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Virus qui infecte spcifiquement les cellules bactriennes; aussi appel phage. Les
bactriophages constituent une varit particulire de virus dont l'hte exclusif est une bactrie. La prsence de rcepteurs la surface de cette dernire dtermine les possibilits d'association entre phage et bactrie. Ces virus sont tudis par les microbiologistes et
utiliss par les biologistes molculaires. En effet, les bactriophages sont porteurs d'ADN,
matriel gntique, et capables d'intgrer leur gnome une partie du gnome bactrien. Cette proprit est trs largement mise profit dans l'tude de la rgulation de l'expression des gnes. Un phage est constitu d'un acide nuclique (ARN ou ADN) entour d'une
coque protectrice. Aprs fixation du phage sur une protine spcifique de la surface
bactrienne, son gnome est introduit l'intrieur de la bactrie o il gouverne la synthse de nouveaux phages (de 100 10 000). Certains phages pratiquent la lysognie, qui consiste intgrer leur gnome dans l'ADN de la bactrie qu'ils infectent au lieu de la tuer
Un bactriophage (ou phage) est un virus n'infectant que des bactries. En grec, phageton signifie nourriture/consommation. On les appelle galement virus bactriens. Ce sont des outils fondamentaux de recherche et d'tude en gntique molculaire. Les bactriophages servent entre autres, de vecteurs de clonage de gnes.
Les bactriophages sont prsents dans l'ensemble de la biosphre. En effet, ils sont prsents partout, mais en quantit plus importante dans les excrments, le sol et les eaux d'gout. La dcouverte des bactriophages se fait en 1915 par Frederick W. Twort ( Londres) qui remarque que des colonies de microcoques prenaient parfois un aspect vitreux, d une destruction des cellules bactriennes, et que cette caractristique tait transmissible des colonies normales par simple contact. Puis Flix d'Herelle fait la mme observation dans des selles de malades atteints de dysenterie bacillaire (maladie du colon). Le support gnomique des bactriophages peut tre un ADN ou un ARN.
Constitution
Comme les virus qui infectent les eucaryotes, les phages sont constitus d'une enveloppe
protique externe (appele capside) protgeant le matriel gntique (ADN ou ARN). Pour plus de 95 % des phages connus, ce matriel est une molcule d'ADN double-brin d'une taille de 5 650 kpb et leur taille varie de 24 200 nm.
Dans les annes 1940, les travaux effectus sur les bactriophages ont permis de
dcouvrir que les acides nucliques taient les principaux constituants du matriel
gntique. C'est avec cette dcouverte que prit naissance le vaste domaine de la biologie molculaire.
Les phages sont en gnral spcifiques et ne peuvent infecter qu'une seule espce de bactrie. Ceci est en particulier li leur mcanisme de pntration dans la cellule bactrienne : les phages reconnaissent en effet une protine spcifique de la surface bactrienne, leur "rcepteur", qui leur permet de s'accrocher et d'injecter leur matriel
Certains phages sont virulents ou lytiques, c'est--dire qu'aussitt qu'ils infectent une cellule, la rplication dmarre, de nouveaux virions sont assembls et produit et, dans un court laps de temps, des protines virales provoquent la lyse de la cellule hte et la libration de nombreux nouveaux phages. Le microbiologiste Mark
Mller a dit
Il s'excise du gnome de l'hte et entre dans un cycle lytique, comme ci-dessus. Parfois,
les prophages apportent quelque chose la relation bactrie-phage quand la cellule est en dormance, en ajoutant de nouvelles fonctions au gnome de la bactrie, un phnomne appel conversion lysogne. Un exemple connu est l'inoffensive bactrie Vibrio qui, quand elle est lysognise par un phage, cause le cholra.
Certains phages ne provoquent pas la lyse de la cellule infecte, mais bourgeonnent la membrane bactrienne, sans la rompre. C'est le cas des phages filamenteux comme M13 ou f1 d'Escherichia coli. La cellule infecte devient alors une usine produire du phage de manire continue.
Comme les phages peuvent porter dans leur gnome des gnes accessoires leur cycle de vie, ils participent aux transferts horizontaux de gnes entre populations bactriennes. C'est la transduction.
conversion lysognique .
Un exemple bien connu est celui des gnes des toxines Stx des Escherichia Coli entrohmorragiques (EHEC). Ces gnes stx sont localises dans des squences de bactriophages lambdodes intgrs dans le chromosome. Les EHEC auraient donc merg par conversion lysognique. On connat de nombreux autres exemples de ce type, comme la toxine cholrique de Vibrio cholerae qui est porte par le phage CTX.
Dans les annes 1960, des recherches de pointe menes sur les mcanismes hte/phage par des physiologistes amricains, Max Delbrck, Alfred Hershey et Salvador Luria, valurent ces chercheurs le prix Nobel de mdecine-physiologie en 1969.
L'tude des phages a des implications importantes en mdecine et en gntique, en particulier pour la comprhension des infections virales, des anomalies gntiques, de l'embryologie humaine, des causes du cancer et de la rsistance des bactries aux antibiotiques.
Les phages sont utiliss de multiples manires dans la biologie molculaire. Ils sont utiliss comme vecteurs de clonage pour insrer de l'ADN dans les bactries. La mthode du phage display est une mthode qui permet la slection d'un peptide grce sa prsentation sur la surface de phages. Le phage display constitue une catgorie de phage permettant la construction
est un phage filamenteux capable d'infecter uniquement les bactries gram () ayant incorpor le facteur F et dont l'infection conduit la lysognie. Sa capside contient, entre autres, les protines P8 et P3 ncessaire pour la liaison du bactriophage la bactrie via les pilis sexuels.
Le squenage d'un gnome ne se fait pas d'un seul coup, mais petit petit sur des fragments de gnomes. Pour cela ces fragments d'ADN doivent tre stocks et multiplis dans des organismes servant de banque d'ADN. Les phages en tant que vecteurs de clonage le permettent.
Les phages dtruisent les bactries en s'y reproduisant massivement, on peut donc les utiliser dans la lutte contre les bactries rsistantes aux antibiotiques. On parle donc de phagothrapie. Les bactriophage ont t dcouvert avant les antibiotiques mais ce sont ces derniers qui ont t retenu en tant que thrapie anti bactrienne car ce sont des molcules inertes clairement dfinies et pour lesquels on maitrise parfaitement les mthodes de prparation contrairement aux bactriophages qui sont eux des tres vivants. Mais aujourd'hui les phages reviennent de plus en plus au devant de la scne justement cause du dveloppement important de rsistances bactriennes face aux antibiotiques.
En ex-URSS et plus particulirement en Gorgie et en Pologne, les phages sont utiliss pour traiter les infections bactriennes avec ou sans adjonction de traitement antibiotique. Dans de
nombreux cas, les phages sont aussi efficaces que les antibiotiques et souvent mme suprieurs,
notamment dans les cas d'infections chroniques.
Nanmoins, il est parfois mis qu' l'instar des antibiotiques, ce traitement pourrait participer la slection de souches bactriennes rsistantes, faisant que l'on pourrait ventuellement
naturellement de manire presque synchrone face aux rsistances des bactries, ce qui n'est pas
le cas des antibiotiques. De ce fait, si leur utilisation est bien encadre, elle constitue une piste srieuse dans la dcouverte de traitements durables contre les infections bactriennes.
phage T7
phage R17 - Le prototype des phages ARN. L'un des virus les plus simples connus. phage M13 - Phagemid phage X174 - phage ADN simple brin, le premier