MARCO ANTONIO GALARZA GONZALEZ 1741080 JONATHAN ALEXIS SILVA RANGEL 1735515 • Las variaciones de el DNA sobre la VARIACIONES doble hebra mantienen la forma EN LA DOBLE general de la estructura genética, pero HEBRA tienen ciertas diferencias que las hacen distintas. FORMA A • Esta forma surge a partir de la deshidratación de la estructura de B-DNA original por debajo de un 75% de humedad. • No se ha encontrado bajo condiciones fisiológicas, pero si en disoluciones deshidratantes. • Es mas corta, mas ancha y con mas bases por vuelta que el B-DNA FORMA Z • A diferencia de las estructuras A-DNA y B-DNA, la Z-DNA, gira hacia el lado izquierdo • Se descubrió accidentalmente en 1970, pero solo en 2018 se descubrió que causaba la transformación, siendo el uso de la proteína hZαADAR1. • Se cree que tiene funciones de expression genetica y replicacion en los seres vivos, pero esto es debatido. • Es mas estrecha, mas larga y con mayor numero de bases por vuelta a comparación de B-DNA. A-DNA B-DNA Z-DNA Sentido de giro Dextrogiro Dextrogiro Levogiro (Derecha) (Derecha) (Izquierda) Anti: Bases nitrogenadas Forma y tamaño Mas ancha, mas Intermedia Mas estrecha y orientadas corta larga alejadas del Diámetro de hélice 2,55 nm 2,37 nm 1,64 nm anillo de Distancia entre 0,23 nm 0,34 nm 0,38 nm pentosa bases Sin: Solo las Pares por vuelta 11 10,4 12 piramidinas Longitud de vuelta 25,3 nm 34,6 nm 4,56 nm se alejan, las de hélice purinas sobre Inclinación de las 19º 1,2º 9º la pentosa pares de bases Surco mayor Estrecho, profundo Ancho, Plano, sin profundidad media profundidad Surco menor Amplio, no Estrecho, Estrecho, profundo profundo profundidad media Enlace N-glicosidico Anti Anti Sin CURVATURA DE LA DOBLE HÉLICE • En secuencias los pares de bases no son VARIANTES exactamente coplanares, lo que LOCALES DE LA ocasionaría una desviación del eje de la ESTRUCTURA doble hélice.
SECUNDARIA • La curvatura no se origina por una
secuencia particular de nucleótidos, DEL B-DNA sino que es forzada por la unión de una proteína a la cadena de DNA. SECUENCIAS PALINDRÓMICAS • Son regiones en el DNA en donde la secuencia de una hebra es leída de izquierda a derecha, es igual que la de la otra hebra, leída de derecha a izquierda.
• Son llamados palíndromos interrumpidos
donde una secuencia separa las dos mitades del palíndromo y actúa como el centro de simetría no puntual. REPETICIONES DE SECUENCIA • Repeticiones invertidas: cuando se leen en sentidos opuestos, las dos mitades tienen la misma secuencia.
• Repeticiones directas: cuando en el DNA
hay repetición de secuencia leída en el mismo sentido.
• Repeticiones especulares: cuando la
secuencia se repite de forma invertida dentro de la misma hebra. FUNCIONALIDAD DE LOS PALINDROMOS • Actúan como señales de reconocimiento a las que se unen numerosas proteínas reguladoras, con estructuras diméricas que permiten unirse de forma simétrica a ambas mitades del palíndromo. CONSECUENCIAS ESTRUCTURALES DE LOS PALÍNDROMOS • En ácidos nucleicos de hebra sencilla: la hebra sencilla de DNA o RNA pueden plegarse sobre sí mismas formando una estructura en horquilla. • En DNA de doble hebra: las hebras del palíndromo pueden separarse y reasociarse de orta forma, dando lugar a horquillas o crucuformes (dos bucles). H-DNA: TRIPLE HÉLICE
• En condiciones normales, las secuencias se
encuentran apareadas sin alteración en la doble hélice.
• Parte de la doble hélice se abra y la región rica en
C y T se repliegue y aparee con la otra hebra (AG) mediante enlaces de Hoogsteen en una zona donde aún forma doble hélice. MOTIVOS • Un motivo es una secuencia de ESTRUCTURALES aminoácidos como una proteína, que RESPONSABLES se asocia con una cierta función y que DE LA UNIÓN DEL esta conservado en secuencias de DNA CON PROTEINAS aminoácidos o DNA. MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE (HTH)
• Se encuentra en proteínas reguladoras de la expresión genética
en virus, procariotas y eucariotas. Regulan la transcripción en bacterias y virus.
• Esta formado por dos segmentos de péptidos en el α-hélice
separados por una secuencia de aminoácidos flexible. Una de las α-helices se encaja en el surco mayor del DNA y la otra α-hélice se una al lado opuesto de le hélice de DNA de la misma manera. Esto da una estructura en un ángulo casi perpendicular. MOTIVO HÉLICE-BUCLE-HÉLICE
• Cuenta con dos segmentos α-hélice, sin embargo, el péptido
que los une es mas largo a diferencia de HTH, esto le da mayor flexibilidad y mas posibilidades de orientación mutua.
• Los motivos HLH (Helix – loop – hélix), se pueden asociar
entre si, creando proteínas dimétricas.
• Un ejemplo famoso es la proteína Max del ratón.
MOTIVO HOMEODOMINIO
• Se puede considerar como una ampliación de HTH,
pero aparece repetidamente con una estructura idéntica en distintas proteínas a diferencia de HTH. Además de las dos α-helice similares a la de HTH, existe una tercera hélice cuyos aminoácidos interactúan directamente con el DNA.
• Regula el desarrollo embrionario y se ha estudiado
muy a fondo en moscas de Drosophila. MOTIVO DEDO DE ZINC • Se encuentra en multitud de proteínas eucarióticas que se unen al DNA. Son importantes para el funcionamiento de transcripción TFIIIA y el receptor de estrógenos.
• Esta formado por 30 aminoácidos, de las cuales 2 son
cisteínas y 2 son histidinas que aparecen en posiciones constantes coordinadas tetradicamente por un ion Zn+2. Esto permite la unión a la cadena peptídica.
• Generalmente la forma del motivo es tridimensional
alargada en forma de dedo. MOTIVO CREMALLERA DE LEUCINA • Una región de la proteína cuya secuencia tiene un residuo de leucina cada 7 aminoácidos.
• Dos cadenas peptídicas de este tipo se asocian
hidrofobicamente intercalando sus restos de leucina similarmente a una cremallera.
• Estas estructuras son de función reguladora para