Los seres vivos cuentan con una gran proporcin de nitrgeno en su composicin qumica.

El nitrgeno oxidado que reciben como nitrato es transfornado a grupos amino. Para volver a contar con nitrato hace falta que los descomponedores lo extraigan de la biomasa dejndolo en la forma reducida de ion amonio, proceso que se llamaamonificacin; y que luego el amonio sea oxidado a nitrato, proceso llamado nitrificacin.

As parece que se cierra el ciclo biolgico esencial. Pero el amonio y el nitrato son sustancias extremadamente solubles, que son arrastradas fcilmente por la escorrenta y la infiltracin, lo que tiende a llevarlas al mar. Al final todo el nitrgeno atmosfrico habra terminado, tras su conversin, disuelto en el mar. Los ocanos seran ricos en nitrgeno, pero los continentes estaran prcticamente desprovistos de l, convertidos en desiertos biolgicos, si no existieran otros dos procesos, mutuamente simtricos, en los que est implicado el nitrgeno atmosfrico. Se trata de la fijacin de nitrgeno, que origina compuestos solubles a partir del N2, y la desnitrificacin, una forma de respiracin anaerobia que devuelve N2 a la atmsfera. De esta manera se mantiene un importante depsito de nitrgeno en el aire (donde representa un 78% en volumen).

La explotacin petrolera afecta al ciclo del nitrgeno debido a los gases involucrados en el proceso de extraccin por la quema de grandes cantidades de combustibles y del gas natural extrado junto con el petrleo, que afecta a toda la comunidad bitica y los qumicos involucrados en el proceso en especial a la biomasa epigea al disminuirse lo niveles de nitritos en el suelo

Este tipo de contaminacin afecta a la familia de las gramneas afectando as la capacidad de las bacterias aerobias y microaerfilas para la fijacin de nitrgeno y la produccin de nitratos y amonios .

Cuando el bosque es talado y quemado para instalar los posos y campamentos petroleros mueren muchos de los microorganismos presentes y parte del nitrgeno se volatiliza durante la quema impidiendo la regeneracin de los biomasa y causando fluctuaciones en la rizosfera afectando la disponibilidad de nutrientes sufriendo cambios en humedad por inundaciones peridicas que ocurren en este tipo de biomas.

 La

contaminacin con petrleo mayor al 6% afecta el ciclo del nitrgeno (especialmente la nitrificacin y la fijacin de nitrgeno) atmosfrico el los suelos altamente contaminados, lo cual disminuye los compuestos orgnicos nitrogenados que utilizan las plantas para producir protena afectando la cadena alimenticia

 En

el agua para la degradacin de los hidrocarburos se aade Nitrgeno y Fosforo para favorecer la proliferacin y reproduccin de microorganismos que pueden disminuir la cantidad de oxigeno el en agua

 En

suelos con alto contenido de materia orgnica el petrleo se adhiere fuertemente a las partculas y restos vegetales de tal manera que permanece por ms tiempo en el ambiente por ejemplo, en suelos de manglares , pantanos y bosques hmedos aumentando la acides del suelo