FUNDAMENTOS Y ENSEÑANZA DE LA FÍSICA Y LOS SISTEMAS DINÁMICOS

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

Universidad de Antioquia

En busca de un modelo dinámico del

acortamiento telomérico

Ricardo L. Posada Castrillón

2017

Universidad de Antioquia www.udea.edu.co FCEN

 El problema del acortamiento de los
telómeros
• https://www.youtube.com/watch?v=hszZXlNY9Wc

• El acortamiento es producto no solo de efectos externos sino que es un resultado propio del
mecanismo de replicación del DNA.
La acumulación generacional

Generación (n) daño máximo (d)

0 0

1 1

2 1

3 2
 Una fórmula de recurrencia

• Ejemplo :
𝑆𝑖 𝑑 = 1 𝑦 𝑛 = 1

𝑁1 2 ∗ 1 = 𝑁0 2 ∗ 1 + 𝑁0 2 ∗ 1 − 1

𝑁1 2 = 𝑁0 2 + 𝑁0 1

𝑁1 2 = 0 + 0 = 0

* El número de células en la generación 1 con 1 deleción en

ambas cadenas es igual a 0.
Prediciendo la primera generación
𝑁1 2 ∗ 1 − 1 = 𝑁0 2 ∗ 1 − 1 + 𝑁0 2 ∗ 1 − 2

𝑁1 1 = 𝑁0 1 + 𝑁0 0

𝑁1 1 = 0 + 1 = 1

𝑁1 ∗ (1) = 𝑁1 2 ∗ 1 + 𝑁1 2 ∗ 1 − 1

𝑁1 ∗ 1 = 𝑁1 2 + 𝑁1 1

𝑁1 ∗ 1 = 0 + 1 = 1
Telomerasa o TRF2 ??
Reacción y constantes
• f : TRF2 libre
• m : repeticiones teloméricas en la
célula.
• Kf : Constante de la reacción hacia la
Formación de complejo.
• Kr : Constante de la disociación del
complejo.
• Eb : Barrera energética entre reactivos
y productos.
• Em: Estado de energía del telómero
aislado.
• Ec: Estado de energía del complejo.
• KbT : Producto de la Constante de
Boltzmann por la temperatura.
Modelo y Punto fijo
• M : Total de repeticiones
F : Total de TRF2

K’ : Constante global de
reacción.

• Algún otro punto fijo ??

• Alguna manera de conocer

las constantes ?

• Como incluir otros factores

y su dinámica con sus
propias constantes ?
La probabilidad de unión

Incorporando la solución del punto

fijo como la esperanza de
supervivencia se modela de nuevo.

Pn : Proporción de células viables

para el modelo de un cromosoma.
 Modelando las constantes

• Em :La Energia asociada al estado de las repeticiones libres se simboliza como beta y es una
constante que depende del tipo de célula y e la especie.

• Ec: La energía del complejo se supone proporcional a al perdida de telómero, bajo una
constante de proporcionalidad alfa.

• Lm: La perdida de telómero a su vez es una función propia de la especie y el tipo de célula, en
particular de :

• r: la tasa a la que se pierde el telómero,

• d: definida ya como el numero limite de deleciones y

• Zo: La longitud inicial de las repeticiones teloméricas con las cuales cuenta el cromosoma.

• Constricción termodinámica :
El Ajuste experimental
Ajuste del Modelo

Arino et al 1992
Un modelo para varios cromosomas
• P (MC):
NUMERO DE
CROMOSÓMAS
DICENTRICOS
 Propuestas
• Revisar la literatura para encontrar factores importantes involucrados en el proceso que
puedan incorporarse al modelo.
-telomerasa
-proteínas de empalme
-confrontar los diferentes Zo , r y demás datos dados en el artículo.

• Integrar el efecto del estrés oxidativo y otros factores ambientales de manera mas formal en
sus diferentes mecanismos, con su propia función y no solo variando el valor de r.

• Reformular la expresión para los daños observados en cada uno de los 4 regiones
telomericas, en forma de matriz con el fín de analizar no solo el daño máximo que estudia el
articulo sino todos los presentes, para ello es posible evolucionar las formulas de recurrencia
de cada componente y mirar su expresión a gran largo plazo mediante el uso de cadenas de
Markov. De esta manera es posible evaluar si es el daño máximo quien explica toda la
variabilidad de la variable viabilidad.

• Adaptar los anteriores análisis para 23 pares de cromosomas, dado que las tasas y longitudes
telomericas se usaron en el modelo Homo sapiens.
Gracias