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MICROBIOLOGIA AMBIENTAL

MSc. Blga. Maritza Arcelis Zavaleta Díaz


INTRODUCCIÓN A LA MICROBIOLOGÍA

Objeto de estudio: Estudio de los seres microscópicos, no visibles a simple vista, la


mayoría son unicelulares aunque hay algunos pluricelulares. Por sus dimensiones
también estudia a los virus, viroides y priones, aunque no son considerados como
seres vivos pero presentan biomoléculas que pueden interactuar con las células.
MICROBIOLOGIA AMBIENTAL:

La microbiología ambiental es el estudio de los


microorganismos que existen en ambientes
naturales o artificiales.
IMPORTANCIA DE LOS MICROORGANISMOS EN
INGENIERIA AMBIENTAL

Son una de la principales fuentes de contaminación de aire, agua y


suelo, pudiendo ser algunos de ellos patógenos para el humano y
otros organismos, así como causar daño a materiales.
La contaminación es un problema importante en la actualidad,
ocasionado principalmente por el hombre, pero algunos
microorganismos que han sido estudiados durante mucho tiempo
pueden contribuir a resolverlo.
Algunos juegan un papel importante como indicadores de
contaminación.
Los diferentes grupos de microorganismos participan en gran medida
en el tratamiento biológico de residuos líquidos y sólidos. Estos
tratamientos pueden ser de tipo aerobio, anaerobio ó mixto.
IMPORTANCIA DE LOS MICROORGANISMOS EN INGENIERIA
AMBIENTAL

Muchos de ellos son útiles en procesos de biorremediación de agua


y suelo.
Contribuyen a la fertilidad del suelo, degradando la materia
orgánica de restos de animales y plantas muertos, así como por la
participación de algunas bacterias en la fijación del nitrógeno
atmosférico.
Pueden utilizarse en el diseño y construcción de Biosensores que
pueden ser utilizados en la determinación de analitos de interés
ambiental.
Un sin número de microorganismos son de gran utilidad en Biotecnología en la
obtención de una gran variedad de productos de interés y producción de proteína
de origen unicelular (Biomasa).
En Ingeniería Genética existe cada vez mayor interés en mejorar la capacidad de
microorganismos, para resolver problemas ambientales.
Los microorganismos como
indicadores de contaminación
Algunos microorganismos pueden ser utilizados como indicadores
en un ambiente específico que ha sido contaminado.
Los indicadores microbiológicos ideales deben reflejar no solamente
la presencia o ausencia de contaminación de un tipo específico,
sino también los niveles de dicha contaminación y sus fluctuaciones
periódicas.
Otros microorganismos tales como Bacillu subtilis y Bacillus
stearothermophilus tienen importancia como indicadores en la
determinación de eficiencia de destrucción de microorganismos
mediante el tratamiento físico ó químico de residuos peligrosos
biológico infecciosos (RPBI)
GRUPOS DE MICROORGANISMOS ESTUDIADOS POR LA MICROBIOLOGÍA.

El estudio de los microorganismos se puede dividir de acuerdo a los grupos más


importantes conocidos hasta ahora.
· Protozología: Estudio de los protozoarios en
Bacteriología: Estudio de las
general. La parasitología estudia a protozoarios
bacterias y otros organismos
y gusanos causantes de enfermedades.
procariotes (Archaea)

Ficología: Estudio de las algas (macroscópicas

· Micología: Estudio de los y microscópicas)

hongos (levaduras y mohos)

· Virología: Trata sobre los virus y otras


partículas infecciosas.
LA MICROBIOLOGÍA Y SU IMPORTANCIA PARA EL SER HUMANO.
CAMPOS DE APLICACIÓN DE LA MICROBIOLOGÍA

· Microbiología Médica. · Microbiología Veterinaria

Bacteria: Propionibacterium acne Priones


Hongo: Candida albicans Virus Newcastle

· Microbiología de Plantas · Microbiología de los Insectos

Prototoario: Tripanosoma cruzi Hongo: Beauveria bassiana


Hongo: Claviceps purpurea Virus del Mosaiso del tabaco

· Microbiología Ambiental.
o Microbiología o Microbiología del Agua o Microbiología
o Microbiología
Acuática. y Drenajes Domésticos. del Suelo.
del Aire.
LA MICROBIOLOGÍA Y SU IMPORTANCIA PARA EL SER HUMANO.
CAMPOS DE APLICACIÓN DE LA MICROBIOLOGÍA
· Microbiología Industrial y de Productos

Microbiología de la Microbiología de los Microbiología Control


Leche. Alimentos. para Biosíntesis. Microbiológico en
Procesos

Microbiología Espacial
Microorganismos y Transformaciones
(Exobiología)
Geoquímicas
I Sanidad III Alimentación
Identificación de nuevas enfermedades, Conservación de alimentos (calor, frio, radiación,
tratamiento, curación y prevención productos químicos)
Alimentos fermentados
II Agricultura
Aditivos alimentarios (glutamato monosódico,
Fijación de nitrógeno ácido cítrico, levaduras
(N2 2NH3)

Ciclo de nutrientes
IV Energía/Medio Ambiente

NO3- N2  NH3 H2S  SO4=  S0 Biocarburantes


(CH4) o Maíz  fermentación Etanol
Cría de animales
Rumen Biorremediación (contaminante + O2 CO2)
CelulosaCO2 +CH4 +Proteína animal
Biolixiviación (CuSCu2+  CuO)

V Biotecnología

Organismos modificados genéticamente.

Obtención de productos farmacéuticos (insulina y otras proteínas humanas).

Terapia génica para ciertas enfermedades (persona enferma  lesión genética corregida).
HISTORIA DE LA MICROBIOLOGÍA:
UTILIZACIÓN EMPÍRICA DE LOS
MICROORGANISMOS EN LAS ANTIGUAS
CIVILIZACIONES. ÉPOCA DE ORO Y
DESCUBRIMIENTOS ACTUALES.
Hace Era Tiempo aproximado
millones geológica de origen
de años

Cenozoico Homo sapiens


Mesozoico Mamíferos y aves
Plantas terrestres
Paleozoico Peces, invertebrados

Proteozoico Organismos multicelulares


1,000--

Células eucarióticas
2,000-- Evolución
Biológica
Bacterias aerobias

Células procarióticas

3,000--
Primeros fósiles y evidencias de vida

Arqueozoico
4,000-- 4 Primeras “células” vivas
3 Protocélula: membrana que envuelven prototipos de ác. nucleicos
2 Coacervación: concentración y agregación de moléculas
1 Sopa orgánica: síntesis de aminoácidos, azúcares y péptidos Evolución
Química
EVENTO IMPORTANCIA PARA LA VIDA

1) Sopa orgánica Primeras moléculas orgánicas a partir


de compuestos inorgánicos, presentes
en una atmósfera reductora.

2) Coacervados Organización de moléculas en


membranas, separando el interior del
exterior.

3) Protocélula Hipotética antecesora de la célula viva,


más compleja que los coacervados al
incorporar otras estructuras dentro de la
membrana
4) Primeras Se postula que ya existe la vida celular
“células” vivas tal como la conocemos, sin embargo no
hay rastro de ella.
5) Primeros fósiles Registros fósiles que confirman la vida
de vida en esa época, se considera que son
bastante evolucionados, hay organismos
litótrofos.
EVENTO IMPORTANCIA PARA LA VIDA
6) Células Aparición de procariotes anaerobios y
procarióticas procariotes fotosintéticos, esos últimos
favorecen la aparición del O2 cambiando
a una atmósfera oxidante.
7) Bacterias Evolución de bacterias que utilizan
aeróbicas respiración aerobia gracias a la
abundancia de oxígeno, se establece la
posibilidad de obtener mayor energía de
los compuestos orgánicos.
8) Células Por el aporte energético de la respiración
eucarióticas aerobia aumenta el grado de complejidad
de las células, aparece el núcleo, y
asociaciones entre organismos aeróbicos
(mitocondrias) o fotosintéticos
(cloroplastos) y células mayores.
9) Organismos Se agregan las células aumentando la
pluricelulares complejidad de los organismos, hay una
diferenciación celular de funciones.
MICROBIOLOGÍA EN LA HISTORIA
ALGUNOS EVENTOS SOBRESALIENTES
ÉPOCA* CIVILIZACIÓN EVENTO

Antiguas Uso de plantas y


Paleolítico civilizaciones minerales para
y Neolítico en todo el tratamiento de heridas.
mundo (evitar infecciones)

Uso de levadura para


3000 A.C. Oriente medio
panificación.

Producción de cerveza.
También uso de levadura
2500 A.C. Egipto antiguo para pan.

*aproximadamente
MICROBIOLOGÍA EN LA HISTORIA
ALGUNOS EVENTOS SOBRESALIENTES
ÉPOCA* CIVILIZACIÓN EVENTO

Peste Negra,
Siglo XIV enfermedad causada por
Europea
D.C. Yersinia pestis, diezmó
la población.

Viruela. Otra vez una


enfermedad
desconocida afecto a la
Siglo XVI población autóctona,
Americana causando su
D.C.
debilitamiento y
conquista.

Siglo XIX
Europea Inicio de la microbiología
D.C.
PANORÁMICA GENERAL DE LA MICROBIOLOGÍA Y
LA BIOLOGÍA CELULAR (1684-1999)
I) Microbiología General y Médica (1680-1940)
Pasteur Koch
Lister
(1857- (1881-
(1867)
1880) 1884)

Año Investigador(es) Evento

1665 Robert Hooke Primeras observaciones de células

1684 Antonie Van Leeuwenhoek Descubrimiento de las bacterias (microscopios funcionales)

1735 Karl Linneo Nomenclatura de microorganismos

1798 Edward Jenner Vacunación contra la viruela

1853 Heinrich Anton De Bary Enfermedades de plantas causadas por hongos

1857 Louis Pasteur Microbiología de la fermentación láctica

1861 Louis Pasteur Papel de las levaduras en la fermentación alcohólica

1862 Louis Pasteur Fin de la controversia sobre la generación espontánea

1864 Louis Pasteur Pasteurización

1867 Joshep Lister Principios antisépticos en cirugía

1870 Ernst Karl Abbé Condensador Abbé y Objetivo de inmersión


Año Investigador(es) Evento
1880 Louis Pasteur Técnicas de inmunización (rabia)

1881 Robert Koch Técnicas de estudio de bacterias en cultivo axénico


1882 Robert Koch Descubrimiento del agente causal de la tuberculosis
Walter Hess Uso del agar en medios de cultivo
1884 Robert Koch Postulados de Koch sobre el origen de las enfermedades
Descubrimiento del Vibrio cholerae
1884 Christian Gram Desarrollo de la técnica de Gram para bacterias

1887 Julius Richard Petri Elaboración de la caja petri para cultivo de microorganismos
1889 Martinus Beijerinck Concepto de virus
1890 Emil von Bering Toxina antidiftérica
1901 Martinus Beijerinck Métodos de cultivo enriquecidos
1908 Paul Erlich Agentes quimioterapéuticos
1928 Frederick Griffith Descubrimiento de la transformación de neumococos
1929 Alexander Fleming, Ernest B. Descubrimiento de la Penicilina y aplicación quimioterapéutica
Chain y Howard W. Florey
1934 Rebeca C. Lacenfield Antígenos de estreptococos

1935 Wendell M. Stanley, John H. Obtención de virus cristalizados


Northrop y James B. Summer
Microbiología General y Biología Molecular (1941-1985)

Watson Margulis Montagnier


Crick
(1956) (1981) (1983)

Año Investigador(es) Evento


1941 George W. Beadle y Salvador E. Luria Establecen la relación entre genes y enzimas

1943 Max Delbrück y Salvador E. Luria Infecciones virales en bacterias

1944 Oswald Avery, Colin MacLeod y El DNA es material genético


Maclyn McCarty
1946 Joshua Lederberg y Conjugación bacteriana
Edward L. Tatum
1953 James Watson y Francis Crick Estructura del DNA
Año Investigador(es) Evento
1959 Rodney Porter Estructura de las inmunoglobulinas

1962 Gerald M. Edelman y Rodney R. Función de los anticuerpos en la defensa del organismo
Porter
1964 Michel. A. Epstein, B. G. Bert Achong Causa de cáncer por el virus Epstein-Barr
y Yvonne M. Barr
1969 Robert Whittaker Propuesta de clasificación de cinco reinos

1973 Paul Berg, Herbert Boyer y Stanley Desarrollo de la ingeniería genética


Cohen
1977 Frederick Sanger, S. Nicklen y R. Métodos de secuenciación de ADN
Coulson
1981 Lynn Margulis Postulación del origen de la célula eucariótica

1981 Stanley Prusiner Caracterización de priones

1982 Karl Stetter Aislamiento del primer procariote con Tº óptima > 100ºC

1983 Luc Montanier Identificación del agente causal del SIDA


III) Microbiología Molecular, Genómica y Proteómica (1985- )

Mullis Bishop Venter


(1985) Varmus Smith
(1989) (1995)

Año Investigador(es) Evento


1985 Kary Mullis Invención de la PCR.

1986 Norman Pace Ecología microbiana molecular.

1988 Johann Deisenhofer, Richard Huber y Pigmentos fotosintéticos de bacterias


Harmut Michel
1989 Michael Bishop y Harold Varmus Descubrimiento de los oncogenes

1992 Jed Fuhrman y Edward DeLong Descubrimiento de arqueas marinas

1995 Craig Venter y Hamilton Smith Secuencia completa de un genoma bacteriano

1999 Instituto de Investigaciones Más de 100 genomas bacterianos secuenciados o en


genómicas y otros (V.S.) proceso.
2005 Proyecto de metagenómica (V.S.) Avance sustancial de la secuenciación de diversos
organismos
1665. Robert Hooke.
Primeras observaciones Louis Pasteur. Robert Koch.
de células. 1857. Microbiología de la 1881. Técnicas de estudio de
fermentación láctica. bacterias en cultivo axénico.
1861. Papel de las levaduras 1882. Walter Hess.
en la fermentación alcohólica. Descubrimiento del agente
1862. Fin de la controversia causal de la tuberculosis. Uso
1684. Antonie Van
sobre la generación del agar en medios de cultivo.
Leeuwenhoek.
Descubrimiento de las espontánea. 1884. Postulados de Koch
bacterias. 1864. Pasteurización. sobre el origen de las
enfermedades.
Descubrimiento del Vibrio
cholerae.
1735. Karl Linneo.
Nomenclatura de 1880. Louis Pasteur.
microorganismos. Técnicas de
inmunización (rabia).

1853. Heinrich Anton De


Bary. Enfermedades de
plantas causadas por 1870. Ernst Karl Abbé.
hongos. Condensador Abbé y
Objetivo de inmersión.

1867. Robert Lister. 1884. Christian Gram.


1798. Edward Jenner. Principios antisépticos Desarrollo de la técnica
Vacunación contra la en cirugía. de Gram para bacterias.
viruela.
Importancia del microscopio en el desarrollo de la microbiología

Permite observar al objeto de estudio: los microorganismos


ESCALA MICROSCÓPICA
Equivalencia Tamaño Objeto Microscopio
de medidas

Microscopio luz
0.1mm -100m Protozoarios
cm = 10-2m

visible
mm = 10-3m
-10m
Eritrocitos
m = 10-6m
1000nm -1m Bacterias
nm = 10-9m

Microscopio
electrónico
U.V.
100nm - 0.1m Å = 10-10m
Virus
pm = 10-12m
10nm - 0.01m
Macro-
moléculas
1nm -10Å
Moléculas

-1 Å
Luz visible
Fotónica Fluorescencia

Ultravioleta

Microscopía

de transmisión

Electrónica
de barrido
Ejemplos del tamaño de microorganismos

Microorganismos Forma Tamaño


Alcaligenes sp bacilos, cocobacilos 0.5 a 1.2 m
cocos 0.5 a 2.5 m
Streptococcus sp cocos <2.0m
Bacillus sp bacilos claviformes 0.3 a 2.0 m ancho
1.27 a 7.0 m largo
Escherichia sp bacilos rectos 1.1 a 1.5 m ancho
2.0 a 6.0 m largo
Saccharomyces sp ovalada 1.0 a 5.0 m ancho
5.0 a 10.0 m largo
Rhodotorula sp ovalada 2.0 a 6 m ancho
7.0 a 12 m largo
Hongos filamentosos filamentos (hifas) 5.0 a 10.0 m ancho
(Mohos) conidias y esporas 1.0 a 10.0 m diámetro
Ejemplos del tamaño de microorganismos (cont.)

Microorganismos Forma Tamaño


Tricomonas sp pera con membrana 2 a 14m ancho
5 a 30 m largo
Tripanosomas sp alargado con punta, 15 m ancho
flagelo 30 m largo
Entamoeba sp (trofozoitos) irregular 15 a 30 m
típica ameboide
Diatomeas (Navicula) oval alargada 5.0 a 8.0 m ancho
redonda 12.0 a 20.0 m largo
Poxvirus ladrillo largo u ovoides 230x400 nm
Adenovirus Cúbica 70 a 90 nm
RELACIÓN DE LA MICROBIOLOGÍA CON OTRAS CIENCIAS.
IMPORTANCIA DEL ESTUDIO DE LOS MICROORGANISMOS EN EL
DESARROLLO CIENTÍFICO Y TECNOLÓGICO.

Bioquímica

Qu ánica
Org
ía

ím i
log
Bio

ca
MICRO
BIOLOGÍA

Ec ica ica
ol m
og uí gán
ía Q r
o
In

Otras ciencias que puede apoyar y/o apoyarse en la microbiología


Arqueología
Arquitectura
Historia
LOS MICROORGANISMOS EN LA EVOLUCIÓN. EL ÁRBOL FILOGENÉTICO.
NOMENCLATURA BIOLÓGICA.

CARACTERÍSTICAS DE LA CÉLULA VIVA

1. Autoalimentación y autodesechos (Compartimentación y metabolismo): Capaz


de tomar nutrientes del medio y eliminar desechos al exterior.

2. Autoduplicación (Crecimiento): Capaz de modificar las sustancias asimiladas


para aumentar las estructuras celulares hasta alcanzar su tamaño máximo y
dividirse.
CARACTERÍSTICAS DE LA CÉLULA VIVA (cont.)

3. Diferenciación: Formación de nuevas estructuras, generalmente como parte del


ciclo de vida celular.

4. Señalización Química (Comunicación): Las células pueden comunicarse o


interactuar por medio de sustancias químicas que son liberadas o captadas.

5. Evolución: Cambio de características celulares a lo largo del tiempo, dando


origen a nuevas especies diferentes de la célula original.
CARACTERÍSTICAS DE LOS MICROORGANISMOS

· Son seres vivos

· Son ubicuos.

· Pueden estar formados por células procariotes o eucariotes.


CARACTERÍSTICAS DE LOS MICROORGANISMOS

· Pueden ser unicelulares o pluricelulares.

· Pueden presentar reproducción sexual y/o asexual.

· Presentan una gran diversidad metabólica.


¿ EN QUÉ SE BASA EL ÉXITO DE LOS
MICROORGANISMOS ?

Experiencia
Tamaño
Diversidad
BIODIVERSIDAD

Característica que presenta la vida en este planeta, que le permite poder tener
algún representante en cualquiera de los nichos biológicos existentes. Estos
nichos están definidos por factores ambientales que restringen el desarrollo de
los seres vivos.

Altura y Tempera- Agua pH Solutos Iluminación


presión tura (humedad)

Mares y
10,000 m océanos Alcalino
-40oC Sin sales
5,000 m Lagos y extremo
-15oC
3,000 m lagunas Alta
-6oC Salinidad
1,500 m Ríos Alcalino
0oC marina
Nivel del Otros Media
5oC
mar lugares Neutro
10oC húmedos Aguas
20 m Baja
30oC Selvas sulfurosas
50 m Ácido
80oC húmedas
100 m Ninguna
150oC Bosques Otro tipo de
1,000 m Ácido compuestos
200oC Sabana extremo
5,000 m
Desiertos
SU LUGAR ENTRE LOS SERES VIVOS

 El reino protista de Haeckel (1886)


 Reino Animal
 Reino Vegetal
 Reino Protista (organismos microscópicos unicelulares: bacterias, hongos,
algas, protozoarios)

Sistema de cinco reinos. La clasificación de Whittaker (1969)


Reino plantae Reino Fungi Reino Animalia
(Plantas y algas (Levaduras, Mohos (Gusanos, insectos,
pluricelulares) y Setas) anfibios, reptiles, aves,
mamíferos)
Protista
(Algas unicelulares y
protozoarios)

Monera
(Bacteria,
Cianobacterias,
Archaea)
Árbol filogenético de Woese (de acuerdo al ARN ribosomal. 1977)

Dominio Archaea Dominio Bacteria


Metanosarcina, Bacterias Gram
Halófilas, positivas, Bacterias
Metanobacterias, etc. verdes, Bacterias
rojas, Flavobacterias,
Cianobacterias, etc.

Dominio Eukarya
Hongos, Algas,
Protozoarios, Plantas,
Animales
Filogenia de los seres vivos – Visión Global

ARCHAE Anima
Bacteri EUKARYA
A EntamoHongoles
as
Euryarc ebas s
verdes Hongo
BACTERI Methanos
haeota muco
Bact no s
A arcina
Methanoba sos Planta
del
erias Crenarch
cteriumm s
Ciliad
Gram azufre Methan
Proteobac aeota os
terias positi ococcus
Thermoc
Thermopr
Pyrodict
Cianoba vas oteus occus Flagel
ium
cterias
Flavoba celer ados
Tricomón
cterias
adas

Thermo
togales Microsp
oridios
Diplomó
nadas
Organización taxonómica de microorganismos:

Dominio Bacteria Eukarya


Reino Proteobacteria Fungi
Phylum Gamma proteobacteria Ascomycota
Clase Zymobacteria Hemiascomycetes
Orden Enterobacteriales Saccharomycetales
Familia Enterobacteriaceae Saccharomycetaceae
Género Escherichia Saccharomyces
Especie Escherichia coli S. cerevisiae
Subespecie E. coli Enterotoxigénica

Dominio Eukarya Eukarya


Reino Plantae Protista
Phylum Chlorophyta Amoebozoa
Clase Chlorophyceae Tubulinea
Orden Chlorococcales Tubulinida
Familia Scenedesmaceae Amoebidae
Género Scenedesmus Amoeba
Especie S. acutiformis A. proteus
Nomenclatura científica (Binomial):

Género especie Completo


La inicial siempre en la inicial siempre en
mayúscula minúscula
Escherichia coli Escherichia coli
Bacillus subtilis Bacillus subtilis
Bacillus cereus Bacillus cereus
Candida albicans Candida albicans
Candida utilis Candida utilis
Streptomyces griseus Streptomyces griseus
Paramecium caudatum Paramecium caudatum

La primera parte indica Género, y se escribe la inicial con mayúscula.


La segunda parte indica la especie y toda se escribe en minúscula.
El nombre completo lleva ambos elementos “Género especie”.
Si al escribir el nombre de un microorganismo se hace de la siguiente forma: Escherichia
sp, Bacillus sp, Candida sp, se indica que es una especie no identificada de ese género y
que toda la cepa pertenece a esa misma especie. En esta situación se habla de un cultivo
puro.
Cuando el nombre aparece como Bacillus spp, se quiere decir que son varias especies del
género Bacillus. Aquí se presentan dos opciones.
Una es que se habla de un cultivo mixto, en donde hay varias especies del mismo género.

La otra opción se refiere al conjunto de especies de ese género, sin que estén en el
mismo lugar físico.
Si se usa computadora se pone en cursiva, en máquina de escribir se subraya al
igual si se escribiera en manuscrita.

Computadora Máquina de escribir Manuscrita

Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus

El uso de abreviaturas debe hacerse con mucho cuidado y contextualizando al


microorganismo, ya que puede causar confusiones como:

E. coli (bacteria) Escherichia coli E. coli (protozoario) Entamoeba coli