis (iniciadores, cebadores o primers), en presencia de deoxinucleótidos de las 4 bases e iones Mg+, entre otros componentes y sometido a ciclos repetidos de:
DESNATURALIZACION APAREAMIENTO DE INICIADORES EXTENSION O SINTESIS PCR
En la reacción, si usamos como sustrato ADN
genómico, entonces típicamente hablamos de una PCR. Pero si usamos ARNm, se le conoce como RT-PCR (Reverse Transcription-PCR, por sus siglas en inglés) En la RT-PCR la reacción se conoce como Transcripcion reversa, y controlada por la enzima transcriptasa reversa, capaz de convertir el ARNm en una molécula de ADNc. El ADNc se utiliza cuando analizamos la expresión del ARNm de algún gen de interés. PARAMETROS
• Àcido nucleico diana o molde: puede tener
desde 50 a 2,000 nucleótidos de longitud. • Polimerasa • dNTPs: dATP, dGTP, dCTP, dTTP. • Temperatura • Primers: secuencias cortas de nucleótidos 20- 24 nucleótidos de longitud, complementarias a una región del DNA que se quiere amplificar. ELECCIÓN DE LOS PRIMERS
• Contenido de G-C ≈ 50%
• No largas secuencias de una sola base • Evitar complementariedad, en cada uno de los primers o entre ambos primers. • Tamaño recomendad 20-30 pb • Concentración 0,1 a 0,5 µM. • Evitar G y C en el extremo 3’. PCR MÙLTIPLE
A la muestra extraída se le añaden varios
juegos de cebadores (cada par específico de un microorganismo o región concreta). Al realizar la reacción, se amplifican diferentes dianas. Por ejemplo puede realizarse para hacer una identificación y detección de varios determinantes de resistencia a los antimicrobianos. PCR CUANTITATIVA
Se utiliza para determinar el número de
copias de la muestra inicial. Suele utilizarse una técnica competitiva, para ello se incorpora a la reacción un ARN o un ADN competidor - según el tipo de ácido nucleico diana a amplificar-, que tenga la misma longitud y utilice los mismos cebadores que el ADN ó ARN problema. La cantidad incorporada del competidor debe ser conocida, de forma que al final de la reacción puedan determinarse las PCR TIEMPO REAL
Se realiza en muy poco tiempo
(aproximadamente 30 minutos) y proporciona una cuantificación continua y precisa del ADN que se va formando. APLICACIONES
• Detección de agentes infecciosos
como: hepatitis B y C, papiloma virus, HIV, entre otros. • Análisis de DNA de cualquier organismo vivo o muerto, análisis de fósiles. • Mutagénesis dirigida (cambios en la información contenida a través de “primers” con mutaciones) • Investigación forense.