Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
•STRUKTUR MIKROBA
(PROKARIOT, FUNGI DAN
VIRUS)
I.PENDAHULUAN
• Pengertian Sel :
•
• Sel merupakan unit terkecil organisme hidup
• Sel adalah satuan struktural organisme hidup
• Sel adalah satuan fungsional dalam organisme hidup
• Sel merupakan kesatuan hereditas yang terkecil
• Sel berasal dari perkataan :
• kytos = ruang kosong (bahasa Yunani)
• cella = ruang kosong (bahasa Latin)
1. Sejarah Perkembangan biologi sel
• Robert Hooke (1635-1703) >> seorang sarjana botani
Inggris mengamati suatu lapisan gabus di bawah
mikroskop. Lapisan gabus tersebut dibangun rongga-
rongga kecil diberi nama cellula = kamar kecil
• Marcello Malpighi dan Nehmian Grew(1688-1694)
>> mengamati sel tanaman >> ruang kecil (utricles /
sacs/vesicles
• A.V. Leeuwenhoek (1632-1723) >> discovered the
animacules, Prtozoa, bactera etc.
• Mirabel (1808) >> reported that plants consist of
membranous cellular tissues.
• J.B. Lamarck (1809) >> stated that in the living
organisms the cell has certain important functions.
• R.J.H. Dutrochet (1824) >> showed that all animals and
plants composed of cells and these cells remain united by
simple adhesive forces.
• Turpin (1826) >> reported the occurrence of cell division
• R.Brown (1828) >> reported brown movement in cellular
particles.
• Schleiden and Schwan (1838) >> all living things are
composed of cells >> teori sel
• J.E. Purkinje (1840) >> named the cell contens as
protoplasm.
• Rudolf Virchow (1855) >> Omnis cellula e cellula >> all cells
came from cells.
• Schaltze (1861) >> said that the cell is a living substance
which processes a nucleus and cell membranne. He used
the term protoplasm for the living substances of cell
and stated protoplasm as “physical basis of life”
• Waldeyer (1863) >> reported the utility of haematoxylin
in staining the chromosomes of cell.
• G. Mendel (1865) >> discovered principles of genetics.
• Benda (1898) >> named the mitochondrion.
• G. Golgi (1898) >> described the golgi complex in nerve
cells.
• Strasburger (1901) >> introduced the term
plasmodesmata.
• F. Meves (1904) >> demonstrated the presence of
mitochondria in plant cell.
• M.Knoll and E. Ruska (1932) >> Produced first electron
microscope.
Cell Theory
All living things are made up of cell(s)
Cells are smallest living unit of structure
and function for all organisms
All cells arise from preexisting cells
(No spontaneous generation)
Sizes of living things
• I I. Struktur Umum Sel
• A. Sel prokaryotik >> Bakteri , Ganggang biru ,
PPLO (the pleuropneumonia like organisms)
• Hans Ris >> pro = sebelum
• karyon = inti
14
Protection
15
Bacterial Structure
PLASMIDS
16
Bacterial Structure
17
Bacterial Structure
18
STRUKTUR DASAR BAKTERI
Staphylococcus Bacterial
21
Useful Bacteria
• Some
bacteria can
degrade oil
• Used to
clean up oil
spills
22
DINDING SEL BAKTERI
Dinding sel tersusun dari peptidoglikan yaitu
gabungan protein dan polisakarida
(ketebalan peptidoglikan membagi bakteri
menjadi bakteri gram positif bila
peptidoglikannya tebal dan bakteri gram
negatif bila peptidoglikannya tipis).
GAMBAR DINDING SEL BAKTERI
MEMBRAN PLASMA
Membran plasma adalah membran yang menyelubungi
sitoplasma. Membran plasma atau plasmalemma pada bakteri
merupakan lapisan hialin yang tersusun atas lapisan
fosfolipid dan protein. Membran plama terletak di bagian
dalam dinding sel.
SITOPLASMA
• Sitoplasma adalah cairan sel. Di dalam sitoplasma
terdapat nukleoid yang merupakan pusat
pengatur aktivitas sel bakteri. Sitoplasma juga
mengandung ribosom, sitosol, dan terkadang
plasmid.
• Ribosom adalah organel yang tersebar dalam
sitoplasma, tersusun atas protein dan RNA.
• Granula penyimpanan, karena bakteri
menyimpan cadangan makanan yang dibutuhkan.
• Plasmid
• Selain memiliki DNA kromosom, bakteri juga memiliki
DNA nonkromosom. DNA nokromosom bentuknya juga
sirkuler dan terletak di luar DNA kromosom. DNA
nonkromosom sirkuler ini dikenal sebagai plasmid.
Ukuran plasmid sekitar 1/1000 kali DNA kromosom.
Plasmid mengandung gen-gen tertentu misalnya gen
kebal antibiotik, gen patogen. Seperti halnya DNA yang
lain, plasmid mampu melakukan replikasi dan
membentuk kopi dirinya dalam jumlah banyak. Dalam
sel bakteri dapat terbentuk 10-20 plasmid.
Struktur Tambahan Bakteri
35
GAMBAR FLAGELUM
37
LETAK FLAGELUM PADA BAKTERI
Pengelompokan bakteri berdasarkan letak flagella pada
sel bakteri adalah sebagai berikut:
• Atrik, jika tidak memiliki flagelum
• Monotrik, jika flagellum hanya terdapat pada salah
satu ujung bakteri
• Lopotrik, jika flagella hanya melekat pada salah satu
ujung sel bakteri
• Amfitrik, jika flagella melekat pada kedua ujung bakteri
• Peritrik, jika flagella tersebar di seluruh permukaan
tubuh sel bakteri
Flagella
• Made of Flagellin
• Used for Classification
• Monotrichous: 1 flagella
• Lophotrichous: tuft at one end
• Amphitrichous: tuft at both ends
• Peritrichous: all around bacteria
39
GAMBAR PENGELOMPOKAN BAKTERI
BERDASARKAN FLAGELLUM
Monotrichous Lophotrichous
Amphitrichous Peritrichous 41
Question:
What is this type of bacteria ?
42
PILUS DAN FIMBRIA
Pilus dan fimbria adalah struktur berbentuk
seperti rambut halus yang menonjol dari
dinding sel, pilus mirip dengan flagelum
tetapi lebih pendek, kaku dan berdiameter
lebih kecil dan tersusun dari protein dan
hanya terdapat pada bakteri gram negatif.
Fimbria adalah struktur sejenis pilus tetapi
lebih pendek daripada pilus. Fungsi fimbriae
adalah sebagai alat untuk menempel pada
substrat atau inang bakteri.
Pilli = Fimbria = Microfibril
Keluar dari dinding sel
Terdiri dari : protein pillin
Ukuran lebih kecil, lebih pendek, dan jumlah lebih
banyak dari flagel
Sebagai alat untuk melekat pada permukaan sel host
Pilli = sex pilli = perlu utk konjugasi
Contoh : Proteus spp.
Pili in Conjugation
45
GAMBAR PILI
Transfer gen resistensi melalui pili seks
KAPSUL
Lapisan penutup sel bakteri lapisan lendir/mukoid
Berasal dari sekresi sel bakteri
Fungsi : virulensi bakteri
Terdiri dari polisakarida
Contoh :
- Klebsiella pneumoniae
- Pneumococcus (Strep. pneumoniae)
• Klorosom (fikobilosom) adalah struktur yang
berada tepat dibawah membran plasma dan
mengandung pigmen klorofil dan pigmen
lainnya untuk proses fotosintesis. Klorosom
hanya terdapat pada bakteri
yang melakukan fotosintesis.
• Vakuola gas terdapat pada bakteri yang hidup
di air dan berfotosintesis.
SPORA
Endospora adalah bentuk istirahat (laten) dari
beberapa jenis bakteri gram positif dan
terbentuk didalam sel bakteri jika kondisi tidak
menguntungkan bagi kehidupan bakteri.
Endospora mengandung sedikit sitoplasma,
materi genetik, dan ribosom. Dinding
endospora yang tebal tersusun atas protein
dan menyebabkan endospora tahan terhadap
kekeringan, radiasi cahaya, suhu tinggi dan zat
kimia.
Pembentukan spora dimulai dengan timbulnya
daerah bening di dekat salah satu ujung bakteri.
Lambat laun daerah tersebut semakin keruh dan
mulai membentuk permukaan spora. Spora yang
dibentuk di dalam sel disebut endospora dan
spora yang dibentuk di luar sel disebut eksospora.
Jika keadaan lingkungan kembali baik, spora akan
tumbuh menjadi individu bakteri. pertumbuhan
bakteri tersebut dimulai dengan meresapnya air
ke dalam spora. kemudian, spora mengembang
dan kotak spora menjadi retak.
Gambaran spora
GAMBAR SPORA
BENTUK BAKTERI
BENTUK COCCUS
• Kokus (Coccus) dalah bakteri yang berbentuk bulat seperti
bola, dan mempunyai beberapa variasi sebagai berikut:
• Mikrococcus, jika kecil dan tunggal
• Diplococcus, jka bergandanya dua-dua
• Tetracoccus, jika bergandengan empat dan membentuk
bujursangkar
• Sarcina, jika bergerombol membentuk kubus
• Staphylococcus, jika bergerombol
• Streptococcus, jika bergandengan membentuk rantai
58
59
Staphylococcus
60
Diplococcus
61
BENTUK BASIL (BATANG)
• Basil (Bacillus) adalah kelompok bakteri yang
berbentuk batang atau silinder, dan mempunyai
variasi sebagai berikut:
• Diplobacillus, jika bergandengan dua-dua
• Streptobacillus, jika bergandengan membentuk
rantai
Bacillus - E. coli
63
Streptobacilli
64
BENTUK SPIRIL
• Spiril (Spirilum) adalah bakteri yang berbentuk
lengkung dan mempunyai variasi sebagai berikut:
• Vibrio, (bentuk koma), jika lengkung kurang dari
setengah lingkaran
• Spiral, jika lengkung lebih dari setengah lingkaran
Spirillum
66
Spirochetes
67
Leptospira
68
CYANOBACTERIA
Cyanobacteria atau ganggang biru-hijau adalah
filum (atau "divisi") bakteri yang mendapat
energi melalui fotosintesis. Jejak fosil
cyanobacteria telah ditemukan sejak 3,8 miliar
tahun lalu. Cyanobacteria sekarang adalah
salah satu kelompok terbesar dan terpenting
bakteri di bumi.
PIGMEN CYANOBACTERIA
• Pigmen yang terdapatpada cyanobacteria adalah
Fikosianin dan Fikoeritrin, secara kesatuan
disebut Fikobilin.
• Fikoeritrin ialah pigmen merah yang membuat
Cyanobacteria berwarna merah atau coklat.
• Cyanobacteria juga memiliki klorofil dan
karatenoid yang terletak didalam lamela
fotosintetis(kantong pipih).
• Sedangkan fikobilin terletak didalam butiran
(granula) dan diantara lamela fotosintesis.
BENTUK CYANOBACTERIA
• Cyanobacteria termasuk uniselular, koloni, dan
bentuk filamen. Beberapa koloni filamen memiliki
kemampuan untuk berdiferensiasi menjadi tiga
tipe sel yang berbeda: sel vegetatif adalah yang
normal, sel fotosintesis pada kondisi lingkungan
yang baik, dan tipe heterokista yang berdinding
tebal yang mengandung enzim nitrogenase.
• Cyanobacteria tidak memiliki flagela. Mereka
bergerak dengan meluncur sepanjang
permukaan.
• Terdiri dari satu sel, bersel banyak (koloni)
• Mempunyai pelindung bagian luar, terdiri dari
gelatin atau lendir.
• Dinding sel disusun oleh lipoprotein,
lipopolisakarida dan mukoprotein.
• Sitoplasma tidak mempunyai RE, Golgi
kompleks, mitokondria, lisosom.
• Mempunyai ribosom 70 S
• Mengandung pigmen karetonoid, khlorofil dan
pigmen lain seperti pikobilin (fikosianin dan
fikoeritrin)
a) nostoc: cyanobacteria berbentuk koloni bola
lendir yang menyatu menyerupai kalung rantai
tunggal
b) anabaena: cyanobacteria yang mirip nostoc, tapi
bersimbiosis dengan akar tumbuhan
c) Gloeocapsa: Sel nya berbentuk bulat hingga oval
dengan warna hijau dan biru tersebar di sekitar
dinding selnya.
d) Oscillatoria, berbentuk filamen dengan bentuk
menyempit dan tersusun oleh sel yang berbentuk
cawan.
e) Rivularia, merupakan genus Cyanobacteria yang
berbentuk cambuk.
GAMBAR CYANOBACTERIA
PPLO (the pleuropneumonia like organisms
misellium
Granula glikogen
Vakuola
Sitoplasma
Enzim
Absorbsi
makanan
Septum Pori
Nukleus
96
What are Viruses?
• A virus is a non-
cellular particle made
up of genetic material
and protein that can
invade living cells.
97
Viral History
98
VIRUS
• Ciri-ciri virus (Campbell,1998:325):
• 1. hanya dapat hidup dan memperbanyak diri di dalam
sel hidup organisme lain
• b. untuk bereproduksi, virus hanya memerlukan asam
nukleat
• c. virus dibentuk oleh sebuah partikel yang disebut
virion yang mengandung DNA atau RNA saja
• d. Dapat dikristalkan tetapi virus tsb msh memiliki daya
patogen apabila diinfeksikan ke organisme hidup
• e. bersifat aseluler (tidak memiliki sel) dan tdk pnya
organel sel