La Spécialité de Master Drug Design

au sein de la
Mention Santé, Soins, Société
 La Mention Santé, Soins, Société

Mention Santé, Soins, Société

M1
S1 mutualisé pour toutes les spécialités de la mention
S2 sous la forme d’UE préparatoires aux différentes spécialités

Spécialité MOSM Spécialité RCEM

Management des Organisations Recherche Clinique
Sanitaires et Médico-Sociales Epidémiologique et Médicament
Spécialité Spécialité
M2 DD IESET
Parcours Parcours Parcours Parcours Ingénierie Education Santé et
Drug Design
MES MEMS DCM MRCE Education Thérapeutique
Management Management Méthodes en
Développement
des des Recherche
Clinique des
Etablissements Etablissements Clinique et
Médicaments
de Santé Médico-Sociaux Epidémiologique

Finalité Finalité Finalité Finalité Finalité Finalité

Pro Pro Pro Recherche Recherche Pro
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Admission

Entrée en M1 :

La mention Santé, Soins, Société est ouverte à tout étudiant titulaire d’un L3.
Le premier semestre de la mention est commun à toutes les spécialités qui la constituent.
Le second semestre est préparatoire au M2. Chaque spécialité propose des UE orientant l’étudiant
vers le M2 choisi.

Entrée en M2 :

Tout étudiant titulaire d’un M1 peut demander à s’inscrire directement en M2 Drug Design. Il en ira de
même des étudiants en pharmacie ayant validé leur DFASP 2 (5AHU), des étudiants en médecine
ayant validé leur deuxième cycle d’études médicales (DCEM), ainsi que des pharmaciens étrangers
diplômés.
Les demandes d’inscription en M2 Drug Design seront examinées par la commission de pédagogie de
la spécialité.
Pour tous les étudiants en pharmacie, l’obtention du M2 Drug Design validera leur DFASP3 (P6) et leur
permettra de soutenir leur thèse d’exercice.
Renseignements : Prof Patrick Dallemagne (patrick.dallemagne@unicaen.fr)
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Inscription
Entrée en M1 :
L’inscription se fait en ligne sur le site de l’Université de Caen Basse-Normandie :
http://webetu.unicaen.fr/formations-et-etudes/inscription/

Etudiants étrangers :
La procédure d’inscription nécessite en premier lieu une validation d’études : https://
gest.unicaen.fr/valid_acquis/candidat/generales.php
Et le suivi de la procédure complète détaillée sur le site de l’université :
http://webetu.unicaen.fr/formations-et-etudes/inscription/vous-venez-d-un-etablissement-etranger-
hors-union-europeenne-308602.kjsp
Ces démarches devront être accompagnés d’une demande de visa sur le site suivant
http://www.campusfrance.org/fr/

Entrée en M2 :
L’inscription est possible après validation des dossiers de candidature par la commission pédagogique
du M2R Drug Design qui se réuni en Mai. Afin d’apprécier vos dossiers les pièces suivantes devront
être transmises au responsable de la spécialité à l’adresse patrick.dallemagne@unicaen.fr :
-CV et lettre de motivation
-Relevé de notes de M1 (ou de diplômes étrangers)
-Attestation ou certificat d’obtention de diplômes étrangers
-Réussite à un test de français (étudiants étrangers)
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Programme et Organisation du M1 – Responsable A.S. Voisin
Ouverture : rentrée 2012

S1
Le S1 du M1 est commun à toutes les spécialités de la mention Santé, Soins, Société.
L’enseignement se fait en présentiel ou par Formation Ouverte à Distance (FOAD).

S2
Le choix des UE est orienté par la spécialité de M2 que les étudiants souhaiteront suivre
l’année suivante.
En ce qui concerne le parcours préparatoire à la spécialité Drug Design, les enseignements
théoriques (en présentiel) ont lieu de février à mars. Ils précèdent le stage de recherche qui a
lieu d’avril à mai
Le mémoire de stage est début juin. La soutenance a lieu à la mi-juin.
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Programme et Organisation du M1 – Responsable A.S. Voisin
Ouverture : rentrée 2012

H
M1 UE Intitulés ECTS
CM et TD
UE2 Système de santé et de protection sociale 40h 5
UE3 Introduction à la sociologie de la santé 40h 5
UE4 Introduction à l’économie de la santé 40h 5
S1 UE Anglais 40h 5
UE8 Introduction aux produits de santé 40h 5
UE9 Méthodologie générale 40h 5
Sous-total S1 240h 30
UE19 Méthodes de quantification en pharmacologie 40h 5
UE 22 Chimie du Médicament 40h 5
UE 23 Introduction à la Chimie Médicinale 40h 5
S2 Stage 2 mois - 7
Mémoire stage - 8
Sous-total S2 120h 30
*Les étudiants doivent choisir 6UE parmi une liste de 9. Les étudiants désirant s’orienter vers le M2 Drug
Design sont invités à choisir de préférence les UE figurant dans ce tableau.
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Contenu des UE du M1 (S2)
UE 19 Méthodes de quantification en pharmacologie
M1 - S2
Responsable François Dauphin

Equipe pédagogique Michel Boulouard, François Dauphin, Pascale Schumann-Bard, Valentine Bouet, Thomas Freret, Eleni Païzanis

Volume horaire total 30 h CM + 8 h TD + 2 h conférences

Objectif Acquérir la maîtrise des méthodes de pharmacométrie quantitative in vitro, ex vivo et in vivo adaptées aux
différents concepts appliqués à la découverte de nouveaux principes actifs thérapeutiques
Programme Cible des médicaments
Diversité des cibles : récepteurs, canaux, enzymes, cascades intracellulaires, ADN, ARN
Diversité et importance des effets intracellulaires
Cibles figées vs cibles plastiques
Homo- hétérodimérisation
Ligands des cibles
Agonistes entiers, partiels, inverses
Antagonistes
Agonistes biaisés
Modulateurs allostériques
Inhibiteurs et activateurs enzymatiques, substrats suicide
Méthodes quantitatives par reconnaissance
Principes des études
Technologies et méthodologies
Exemples et applications in vitro, ex vivo et in vivo
Méthodes quantitatives fonctionnelles
Principes des études
Technologies et méthodologies
Exemples et applications in vitro, ex vivo et in vivo
De la transposition in vitro/in vivo « in vivo veritas »
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Contenu des UE du M1 (S2)
UE 22 Chimie du médicament
M1 - S2
Responsable F Fabis

Equipe pédagogique Frédéric Fabis, Christophe Rochais, Thomas Cailly, Maria Pereira.

Volume horaire total 40 h (25h CM + 15h TD)

Objectif Acquérir les connaissances nécessaires à la compréhension des méthodes de synthèse et d’analyse des
molécules à propriétés thérapeutiques
Programme Stratégie de synthèse appliquée à la chimie médicinale.
Analyse rétrosynthétique et stratégie de protection des molécules polyfonctionnelles.
Analyse RMN : rappel RMN 1H ; RMN du 13C et bidimensionnelle.
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Contenu des UE du M1 (S2)
UE 23 Introduction à la Chimie Médicinale
M1 - S2
Responsable P Dallemagne

Equipe pédagogique Patrick Dallemagne, Christophe Rochais, Anne Sophie Voisin-Chiret, Valérie Collot, Ronan Bureau, Aurélie
Malzert-Fréon
Volume horaire total 40 h (25h CM + 15h TD)

Objectif Acquérir les connaissances nécessaires à la compréhension des méthodes de conception et d’obtention
de molécules à propriétés thérapeutiques
Programme Drug discovery (vue d’ensemble)
Recherche d’un hit :
Exploration règnes naturels (exemples)
Fouille de chimiothèques
Hit to lead chemistry (vue d’ensemble)
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Programme et Organisation du M2
Ouverture : rentrée 2013

S1
Les enseignements du S1 (en présentiel) ont lieu de septembre à novembre. Les examens ont
lieu en décembre.

S2
Le stage de 6 mois débute en janvier et s’achève en juin. Il a lieu dans une Unité de Recherche
reconnue par l’AERES.
La soutenance du mémoire de stage a lieu en juillet.
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Programme et Organisation du M2
Ouverture : rentrée 2013

H
M2 UE Intitulés ECTS
CM et TD

DD1 Hit-to-Lead Chemistry 40h 5

DD2 Les Produits Naturels en Chimie Médicinale 40h 5
DD3 Modélisation moléculaire 40h 5
DD4 Informatique, données, santé 40h 5
S1
DD5 1 UE à choix* 40h 5
DD6 Préparation du stage, Travail personnel - 5

Sous-total S1 200h 30

Stage 6 mois - 20

S2 Mémoire stage + soutenance - 10

Sous-total S2 - 30

* Il s’agira de préférence des UE Pharmacovigilance des essais cliniques (RM6) et Développement

préclinique (RM9) de la spécialité RCEM de la mention SSS, mais toute autre UE de cette mention ou
d’une autre mention de M2 peut-être choisie par les étudiants après accord de la commission de
pédagogie de la spécialité DD.
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Contenu des UE du M2
UE DD1 Hit-to-Lead Chemistry
M2 - S1
Responsable P Dallemagne

Equipe pédagogique Patrick Dallemagne, Marie Pierre Halm-Lemeille, Aurélie Malzert-Fréon, Christophe Rochais, Marc Since,
Anne Sophie Voisin-Chiret, Serge Mignani, Hervé Ficheux, Thierry Langer, Luc Van Hifte, Pascal George,
Thierry Cresteil
Volume horaire total 40 h (25 h CM + 15h TD + conférences)

Objectif Acquérir les méthodes de drug discovery et de hit-to-lead chemistry permettant la découverte de nouveaux
principes actifs thérapeutiques
Programme Vue d’ensemble
Aménagement fonctionnel à visée pharmacomodulatrice
Notions générales
Recherche de hits, leads et clinical candidates
Aménagement fonctionnel à visée biodisposante (modifications paramètres ADMETOX)
Lipophilien polarisabilité, passage de membranes : mesures, modulations chimiques
Prodrogues (traditionnelles et innovantes)
Modulations de la résistance au métabolisme
Exemples de hit to lead chemistry
Lead to drug candidate
Aspects pharmacotechniques
Aspects réglementaires
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Contenu des UE du M2
UE DD2 Les Produits Naturels en Chimie Médicinale
M2 - S1
Responsable V Collot

Equipe pédagogique Valérie Collot, Jérome Quintin, Elizabeth Chosson, David Garon, Claude Bensoussan, Catherine Vonthron,
Bruno David, Marie Lise Bourguet
Volume horaire total 40 h (25 h CM + 15h TD + conférences)

Objectif Acquérir les connaissances relatives à la chimie des principes actifs thérapeutique d’origine naturelle

Programme -Transformations chimiques autour de pharmacophores naturels (grandes voies de biosynthèse, synthèses
biomimétiques, hémisynthèse)
- Biotechnologies végétales et fongiques : application dans la synthèse de médicaments
- Procédés extractifs appliqués aux substances naturelles
-Des substances naturelles aux principes actifs
-Stratégies de mise en évidence de nouvelles molécules bioactives (Ethnopharmacologie, chimiotaxonomie)
- Chimie des substances naturelles d’origine marine
- Valorisation industrielle des substances naturelles et aspects réglementaires
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Contenu des UE du M2
UE DD3 Modélisation Moléculaire
M2 - S1
Responsable R Bureau

Equipe pédagogique Ronan Bureau, Jana Sopkova, Alban Lepailleur, Serge Mignani, Jonathan Essex, Thierry Langer
Volume horaire total 40 h (25h CM + 15H TD)

Objectif Acquérir des connaissances avancées dans le domaine de la modélisation moléculaire appliquée au drug
design.
Programme Analyse conformationnelle (du 2D vers le 3D).
De la mécanique classique vers la dynamique moléculaire
Conception basée sur les ligands
Notion de pharmacophores / 3D-QSAR
Analyse finale des relations structure-activité
Conception basée sur les structures
Techniques de docking – Scoring
Intégration des relations structure-activité (ligands)
Mise en évidence de structures originales
Intérêt du screening virtuel
Notion de polypharmacologie en modélisation moléculaire
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Contenu des UE du M2
UE DD4 Informatique, Données, Santé
M2 - S1
Responsable R Bureau

Equipe pédagogique R. Bureau, A. Lepailleur, B. Cremilleux, B. Cuissart

Volume horaire total 40 h (25h CM + 15H TD)

Objectif

Programme Descripteurs moléculaires et relations structure-activité

Des propriétés physico-chimiques aux fingerprints
Bases de données
Principe des bases de données relationnelles
Conception d'une base de données
Utilisation d'une base de données : modification, consultation et exportation des contenus
Inférences statistiques et extraction de connaissances
Introduction pratique aux tests statistiques et aux méthodes de Monte-Carlo
Initiation à l'écriture de scripts (langages Python et R)
Introduction et outils pour la fouille de données
Méthodes de prédiction : arbre de décision, classification supervisée
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Contenu des UE du M2
UE DD6 Préparation projet de stage
M2 - S1
Responsable C Rochais

Volume horaire total 40 h (travail personnel)

Objectif Préparer le stage en laboratoire de recherche à travers une étude bibliographique du sujet confié à l’étudiant