ROL BIOLÓGICO DE LAS PROTEÍNAS

- Estrutural
- Receptores
- Unión celular
- Hormonas
- Defensa
- Transporte
- Canales iónicos
- Marcadores
- Movimiento
- Reserva
- Enzimas
 COLÁGENO

UNIONES POR PUENTES DE Lys

300 x 1,5 nm
Gly-X-Y (Gly.Pro.HidroxiPro)
RECEPTOR DE INSULINA
 UNIÓN CELULAR
ADHERENS JUNCTION (zonula adherens)
INSULINA
ANTICUERPOS
HEMOGLOBINA
CANAL DE SODIO
UBIQUITINA
- en células eucariotas
- muy conservadas
- 76 aa
- 8,6 kDa
MIOSINA
 OVOALBUMINA
- 386 aa, 8 aa esenciales, 45 kDa, pI 4.5
- 4 lugares glicosilados
- rica en Cys, Met
- 1 puente disulfuro
- 30% de homología con serpinas (inhibidores de proteasas)
- 3 formas electoforéticas: defosforilada, monofosforilada y difosforilada (Ser68 y Ser344)

10 20 30 40 50 60
MGSIGAASME FCFDVFKELK VHHANENIFY CPIAIMSALA MVYLGAKDST RTQINKVVRF
70 80 90 100 110 120
DKLPGFGDSI EAQCGTSVNV HSSLRDILNQ ITKPNDVYSF SLASRLYAEE RYPILPEYLQ
130 140 150 160 170 180
CVKELYRGGL EPINFQTAAD QARELINSWV ESQTNGIIRN VLQPSSVDSQ TAMVLVNAIV
190 200 210 220 230 240
FKGLWEKAFK DEDTQAMPFR VTEQESKPVQ MMYQIGLFRV ASMASEKMKI LELPFASGTM
250 260 270 280 290 300
SMLVLLPDEV SGLEQLESII NFEKLTEWTS SNVMEERKIK VYLPRMKMEE KYNLTSVLMA
310 320 330 340 350 360
MGITDVFSSS ANLSGISSAE SLKISQAVHA AHAEINEAGR EVVGSAEAGV DAASVSEEFR
370 380
ADHPFLFCIK HIATNAVLFF GRCVSP
ENZIMAS
 BREVE HISTORIA DE LAS ENZIMAS
- 1860, Pasteur: la fermentación alcohólica depende de
células vivas.

- 1876, Kuhne propone el nombre enzima (gr. ενζυμον

"en levadura“).

- 1897, Buchner muestra que las enzimas pueden

extraerse activas de las levaduras, (Nobel, 1907).

- 1926, Sumner: cristaliza la ureasa y demuestra que es

una proteína. En 1937 hace lo mismo con la catalasa.

- 1930, Northrop demuestra que las enzimas digestivas

son proteínas, (Nobel 1946, con Sumner).
¿TODAS LAS ENZIMAS SON PROTEÍNAS?

Sidney Altman Thomas Cech

(Premio Nobel de Química 1989)
 LA RIBONUCLEASA P
PROCESA EL PRE-RNAt

5´
ESTRUCTURA DE LA RIBONUCLEASA P
RNA P: 377 n (140 kDa)

Proteína P:119 aa (14 kDa)

PROTEÍNA P, NO CATALIZA

RNA P, SI CATALIZA
PROCESAMIENTO DEL PRE-RNAr DE Tetrahymena termophilus

El pre rRNA 35S de este

ciliado, in vitro, origina
de manera autónoma,
un rRNA 26S y un corto
intrón de 400 bases.
 ENZIMAS
• Biocatalizadores
• Se unen a S y lo modifican en P
• Poseen especificidad
• Actúan en condiciones suaves de pH y temperatura
EL SITIO ACTIVO DE UNA ENZIMA
 RIBONUCLEASA PANCREÁTICA
Tiene 124 aa, 4 puentes S-S, en sitio activo hay His 12, Lys 41, His 119
AMINOÁCIDOS DE SITIO ACTIVO
LAS ENZIMAS AL UNIRSE AL SUSTRATO SUFREN
CAMBIOS CONFORMACIONALES
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
Clase 2: TRANSFERASAS
Clase 3: HIDROLASAS
Clase 4: LIASAS
Clase 5: ISOMERASAS
Clase 6: LIGASAS
Distribución de las
enzimas conocidas
LAS ENZIMAS ACELERAN LAS REACCIONES QUÍMICAS
PORQUE DISMINUYEN LA ENERGÍA DE ACTIVACIÓN
EFECTO DEL pH
EFECTO DE LA TEMPERATURA
 EFECTO DE LOS COFACTORES
Los cofactores pueden ser:

IONES

COENZIMAS (derivados vitamínicos)

HOLOENZIMA = APOENZIMA + COFACTOR (grupo prostético)

LAS COENZIMAS DERIVAN
DE LAS VITAMINAS
LA VITAMINA B1 ES EL PRECURSOR DE
LA TIAMINA PIROFOSFATO

La TPP (forma activa de la vit. B1), se forma por acción de la TPP sintetasa.
LA NIACINA SE REQUIERE PARA LA
SÍNTESIS DE NAD+

Pelagra
ESPECTRO DE ABSORCÓN DEL
NAD+ Y NADH
 BIOTINA

Vitamina H o B8: es un cofactor de las enzimas que participan en

reacciones de descarboxilación.
 ÁCIDO FÓLICO Y
FORMACIÓN DE THF

ÁCIDO FÓLICO O VITAMINA B9

VITAMINA C
LA CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO AFECTA
LA VELOCIDAD ENZIMÁTICA
LA VELOCIDAD ENZIMÁTICA ES MÁXIMA
CUANDO LA ENZIMA ESTÁ SATURADA
VELOCIDAD DE UNA REACCIÓN ENZIMÁTICA

V = K2 ES
ECUACIÓN DE MICHAELIS - MENTEN

v = K2 ES
VELOCIDAD DE UNA REACCIÓN ENZIMÁTICA

v = Vmax S
Km + S
ECUACIÓN DE LINEWEAVER - BURK
EL Km NOS DA UNA IDEA DE LA AFINIDAD DE
LA ENZIMA POR EL SUSTRATO

ENZIMA AMILASA Km (M) AFINIDAD

A 2x 10-4 MENOR

B 4x 10-6 MAYOR

Km alto indica baja afinidad de E por S

Km bajo indica alta afinidad de E por S
INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
TIPOS DE INHIBICIÓN ENZIMÁTICA

INHIBICIÓN REVERSIBLE
- INHIBICIÓN COMPETITIVA
- INHIBICIÓN NO COMPETITIVA
- INHIBICIÓN ACOMPETITIVA

INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
INHIBICIÓN COMPETITIVA
INHIBICIÓN COMPETITIVA
INHIBICIÓN NO COMPETITIVA
INHIBICION NO COMPETITIVA
INHIBICIÓN ACOMPETITIVA
INHIBICIÓN ACOMPETITIVA
 INHIBICIÓN IRREVERSIBLE

DIISOPROPIL
FLUOR
FOSFATO
(DFP)

FENIL METIL SULFONIL FLUORURO (PMSF)

PM = 174.19
 TPCK = TOSYL PHENYLALANYL
TLCK = TOSIL LISIL CHLOROMETHYL KETONE
CLOROMETIL CETONA

PM = 232.8
IODOACETATO

Inhibición de G3PDH
 PEPSTATIN

Hexapéptido: Iva-Val-Val-Sta-Ala-Sta
MERCAPTOETANOL
EDTA
TETRAETHYLENEPENTAMINE
ENZIMAS REGULADORAS
- ENZIMAS ALOSTÉRICAS
- ENZIMAS REGULADAS POR MODIFICACIÓN COVALENTE
- ENZIMAS REGULADAS POR PROTEOLISIS
- ISOENZIMAS
- ENZIMAS REGULADAS POR PROTEÍNAS MODULADORAS
 - Oligoméricas
ENZIMAS ALOSTÉRICAS - Sitio alostérico
- Moduladores (+) y (-)
 INHIBICIÓN
FEEDBACK,
RETROINHIBICIÓN
O INHIBICIÓN POR
PRODUCTO FINAL
Treonina deshidratasa tiene 4
subunidades, cada una con lugares de
unión para el sustrato y el modulador
negativo.
LA FOSFOFRUCTOKINASA ES UNA ENZIMA
ALOSTÉRICA QUE REGULA LA GLICOLISIS

- Es tetramérica
- C/ subunidad con sitios de unión para ATP, F6P y
el regulador.
- Moduladores positivos: ADP, AMP, F2,6DP
- Moduladores negativos: ATP, CITRATO
- 85 kDa (hombre), 50kDa (Trypanosoma brucei).
ASPARTATO TRANSCARBAMILASA

2 subunidades catalíticas (c3)

3 sububidades regulatorias (r2)

Es un dodecámero (c3)2 (r2)3.

CTP (modulador negativo)

ATP (modulador positivo).
ENZIMAS REGULADAS POR MODIFICACIÓN
COVALENTE (FOSFORILACIÓN)
ACCIÓN DE LA GLUCÓGENO
FOSFORILASA
 REGULACIÓN DE LA
GLUCÓGENO FOSFORILASA
OTRAS MODIFICACIONES COVALENTES
ENZIMAS ACTIVADAS POR PROTEÓLISIS
(ZIMÓGENOS / PROENZIMAS)
ISOENZIMAS
 ENZIMAS
REGULADAS POR
PROTEÍNAS
MODULADORAS
La protein kinasa dependiente
de AMPc tiene dos proteínas
moduladoras
 APLICACIONES
DE LAS ENZIMAS E
INHIBIDORES ENZIMÁTICOS
 USO DE ENZIMAS

ALFA DORNASA
DNasa que hidroliza el
exceso de ADN en las
secreciones pulmonares
del tracto respiratorio de
personas con fibrosis
quística, disminuyendo
el riesgo de infecciones .
TRATAMIENTO DE LA TROMBOSIS

UROQUINASA
(Serino proteasa de 411aa)

Degrada coágulos
de fibrina
ASPARAGINASA

Homotetrámero
C/cadena de 90 aa
USO DE INHIBIDORES
REGULACIÓN DE LA PRESIÓN SANGUÍNEA

α-2 globulina, 789 aa. se produce

principalmente en el hígado.
(Inhibidor de ECA)
 ALISKIREN
(Inhibidor de la Renina)
INHIBICIÓN DE LA AGREGACIÓN PLAQUETARIA
SÍNTESIS DE
COLESTEROL
 LOVASTATIN (MEVINOLIN)

El lovastatin fue aislado de una cepa de Aspergillus terreus

y desarrollado en Merck Sharpe and Dohme.
TERBINAFINA PARA EL TRATAMIENTO DE
ALGUNAS INFECCIONES MICÓTICAS

La terbinafina (PM=291.43) inhibe a la enzima escualeno

2-3 epoxidasa, interfiriendo con la síntesis del ergosterol,
componente fundamental de la membrana del hongo.
ACTIVIDAD DE LA PROTEASA DE HIV
INHIBIDORES DE LA PROTEASA DE HIV

PROTEASA - CRIXIVAN
 SILDENAFIL

Inhibidor competitivo de la fosfodiesterasa tipo 5

específica de GMPc.