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MEIOSIS
AB
A A
B B b b
Ab
A A
aB
a a
ab
Dr. Antonio Barbadilla
a a
b b
Proporcin 1:1:1:1
B
b
La frecuencia de gametos recombinantes (FR) debe estar entre el ligamiento total (0%) y la segregacin independiente (50%)
0% FR 50%
Dr. Antonio Barbadilla
+: salvaje
ap: aptera vg: vestigial dp: dumpy
w: white
sepia
Bar
D: Dichaete
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Ligamiento:
Simbolismo del ligamiento Configuracin en acoplamiento o cis -> AB/ab Configuracin en repulsin o trans -> Ab/aB Prueba de ligamiento: desviacin de la proporcin 1:1:1:1 en un cruzamiento prueba de un dihbrido
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Cruzamiento prueba:
Genotipos P AA BB AB Aa Bb Gametos AB aa bb ab X ab Aa Bb A- Baa bb Cruzamiento prueba
Gametos P
F1
Ab aB
Dr. Antonio Barbadilla
ab
Aa bb aa Bb aa bb
Genotipos
A- bb aa Baa bb Fenotipos13
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El cruzamiento de prueba permite inferir las proporciones de los gametos que se forman en el doble heterocigoto
Dr. Antonio Barbadilla
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Recombinacin: la generacin durante la meiosis de genotipos haploides distintos de los genotipos parentales
Gametos P AB ab
F1
Aa Bb
AB Gametos
Dr. Antonio Barbadilla
ab Ab
aB
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Recombinacin:
AB Ab aB
A A
A A a a a a
B
B
b
b B B b b
50% recombinantes
ab
Recombinacin intracromosmica: genes situados en el mismo cromosoma ---> Tema 5: Entrecruzamiento Ligamiento y mapas genticos
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Proporcin 1:1:1:1
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Entrecruzamiento (Crossover): El
intercambio de cromtidas no hermanas entre cromosomas homlogos durante la meiosis por un proceso de rotura y reunin del DNA
Cromosomas en la meiosis
Meiosis sin entrecru zamiento entre los genes Meiosis con entrecru zamiento entre Barbadilla los Dr. Antonio genes
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Productos meiticos
A A a a B B b b
A A a a
B B b b
A A a a
B B b b
A A a a
B b B b
Recombinantes
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Meiosis y entrecruzamiento
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Migracin ramal
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Cartografa gentica:
La cartografa gentica asigna el lugar cromosmico de un gen (o locus) y su relacin de distancia con otros genes (o loci) en un cromosoma dado
A. Sturtevant (1913). La distribucin y el orden lineal de los genes se pueden establecer experimentalmente mediante el anlisis gentico
Dr. Antonio Barbadilla
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Supuesto: las frecuencias de entrecruzamiento, y por tanto la frecuencia de recombinacin, depende de la distancia entre genes
A B C
Unidad de distancia: La unidad de mapa (u.m.) o el centimorgan (cM) --> La distancia entre genes (loci) en los Tema 5: Ligamiento y mapas genticos 24 que la frecuencia de recombinacin es del 1% 24
Meiosis 1
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Mayor distancia entre loci --> Mayor nmero de entrecruzamientos Ms Entrecruzamientos ---> Ms Recombinacin A mayor frecuencia de recombinacin mayor la distancia entre loci
El nmero de entrecruzamientos por meiosis y por cromosoma se puede representar por una distribucin aleatoria de Poisson, con media
e f (i ) i!
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1 FR (1 e ) 2 ln(1 2 FR)
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Mapa a partir de cruzamientos prueba de dos puntos (dos loci en el mismo cromosomas)
Se determina la distancia 2 a 2 entre loci y stas se suman para estimar la distancia gentica total de un cromosoma A B
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Experimento de Morgan pr = Ojos Prpura vg = Alas vestigiales Ambos alelos son recesivos respecto al salvaje P F1 pr+ pr+ vg+ vg+ X pr pr vg vg pr pr vg vg
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Metodologa
Normalmente heterocigoto X homocigoto recesivo (cruzamiento prueba) -> AB/ab X ab/ab No se observa en la F2 la proporcin fenotpica 1:1:1:1, y la proporcin no es predecible a priori porque depende de la distancia entre los genes estudiados Las dos clases mayoritarias corresponden a los gametos no recombinantes (parentales), y las minoritarias a los recombinantes (no parentales) La frecuencia de recombinacin (recombinantes/total X 100) refleja la distancia gentica entre los dos genes. Una unidad de mapa o centimorgan (1cM) = 1% de recombinantes Se ordernan tres genes cuyas distancias se han medido dos a dos
Tema 5: Ligamiento y mapas genticos 29
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Fenotipos F 2 pr+ vg+ pr vg pr+ vg pr vg+ 1339 1195 151 305 154 ____ 2839
vg
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10,7 cM
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Cul es el orden de los genes? Las distancias deben ser aditivas y consistentes entre s
Supongamos las tres ordenaciones posibles
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12
A A C
12 C
B 7 Aditividad
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FR = x A
FR = y C
FR < x + y
25,4 La mejor estima distancia, suma (b-pr) + (pr-c)
b 5,9 pr
Dr. Antonio Barbadilla
19,5
c
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A A a a
B b B b
C C c c
La relacin entre la distancia real de mapa (nmero de entrecruzamientos) y la frecuencia de recombinacin entre dos marcadores o loci no es lineal. Cuanto ms lejos estn los marcadores peor es la estima La frecuencia de recombinacin (FR) entre dos marcadores no puede superar el 50% Dr. Antonio Barbadilla FR 0,5
Tema 5: Ligamiento y mapas genticos 34
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Funcin de mapa
Es una funcin que permite estimar la distancia de mapa mejor que empleando solamente la frecuencia de recombinacin, pues corrige los intercambios (entrecruzamientos) no detectados
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FR observada (%)
40
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20 10
1 FR (1 e ) 2
=1 =2 =3 =4
Zona de linealidad 35
50 100 150 200 Tema 5: Ligamiento y mapas genticos Unidades de mapa reales
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Por qu la frecuencia de recombinacin (FR) entre dos marcadores no puede superar el 50%?
Es igual de probable cualquier combinacin, ++, ab, a+, +b, es como si segregaran independientemente ambos 36 loci. Luego, la FRTema 5: Ligamiento yes 50% mxima mapas genticos
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Por qu la frecuencia de recombinacin (FR) entre dos marcadores no puede superar el 50%?
Demostracin 2: caso completo para 1 2 entrecruzamientos
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Mapa a partir de cruzamientos prueba de tres puntos (tres loci en el mismo cromosomas)
Metodologa
Triple heterocigoto X homocigoto recesivo (cruzamiento prueba) -> ABC/abc X abc/abc Si hay ligamiento, no se observa en la F2 la proporcin fenotpica 1/8 para cada tipo de gameto Se agrupan las clases recprocas (aquellas que tienen un fenotipo mutante en el par recproco, como el par de fenotipos fenotipos ABC-abc Abc-aBC. Las clases recprocas deben ser de frecuencia parecida Orden de los genes: Los fenotipos no recombinantes (parentales) son los ms frecuentes Los fenotipos menos frecuentes resultan de un doble entrecruzamiento Al comparar los fenotipos no recombinantes con los doble entrecruzados, el gen del medio es el que est cambiado Distancias de mapa: a la distancia entre genes consecutivos debe sumarse Dr. las Antonio Barbadilla frecuencias de los dobles entrecruzamientos
Tema 5: Ligamiento y mapas genticos 38
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Tres mutantes marcadores b = Cuerpo negro; pr = Ojos Prpura; c = curved, alas curvadas Los tres alelos son recesivos respecto al salvaje P F1 b+ b+ pr+ pr+ c+ c+ X bb prpr cc b+b pr+ pr c+ c X bb pr pr vg vg
Si no estn ligados Si estn ligados
Ejemplo:
1/8 bb prpr cc 1/2 bb prpr cc 1/8 bb prpr c+c 1/2 b+b pr+pr c+c F2 1/8 bb pr+pr cc 1/8 bb pr+pr c+c 1/8 b+b prpr cc 1/8 b+b prpr c+c Dr. Antonio Barbadilla 1/8 b+b pr+pr cc Tema 5: Ligamiento y mapas genticos 1/8 b+b pr+pr c+c 39
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Salvaje Black, purp, cur Purp,curved Black Curved Black,purp Purp Black,curved
b+b pr+pr c+c bb prpr cc b+b prpr cc bb pr+pr c+c b+b pr+pr cc bb prpr c+c b+b prpr c+c bb pr+pr cc
388 367 60 72
Total
Porcentaje
Dr. Antonio Barbadilla
15 000
887
5,9%
3550
23,7%
40
40
Tetrada meitica
Entrecruzamiento entre b y pr
Gametos
b b b+ b+
pr pr pr+ pr+
c c c+ c+
b b b+ b+
pr pr+ pr pr+
c c+ c c+
b b b+ b+
Dr. Antonio Barbadilla
pr pr pr+ pr+
c c c+ c+
b b b+ b+
pr pr+ pr pr+
c c c+ c+
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La mejor estima distancia entre los extremos es la 25,4 suma (b-pr) + (pr-c)
b 5,9 pr
19,5
23,7
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Coeficiente de coincidencia: mide si los entrecruzamientos son independientes entre s Si los mltiples entrecruzamientos suceden independiemente los unos de los otros, la frecuencia de los dobles entrecruzamientos ser al producto de la frecuencia de los intercambios sencillos Coeficiente coincidencia (CC) = (nmero de dobles entrecruzamientos observados)/(nmero de dobles entrecruzamientos esperados) Si CC < 1, dobles disminuidos Si CC > 1, dobles incrementados Interferencia: 1 - CC
Dr. Antonio Barbadilla
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Describir Ias tasas de recombinacin a lo largo del genoma Predecir la transmisin gentica de un gameto Localizacin de genes que influyen el fenotipo (QTLs) Marco de referencia para cartografa fsica Marco de referencia para la cartografa de genes Tema 5: Ligamiento 46 asociados a enfermedades y mapas genticos
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Distancia media entrecruzamientos consecutivos 1.0 x 104 pb 1.2 x 105 pb 2.5 x 105 pb 1.3 x 106 pb 1.2 x 107 pb 2.5 x 107 pb 9.0 x 107 pb 6.0 x 107 pb 3.5 x 107 pb
Fago T4 1.6 x 105 pb E. coli 4.2 x 106 pb Levadura 2.0 x 107 pb Hongo 2.7 x 107 pb Nemtodo 8.0 x 107 pb Mosca de la fruta 1.4 x 108 pb Ratn 3.0 x 109 pb Humanos Varn 3.3 x 109 pb Mujer 3.3 x 109 pb
Dr. Antonio Barbadilla
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Anlisis de ttradas
Los hongos ascomicetos retienen los cuatro productos haploides de cada meiosis en un saco denominado asca
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Hongos ascomicetos
Estos organismos son nicos porque se puede analizar meiosis individuales, permitiendo estudiar aspectos bsicos de la gentica de la meiosis (un proceso central de la biologa de los eucariotas) Cartografiar los centrmeros como si fuesen loci Investigar la posibilidad de interferencia de cromtida Examinar los mecanismos de entrecruzamiento
Ustigalo hordei Neurospora Aspergillus Coprinus (basidio nidulans crassa Lagopus Ascobolus miceto) (basidiomiceto) immersus Saccharomyces cerevisiae
Ttradas
Dr. Antonio Barbadilla
Octadas
Ttradas Octadas
No ordenadas
Lineales
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50
50
4:4
51
51
2:2:2:2
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ttradas que muestran patrones de segregacin en la segunda divisin para ese locus y divdase por 2
Patrones MII = 9 + 11 + 10 + 12 = 42 o sea 14% Puesto que slo la mitad de los cromosomas que sufren entrecruzamiento son Dr. Antonio Barbadilla recombinantes, la distancia de mapa (medida como frecuencia de 53 recombinacin) ser 14/2 Tema unidades de mapa cM = 7 5: Ligamiento y mapas genticos
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r
r R r R r
Mitosis
R R
Clula normal R/R
r r
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Cartografa en humanos
Mapas genticos (de recombinacin)
Herencia ligada al cromosoma X Marcadores polimrficos asignados a colecciones de familias (CEPH). alozimas DNA (RFLPs, microsatlites, RAPDs,...) La caza de genes asociados a enfermedades
Mapas fsicos
Mtodos especiales de cultivo celular: hibridacin de clulas somticas Hibridacin in situ de sondas de DNA en cromosomas metafsicos Secuenciacin del DNA
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Cartografa marcador-enfermedad
La caza de genes asociados a enfermedades
Cartografa marcador-marcador
Estudios marcadores polimrficos asignados a colecciones de familias (CEPH). DNA (Microsatlites, RFLPs, RAPDs,...)
Dr. Antonio Barbadilla
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http://lpg.nci.nih.gov/CHLC/
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Xg Protena grupo sanguneo Ictiosis (un efermedad de la piel) Albinismo ocular Angioqueratoma (crecto celular) Centrmero Fosfoglicerato-quinasa Alfa-galactosidasa Xm Deutan (ceguera color rojo-verde) G6PD Protano (ceguera color rojo-verde) Hemofila A
Dr. Antonio Barbadilla
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Procesos sexuales en bacterias y virus: Transformacin, conjugacin, transduccin y sexduccin en bacterias y recombinacin vrica Conjugacin Ciclo biolgico de fagos
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Conjugacin
Sexduccin
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Se requiere un doble entrecruzamiento para la transformacin Ejemplo del uso de la fecuencia de transformacin para estimar distancias genticas: Una cepa his+ met+ se transforma con his- met34 hist- met+ Distancia entre ambos genes = 28 hist+ met194 hist- met- (transformantes sencillos/total transformantes) = (34 + 28 )/(34 + 28 + 194) = 0,24
Tema 5: Ligamiento y mapas genticos 63
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Conjugacin bacteriana
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Unidades en minutos
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ALELISMO Y CONJUGACIN
Suponga que lleva a cabo pruebas de complementacin o cis-trans entre parejas de mutantes. Escriba los resultados que esperara obtener en una tabla, utilizando un signo + cuando exista complementacin y un signo - en caso de ausencia de complementacin.
Dr. Antonio Barbadilla
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Dos mutaciones complementan cuando afectan a distinta unidad funcional o distinto cistrn y dos mutaciones no complementan si afectan al mismo cistrn (gen) o unidad de funcin.
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Las mutaciones C y D no pueden complementar, afectan al mismo cistrn, pero si complementaran con las dems (A, F, B y E). Las mutaciones A y F no complementan entre s ya que afectan al mismo cistrn, pero complementan con todas las dems (C, D, B y E) ya que estn en distinto gen. Por ltimo, B y E no complementarn entre si por estar en el mismo cistrn y si complementarn con las mutaciones A, C, D y E. Los resultados se indican en la siguiente tabla :
A B C D E F
A -
B + -
C + + -
D + + + -
E + + -
F + + + + -
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HERENCIA EXTRANUCLEAR
Las mitocondrias y los cloroplastos poseen ADN capaz de replicarse, transcribirse y traducirse independiente del nuclear.
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El aporte citoplsmico del gameto masculino es pequea, si no nula, as los individuos reciben slo aporte va materna, slo genes extranucleares de la madre. El individuo en su desarrollo en el vulo, tendrn influencia de las protenas de origen nuclear materno sobre el fenotipo del individuo
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Su ADN es una molcula circular, bicatenaria y que contiene entre 120 y 160 Kpb.
El contenido de ADN es inferior al que presentan las algas verdes, se supone que por evolucin se ha reducido el tamao, bien por prdida de material o bien por integracin de genes dentro del genoma eucaritico.
Dr. Antonio Barbadilla
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El nmero de molculas de ADN por cloroplasto es muy variable. En plantas es entre 20 y 60 molculas por cloroplasto, en algas superiores el nmero es mayor.
La organizacin es sencilla apenas posee secuencias repetidas, aunque en la mayora de las especies vegetales se ha demostrado la presencia de una duplicacin invertida que incluye genes de ARNt. La secuenciacin del ADN de los cloroplastos ha revelado que existen alrededor de 150 genes.
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Adems de los ARNt y los ARNr hay unos 90 genes que estn implicados en la fisologa de los cloroplastos, principalmente en la fijacin fotosinttica del carbono. Estos genes suelen agruparse en pequeos nichos cuya organizacin se ha mantenido a lo largo de la evolucin. El orden de estos genes dentro del genoma del cloroplasto, no se ha mantenido constante en todas las especies estudiadas, lo cual indica que en el proceso evolutivo han existido variaciones cromosmicas estructurales.
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Para estudiar la herencia en los cloroplastos. El anlisis ms comn es el que estudia la transmisin del carcter variegado en plantas. En todas las especies vegetales aparecen individuos que presentan en las zonas verdes (tallos, hojas, etc.) una alternancia entre zonas verdes y blancas (variegacin), estas zonas blancas o ms plidas de lo normal, es debido a la constitucin gentica de los cloroplastos.
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El nmero de molculas presentes en una mitocondria, as como el tamao depende de las especies. El ADN-mt es una molecula de doble hlice circular que oscila entre 15 -18KB (animales), y 250 - 2500 KB en plantas. Cada mitocondria contiene entre decenas y cientos de molculas de este ADN.
Tema 5: Ligamiento y mapas genticos 84
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El ADNmt de clulas animales y de las levaduras es bastante similar en su organizacin y contenido, pero distinto al de las plantas.
El ADNmt de las plantas es ms grande, con ms secuencias no codificadoras, con ms genes y con distinta organizacin (exones e intrones) en los mismos. La mayora de las protenas presentes en las mitocondrias son de codificacin nuclear, tan slo unas pocas se traducen dentro de la mitocondria.
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El sistema de traduccin mitocondrial es exclusivo de las mismas (traduccin mit). Los ARNs ribosmicos y de transferencia estn codificados por el ADNmt, y el cdigo gentico utilizado para la traduccin es distinto al universal.
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En el embrin las primeras divisiones celulares estn determinadas por la codificacin de genes maternos, ya luego empiezan a expresarse los genes presentes en el feto.
Un ejemplo muy interesante de efecto materno debido a genes nucleares maternos, es el que ocurre en los caracoles del gnero Linnaea. Sturtevant en 1923, observ que el enrollamiento de la concha de estos caracoles dependa del genotipo de la hembra utilizada en los cruzamientos
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La concha de estos caracoles puede enrollarse a derecha o izquierda, el carcter est controlado por un gen con dos alelos. El alelo s+ enrolla hacia la derecha y el recesivo "s" enrolla hacia la izquierda. El momento en que empieza el enrollamiento de la concha, est determinado por los productos gnicos codificados por la madre, no por los del embrin.
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Es en la siguiente generacin cuando el individuo muestra su genotipo al codificar el enrollamiento de la concha de sus descendientes. Si se observa las generaciones, se aprecia que las leyes de Mendel se cumplen pero con una generacin de retraso, la F3 muestra las segregaciones de la F2 mendeliana (3:1), y la F2 es uniforme como la F1 mendeliana.
Este tipo de herencia tambin se denomina, por este hecho, herencia retrasada.
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GRACIAS
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