Tecnologia do DNA Barcode

Dra Denise Correa Benzaquem

Pós Doc Programa de Biotecnologia e Recursos Naturais -UEA
 Que aranha lhe
picou???

Carl Linneaus, 1735 sistema de nomeação e classificação

Taxônomia
 Classificacao Visual
 Algumas espécies distintas não são fáceis de
diferenciar visualmente...

ou
 Mudanças Climáticas e a extinção de espécies

Compreender os
ecossistemas e monitorar
as mudanças climáticas
Através do código
de barras de DNA, a
biotecnologia ajudou a
preencher uma lacuna
deixada pela
taxonomia clássica.
 A proposta
CÓDIGO DE BARRAS DA VIDA: Uma seqüência curta de DNA com
localização uniforme nos genomas utilizada para identificar espécies.

pesquisador canadense Paul Herbert

New Scientist, 26 June, 2004 e sua equipe da Universidade de Guelph
DNA barcode é uma abordagem padronizada para identificação de plantas
e animais por mínimas seqüência de DNA, chamado DNA barcode

Gene Citocromo Oxidase I (CO1)

Projeto de Identificação Global
‘E a maior iniciativa de genômica da biodiversidade já realizada.

► 5 anos

► 5Milhoes especimes

► 500mil espécies
Desafio do iBOL 10Mi especimes, 100Mil espécies
Official launch of iBOL – CN Tower, Toronto, September 25, 2010
 Comunidades de DNAs barcode

Redes, projetos, organizações

• promover a producçao de
Barcodes
• Construir parcerias
• trabalhar em grupo
• Padronização
• Conferências
internacionais
• aumento do banco público
de sequencias
105 Intituições
colaboradoras
Link do GenBank para o BOLD
Linke do GenBank para os Museus
Porque COI??
The Mitochondrial Genome
 Está presente em todos os Small ribosomal RNA
D-Loop
organimos que utilizam energia
Cytochrome b
Taxa de mutação mais
elevada que o genoma nuclear, ND6
ND1

resultando em maior
variabilidade genética entre
espécies
 Herança materna menor
ND5
COI ND2

L-strand
diversidade entre mesma H-strand
espécie ND4
Sequenciemento direto ND4L
Sequencia curta pode ser ND3
COII
COIII
amplificada por PCR ATPase subunit 8
ATPase subunit 6
Baixo custo
Padronização da técnica
Questão de Padronização

• O objetivo é permitir que qualquer pessoa, em qualquer lugar, a

qualquer momento possa identificar rapidamente e com precisão
a espécie de um determinado espécimen em qualquer condição de
preservação.
Componentes do projeto DNA barcode
 Aplicações do DNA barcode

Identificação de espécies em estagio larval

Vetores de doenças
Fiscalização Ambiental
Segurança alimentar
Diferenciar espécies crípticas
Complexa identificação
Metabarcoding é um método rápido de avaliação da biodiversidade que
combina duas tecnologias: identificação baseada em DNA e
sequenciaamento de DNA de alto rendimento.
 Nem tudo são flores ...

 Nenhum gene irá funcionar para todos os taxa (por

exemplo, COI não é apropriado para plantas
vasculares, ou mesmo para alguns animais).
 A abordagem de um gene é menos precisa do que usar
múltiplos genes
 Não funciona para grupos com pouco diversidade
genética
 Não resolução entre espécies com divergência
recente.
 Híbridos não garante a correta identificação de
híbridos
 Simples & Ambicioso !
Defensores Opositores

ID todas as espécies Não funciona

Descobrir Destrói a
novas sitemática
espécies tradicional

Velocidade na ID Serve a indústria

Revitalizar as coleções Falsa Taxônomia

Desejo para futuro...

• O código de barras do DNA cria uma linguagem

comum para que os cientistas trabalhem juntos
e compreendam a biodiversidade.
Gostaria de ver no futuro...

 Dados gerados em
segundos

 Receber para deposito

de sequencia

 Um GPS taxonômico
usado por todos
Obrigada!