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Saccharomyces cerevisiae
RENAISSANCE
1435 : Le houblon s’impose comme arôme principal
de la bière
1489 : Le mot bière (qui vient de « bier ») apparaît
pour la première fois dans une ordonnance qui
réglemente le commerce des cervoises
HISTORIQUE
10 mm
Schizosaccharomyces pombe
Vacuole
Équivalent du lysosome des mammifères
Péroxysome
Assimilation des acides gras
A quoi ça ressemble ?
Noyau
1µm
16 chromosomes (12,5Mb)
Mitose : pas de rupture de
l’enveloppe nucléaire
Nucléole en forme de croissant
Mitochondrie
20% du poids sec
Son cycle de vie et sa "reproduction"
* cycle de vie :
α
1h30
a
Bourgeonnement axial
Bourgeonnement bipolaire
fin
Son cycle de vie et sa "reproduction"
*conjugaison :
3/Formation du zygote
1/Reconnaissance du 2/Synchronisation du
attachement
signe opposé : cycle cellulaire :
des celllules
Phéromones Arrêt en G1
Polarisation des fusion
cellules: : Shmoo cellulaire
fusion
nucléaire
cycle
Son cycle de vie et sa "reproduction"
*détermination du signe sexuel
(119aa) (126aa)
(642pb)
(210aa) (175aa)
W X (747pb) Z1 Z2
Son cycle de vie et sa "reproduction"
Switch sexuel à chaque division cellulaire
Son cycle de vie et sa "reproduction"
Comment ça marche ?
cycle
Intérêts comme modèle génétique
Peu cher
Facile à utiliser et conserver
Peut se congeler à -80°C
Cycle de division très rapide (1h30 par génération) =
croissance exponentielle
Permet des études statistiques
À 30°C
Comment la cultiver ?
En culture liquide
À 30°C
avec agitation
Génétique formelle
Haploïde 1 Haploïde 2
DP :
croisement
diploïde
DR :
sporulation
(méiose)
tétrades T:
1 2 3 4 5 6
Ditypes parentaux ?
Ditypes recombinés ? 1/relation entre les gènes : établir des cartes génétiques
Tétratypes ? 2/sélection de souches mutantes
Génétique formelle
1/relation entre les gènes : Carte génétique détaillée de Saccharomyces cerevisiae
Haploïde 1 Haploïde 2 DP : Ab
Ab aB Ab
aB
aB
croisement
Ab diploïde
aB AB
DR :
Sporulation AB
(méiose) ab
tétrades ab
1 2 3 4 5 6
T:
AB
Ab
aB
ab
Génétique formelle
Haploïde 1 Haploïde 2 micromanipulateur
croisement
diploïde
sporulation
(méiose)
tétrades
1 2 3 4 5 6
Ditypes parentaux ?
Ditypes recombinés ?
Tétratypes ?
Génétique formelle
Haploïde 1 Haploïde 2
micromanipulateur
croisement
diploïde 1 2 3 4
A
B
sporulation C
(méiose) D
tétrades
tétrades
1 2 3 4 5 6
Ditypes parentaux ?
Ditypes recombinés ?
Tétratypes ?
Génétique formelle
Haploïde 1 Haploïde 2
croisement
diploïde
sporulation
(méiose)
tétrades
1 2 3 4 5 6
https://www.youtube.com/watch?feature=player_embedded&
v=k-4H2QQuShs
Ditypes parentaux ?
Ditypes recombinés ?
Tétratypes ?
Génétique formelle
Génétique formelle
Études fonctionnelles
Études fonctionnelles
Boris Ephrusi
Paroi épaisse
Choc
thermique :
42°C
Acétate de lithium
La recombinaison homologue
Produit de PCR ou
produit de restriction
enzymatique
chromosome
La recombinaison homologue
GAP repair
Produit de PCR ou
produit de restriction
enzymatique
Plasmide
digéré
Et le génome …
La carte physique du génome de Saccharomyces cerevisiae
Historique de la génomique.
1951 Première séquence de protéine (Insuline, Sanger)
1977 Première méthodes de séquençage à grande échelle d’ADN (Sanger, Maxam, Gilbert)
1978 Premières bases données contenant des séquences biologiques : ACNUC, PIR, EMBL, GenBank.
… …
Fonction approximative
Banque euroscarf :
-4826 souches de chaque signe sexuel délétées chacune pour un gène non essentiel
-4826 souches diploïdes homozygotes, délétées chacune pour les deux copies d’un gène non essentiel
-environ 6000 souches diploïdes hétérozygotes, délétées chacune pour une des deux copies un gène
Nomenclature
U1 et U2 Commun à TAG1
Spécifique à
l’ensemble des
chaque délétant
délétants
D1 et D2 TAG2
Crible de la banque EUROSCARF
wt phénotype
Modification du WT
∆ygr088w phénotype ?
∆ygr088w
=> Identification du
partenaire génétique ∆ymr005w
∆ykl154c
∆ymr024c
….. : 4826
transformations
indépendantes
Crible de la banque EUROSCARF
76 plaques de 96 puits
souches ordonnées
phénotype
wt
∆ygr088w
Modification du phénotype ?
Identification des
souches grâce
∆ymr024c
aux tags
TAG1 TAG2
pool x souches
1transformation du pool
Etude de maladies humaines
40% des gènes humains responsables de maladies ont un
homologue chez la levure