УДК 544.183.

26

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКИХ РАСЧЕТОВ

ДЛЯ РАЗРАБОТКИ НОВЫХ ПРОТИВОМИКРОБНЫХ
СОЕДИНЕНИЙ

Елисеева Е.В., студент 4 курса; Пешков С.А., канд. хим. наук,

доцент
Оренбургский государственный университет
katyaeliseeva@outlook.com

Бета-лактамные антибиотики находят широкое применение в

медицинской практике, так как обладают такими ценными качествами, как
надежность, относительно широкий спектр антимикробного действия,
высокая активность, стабильность и эффективность. Вместе с низкой
токсичностью такие качества дают основания считать эти антибиотики
идеальными препаратами для лечения многих бактериальных инфекций
[1]. Но серьезной проблемой является развитие устойчивости у
микроорганизмов [2]. Способом решения проблемы восстановления
действия пенициллиновых антибиотиков является модификация уже
известных форм.
Существует несколько подходов к получению лекарственных
препаратов. Самый простой заключается в получении действующего
вещества, а затем в изучении его механизма действия и подборе объектов
(или мишеней) воздействия. Данный способ дорогой и неэффективный с
точки зрения затрат на эксперименты. Другой способ – молекулярное
моделирование с элементами квантовохимического моделирования
методами ab initio. Такой подход позволяет произвести поиск наиболее
оптимальной ориентации и конформации лиганда в активном центре
мишени (молекулярный докинг). На основе свободной энергии
образования комплекса отбрасываются все ненужные лиганды и
предсказывается пространственная структура комплекса рецептор-лиганд.
Вследствие этого не требуется проведение затратных лабораторных
исследований. Лишь только на последнем этапе проверки биологической
активности полученного соединения требуется анализ in vitro и in vivo.
В работе рассмотрены молекулы сериновой бета-лактамазы класса А,
относящейся к типу TEM с бета-лактамными антибиотиками
(амоксициллин, бензилпенициллин, фаропенем, биапенем, имипенем) и
ингибиторами бета-лактамаз (клавулановая кислота, ваборбактам,
сульбактам).
Была проведена оптимизация
структуры взятых молекул и получены
значения энергии активации
Рис. 1. Молекулы биапенема и
бензилпенициллина после оптимизации
вкомплексов
приближенииразличных
B3LYP/6-31 комбинаций, на основании которых можно сделать
вывод об эффективности использования тех или иных ингибиторов в
комплексе с различными антибиотиками.
Расчет производили с использованием квантово-химического пакета
FireFly 8.1 с использованием теории функционала плотности в
приближении B3LYP/6-31. Наибольшей энергией активации, обладает
комплекс с имипенемом, наименьшей – с фаропенемом. Добавление в
реакционный центр бета-лактамазы клавулановой кислоты, ваборбактама и
сульбактама не сильно изменяет энергию образования соединения.
Необходимо разрабатывать другие более эффективные ингибиторы.
Таким образом, полученные результаты показывают, как можно
применять современные компьютерные методы в химии для разработки
новых, а также «возрождения» давно применяемых, но малоэффективных
сегодня антибиотиков, что является довольно важной задачей, так как
число действенных препаратов в настоящее время сокращается из-за
непрерывно развивающейся устойчивости бактерий к антибиотикам
вследствие их широкого применения.

1. Егоров Н.С. Основы учения об антибиотиках / М.: Наука, 2004. –

528.
2. Супотницкий М.В. Механизмы развития резистентности к
антибиотикам у бактерий // Биопрепараты. – 2011. – № 2. – С. 4-11.