Академический Документы
Профессиональный Документы
Культура Документы
Альберт Ленинджер - Основы Биохимии - Том 1
Альберт Ленинджер - Основы Биохимии - Том 1
Ленинджер
ОСНОВЫ
БИОХИМИИ
.ru
ib
e r-l
sh
u
ak
А . Л е н и н д ж е р
ОСНОВЫ
БИОХИМИИ
.ru
В ТРЕХ ТОМАХ
1 ib
r-l
П е р е в о д с а н гл и й ск о го
кан д. ф и з-м а т. наук В. В. Б о р и с о в а,
e
кан д. б и о л . наук М . Д . Г р о зд о в о й
и
sh
п од р едакц и ей
акад . [B .Ä . Э н гел ы -ар д та]
u
и
проф . Я . М . В а р ш ав с к о го
ak
М ОСКВА «М И Р» 1985
ПРЕДИСЛОВИЕ РЕДАКТОРОВ ПЕРЕВОДА
И мя автора «Основ биохимии», круп важных задач, стоящих перед химиками,
ного американского ученого и педагога, физиками и инженерами. Но все же
.ru
профессора Университета Дж. Гопкинса главное значение вводного курса биохи
Альберта Л. Ленинджера хорошо из мии определяется тем местом, которое
вестно советскому читателю по русским занимает комплекс биологических наук
переводам его учебника биохимии в современном естествознании, и той
и книг по биоэнергетике, получившим ролью, которую долж на играть биоло
гия в научном воспитании молодых лю
ib
широкое распространение и признание
в нашей стране. дей. Только знание биологических зако
Главная цель, которую поставил нов поможет им в полной мере оценить
перед собой А. Ленинджер при написа значение важнейшей проблемы, стоящей
сейчас перед человечеством,-сохранения
r-l
нии этого нового учебника, состояла не
столько в том, чтобы сообщ ить читате живой природы и здоровья людей. П о
лю конкретную информацию о структу нимание этих законов должно стать до
рах и механизмах, обеспечивающих стоянием не только специалистов био
функционирование живых организмов логического профиля, но и всех образо
e
(хотя такая информация составляет ос ванных и мыслящих людей.
новное содержание книги), сколько Особое значение в этой ситуации при
в том, чтобы разъяснить ему общие обретает, естественно, задача создания
sh
зрения на роль биохимии в системе со нинджеру, как нам кажется, удалось ре
временного образования, к которой он шить ее-напи сан ная им книга «Основы
пришел в последние годы. П о мнению биохимии» является великолепным
ak
.ru
оправдывает ее. и 26) и В. Г. Горбулевым (гл, 27-30, при
М ожно не сомневаться в том, что эта ложения и словарь терминов).
книга окажется очень полезной не только
для ш ирокого круга читателей, изучаю
В. А. Энгелъгардт
щих или преподающих биохимию, но
Я. М. Варшавский
ib
e r-l
u sh
ak
Посвящает ся Д ж е и
ПРЕДИСЛОВИЕ
Книга «Основы биохимии» адресована тех, кому предстоит впервые познако
в первую очередь студентам, впервые миться с этим предметом. Кроме того,
приступающим к изучению биохимии. известно, что при переиздании учебников
Это новая книга, а не просто осовреме их структура обычно усложняется,
ненный вариант моих прежних учебников а текст становится более насыщенным,
.ru
«Биохимия» (1970, 1975) и «Краткий курс и в результате нередко исчезает та яс
биохимии» (1973). Первоначально я наме ность изложения, которая обеспечивала
ревался подготовить новые издания этих успех первым изданиям. По-видимому,
учебников, но постепенно убеждался лучше всего попытаться написать учеб
в том, что едва ли они будут соответство ник заново.
вать поставленным целям. В сам ом деле, Одно время я считал, что биохимию
ib
первое издание «Биохимии», опублико следует преподавать студентам старших
ванное в 1970 г., предназначалось курсов после тщ ательного изучения ими
главным образом для студентов, ко химии и биологии. Сегодня я придержи
торым предстояло прослушать первый и, ваюсь другой точки зрения. П реподава
r-l
может быть, единственный в своей жизни ние биохимии нужно начинать гораздо
курс биохимии. Когда учебник был пере раньше, поскольку она объединяет все
издан в 1975 г., его объем увеличился бо науки о живом и ее изучение способ
лее чем на 20",,. Если бы при подготовке ствует лучшему пониманию лю бой обла
третьего издания я сделал бы аналогич сти биологии. И не только биологии-
e
ную попытку включить в него новые д о преподавание начального курса биохи
стижения биохимии, то объем книги со мии студентам химических и физических
ставил бы не менее 1500 страниц. факультетов дает возможность на увле
sh
написана «Биохимия». «Основы биохи курс биохимии вносит также вклад в под
м и и » -это возвращение к моей первона готовку молодежи к будущему, связанно
чальной цели; если угодно, это возрожде му с постоянно возрастаю щ им беспокой
ak
.ru
нать и понять, какие молекулярные взаи тельности и принципы их регуляции.
модействия лежат в основе жизнедея Третья часть книги посвящена биохи
тельности. мии человека. Она состоит из глав,
П редлагаемая читателю книга состоит в которых анализируются взаимосвязи
из четырех частей: биомолекулы, био между различными органами в процес
энергетика и метаболизм, вопросы био сах метаболизма, рассматриваю тся воп
ib
химии человека и основы молекулярной росы, касающиеся эндокринной регуля
генетики. Она написана в том же стиле, ции и питания человека. С моей точки
что и «Биохимия». И злагая материал, зрения, проблема питания не сводится
я стремился не столько к энциклопедиче к знанию того, что тот или иной витамин
r-l
скому охвату всех деталей, сколько к вы входит в состав того или иного кофер-
явлению основы и молекулярной логики мента. Наука о питании это один из
биохимии; однако процессы, имеющие самых важных вкладов биохимии
фундаментальное значение, раскрыты во в благосостояние человечества и, по мое
всей полноте и подробностях. му убеждению, она требует более обо
e
Книга начинается с глав, посвященных бщенного, интегративного подхода, чем
структуре клеток и важнейшим принци получала до сих пор.
пам органической химии, относящимся В четвертой части книги я особенно
sh
.ru
достаточно полный словарь биохимиче са дал полезные советы относительно ил
ских терминов (более 400 слов). люстраций к первым главам. Джоффри
Особо следует отметить помещенные М артин тщ ательно проверил правиль
в конце каждой главы вопросы и задачи ность всех приведенных в книге уравне
общим числом более 350; больш ую часть ний и структурных формул, а Линда
их составил П оль ван Эйкерен из К ол Хэнсфорд прочитала корректуру и соста
ib
леджа Харви М адда. Цель этих вопросов вила предметный указатель. Однако вся
и задач состоит не просто в том, чтобы ответственность за возможные фактиче
читатель произвел какие-то вычисления. ские ошибки или неправильную интер
Они призваны фокусировать его внима претацию данных лежит целиком на мне.
r-l
ние на внутренних связях биохимических Я особенно признателен Пегги Джейн
процессов; некоторые из них требуют Форд, которая не только перепечатывала
весьма вдумчивого анализа. Все вопросы (причем неоднократно) рукопись книги,
и задачи, а также ответы к ним были тщ а но и помогала мне распределить время
и внимание между такими конкурирую
e
тельно просмотрены опытными препода
вателями общего курса биохимии. щими моими обязанностями, как препо
Представляя эту книгу на суд читате давание, научные исследования, админи
sh
Я глубоко признателен тем, кто пом о Приношу также благодарность всем со
гал мне в подготовке этой книги. Прежде трудникам издательства «Уорт П абли
шере» за их сочувствие, поддержку
ak
БИОМ ОЛЕКУЛЫ
Около 20 миллиардов лет назад про сти, Эти соединения, называемые биомо
изошел сверхмощный взрыв, и все про лекулами, играю т роль строительных
странство заполнилось раскаленными блоков при образовании биологических
субатомными частицами с очень высокой структур; они были отобраны в ходе био
энергией. Так возникла Вселенная. П о логической эволюции благодаря их при
степенно, по мере остывания Вселенной, годности к выполнению строго опреде
из этих элементарных частиц сформиро ленных функций в живых клетках. Во всех
вались положительно заряженные ядра, организмах эти соединения одинаковы.
к которым стали притягиваться отрица Биомолекулы связаны между собой
тельно заряженные электроны. Таким пу и взаимодействуют в соответствии с пра
тем образовалось около сотни или не вилами «молекулярной игры» - молеку
.ru
сколько более химических элементов. Все лярной логики живого состояния. Р аз
атомы, присутствующие сегодня во Все меры, форма и химические свойства
ленной, в том числе и атомы, входящие биомолекул позволяю т им не только слу
в состав живых организмов, возникли жить строительными блоками при созда
в результате этого «больш ого взрыва», нии сложной структуры клеток, но и уча
так что и мы, люди, и вообще все живые ствовать в непрекращающихся процессах
ib
существа созданы из звездной пыли. превращения энергии и вещества. Биом о
Простые органические соединения, из лекулы следует рассматривать, таким
которых построены все организмы, при образом, с двух точек зрени я-хи м иче
сущи лиш ь живой природе и в совре ской и биологической. Б и о х и м и я -это су
r-l
менных земных условиях являются про перхимия, т. е. химия наиболее высокоор
дуктами только биологической активно ганизованной материи.
e
u sh
Б И О Х И М И Я -М О Л Е К У Л Я Р Н А Я
.ru
Л О Г И К А Ж И В Ы Х О Р Г А Н И ЗМ О В
Объекты живой природы состоят из пическим внутриклеточным структурам,
«неживых» молекул. Если эти молекулы таким, как клеточное ядро. Даже индиви
выделить и каждый их вид исследовать дуальные химические соединения, содер
в отдельности, то можно убедиться, что жащиеся в клетке, например белки или
ib
они подчиняются всем законам физики липиды, наделены специальными функ
и химии, описывающим поведение неоду циями. П оэтому вполне правомерен во
шевленной материи. Тем не менее живые прос о том, для какой цели понадобилась
организмы обладаю т необычными свой живому организму та или иная молекула
r-l
ствами, отсутствующими в скоплениях или химическая реакция, тогда как спра
неживых молекул. Если мы поближе по ш ивать о функции различных химиче
знакомимся с этими особыми свойства ских соединений, входящих в состав не
ми, то нам станут более понятны те ос живой материи, абсолю тно бессмыс
новные вопросы, ответы на которые ленно.
e
пытается найти биохимия. Третья особенность живого, благодаря
которой мы ближе подходим к сути жиз
ненных процессов, состоит в том, что
sh
.ru
ib
e r-l
sh
Рис. 1-1. Некоторы е характерные особенности ство, которое можно считать поистине
живой м атер и и -« пр и зн аки жизни». А. П опе квинтэссенцией живого состояния. И з
речный срез фотосинтезирую щ ей клетки, на ко вестные нам смеси веществ, входящие
тором видна ее тонкая и сложная структура:
темные о б р азо в ан и я-это х л ороп ласта, содер в состав неодушевленных предметов, не
u
.ru
низмы, взаимодействуют друг с другом, С
поддерживая живое состояние и обеспе I
чивая его воспроизведение. Разумеется, т
биохимия позволяет получать важную
информацию, находящую применение Gly
ib
в медицине, сельском хозяйстве, пищевой
промыш ленности и производстве, одна Ile
ко конечная ее цель заклю чается все же
т
Т
0
Тгр
в познании тайны жизни во всех ее кон
п 1
r-l
кретных проявлениях.
G Ala
Молекулы, из которых состоят живые
организмы, подчиняются всем из I I
А Gly
вестным законам химии, но, кроме того, I
они взаимодействуют между собой в со
e
ответствии с другой системой принци
пов, которой мы можем дать общее на Рис. 1-2. А. Схематическое изображение участка
зв ан и е- молекулярная логика живого со молекулы Д Н К , состоящей из нуклеотидных
sh
му закономерностей, характеризующих
природу, функции и взаимодействия био нения углерода, в которых атомы углеро
молекул, т. е. таких молекул, которые вхо да ковалентно связаны с другими атома
ak
.ru
зом. Фактически каждый вид живых ор что все живые организмы произошли от
ганизмов содержит свой набор белков общего предка.
и нуклеиновых кислот, и почти все они Для простых молекул, из которых по
четко отличаются от белков и нуклеи строены все макромолекулы, характерна
новых кислот, принадлежащих другому еще одна примечательная особенность.
виду. Поскольку существуют около 10 О на состоит в том, что каждая из этих
ib
миллионов видов живых организмов, молекул выполняет в клетке сразу не
легко подсчитать, что все эти виды, вме сколько функций. Различные аминокис
сте взятые, должны содержать по мини лоты служат не только строительными
мальной оценке 1011 различных белков блоками белков, но и предшественника
r-l
и почти столько же различных нуклеи ми гормонов, алкалоидов, пигментов
новых кислот. и многих других биомолекул. Нуклео
Если бы биохимики поставили перед тиды используются не только как
собой задачу выделить, охарактеризо строительные блоки нуклеиновых кис
вать и синтезировать все органические лот* но и как коферменты и переносчики
e
молекулы, входящие в состав живых ор энергии. В живых организмах обычно не
ганизмов, то это было бы совершенно бывает соединений, которые не выпол
безнадежным делом. Однако, как это ни няли бы какой-либо функции, хотя
sh
.ru
условиях их существования при данных пригодной для них форме.
значениях температуры и давления. За
Хотя живые организмы способны пре
тем они возвращ аю т в среду эквива
образовывать энергию, они кар
лентное количество энергии, но уже
динальным образом отличаю тся от
в другой, менее доступной для них фор
обычных машин, созданных человеком.
ме. П олезная ф орма энергии, которая
Системы преобразования энергии
ib
требуется живой клетке, называется сво
в живых клетках целиком построены из
бодной энергией', ее можно определить
сравнительно хрупких и неустойчивых
просто как энергию, способную совер
органических молекул, не способных
ш ать работу при постоянных темпера выдерживать высокие температуры,
r-l
туре и давлении. Менее полезный вид
сильный электрический ток, действие
энергии, возвращ аемый клеткой в окру- сильных кислот и оснований. Все части
живой клетки имеют примерно одну
и ту же температуру, нет в клетках
e
Свободная и сколько-нибудь значительных перепа
энергия
дов давления. О тсю да можно заклю
чить, что клетки не могут использовать
sh
.ru
Весь растительный и животный мир
(вообще все живые организмы) зави
сят друг от друга, поскольку меж ду
ними через внешнюю среду постоянно
происходит обмен энергией и мате
рией.
ib
1.5. Ферменты, играющие
роль катализаторов в живых
r-l
клетках, управляют сложно
организованной сетью
химических реакций
Клетки могут функционировать как
e
химические маш ины благодаря присут
ствию в них ф ерм ентов-катализаторов,
способных в значительной мере уско
sh
биосфере источником энергии служит Рис. 1-5. Ф ерменты во м ного раз повыш аю т
в конечном счете солнечное излучение, скорость определенных химических реакций.
которое возникает в результате реакции
ak
ского действия, а также способны рабо стием, в живой клетке может одновре
тать в относительно мягких условиях — менно протекать множество различных
при умеренной температуре и физиоло химических реакций; при этом не возни
гической концентрации водородных ио кает никакой опасности, что клетка по
нов. В присутствии ферментов за какие- грязнет в месиве бесполезных побочных
то секунды протекаю т сложные после продуктов.
довательности реакций, для проведения Сотни протекающих в клетке химиче
которых в химической лаборатории по ских реакций, катализируемых фермен
требовались бы дни, недели или месяцы тами, организованы в виде множества
работы. К ром е того, реакции, катализи различных последовательностей идущих
руемые ферментами, идут со 100%-ным друг за другом реакций. Такие последо
выходом и без образования побочных вательности могут состоять из несколь
продуктов. В то же время известно, что ких р еак ц и й -о т 2 до 20 и более. Одни
реакции, которы е проводят в лаборато из этих последовательностей фермента
.ru
рии химики-органики, почти всегда со тивных реакций приводят к расщепле
провождаю тся образованием одного нию органических пищевых продуктов
или нескольких побочных продуктов. на более простые соединения, причем
Поскольку каждый фермент способен в процессе такого расщепления из них
ускорять лиш ь какую-то одну цепь ре извлекается химическая энергия. Другие
акций данного соединения, не влияя на последовательности реакций, требую
ib
другие возможные реакции с его уча- щих затраты энергии, начинаются
с малых молекул-предшественников, ко
А торые постепенно соединяются друг
с другом и образуют крупные
r-l
Е, и сложные макромолекулы. Все эти це
V
пи взаимосвязанных ферментативных
В реакций, составляющих в совокупности
клеточный метаболизм, имею т множе
Е*
e
ство узловых точек.
■ 1.6. Клетки используют
sh
.ru
ственная модель (£) аденозинтрифосфата(АТР). вой функционирующей протоплазмы
клеток данного вида. Следовательно,
жду двумя большими разветвленными катализируемые ферментами м етаболи
системами ферментативных реакций ческие реакции точно отрегулированы
в клетке. Одна из этих систем сохраняет и производят лиш ь столько простых
химическую энергию, поступающую из молекул разных видов, сколько их необ
ib
окружающей среды, в основном путем ходимо для сборки строго заданного
фосфорилирования бедного энергией числа молекул нуклеиновых кислот, бел
ADP и превращения его в богатый энер ков, липидов или полисахаридов каж до
гией АТР. Другая же система реакций го типа. Более того, живые клетки спо
r-l
использует энергию АТР для биосинте собны регулировать синтез своих соб
за клеточных компонентов из более ственных катализаторов - ферментов.
простых предшественников, выполнения Например, клетка может «выключить»
механической работы сократительных синтез фермента, необходимого для
e
и двигательных аппаратов, а также для производства какого-либо продукта из
sh
траты энергии.
реноса веществ через мембраны. Так же чает этот продукт в готовом виде из
как и биомолекулы, играющие роль внешней среды. Такая способность
строительных блоков, эти взаимосвя к самонастройке и саморегуляции по
занные системы ферментативных реак зволяет живым клеткам поддерживать
ций практически идентичны у больш ин внутри себя определенное стационарное
ства видов живых организмов. состояние даже в условиях значи
тельных изменений внешней среды. О т
1.7. Процессы клеточного сю да следует еще один принцип молеку
метаболизма находятся лярной логики живого состояния:
под постоянным контролем
Живые клетки представляют собой
Растущие клетки могут одновременно саморегулируемые химические си
синтезировать тысячи разных молекул стемы, настроенные на работу в режи
белков и нуклеиновых кислот в таких ме максимальной экономии.
относительных количествах, которые
20 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
ваемое из поколения в поколение количе зеттский камень, давш ий ключ к расши
ство генетической информации может фровке древнеегипетских иероглифов,
уместиться в крошечном клеточном ядре, насчитывают всего несколько тысячеле
в котором эта информация хранится. Мы тий. Однако есть все основания считать,
знаем теперь, что вся генетическая ин что многие современные бактерии имеют
формация, содержащаяся в бактериаль почти те же размеры, форму, внутрен
ib
ной клетке, заклю чена в одной больш ой ню ю структуру и содержат те же типы
молекуле дезоксирибонуклеиновой кис строительных блоков молекул фермен
лоты ( Д Н К ). А гораздо большее количе тов, что и бактерии, жившие миллионы
ство генетической информации, содержа лет назад. И это постоянство сохраняет
r-l
щееся в одной половой клетке человека, ся, несмотря на то что бактерии, как и все
закодировано в наборе молекул Д Н К об другие организмы, подвержены
щей массой всего лиш ь 6-10 ~ 12 г. Это непрерывным эволюционным измене
позволяет нам сформулировать еще один ниям. Генетическая информация не запи
важный принцип молекулярной логики
e
сана на меди и не выбита на камне, а хра
живого состояния: нится в форме Д Н К - настолько хрупкой
Генетическая информация закодирова органической молекулы, что она разры
sh
.ru
ную точность процесса генетической ре
пликации, в Д Н К изредка происходит то
или иное очень небольшое изменение —
мутация, которая может приводить
к появлению либо более совершенного
и более приспособленного потомства,
ib
либо, наоборот, потомства, менее спо
собного к выживанию. Таким путем
живые организмы непрерывно повы-
r-l
I
Т
e
?
u sh
ak
Линейный
код ДНК
Рис. 1-10. К омплементарность между кодирую- Рис. 1-11. Информация, записанная в виде ли-
щими элементами двух цепей Д Н К . нейной последовательности нуклеотидов
в Д Н К , транслируется (т. е. переводится) в трех
мерную структуру белков.
22 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
мерных компонентов. «Одномерная» ин логику живых клеток, мы ни разу не
формация, заключенная в Д Н К , преобра столкнулись с нарушением известных фи
зуется в «трехмерную» информацию, зических законов или с необходимостью
присущую живым организмам, путем сформулировать какие-либо новые за
трансляции (т. е. перевода с одного языка коны. «Мягкие» органические меха
на другой) структуры Д Н К в структуру низмы, обеспечивающие функционирова
ib
белка. В этом процессе принимает уча ние живых клеток, подчиняются той же
стие рибонуклеиновая кислота (РНК). совокупности законов, которые упра
В отличие от молекул Д Н К , имеющих вляю т работой машин, созданных чело
в основном одинаковую структурную веком; однако химические реакции и ре
r-l
форму, молекулы разных белков сам о гуляторные процессы, протекающие
произвольно свертываю тся характерным в клетках, гораздо более совершенны
для данного белка способом, образуя и намного превосходят возможности со
самые разнообразные трехмерные струк временной химической технологии
туры, каждая из которых выполняет спе
e
Хотя мы отдаем себе отчет в том, что
цифическую функцию. Точная геометрия сформулированные нами принципы, со
молекул данного белка определяется его ставляю щ ие в совокупности молекуляр
sh
.ru
личные классы биомолекул. Затем мы основ сельского хозяйства, эволюции,
перейдем к анализу изотермических, по экологии, а также великого кругово
следовательно связанных друг с другом, рота вещества и энергии между солн
саморегулируемых ферментативных ре цем, землей, растениями и живот
акций, составляющих систему, через ко ными.
ib
e r-l
u sh
ak
ak
ush
er-l
ib
.ru
ГЛАВА 2
К Л ЕТК И
.ru
Читатели могут задать вопрос: поче реакции в живых клетках протекают
му, приступая к обсуждению биохимии, в объемах, жестко ограниченных разм е
мы начинаем с клеток? Конечно, неко рами клеток или их органелл, необычай
торые из вас уже, возможно, изучали био но хрупкие стенки которых часто имеют
логию клетки. Тем не менее начать толщину порядка нескольких молекул.
с клетки необходимо, потому что боль К роме того, биохимические реакции
ib
шинство биохимических реакций в есте осуществляются только в водной среде
ственных условиях происходит именно при сравнительно низких постоянных
в клетках, а не в колбах или пробирках. температурах. Клетки не могут перено
Основное различие между биохимией сить экстремальной температуры или
r-l
и «обычной» химией состоит в том, что давления, экстремальной кислотности
биохимические реакции протекают или присутствия соединений, обладаю
в строго ограниченных условиях, за щих высокой химической активностью.
данных размерами клеток и их внутрен В дальнейшем, рассматривая химию био
e
ней структурой, а также физическими логических процессов, мы всегда должны
и химическими условиями, совместимы помнить о размерах, строении и свой
ми с жизнью клеток. ствах клеток, постоянно согласуя между
sh
.ru
ство лю бой клетки заполнено цитоплаз
различия, клетки разных типов обладаю т мой, в которой протекает большинство
поразительным сходством в своих катализируемых ферментами реакций
главных структурных особенностях клеточного метаболизма. Именно в ци
(рис. 2-1). К аж дая клетка окружена очень топлазме высвобождается химическая
тонкой мембраной, ограничивающей ее энергия, необходимая для построения
содержимое и позволяющей ей быть до
ib
клеточных структур и поддержания их
некоторой степени самостоятельной. целостности, а также для механической
Клеточная мембрана, которую назы ваю т работы сокращения и передвижения.
также плазматической мембраной, харак В цитоплазме всех клеток присутствуют
теризуется избирательной проницае
r-l
также рибосом ы - небольшие гранулы
мостью . Это ее свойство позволяет необ диам етром от 18 до 22 нм, функция ко
ходимым питательным веществам торых состоит в обеспечении синтеза
и солям проникать внутрь клетки, а из белков. Кроме того, все живые клетки со
лиш ним продуктам выходить из нее. В то держат ядро или ядерное тельце, в ко
e
торых происходит редупликация генети
Плазматическая ческого материала и его хранение в виде
мембрана Ядро или ядерное тельце дезоксирибонуклеиновых кислот (ДНК).
sh
.ru
2-2 приведены размеры некоторых на Гемоглобин (белок средних
иболее важных биологических структур размеров) 6,8
и, в частности, небольших биомолекул Рибосома E. coli 18
(аланина и глюкозы), макромолекул Вирус полиомиелита 30
(трех белков и липида), надмолекулярных Миозин (длинный палочко
видный белок) 160
Вирус табачной мозаики 300
ib
Таблица 2-1. Международная система еди- М итохондрия клетки печени 1 500
ниц Клетка E. coli 2 000
Х лоропласт из листа ш пи
ната 8 000
r-l
Основные единицы К летка печени 20 000
Единицы длины, используемые в биологии клетки вается, для этого есть важные причины.
и биохимии Самая маленькая жизнеспособная клет
ка-м и кр о о р ган и зм Mycoplasma- не м о
ak
= 10“ 9 м
жет быть намного меньше, чем она есть,
Н анометр (нм)
= 10“ 6 мм просто из-за того, что молекулы, из ко
= 10~3 мкм торых она построена, имеют фиксиро
М икрометр (мкм) = 10“ 6 м ванную величину, задаваемую разм ера
= 10~3 мм ми атомов углерода, водорода, кислоро
= 1000 нм да и азота. Д ля обеспечения жизнедея
тельности клетки необходимо, чтобы она
содержала хотя бы минимальное число
Устаревшие, но все еще часто используемые еди
ницы различных биомолекул. Поэтому, если
бы клетки были меньше, они должны бы
ли быть построены из более мелких ато
1 микрон (|i) = 1 м икрометр (мкм)
мов или молекул.
1 миллимикрон (мц) = 1 нанометр (нм)
1 ангстрем (А) = 0,1 нанометр (нм) С другой стороны, клетки, вероятно, не
могут бы ть намного больше, чем они
28 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
облегчить возможность быстрых взаи
модействий между специфическими м о
лекулами за счет сокращения пути, ко
торый они преодолевают, прежде чем
сталкиваю тся и вступают в реакцию друг I----------1
с другом. Вполне понятно, что одна из
ib
0 ,2 мкм
причин, по которой клетки имею т малые
размеры, состоит в том, что им при Рис. 2-2. Возраст этого напоминаю щ его бакте
рию микроископаемого, найденного в Ю жной
ходится обходиться без электрических Африке при раскопках залежей кремниевых по
или механических перемешивающих
r-l
род, носящих название «черный сланец»,
устройств. Д ругая причина связана с су составляет около 3,4 м иллиардов лет. Это
ществованием оптимального соотнош е одно из древнейших известных в настоящее вре
мя ископаемых получило название Eobacterium
ния между поверхностью и объемом кле isolatum, что означает «единственная бактерия на
ток. Благодаря тому что площ адь по заре (жизни)».
e
верхности клетки относительно велика К ороткая прям ая линия под этой и всеми после
по сравнению с ее объемом, в клетку про дую щ ими электронными микрофотографиями
характеризует м асш таб; 1 мкм составляет
никает большее число молекул пита
sh
1/10000 см.
тельных веществ в единицу времени.
В результате несложных вычислений терий. П рокариоты были первыми клет
можно убедиться в том, что с увеличе ками, возникшими в процессе биологиче
нием диам етра сферы отношение площ а ской эволю ции: ископаемые остатки этих
ди ее поверхности к объему резко сни клеток, возраст которых составляет бо
u
жается. (Попробуйте сами рассчитать лее 3 млрд. лет (ЗЛО9), были найдены
отношения поверхности к объему для в древних сланцах в Африке (рис. 2-2),
сфер диаметром 1, 10 и 100 мкм. П ло а также в Австралии. Эукариотические
ak
риал локализован в довольно неупорядо другие классы бактерий также могут осу
ченном, не окруженном мембраной ядер- ществлять фотосинтез, однако они не вы
ном тельце, или нуклеоиде. Эукариотиче деляю т кислород. Больш инство видов
ская клетка, напротив, содержит высо бактерий не способны к фотосинтезу
коорганизованное, очень сложное ядро, и получают энергию за счет расщепления
окруженное ядерной оболочкой, состоя питательных веществ, поступающих из
щей из двух мембран. Рассмотрим те окружающей среды. Существуют 20 раз
перь прокариотические и эукариотиче личных семейств прокариот, классифика
ские клетки несколько подробнее. ция и названия которых основаны на их
внешнем виде (рис. 2-3), а также на спо
2.4. Прокариоты - самые собности к передвижению, окраш ива
простые и самые мелкие нию, потреблению определенных пита-
клетки
.ru
Рис. 2-3. Классификация и названия некоторых
К прокариотам относятся около 3000 прокариот основаны на их внеш нем виде. А. Б а
ц и л л ы -п ал оч кообразн ы е м икроорганизмы,
видов бактерий, в том числе организмы, к которы м относится Escherichia coli, а также па
обычно называемые сине-зелеными водо тогенные микробы, вызы ваю щ ие дифтерию,
рослями. Сине-зеленые водоросли сос столбняк и туберкулез. Б. К окки-сф ерические
тавляю т особое семейство бактерий, бактерии. Иногда они объединяются, образуя
ib
пары (диплококки), группы (стафилококки) или
их современное и предпочтительное на цепочки (стрептококки; показаны на этом рисун
звание - цианобактерии («циано» - синий). ке). К коккам относятся бактерии, вызываю щ ие
Особое положение цианобактерий объяс скарлатину, некоторые виды пневмоний и ра
няется наличием у них выделяющей кис невые инфекции. В. С пирохеты -спиралевидны е,
r-l
часто очень длинные (до 500 мкм) бактерии. Н а
лород фотосинтетической системы, во рисунке показаны бактерии длиной от 10 до 15
многом сходной с системой фотосинтеза мкм. К этому классу м икроорганизм ов относит
высших зеленых растений. Н екоторые ся возбудитель сифилиса.
e
u sh
ak
3 м км
30 ЧАСТЬ I. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
молекулу Д Н К . Кроме того, можно лег
всей живой материи на Земле приходится ко индуцировать образование генетиче
на долю микроорганизмов, большинство ских мутантов прокариот, а затем выра
из которы х-прокариоты . Более того, щивать их. Благодаря всем этим свой
прокариоты играю т важную роль в био ствам бактерии сыграли важную роль
логических превращениях материи в формировании наших представлений
ib
и энергии на Земле. Фотосинтезирующие об основных молекулярных процессах,
бактерии, обитающ ие как в пресной, так обеспечивающих передачу генетической
и в морской воде, поглощ аю т солнечную информации.
энергию и используют ее для синтеза
r-l
углеводов и других компонентов клеток, 2.5. i ’sclierii hiii coli
которые в свою очередь служат пищей сам ая iim t'crm in
для других организмов. Некоторые бак
из прокариотических клеток
терии м огут фиксировать молекулярный
азот ( N 2 ) и з атмосферы, образуя биоло Escherichia coli (рис. 2.4)- типичная не
e
гически полезные азотсодержащ ие соеди патогенная бактерия, обитаю щ ая в желу-
нения. Таким образом, прокариоты дочно-кишечном тракте людей и многих
играю т роль отправной точки для м но высших животных. Эта бактерия иссле
sh
гих пищевых цепей в биосфере. К ром е т о дована наиболее полно из всех прокарио
го, прокариоты выполняю т функцию ко тических, а возможно, и любых других
нечных потребителей, поскольку раз клеток. Д лина клеток E. coli составляет
личные бактерии осуществляют расщ е около 2 мкм, а диам етр-н ем н ого мень
пление органических структур в мертвых ше 1 мкм. Клетки E. coli защищены кле
u
Клеточная Клеточная
стенка мембрана
0,5mii
.ru
Рис. 2-4. Д ва изображения клеток E. coli. Л.
Электронная микрофотография тонкого среза.
В центре видны две клетки, которые только что
завершили деление, но еще не разошлись.
ib
Светлые участки в центре каждой клетки -
ядреные тельца, или нуклеоиды, содержащие
Д Н К . Очень темные гранулы в ц и то п л а зм е -р и
босомы. Б. Электронная м икрофотография по
верхности клеток E. coli, на которой видны пили
r-l
и жгутики.
0,5 мкм
мелкие кольцевые фрагменты занный белками. Клеточная мембрана
Д Н К - плазмиды. В дальнейш ем м ы уви обладает избирательной проницае
дим, что изучение этих не связанных с ос мостью и содержит белки, способные
e
новной молекулой Д Н К полунезави транспортировать питательные вещества
симых генетических элементов привело внутрь клетки, а продукты р а с п а д а-и з
клетки во внешнюю среду. В клеточной
sh
Клеточная стенка
Чехол
.ru
Внутренние мембраны,
ib
Липидные капельки содержащие фотосинте-
Ядерное тельце
тические пигменты 2 мкм
щ иту клетки. Клеточная мем брана транс к ним; напротив, токсические вещества
портирует питательные вещества внутрь отталкиваю т бактерии, и они движутся
клетки и ненужные продукты из нее нару в противоположную сторону. Таким
ak
.ru
внутренней структурой. П одобно прока
риотам, эукариотические клетки также
могут делиться неполовым путем, но это
происходит с помощ ью значительно бо
лее сложного процесса, называемого ми
тозом. П оловые клетки (гаметы) эука
ib
риотических организмов способны
к сложной половой конъюгации, сопро
вождаемой обменом генами.
r-l
Рис. 2-6. Хемотаксис у бактерий. Подвижные Еще одно важное различие между эука
бактерии м огут чувствовать незначительные риотами и прокариотами состоит в том,
концентрационные градиенты и «плыть» в на
правлении к аттрактантам типа питательных ве что эукариотические клетки, кроме орга
ществ. С пом ощ ью одного или нескольких жгу низованного ядра, содержат целый ряд
тиков клетка перемещается по прямолинейным других ограниченных м ем бранами вну
e
траекториям, прерываемым «кувыркающимися» триклеточных органелл, таких, как мито
движениями. Бактерия движется к аттрактанту
(или от репеллента) не по прямому, а по извили хондрии, эндоплазматический ретикулум
стому пути. и тельца Гольджи. Каждая из этих орга
sh
Шероховатый
плазматический
ретикулум
.ru
Тельце Гольдж!
Ядрышко
Митохондрии
ib
r-l
Ядро
e
Плазматическая
мембрана
sh
I---------------- 1
0,25 мкм
нетического материала и часто претерпе Рис. 2-7. М икроф отограф ия крысиного гепато-
ваю т половую конъюгацию, при которой цита (клетки печени основного типа), полученная
м етодом трансмиссионной электронной м икро
может происходить обмен генами, эука
u
.ru
Рис. 2-8. А. Электронная микрофотография хо
0,5 мкм
ib 0 ,5 мкм
браны ядерной оболочки сливаются друг сти событий -м ит оза. Н аиболее важ
с другом, образуя отверстия с диам етром ные стадии м итоза показаны на рис.
около 90 нм -ядерны е поры. Через эти о т 2-9. После завершения м итоза хром а
верстия происходит обмен различными тин вновь распределяется по всему
веществами между ядром и цитоплаз ядру.
мой. Таким образом, хорошо оформленное
Внутри ядра находится ядрышко ядро эукариотической клетки имеет
(рис. 2-8), которое прокрашивается более очень сложную структуру и выполняет
интенсивно благодаря высокому содер значительно более сложные биологиче
жанию в нем рибонуклеиновой кислоты ские функции по сравнению с относи
(РНК). Ядрышко служит «фабрикой» тельно простым ядерным тельцем прока
РН К ; здесь же осуществляются первые риот.
этапы синтеза рибосом.
В остальной части ядра содержится
хроматин, названный так за его способ-
2'
36 ЧА СТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
наборов микротрубочек Нити веретена
ib
r-l
2.8. Митохондрии - хондрию. Внутренняя же мембрана обра
«силовые установки» зует выступающие внутрь митохондрии
e
эукариотических клеток, складки -кристы. В митохондриях пече
поставляющие энергию ни число крист сравнительно невелико,
тогда как в сердечных клетках имеется
sh
Весьма заметное место в цитоплазме очень много крист, причем они распола
эукариотических клеток занимаю т мито гаются параллельно друг другу. Внутрен
хондрии (рис. 2-10). Размеры, внешний нее пространство митохондрий заполне
вид, число митохондрий, а также место но гелеподобным веществом -м ат рик
их локализации могут варьировать сом.
в очень широких пределах в зависимости М итохондрии выполняют в клетке
u
Матрикс (пространство,
ограниченное внутренней
мембраной)
0,5 мкм
.ru
Рис. 2-10. Структура митохондрий. Название никли в ходе эволюции путем вторжения
митохондрий происходит от греческих слов в цитоплазму крупных прокариотических
“m itos” - нить и “chondros” - зерно или семя. анаэробных клеток других прокариоти
В некоторых клетках митохондрии имею т вы тя
нутую, почти нитевидную форму, однако в боль ческих клеток меньшего размера, спо
ш инстве случаев для них характерна эллиптиче собных использовать молекулярный кис
ib
ская или сферическая форма. Н а приведенной лород для окисления питательных ве
здесь электронной м икрофотографии митохон ществ (рис. 2-11). Вторгнувшиеся бакте
дрии из клетки поджелудочной железы видна
гладкая внешняя м ембрана и многочисленные рии стали, таким образом, паразитами
складки внутренней м ем б р ан ы -кри сты . в клетках-хозяевах. В ходе дальнейшей
r-l
эволюции эти взаимоотнош ения при
В митохондриях содержится неболь обрели со временем характер симбиоза,
шое количество Д Н К , а также РН К и ри выгодного как для хозяина, так и для па
босомы. М итохондриальная Д Н К коди разита. Сейчас мы знаем, что во время
e
рует синтез некоторых специфических деления клетки митохондрии тоже делят
белков внутренней мембраны. Может ся. Таким образом, не исключено, что
возникнуть вопрос: почему в м итохон Д Н К и рибосомы м и то х о н д р и й -это по
sh
Эволюция
Мелкая эука-
бактерия за - ТИ
Рио" Митохондрии со
Ч6—
крепляет свои ских своей ДНК
Мелкая позиции как кле-
бактерия внутриклеточ- т°к
|проникает— » ныйсимбионт^шЦ
в цитоплаз Она сотрудни Двойная мембра
му клетки- чает с клеткой- на, окружающая
хозяина и хозяином,обес ядро современ
размножается печивая окисление ной эукариоти
питательных веществ ческой клетки
38 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
роль в биосинтезе липидов. В эукариоти
ществ, как правило, из клетки во внеш ческих клетках различных типов он раз
ню ю среду. О днако в некоторых клетках личается по форме и выполняет разные
цистерны служат хранилищами запа функции. Так, в клетках скелетных мышц,
сенных питательных веществ. Суще сокращение которых стимулируется ио
ствуют два типа эндоплазматического нами С а +, эндоплазматический рети
ib
ретикулума: шероховатый и гладкий. Н а кулум участвует в процессе расслаб
ружная поверхность м ембраны ш ерохо ления, обеспечивая реабсорбцию ионов
ватого эндоплазматического ретикулума С а2 + .
e r-l
sh
---------- 1
u
0 ,5 мкм
ak
Цистерны
1 мкм
Рис. 2-12. А. Эндоплазматический ретикулум
(шероховатый) клетки поджелудочной железы
Клетки этого типа очень активно синтезируют
белки на рибосомах, прикрепленных к внешней
поверхности м ембраны, а затем секретируют их
в цистерны. Слева видна часть митохондрии. Б.
О тдельные рибосом ы и цистерны при больш ем
увеличении. В. Схема, иллю стрирую щ ая трех
мерную структуру эндоплазматического ретику
лума. Видно, как из узких цистерн формирую тся
сплош ные лабиринтоподобны е каналы, про
низываю щ ие значительную часть цитоплазмы
клетки.
ГЛ. 2. К Л Е Т К И 39
.ru
терна стопкообразная структура, состоя готовых компонентов внешней клеточ
щая из уплощенных пузырьков, каждый ной стенки из внутренней части клетки,
из которых окружен одиночной м ем где они синтезируются, к внешней, где
браной. О т краев пузырьков больших они присоединяются к растущей клеточ
размеров отпочковываются сферичес ной стенке.
ib
e r-l
sh
Б
0 ,2 5 мкм
Рис. 2-13. А. Тельце Гольдж и в цитоплазм е 2.11. Л изосомы - к о н т е й н е р ы
амебы. Мелкие сферические пузырьки отще- с ГИ Д роЛИ ТИ ЧеС КИ М И ф е р м е н т а м и
пляю тся от краев более крупных уплощенных
u
.ru
гаю тся гидролитическому расщеплению
до простейших составных частей, посту
пающих затем обратно в цитоплазму.
У людей с наследственной болезнью
Т ея -С а кса в лизосомах нет ряда фер
ментов, гидролизующих липиды, в ре
ib
зультате чего некоторые из этих соедине
ний накапливаются в мозгу и других
тканях, что приводит к задержке ум
ственного развития.
r-l
2.12. Пероксисомы-
пузырьки, разрушающие
перекись водорода
e
Еще один тип окруженных мембраной
цитоплазматических органелл предста
вляю т пероксисомы (рис. 2-14). Эти
sh
их название-пероксисом ы . Необычайно
токсичная для клеток перекись водорода
(Н2О 2) расщепляется в пероксисомах на
воду и кислород под воздействием еще
одного содержащегося в них фермента —
каталазы. Благодаря тому что фер
менты, образующ ие перекись водорода,
и каталаза локализованы внутри перок-
сисом, остальное содержимое клетки за 2 5 мкм
щищено от разруш аю щ его воздействия Рис. 2-15. Актиновые и миозиновые нити в фи-
перекисей. бробластах-специализированны х клетках
соединительной ткани. А. Тонкие актиновые ни
ти, выявленные с помощ ью флуоресцентного
маркера. Б. М иозиновые нити, расположенные
около ядра.
ГЛ. 2. К Л Е Т К И 41
.ru
при перемещении различных структур
внутри клеток.
Второй тип нитей в эукариотических
к л етках -это миозиновые нити, которые
намного толщ е актиновых (рис. 2-15).
М иозиновые нити - основной компонент
ib
сократительного аппарата скелетной
мышцы, однако они встречаются и в не-
мышечных клетках, часто в ассоциации
с тонкими актиновыми нитями. В клет
r-l
ках некоторых типов миозиновые нити
прикреплены к клеточной мембране. Ак-
тиновые и миозиновые нити связаны
с различными видами клеточных и вну
e
триклеточных передвижений.
Нити третьего типа еще толще, их диа
метр составляет около 10 нм. Такие нити
sh
.ru
обнаружена при помощ и высоковольтно лета фибробласта человека схематически
го электронного микроскопа, обладаю показано на рис. 2-17.
щего очень высокой разреш аю щ ей спо
собностью. Д о применения этого метода
микротрабекулярную сеть удавалось на 2.16. Реснички и жгутики позволяют
блю дать только в виде неразреш аемого клеткам передвигаться
ib
фона, названного основным веществом Реснички и ж гутики-подвиж ны е
цитоплазмы. М икротрабекулярная сеть структуры, или отростки, выступающие
состоит из очень тонких переплетающих с поверхности многих одноклеточных эу
ся нитей, химический состав которых по кариот и некоторых клеток животных (но
r-l
ка неизвестен, но в них почти наверняка не растений), построены по одному обще
содержатся белки. Точная трехмерная му архитектурному плану (рис. 2-18).
организация и функция микротрабеку- Важно, однако, подчеркнуть, что жгутики
лярной сети в различных клетках в на эукариот очень сильно отличаются от
стоящее время активно исследуются.
e
жгутиков прокариот. Жгутики прокариот
намного тоньш е (10-20 нм) и состоят из
отдельных белковых нитей. Они предста
sh
(gi ib v
'« i « о ' I )
хФ. <•* ftl >
.ru
0 ,2 5 мкм
ib --------- »
Направление движения
r-l
В
0 ,5 мкм
Рис. 2-18. Реснички и жгутики имею т одинако жении клеточной мембраны, что наблю
e
вое строение, но реснички значительно короче. дается, например, у амебы.
П ары микротрубочек окружены выступающ ими
за пределы клетки цитоплазмой и клеточной
мембраной. Скольжение и закручивание м икро 2.17. В цитоплазме
sh
.ru
пающей из крови глю козы в молочную
кислоту в работаю щ ей скелетной мышце
осуществляется в результате последова
тельного образования 10 промежу
точных продуктов, причем только по
следний из них непосредственно превра
ib
щается в молочную кислоту.
К третьему классу растворенных в ци
тозоле веществ относятся различные к о -
ф е р м е н т ы , а также АТР и A D P - главные
r-l
компоненты системы переноса энергии
в клетке. И наконец, в цитозоле содер
0 ,0 5 мкм жатся различные и о н ы н е о р г а н и ч е с к и х с о
Рис. 2-19. Г ранулы гликогена (интенсивно окра л е й , такие, как К + , M g2 + , С а2 + , С1 “ ,
e
шенные) в цитоплазм е клетки печени хомяка. НСОз и H P O 2".
Г ранулы состоят из больш их групп, образуемых Все составные части цитозоля поддер
м олекулами гликогена. П о своим разм ерам они
значительно превыш аю т рибосомы, которые
живаются в постоянных концентрациях
sh
.ru
димости быстро расти и делиться, и по тельных веществ должны проходить
тому их энергетические потребности с высокой скоростью в ходе усвоения
обычно не столь велики. переваренной пищи.
Вместе с тем эукариотические клетки
характеризуются специфическими струк 2.20. На поверхности многих
турными особенностями, обеспечиваю животных клеток имеются
ib
щими максимальное отношение площ а также «антенны»
ди поверхности клетки к объему. Так,
нервные клетки, в которых интенсив С внешней стороны плазматической
ность метаболизм а относительно высо мембраны многие клетки животных тка
r-l
ка, имеют длинную и узкую форму и со ней имеют тонкую гибкую клеточную
ответственно больш ую площ адь поверх оболочку. В ней содержится больш ое
ности. Ф орма других клеток может быть число разнообразных полисахаридных,
весьма разветвленной или звездообраз липидных и белковых молекул, располо
ной, однако чаще всего площ адь поверх женных на наружной стороне плазмати
e
ности клетки увеличивается благодаря ческой мембраны. Н а поверхности клет
образованию на ней многочисленных ки находится много различных молеку
складок или пальцеообразных отростков лярных структур, принимающих и рас
sh
m s
v. ■
- '
* Рис. 2-20. М икроф отограф ия поверхности изо
лированной клетки печени крысы, полученная
методом сканирующей электронной микроско
пии. Видно, что площ адь поверхности клетки
сильно увеличена за счет микроворсинок, ф орма
5 мкм и расположение которых постоянно меняются.
46 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
стимулируют определенный аспект кле жалуй, наиболее явное различие состоит
точной активности. Другие специфиче в том, что больш инство растительных
ские участки на поверхности животных клеток содержит пластиды. П ластиды -
клеток м огут распознавать и связывать это расположенные в цитоплазме специа
некоторые чужеродные для данных кле лизированные органеллы, окруженные
ток белки. Связывание чужеродных бел двумя мембранами. К самым типичным
ib
ков с такими участками вызывает о т пластидам, характерным для всех клеток
ветные реакции клеток, в результате чего зеленых растений, относятся хлоро-
развивается аллергия. Эти же специфиче пласты (рис. 2-22). П одобно митохон
ские участки отвечают за отторжение чу дриям хлоропласты можно рассматри-
r-l
жеродных для данного реципиента тка
ней и органов после их хирургической
пересадки. Таким образом, поверхность Рис. 2-21. Электронная микрофотография клет
многих животных клеток представляет ки листа кукурузы. Заметьте, что по своим раз
собой поистине сложную мозаику, сос мерам хлоропласты значительно превышают
e
митохондрии, однако число их меньше числа
тавленную из различных чувствительных митохондрий. По мере увеличения возраста
молекулярных «антенн», при помощ и ко клетки вакуоль обычно становится крупнее. Кле
торых клетки общ аю тся с внешним м и точная стенка относительно толстая и жесткая.
sh
К леточная стен ка
u
ak
Хлоропласт 5 мкм
ГЛ. 2. К Л Е Т К И 47
Внутренняя мембрана
.ru
Рис. 2-22. Х лоропласт фотосинтезирующей
клетки листа салата. 1 М КМ
ib
чие между ними заключается в том, что и рибосомы. Вполне вероятно, что хлоро
хлоропласты - это с о л н е ч н ы е силовые пласты, как и митохондрии, произошли
установки, использующие энергию света, в ходе эволюции эукариотических клеток
тогда как митохондрии - х и м и ч е с к и е «си из паразитирующих прокариот (см.
r-l
ловые установки», использующие хими рис. 2-11). Однако в данном случае про
ческую энергию молекул питательных кариотами, проникшими в другие более
веществ. Хлоропласты поглощ аю т свето крупные прокариотические клетки, были,
вую энергию и используют ее для восста по-видимому, примитивные цианобакте
новления двуокиси углерода с образова рии, придавшие клеткам способность
e
нием углеводов, например крахмала, что к фотосинтезу и образованию кисло
сопровождается высвобождением м оле рода.
кулярного кислорода (О 2). Фотосинтези Растительные клетки содержат также
sh
тохондрий и могут иметь самую разную таболизм а. Эти продукты часто агреги
форму. И з-за высокого содержания в фо руют с образованием кристаллических
тосинтезирующих клетках пигмента х л о отложений. В молодых клетках вакуоли
р о ф и л л а они обычно окрашены в зеленый имеют небольшую величину, но по мере
цвет, однако их окраска может меняться старения клеток их размеры увеличи
в зависимости от относительных коли ваются, и часто они заполняю т весь
честв других пигментов, содержащихся объем клетки. Вакуоли встречаются так
в хлоропластах. М олекулы этих пигмен же и в некоторых животных клетках, но
тов, которые в совокупности способны здесь они, как правило, значительно
поглощ ать световую энергию во всей ви мельче. У растительных клеток нет ни ре
димой области спектра, располагаю тся сничек, ни жгутиков.
во внутренней мембране хлоропласта. Больш инство клеток высших растений
Эта мембрана свернута весьма сложным полностью окружено к л е т о ч н о й с т е н к о й ,
образом в виде дисков, называемых т и - которая служит в основном жесткой за
48 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
погруженных в органический «клей». Стенки
растительных клеток очень прочны, по своей
структуре они напом инаю т бетонную плиту,
0 ,5 мкм укрепленную стальной арматурой.
ib
строение и очень прочна (рис. 2-21 форму, определенные размеры и химиче
и 2-23). Она состоит из целлюлозных во ский состав. Некоторые вирусы можно
локон, «склеенных» друг с другом получить даже в кристаллическом виде;
сложными полимерными цементирую
r-l
следовательно, они ведут себя как
щими веществами. Вода и небольшие м о чрезвычайно крупные молекулы. Однако
лекулы легко проходят через поры в кле как только вирусная частица (или ее ну
точной стенке, которая, однако, предо клеиновая кислота) проникает в специфи
храняет клетку от набухания и растяже ческую для нее клетку-хозяина, форма ее
e
ния. В одеревеневших частях растений существования качественно изменяет
и стволах деревьев первичные клеточные с я - о н а становится внутриклеточным па
стенки окружены толсты ми прочными разитом. Вирусная нуклеиновая кислота
sh
триваются как единицы живой материи, ства новых дочерних вирусных частиц.
не может быть полным, если мы не кос В результате заражение клетки-хозяина
немся вирусов. Хотя вирусы и не являю т одним-единственным вирионом может
ся живыми, они представляют собой привести к образованию десятков или да
образующиеся биологическим путем же сотен новых вирусных частиц
надмолекулярные комплексы, которые (рис. 2-24). В одних системах х о зя и н -в и
способны к самовоспроизведению в со рус образовавш иеся вирионы высвобо
ответствующих клетках-хозяевах. Вирус ж даю тся из клетки-хозяина, которая
состоит из молекулы нуклеиновой кис в дальнейш ем погибает и подвергается
лоты и окружающей ее защ итной обо лизису. В других же системах вновь син
лочки, или капсида, построенной из бел тезированная вирусная нуклеиновая кис
ковых молекул. Вирусы существуют лота остается внутри клетки-хозяина,
в двух состояниях. Вне сформировавших иногда лиш ь незначительно влияя на ее
их клеток вирусы представляю т собой жизнеспособность; однако часто при
ГЛ. 2. К Л Е Т К И 49
.ru
как это имеет место, например, в случае
вируса табачной м оза и ки -о д н о го из про
стейших вирусов, который первым был
получен в кристаллическом виде
(рис. 2-25). Другие вирусы могут содер
ж ать десятки и сотни белков различных
ib
типов. Размеры вирусов варьирую т в ш и
Пустая оболочка роких пределах. Так, один из самых м ел
ких вирусов, бактериофаг фХ174, имеет
Впрыснутая в клетку диаметр 18 нм, тогда как один из самых
r-l
.^нуклеиновая кислота
крупных вирусов-вирус осповакцины —
по разм ерам своих частиц соответствует
самы м мелким бактериям. Вирусы раз
личаются также по форме и степени
e
сложности их структуры. К числу наибо
лее сложных относится бактериофаг Т4
(рис. 2-25), для которого клеткой-хозяи
sh
Бактериофаги E.coli
фХ 174 ДНК 6 18 М ногогранник
Т4 ДНК 220 200 Г оловастикоподобная
X (лямбда) ДНК 50 120 Г оловастикоподобная
MS2 РН К 3,6 20 М ногогранник
Вирусы растений
.ru
Вирус табачной
мозаики РН К 40 300 Палочковидная
Вирус кустистой
карликовости том ата РН К 10,6 28 М ногогранник
Вирусы животных
Вирус полиомиелита РН К 6,7 30 М ногогранник
Обезьяний вирус 40 ДНК 28 45 Сферическая
ib
(SV40; вызывает рак
у новорожденных жи
вотных)
Аденовирус ДНК 200 70 Многогранник
r-l
(вызывает обычную
простуду)
Вирус оспы ДНК 4000 250 Сферическая
e
цию о структуре хромосом, механизмах из них снабжены жгутиками, с помощ ью
ферментативного синтеза нуклеиновых которых они могут передвигаться. В ци
sh
.ru
ib
e r-l
25 нм
sh
Рис. 2-25. А. Вирус табачной, мозаики, имеющий клетки. Л изосомы содержат деструк
палочковидную форму. Электронная микрофо тивные ферменты, а пероксисомы отде
тография (Б) и м одель (В) бактериофага ляю т ферменты, образующ ие и разру
Т 4 - сложного вируса, по своей ф орме напоми
ш аю щ ие перекиси, от остального содер
наю щ его головастика. П осле прикрепления кон
цевых нитей бактериофага к специфическим жимого клетки. В цитоплазме эукариоти
ческих клеток обнаруживаю тся микрофи
u
.ru
ценнных сведений о биохимических ас of the Living Cell, Sei. Am., 244, 56-67, March
пектах переноса генетической информа (1981).
ции. Satir P. How Cilia Move, Sei. Am., 231, 44-63,
O ctober (1974).
Sloboda R.D . The Role of M icrotubules in Cell
Л И Т Е РА Т У РА Structure and Cell Division, Amer. Sei., 68,
290-298 (1980).
ib
Учебники Wessells N. K. How Living Cells Change Shape,
C unis Н. Biology, 3d ed., W orth, New York, Sei. Am., 225, 76-85, O ctober (1971).
1979. П рекрасно написанный и иллю стриро
ванный учебник по общей биологии.
r-l
Dyson R.D . Cell Biology: A M olecular Вопросы и задачи
Approach, 2d ed., Allyn and Bacon, Boston,
1978. Учебник с биохимической ориента Ч тобы понять молекулярную логику кле
цией. ток, мы должны научиться оценивать свой
Fawcett D. W. The Cell, 2d ed., Saunders, Phil ства и взаимодействие биомолекул как в каче
e
adelphia, 1981. Электронные м икроф отогра ственном, так и в количественном отношении.
фии различных клеток и тканей. Мы должны также уметь анализировать
Karp G. Cell Biology, M cGraw-Hill, New York, сложные явления, происходящие в живой
sh
1979. Особое внимание уделено молеку клетке, сводя эти явления к самым простым
лярны м аспектам передачи генетической компонентам и процессам, лежащим в их ос
информации. нове. С этой целью в конце каждой главы при
Ledbetter М. С., P orter K .R . Introduction to the водится ряд задач, иллюстрирующих важные
Fine Sctructure of Plant Cells, Springer-Verlag, биохимические принципы. Одни задачи
New York, 1970. имеют конкретные численные решения, харак
u
Loewy A. G., Siekevitz P. Cell Structure and теризующие размеры молекул и клеток или
Function, 3d ed., Holt, New York, 1979. скорости биохимических процессов. Чтобы
решить другие задачи, в которых требуется
Интересные книги
ak
Segel L. Biochemical Calculations, 2d ed., Wiley, плотность (главным образом за счет воды)
New York, 1976. Особенно хорошо осве равна в среднем 1,1 г/см 3?
щены вопросы ферментативной кинетики. б) Толщ ина защитной клеточной стенки Е.
Wood W.B.. Wilson J.H., Benhow R. М., Hnod L. coli равна 10 нм. Какую долю (в процентах)
E. Biochemistry: A Problems Approach, 2d общ его объема бактерии составляет кле
ed., Benjamin, Menlo Park, Calif., 1981. точная стенка?
В этой уникальной книге, охватывающей в) E. coli быстро растет и размнож ается б л а
широкий круг проблем, рассмотрены ос годаря тому, что в ее клетке присутствует
новные разделы биохимии и приведено боль около 15000 сферических ч асти ц -р и бо со м
шое число различных контрольных вопросов (диаметр 18 нм), осуществляющих синтез
и задач с численными решениями. Основные белков. Какая часть общ его объема клетки
разделы представлены примерно в той же по приходится на долю рибосом?
следовательности, что и в данной книге. 4. Генетическая информация в Д Н К E. coli.
Ниже приведено несколько задач, относя Содержащ аяся в Д Н К генетическая инфор
.ru
щихся к содержанию гл. 2. Их решение пом о мация закодирована линейной последова
жет читателю более четко уяснить геометри тельностью ключевых слов, называемых
ческие и численные соотношения, характери кодонами. Каждый кодон представляет со
зующие структуру клеток и их функции. Для бой специфическую последовательность
упрощения цитирования и обсуждения каждая трех нуклеотидов (три пары нуклеотидов
задача имеет свое заглавие. в двухцепочечной Д Н К ) и соответствует
L Малые размеры клеток и их составных ча одному аминокислотному остатку в белке.
ib
стей. Из данных, приведенных в табл. 2-2, Д Н К E. coli имеет очень больш ую молеку
приблизительно рассчитайте число а) кле лярную м ассу -п р и м ер н о 2,5- 109. Средняя
ток печени, б) митохондрий и в) молекул молекулярная масса пары нуклеотидов
миоглобина, которые можно поместить равна 660, причем вклад каждой пары ну
r-l
в один слой на кончике булавки (диаметром клеотидов в общ ую длину молекулы Д Н К
0,5 мм). П редполагается, что все структуры составляет 0,34 нм.
имеют сферическую форму. П лощ адь круга а) Используя л и данные, рассчитайте длину
равна лт2, где л = 3,14. молекулы Д Н К E. eoli. Сравните длину м о
2. Число растворенных молекул, содержащих лекулы Д Н К с размерами клетки. Каким
e
ся в самых мелких из известных клеток. образом ей удается уместиться в клетке?
Самыми мелкими из всех известных клеток б) Подсчитайте, чему равно максимальное
являются микоплазм ы -сф ерические клет число белков, которое мож ет бы ть закоди
ровано в молекуле Д Н К E. coli, если пред
sh
нию.
а) Основным источником энергии для мико В идеальных условиях бактериальная клет
плазм служит D -глюкоза, ее концентрация ка обычно вдвое увеличивается в размерах
внутри таких клеток составляет около и делится каждые 20 минут, тогда как жи
ak
1,0 мМ . Рассчитайте число молекул глю вотным клеткам для этого требуется при
козы, содержащихся в одной клетке. Число мерно 24 ч. Из-за высокой скорости м ета
Авогадро (число молекул в 1 моле неиони- болизма бактериям необходимо иметь
зированного вещества) равно 6 ,0 2 -1023. больш ую площ адь поверхности по отнош е
О бъем сферы равен 4/Зтгг3. нию к объему клетки.
б) Во внутриклеточной жидкости микоплазм а) Почему максимальная скорость м етабо
содержится 10 г гексокиназы (мол. масса лизм а долж на зависеть от соотношения
100000) в 1 л. Рассчитайте молярную кон между поверхностью клетки и ее объемом?
центрацию гексокиназы -первого фермен б) Рассчитайте отношение площ ади поверх
та в цепи реакций, приводящих к расщепле ности клетки к ее объему у сферической
нию глю козы с образованием энергии. бактерии Neisseria gonorrhoeae (диаметром
3. Компоненты E. coli. Клетки E. coli имеют 0,5 мкм), вызывающей гонорею. Сравните
форму цилиндра высотой 2 мкм и диам ет полученное значение с отношением поверх
ром 0,8 мкм. Объем цилиндра вычисляется ности клетки к ее объему у шаровидной
по формуле яг2/), где h - высота цилиндра. амебы крупной эукариотической клетки
а) Сколько весит одна клетка E. coli, если ее диаметром 150 мкм.
54 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
благодаря тому, что площ адь их поверхно
сти, соприкасаю щейся с питательными ве
ществами, увеличена за счет микроворси
нок. Предположим, что эпителиальная к------ 0,2 м км ----- у
клетка, выстилаю щ ая просвет тонкого ки
Р асполож ение микроворсинок на
шечника, имеет форму сферы (диаметром
покрытом ими участке
20 мкм). Поскольку лиш ь часть клетки
ib
обращ ена в просвет кишечника, будем счи 4яг2. Исходя из этих данных, рассчитайте:
тать, что микроворсинки покры ваю т уча а) число микроворсинок на покрытом ими
сток, площ адь которого составляет 25% участке, б) площ адь поверхности этого
площ ади поверхности клетки. П редполо участка без микроворсинок, в) площ адь по
r-l
жим также, что микроворсинки имею т фор верхности участка с учетом микроворси
му цилиндров высотой 1,0 м км и диам ет нок, г) на сколько процентов увеличится по
ром 0,1 мкм и располагаю тся в виде глощ аю щ ая способность (определяемая
регулярной решетки с расстоянием 0,2 мкм отношением площ ади поверхности клетки
между центрами двух соседних м икровор к ее обьему) благодаря наличию микровор
e
синок. П лощ адь поверхности сферы равна синок?
u sh
ak
ГЛАВА 3
.ru
СОСТАВ Ж И В О Й М А ТЕ РИ И :
БИОМОЛЕКУЛЫ
М ы уже убедились в том, что жи З Л , Х и м и ч ес ки й c o c ia ii
ib
вотные и растения различных видов по ЖИВОЙ \ U S i t j t U H O i l M M d C i e » !
химическому составу во многом сходны u i м ш и 1«:CKi.>! о с о с т а в а
между собой. Например, все молекулы К'МНШ! КЧ»|1Ы
белков у всех видов живых организмов
r-l
построены из одного и того же набора 20 Д ля различных форм живого необхо
различных аминокислот. Точно так же димы лиш ь 27 из 92 природных химиче
нуклеиновые кислоты у всех видов по ских элементов, присутствующих в зем
строены из одного и того же набора ну ной коре. Они перечислены в табл. 3-1.
e
клеотидов. Теперь мы увидим, что по хи Больш инство встречающихся в живой
мическому составу живая материя очень материи элементов имеют сравнительно
сильно отличается от неживой материи небольшие порядковые номера, и лишь
sh
земной коры. Поэтому, прежде чем при у трех из них порядковые номера превы
ступить к изучению биомолекул и их ш аю т 34. Более того, соотношение этих
взаимодействий, следует задать несколь химических элементов в живых организ
ко важных вопросов. Какие химические мах совсем иное, чем в земной коре (табл.
элементы и в каких соотношениях обна 3-2). В живых организмах в наибольших
руживаются в клетках? Как они туда по количествах встречаются четыре элемен
u
2 мм
u
.ru
именно той жидкой средой, в которой
•менты, встречающиеся в виде ионо живые организмы впервые появились на
Натрий N a + Кальций Ca ранних этапах развития Земли.
Калий К + Хлор СГ
Магний M g2 +
3.2. Большинство биомолекул
Микроэлементы содержит углерод
ib
Ж елезо Fe Никель Ni
Медь Cu Хром Cr Химические свойства живых организ
Цинк Zn Фтор F мов в значительной степени зависят от
Марганец Mn Селен Se углерода, на долю которого приходится
r-l
Кобальт Co Кремний Si
более половины их сухого веса. Углерод,
Йод I Олово Sn
В
так же как и водород, кислород и азот,
Молибден Mo Бор
V М ышьяк As может образовы вать ковалентные связи,
Ванадий
т. е. связи, осуществляемые парами элек
тронов, принадлежащими обоим соеди
e
дорода и азота, вместе взятых, приходит няющимся атом ам (рис. 3-1). Д ля запол
ся менее 1% ее общей массы. Вместе с тем нения внешней электронной оболочки
восемь из десяти элементов, содержа
sh
Н'
Н
:О ' •N ‘ + 3 H ' -» :N Н =
:N * H
н
с- Аммиак
.ru
Рис. 3-1. О бразование ковалентных связей. М е
жду двум я атом ам и, имею щ ими на внешних Н 1
оболочках неспаренные электроны, м огут обра
зоваться ковалентные связи путем «обобщ ест
•с • + 4Н • н £ :н = н —С — Н
вления» электронных пар (молекулярных орби
н Н
талей). Атомы, участвующие в формировании
ковалентных связей, стрем ятся к заполнению Метан
ib
своих внешних электронных оболочек.
Линейный Циклический
I I I I I I I I I I .i.
- С — С — С - С - С - С - С — С — С — С— ^ С х I V — С — С — С — С-
I I I I I I I I I I
— С—
Р азв етвл ен н ы й
I I I I I II I
— С - С — С —С - С - С - С - С —
L I I I —I
.ru
— С— С—
I
— С—
Рис. 3-3. Углерод-углеродные связи Образуют I
каркас молекул многих органических веществ.
ib
этих связей составляет около 109,5° кой другой химический элемент не может
(рис. 3-4). В молекулах различных орга образовы вать молекулы, столь раз
нических соединений этот угол у разных личные по разм ерам и форме, а также по
атомов углерода несколько изменяется. строению боковых цепей и функцио
r-l
Благодаря такому свойству углеродсо нальных групп. Необычайная сложность
держащие соединения образую т разно- внутриклеточных структур в значитель-
ной мере отражает разнообразие разме женные группы; в этом случае вращение
ров и форм органических молекул, из ко может быть ограничено. Благодаря тако
торых они построены. му свойству органические молекулы
Второе важное свойство органических с больш им числом одинарных связей м о
соединений заключается в том, что со гут принимать различные формы, назы
ставные части их молекул могут абсо ваемые конформациями (рис. 3-4), в зави
лю тно свободно вращ аться вокруг оди симости от угла поворота этих связей.
нарных углерод-углеродных связей, если Третье важное свойство ковалентных
только к атом ам углерода, участвующим связей, образуемых углеродом, заклю
в образовании таких связей, не присоеди чается в том, что они характеризуются
нены очень больш ие или сильно заря определенной длиной. В среднем длина
.ru
Таблица 3-3. Радиусы некоторых атомов
Приведенные данные относятся к вандерваальсовым радиусам, характери
зую щим истинные размеры атом ов в постранстве; однако, когда атомы
соединяются между собой ковалентными связями, их радиусы в точке
взаимодействия с другими атом ам и уменьш аю тся из-за притяжения ато-
мов друг к другу за счет образования обобщенной пары (молекулярной
ib
орбитали)
П ространственная модель
r-l
Элемент Р адиус, нм
! О ,I hm !
Углерод 0,077
e
Водород 0,037
sh
Кислород 0 ,066
Азот 0,070
u
Фосфор 0,110
ak
С ера 0,104
1
— с —И
1
1 /
—с —n4
1 4 о
н
чо —И
ГЛ. 3. СОСТАВ Ж И В О Й М А ТЕ РИ И : Б И О М О Л Е К У Л Ы 61
.ru
го атома до центра другого) лучше всего
можно показать с помощ ью моделей из
шариков и стержней, тогда как внешние
контуры органических молекул хорошо
видны на пространственных моделях Рис. 3-6. К омплементарное соответствие м оле
(рис. 3-5), составные части которых про кулы субстрата активному, или каталитическо
ib
порциональны по разм ерам радиусам му, центру молекулы фермента. Каталитический
центр распознает лиш ь те молекулы, простран
атомов (табл. 3-3). Из рассмотренных ственные характеристики и разм еры которых
здесь данных следует, что органические в точности соответствую т его строению.
биомолекулы имею т характерные раз
r-l
меры и трехмерную структуру, опреде ферментов с субстратами (рис. 3-6). Д ля
ляемые строением их скелета и располо обеспечения нормальных биологических
жением боковых групп. функций молекулы фермента и субстрата
Трехмерная структура (конформация) должны быть комплементарными, т.е. их
e
органических биомолекул играет исклю структуры должны стерически точно со
чительно важную роль во многих биохи ответствовать друг другу. Такая же стро
мических процессах, в частности при гая комплементарность необходима для
sh
относительные длины связей и углы между ни лекул при помощ и точных физических
ми. Шарики показываю т приблизительные раз методов составляет важную часть совре
меры атомных ядер. В. Пространственная м о
дель. Здесь относительные размеры всех атомов
менных исследований, направленных на
ak
Водород
Оч ОН и Кислород
с
Углерод
И -С -И Азот
Н
62 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
водорода. Скелеты углеводородов очень
0= 0
X
рГ
Альдегидная Альдегиды
1
1
устойчивы, поскольку электронные пары
в одинарных и двойных углерод-угле-
родных связях в равной мере принадле
Карбонильная R,— С— R, Кетоны
жат обоим соседним атом ам углерода. II
Один или более атомов водорода О
ib
в углеводородах могут бы ть замещены
различными функциональными группами. Карбоксиль Rt— С —ОН Кислоты
ная II
П ри этом образуются различные семей О
ства органических соединений. К ти
r-l
пичным семействам органических соеди
нений с характерными функциональны / н
Аминогруппа Ri— N Амины
ми группами относятся спирты, в м оле \
кулах которых имеется одна или несколь Н
e
ко гидроксильных групп; амины, содержа н
щие аминогруппы; кетоны, содержащие
Амидогруппа R — С— N Амиды
карбонильные группы и кислоты с карбок
sh
г3
1
1
0
0=0
Н Н Н ОН
1 i 1
-а =
О
0
Di
I
R— С — Н R— С — С — Н R,— S —S—R2
1
1
i i
Н Н Н О
Метильная Этильная Дисульфидная Фосфатная
Н Н
R- - с — с —н
.ru
н н У =С/
1 1
R — N—С— NX / N > - н
Ц м н
Н 1
Н н н
Н
Гуанидиновая Имидазольная Фенильная
ib
в основном служат строительными бло
r-l
СООН ками белков. Все аминокислоты содер
h 4n — с — н Аминокислота аланин жат функциональные группы по меньшей
(один из строительных мере двух ти п ов: аминогруппу и карбок
сн3 блоков белков) сильную группу. Н а рис. 3-7 приведена
e
формула аминокислоты аланина, на ко
И торой видны обе эти группы. Химические
I свойства этой аминокислоты полностью
С=О
sh
н -с-о н
нальные группы двух ти п о в -ги д р о к
СНг— ОН сильные группы и альдегидная группа
ak
.ru
или стереоизомерами, в химических реак в одной из двух возможных форм. Так,
циях ведут себя одинаково, но разли аминокислоты, и в частности аланин,
чаю тся по весьма характерному физиче встречаются в белках только в одной хи
скому свойству, а именно по способности ральной форме. Аналогичным образом
вращ ать плоскость поляризации плоско- глюкоза, основная структурная единица
поляризованного света. Если раствор, со крахмала, обнаруживается в биологиче
ib
держащий энантиомер одного типа, вра ских объектах только в одной из своих
щает плоскость поляризации вправо, то многочисленных хиральных форм. Н а
раствор энантиомера другого типа будет оборот, когда химик в лабораторных ус
вращ ать плоскость поляризации влево; ловиях синтезирует органическое соеди
r-l
угол вращения можно измерить при по нение с одним асимметрическим атомом
мощ и поляриметра. Соединения, м оле углерода, используя обычные небиологи
кулы которых не содержат асимметриче ческие реакции, с равной вероятностью
ских атомов углерода, не способны образуются обе возможные хиральные
вращ ать плоскость поляризации плоско-
e
формы, в результате чего получается эк-
поляризованного света.
Изображенная на рис. 3-8 аминокисло Рис. 3-8. Хиральные молекулы. А. Если атом
уг лерода связан с четырьмя разными группами
та аланин представляет собой асиммет
sh
.ru
(гл. 1 1 ).
ib
В табл. 3-6 приведены основные классы
биомолекул, обнаруживаемые у бактерии
Escherichia coli, данные о вкладе каждого
r-l
класса в общую массу клетки и прибли
зительное число биомолекул каждого
e
Таблица 3-6. М олекулярные компоненты
клетки E. coli
sh
Приблизи
Содер тельное
жание, число раз
% (по личных ви
весу) дов моле
u
кул
Вода 70 1
ak
Белки 15 3000
Нуклеиновые кис
лоты
ДНК 1 1
РН К 6 >3000
П олисахариды 3 5
СООН СООН Липиды 2 2 0
М олекулы, вы
полняющие роль
строительных
блоков и проме
Н,С жуточные соеди
нения 2 500
NH 2 NH 2 Неорганические
D-аланин L -аланин
ионы 1 2 0
3-767
66 Ч А С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
1 МКМ 1м к м
кулярными массами и потому назы ваю т Участок цепи ДНК - ин- Участок моле
ся макромолекулами. М олекулярные формационной молекулы кулы целлюлозы
массы различных белков лежат в преде
лах от 5000 до 1 млн.; у некоторых АI Glc
1
нуклеиновых кислот молекулярные 1
.ru
крупные структуры, которые вклю чаю т Glc
A1 1
тысячи молекул и функционируют, по су 1
ществу, как макромолекулярные системы G Glc
(такая система служит, в частности, «ос
новой» клеточных мембран). Таким G Glc
образом, мы можем отнести подобные
т Glc
ib
липидные структуры также к м акром оле
кулам. AI Glc
1
1
C Glc
3.7. Макромолекулы
r-l
образуются из небольших 1
Glc
Ai
молекул, играющих роль 1
1
3'
68 Ч А С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
I соон схю н СООН
h 2n —с — н
I I
I HjN— С— Н H,N—С— Н
Сн2 соон
А.
Лейцин I
Цистеин СН, СН,
h 2n —с — н I
/ \
СН, СН, L СН
сн,
I
ib
сн 2
соон соон 1 -т Лизин I
I Гистидин СН2
h 2n —с — н
I
I
h 2n — с — н I >
НС— N
I
NH,
Н -С —СН,
r-l
I 3
СООН
Сн СООН
Изолейцин i г I I
Тирозин H2N—с —н
СН» HjN—С—Н
Аспарагин СН2 сн2
соон I
e
I 0 = С —NH, сн,
.с н I
соон Метионин S
НгС^ NH
I I
I
sh
h 2n —с — н сн.
н гс - -с н г
Пролин СН,
I СООН
С=СН I
соон \ H2N— С— н
NH I
HjN—С—Н Триптофан 1___/ СН2
u
I
Глицин H Г л у та м и н сн,
Фенилаланин I
О = С —n h 2
ak
.ru
I
сн снг
Цитозин 2-дезокси-а -D-рибоза он I
сн2 сн2
Фосфорная кислота I
NH, сн2 сн2
I I I
_N . Сахар-предшественник СНг сн2
N ХС 44 HN
сн2 сн2
I II "СН
, I II От CHjOH
ib
НС^ /С / HjN—С ^ С^ /
сн2 СН2
N N N N
н н сн5
Гуанин СН;
Аденин Кон Н/ I Пальмитиновая
Н° ^ н 4 ° н кислота
н он Г
r-l
a -D -гл ю коза
сн3
Олеиновая кислота
Рис. 3-11. Первичные биомолекулы, играю щ ие пиды содержат спирты, например глице-
роль основных строительных блоков, предста рин, а некоторые еще и фосфорную кис
вляю т собой как бы буквы биохимического ал лоту. Таким образом, больш ая часть
e
фавита. Н а этом рисунке показаны 20 аминокис
лот (А ), из которых построены белки всех
биомолекул построена примерно из трех
организмов, пять азотистых оснований и два пя десятков органических соединений, при
sh
.ru
примерно из 600 аминокислотных еди
Пептидные гормоны ниц, соединенных в длинные цепи, уло
Аминокислоты
Нейромедиаторы женные в виде глобулярных структур.
Алкалоиды М олекулы белков, в свою очередь, малы
по сравнению, например, с рибосомами -
Нуклеиновые кислоты субмолекулярными частицами, содержа
ib
АТР
щимися в тканях животных. В состав ка
Аденин ждой из них входит приблизительно 70
Коферменты
различных белков и четыре молекулы ну
Мочевая кислота
клеиновой кислоты. Рибосомы, в свою
r-l
очередь, малы по сравнению с такими ор-
Рис. 3-12. Каждая первичная биомолекула, ис
пользуемая в качестве строительного блока, ганеллами, как митохондрии. Таким
играет также роль предшественника в биосинте образом, переход от прость!х биомоле-
зе многих биомолекул других типов. кул к более крупным субклеточным
структурам происходит скачкообразно.
e
диаторам и (нейротрансмиттерами) и На рис. 3-13 показана структурная ие
предшественниками ряда гормонов, а рархия в молекулярной организации кле-
у растений-токсичны х алкалоидов. Аде
sh
.ru
ib
r-l
>» 2
*
5о °^
2 *
О-
e
~
I
"УТ,
ми связями
sh
I ч С Ü со ОST
u
о 2 S «
■ул ' • ■* ою
"о" 1
О- * сSЗ ^jj
* *
ak
-Ш 52 с° /I S
я I
S
* . & •’ '• t ' • К «=1
g s S
и °
* « ^ | 8
£*8
в**
2
5 о о
Ы й о ■ö'
О 3 &.*§ 2
0 А
* 1 S I?
2 | g £
О D. я я
Л \ & & §
с £ ^ IВ*
* € А . . * ■ £ £ £ | е
g-Ö &Е*
.у А
сАЩ л" *о •.О 0)
*V # ' •* J
Ü & S 5
я он Ч
IX к rwi «Ч* яЧ
72 Ч А С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
макромолекула в свою очередь состоит
из небольших строительных блоков. Поскольку у всех видов живых орга
В белках, нуклеиновых кислотах и по низмов макромолекулы образуются од
лисахаридах отдельные строительные ним и тем же способом всего лишь из не
блоки соединены друг с другом кова скольких десятков молекул, играющих
лентными связями, тогда как в надмоле роль строительных блоков, было выска
ib
кулярных ансамблях (в рибосомах, м ем зано предположение, что все живые орга
бранах или хроматине) объединение низмы произошли от одной первичной
макромолекул происходит при помощ и линии клеток. Согласно этому предполо
значительно более слабых взаимодей жению, первые возникшие на Земле и вы
r-l
ствий. К таким взаимодействиям отно жившие клетки были построены всего из
сятся, в частности, водородные связи, нескольких десятков различных органи
энергия которых составляет всего лишь ческих молекул, причем каждая из них
несколько килокалорий, тогда как энер в отдельности и все они вместе взятые
гия ковалентных связей достигает 80Л 0 0 оказались наделенными химическими
e
ккал/моль. В рибосомах, представляю и физическими свойствами в таком бла
щих собой характерные и специфические гоприятном сочетании, что это позволи
sh
.ru
Рис. 3-15. Вспышки молний, сопровождавш ие
вулканическое извержение, в результате которо
го в 1963 г. у берегов Исландии возник остров
Сертси. Интенсивные электрические поля, высо
кие температуры и ударные волны, весьма часто
возникавшие при таких катаклизмах на пер
вобытной Земле, м огли сы грать роль основного
ib
ф актора в происхождении органических соеди
нений.
.ru
ставители всех наиболее важных типов
молекул, содержащихся в клетках, а так
же целый ряд веществ, не встречающихся
в живой природе. Среди всех этих ве
ществ обнаружены многие аминокис
лоты, входящие в состав белков, азо
ib
тистые основания, выполняющие роль
строительных блоков нуклеиновых кис
лот, и ряд органических кислот и сахаров,
Рис. 3-16. Искроразрядный аппарат, предназна содержащихся в биологических системах.
r-l
ченный дл я демонстрации абиотического обра Таким образом, представляется вполне
зования органических соединений в условиях
первичной атмосферы.
вероятным, что первичный океан был
обогащ ен растворимыми органическими
смеси. В темно окрашенном конденсате соединениями, в число которых, возмож
e
содержались значительные количества но, входили многие, если не все, м оле
водорастворимых органических веществ. кулы, используемые сегодня в живых
Среди соединений, идентифицированных клетках в качестве строительных блоков.
sh
сначала из метана и амм иака образовал нуть и в других частях Вселенной. Под
ся цианистый водород (H C N )-вещество, термином химическая эволюция подразу
обладаю щ ее очень высокой реакционной мевается возникновение органических ве
способностью; последующее взаимодей ществ из неорганических предшественни
ствие цианистого водорода с другими ков под воздействием энергии и их
компонентами газовой смеси привело дальнейшее развитие. Теперь мы знаем,
к образованию ряда аминокислот. С тех что Земля образовалась примерно 4800
пор другие исследователи провели много млн. лет назад. Предполагается, что хи
экспериментов подобного типа с исполь мическая эволю ция продолжалась на Зе
зованием различных смесей газов, в том мле по меньшей мере в течение первых
числе азота, водорода, окиси и двуокиси 1ОООмлн. лет ее истории. Затем, вероятно
углерода; эти эксперименты вновь проде около 3500 млн. лет назад, возникли
монстрировали, что при наличии доступ первые живые клетки, после чего начался
ного источника энергии из таких смесей процесс биологической эволюции, ко
легко образую тся аминокислоты и дру торый продолжается и в наши дни.
ГЛ. 1 СОСТАВ Ж И В О Й М А ТЕ РИ И : БИ О М О Л Е К У Л Ы 75
.ru
гией, необходимой для роста. Постепен
но с течением времени органические ве Краткое содержание главы
щества в первичном море стали исчезать
быстрее, чем они образовывались под Больш ая часть сухого вещества живых
воздействием природных сил. Эта идея, организмов состоит из углеродсодержа
а по существу и вся концепция химиче щих органических соединений, в которых
ib
ской эволюции в целом, бы ла сформули атомы углерода ковалентно связаны
рована более 100 лет назад Ч арлзом Д ар с другими атомами углерода, а также
вином. Об этом свидетельствует следую с атомам и водорода, кислорода и азота.
щий отрывок из письма, которое он Углерод был отобран в ходе биологиче
r-l
написал в 1871 г. сэру Джозефу Хукеру: ской эволюции, по-видимому, из-за нали
«Часто говоря т, что и сейчас существуют чия у него целого ряда благоприятных
все условия, которые необходимы были свойств. К их числу относится способ
для возникновения первых живых орга ность углеродных атомов соединяться
Друг с другом при помощ и одинарных
e
низмов. Но если (о, как велико это «ес
ли») предположить, что в одном из не и двойных связей, что делает возможным
больших теплых водоемов из всех содер образование самых разнообразных (ли
sh
.ru
существует структурная иерархия. Клет 3d ed., Allyn anil Bacon, Boston, 1973. Пре
ки содержат органеллы, такие, как ядро красный учебник органической химии; рас
сматриваю тся многие биомолекулы.
и митохондрии, которые в свою очередь
Orgel L. The Origins of Life: Molecules and
содержат надмолекулярные структуры, N atural Selection, Wiley, New York. 1973.
например мембраны и рибосомы, а эти Очень интересная книга.
последние представляют собой группу Weinberg S. The First Three M inutes: A M odern
ib
объединенных между собой м акром оле View of the Origin of the Universe, Basic
кул, связанных друг с другом с помощ ью Books, New York, 1977.
многочисленных относительно слабых White E.H . Chemical Background for the
межмолекулярных связей. В м акром оле Biological Sciences, 2d ed., Prentice-Hall,
r-l
кулах отдельные строительные блоки со Englewood Cliffs, N .J., 1970.
единены друг с другом ковалентными Вопросы и задачи
связями.
Типичные биомолекулы, используемые 1. Витамин С: отличается ли искусственно
синтезированный витамин от природного?
e
в качестве строительных блоков, возни
кли самопроизвольно на ранних этапах Производители пищевых продуктов, бо
гатых витаминами, утверждают, в частно
истории Земли из атмосферных газов
сти. что витамины, полученные из при
sh
и воды под воздействием энергии. Эти родных источников, полезнее для здоровья,
процессы, в совокупности называемые чем синтезированные искусственным пу
химической эволюцией, можно воспроиз* тем. Считается, например, что чистая L-
вести в лабораторных условиях. Совре аскорбиновая кислота (витамин С) из пло
менные биомолекулы (строительные дов шиповника полезнее L-аскарбиновой
блоки), по-видимому, были отобраны на кислоты, синтезированной на химическом
u
г) Задача 3
СООН
.ru
I
h 2n —с —н
НО
н —с —он
I НО
СН3
Изопротеренол
Треонин (аминокислота)
Д) О
V
I
О
I
н —с — n h 2
ib Задача 4
Н
^ — СН 2— С — СН 3
r-l
сн2
I I NH2
сн2 НО — С — н
I н —с —он
NH 5. Строительные блоки слож ных биомолекул.
I Хотя число природных биомолекул огром
н —с — он
e
С=О
I но и они чрезвычайно сложны по своей
I
Н С — ОН СН2ОН структуре, строение этих молекул основано
I на простых принципах, поскольку все они
sh
СН3 О-
.1
Н ;!С — N — С Н 2— С Н 2— О — Р — О — СН; н н
I I
СН, О Н С — О — С — (СН,)7— С = С — (СН2); - -С И ,
О
с н 2— о — с — ц:н2),,— -сн.,
.ru
н о И Н П О СН2 Н Н
I II I I I II
НО- С Н 2— с — с- -N С — С — N — С— С - - М— С — С — N — С — СООН
I I I II I
NH, н н О н н н о сн.,
I 4
сн„
ib
I
S
Определение структуры биомолекулы. Из
сн.
мы ш ц кролика выделили неизвестное веще
r-l
ство X. Его структура бы ла установлена на
основе следующих наблюдений и экспери б) Нарисуйте возможные структурные
ментов. Результаты качественного анализа формулы этого вещества, которые удов
показали, что это вещество содержит толь летворяли бы эмпирической формуле
ко углерод, водород и кислород. Взве и имели одну двойную связь. Рассмотри
e
шенный образец вещества X был подверг те только линейные и разветвленные
нут полному окислению и определены структуры, не принимая во внимание ци
количества образовавш ихся Н 2О и С О 2. клические структуры. Учтите, что атомы
sh
Исходя из данных этого анализа, было сде кислорода с трудом образую т связи друг
лано заключение, что весовое содержание с другом.
С, Н и О в X составляет соответственно в) К акое значение для структуры молекулы
40,00%, 6,71% и 53,29%. М олекулярная мас имеет оптическая активность? Какие из
са вещества X, по данным масс-спектроме- перечисленных в пункте б) структур нахо
трии, оказалась равной 90,0. М етодом ин дятся в противоречии с этим наблю де
u
ряется в воде, образуя кислый раствор. При имеет тот факт, что при растворении
исследовании этого раствора с помощ ью X образуется кислый раствор? Какие из
поляриметра было установлено, что полученных структур можно теперь ис
X обладает оптической активностью , при клю чить? Какие структуры соответ
чем удельное вращение плоскости поляри ствую т этому наблюдению ?
зации [ot]D равно + 2 ,6 °. д) К аково строение X? Совместимо ли со
а) Определите эмпирическую формулу ве всеми имеющ имися данными наличие
щества X. более одной структуры?
ГЛ А В А 4
.ru
ВОДА
Вода является наиболее широко рас 4.1. Необычные физические
пространенным веществом в живой при свойства воды обусловлены
роде, и ее весовое содержание в больш ин ее способностью участвовать
стве живых организмов составляет 70% в образовании водородных
связей
ib
и более. Кроме того, как м ы уже говори
ли, первые живые организмы возникли,
П о сравнению с больш инством других
вероятно, в первичном океане, так что во
жидкостей вода имеет необычно высокие
д а - э т о по существу прародительница температуры плавления и кипения и те
r-l
всего живого. Вода заполняет все со плоту испарения (табл. 4-1). Эти особен
ставные части каждой живой клетки, ности воды свидетельствуют о сильном
и именно она представляет собой ту сре притяжении между соседними молекула
ду, в которой осуществляются транспорт
ми, вследствие чего жидкая вода характе
питательных веществ, катализируемые
e
ризуется больш им внутренним сцепле-
ферментами метаболические реакции
и перенос химической энергии. П оэтому
все структурные элементы живой клетки Таблица 4-1. Температуры плавления, темпе
sh
Вода 0 1 0 0 540
как безвредную инертную жидкость,
М етиловый спирт -9 8 65 263
удобную для практического использова 204
Этиловый спирт - 117 78
ния в разных целях. Хотя в химическом П ропилов ый
отношении вода весьма устойчива, она спирт - 127 97 164
представляет собой вещество с довольно Ацетон -9 5 56 125
необычными свойствами. В сам ом деле, Г ексан -9 8 69 101
.ru
лекуле воды) объединяет свой электрон
с одним из электронов атом а кислорода.
Взаимное расположение возникающих
при этом двух электронных пар обусло
вливает V-образную форму молекулы
воды (рис. 4-1). Поскольку у атом а кис
ib
лорода имеются еще две неподеленные
электронные пары, он несет частичный
отрицательный заряд (в вершине V-об Рис. 4-1. Биполярная природа молекулы Н 2 0 ,
разной структуры). Более электроотри показанная при помощ и модели из ш ариков
r-l
цательный атом кислорода стремится и стержней (Л) и пространственной модели (Б).
притянуть электроны атомов водорода; П оскольку расположение валентных элек
тронных пар вокруг атом а кислорода в молеку
поэтому на ядрах обоих атомов водоро ле воды близко к тетраэдрическому, на двух ато
д а (протонах) локализую тся частичные мах водорода локализованы частичные положи
положительные заряды. Хотя молекула тельные заряды, а на атом е ки сл о р о д а-д в а
e
воды в целом электрически нейтральна, частичных отрицательных заряда. В. Две м оле
кулы Н 2 0 , связанные друг с другом водородной
ее частичные отрицательный и положи связью (обозначена цветными черточками),
тельный заряды пространственно разде
sh
.ru
4.2. Водородные связи
широко распространены
GW^'^ F W " - Г в биологических системах
и играют в них важную роль
ib
Водородные связи характерны не толь
ко для воды. Они легко образую тся ме
жду лю бы м электроотрицательным ато
Рис. 4-2. Каж дая молекула воды во льду связа
мом (обычно кислородом или азотом)
r-l
на водородны ми связями с четырьмя другими
молекулами воды, так что при этом образуется и атом ом водорода, ковалентно свя
регулярная кристаллическая решетка. В жидкой занным с другим электроотрицательным
воде при комнатной температуре каждая м оле
атом ом в той же или другой молекуле
кула воды связывается при помощ и водородных
связей в среднем приблизительно с 3,4 молекул (рис. 4-3). Атомы водорода, соединенные
e
воды. Таким образом, в жидкой воде молекулы ковалентной связью с сильно электро
воды расположены относительно друг друга ме отрицательными атомами, такими, как
нее «рыхло», чем в кристаллической решетке
кислород, всегда несут частичные поло
sh
парения у гексана и бензола, как показы личие служит причиной того, что бути
вает опыт, действительно намного мень ловый спирт (С Н 3 С Н 2 С Н 2 С Н 2 ОН),
ше, чем у воды (табл. 4-1). в молекуле которого один из атомов во
Водородные связи слабее ковалентных. дорода связан с кислородом и может, та
Согласно имеющимся данным, энергия ким образом, образовать водородную
водородных связей в жидкой воде (т. е. связь с другой молекулой бутилового
энергия, необходимая для разрушения спирта, обладает сравнительно высокой
одной связи) составляет всего лишь температурой кипения ( + 1 1 7°С). Н аобо
около 4,5 ккал/моль, тогда как энергия рот, бутан (С Н 3 С Н 2 С Н 2 С Н 3), который
ковалентных связей Н — О в молекулах не способен образовы вать межмолеку-
воды равна 110 ккал/моль. Тем не менее лярные водородные связи, поскольку все
благодаря своей многочисленности водо атомы водорода в его молекулах связаны
родные связи обеспечивают высокую с углеродом, имеет низкую температуру
устойчивость жидкой воды. Хотя в л ю кипения ( —0,5°С). Некоторые примеры
82 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
\-Н н м О / молекулы или группы в определенной
/ \
взаимной ориентации. Ниже мы увидим,
\
N — HiHiN
S что именно это свойство водородных
/ \ связей способствует стабилизации строго
определенных пространственных струк
тур, характерных для молекул белков
ib
и нуклеиновых кислот, содержащих боль
Рис. 4-3. Водородные связи. В связях этого типа
шое число внутримолекулярных водо
атом водорода неравномерно распределен ме
жду двум я электроотрицательны м и атомами. родных связей (гл. 7, 8 и 27).
Атом, с которы м водород связан ковалентно,
r-l
служит донором водорода, а электроотрица
тельный атом другой молекулы - акцептором. 4.3. Вода как растворитель
В биологических системах электроотрица
обладает необычными
тельны ми атом ам и, участвующими в образова
нии водородных связей, являю тся кислород свойствами
и азот; атом ы углерода принимаю т участие
e
в образовании водородных связей только Вода является значительно лучшим
в редких случаях. Расстояние между двум я элек растворителем, чем больш инство других
троотрицательны м и атом ам и, соединенными общеизвестных жидкостей. Многие кри
sh
„СН3
N Тимин
ГЛ. 4. ВОДА 83
н
ж н
С1" , извлекая их из решетки. В результа
те эти ионы в гидратированной форме
Сильная водородная связь постепенно переходят в раствор
(рис. 4-6). Вода растворяет также многие
простые органические соединения, содер
жащие карбоксильные группы или ами
ногруппы, способные ионизироваться
при взаимодействии с водой.
Второй класс веществ, хорош о раство
Ж
.ru
н н римых в воде, вклю чает многие ней
тральны е органические соединения, со
Слабая водородная связь
держащие полярные функциональные
группы. К ним относятся, в частности, са
хара, спирты,, альдегиды и кетоны. Раст
Рис. 4-5. Направленность водородной связи.
воримость этих веществ обусловлена
Верхняя структура характеризуется более
ib
прочной водородной связью, поскольку при та способностью молекул воды образовы
кой ориентации взаимодействующ их молекул вать водородные связи с гидроксильны
обеспечивается максимально возм ож ное притя ми группами сахаров и спиртов, а также
жение между частичными электрическими зар я с карбоксильными группами альдегидов
r-l
дами.
и кетонов (см. рис. 4-4).
почти нерастворимы в неполярных жид
Рис. 4-6. Х орош ая растворим ость в воде м н о
костях, например в хлороформе или бен гих кристаллических солей обусловлена гидра
золе. Это свойство обусловлено бипо тацией ионов, образую щ их эти соли. И зоб ра
e
лярным характером молекулы воды. женная здесь кристаллическая реш етка N aC l
стабилизирована за счет сил притяжения между
Кристаллическая решетка соли стабили
ионами N a + и С1 ~ . К ристалл растворяется в во
зирована за счет очень сильного электро де вследствие гидратации ионов N a + и С1 , что
sh
Гидратированны й
О
ион N a +
u
С1-
ak
© Na +
V
Молекула воды
Г идратированны й
ион С1~
84 ЧА СТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
6 О Полярная голова жать сотни или даже тысячи молекул
V
/
мыла. Такие мицеллы остаю тся равно
мерно суспендированными в воде, так
сн2 как все они несут отрицательный заряд
V
сн2 и потому стремятся оттолкнуться друг
/
сн2 от друга. М ыльная вода обычно бывает
ib
сн2 мутной, потому что мицеллы имеют до
/ вольно больш ие размеры и рассеивают
сн2
свет.
сн2
/ Характерное расположение непо
r-l
сн2 лярных групп в таких мицеллах обусло
V
сн влено стремлением окружающих мицел
II Неполярный хвост лу молекул воды образовы вать водо
сн
/ родные связи друг с другом и связывать
сн2
ся с гидрофильными карбоксильными
e
сн2 Символ
группами, вынуждая тем самым углево
/
сн2 дородные цепи перемещаться внутрь м и
Голова
сн2
sh
Водная ф аза или неполярная, ф азв молекул внутри таких мицелл, однако на
самом деле речь идет о стремлении моле
\ Na
кул воды, окружающих мицеллу, образо
вать как можно больш е водородных свя
зей друг с другом ; именно это стремле-
ние и служит движущей силой образова ком растворе влияние растворенного ве
ния мицелл и причиной их стабильности. щ ества проявляется в том, что при дав
Многие компоненты живых клеток, на лении 760 м м рт. ст. температура зам ер
пример фосфолипиды (гл. 1 2 ), белки зания воды (0°С в случае чистой воды)
(гл. 8 ) и нуклеиновые кислоты (гл. 27), снижается до — 1,86°С, температура ки
обладаю т амфипатическими свойствами пения (обычно 100°С) повышается до
и стремятся образовать в водных раство 100,543°С, а осмотическое давление, из
рах структуры, в которых неполярные, меряемое при помощ и специальной ап
гидрофобные, участки изолированы от паратуры (рис. 4-8), достигает 22,4 атм.
водной фазы. Более того, как мы увидим И деальным растворенным веществом
ниже (гл. 1 2 ), именно мицеллярная орга называется такое вещество, которое не
низация амфипатических липидных м о диссоциирует на две или более составные
лекул составляет «основу» биологиче части и не претерпевает ассоциации, при
.ru
ских мембран. водящей к уменьшению общего числа
растворенных частиц. Коллигативные
4.4. Растворенные вещества свойства зависят только от числа раство
изменяют свойства воды ренных частиц в единице объема раство
рителя и не зависят от их химического
Водные растворы обладаю т четырьмя строения. Э то объясняется тем, что один
ib
важными свойствами, известными под моль лю бого неионизированного со-
названием коллигативных свойств, в ос
нове которых лежит изменение физиче
ской константы воды под влиянием раст Рис. 4-8. О смос и осмотическое давление. Л. И с
r-l
ходное состояние. Вода перетекает из внешнего
воренных в ней веществ. К этим свой пространства через м ембрану внутрь раствора,
ствам относятся: 1 ) температура зам ер стремясь вы равнять концентрации воды по обе
зания, 2 ) температура кипения, 3) давле стороны мембраны. Б. Конечное состояние. Во
ние пара и 4) осмотическое давление. да проникла в раствор вещества, м олекулы кото
рого неспособны проходить сквозь мембрану,
e
Слово «коллигативный» означает «взаи в результате чего произош ло разбавление
мосвязанный». Коллигативные свойства раствора. В состоянии равновесия давление
растворов - это свойства, имеющие об столба раствора, имею щ его высоту h, точно
sh
щую основу и изменяющиеся под влия уравновеш ивает осмотическое давление, харак
теризующ ее стремление воды перетекать в зону
нием растворенных веществ так, что эти с более низкой ее концентрацией. В. О смотиче
изменения можно заранее предсказать. ское д а в л е н и е -это сила, которую необходимо
Раствор 1,00 м оля лю бого идеального приложить к порш ню , чтобы предотвратить на
нелетучего вещества в 1 0 0 0 г воды (или правленный в противополож ную сторону осм о
тический ток жидкости. О но численно равно ги
u
Полупроницаемая
мембрана
86 ЧА СТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
замерзания 1,0 m раствора, т .е .-0,186 С, родных связей; гидратированные ионы
так как число молекул в этом растворе имею т более упорядоченную и более ре
(на 1 л воды) в 1 0 раз меньше, чем в Im гулярную структуру. Таким образом,
растворе. 0,100 т раствор NaCl, в кото растворенные соли стремятся разрушить
ром все молекулы полностью диссоци нормальную структуру жидкой воды
ированы на ионы N a + и С1 ~ , должен за и изменить ее свойства как растворителя.
ib
мерзать при - 0,372СС, поскольку число Ниже мы увидим, что растворимость
частиц растворенного в нем вещества (на белков резко уменьшается при повыше
1 л воды) в два раза больше, чем нии концентрации нейтральных солей,
в 0,100 m растворе глюкозы. Все эти пра например NaCl, N a 2 SO 4 и (N H 4 ),SO 4, из
r-l
вила, позволяю щ ие предвидеть коллига- меняющих свойства воды и снижающих
тивные свойства и предсказывать чис ее способность растворять белки. Такое
ленные значения соответствующих кон влияние растворенных нейтральных со
стант, точно соблю даю тся только лей может быть использовано для разде
в случае разбавленных водных раство
e
ления смеси белков, поскольку многие
ров. белки различаю тся по своей способности
Рассмотренная выше способность во осаждаться из солевых растворов.
ды изменять свои свойства под влиянием
sh
.ru
ществ (А или В) либо концентрации ной характеристикой лю бой химической
обоих этих веществ. И наоборот, увели реакции, протекающей при определенной
чение концентрации веществ С или D ли температуре. Она позволяет вычислить
бо одновременное увеличение концентра состав равновесной смеси для данной ре
ций обоих этих веществ приведет к тому, акции независимо от количеств исходных
что данная реакция будет идти справа на веществ и образующихся продуктов.
ib
лево до достижения нового равновесия. И наоборот, если известны концентрации
Этому принципу можно дать также более всех исходных реагентов и конечных про
количественную формулировку. Ско дуктов в состоянии равновесия, то для
рость прямой реакции i’L, протекающей данной реакции, протекающей при из
r-l
слева направо, пропорциональна про вестной температуре, легко можно вы
изведению активных концентраций ре числить величину константы равновесия.
агирующих веществ А и В:
4.6. Ионизацию воды можно
e
Vi = k i [А] И ’ охарактеризовать величиной
константы равновесия
где k i -кон стан та пропорциональности, Перейдем теперь от общих рассужде
sh
и обратной реакции равны, при равнове иметь в виду, что «голых» водородных
сии должно соблю даться равенство ионов, т.е. свободных протонов, в воде не
щ = v2 существует, поскольку они, как и боль
шинство других ионов, всегда гидратиро
и, следовательно: ваны, т.е. окружены гидратной оболоч
[А] [В] = к 2 [С] [D ] . кой. Гидратированную форму иона Н +
Преобразование этого выражения дает называю т ионом гидрония или ионом ги-
дроксония. Его часто обозначаю т Н 3О + ,
h [С] [D] однако в действительности каждый ион
к2 [А] [В] • Н + плотно окружен несколькими моле
кулами Н 2 О, число которых зависит от
температуры.
Отношение двух констант скорости пр В соответствии с уравнением
кобр
может быть заменено одной новой кон H 2O ^ Н+ + ОН (3)
88 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
выражение для константы равновесия ет место, например, в чистой воде, то
обратной реакции (3): такой раствор называется нейтральным.
Исходя из численного значения ионного
[H + H Q H - ] произведения воды, можно рассчитать
Keq = концентрацию ионов Н + и ОН ~ в воде:
[Н 2 О ]
Kw=[H +][OH-] = [H +]2.
Э то выражение можно упростить, так как
относительная концентрация Н 2О очень
высока (она равна числу грам м ов воды
ib Реш ая это уравнение относительно Н + ,
имеем
r-l
[Н + ] = \ / k v = l / l х 1 0 - 14,
в 1 л, деленному на ее молекулярную
[Н + ] = [О Н “ ] = 1о - 7М ,
массу в граммах, т. е. 1000 :18 = 55,5 М) и
поэтому представляет собой практически
постоянную величину по отнош ению к Так как ионное произведение воды явля
e
очень низким концентрациям (1 • 10“ 7 М) ется величиной постоянной, очевидно,
ионов Н + и О Н - в чистой воде при что если концентрация ионов Н + превы
25°С. Таким образом, м ы можем под шает 1 Л 0 - 7 М, то концентрация ионов
sh
55,5
ку их произведение всегда должно оста
или ваться равным 1 • 10“ 14. И наоборот,
ak
.ru
не арифметической, а логарифмической.
pH = lo g W T = —1 о 8 [ н + ] ■
Если говорят, что величины pH каких-то
двух растворов различаю тся на одну еди
В строго нейтральном растворе, в кото
ницу, то это означает, что концентрация
ром концентрация ионов Н + составляет
ионов Н + в одном из них в 10 раз боль
1,0 • 10 ~ 7 М, величина pH при 25°С равна
ше, чем в другом, хотя мы можем и не
ib
знать абсолю тные значения pH этих рас
pH = log -- ^ j o _ 7 = log (1 х 107) = творов. Н а рис. 4-9 приведены значения
pH для некоторых жидкостей. Заметим,
= log 1,0 + log 107 = 0 + 7; pH = 7. что концентрация ионов Н + в напитке
r-l
кока-кола (pH 3) или в красном вине (pH
e
Дополнение 4-1. Ионное произведение воды
sh
[ н +] = - = I .: . 1 0 1 4 = 1о - 1 3 M.
L J [О Н - ] 0,1
110 “ 14
[ О Н " ] = -= 7,7 10" 11 М
L J 0,00013
90 Ч А С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
[н +], м pH [О Н - ], М рОН
1,0 0 10“ 14 14
0,1 1 10“ 13 13
0,01 2 10-12 12
0,001 3 10- " 11
10 4 4 10- 1° 10
10“5 5 10"9 9
10"6 6 10“8 8
10~7 7 10 “ 7 7
.ru
10“ 8 8 10~6 6
10“ 9 9 10"5 5
10- 10 10 10“ 4 4
10 " 11 11 0,001 3
10“ 12 12 0,01 2
10' 13 13 0,1 1
10 14 14 1,0 0
)
ib
r-l
3,7) приблизительно в 10 ООО раз больше,
чем в крови.
Иногда для количественной характери
стики основности, т.е. концентрации ио
e
нов ОН ~ в растворе, используют вели
чину рО Н , определяемую выражением
sh
.ru
4.8. Свойства кислот
мой реакцией:
и оснований тесно связаны
со свойствами воды С Н 3С О О Н — Н + + С Н 3СО О
Д онор про- П ротон Акцептор
Молекулы соляной, серной и азотной тона, сопря- протона,
кислот, называемых обычно сильными женная кис- сопряженное
л о та основание
ib
кислотами, полностью ионизированы
в разбавленных водных растворах. Ана Х арактерная особенность каждой кис
логично молекулы сильных оснований лоты состоит в том, что в водном раство
NaO H и К О Н также полностью ионизи ре она стремится отщепить свой протон.
r-l
рованы. Ч ем сильнее кислота, тем сильнее вы ра
В биологии мы чаще встречаемся со жена эта тенденция. Способность любой
слабыми кислотами и слабыми основания кислоты НА отщ еплять протон и обра
ми, которые при растворении в воде ио зовывать сопряженное с ней основание
низируются не полностью. П римером А - характеризуется константой равнове
e
слабой кислоты может служить уксусная сия обратимой реакции
кислота (СН 3 СООН), придаю щая уксусу
кислый вкус; в качестве примера слабого НА — Н + + А~ ,
sh
.ru
кислота) Если при титровании слабой кислоты
C H jC H O H C O O H 1,38 х 1СГ 4 3,86 тщ ательно измерять pH титруемого рас
(молочная кисло твора после добавления каждой порции
та) раствора основания вплоть до достиже
Н 3 Р О 4 (фосфорная 7,25 х 10" 3 2,14 ния точки нейтрализации, то можно не
кислота) только определить концентрацию кис
ib
Н 2 Р О 4 (дигидро 1,38 х К Г 7 6 ,8 6
лоты, но и получить также важную до
фосфат-ион) полнительную информацию об анализи
Н Р О 4 (моногид- 3,98 х 1 0 ' 13 12,4
руемом растворе. График, характеризую
рофосфат-ион)
Н 2 С О 3 (угольная 1,70 х 1 0 - 4 3,77 щий зависимость pH титруемого раство
r-l
кислота) ра от количества добавленного основа
Н С О 3 (бикар- 6,31 х 1 0 - 11 1 0 ,2 ния, называется кривой титрования. На
бонат-ион) рис. 4-10 показана кривая титрования ук
N H ; (ион 5,62 х 1 0 - 10 9,25 сусной кислоты (типичной слабой кис
аммония) лоты). Проследим за ходом титрования
e
0,1 М раствора уксусной кислоты 0,1 М
даю щ ий лиш ь весьма слабо выраженной раствором N aO H при 25°С, имея в виду,
что этот процесс включает два обра
sh
X W= [ H + ] [ O H - ] = M O - 14, (6 )
Символ р, так же как и в случае pH, озна [Н + ] [Ас - 1
чает «отрицательный логарифм». Чем = — = 1,74-10 - 5 М. (7)
[HAcJ
легче диссоциирует кислота, тем меньше
значение ее р К '. Как м ы сейчас увидим,
В начале титрования, до добавления
определение величины р К ' лю бой слабой
N aO H , уксусная кислота уже слегка
кислоты не представляет особого труда.
ионизирована, причем степень ее иониза
ции можно вычислить из константы ио
4.9. Слабые кислоты имеют низации (7). Попытаемся сделать это.
характерные кривые титрования Д ля упрощения будем считать, что сте
Д ля определения количества кислоты пень ионизации уксусной кислоты
в данном растворе используется титрова чрезвычайно м ала и потому концентра
ние. Э та процедура состоит в добавлении ция ее недиссоциированных молекул су-
ГЛ. 4. ВОДА 93
.ru
Рис. 4-10. К ривая титрования уксусной кислоты
ib
устанавливается равновесие, характери
r-l
(подробности см. в тексте). После добавления ка зующееся константой диссоциации уксус
ждой порции стандартного раствора N aO H ной кислоты (7). Таким образом, по мере
к титруемому раствору уксусной кислоты, изме
ряю т величину pH смеси. Эту величину отклады добавления новых порций раствора
ваю т по оси ординат, тогда как по оси абсцисс N aO H в процессе титрования, степень
отклады ваю т долю общ его количества N aO H , ионизации НАс будет увеличиваться.
e
требуемого для нейтрализации уксусной кис Следовательно, концентрация НАс в рас
лоты, т. е. для достижения pH « 7. Полученные
прц этом точки позволяю т построить кривую творе постепенно уменьшается, а концен
sh
.ru
зультате образую тся Н 2О и ацетат. Н а каждой системы. Сопряженные кислотно-ос-
протяжении всего процесса титрования новные пары служат эффективными буферами
при тех значениях pH, при которых соединения,
сосуществуют два взаимосвязанных рав играю щ ие роль доноров протонов, ионизиро
новесия (4) и (5), причем соотношение м е ваны на 25-75%.
ib
e r-l
u sh
ak
.ru
[А с“ ]/[Н А с] уменьшается до тех пор, по страняющ ийся примерно на одну едини
ка не достигнет исходного состояния, ко цу pH по обе стороны от средней точки,
торое имело место перед началом титро которая соответствует pH 4,76. П ри уве
вания раствора уксусной кислоты раство личении концентрации ионов Н + (или
ром NaO H . ОН - ) в титруемом растворе на данном
На рис. 4-11 сравниваются кривые ти участке происходит лиш ь небольшое из
ib
трования трех слабых кислот с сильно менение величины pH. Э тот относитель
различающимися константами диссоциа но плоский участок представляет собой
ции, а именно уксусной кислоты (рК' = буферную область сопряженной кислот
= 4,76), иона H jP O ^ (рK ' = 6 ,8 6 ) и иона но-основной пары уксусная кислота
r-l
аммония N H 4 (рК' = 9,25). Хотя кривые ацетат. В средней точке буферной обла
титрования всех этих кислот имеют оди сти, где концентрация донора протона
наковую форму, они располагаю тся на (уксусной кислоты) точно равна концен
разных уровнях вдоль оси pH просто по трации сопряженного основания (ацета
та), буферная емкость системы макси
e
тому, что все три кислоты различаются
по своей силе. Уксусная кислота является мальна. Э то означает, что увеличение
самой сильной из них и легче других о т концентрации ионов Н + (или ОН “ ) вы
sh
дает свой протон иону О Н “ , так как зывает в этой точке минимальное изме
имеет самую больш ую константу иони нение pH. Особенность этой точки кри
зации К' и соответственно самую низкую вой титрования уксусной кислоты со
величину р К ’. Уксусная кислота при pH стоит также в том, что величина pH в ней
4,76 уже диссоциирована на 50%. Труднее численно равна значению р К ' уксусной
отщепляется протон от иона H jP O ^ , ко кислоты. Очень важно отметить, что ве
u
женныи с ним акцептор протонов при ус двух обратимых реакций и установления
ловии, что оба они присутствуют в при соответствующих' равновесий, опреде
близительно равных концентрациях. П о ляемых константами равновесия этих ре
смотрим, как работает буферная система, акций, K w и К'. Если мы добавляем к бу
используя для этого схему, приведенную ферному раствору ионы ОН “ (или Н + ),
на рис. 4-12. Один из двух компонентов то в результате возникает небольшое из
менение в соотношении относительных
ОН" НгО концентраций слабой кислоты и ее анио
на, а следовательно, и незначительное из
менение pH. Уменьшение концентрации
CHjCOOH CH3COO“ одного из компонентов буферной си
стемы при добавлении небольш ого коли
чества основания (или кислоты) точно
.ru
уравновешивается повышением концен
Рис. 4 - 1 2 . С истема уксусная к и с л о та -а ц е та т
может действовать в качестве буфера, способно трации другого компонента. Сумма ком
го поглощ ать либо Н + либо О Н “ -ионы вслед понентов буферной системы при этом не
ствие обратим ой диссоциации уксусной кислоты изменяется, меняется лиш ь их соотноше
(см. текст). ние.
Укажем еще на одну важную особен
такой си стем ы -д о н о р протона, или ела-
ib
ность буферных систем. Как следует из
бая кислота (НА), содержит резервные сказанного выше, способность системы
связанные ионы Н + , которы е могут выс уксусная ки сл о та-ац етат функциониро
вобождаться, чтобы нейтрализовать до вать в качестве эффективного буфера
бавленные к системе ионы О Н “ с обра
r-l
вблизи pH 4,76- э т о автоматическое
зованием Н 2 О. Это происходит потому, следствие того факта, что величина рK '
что равновесие на какой-то м ом ент нару уксусной кислоты равна 4,76. Очевидно,
шается, и член [Н + ] [О Н " ] становится что эта система не может служить буфе
больш е 1 1 0 -1 4 . Нарушенное равнове ром при pH крови (около 7,4). Приве
e
сие быстро восстанавливается, так что денные на рис. 4-11 кривые титрования
произведение [Н + ] [О Н “ ] опять оказы показывают, что для каждой сопряжен
вается равным 1 -1 0 “ 1 4 (при 25°С), что ной кислотно-основной пары характерна
sh
сразу же приводит к снижению концен своя область pH, в которой она может
трации ионов Н + . О днако теперь отно служить эффективной буферной систе
шение [Н + ] [О Н “ ] становится меньше мой. Видно, что пара Н 2 Р О 4 - Н РО ^ “
величины К', и в результате происходит имеет р К 6 , 8 6 и, следовательно, может
дальнейш ая диссоциация кислоты НА, служить буферной системой в области
u
.ru
сколько задач, которые можно решить с его помощью.
Уравнение Хендерсона Х ассельбаха- это по существу одна из форм
выражения константы диссоциации кислоты:
к , = [Н + ] [ А ~ ]
[Н А ] '
ib
С начала мы решим это уравнение относительно [Н + ]:
„ [НА]
r-l
[Н + ] — К '
[А"]
pH = p K ' - l g J ^ l .
u
[А- ]
pH - рK ’ + lg |-HA-j •
4-767
98 ЧА СТЬ 1. БИ О М О Л Е К У Л Ы
.ru
пов вместе с их решениями.
1) Вычислите величину р K' молочной кислоты, если при концентрации
свободной молочной кислоты, равной 0,010 М, и концентрации лактат-
иона, равной 0,087 М, величина pH равна 4,80.
pH = рК' + lg [Лактат]
ib
[М олочная кислота]
[Л актат] 0,087
р К = pH - lg —------------------------- - = 4,80 - lg ——— =
r-l
[М олочная кислота] 0,010
= 4,80 - lg 8,7 = 4,80 - 0,94 = 3,86.
2) Вычислите величину pH смеси, состоящей из 0,1 М раствора уксус
ной кислоты и 0,2 М раствора ацетата натрия, если известно, что ве
e
личина рК ' уксусной кислоты равна 4,76.
ГАцетат-ион]
u
pH = рК ' + lg L J
[Уксусная кислота]
ГАцетат-ион!
ak
[Ацетат-ион]
Антилогарифм 0,54 = 3,47
[Уксусная кислота]
.ru
весием с С О 2 газовой фазы (г):
ib
тервале значений pH. Э та система обла
дает максимальной эффективностью ■*, = [С 0 2(Р>]
вблизи pH 6 ,8 6 , поскольку величина рК [С О 2 (г)] '
ионов Н 2 Р О 4 равна 6 , 8 6 (см. табл. 4-4
Величина pH бикарбонатной буферной
r-l
и рис. 4-11). Фосфатная буферная пара
Н 2 Р О 4 - Н Р О |~ способна сопротив системы зависит от концентрации рас
ляться изменениям pH в интервале меж творенных в ней компонентов Н 2 С О 3 и
ду 6 , 1 и 7 , 7 и может, следовательно, обес H C O J, выполняющих роль донора и ак
печивать достаточную буферную емкость цептора протонов. Поскольку, однако,
e
внутриклеточной жидкости, величина pH концентрация Н 2 С О 3 в свою очередь за
которой лежит в пределе 6 ,9-7,4. висит от концентрации растворенной
Главной буферной системой плазмы С О 2, а п о сл ед н я я-о т парциального дав
sh
Водная ф аза
.ru
н + нсо:
Реакция 1
Н 2СО 3
J
навливается равновесие. Так как концентрация
растворенной С 0 2 мож ет бы ть быстро отрегу Реакция 3
лирована путем изменений скорости дыхания,
Воздушное про
e
бикарбонатная буферная система крови нахо
дится почти в равновесии с обш ирным потен странство в лег- W
циальными резервуаром С 0 2. v1У
uК
1vЛ
sh
.ru
регулирующих величину pH, наблю даю
щиеся, например, при тяжелых формах РН
диабета вследствие ацидоза, обусловлен
ного «перепроизводством» метаболиче
ских кислот, вы зываю т падение pH крови
до величины 6 , 8 и ниже, что в свою оче
ib
редь, может приводить к непоправимым
последствиям и смерти. При некоторых
других заболеваниях величина pH крови
иногда достигает столь высоких значе
r-l
ний, что она уже не поддается норм али
зации. Поскольку повышение концентра
ции ионов Н + всего лиш ь на 1,18 • 10 - 7 М
(приблизительная разница между кровью
при pH 7,4 и кровью при pH 6 ,8 ) может
e
оказаться опасным для жизни, возникает
вопрос: какие молекулярные механизмы
обеспечивают поддержание величины pH pH
sh
.ru
использует высокое поверхностное натяжение
воды. Это насекомое, которое живет на поверх
ности прудов, имеет специальные волоски на
своих первых и третьих парах ног, благодаря ко
торы м оно держится на поверхностном слое во
ды, не продавливая его. Средняя пара ног, про
никаю щ ая через этот слой, действует как весла.
4.12. Приспособленность
живых организмов к водной среде
Живые организмы успешно приспосо
ib благодаря свойствам воды. О т свойств
воды зависит даже такой важный про
цесс, как репликация Д Н К.
r-l
бились к водной среде и даже приобрели
4.13. «Кислые» дожди
способность использовать необычные
загрязняют наши озера и реки
свойства воды. Благодаря высокой
удельной теплоемкости воды она дей Чистая вода, контактирующ ая с «нор
e
ствует в клетках как «тепловой буфер», мальным» воздухом, имеет pH около 5,6,
позволяю щий поддерживать в организме а не теоретическую величину pH 7. Это
относительно постоянную температуру связано с тем, что воздух содержит очень
sh
.ru
рез которые продукты сгорания вы- имеющих полярные молекулы. Вода
брасываются в атмосферу, чтобы исклю- диспергирует также амфипатические ве-
чить загрязнение нижних слоев воздуха, щества, например мыла, с образованием
поэтому верхние слои атмосферы над агрегатов молекул, называемых мицел-
огромными областями земного ш ара лами, в которых гидрофобные г руппы
оказались загрязненными этими кисло- спрятаны внутри и не контактируют
ib
тами, выпадающими на землю в виде с водой, тогда как заряженные группы
дождя. Иногда местные дожди могут расположены на внешней поверхности,
быть особенно кислыми: во время лив- Вода очень слабо диссоциирует, оо-
н ей в Ш о т л а н д и и в 1974 г. дождевая вода разуя ионы Н + и О Н . В разоавлен-
r-l
имела pH 2,4 (более низкая величина, чем ных водных растворах концен грации
pH уксуса!) ионов Н + и ОН связаны между со-
Вследствие «кислых» дождей вода во бой обратной зависимое) ью . К * -
многих озерах Скандинавских стран, во- = | Н +] [ О Н ] = 1Л0
сточной части Канады, северной части Концентрацию ионов водорода в био-
e
Новой Англии, а также в горах Адирон- логических системах обычно выражаю т
дака и в Флориде стала настолько кис- в виде pH, величина которого численно
лой, что рыба в этих озерах частично или равна отрицательному логарифму кон-
sh
полностью погибла, так как многие виды центрации ионов Н (pH = —lg [H ]).
рыб не выносят кислотности ниже pH 5. Величину pH водных растворов изме-
Более того, повышение кислотности вЬ- ряю т при помощ и стеклянных электро
ды уже вызвало нарушение неустойчиво- дов, чувствительных к концентрации н е
го равновесия между животными и расте- нов Н + .
u
можно ожидать, что это приведет к еще основная пара состоит из Донора прото
большей загрязненности запасов пресной на НА и соответствующ его ему акцеп-
воды, если тепловые электростанции тора протона А . Способность кислоты
и металлургические предприятия не бу- НА отдавать свой протон характери-
дут снабжены эффективными установка- зуется ее константой диссоциации
ми, предотвращ ающ ими выброс загряз
няющих веществ в атмосферу. ( t., [ Н +] [Н А ] ^
I* - [Н А ] J'
Краткое содержание главы
В о д а - э т о с а м о е распространенное со- или величиной рК ’, определяемой как
единение в живых организмах. Относи- - lg К'. Величина pH водного раствора
тельно высокие значения температуры слабой кислоты количественно связана
замерзания, температуры кипения и теп- со значением ее р К и с i.«ношением
104 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
ра, имитирую щего уксус.
Л И Т Е РА Т У РА 3. Кислотность ж елудочной соляной кис
лоты. В клинических лабораториях для
Callewaert D .M ., Jenyea J. Basic Chemistry: определения кислотности желудочного
General, Organic, Biological, W orth, New сока оттитровы ваю т 1 0 , 0 мл желудочно
York, 1980. П олезно просмотреть как этот, го сока, взятого через несколько часов
ib
так и другие учебники общей химии. после еды, 0,1 н. раствором N aO H до ней
Dick D. А. Т. Cell W ater, Butterworths, W ashi тральной реакции. Допустим, что для
ngton, 1966. Свойства и функции воды этого потребовалось 7,2 мл раствора
в живых организмах. N aO H . Так как желудок к этому времени
Eisenberg D., Kauzmann W. The Structure and уже не содержит непереваренной пищи
r-l
Properties of W ater, Oxford University Press, или напитков, никаких буферов в нем
F air Lawn, N .J., 1969. Трактовка физиче нет. К акова величина pH желудочного
ской химии воды, рассчитанная на подго сока?
товленных читателей. 4. И змерение содержания ацетилхолина по
Likens С. Е„ Wright R. F., Galloway J. N„ изменению pH. Концентрацию нейроме
e
Butler T .J . Acid Rain, Sei. Am., 241, 43-51, диатора ацетилхолина можно определить
O ctober (1979). по изменению pH , сопровождающему
Montgomery R., Swenson С. A. Q uantitative гидролиз ацетилхолина. При инкубации
sh
О СН 3 Н2О
11 J (
СН3 — С — О — СН2 — СН2 — N — СН3 ---- Н О — СН2— СН2— N — СН3 + СН3— С — O ’ + Н +
I II
СН 3 СН3 о
Ацетилхолин Холин А цетат
.ru
глицина, имеющ ая р K' 9,3, мож ет суще
ствовать либо в протонированной форме 7. Зависимость растворимости от pH.
(— N H 3 ), либо в виде свободного основа Сильно выраженная полярность воды
ния (— N H 2), которые находятся между и ее способность легко образовы вать во
собой в равновесии: дородны е связи делает ее прекрасным
растворителем для веществ ионной при
—N H 3 — N H 2 + Н +. роды. Вместе с тем эта особенность воды
ib
а) В каком интервале pH глицин м о обусловливает плохую растворимость
жет бы ть использован в качестве эф в ней неионизируемых неполярных орга
фективного буфера за счет его амино нических веществ, таких, как бензол.
группы? В принципе растворимость всех органи
r-l
б) К акова доля молекул глицина, ческих кислот и оснований в воде можно
имеющих в 0,1 М растворе при pH 9,0 повысить путем соответственно депрото
аминогруппу в протонированной фор нирования и протонирования, что приво
ме (— N H +)? дит в обоих случаях к образованию заря
в) К акой объем 5 М раствора К О Н женных частиц. Например, бензойная
e
нужно добавить к 1,0 л 0,1 М раствора кислота плохо растворима в воде, однако
глицина (pH 9,0), чтобы величина pH добавление бикарбоната натрия вызы
смеси бы ла равна точно 1 0 ,0 ? вает повышение pH раствора и депрото
sh
а) в) О
II н
С
n ; / \. I
/ X
Н,С N — С— СН 2 ОН
/
н И с
Пиридиний-ион / \
О О — СНз
рК ’ ~ 5
Метиловый эфир N-ацетилтирозина
рК' ~ ю
б)
ß -Нафтол
рК '"~ 1 0
106 ЧА С Т Ь 1. БИ О М О Л Е К У Л Ы
пями алкильных групп вызы ваю т харак калибровки рН-метра. Стеклянный элек
терную зудящую сыпь. трод, используемый в имеющихся в про
даже рН-метрах, дает электрический сиг
нал, величина которого пропорциональна
ОН концентрации ионов водорода. Для того
чтобы по величине сигнала можно было
правильно судить о величине pH, не
(СН 2)„ — СНз обходимо провести калибровку стеклян
рК ' = 8 ного электрода, используя для этого
стандартные растворы с известной кон
.ru
центрацией ионов водорода. Определи
Если вы случайно дотронулись до сума те, какие количества (в граммах) пер
ха, то какой способ обработки поражен вичного кислого фосфата натрия
ного участка кожи из перечисленных ни (N aH 2 P O 4 •Н 2 О ; мол. масса 138,01)
же вы изберете и почему? и вторичного кислого фосфата натрия
(а) Промывание поверхности кожи хо (N a 2 H P O 4; мол. масса 141,98) необхо
лодной водой. дим ы для приготовления 1 л стандартно
ib
(б) П ромывание поверхности кожи раз го буфера с pH 7,00, в котором суммар
бавленным уксусом или лимонным ная концентрация фосфатов равна
соком. 0,100 М. (Мол. масса смеси фосфатов бу
(в) П ромывание поверхности кожи м ы дет зависеть от их соотношения). Вели
r-l
лом и водой. чина р К ' первичного кислого фосфата при
(г) П ромывание поверхности кожи м ы 25°С равна 6 ,8 6 .
лом, водой и пищевой (питьевой) со 11. Контроль pH крови путем изменения ин
дой (бикарбонатом натрия). тенсивности дыхания.
9. Величина pH и всасывание лекарственных а) П арциальное давление С О 2 в легких
e
веществ. Ш ироко используемый лекар может бы стро меняться в зависимости
ственный препарат аспирин представляет от интенсивности и глубины дыхания.
собой слабую кислоту с р K ' = 3,5 Известно, что для избавления от икоты
sh
pH крови.
Аспирин всасывается в кровь человека б) Бегуны на короткие дистанции непос
через клетки слизистой желудка и тонко редственно перед стартом обычно ин
го кишечника. Д ля того чтобы вещество тенсивно и глубоко ды ш ат (гипервен
всасывалось, оно долж но легко прохо тиляция) примерно в течение 1 / 2 мин
дить через клеточные мембраны. Воз для удаления С О 2 из легких. Величина
можность прохождения вещества через pH крови может подскочить при этом
клеточную мембрану определяется по до 7,60. Объясните, почему pH крови
лярностью его молекул: ионизированные повышается в этих условиях.
(заряженные) и сильно полярные м оле в) Во время бега на короткую дистан
кулы проходят медленно, тогда как ней цию мышцы производят больш ое ко
тральны е гидрофобные молекулы про личество молочной кислоты из запасов
ходят сквозь мембраны быстро. Где глю козы. Исходя из этого факта,
аспирин легче всасывается в кровяной объясните, почему перед стреми
п о т о к -в желудке или в тонком кишечни тельным бегом полезна гипервентиля
ке, если величина pH желудочного сока ция?
ГЛАВА 5
АМИНОКИСЛОТЫ И ПЕПТИДЫ
.ru
В количественном отношении белки стоящ им из двух или более аминокис
занимаю т первое место среди всех со лот, соединенных ковалентными связя
держащихся в живой клетке макром оле ми. Поистине замечательное свойство
кул; на их долю приходится не менее к л е т о к -эт о их способность соединять
половины сухого веса клетки. Белки 2 0 аминокислот в различных комбина
присутствуют во всех клетках, причем циях и последовательностях, в результа
ib
их можно найти в любой части клетки. те чего образуются пептиды и белки,
Велико также и разнообразие белков; обладающ ие совершенно разными свой
в одной клетке'м ож но обнаружить сот ствами и биологической активностью.
ни различных видов этих макромолекул. Из одних и тех же строительных блоков
r-l
Белки выполняют многообразные био разные организмы способны вы рабаты
логические функции, поскольку они слу вать такие разнообразные продукты,
жат молекулярными инструментами, как ферменты, гормоны, белок хруста
с помощ ью которых генетическая ин лика глаза, перья, паутина, панцырь че
формация находит свое реальное вопло репахи (рис. 5-1), белки молока, энкефа-
e
щение. Поэтому изучение биологических лины (наркотики, вырабатываемые са
макромолекул разумно начать именно мим организмом), антибиотики, ядо
sh
с белков, или протеинов. (Это название витые вещества грибов и многие другие
происходит от латинского слова, озна соединения, наделенные специфической
чающего «первый» или «главный».) биологической активностью.
Ключ к пониманию структуры лю бо
го из всех этих тысяч различных белков
дает небольшая группа довольно про
u
.ru
женных в белках аминокислот оказался кислота
треонин, который удалось идентифици Валин Val V
Г истидин His H
ровать лиш ь в 1938 г. К аж дая амино
Глицин Gly G
кислота имеет тривиальное (традицион Глутамин Gin Q
ное) название, происходящее иногда от Г лутаминовая Glu E
источника, из которого аминокислота кислота
ib
была впервые выделена. Например, ас Изолейцин lie I
парагин, как нетрудно догадаться, Лейцин Leu L
впервые обнаружили в аспарагусе, а глу Лизин Lys К
таминовую ки сло т у-в клейковине (по- Метионин Met M
r-l
английски «gluten») пшеницы; глицин Пролин Pro P
был назван так за его сладкий вкус (от
Серин Ser s
Тирозин Tyr Y
греч. « g ly k o s» -сладкий). Треонин Thr T
Все 20 аминокислот, встречающиеся Триптофан Trp W
e
в белках, характеризуются общей струк Фенилаланин Phe F
турной особенностью -наличием кар Цистеин Cys С
боксильной группы и аминогруппы, свя
sh
.ru
поляризации измеряют при помощ и по К арбоксильны е группы, представляю щ ие собой
ляриметра (разд. 3.5). Если не считать точки отсчета, расположены на конце связи, иду
глицина, не имеющего асимметрическо щей от хирального центра по вертикали. Струк
туры L- и D -а л а н и н а -э т о несовмещ ающиеся
го атома углерода (рис. 5-3), все зеркальные отражения друг друга. Б и В. Два
разных способа изображения пространственной
конфигурации оптических изомеров. В перспек
СО О Н
ib
тивных формулах связи, выступающ ие над пло
I скостью рисунка, изображ аю тся в виде клиньев,
HoN— С — Н а связи, уходящие за плоскость рисунка, обозна
чаю тся пунктиром. В проекционных формулах
предполагается, что горизонтальны е связи вы
н
r-l
ступаю т над плоскостью рисунка, а верти
кальные - уходят за его плоскость. П равда, про
Рис. 5-3. Глицин, единственная аминокислота, екционным ф ормулам далеко не всегда придаю т
у которой нет асимметрического атом а углеро строгий смысл и пользую тся ими вне всякой свя
да. R-группа, представляю щ ая собой атом водо зи со стереохимической конфигурацией м оле
рода, выделена красным цветом. кулы.
e
u sh
н Н
ak
L -аланин D-аланин
СНз СНз СН 3
СН 3
L-аланин D-аланин
L-аланин D- аланин
В
110 ЧАСТЬ 1. БИ О М О Л Е К У Л Ы
.ru
скость поляризации света точно на та
кой же угол, но вправо (по часовой ны значения удельного вращения для не
стрелке) и называется правовращающим скольких аминокислот; обратите внима
изомером [в этом случае впереди ставят ние, что среди них есть как левовращ аю
знак ( + )]. Эквимолярная смесь ( + )- и щие, так и правовращающие.
( — )-форм не способна вращ ать пло
5.3. Стереоизомеры
ib
скость поляризации света. Поскольку
все аминокислоты (за исключением обозначаются в соответствии
глицина), выделенные из белков в м яг с их абсолютной конфигурацией
ких условиях, вращ аю т плоскость поля
В основе более строгой системы клас
r-l
ризации света, ясно, что в составе бел
ковых молекул они присутствуют толь сификации и обозначения стереоизоме-
ко в какой-либо одной стереоизомерной ров лежит не вращение плоскости поля
форме. ризации света, а абсолютная конфигура
Оптическая активность стереоизомера ция молекулы стереоизомера, т. е.
e
количественно выражается величиной взаимное расположение четырех зам е
удельного вращения, которую можно щающих групп, находящихся в верши
определить, измерив угол поворота пло нах тетраэдра, вокруг локализованного
sh
.ru
более хиральных центров, оно может
L -аланин D-аланин иметь 2 " стерео изомеров, где п - число
Рис. 5-5. Стерическое соответствие между хиральных центров. Глицин не содер
структурой энантиомеров аланина и абсолю т жит асимметрического атом а углерода
ной конфигурацией L- и D -глицеральдегида. (см. 5-3), и поэтому у него нет стереои
сильно окисленный атом углерода, свя зомеров. Все другие аминокислоты,
ib
занный с асимметрическим атомом обычно встречающиеся в белках, содер
углерода. Таким атомом в молекуле L- жат по одному асимметрическому ато
аланина служит углерод карбоксильной му углерода. Исключение составляют
группы, а в молекуле L -глицеральдеги- треонин и изолейцин, каждый из ко
r-l
д а-у гл е р о д альдегидной группы. Если торых имеет по два таких атома и 2 ” =
эти два атома расположить в простран = 2 2 = 4 стереоизомера. Однако в со
стве одинаковым образом, то, как видно став белков входит только по одному
из рис. 5-5, аминогруппа L-аланина бу из этих четырех возможных изомеров
дет соответствовать гидроксильной той и другой аминокислоты.
e
группе L -глицеральдегида, а метильная Д ля соединений, содержащих два или
группа (R-rpynna) L -аланина-----С Н 2 ОН- более хиральных центров, приведенная
группе L-глицеральдегида. Такое же со выше система обозначения стереоизоме
sh
.ru
SH > OR > О Н > N H CO R > NH2 > С О О Н > СН О >
> С Н 2О Н > С 6 Н 5 > СН3 > Н.
ib
из них содержит два асимметрических атом а углерода и для них воз
можно существование четырех (22) стереоизомеров. В этих изомерах
конфигурация замещающих групп относительно каждого хирального
центра была установлена путем сравнения их с L- и D -формами гли-
r-l
церальдегида, и изомеры получили соответствующие обозначения
(приставка «алло» означает по-гречески «другой»).
СООН СООН
e
H2 N — С — Н H2N — С — Н
sh
Н — С — ОН НО— С— н
СН;, СНз
L-треонин L -алло- треонин
u
СО О Н СООН
ak
НО—с — Н Н — С — ОН
СНз СН3
D-треонин D-алло-треонин
.ru
Н О О С ___ ^С Н О Н
СНз
ib
Видно, что направление, в котором происходит уменьшение приори
тета (показано стрелками) замещ аю щ их групп, соответствует пово
роту против часовой стрелки. Следовательно, углерод-2 имеет кон
фигурацию S. Такую же стерическую диаграмму можно нарисовать
r-l
и для атома углерода-3, причем связь между этим атомом углерода
и атомом водорода (группой с наименьшим приоритетом) должна
быть направлена за плоскость рисунка:
e
sh
u
.ru
вращает плоскость поляризации ни
на основе многочисленных тщ ательно в том, ни в другом направлении. Раце
проведенных химических исследований, мическую смесь можно разделить на D-
в которых оптические свойства амино и L-изомеры только при помощи очень
кислот сопоставлялись с их поведением трудоемких методов, основанных на
в химических реакциях. Ниже мы уви различиях в физических свойствах сте
дим, что в живой природе встречаются
ib
реоизомеров. Разделенные D- и L -изо-
также и некоторые D -аминокислоты, меры со временем снова превращаются
но они никогда не входят в состав в рацемическую смесь (см. дополнение
белков. 5-2).
r-l
Дополнение 5-2. Как определить возраст человека,
используя химию аминокислот
e
Оптические изомеры аминокислот претерпевают очень медленную
и самопроизвольную неферментативную рацемизацию, так что за ка
sh
.ru
ряду. лярности, размерам и форме R-rpynn.
ib
нокислот, встречающихся в белках. Де R-группы этого класса аминокислот
ло облегчается тем, что все аминокис представляю т собой углеводороды, и,
лоты можно сгруппировать на основе следовательно, они гидрофобны
признаков, свойственных их R-группам, (рис. 5-6). К данному классу относятся
r-l
в частности их полярности (табл. 5-3), пять аминокислот с алифатическими R-
т.е. способности R-rpynn к взаимодей группами (аланин, валин, лейцин, изолей
ствию с водой при биологических значе цин и пролин), две аминокислоты с аро
ниях pH (вблизи pH 7,0). По степени по матическими кольцами (фенилаланин
лярности все R-группы аминокислот и триптофан) и одна аминокислота, со
e
можно расположить в виде непрерывно держащ ая серу (метионин). Особого
го ряда, начиная от полностью непо- упоминания заслуживает пролин, так
как его а-аминогруппа не свободна,
sh
COO' соо~
H jN - C - H H3N - C —Н H ,N - C - H H.N н
СН, снг н -с -с н 3
НЯС СН3 сн снг
Н3С чсн3 сн3
Аланин Валин Лейцин Изолейцин
СОО-
H3N - C - H , 3еN—п
H L-—м HjN-—( |—Н
сн2 I
ь
снг СН, сн2
Н£- СН, I
.ru
СН2 с=сн
S NH
I
сн,
H jN - C - H
H
HjN- С —H
CHjOH
СОСГ
HjN- С —H
H -C -O H
■■
ib СОО-
H3N5-- С —H
CHa
HjN—С—Н
СОО"
CH2
0X3-
HjN—C —Н
СН2
СОО-
H ,N -C -H
сн2
r-l
I
CH5 SH Oia
h 2n 7 ч о
4^ /Ч О
HaN
ОН
Глицин Серин Треонин Цистеин Тирозин Аспарагин Глутамин
e
Отрицательно заряженные Положительно заряженные полярные R-группы
полярные R-группы
СОСУ ОТО- СОО"
sh
HaN—С —Н HjN—С—Н * - Cг - H
H3N H jN - C - H H3N—С —Н
сн 2 СН2 СНа сн» сн 2
СОО- СН, сн» СН2 C-NH
COO' СН2 СНа СН
14
u
сн2
1А NH
1
С -/
+ н н
*NHj C=NHj
1
nh2
ak
Аспарагиновая Глутаминовая
Лизин Аргинин Гистидин
.ru
СН 2 — S — S — С Н 2
при pH 7,0 несут суммарный положи
Цистин тельный зар я д ,-это лизин, содержащий
Рис. 5-7. Цистеин и цистин. Тиоловые (— SH) вторую аминогруппу, прикрепленную
группы двух молекул цистеина легко окисляю т к алифатической цепи в е-положении,
ся и, соединяясь друг с другом, образую т ди- аргинин, имеющий положительно заря
сульфидную группу цистина. В белках встре
женную гуанидиновую группу, и гисти
ib
чаются как цистеин, так и цистин.
дин, содержащий слабо ионизированную
группа тирозина-ионизированы лишь имидазольную группу (рис. 5-6).
в незначительной степени.
Цистеин заслуживает особого упоми
r-l
нания по другой причине. Он может 5.10. В некоторых белках
присутствовать в белках в двух фор присутствуют нестандартные
м а х -л и б о в форме собственно цисте аминокислоты
ина, либо в форме цистина, молекула
e
которого представляет собой две м оле К ром е 20 стандартных аминокислот,
кулы цистеина, ковалентно связанные встречающихся почти во всех белках,
друг с другом при помощ и дисульфид- существуют нестандартные аминокис
sh
ного мостика, образующ егося при окис лоты, являющиеся компонентами лишь
лении обеих тиоловых групп (рис. 5-7). некоторых типов белков (рис. 5-8). К аж
Цистин играет важную роль в формиро дая из этих нестандартных аминокислот
вании некоторых белков, например гор представляет собой производное одной
мона инсулина и иммуноглобулинов ( ан из 20 обычных аминокислот. К нестан
дартны м аминокислотам относятся
u
.ru
ностью ионизированных молекул, ко
СН, — N H — СН 2 — СН 2 — СН 2 — СН 2 — С Н — СООН торые называю тся биполярными ионами
I или цвиттерионами (что по-немецки оз
NH 2
e-N-метиллизин начает «гибридные ионы») (рис. 5-9).
А Хотя такие ионы и несут на своих «по
люсах» электрические заряды противо
ib
,СООН положного знака, в целом они электри
чески нейтральны и потому не сме
щ аю тся под действием электрического
поля. Предположение о биполярном
r-l
строении аминокислот вначале было ос
СООН новано на том, что кристаллические
Биполярная форма
Неионная форма (называемая также
e
цвиттерионом)
СООН СОО
I ♦ I
sh
H2 N — С— н H3N — с — Н
I
Десмозин
R
* I
Рис. 5-9. Неионная и биполярная (цвиттерион-
Рис. 5-8. А. Н екоторы е нестандартные ам ино
ная) формы аминокислот. О братите внимание
u
.ru
вести себя и как кислоты,
Н а рис. 5-10 дана кривая титрования
и как основания
аланина, находящегося вначале в пол
В водном растворе аминокислоты, на ностью протонированной форме. Т итро
пример аланин, существуют в форме би вание проходит через две стадии, каждая
полярных ионов, которые функциони из которых соответствует отщеплению
руют либо как кислоты (доноры прото одного протона. Участок кривой, отве
ib
нов): чающий каждой из этих стадий, напо
минает по форме кривую титрования
одноосновной кислоты, например уксус
ной (см. рис. 4-10), и допускает точно та
r-l
Н *1 кую же интерпретацию. В самом начале
R—С—СОО- + Н+ = R—С—СООН титрования аланина его молекулы нахо
NH-j NH3 дятся в полностью протонированной
+ +
форме и в растворе преобладаю т ионы
e
+ N H 3 — C H R —С О О Н (в этой формуле
R означает метальную группу аланина).
либо как основания (акцепторы прото
В средней точке участка кривой, соответ
sh
NH 2C H R C O O
Стадия 1 — титрование
_____ - СООН-группы_
NH 3 C H R C O O "
.ru
NRCHRCOOH NH 2 C H R C O O “
NRCHRCOO
Изоэлектрическая-
ib
биполярная форма
NH3C H R C O O H
N H 3 CHRCOO"
r-l
Стадия 2 — титрование
------+NH 3-группы-------
p /f1= 2,34
e
sh
этого участка кривой титрования со нам р К { = 2,34 и р К { = 9,69, представляю т со
бой зоны, где аланин обладает буферной ем
ответствует эквимолярным концентра костью.
ak
а-Аминокислота
.ru
Н Н
I
R— С— СООН -г=* R— С— СОО- + Н*
I I /
H,N HSN ^ /
Положительные заряды Рис. 5-11. Аминогруппа в а-аминокислотах по
ib
отталкивают друг друга выш ает способность карбоксильной группы
Уксусная кислота к ионизации вследствие взаим ного отталкива
ния полож ительно заряженной + N H 3-i руппы
и полож ительно заряж енного иона Н + (обе
СН3— СООН ; : СН3 — СОО- + н + группы выделены красным цветом). Б лагодаря
r-l
таком у отталкиванию карбоксильная группа
\ / в а-аминокислотах имеет более высокую степень
Противоположные заряды ионизации, чем карбоксильная группа уксусной
притягивают друг друга кислоты.
e
Из кривой титрования аланина ствующем точке перегиба кривой титро
(рис. 5-10) мы можем узнать еще об вания, где одна стадия титрования пере
sh
ниями pH 8,7 и 10,7. О тметим также, что (pH ; или р/). Изоэлектрическая точка
при значении pH около 7,4, характерном представляет собой среднее арифметиче
для межклеточной жидкости и крови, ское двух величин рК':
аланин является плохим буфером.
Используя уравнение Х ендерсона-
РН / = j(p K \ + р К ’2);
Хассельбаха (гл. 4), м ы можем рассчи
тать, в каком соотношении нужно взять отсю да изоэлектрическая точка аланина
протондонорные и протонакцепторные равна
формы аланина, чтобы приготовить бу
фер с заданным значением pH, находя p H , = у (2,34 + 9,69) = 6,02.
щимся в пределах буферных зон аланина.
Это уравнение позволяет реш ать также
и другие задачи, связанные с буферными П ри лю бом значении pH, превыш ающ ем
свойствами аминокислот. изоэлектрическую точку, аланин имеет
122 ЧАСТЬ 1. БИ О М О Л Е К У Л Ы
.ru
кулы аланина существуют в форме ионов
+N H 3 — C H R — С О О Н с суммарным по Аминокислота р К[ р К'2 рК'
—СООН—N H J R-группы
ложительным зарядом 1,0. При pH 2,34,
когда мы имеем дело со смесью равных
количеств ионов +N H 3 — C H R — С О О Н Глицин 2,34 9,6
и +N H 3 — C H R — С О О - , средний, или Аланин 2,34 9,69
ib
суммарный, положительный заряд равен Лейцин 2,36 9,60
Серин 2 ,2 1 9,15
0,5. Аналогичным образом можно пред
Треонин 2,63 10,43
сказать знак и величину суммарного за Глутамин 2,17 9,13
ряда для лю бой другой аминокислоты
r-l
Аспарагиновая 2,09 9,82 3,86
при лю бом значении pH. кислота
Э та информация, как мы вскоре уви Глутаминовая 2,19 9,67 4,25
дим, имеет важное практическое значе кислота
ние, так как из нее следует, что смесь ами Г истидин 1,82 9,17 6 ,0
e
нокислот можно разделить, подвергнув Цистеин 1,71 10,78 8,33
Тирозин 2 ,2 0 9,11 10,07
ее воздействию электрического поля при
Лизин 2,18 8,95 10,53
определенном значении pH : в этих усло
Аргинин 2,17 9,04 12.48
sh
.ru
ib
Рис. 5-12. Кривые титрования глутаминовой 5.16. Кислотно-основные
кислоты и гистидина. Величина р K' R-группы
обозначена как р К ^ . свойства аминокислот служат
основой для аминокислотного
анализа
r-l
сильных групп), т.е. намного ниже, чем
у аланина. Аналогичным образом изо- Как м ы увидим в гл. 6 , первым ш агом
электрическая точка у лизина, содержа на пути установления структуры данного
щего две аминогруппы, равна 9,74, что белка является его гидролитическое рас
гораздо выше, чем у аланина. щепление на составляющ ие аминокис
e
Другое важное обобщение, касающее лоты. После этого необходимо опреде
ся кислотно-основных свойств 2 0 стан лить, какое количество аминокислот
дартных аминокислот, состоит в следую
sh
остальные аминокислоты имею т вели тоды, позволяю щ ие реш ать такие задачи
чины рK' слишком далекие от pH 7, достаточно быстро. К подобным м ето
чтобы их растворы можно было исполь дам относятся, в частности, электрофо
зовать в качестве эффективных буферов рез и ионообменная хроматография. О ба
при этом значении pH. Содержащийся этих м етода основаны на различиях
в эритроцитах белок гемоглобин, выпол в кислотно-основных свойствах амино
няющий функцию переносчика кислоро кислот, т.е. на различиях в знаке и вели
да, характеризуется очень высоким со чине суммарного электрического заряда
держанием остатков гистидина. Это при данном значении pH, которые можно
придает ему значительную буферную ем легко предсказать исходя из величин рК '
кость при pH около 7, что весьма важно и кривых титрования исследуемых ами
для той роли, которую играю т эритро нокислот.
циты в переносе кровью кислорода
и углекислого газа (гл. 25).
124 ЧА СТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
щее сильное электрическое поле. И з-за кислоты либо остаю тся на месте их нане
различий в величинах рК ' аминокислоты сения, либо перемещ аются лиш ь на не
перемещ аю тся вдоль полоски в том или значительные расстояния, так как кроме
а-аминогруппы и а-карбоксильной
Полоска фильтро- Пятно, содержащее группы у них нет других ионизируемых
вдльной бумаги см есь аминокислот групп; поэтому изоэлектрические точки
ib
всех этих аминокислот практически не
различаются. Об этом свидетельствуют
величины рК { и р K j, приведенные
® - я *i ----- Анионы »К атионы —
в табл. 5-4. Ч тобы установить положе
r-l
ние разделенных аминокислот на элек-
Кювета с буфером \ трофореграмме, полоску бумаги высу
Анод Катод
шивают, опрыскивают нингидрином (см.
ниже) и нагревают. Синие или лиловые
Т\
пятна, проступающие на бумаге, указы
e
ваю т на присутствие той или иной ами
72 нокислоты. П ри тех же условиях прово
sh
.ru
«нагружают» ионами N a + (рис. 5-14). За зультате различные аминокислоты про
тем на поверхность смолы наносят двигаю тся вниз по колонке со смолой
кислый раствор (pH 3,0), содержащий с разными скоростями, которые зависят
анализируемую смесь аминокислот, в основном от величин их р К ', но отчасти
Анионные центры
I 1,0
кислота Глутамино
Глутамино-
^ вая кислота
i
|
Аланин
|Аланин
I
-i
iI Фенилала--!'
нин 1 1
I
:«
ill 1Г 1н
I Пролин I I Цистеин
Цист«
$О о,з
Ё 0,1
Ll_
.ru
о
40 120 160 200 240 280 320 330 370 410 450 490 50
Элюат, мл
а
\ / X
ib
ние ам инокислот проводят различными буфера
ми с постепенно возрастаю щ им и значениями
pH . Выходящий из колонки раствор собираю т С + R— С — СООН Аминокислота
небольш ими порциями в отдельные пробирки, Г7 \ I
после чего в каждой из них автоматически опре f
Нингидрин
0Н NH.
О
r-l
деляется содержание аминокислоты. Площ адь
под каж дым пиком пропорциональна количе
ству соответствую щ ей аминокислоты в анализи
руемой смеси.
e
5Л9. Химические реакции,
характерные для аминокислот
sh
.ru
пления компонентов молекулы воды от
карбоксильной группы одной аминокис
лоты и а-аминогруппы другой аминокис
лоты под действием сильных конденси
рующих агентов (рис. 5-18). Три амино
кислоты могут соединиться анало
ib
^£> 2 2,4-динитрофе-
гичным образом при помощ и двух
N—Н ниламинокис-
пептидных связей и образовать трипеп-
Н—С—R Л0ТЗ тид; точно так же можно получить те
I трапептиды и пентапептиды. Если таким
r-l
СО О Н
способом соединить больш ое число ами
Рис. 5-17. Образование 2,4-динитрофенильных нокислот, то возникает структура, назы
производных аминокислот. ваемая полипептидом. Пептиды различ
ной длины образую тся при частичном
рина образуется продукт лилового цвета,
e
гидролизе очень длинных полипеп-
если аминокислота содержит свободную тидных цепей белков, которые м огут со
а-аминогруппу, и желтый продукт, если, держ ать сотни аминокислотных звеньев.
sh
R. H R, j R, н R2
H 2N — С Н — С — О Н + Н — N — С Н — С О О Н H 2N — С Н — С — N — С Н — С О О Н
128 Ч АСТЬ 1. Б И О М Л Е К У Л Ы
Н3с ,сн3
С Н 2О Н Н н
+ I I I
H 3 N — СН — С — N - - C — С
О н О
Аминоконцевой Карбоксиконцевой
.ru
остаток остаток
Серил-глицил-тирозинил-алани л-лейцин
Ser-G ly-T yr. A la-Leu
ib
Рис. 5-19. Структура пентапептида серил-гли- Gly-Gly
цил-тирозинил-аланил-лейцина. Н азвания пеп
Gly-Ala Ala-Gly
тидов образую т из названий аминокислот, на
чиная с аминоконцевого остатка. Пептидные G lyV al Val-Gly
связи затенены, а R-группы выделены красным Gly-Leu Leu-Gly
r-l
цветом. G ly lle Ile-Gly
G ly P ro Pro Gly
цевым остатком. Н азвания пептидов Gly-Met Met-Gly
образую т из названий входящих в них Gly-Phe Phe-Gly
аминокислотных остатков в соответ Gly-Trp T rpG ly
e
ствии с их последовательностью, начиная G ly S er Ser-Gly
Gly-Thr Thr-Gly
с N -концевого остатка, как показано на
Gly-Cys Cys-Gly
рис. 5-19.
sh
G ly T y r Tyr-Gly
G lyA sn Asn-Gly
5.21. Разделение пептидов Gly-Gln Gln-Gly
может быть основано G ly Asp A sp G ly
на различиях в их Gly-Glu G luG ly
ионизационных свойствах Gly-Lys Lys-Gly
u
Gly-Arg A rg-Gly
При частичном гидролизе белков Gly-His His-Gly
образуется огромное множество раз
ak
Изоэлектрическая форма О =С
I
СН 3 Н СН 3 N—Н
.ru
Анионная форма (при pH выше 10) NH
I
Gly СН 2
СН 3 Н СН 3
I I I О=
N H 2— СН— С — N — С Н — СОО I
II N—Н
О I +
Lys СН— СН 2 — СН 2 — СН2 — СН2 —NH 3
ib
I
СОО
Рис. 5-21. И онизация и электрические заряды лоты, пептиды имею т характерные
пептидов. Группы, ионизирующиеся при pH 6,0, кривые титрования и определенные изо-
r-l
выделены красным цветом. Н а рисунке электрические точки, т.е. такие значения
представлены катионная, изоэлектрическая
pH, при которых они не перемещ аются
и анионная формы дипептида аланил-аланина.
Справа приведена структурная формула тетра в электрическом поле.
пептида. Н есмотря на то что при неполном ги
дролизе белков образуется очень боль
e
бодную а-карбоксильную группу, ко шое число различных пептидов, их
торые находятся в концевых остатках сложные смеси можно разделять с по
sh
Н н н Н Н
Ri— С — С— N — С— COO- R i— С— СОО" + R ,— С— СОО-
N H, О R. NH, NH,
.ru
торых ферментов, таких, как трипсин
и химотрипсин, представляющ ие собой
протеолитические (белок-расщепляю-
R ,— СН
щие) ферменты, секретируемые в кишеч
ник и способствующие перевариванию,
т . е. гидролитическому расщеплению,
ib
белков, входящих в состав пищи. Если
кипячение пептидов с кислотой или ще R.,— СН
лочью приводит к гидролизу всех пеп
тидных связей независимо от природы
r-l
и последовательности соединенных при
их помощ и аминокислотных звеньев, то
Ra— СН R3— СН
трипсин и химотрипсин осуществляют
каталитическое расщепление пептидов С=О С=О
избирательным образом. Трипсин гид I I
e
ролизует только те пептидные связи, HN HN
I I
в образовании которых участвуют кар r 4—с н R,— СН
sh
I -фтор-2,4-динигробензол (ФДНБ).
ферментативный гидролиз оказывается
очень полезным при анализе аминокис
ванию динитрофенилпептида. При помо
лотных последовательностей белков
ak
чающихся в живых организмах как сво Arg ■Pro ■Pro •Gly •Phe- Ser -Pro ■Phe •Arg
бодные соединения, не связанные со
структурой белков. Особенно интересен А
тот факт, что многие свободные пептиды
обладаю т высокой биологической актив -S—S-
ностью. Например, к пептидам или поли Cys-Tyr-Ile-Gln-Asn-Cys-Pro-Leu Gly-NH*
пептидам относится ряд гормонов. Гор Б
моны служат-химическими медиаторами,
вырабатываемыми специализированны
ми секреторными клетками эндокринных HN4
ж елез-подж елудочной железы, гипофиза
и надпочечников; с током крови гормоны H2C --------CH2 H CH2 H ^ c — CH2
переносятся в другие ткани или органы
.ru
X С --------С — N — С — С— N
и регулируют их специфические функции.
Гормон инсулин, вырабатываемый ß- O^ I \ H OII I O
H V
/С - СA«
Н ,
клетками поджелудочной железы, посту H H c = 0
ib
Пироглутаминовая Гистидин Пролинамид
цепгор’а ми и стимулирует способность кислота D
этих клеток использовать глю козу в ка D
честве метаболического топлива. Инсу
Tyr-Gly-Gly-Phe-Met
лин состоит из двух полипептидных це
r-l
Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu
пей, одна из которых содержит 30
аминокислотных остатков, а др у гая- 2 1 .
К полипептидным горм онам относится
также другой гормон поджелудочной же
e
лезы, глюкагон, действующий как антаго D-Phe—»L-Leu—» L-Orn—>L-Val—»L-Pro
нист инсулина, и кортикотропин, вы ра t 4
L-Pro <—L-Val <—L -O rn«—L-Leu «-D -Phe
батываемый передней долей гипофиза
sh
и стимулирующий функционирование Д
надпочечников. Кортикотропин состоит Рис. 5-23. Н екоторы е природные пептиды,
из 39 аминокислотных остатков. обладаю щ ие высокой биологической актив
Молекулы некоторых гормонов пред ностью . Аминоконцевые остатки находятся
ставляю т собой гораздо более короткие слева. .4. Б ради ки ди н-горм оноп одоб н ы й пеп
тид с противовоспалительной активностью . Б.
u
пептидные цепи. В число таких гормонов Окситоцин - горм он, образую щ ийся в задней
входят окситоцин (девять аминокис доле гипофиза. Н а цветном фоне - остаток гли-
лотных остатков)-горм он, синтези цинамида (N H 2 C H 2 C O N H 2). В. Т иреолиберин -
ak
руемый в задней доле гипофиза и стиму горм он, образую щ ийся в гипоталамусе. Г. Энке
фалины - пептиды м озга с опиатоподобной ак
лирующий сокращение матки; брадики- тивностью . Д . Грамицидин С -ан ти б и о ти к.
нин {девять остатков)-горм он, по Стрелки указы ваю т направление от аминокон
давляющий воспалительные процессы цевого к карбоксиконцевому остатку. О т -- обо
в тканях, и тиреолиберин (три остатка), значение о р н и ти н а- аминокислоты, не встре
чающ ейся в белках. О братите внимание, что
синтезируемый в гипоталамусе и стиму в состав грамицидина С входят два остатка
лирующий синтез другого гормона, D -аминокислоты.
тиреотропина (тиреотропного гормона),
вырабатываемого передней долей гипо зии, т. е. ослаблению болевых ощущений.
физа (рис. 5-23). Особого упоминания за Энкефалины (что значит «находящиеся
служивают энкеф алины -короткие пеп в голове») представляют собой наркоти
тиды, синтезируемые в центральной ки (опиаты), вырабаты ваемые самим ор
нервной системе. Связывание энкефали- ганизм ом ; они связываю тся с теми же
нов со специфическими рецепторами не участками мозга, что и морфин, героин
которых клеток м озга приводит к аналге- и другие наркотические вещества. К пеп
5*
132 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
токсичными соединениями. О тсю да ясно, мах, образование которых зависит от pH.
что биологическая активность и специ П ри взаимодействии аминокислот с нин-
фичность действия пептидов и полипеп гидрином образую тся окрашенные про
тидов полностью определяются последо дукты. Д ля разделения сложных смесей
вательностью составляющ их их амино аминокислот, а также для идентифика
кислотных остатков. ции и определения количества разде
ib
ленных аминокислот используют м е
Краткое содержание главы тоды электрофореза и ионообменной
хроматографии.
Каждая из 20 аминокислот, которые
Аминокислоты, ковалентно соеди
r-l
обычно обнаруживают как продукты ги ненные друг с другом при помощ и пеп
дролиза белков, содержит а-карбоксиль тидных связей, образую т пептиды, ко
ную группу, а-аминогруппу и специ торые могут бы ть получены также как
фическую для данной аминокислоты продукты неполного гидролиза полипеп
R-группу, замещ аю щ ую водород при
e
тидов. Кислотно-оснбвные свойства пеп
а-атом е углерода. ос-Атом углерода во тида определяю тся его концевыми N H 2-
всех аминокислотах (за исключением
и С ООН-группами, а также входящими
глицина) является асимметрическим, и,
sh
Cooper T.G. The Tools of Biochemistry, Wiley, 3. Соотношение меж ду структурой и хим и
New York, 1977. Теория и практические ука ческими свойствами аминокислот. П о
зания по хроматографии и электрофорезу скольку аминокислоты служат строи
аминокислот. тельны ми блоками белков, знание их
Corrigan J. Т. D-Amino Acids in Animals, структуры и химических свойств имеет
Science, 164, 142-148 (1969). первостепенное значение для понимания
Dickerson R. E., Geis I. P rotein s: Structure, того, как белки выполняю т свои биологи
Function and Evolution, 2d ed., ческие функции. Ниже приведены струк
Benjamin j Cummings, M enlo Park, Calif., турные формулы боковых цепей (R-rpynn)
1983. 16 аминокислот (Ala, Arg, Asn, Asp, Cys,
Haschemeyer R., Haschemeyer A .H . Proteins: Glu, Gly, His, Lys, Met, Phe, Pro, Ser, Trp,
A G uide to Study by Physical and Chemical Туг и Val). Н азовите аминокислоты, ко
Methods, Wiley, New York, 1973. торы м принадлежат изображенные здесь
Lehninger A. L. Biochemistry, 2d ed., W orth, New R -группы. Какие из перечисленных ниже
York, 1975. Главы 4 и 5 содержат более под свойств характерны для каждой из этих
.ru
робное описание свойств аминокислот аминокислот? Н екоторы е из этих свойств
и пептидов. можно использовать для характеристики
Meister A.: Biochemistry of the Amino Acids, 2d более чем одной аминокислоты.
ed., 2 vols., Academic, New York, 1965. Энци Свойства R-групп и соответствующих
клопедическое изложение вопросов, касаю аминокислот.
щихся свойств и распространения амино Н
/
ib
кислот, а также их участия в процессах 1) — Н 2) — С Н 3 3) — С — СНз
метаболизм а живых организмов.
ХС Н 3
Segel I. Н. Biochemical Calculations, 2d ed.,
Wiley, New York, 1976. 4) — С Н 2О Н
r-l
Вопросы и задачи 5) — С Н 2— С Н 2— С Н 2—
С Н 2С Н 2С Н 2— N H — С — N H 2
Н С -* N H 2 ° О
ak
/
СООН 9) ~ С Н 2- С ^
О"
П ри 25°С стеклянная трубка длиной 20 см,
заполненная 5%-ным раствором цитрул
лина в 0,3 н. НС1, вращ ает плоскость поля
ризации света на 1,79° вправо. К акова ве 10) — СН2— СН2— С ^
личина удельного оптического вращения сг
цитруллина? М ожно ли по удельному вра
щению цитруллина определить, является 11) — СН2- - С Н 2— S — СН:,
ли он D- или L-аминокислотой?
2. Абсолютная конфигурация цитруллина. 12) — С Н 2— SH
Какую конфигурацию (D или L) имеет вы
деленный из арбуза цитруллин (см, фор
мулу, приведенную в предыдущем вопро
се)? Д айте обоснованный ответ.
134 ЧАСТ Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
Н
н) Если эту полярную, но незаряженную
14) — С Н ,— С Н 2 — С Н ,—
R-группу подвергнуть гидролизу, то со
C -N H , держ ащ ая ее аминокислота превращает
ся в другую аминокислоту с отрица
Н—+N
I тельно заряженной R-группой при pH
н около 7.
4. Связь меж ду кривой титрования и кислот-
15) — С Н ,— С Н 2 — С Н ,— С Н ,— N H 3 но-основными свойствами глицина. 0 , 1
М раствор глицина (100 мл), имеющий pH
1,72, был оттитрован 2 М раствором
16) С Н ,— С — n h 2
N aO H . В ходе титрования производилась
о регистрация pH , полученные данные были
отложены на графике, представленном на
рисунке. Наиболее важные точки на гра
а) Н ебольш ая полярная R-группа, содер
.ru
фике обозначены римскими цифрами от
жащ ая гидроксильную группу. С оответ I до V. Какую из этих пяти точек на кри
ствую щ ая аминокислота играет важную вой титрования следует указать, отвечая
роль в функционировании активных на поставленные ниже вопросы? Поясните
центров некоторых ферментов. свой выбор.
б) R-группа создает наименьшие
стерические ограничения. Задача 4
ib
в) R-группа имеет рК' 5 ; 10,5 и при физио
логических значениях pH несет полож и
тельный заряд.
г) Серусодержащая R -группа; нейтральна
при всех значениях pH.
r-l
д) Ароматическая R-группа; имеет гидро
фобную природу и нейтральна при всех
значениях pH.
е) R-группа, представляю щ ая собой оста
ток насыщенного углеводорода; вносит
e
важный вклад в гидрофобные взаим о
действия.
ж) Единственная аминокислота, содерж а
sh
.ru
вращ аются на 50% в ионы может находиться в одном из двух состоя
н и й -за р яж ен н о м или нейтральном. Элек
H 3 N — С Н 2 — С О О ’ и на 50% в ионы
трический заряд на функциональной груп
H jN С Н , С О О ? пе определяется соотношением между
н) В какой точке средний суммарный за величиной рK ' этой группы и значением
ряд молекулы глицина равен — 1 ? pH раствора. Это соотношение описы
ib
о) В какой точке 50% молекул глицина вается уравнением Х ендерсона-Х ассель-
превращаю тся в ионы H 3 N — С Н 2— баха.
saC O O H , а остальные а) Гистидин имеет три ионизируемые
функциональные группы. Напишите
50%- в ионы H ,N С И , С О О '? уравнения для трех соответствующих
r-l
п) Какой точке соответствует изоэлектри процессов ионизации гистидина и ука
ческая точка Глицина? жите примерные величины констант
р) В какой точке средний суммарный за- равновесия (р К'), характеризующих
1 каждый из этих процессов. Нарисуйте
ряд глицина равен —— ? структуру гистидина во всех трех со
e
с) Какой точке соответствует конец ти стояниях ионизации. Какой суммарный
трования заряд имеет молекула гистидина в каж
дом из состояний ионизации?
sh
ствующие точки,
у) В какой точке в ходе титрования пре в) Каков суммарный заряд молекулы
обладающ ей формой глицина становят гистидина при pH 1 , 4, 8 и 12? К уда бу
ся ионы H..N СН . С О О ? дет двигаться гистидин при каждом из
ak
.ru
лекула изолейцина?
менной хроматографии. Н ебольш ое коли
б) Сколько оптических изомеров может
чество смеси вносят в верхню ю часть ко
бы ть у изолейцина?
лонки, заполненной частицами полисти
в) Нарисуйте перспективные формулы
рола, содержащ ими остатки сульфоновой
всех оптических изомеров изолейцина.
кислоты (см. рис. 5-14). Затем через колон
г) Как вы обозначите каждый из этих
ку пропускают буферный раствор. Амино
изомеров в рамках RS-системы? (Указа
ib
кислоты проходят через колонку с разны
ние: по своему приоритету группа
ми скоростями, поскольку их движение
C H jC H j занимает промежуточное по
торм озят два фактора: 1 ) электростатиче
ложение между группами С 6 Н 5 и С Н 3.
ское притяжение между отрицательно за
12. Сравнение величин рК' аминокислоты
ряженными остатками сульфоновой кис
r-l
л оты и положительно заряженными функ в свободном виде и в составе пептидов.
циональными группами аминокислот и 2 ) Кривая титрования аминокислоты ала
гидрофобное взаимодействие между бо нина отраж ает процессы ионизации двух
ковыми цепями аминокислот и сильно ги функциональных групп с рK ' 2,34 и 9,69,
дроф обны м остовом полистирольной что отвечает ионизации соответственно
e
смолы. Д ля каждой из выписанных ниже карбоновой кислоты и протонированного
пар аминокислот определите, какая ами амина. Титрование ди-, три- и олигопепти
нокислота данной пары будет сходить дов аланина, содержащих более четырех
sh
р К±
г) Gly и Leu
д) Ser и Ala
10. Набор трипептидов. П редположим, что вы Ala 2,34 9,69
ak
.ru
Белки, или протеины (что в переводе цию, определяемую соответствующ им
с греческого означает «первые» или «важ геном. Таким образом, б ел к и -эт о не
нейшие»), количественно преобладаю т только наиболее многочисленные, но
над всеми другими макромолекулами, и исключительно разнообразные по
присутствующими в живой клетке, и со своим функциям макромолекулы.
ib
ставляю т более половины сухого веса Особенно поразительно то, что все
больш инства организмов. В предыдущей белки во всех организмах, независимо от
главе мы рассматривали аминокис их функции или биологической активно
лоты -структурны е элементы б е л к о в -и сти, построены из одного и того же ос
r-l
простые пептиды, состоящие из неболь новного набора 2 0 стандартных амино
шого числа аминокислотных остатков, кислот, каждая из которых, взятая
соединенных друг с другом пептидными в отдельности, не обладает никакой био
связями. Теперь м ы займемся структурой логической активностью. Ч то же тогда
белков, молекулы которых представляют придает одному белку ферментативную
e
собой очень длинные полипептидные це активность, другом у—гормональную ,
пи, построенные из многих аминокис а тр етьем у-свой ства антитела? Как бел
лотных звеньев. ки различаю тся химически? О твет до
sh
Белки служат теми инструментами, по вольно прост: белки отличаю тся друг от
средством которых генетическая инфор друга тем, что каждый имеет свою, ха
мация получает свое реальное воплощ е рактерную для него одного последова
ние. В соответствии с тем что тельность аминокислотных звеньев.
в клеточном ядре содержатся тысячи ге А м инокислоты -это алфавит белковой
u
.ru
ставлены в равных соотношениях, то получится 1 0 3 0 0 возможных по
следовательностей. Если теперь допустить, что этот белок построен из
2 0 различных аминокислот, представленных в равных соотношениях,
то число возможных последовательностей будет еще намного больше.
Если бы существовало только по одной молекуле каждого из этих воз
можных изомеров такого белка, то общий вес всех этих молекул значи
ib
тельно превысил бы вес Земли!
Таким образом, двадцать аминокислот могут дать достаточное чис
ло последовательностей, чтобы их хватило не только для тысяч белков,
присутствующих у каждого из ныне существующих видов организмов,
r-l
но и для белков всех тех видов, которые когда-либо существовали
в прош лом и появятся в будущем. Живущие сейчас на Земле виды со
ставляю т, по имеющимся оценкам, примерно одну тысячную всех ви
дов, существовавших ранее на нашей планете. Молекулярная логика
аминокислот и белков в достаточной степени предусматривает воз
e
можность возникновения новых видов, обусловленную дивергентной
природой биологической эволюции.
sh
.ru
Пищевые и Глиадин (пшеница) стадиях развития зародыш а. Наиболее
запасные белки Яичный альбумин известными примерами таких белков
(яйцо) служат белки семян пшеницы, кукурузы
Казеин (молоко) и риса. К пищевым белкам относится
Феррнтин также яичный альбумин - основной ком
Сократительные и Актин
понент яичного белка, и казеин, главный
двигательные бел Миозин
ib
Т убулин белок молока. В ферритине, встречаю
ки
Динеин щемся в животных тканях, запасено же
Структурные Кератин лезо.
белки Фиброин
r-l
К оллаген г. С ократ ит ельны е
Эластин и д вигат ельны е белки
Протеогликаны
Защитные белки Антитела Н екоторые белки наделяю т клетку или
Фибриноген
организм способностью сокращ аться, из
e
Тромбин
Ботулинический менять форму или передвигаться. Актин
токсин и миозин представляют собой ните
видные белки, функционирующие в со
sh
Дифтерийный ток
син кратительной системе скелетной мышцы,
Змеиные яды а также во многих немышечных клетках
Рицин (разд. 2.13). Другим примером таких бел
Регуляторные Инсулин ков служит тубулин - белок, из которого
белки Гормон роста
построены микротрубочки. Они являю т
u
Кортикотропин
Репрессоры ся важными элементами ресничек и жгу
тиков (разд. 2.14), при помощ и которых
клетки передвигаются.
ak
.ru
у позвоночных,- это специализированные циям, построены из одних и тех же 2 0
белки, вы рабатываемые в лимфоцитах; аминокислот.
они обладаю т способностью распозна
вать проникшие в организм бактерии, ви 6.2. Белки можно
русы или чужеродные белки других ви классифицировать также
дов, а затем нейтрализовать их или но форме их молекул
ib
связываться с ними, вызывая образова
ние осадка. Фибриноген и т р о м б и н -б ел Белки м огут быть разбиты на два
ки, участвующие в процессе свертывания больших класса в соответствии с формой
крови; они предохраняют организм от их молекул и некоторыми физическими
r-l
потери крови при повреждении сосуди свойствами: глобулярные и фибрил
стой системы. Змеиные яды, бакте лярные белки (рис. 6-1). В глобулярных
риальные токсины и токсичные белки рас белках одна или большее число полипеп-
тений, например рицин, по-видимому, тидных цепей свернуты в плотную ком
также выполняю т защ итные функции.
e
пактную структуру сферической, или гло
булярной, формы. Обычно глобулярные
ж . Р е гуля т о р н ы е белки белки растворимы в водных системах
sh
.ru
ib
e r-l
sh
.ru
2 10
ib
Lys 18 14
Met 3 2
входят сахара (от греч. «glykos», что зна
Phe 3 6 чит сладкий), а металлопротеины имеют
Pro 4 9 в своем составе гот или иной харак
Ser 28 терный для каждого из них металл, на
r-l
2
.ru
дов разной длины, с различным амино яичного белка)
М иоглобин (из 16890 153 1
кислотным составом и различной после
миокарда л о
довательностью аминокислот. Все моле
шади)
кулы данного индивидуального белка иден Химотрипсин 22 600 241 3
тичны по аминокислотному составу, (из поджелу
последовательности аминокислотных
ib
дочной железы
остатков и длине полипептидной цепи. быка)
В одних белках имеется только одна Гемоглобин 64 500 574 4
полипептидная цепь, тогда как в других, (человека)
олигомерных, б ел к ах -д в е или большее Сывороточный 6 8 500 ~ 550 1
r-l
число цепей (табл. 6-4). Например, фер альбумин (че
ловека)
мент рибонуклеаза состоит из одной по Гексокиназа (из 1 0 2 0 0 0 ~ 800 2
липептидной цепи, а гем о гл о б и н -и з дрожжей)
четырех. у-Глобулин 149 900 ~ 1250 4
e
М олекулярные массы белков, которые (лошади)
можно определить различными физико Глутам атде- 1 000000 ~ 8300 ~ 40
химическими методами, лежат в диапа гидрогенеза
sh
По-видимому, не существует простых за (мол. масса 18,0) и, таким образом, сред
кономерностей, связывающих молеку няя м асса аминокислотного остатка со
лярные массы белков с их функциями. ставляет 128 — 1 8 = 110. В табл. 6-4 при
Например, ферменты очень сильно раз ведены данные о числе аминокислотных
личаются по молекулярной массе. остатков в различных белках.
Число аминокислотных остатков
в простых белках, не содержащих просте- 6.6. Белки можно выделить
тических групп, можно приблизительно и подвергнуть очистке
оценить, поделив значение молекулярной
массы белка на 110. Хотя средняя м оле Клетки содержат сотни, если не тысячи
кулярная масса каждой из 2 0 аминокис различных белков, и для того чтобы
лот, содержащихся в белках, составляет определить аминокислотный состав или
около 138, в большинстве белков пре аминокислотную последовательность
обладаю т аминокислоты меньшего раз- того или иного белка, его прежде всего
144 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
ib
r-l
необходимо получить в виде чистого пре Рис. 6-3. Диализ. М ембрана, окруж аю щ ая рас
e
парата. Каким же образом один белок, твор белка, свободно пропускает воду и низко
например какой-нибудь фермент, можно молекулярные соединения, такие, как NaCl или
глю коза, но не пропускает больш ие молекулы,
отделить от сотен других белков, присут в частности молекулы белка. М алые молекулы
sh
в клеточном или тканевом экстракте, пу кулярных соединений в растворе белка до сколь
угодно малой величины.
тем диализа (рис. 6-3). Крупные м оле
кулы, такие, как молекулы белков,
ak
Гранула декстрана
Гранула
декстрана
.ru
гранулы поры
ib
скаю т через колонку, заполненную очень мелки лых белков лого белка про
ми пористыми гранулами гидрофильного поли никают в гра
мера; ш ироко использую т дл я этой цели нулы и задер
производные декстрана. М олекулы малых бел живаются
ков проникаю т внутрь гранул, тогда как более
r-l
крупные молекулы не м огут туда проникнуть.
Молекулярную массу белка можно определить
путем сравнения скорости его прохождения че Таблица 6-5. Изоэлектрические точки (pHj)
рез колонку со скоростями прохождения других некоторых белков
белков с известными молекулярными массами.
e
колонку с промежуточными скоростями pH ,
в зависимости от их способности прони
кать внутрь гранул. Такая колонка, в ко
sh
Пепсин < 1 ,0
6 ,6
методе играю т знак и число электриче
Г емоглобин 6 ,8
ских зарядов, локализованных на R-rpyn- 7,0
М иоглобин
пах, концевой аминогруппе и концевой Химотрипсиноген 9,5
ak
N.
Д ва больших открытия, сделанные
+
1
в 1953 г., ознаменовали наступление но
вой эры в биохимии. В этом году Джеймс
После включения Д. Уотсон и Фрэнсис Крик в Кембридже
напряжения V (Англия) создали модель структуры Д Н К
(двойную спираль) и высказали предпо
о • • ложение о структурной основе точной
О • •
+ <Г" о • - » • —> - репликации Д Н К . В этом предположе
о • •
о • • нии. по существу (хотя и не в явной фор
ме), бы ла выражена идея о том, что по
.ru
Рис. 6-5. Электрофорез смеси трех белков.
Смесь белков наносят на полоску ацетата цел следовательность нуклеотидных звеньев
люлозы, смоченную буфером с заданным значе Д Н К содержит в себе закодированную
нием pH. Концы полоски опускают в кюветы генетическую информацию. В том же го
с электродами. Ацетат целлюлозы служит носи ду Фредерик Сэнгер, работавший в Кем
телем, предотвращающим беспорядочное пере
мещение молекул белка в результате диффузии. бридже в той же лаборатории, расши
фровал последовательность аминокис
ib
После нанесения смеси белков на середину поло
ски молекулы белков подвергают действию лот в полипептидных цепях гормона
электрического поля, создаваемого разностью инсулина. Это достижение само по себе
потенциалов между электродами. Каждый из
трех белков перемещается в сторону положи имело больш ое значение, так как в тече
r-l
тельного или отрицательного электрода с раз ние долгого времени считалось, что опре
ной скоростью в зависимости от pH среды и кис- деление аминокислотной последователь
лотно-основных свойств каждого белка. По ности полипептида представляет собой
окончании электрофореза положение белков
можно выявить при помощи красителей, связы совершенно безнадежную по трудности
вающихся с белками. задачу. Но, кроме того, результаты, по
e
лученные Сэнгером, практически одно
лоску бумаги, либо пленку ацетата временно с появлением гипотезы Уотсо
целлюлозы, либо пластину гидрофильно н а -К р и к а , тоже наводили на мысль
sh
.ru
чистого полипептида. О бразую щ аяся связь между 2,4-динитрофенильной груп
смесь аминокислот анализируется затем пой и а-аминогруппой N -концевого
при помощ и ионообменной хром атогра остатка остается незатронутой. Следова
фии (разд. 5.18), что позволяет опреде тельно, N -концевой остаток будет пред
лить, какие аминокислоты и в каком со ставлен в гидролизате в виде 2,4-дини-
отношении присутствуют в гидролизате. трофенильного производного (рис. 6 - 6 ).
ib
Это производное легко отделить от неза
б. Стадия 2: идентификация мещенных свободных аминокислот
амино- и карбоксиконцевых
Рис. 6 - 6 . Идентификация аминоконцевого
остатков остатка тетрапептида путем получения 2,4-дини-
r-l
Следующий ш аг состоит в идентифи трофенильного производного. Тетрапептид
вступает в реакцию с 1 -фтор- 2 ,4-динитробензо
кации аминокислотного остатка, находя
лом (Ф ДНБ) с образованием 2,4-динитрофе-
щегося на конце полипептидной цепи, не- нильного производного. Последнее подвергаю т
NO* затем кипячению в присутствии 6 н. НС1 с тем,
e
чтобы расщ епить все пептидные связи. П ри этом
аминоконцевая ам инокислота остается в виде
2,4-динитрофевильного производного.
sh
NH 2
R,— СН
nh2
I СООН
R,— СН
u
C=(
I NH,
HN HF
ak
I R3— СН
f NOj
r 2— с н
I- СООН
C= =O
I +
HN
nh2
R,— CH СООН
2,4-динитрофенил - r 4— СН
C=O аминокислота, соот СООН
I ветствующая N-кон
HN цевому остатку Свободные
I аминокислоты
R„— CH
I
COOH СООН
Тетрапептид 2 ,4-динитрофенил -
тетрапептид
148 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
определения аминокислотной последова
тельности.
ib
СООН Теперь мы берем еще одну порцию
Три п еп тид , м еченны й
анализируемого препарата, содержащего
дансилхлоридом
неповрежденные полипептидные цепи,
r-l
Рис. 6-7. Введение метки в аминоконцевой оста и расщепляем их на более мелкие куски —
ток трипептида с пом ощ ью дансилхлорида. П о короткие пептиды, состоящие в среднем
сле гидролитического расщепления всех пеп
тидных связей дансильное производное ам ино из 10-15 аминокислотных остатков. Цель
концевой аминокислоты мож но выделить этой операции заключается в том, чтобы
и идентифицировать. Б лагодаря интенсивной разделить полученные фрагменты
e
флуоресценции дансильных групп они вы
и определить в каждом из них аминокис
являю тся в значительно меньших количествах,
чем динитрофен ильные группы. П оэтом у дан- лотную последовательность.
Д ля расщепления полипептидной цепи
sh
.ru
Триптофан
(рис. 6 - 8 ).
Тирозин
Пепсин Фенилаланин
Триптофан г. С т адия 4 : определение
Тирозин последоват ельност и пепт идны х
Некоторые другие остат ф рагм ент ов
ки
ib
Бромциан Метионин На этой стадии устанавливается ами
нокислотная последовательность в каж
дом из пептидных фрагментов, полу
ченных на стадии 3. Обычно для этой
r-l
цели используют химический метод, раз
работанный П ером Эдманом. Расщепле
ние по Эдману сводится к тому, что м е
тится и отщепляется только N -концевой
e
остаток пептида, а все остальные пеп
тидные связи не затрагиваю тся (рис. 6-9).
В этом
нап рав
После идентификации отщепленного N-
sh
аминокислотную последовательность
М есто нанесения В этом направлении пептида, используя для этой цели всего
см еси пептидов проведен электроф орез
ak
Фопилтиогидантоиновое
производное N -кон
цевой аминокислоты
Фенилтиокарба-
Фенилизо-
моильная группа
тиоцианат
>C=S
NH
R, — СН
С=О +
.ru
HN NH2
I I
R — СН R. — CH
I
С=О C=O
I I
HN HN
ib
I I
Rn— СН R — CH
С=О C=O
I
I
r-l
HN HN
I I
R„— СН R4— CH
I I
СООН COOH
Фенилтиокарбамоил-
e
Исходный пептид минус
тетраиептид N -концевой остаток
sh
же серии реакции, что позволяет иденти Рис. 6-9. Схема определения аминокислотной
фицировать новый N -концевой остаток. последовательности пептида путем его расщ еп
ления по Эдману. Исходный тетрапептид всту
П овторяя таким образом отщепление пает в реакцию с ф енилизотиоцианатом, в ре
одного за другим N -концевых остатков, зультате чего образуется фенилтиокарбамоиль-
можно легко определить аминокислот ное производное аминоконцевого остатка. Этот
ную последовательность пептидов, со остаток отщ епляю т от пептида без разры ва дру
u
довательности проводится для всех пеп способом. О ставшийся трипептид вновь прово
тидов, образовавш ихся под действием дят через тот же цикл реакций, что позволяет
идентифицировать второй остаток. Эти опера
трипсина. После этого сразу же возни ции повторяю т до тех пор, пока не будут иденти
кает новая проблем а-оп ределить, в ка фицированы все остатки.
ком порядке трипсиновые фрагменты
вую порцию препарата исходного поли-
располагались в первоначальной поли-
пептида и расщепляют его на более
пептидной цепи.
мелкие фрагменты каким-либо иным
д. С т а д и я 5 : расщ епление способом, при помощ и которого расще
исходной полипептидной цепи пляются пептидные связи, устойчивые
ещ е одним сп особ о м к действию трипсина. В этом случае бо
лее предпочтительным часто оказывает
Чтобы установить порядок расположе ся не ферментативный, а химический ме
ния пептидных фрагментов, образовав тод. Особенно хорошие результаты дает
шихся под действием трипсина, берут но- реагент бромциан, расщепляющий толь-
ГЛ. 6. Б Е Л К И : К О В А Л ЕН ТН А Я С Т Р У К Т У Р А И Ф У Н К Ц И И 151
.ru
ную последовательность. м ентации двумя способами. Вверху показаны
полученные фрагменты, а внизу -воссоздание
Итак, м ы получили два набора пеп полной последовательности полипептида по
тидных фрагментов - один после обра- перекрывающ имся участкам.
Данные эксперимента
N- концевой остаток *
С-концевои остаток
т-т-ш
r-l
ы ч н
ш-л щ -Ш гШ -м
Е -о -т н й V-E-R-1
e
R-L-A А-ш-т
H -O -M i-i
sh
■ -о
остатки Я ™
фрГ ™ « -« Н М ЯМЫ»
ak
ИЛИ
Ш-ВЧ1
Фр^ментовор ш-т-т-ш и-ш ш ш-ш-щ-ш ш-ш-ж ш-ш
Перекрываю
щиеся участки
Второй набор Ж _ щ т .Щ _ т _ т S E -0 V - e - e - L А - Р -iS
фраг ментов ■I , i i
Перекрываю
щиеся участки
Полученная
последова—
тельность
152 Ч А С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы N-концы
Gly Phe
е. С т а д и я 6 : установл ение
I I
ile Val
п орядка р а сп о л о ж е н и я I
пептидных ф р а г м е н т о в Val Asn
I I
по перекры ваю щ им ся у ч а с т к а м Glu Gin
I I
Теперь сравниваю т аминокислотные Gin 5 His
I I
последовательности в пептидных фраг -C y s Leu
ментах, полученных двумя способами из I I
исходного полипептида, чтобы во вто C y s- -S — S- — Cys
ром наборе найти пептиды, в которых бы I
lla Gly
последовательности отдельных участков I
6 er Ser
перекрывались (т. е. совпадали) с после
довательностями тех или иных участков I.
ia l io His
.ru
в пептидах первого набора. Принцип рас I I
положения пептидов показан на -C y s Leu
рис. 6-10. Пептиды из второго набора I I
Ser Val
с перекрывающимися последовательно I
стями позволяю т соединить в правиль Leu Glu
I I
ном порядке пептидные фрагменты, по Tyr Ala
ib
лученные в результате первого расщепле I I
ния исходной полипептидной цепи. Более 15 Gin is Leu
I I
того, эти два набора фрагментов позво Leu Tyr
ляю т выявить возможные ошибки I I
r-l
в определении аминокислотной последо Glu Leu
I I
вательности каждого фрагмента. Asn Val
И ногда второго расщепления полипеп I I
тида на фрагменты оказывается недоста Tyr -----Cys
I I
e
точно, чтобы найти перекрывающиеся 20 CVS- -S — S- го Gly
участки для двух или более пептидов, по I I
лученных после первого расщепления. Asn Glu
I
sh
I
ходной цепи. П ри этом для расщепления Tyr
полипептида можно использовать другие I
Thr
ak
Н Н О
I I II
Цепь I -С — •N - - С — С - • Цепь I
I I I
Н СН2 Н СН2
о I Поперечная
Дисульфидная I
поперечная н—с—о—он so3H связь ра
связь Надмуравьиная зорвана
кислота SO.H
Н СН2 Н
I I I
Цепь II ....N — С — С—• • Цепь II
I II
Н О Н О
Два остатка цистеи-
Остаток цистина
новой кислоты
.ru
Сэнгером при установлении аминокис Рис. 6-12. Расщ епление дисульфидных попе
речных связей надмуравьиной кислотой.
лотной последовательности бычьего ин
сулина; эта последовательность приведе
на на рис. 6-11. Бычий инсулин имеет необходимы обе ц е п и -А и В. Более того,
молекулярную массу около 5700. Его м о необходимо, чтобы обе поперечные ди-
ib
лекула состоит из двух полипептидных сульфидные связи оставались нерасще-
цепей: A-цепи, содержащей 21 аминокис пленными. Удаление части остатков из
лотный остаток, и В-цепи, содержащей 30 той или другой цепи путем их избира
аминокислотных остатков. Эти две цепи тельного отщепления приводит к частич
r-l
соединены двумя дисульфидными ной или полной потере активности. Хотя
(— S-—S—) поперечными связями, при инсулины, выделенные из поджелудоч
чем в одной из цепей имеется еще одна ной железы нескольких видов живот
внутренняя дисульфидная связь. При ных -к о р о в ы , свиньи, овцы и каш алота,
определении последовательности внача сохраняют гормональную активность
e
ле были разорваны поперечные дисуль- в организме человека и могут быть ис
фидные связи, что позволило разделить пользованы для лечения больных диабе
sh
цепи. Д ля этой цели Сэнгер использовал том, они все же не идентичны инсулину
в качестве окислителя надмуравьиную человека. Тем не менее весьма существен
кислоту, которая расщепляет каждый но то, что в каждой цепи инсулина в опре
остаток цистина на два остатка цистеи- деленных положениях всегда присут
новой кислоты (рис. 6 - 1 2 ), по одному ствуют одни и те же аминокислоты
в каждой цепи. После разделения цепей независимо от вида, из которого был вы
u
ностей еще более длинных полипеп двух идентичных а-глобинов (141 оста
тидных цепей. Очень скоро была ток) и двух идентичных ß-глобинов (146
установлена аминокислотная последова остатков). В молекуле гемоглобина эти
тельность адренокортикотропного гор цепи не соединены ковалентными связя
мона (кортикотропина, А К Т Г )-г о р м о н а ми, но тесно ассоциированы друг с дру
передней доли гипофиза, стимулирующ е гом посредством водородных связей
го рост и активность коры надпочечни и гидрофобных взаимодействий (гл. 7).
ков. Э тот гормон состоит из одной поли- После разделения а- и ß-глобинов их
пептидной цепи, содержащей 39 амино аминокислотные последовательности
кислотных остатков, с молекулярной были установлены двумя группами ис
массой около 4600. К концу 1950-х гг. бы следователей в Соединенных Штатах
ла установлена последовательность пер и о д н о й -в ФРГ. Среди более длинных
вого фермента -рибонуклеазы ; эту рабо полипептидных цепей, для которых уста
.ru
ту выполнили Стэнфорд М ур и Уильям новлена полная аминокислотная после
Стейн из Рокфеллеровского института, довательность, можно указать бычий
а также Кристиан Анфинсен с группой трипсиноген (229 остатков), бычий химо-
сотрудников из Национальных институ трипсиноген (245 остатков), глицеральде-
тов здравоохранения (США). М олекула гид-3-фосфатдегидрогеназу (333 остатка)
бычьей рибонуклеазы содержит в своей и состоящий из одной цепи сыворо
ib
единственной цепи 124 аминокислотных точный альбумин человека (582 остатка).
остатка и четыре внутрицепочечные Многие стадии, через которые прохо
— S— S— связи (рис. 6-13). дит определение аминокислотной после
Следую щим важным событием было довательности длинных полипептидных
r-l
определение аминокислотной последова цепей, и одновременная регистрация всех
тельности в двух типах полипептидных полученных результатов осуществляют
цепей гемоглобина. Это бы ла первая по ся в настоящее время автоматическими
следовательность, установленная для аминокислотными анализаторами с про
e
олигомерного белка. М олекула гем о граммным управлением. Даже расщепле
глобина состоит из четырех полипеп ние по Эдману проводится при помощи
тидных цепей, называемых глобинами — специального прибора с программным
sh
L y s - G l u - T h r - A l a - A l a - A l a - L y s - P h e - G l u - A r g ',0
G l n - H i s ’ M e t - A s p - S e r - S e r - T h r - S e r - A l a - A l a -20
S e rS e r-S e r-A s rrT y rC y s -A s n -G ln -M e t-M e t'3 0
L y s - S e r - A r g - A s n - L e u - T h r - L y s - A s p - A r g - C y s '40
L y s - P r o - V a l - A s n - T h r - P h e - V a l - H i s G l u - S e r - So
L e u - A I a - A s p - V a l ' G l n - A I a - V a l - C y s - S e r - G l n - 6o
L y s - A s n - V a l - A l a - C y s - L y s - A s n - G l y - G l n - T h r -70
A sn -C y s -T y r-G ln -S e r-T y r-S e r-T h r-M e t-S e r-g o
I l e - T h r - A s p - C y s ' A r g - G l u - T h r G l y S e r - S e r - 9o
L y s - T y r - P r o A s n - C y s - A l a - T y r - L y s - T h r - T h r -,00
G ln -A la -A s n -L y s -H is -lle lle -V a l-A la -C y s -,,,,
G l u G l y A s n - P r o - T y r - V a l - P r o - V a l - H i s - P h e -,20
A s p - A l a - S e r - V a l ,24
Б
Г л . 6. БЕ Л К И : КО В А Л Е Н Т Н А Я С Т Р У К Т У Р А ß ФУНКЦИИ 155
.ru
определить, какое количество каждой из его полинептидная цепь содержит 1 0 0
аминокислот присутствует в одном отпе или несколько больш ее число аминокис
чатке пальца! Д ля установления полной лотных остатков. Были установлены
аминокислотной последовательности ча аминокислотные последовательности
сто достаточно иметь всего один м илли для цитохромов с, выделенных более чем
грамм белка. из 60 видов, и во всех исследованных бел
ib
ках 27 положений в полипептидной цепи
6.10. Гомо. ins кчные Гкмкн оказались занятыми одинаковыми ами
!П1Ш Ы \ t.U. -iiH 0 Ш '!'Н нокислотными остатками (рис. 6-14). Это
указывает на то, что все эти остатки
r-l
i о м о . hx S’W i.iC ! н ч . н \ »*;
играю т важную роль в определении био
При изучении аминокислотных после логической активности цитохрома с.
довательностей гомологичных белков, В других положениях аминокислотные
выделенных из разных видов, было сде остатки могут варьировать от вида к ви
e
лано несколько важных выводов. К гомо ду. Второй важный вывод, сделанный на
логичным белкам относятся те белки, ко основе анализа аминокислотных после
торые у разных видов выполняю т одина довательностей цитохромов с, состоит
sh
ковые функции. П римером может слу в том, что число остатков, по которым
жить гемоглобин: у всех позвоночных он различаю тся цитохромы с любых двух
осуществляет одну и ту же функцию, свя видов, пропорционально филогенетиче
занную с транспортом кислорода. Гомо- скому различию между данными видами.
логичные белки разных видов обычно Например, молекулы цитохромов с л о
u
iw^ ; г Р
- 2 0
.ru
2 4
ЗЕ М Н О В О Д Н Ы Е *
— М инога
= - 30 Debaryamyces
--- Candida 12
--
О 11
ib
ГРИ БЫ П лодовая м уш ка
Ф асоль
1 4 ,5
- 40 1 2 ,5 М ясная м уха
Тутов ы й
ш елкопряд
r-l
Кунж ут
НАСЕКО М Ы Е
Д рож ж и V -У 6
i CJ К л е щ е в и н а
e
о
11
7 ,5 П ш еница f j y 2
äff
13 V м
sh
- 6 0 4
12
7 ,5
■
i.
7 ,5
о g
П одсолнеч-
ник
Нейроспора
__ л
- 7 0
25 Щ
u
15
‘ 25
ak
А.
- 8 0
12
- 9 0
о
tp - 1 0 0
СООН
С -к он е ц
А Б
ГЛ. 6. Б Е Л К И : КО В А Л Е Н Т Н А Я С Т Р У К Т У Р А И Ф У Н К Ц И И 157
.ru
нения, чужеродного для данного вида. ным альбумином из куриных яиц. За
Каждый чужеродный белок вызывает тем сыворотку крови иммунизированно
образование антител только одного го животного (антисыворотку), содержа
определенного типа. П одобная реакция щую антитела, смеш иваю т с небольшим
организма, высокоспецифическая по о т количеством антигена, т.е. яичным аль
ношению к инъецированному белку, на бумином. При этом происходит помут
ib
зывается иммунным ответом или им нение, так как образуется осадок (преци
мунной реакцией', она составляет основу питат), содержащий комплекс анти
целой научной области - иммунологии. ген -ан ти тел о. Если же с антигеном сме
Молекулы антител, формирующиеся ш ивается сыворотка неиммунизирован-
r-l
в специализированных клет ках-лим ф о ного животного, никакого осадка не об
цитах, способны соединяться с молеку разуется.
лам и антигенов, вызвавш ими их появле Антитела представляют собой м оле
ние, в результате чего образуется ком кулы Y-образной формы, состоящие из
e
плекс антиген - антитело. Иммунитет четырех полипептидных цепей. У них
к инфекционным болезням во многих имеются участки связывания антигена,
случаях можно создать путем инъекции комплементарные определенным хими
sh
.ru
сокомолекулярные белки, молекулы которых
состоят из четырех полипептидных цепей и со
Т-лимфоцит держ ат несколько углеводных групп. Они могут
специфически связываться с антигеном, вызвав
ш им образование антител, но не связываю тся ни
с какими другими белками. Иммуноглобулины
им ею т Y-образную форму и содержат два участ
ib
ка для связывания антигена. Антитела вызы
ваю т преципитацию (выпадение в осадок) анти
гена благодаря образованию нерастворимого
агрегата со структурой наподобие решетки.
Л имф област Каждый антиген стимулирует образование ан
r-l
тител лиш ь одного определенного типа. Эти ан
i титела распознаю т и связы ваю т только данный
антиген или близкородственные молекулы.
называемые денатурацией
Н а протяжении всей этой главы мы
ak
.ru
практически всех глобулярных белков не
зависимо от размеров их молекул и био
логической функции, хотя температура,
при которой осуществляется этот про
цесс, неодинакова у разных белков. И зм е
нения, происходящие с белками при на
ib
гревании, в совокупности называю тся
денатурацией. Белки в их естественном
состоянии носят название нативных бел
ков, а после денатурации -денат уриро
r-l
ванных белков.
Еще одно важное следствие денатура
ции белка заключается в том, что белок
почти всегда утрачивает характерную
e
для него биологическую активность. Так,
если водный раствор фермента кипятить
Денатурированный, т .е .
в течение нескольких минут, а затем ох
развернутый, белок
sh
.ru
ких, воздействиях. Если м ы хотим зани полипептид расщепляю т на фрагменты
маться изучением биологической актив каким-нибудь другим способом так,
ности какого-нибудь белка, мы должны чтобы места расщепления цепи не совпа
при выделении и очистке этого белка дали с местами ее расщепления при ис
обращ аться с ним очень осторожно, пользовании первого способа фрагмен
чтобы избежать его денатурации. тации. Аминокислотные последова
ib
В следующих двух главах будет пока тельности второго набора фрагментов
зано, каким образом полипептидные це должны перекрывать места расщеп
пи нативных белков свертываю тся и при ления цепи, полученные первым спосо
обретаю т характерную для них специфи бом.
r-l
ческую конформацию и как эта конфор Гомологичные белки, выделенные из
мация зависит от аминокислотной после организмов различных видов, обнаружи
довательности. ваю т гомологию последовательностей;
это означает, что наиболее важные поло
жения в полипептидных цепях гом оло
e
Краткое содержание главы
гичных белков заняты одними и теми же
Б е л к и -э т о самый многочисленный аминокислотами независимо от вида ор
sh
D ayhoff М. О. Atlas of Protein Sequence and ся на долю растворимых белков, среди ко
.ru
Structure, vol. 5, suppl. 1-3, N ational торых ß-галактозидаза составляет 1 ,0 %.
Biomedical Research Foundation, W ashi Подсчитайте число молекул ß-галактози-
ngton, D .C., 1972-1979. Энциклопедия ам и дазы в клетке E. coli, выросшей на лактозе.
нокислотных последовательностей белкоЕ. 2. Число остатков триптофана в сывороточ
Dickerson R. E., Geis I. Proteins: Structure, ном альбумине быка. Г1 о данным количе
Function, and Evolution, 2d ed., ственного аминокислотного анализа
Benjamin/Cummings, Menlo Park, Calif., 1983.
ib
в сы вороточном альбумине быка содер
Прекрасно иллю стрированная книга о бел жится 0,58% (по весу) триптофана, мол. м ас
ках, которую можно рассматривать как вве са которого равна 204.
дение в эту область. а) Рассчитайте минимальную м олекуляр
Haschemeyer R., Haschemeyer A. H . Proteins: ную массу сывороточного альбумина
r-l
A G uide to Study by Physical and Chemical быка.
Methods, Wiley, New York, 1973. б) По данным гель-фильтрации молеку
Neurath H., H ill R. L. The Proteins, 3d ed.. лярная масса сывороточного альбумина
Academic. New York, 1977. Всестороннее быка составляет приблизительно 70 000.
и детальное изложение сведений о белках, Сколько остатков триптоф ана присут
e
представленное в виде многотом ного сбор ствует в молекуле сывороточного аль
ника статей. бумина?
Schultz G. E., Schirmer R. H. Principles of Protein 3. М олекулярная масса рибонуклеазы. С одер
sh
.ru
гистонов с Д Н К ? м и стр у к ту р а с у к а за н н ы м и н и ж е
7. Растворимость полипептидов. В одном из а) П о л н ы й ги д р о л и з и о д д е й ств и е м 1 М
методов разделения полипептидов исполь Н С 1 п р и 110 С с п о с л е д у ю щ и м а м и н о
зуется различие в их растворимости. Как к и с л о т н ы м а н а л и зо м в ы я в и л п р и су т
уже было сказано в тексте, растворимость ств и е G ly , Le u . P h e и Т у г в м о л я р н о м о т
крупных полипептидов в воде зависит от н о ш е н и и 2 : 1 :1 :1 .
степени полярности их R-групп, особенно б) П о с л е о б р а б о т к и п о л и п е п т и д а 2 ,4 -д и -
ib
от числа ионизируемых групп: чем больше н и тр о ф то р б е н зо л о м с п о с л е д у ю щ и м
ионизируемых групп, тем выше раствори п о л н ы м ги д р о л и зо м и х р о м а то гр а ф и
мость полипептида. Какой полипептид из ч е ск и м р а зд ел е н и ем п р о д у к то в б ы л о
каждой пары приведенных ниже полипеп в ы я в л е н о п р и су тств и е 2 .4 -д и н и тр о ф е -
r-l
тидов более растворим в указанных усло и и л ы ю г о п р о и зв о д н о го ти р о зи н а . С в о
виях? б о д н о го ти р о зи н а п ри э т о м не б ы л о
а) (Gly ) 2 0 или (G1u) 2 0 при pH 7,0; о б н ар у ж ен о .
б) (Lys— Ala), или (Phe— M et ) 3 при pH 7,0; в) Ч а с т и ч н ы й г и д р о л и з п о л и п е п т и д а хи -
в) (Ala— Ser— G ly ) 5 или (Asn— Ser —H is ) 5 м о тр и п си н о м с п о с л е д у ю щ и м х р о
e
при pH 9,0; м а то гр а ф и ч е ск и м р а зд ел е н и ем п о л у
r) (Ala— \s p GlyU или (Asn Ser —His ) 5 ч е н н ы х п р о д у к то в д а л Le u , Т у г и б о
при pH 3,0. лее к о р о тк и й п еп ти д . П о л н ы й ги д р о
sh
.ru
объяснить на молекулярном уровне, поче
лиганд
му добавление солей в высоких концен
трациях приводит к понижению раствори
По этому методу лиганд, специфически
мости белка.
связываю щийся с белком, который нам
б) На графике показана зависимость рас
нужно выделить, ковалентно присоеди
творимости двух белков от концентрации
няют к нерастворимы м полимерным гра
(N H 4 )2 SO4. Как можно использовать эти
ib
нулам диаметром 10-50 мкм.
данные для разделения белков А и В?
Задача 11
e r-l
Д ля выделения этого белка из клеточного
экстракта последний вносят в колонку, за
полненную полимерными гранулами
sh
фичный и эффективный метод выделения просто вымы ваю тся буфером. Поскольку
специфических белков. Вследствие того что сродство и специфичность белка к лиганду
молекулы большинства белков легко раз очень высоки, таким путем зачастую м ож
ak
.ru
следовательностей дал следующие ди-
NH 3 —СН 2 —СН 2 —СН 2 —С—СО 2 и трипептиды (N -концевая аминокисло
та всегда расположена слева);
NH 3
+
Leu— Phe Phfr—P ro P he— P ro — Val
б) Измерения молекулярной массы дали
Val— O rn — Leu O rn — Leu
ib
приблизительную величину 1 2 0 0 .
Val— O rn Pro \ al— O rn
в) Пептид не подвержен гидролизу под
действием фермента карбоксипептида- Исходя из приведенной выше информа
зы. ции, попытайтесь восстановить амино
г) О бработка исходного полипептида кислотную последовательность поли-
r-l
фтординитробензолом с последующ им пептидного антибиотика. Поясните ва
полным гидролизом образовавш егося ши рассуждения. П осле того как у вас
производного и хроматограф ировани будет готов ответ, вернитесь назад
ем полученных продуктов дает лиш ь и проверьте, насколько установленная
свободные аминокислоты и производ вами структура согласуется с каждым
e
ное следующего строения: из описанных выше наблюдений.
u sh
ak
ГЛАВА 7
ФИБРИЛЛЯРНЫ Е БЕЛКИ
.ru
Белки можно разделить на два ос вехой на пути к изучению м етодом рент
новных класса: фибриллярные б е л к и -рас геноструктурного анализа структуры
положенные параллельно друг другу вы и функции глобулярных белков.
тянутые полипептидные цепи, образую
щие длинные нити или слои, и глобу
ib
лярные белки, в которых полипептидные 7.1. Термины «конфигурация»
цепи плотно свернуты в компактные и «конформация» имеют
структуры сферической ф о р м ы -г л о разный смысл
булы. В этой главе мы рассмотрим трех В этой и следующей главе мы рассм о
r-l
мерную структуру фибриллярных бел трим вопрос о пространственном распо
ков. В биологическом отношении фи ложении полипептидных цепей. Н о пре
бриллярные белки играю т очень важную жде всего мы дблжны точно определить,
роль, связанную с анатомией и физиоло что означают два термина, часто исполь
e
гией животных. У крупных позвоночных зуемые при обсуждении пространствен
на долю этих белков приходится одна ной структуры молекул; конфигурация
треть (или более) общего содержания и конформация. Эти слова не синонимы.
sh
.ru
стом виде, так как между ними суще
О пти чески е изом еры
(энантиом еры )
ствует- равновесие и они свободно пере
ходят одна в другую. Однако, как можно
СООН предположить, исходя из моделей, пред
H2N — С— н ставленных на рис. 7-2, если в молекуле
эгана один пли большее число атомов
ib
О й * водорода, связанных с двумя атомами
L -аланин углерода, заменить на более крупные или
электрически заряженные функцио
СООН нальные группы, то свобода вращения
r-l
н —с:—nh 2
11ак.юнная проекция Нил е. торца
hu. Н
D-п. i;umn
e
Р и с. 7-1. К о н ф и г у р а ц и я c i e p e o ti iO SiepoB. Т аки е4,
и з о м е р ы н е л ь з я и р с в р а i in ь о д и н в д р у г он б ез
р а з р ы в а к о в ал ен тн ы х связей Н »H Н
sh
н
также L- и D-изомеры аланина (см.
рис. 3-8 и 5-4), в которых замещаю щие
'З а т о р м о ж е н н а я larop sjoA e iu iaH
группы имеют две различные конфигура к о н ф о р м ац и и конформация
ции относительно хирального центра.
u
О т л и ч и т ел ьн ы м п р и зн а к о м к о н ф и г vpa-
ЦЖЖ№ых и зо м ер о в я в л я е т с я т о. чт о их
н е л ь зя преврат ит ь один в д р уго й б ез р а з
ak
ры ва о д н о й или б о л ь ш е го чи сла ко ва нп
л е н т н ы х с в я зей .
Термин к о н ф о р м а ц и я используют для I/
описания пространственного расположе
n> h
ния в органической молекуле зам ещ аю н II
щих групп, способных свободно изме ’’а и л о м о н н а я ’З а с л о н е н н а я
нять свое положение в пространстве без конф орм ации конф орм ация
разры ва каких бы то ни было связей бла
Рис. 7-2. Д ве крайние конформации молекулы
годаря свободному вращению вокруг п а и а. Благодаря свободному вращ ению в окру i
одинарных углерод-углеродных связей. одинарной С С-связи возможны и многие
Например, для простого углеводорода другие конформации. Различные
эт ана характерна полная свобода враще кои формационные формы легко переходя г од im
в другую, и их нельзя отделить друг oi дру| а.
ния вокруг одинарной С — С-связи. П о Затормож енная конформация наиболее
этому молекула этана может принимать устойчива и преобладает над всеми другими.
ГЛ. 7. Ф И Б Р И Л Л Я Р Н Ы Е БЕЛ КИ 167
вокруг одинарной С— С-связи окажется почти весь сухой вес волос, шерсти, перь
сильно ограниченной, что существенно ев, рогов, ногтей, когтей, игл, чешуи,
уменьшит число возможных конформа копыт и черепашьего панцыря (см.
ций молекулы этана. рис. 5-1), а также значительная часть су
хого веса наружного слоя кожи. а-Кера-
7.2. Как это ни парадоксально, тины представляют собой целое семей
нативные белки имеют только ство белков. Они, как правило, сходны по
одну или всего лишь аминокислотному составу, содержат
несколько конформаций м ного остатков цистина и имеют одина
ковое пространственное расположение
Поскольку в ковалентном остове поли- полипептидных цепей.
пептидной цепи все связи одинарные, Хотя волосы, перья, ногти и другие
можно было бы ожидать, что полипеп подобные им наружные образования
.ru
тид способен принимать в пространстве можно было бы считать, исходя из их ме-
бесконечное число конформаций. Более
того, естественно было бы предполо
жить, что конформация полипептида
претерпевает постоянные изменения
вследствие теплового движения и беспо
ib
рядочного вращения участков цепи во
круг каждой из одинарных связей кова
лентного остова. П оэтому может пока
заться парадоксальным тот факт, что
r-l
полипептидная цепь нативного белка
в нормальных биологических условиях-
при обычной температуре и нейтральных
значениях p H -и м е е т только одну или
e
очень небольшое число конформаций.
Э та нативная конформация достаточно
устойчива: если выделение белка вести
sh
.ru
чехол, называемый кутикулой. Ногти нию. Он показал, что пучок рентгенов
и перья, а также чешуя пресмыкающихся ских лучей, направленный на волос или
развиваю тся аналогичным образом, хотя ш ерстяную нитку, в состав которых вхо
они и представляю т намного более дит в основном а-кератин, дает характер
сложные структуры (рис. 7-3). ную дифракционную картину. Н а основе
а-Кератин, особенно та его форма, ко анализа этой картины Астбери заключил,
ib
торая встречается в составе волос и ш ер что волос и ш ерсть обладаю т периодич
сти, сыграл очень важную роль в разви ностью, т. е. содержат повторяющиеся
тии наших представлений о структуре структурные единицы длиной около
белков. Полипептидные цепи ос-кератина 0,54 нм, расположенные вдоль оси воло
r-l
образую т длинные регулярно скру са. Его наблюдения привели в дальней
ченные волокна, структуру которых м ож шем к предположению о том, что поли
но исследовать м етодом рентгенострук пептидные цепи в белках этого семейства
турного анализа; поэтому изучение а-ке- не вытянуты полностью, а скручены или
e
ратина и стало важнейшим этапом свернуты каким-то регулярным образом.
в создании наших сегодняшних предста К роме того, Астбери обнаружил, что
влений о значительно более сложных фиброин (белок из которого состоят нити
sh
повторяющиеся структурные
единицы шерсти под горячим паром, характери
зуется периодичностью, близкой
Ч тобы определить расстояния между
ak
.ru
связи враще группы и атом водорода— N H -группы
ние невоз- с
можно ' находятся относительно пептидной связи
в транс-положении (рис. 7-4). Исходя из
всех этих исследований, они заключили,
Рис. 7-4. П лоская пептидная группа. что С — N -связи, составляющ ие одну
С — N -связь частично имеет характер двойной треть всех связей полипептидного осто
ib
связи и поэтому вокруг нее свободное вращение ва, не допускаю т свободного вращения
невозможно. О братите внимание, что атом ы
и имеют частично характер двойных свя
кислорода и водорода леж ат в этой плоскости
по разные стороны от С — N -связи. Это зей. Таким образом, остов полипептид
соответствует транс-конф игурации пептидной ной цепи можно представить в виде ряда
r-l
связи. жестких плоскостей, разделенных зам е
ков был сделан в 40-х и начале 50-х годов щенными метиленовыми группами
Лайнусом П олингом и Робертом Кори (— C H R —), как показано на рис. 7.5. Те
(США). Они получили дифракционные перь нам ясно, что жесткие пептидные
e
картины кристаллов аминокислот и про связи накладываю т некоторые ограниче
стых ди- и трипептидов. Н а основе этих ния на число возможных простран
рентгенограмм им удалось установить ственных конформаций полипептидной
sh
цепи.
Рис. 7-5. Ограничения, налагаемые на вращ ение
7.6. В а-кератине
вокруг одинарных связей полипептидной цепи.
С — N -связи, входящ ие в состав плоских полипептидные цепи имеют
пептидных групп (показанных на красном фоне) форму ос-спирали
и составляю щ ие третью часть всех связей
u
N-конец С-конец
.ru
ральная структура, которую Полинг родных связей участвует каждая пептид
и Кори назвали ос-спиралью. В этой струк ная группа. Таким образом, каждый по
туре полипептидный остов образует следующий виток а-спирали связан
плотные витки вокруг длинной оси м оле с предшествующим несколькими водо
кулы, тогда как R-группы аминокис родными связями, что придает всей
лотных остатков выступают из спираль структуре значительную устойчивость.
ib
ного остова наружу. Периодически по Итак, мы видим, что а-спираль является
вторяю щ аяся единица соответствует устойчивой конформацией полипептид-
одному витку спирали, ш аг которой со
ставляет приблизительно 0,54 нм, что хо Рис. 7-6. Три модели ос-спирали, показывающ ие
r-l
различные особенности ее структуры.
рош о согласуется с периодичностью, на
Л. Ф ормирование правой а-спирали. Плоскости
блю даю щ ейся при рентгеноструктурном жестких пептидных групп параллельны длинной
исследовании кератина волос. оси спирали. О дна из водородных связей
В связи с этим возникает вопрос: за выделена красным цветом. Б. Модель
e
а-спирали из стержней и ш ариков, на которой
счет каких сил стабилизируется конфор
показаны внутрицепочечные водородные связи.
мация а-спирали? Почему из всех воз В. Шаг спирали соответствует периоду 0,54 нм
можных конформаций реализуется имен (3,6 аминокислотных остатков).
u sh
ak
Т
0,54 им
(3,6 остатка)
В
ГЛ. 7. Ф И Б Р И Л Л Я Р Н Ы Е БЕ Л К И 171
.ru
В ходе дальнейшей работы с использо цветом выделены жесткие пептидные группы.
ванием моделей было показано, что а- Ж есткая R -rpynna пролина показана на красном
фоне.
спираль может быть построена либо из
L-, либо из D -аминокислот, но все амино
кислоты должны представлять собой сте ложительный заряд; взаимное отталки
реоизомеры одного и того же типа, так вание этих остатков будет препятство
ib
как пептидная цепь, состоящ ая из смеси вать образованию а-спирали. Некоторые
остатков L- и D -аминокислот, не способ другие аминокислоты, например аспара
на образовать спираль. Далее, если ис гин, серии, треонин и лейцин, также м ег
пользовать только природные L-амино- ш аю т образованию а-спирали, если они
r-l
кислоты, то можно построить как пра расположены в цепи близко одна к дру
вую, так и левую спираль; для больш ин гой; в этом случае причиной служат
ства фибриллярных белков характерны больш ие размеры и ф орма их R-rpynn.
правые спирали. Еще одним препятствием, меш аю щ им
образованию а-спирали, является при
e
сутствие в полипептидной цепи одного
7.7. Некоторые
аминокислотные остатки или больш его числа остатков пролина.
sh
.ru
вляет собой а-спираль.
7.8. В ос-кератинах
содержится много аминокислот,
способствующих образованию
«-спиральной структуры
Протофибрилла
7.10. а-Кератины нерастворимы
в воде из-за преобладания
в их составе аминокислот
с неполярными R-группами
.ru
а-Кератины замечательны не только
своей физической прочностью, но и тем,
что они полностью нерастворимы в воде
при pH 7,0 и физиологической температу
ре. В этом отношении а-кератины состав
ib
ляю т разительный контраст с глобу
лярны ми белками, такими, как сыворо
точный альбумин, из которого благодаря
Микрофибрилла его хорошей растворимости в воде м ож
r-l
Структурная организация но приготовить 60%-ный раствор. Как
отдельного волоса Макрофибрилла можно объяснить такую разницу между
Кутикула двумя белками, построенными из одного
Клетка и того же набора 2 0 аминокислот?
Частично это обусловлено тем, что
e
в каждом из этих белков преобладаю т
разные типы аминокислот. а-Кератины
особенно богаты аминокислотами, со
sh
.ru
к категории нитевидных нерастворимых зом, что имеет уже не спиральную, а зиг
белков; хотя они более гибки, вместе загообразную структуру. В фиброине
с тем с трудом поддаю тся растяжению. зигзагообразные полипептидные цепи
Они отличаю тся от а-кератинов тем, что уложены параллельно друг другу в виде
имею т другую периодичность струк целого ряда складок; поэтому такая
туры, элементы которой повторяю тся че структура называется складчатым слоем
ib
рез каждые 0,70 нм. Еще одно различие (рис. 7-10). Д ля ß-конформации харак
между а- и ß-кератинами сыграло важ терно отсутствие внутрицепочечных во
ную роль в установлении структуры ß-ке- дородных связей. Вместо них образуются
ратинов. При обработке а-кератина во меж цепочечные водородные связи ме
r-l
лос паром его можно растянуть почти жду пептидными группами соседних по
вдвое по сравнению с исходной длиной. липептидных цепей, находящихся в вытя
В этом растянутом состоянии он дает нутой конформации. В образовании та
рентгенограммы, напоминающ ие рентге ких межцепочечных водородных связей
нограммы , характерные для фиброина участвуют все пептидные группы ß-ке-
e
шелка. О тсю да был сделан вывод, что ратина. R-группы аминокислот высту
при растяжении а-кератин волос утрачи паю т по обе стороны зигзагообразной
вает а-спиральную конформацию и его
sh
.ru
Так, в фиброине шелка и других ß-керати вливая цистин, который при этом превра
нах, например в белке паутины, наблю щается в два остатка ц и стеин а-по
дается очень высокое содержание гли одному в каждой цепи. Нагревание
цина и аланин а-ам и ноки слот с наимень увлажненных волос приводит к разруш е
шими по размеру R-группами. Примеча нию водородных связей, вследствие чего
тельно, что в фиброине шелка каждой а-спиральная структура полипептидных
ib
второй аминокислотой является глицин.
Рис. 7-11. П оследовательные стадии
перманентной завивки волос. А. В прям ом
7.12. Перманентная завивка волосе а-спиральные витки кератина выстроены
волос-пример в одну прямую линию и стабилизированы
r-l
поперечными дисульфидными связями. Б. Для
биохимической технологии того чтобы сделать волосы вьющимися,
поперечные связи разруш аю т
Мы уже знаем, что а-кератины при на восстанавливаю щ им агентом, под действием
гревании в увлажненном состоянии м о которого дисульфидные связи цистина
гут растягиваться и принимать ß-кон- превращ аю тся в тиоловы е группы остатков
e
цистеина, расположенных в двух соседних цепях.
формацию, но при остывании они сам о В. Волосы механически изгибаю т, накручивая
произвольно возвращ аю тся в а-спираль- их на специальные трубочки. П ри изгибании
ную конформацию. Это происходит
sh
А Б
176 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
однако теперь волосы образую т вью щ ие значительно больш е белка и меньше
ся пряди желаемой формы, стабилизиро углевода. П ротеогликаны выполняют
ванные новыми дисульфидными попе функцию основного вещества, в которое
речными связями, которые обеспечивают погружены или которым покрыты волок
дополнительное скручивание или изгиба нистые элементы соединительной ткани.
ние пучков а-спиралей в соответствии Протеогликаны играю т также роль
ib
с формой прядей. межгканевых прослоек и служат сма
зочным м атериалом в суставах.
7.13. Коллаген и эластин Коллаген, эластин и протеогликаны
главные фибриллярные белки синтезируются в фибробластах и хондро-
r-l
соединительных тканей цитах - специализированных клетках
соединительной ткани. Затем эти белки
Соединительная ткань состоит из меж выталкиваю тся из клеток и приобретают
клеточных элементов, выполняющих структурную организацию, свойствен
структурные и опорные функции; на ее ную различным элементам соединитель
e
долю приходится значительная часть ной ткани.
всего органического вещества, содержа
щегося в теле высших животных. Сухо 7.14. Коллаген самый
sh
ство между клетками так называемым часть всего белка составляет коллаген.
основным веществом. Существуют три Тело коровы, весящей 400 кг, скрепляется
главных молекулярных компонента сое и поддерживается в основном системой
динительной ткани: два фибриллярных прочных коллагеновых волокон, находя
белка -ко лла ген и эластин, которые щихся в коже, сухожилиях, хрящах и ко
в разных соотношениях присутствуют стях животного.
в больш инстве соединительных тканей, К оллагеновая соединительная ткань
и протеогликаны семейство гибридных состоит из волокон, которые в свою оче
молекул, представляющ их собой белки, редь состоят из коллагеновых фибрилл,
ковалентно связанные с полисахаридами. характеризующихся поперечно-исчерчен
Фибриллы коллагена не растягиваю т ной структурой (рис. 7-12). Эти фи
ся, тогда как для фибрилл эластина ха бриллы организованы различным обра
рактерна высокая степень растяжимости. зом в зависимости от биологической
Сухожилия, при помощ и которых м ы функции соединительной ткани. В сухо-
ГЛ. 7. Ф И Б Р И Л Л Я Р Н Ы Е Б Е Л К И 177
.ru
лаген превращ ается в ж елат ину-ра-
створимую смесь полипептидов, кото
рую в кулинарии используют для приго
товления желе. В ходе этого превращения
происходит гидролиз некоторых кова
лентных связей ко л л а ген а-о д н а из
ib
I------------ 1
главных причин, по которой мясо прихо
0,5 мкм дится подвергать тепловой обработке,
так как именно коллаген соединительной
Рис. 7-12. Электронная микрофотография
r-l
коллагеновых фибрилл соединительной ткани.
ткани и кровеносных сосудов делает м я
Обратите внимание на периодичность со жестким. Имеющиеся в продаже спе
поперечных полос в фибриллах. В коллагенах циальные препараты для размягчения
многих тканей эти полосы повторяю тся мяса содержат смесь растительных фер
примерно через каждые 64 нм. ментов, способных гидролизовать неко
e
жилиях фибриллы коллагена располо торы е пептидные связи коллагена, в ре
жены в виде поперечно-связанных парал зультате чего он превращ ается в раство
лельных пучков, обладающ их очень римые, легко усваиваемые полипептиды.
sh
ОН
н — С-------- -СН 2 NH 2
5
5 СН 2 "сн — СО О Н H 2 N C H 2 CH CH 2 CH2CHCOOH
6 1 .4 3 2 1
I ОН
Н
4 -гидроксипролин 5-гидроксиличин
Рис. 7-13. Д ве нестандартные аминокислоты,
«голова к хвосту» (рис. 7-14). Головки па
присутствующ ие в коллагене. Они образую тся
из стандартны х ам инокислот - пролина раллельно расположенных молекул тро-
и л и зи н а-п у тем их гидроксилирования поколлагена сдвинуты относительно
.ru
(введенные гидроксильные группы выделены друг друга ступенчатым образом на одно
красным цветом). и го же расстояние в продольном напра
присутствовать в пище больш инства жи влении. Этим объясняется характерная
вотных. для коллагеновых волокон поперечная
Напомним, что пролин и гидроксипро- исчерченность, которой соответствует
лин образую т изгибы в полипептидных период 64 нм.
ib
цепях, и потому их присутствие в белках Коллагеновые волокна даю т рентгено
несовместимо с существованием а-спи грамму, отличающуюся от рентгено
ральной структуры. грамм а- и ß-кератинов. Н а основе
данных рентгеноструктурного анализа
r-l
7.16. Полипептиды в коллагене был сделан вывод, что тропоколлаге
представляют собой новые субъединицы состоят из трех по
трехцепочечные спиральные липептидных цепей, плотно скрученных
структуры в виде трехжильного каната.
e
Тропоколлаген представляет собой па
Фибриллы коллагена состоят из повто лочкообразную молекулу длиной 300 нм
ряющихся полипептидных субъединиц, и толщиной всего лиш ь 1,5 нм. Его м оле
sh
Г оловки молекул
64 Поперечные полосы
тропоколлагена нм
J J
— — *— — '— •—
ak
.ru
цепь тропоколлагена тоже представляет и понижаю т прозрачность роговицы гла
собой спираль, хотя ее периодичность за.
и размеры весьма отличаю тся от со Коллагеновая спираль уникальна, так
ответствующих параметров а-спирали. как не встречается ни в каких других бел
Полипептидная цепь тропоколлагена ках, кроме коллагена, в отличие от а-спи
образует левую спираль, на один виток рали и ß-конформации, которые хотя бы
ib
которой приходится только три амино в виде небольших участков обнаружи
кислотных остатка. Поскольку в колла ваю тся во многих глобулярных белках.
гене присутствует м ного остатков про
лина и гидроксипролина, что придает 7.17. Структура эластина
r-l
цепи жесткую изогнутую конформацию, придает особые свойства
три спиральные полипептидные цепи эластической ткани
плотно обвиты одна вокруг другой. Они
соединены между собой также попе К основным типам соединительной
речными водородными связями. К ром е ткани, богатой эластином, но содержа
e
того, в коллагене обнаружены кова щей также небольш ое количество колла
лентные связи необычного типа, обра гена, относятся желтая эластическая
зующиеся между двумя остатками ли ткань связок и эластический слой соеди
sh
/ ■i N
Н— N Н N—Н
I /
ХС Н — СН 2— СНг— СН 2— СН 2 — N — СН 2— СН 2— СН 2— СН2— СН
/ чс=о
О=С
N /
Полипептидная Остаток лизина Остаток лизина Полипептидная
цепь (минус е -аминогруппа). цепь
180 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
аминокислоты, обнаруженной только
А. Сегмент молекулы тропоэластина. Б. Точная
в эластине. Ее центральная циклическая
структура эластина не установлена. Известно,
структура образуется путем взаимодействия
однако, что молекулы тропоэластина соединены
R-групп (выделены красным цветом) четырех поперечными связями и образую т единую
остатков лизина, что приводит к возникновению
двумерную или трехмерную сеть, обладаю щ ую
поперечных связей между полипептидными
высокой степенью эластичности. П ом имо
цепями эластина (см. рис. 7-17). остатков десмозина (выделенных цветом),
ib
связываю щ их между собой две, три или четыре
около 800 аминокислотных остатков. молекулы тропоэластина, как показано на
П одобно коллагену, эластин богат гли рисунке, в эластине имеются и другие виды
поперечных связей (тоже выделенных красным
цином и аланином. Тропоэластин отли цветом).
r-l
Остаток
десмозина
Л Б
ГЛ. 7. фибриллярны е белки 181
.ru
обратимо растягиваться во всех направ определенной последовательности ами
лениях (рис. 7-17). нокислотных остатков в фибриллярных
белках. Изучение вторичной структуры
7.18. Что говорят нам фибриллярных белков стало важной ве
фибриллярные белки хой на пути к пониманию значительно
о структуре белков? более сложной трехмерной структуры
ib
глобулярных белков. Как м ы увидим
Исследование фибриллярных белков, в следующей главе, сегменты а-спиралей
о которых ш ла речь в этой главе, позво и ß-структуры часто обнаруживаю тся и
ляет сделать три главных вывода, касаю в глобулярных белках.
r-l
щиеся структуры белков. Прежде всего,
мы видим, что белки обладаю т не только Таблица 7-1. Вторичная структура и свойства
первичной структурой, т.е. ковалентным фибриллярных белков
остовом, но и характерной вторичной
Характеристики Примеры
e
структурой, которая определяется про Структура
странственным расположением последо а-С пираль с П рочные не Волосы,
вательных аминокислотных остатков, поперечными растворимы е перья,
sh
ция нити
полипептид имеет определенный амино Сухожи
Тройная кол Выдерживает
кислотный состав и определенную ам и лагеновая высокую на лия,
ak
.ru
процессах сокращения. Две а-спиральные
М и о зи н -эт о очень длинная палочко полипептидные цепи,
закрученные одна
видная молекула с хвостом, состоящ им вокруг другой
из двух навитых друг на друга а-спи-
ральных полипептидов; она имеет также
сложную по своему строению «головку»,
ib
обладаю щ ую ферментативной актив
ностью (рис. 7-18). О бщ ая молекулярная
масса миозина составляет 450000, м оле
кула имеет в длину около 160 нм и содер
r-l
жит шесть полипептидных цепей.
Длинный хвост состоит из двух цепей, ка Шарнирная область
ждая с молекулярной массой 2 0 0 0 0 0 ; это
тяж елые цепи, в которых находятся гиб Тяж елые цепи
e
кие шарнирные участки. Головка имеет
глобулярную форму и содержит концы
тяжелых цепей, а также четыре легкие це
sh
С-актина
кулы миозина, регулярно уложенные
в виде пучка, образую т толстое нити
ak
.ru
наличии в системе АТР. этом ш аг спирали составляет 0,54 нм. Все
Еще одна система длинных ните пептидные группы участвуют в образова
видных белков имеется в микротрубоч нии внутрицепочечных водородных свя
ках, о которых речь ш ла выше (разд. 2.14 зей, стабилизирующ их а-спираль. Д еста
и 2.15). М икротрубочки - это длинные по билизирующее действие на а-спираль
лые трубки, каждая из которых построе оказываю т расположенные по соседству
ib
на из 13 белковых нитей, уложенных па R-группы, несущие электрический заряд
раллельно друг другу вокруг централь одного и того же знака или имеющие
ной полости. К аждая нить состоит из больш ие размеры, а также остатки про-
чередующихся молекул двух глобу лина, которые изгибаю т цепь и искажают
r-l
лярных белков а-тубулина и ß-тубули- а-спираль. Волосы представляют собой
на. Микротрубочки входят в состав ре скрученные наподобие каната много
сничек и жгутиков эукариот; их взаимное жильные структуры, образованные а-
скольжение или скручивание относитель сииральными полипептидными цепями,
e
но друг друга сообщ ает ресничкам и жгу обвитыми одна вокруг другой в виде су
тикам характерное винтообразное, вра перспирали. В а-кератинах имеется
щательное или волнообразное движение, много поперечных связей, в образова
sh
.ru
связанных остатками десмозина. Он об относительно прочности этой связи и ее
ладает больш ой упругостью. М иозин, ак кратности (т. е. является ли она одинар
тин и тубулин представляю т собой ной, двойной или тройной)?
примеры внутриклеточных нитевидных б) П родолжив ответ на предыдущий во
белков, участвующих в зависимых от прос, объясните, почему такая
энергии АТР процессах мышечного со С — N -связь занимает по своей длине
ib
промежуточное положение между
кращения и перемещения клеток.
двойными и одинарными связями.
Л И Т Е РА Т У РА в) Ч то мож но сказать на основе данных
П олинга и К ори о возможности вращ е
Книги ния вокруг пептидной С — N -связи?
r-l
См. также библиографию к главам 6 и 8 2. Ранние данные о структуре шерсти. Уиль
Cantor C. R., Schimmel Р. R., Biophysical ям Астбери первым заметил, что рентге
Chemistry, p. I. The Conform ation of н ограм м а шерсти указывает на присут
Biological M acromolecules, Freem an, San ствие структурной единицы, повторяю
щейся вдоль волокна с интервалом около
e
Francisco, 1980.
Dickerson R. £., Geis I. P ro tein s: Structure, 0,54 нм. П осле растяжения шерсти, под
Function, and Evolution, Benjamin / C um m i вергнутой действию пара, на рентгено
грам м е появлялись признаки изменения
sh
August (1969).
ходя из современных данных о структуре
Gross J. Collagen, Sei. Am., 204, 120-130, May
шерсти, объясните эти наблюдения.
(1961).
3. Скорость синтеза <х-кератина волос. По
Вопросы и задачи нашим меркам вблос растет относительно
м е д л ен н о -с о скоростью 15-20 см в год.
1. Свойства пептидной связи. П ри рентгено Зона роста находится у основания волоса,
структурном исследовании кристалличе где в клетках эпидермиса синтезируются
ских пептидов Лайнус П олинг и Роберт а-кератиновые нити, скручивающиеся за
К ори обнаружили, что С— N -связь пеп тем наподобие канатов (см. рис. 7-9). Ос
тидной группы по длине (0,132 нм) зани новным структурным элементом
мает промежуточное положение между а-кератина является а-спираль, шаг кото
типичными одинарны ми С — N -связями рой составляет 0,54 нм, а на виток прихо
(0,149 нм) и двойны ми С = М -связям и дится 3,6 аминокислотных остатков (см.
(0,127 нм). К ром е того, они установили, рис. 7-6). В предположении, что фактором,
что пептидная группа имеет плоскую кон лимитирую щ им рост волос, служит био
фигурацию, т. е. все четыре атом а, присое синтез а-спиральных цепей кератина, рас
ГЛ. 7. Ф И Б Р И Л Л Я Р Н Ы Е Б Е Л К И 185
считайте скорость образования пеп лах целого ряда природных белков содер
тидных связей в цепях а-кератина (число жится больш ое число остатков цистина.
пептидных связей в 1 с), которая м огла бы При этом наблю дается корреляция между
обеспечить наблю даемое удлинение волос механическими свойствами белков (проч
за 1 год. ностью на разрыв, вязкостью , твердостью
4. Влияние pH на конформацию полиглута- и т.д.) и содержанием цистина. Н апример,
миновой кислоты и полилизина. Разверты глутенин (богатый цистином белок пше
вание полипептидной цепи, имеющей ницы) определяет вязкость и эластичность
а-спиральную конформацию, с образова теста, приготовленного из пшеничной му
нием беспорядочного клубка сопровож ки. Точно так же твердый и прочный
дается резким понижением удельного панцирь черепахи обязан этими свойства
оптического вращения. П олиглутамино- ми высокому содержанию цистина в а-
вая кислота-полипептид, состоящий кератине, из которого он состоит.
только из остатков глутаминовой кис К акова молекулярная основа наблю дае
.ru
л о т ы -п р и pH 3 имеет а-спиральную кон мой корреляции между содержанием
формацию. Однако при повышении pH до цистина и механическими свойствами
7величина удельного оптического вращ е белка?
ния раствора сильно понижается. Анало 6 . П очем у шерсть садится? Если шерстяной
гичная картина наблю дается в случае по свитер или шерстяные носки постирать
лилизина, который при pH 10 имеет в горячей воде, а затем высушить в элек
а-спиралькую конформацию, но при по тросушилке, они становятся меньше. И с
ib
нижении pH до 7 его удельное оптическое ходя из того, что известно о структуре а-
вращение сильно уменьшается, как пока кератина, как объяснить это явление?
зано на графике. Вместе с тем шелк при тех же условиях
не дает такой усадки. Объясните,
r-l
почему.
О „ П оли-Ь-глутам и- 7. Устойчивость цистин-содержащих белков
g -Спираль новая кислота
к нагреванию. Больш инство глобулярных
белков при кратковременном нагревании
-20
до 65°С денатурирует (претерпевает про
e
цесс разворачивания цепей) с полной поте
а-С пираль рей активности. О днако те глобулярные
-4 0 белки, в которых содержится много остат
sh
Окисление р а л ь н ы х се гм ен то в , п р о н и зы в а ю щ и х м е м
б р а н у б а к те р и а л ь н о й к л етки то л щ и н о й
4 ,5 н м . Р а с с ч и т а й т е м и н и м а л ь н о е ч и с л о
а м и н о к и с л о т, к о то р о е д о л ж н о со д е р ж а ть
- S — И + И — S — • — S — S — ся в о д н о м се гм е н те а -сп и р а л и , ч то б ы он
м о г п о л н о с т ь ю п р о н и зы в а ть м е м б р а н у .
О ц е н и те , какая д о л я а м и н о к и с л о тн ы х
Ч_______________________ J о ста тк о в б а к те р и о р о д о п си н а уча ствует
В о е .с.т ш ю ш н 'п п е в о б р а зо в а н и и а -сп и р а л ь н ы х се гм е н то в
(сред н яя м о л е к у л я р н а я м а сса о д н о го а м и
н о к и с л о т н о г о о с т а т к а р а в н а 110). П р и в е
а) О д и н и з с т а н д а р т н ы х с п о с о б о в р а з р ы
д и те о б о сн о в а н и е в а ш и х расчетов.
ва д и су л ь ф и д н ы х м о с т и к о в со сто и т
1 1 . Биосинтез коллагена. К о л л а г е н , к о л и ч е
в о б р а б о тк е б ел к а и з б ы т к о м 2 -м е р к ап -
ств е н н о п р е о б л а д а ю щ и й н а д в се м и д р у ги
го эта н о л а ( H S C H 2C H 2O H ). О б ъ я сн и т е ,
.ru
м и б е л к а м и в о р га н и з м е м л е к о п и та ю щ и х ,
н а ч е м о сн о в а н э т о т сп о со б .
и м е е т н е о б ы ч н ы й а м и н о к и с л о тн ы й с о
б) О д и н из н е д о ста тк о в у к а за н н о го сп о со
став. В о тл и ч и е о т б о л ь ш и н ств а д р у ги х
б а за к л ю ч а е тся в т о м , ч то п о сл е р а з р ы
б е л к о в о н о чен ь б о га т п р о л и н о м и ги д р о к-
ва п о п е р е ч н ы х ц и с ти н о в ы х свя зей о н и
с и п р о л и н о м (с м . р и с . 7-13). П о с к о л ь к у ги -
м о г у т о б р а зо в а ть с я вн о вь. П о ч е м у это
д р о к с и п р о л и н не в х о д и т в ч и сл о 20 а м и н о
п р о и сх о д и т?
к и сл о т, о б ы ч н о п р и су тств у ю щ и х в бел ках,
ib
9 . Периодичность расположения ß - t \ю ев
его в к л ю ч е н и е в к о л л аге н м о ж е т и д ти д в у
в нитях шелка. Х и м и ч е с к о е и с с л е д о в а н и е
м я п у т я м и : 1) п у т е м ф е р м е н т а т и в н о г о г и -
п р о д у к та , п о л у ч е н н о го в р е зул ьта те ч а
д р о к с и л и р о в а н и я п р о л и н а в ги д р о к си п р о -
сти ч н о го ги д р о л и за ф и б р о и н а ш ел к а , в ы
л и н п еред его в к л ю ч е н и е м в к ол л аген
р а б а ты в а е м о го гу се н и ц а м и ш е л к о п р я д а
r-l
и 2) п у т е м г и д р о к с и л и р о в а н и я п р о л и н а ,
Bombyx mori, п о к а з а л о , ч т о в п о л и п е п т и д -
у ж е в к л ю ч е н н о го в со ста в к ол л аген а. Д л я
н о й ц е п и это го б ел к а м н о г о р а з п о в т о
то го ч то б ы сд е л а ть в ы б о р м е ж д у э ти м и
р я е тся се гм е н т из ш е сти о ста тк о в
д в у м я в о зм о ж н о стя м и , б ы л и в ы п о л н е н ы
(— G ly— Ser— Gly - Ala— G ly - - Ala— )„. сл е д у ю щ и е эк сп е р и м е н ты . С н а ч а л а в о р
e
га н и зм к р ы сы с п и щ е й в в о д и л и
В м е с т е о .т е м и з д а н н ы х р е н т г е н о с т р у к т у р - 14С - п р о л и н и и з х в о с т а в ы д е л я л и к о л л а
н о го а н а л и за сл ед ует, ч то о сн о в н а я стр у к ген. П р и э т о м о ка за л о сь, ч то н о в о си н тези -
ту р н а я ед и н и ц а п о в то р я е тся в ф и б р о и н е
sh
р о в а н н ы й к о л л аге н р а д и о а к ти в ен . З а те м
с и н т е р в а л о м 0 ,7 0 н м (см . те к с т). О д н а к о
то ч н о та к ж е в в о д и л и 14С -ги д р о к с и -
п р и э т о м б ы л и в ы я в л е н ы е щ е д ве п о в т о
п р о л и н , н о в э т о м сл уч ае в н о в о си н те зи р о -
р я ю щ и е ся е д и н и ц ы с п е р и о д а м и 0 ,3 5
в а н н о м к о л л а ге н е р а д и о а к ти в н о сти не
и 0 ,5 7 н м , с о о т в е т с т в у ю щ и е р а с с т о я н и я м
б ы л о о б н а р у ж е н о . К а к н а о сн о в е эти х
м е ж д у ß -сл о я м и . П р е д л о ж и т е сх е м у р а с
э к с п е р и м е н то в сд е л а ть в ы б о р м е ж д у д в у
п о л о ж е н и я у к а за н н ы х се гм е н то в из ш е сти
u
м я р а с с м а т р и в а е м ы м и в о з м о ж н о с т я м и ?
о ста тко в , из к о т о р о й б ы сл е д о в а л и эти
1 2 . Патогенное действие бактерий, вызываю
р а ссто я н и я м е ж д у ß -сл о я м и в ф и б р о и н е
ш ел ка.
щих газовую гангрену. П а т о г е н н ы е а н а э
ak
р о б н ы е б а к т е р и и Clostridium perfringens,
1 0 . Бактериородопсчн белок пурпурной м ем
я в л я ю щ и е ся в о зб у д и те л я м и га зо в о й га н
браны. П р и б л а г о п р и я т н ы х в н е ш н и х у с л о
гр е н ы , п р и к о то р о й п р о и сх о д и т р а зр у ш е
в и я х б а к т е р и я H ulobacterium halobium, р а с
н и е ткан ей , в ы д е л я ю т ф ер м е н т, эф ф ек ти в
ту щ а я в среде, со д е р ж а щ е й в ы со к и е
но к а т а л и з и р у ю щ и й ги д р о л и з п е п ти д н о й
к о н ц е н тр а ц и и со л ей , си н те зи р у е т м е м
св я зи (к р а сн ы й цвет) в и зо б р а ж е н н о й н и ж е
б р а н н ы й б е л о к (м о л , м а с с а 2 6 000), и з
п о с л е д о в а те л ь н о с ти :
в е стн ы й п о д н а зв а н и е м б а к те р и о р о д о п -
син. М о л е к у л ы э то го бел ка, и м е ю щ е го И,О
X — G ly P ro Y ------ - ----- *
п у р п у р н ы й цвет, о б у сл о в л е н н ы й п р и с у т ф ер м .
ств и е м в н и х р е ти н ал я, о б р а з у ю т в к л е то ч +
н о й м е м б р а н е а гр е га ты в ви д е п у р п у р н ы х ... X — С О ; + H 3N — G ly — P ro — Y —
« зап л ато к» . Б а к те р и о р о д о п с и н д е й ств у е т
к ак а к ти в и р у е м ы й св е то м п р о т о н н ы й н а i.ic X и Y л ю б а я из 20 а м и н о к и с л о т. К а
со с и та к и м о б р а з о м сн а б ж а е т к л етки к и м о б р а з о м это т се к р е ти р у е м ы й ф е р м е н т
эн ерги ей . Б ы л о п о к а за н о , ч то э то т б ел ок п о м о га е т б а к те р и и п р о н и к а ть в тк а н и че
с о сто и т из се м и п а р а л л е л ь н ы х « -сп и л о в ек а ? П о ч е м у это т ф е р м е н т не п р и н о
си т вреда са м о й б а к те р и и ?
ГЛ А В А 8
Г Л О Б У Л Я Р Н Ы Е БЕЛКИ : С Т Р У К Т У Р А
.ru
И ФУНКЦИЯ ГЕМ ОГЛОБИНА
В глобулярных белках полипептидная 8.1. Полипептидные цепи
цепь свернута в компактную глобулу. глобулярных белков свернуты
Белки этого класса, значительно более в плотную компактную
сложные по конформации, чем фибрил структуру
ib
лярные белки, способны выполнять
самые разнообразные биологические Существуют две группы данных, ко
функции, причем их активность носит не торые с очевидностью свидетельствуют
статический, а динамический характер. о том, что полипептидные цепи глобу
r-l
К глобулярным белкам относятся почта лярных белков плотно свернуты и что та
все из 2 0 0 0 или даже больш его числа из кая конформация важна для выполнения
вестных ферментов. Некоторые глобу Этими белками их биологических функ
лярные белки выполняю т транспортные ций. Первая группа данных касается де
e
функции: вместе с током крови они пере натурации нативных глобулярных бел
носят кислород, питательные вещества ков, происходящей при их нагревании,
и неорганические ионы; к тгому же клас воздействии экстремальными значения
sh
ную структуру. Мы увидим также, что рованный глобулярный белок, как прави
нативная свернут ая конформация глобу ло, становится нерастворимым в водных
лярных белков служит необходимой системах при pH около 7 и обычно утра
предпосылкой их биологической актив чивает свою биологическую активность.
ности. Далее мы рассмотрим химические Вторым доказательством свернутой
и биологические свойства содержащегося конформации глобулярных белков слу
в эритроцитах белка гемоглобина, ко жит сравнение длины их полипептидных
торый играет роль переносчика кислоро цепей с реальными размерами, их моле
да. и в связи с этим коснемся некоторых кул, рассчитанными по результатам фи
медицинских вопросов. На примере ге зико-химических измерений. Например,
моглобина мы проиллюстрируем, каким сывороточный альбумин (мол. масса
образом трехмерная структура глобу 64 500) имеет одну полипептидную цепь,
лярных белков приспособлена к выпол состоящ ую из 584 аминокислотных-
нению их важных биологических функ остатков. Если бы эта цепь находилась
ций. в полностью вытянутой ß-конформации,
188 Ч А С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
тидных цепей глобулярных белков в ком
пактную сферическую глобулу мы будем
называть третичной структурой.
Возникает ряд очевидных вопросов.
Как можно установить способ свертыва
ния цепей в глобулярных белках? О ди
ib
накова ли укладка полипептидных цепей
во всех глобулярных белках? Какие силы
удерживают цепь в свернутой конформа
ции?
О
r-l
8.2. Рентгеноструктурный
584 о с та т к а в Бычий сы воро
анализ миоглобина-
а-спиральной точный ал ьб у выдающееся достижение
форме
e
мин в нативной в исследовании белков
90 х 1,1 нм глобулярной
ф ерме О твет на поставленные выше вопросы
13 х 3 нм
дал один из самых эффективных м ето
sh
д о в -м е т о д рентгеноструктурного анали
за, при помощ и которого, как мы уже ви
дели, удалось установить структуру ряда
фибриллярных белков. Однако рентгено
структурный анализ глобулярных белков
u
.ru
(рис. 8 -2 ), содержащийся также в гем о в боковой проекции внизу справа. В миоглобине
и гемоглобине за эту свободную связь пом им о
гл об и н е- кислород-связывающ ем белке молекулы 0 2 мож ет конкурировать м олекула
эритроцитов. Присутствием гемогруппы окиси углерода (СО), которая образует с атом ом
объясняется густой красно-коричневый железа в 2 0 0 раз более прочную связь, чем 0 2.
цвет, характерный для миоглобина и ге При отравлении угарным газом (окисью
углерода) значительная часть гемоглобина
моглобина. М иоглобина особенно много
ib
переходит в ф орму карбоксигемоглобина, что
в мышцах морских млекопитающих - ки- препятствует переносу 0 2 из легких в ткани.
и -»\
N 1:
n — F e - ~ O z
С / !
/ С “ i
О ста то к П л о ск о сть
ги сти д и н а м ол екулы
порф и рина
190 ЧА СТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
та, тюленя и дельфина: высокое содержа чем она есть на самом деле. Н а рисунке
ние миоглобина придает их мы ш цам ко изображена также плоская гемогруппа,
ричневый цвет. М иоглобин позволяет плотно прилегаю щ ая к полипептидной
этим животным запасать в мышцах необ цепи, хотя и не связанная с ней ковалент
ходимое количество кислорода при по но. Н а втором этапе рентгенострук
гружении на длительное время в воду. турный анализ миоглобина был выпол
Рентгенограммы, которы е Кендрью нен при разрешении 0 , 2 нм, достаточно
использовал для исследования струк высоком, чтобы идентифицировать боль
туры миоглобина из мыш ц каш алота шинство R -групп. Н а третьем этапе была
(рис. 8.3), носили очень сложный харак проведена идентификация всех амино
тер и содержали почти 25 ООО рефлексов. кислотных остатков при разрешении
Расчеты, связанные с анализом интенсив 0.14.нм. Полученная аминокислотная по
ностей всех этих дифрагированных рент следовательность довольно хорошо со
.ru
геновских лучей, проводили последова ответствовала данным химического ана
тельными этапами. Н а первом этапе, лиза.
завершенном в 1957 г., трехмерная струк Н а рис. 8-4 показана детальная, с уче
тура миоглобина была рассчитана с раз том каждого остатка, вторичная струк
решением 0,6 нм. При такой степени раз тура полипептидного остова миогло
решения, еще не достаточной для опреде бина, изображенного внутри общего
ib
ления точных положений индиви контура молекулы, свернутой наподобие
дуальных атомов, удалось выяснить, как колбасы, а также его третичная струк
свернута полипептидная цепь в молекуле тура, т. е. укладка всей цепи в трех изме
миоглобина. О казалось, что она уложена рениях. Остов молекулы миоглобина по
r-l
довольно причудливым и нерегулярным строен из восьми относительно прямоли
образом, так что очертания третичной нейных сегментов, чередующихся с изог
структуры миоглобина напоминаю т нутыми участками полипептидной цепи.
свернутую колбасу (рис. 8-4). Поскольку Каждый прямолинейный сегм ен т-это
e
R-групп на рисунке нет, структура м оле отрезок а-спирали, причем самый
кулы выглядит намного более рыхлой, длинный из них содержит 23 аминокис
лотных остатка, а самый коротки й -все
sh
.ru
С-конец
ib
r-l
©
IR.UIM3
N -конец Ge-'S
Рис. 8-4. Третичная структура миоглобина
e
каш алота, установленная методом Таблица 8-1. К л а с с и ф и к а ц и я а м и н о к и с л о т
рентгеноструктурного анализа. П оказана в со о тв е тств и и с их п о л я р н о с т ь ю и р а сп о л о
структура остова молекулы, полученная при ж е н и е м в м о л е к у л а х гл о б у л я р н ы х б ел к о в
sh
стоянии. В ы с о к о ги д р о ф о б н ы е а м и н о к и с л о ты , р а сп о
л о ж е н н ы е в о с н о в н о м в н у тр и м о л е к у л гл о б у
3. Больш ая часть гидрофобных R-rpynn
л я р н ы х б ел к о в
расположена внутри молекулы м ио
Ф е н и л а л а н и н М е т и о н и н
глобина и таким образом защищена
Л е й ц и н В а л и н
от соприкосновения с водой (см. И зо л е й ц и н Т р и п т о ф а н
табл. 8 - 1 , в которой перечислены ам и
нокислоты с наиболее гидрофобными А м и н о к и с л о т ы , з а н и м а ю щ и е п о сте п е н и п о
л я р н о сти п р о м е ж у т о ч н о е п о л о ж е н и е ; о н и
и наиболее гидрофильными R-группа
м о г у т н а х о д и ть ся как в н у тр и , т а к и н а п о
ми, а также аминокислоты с R-группа в е р х н о сти гл о б у л я р н ы х б ел к о в
ми, занимаю щ ими по своим свой
П р о л и н А л а н и н
ствам промежуточное положение). Т р е о н и н Г л и ц и н
4. Каждый из четырех остатков пролина С е р и н Т и р о з и н
в молекуле миоглобина находится Ц и сте и н
в месте изгиба полипептидной цепи
192 ЧА СТЬ 1. БИ О М О Л Е К У Л Ы
.ru
(кармане) вблизи поверхности м оле
кулы. Атом железа, находящийся М ожет быть, и все другие глобулярные
в центре гемогруппы, имеет две коор белки свернуты точно так же, как мио-
динационные связи, направленные глобин ? Н а этот вопрос ответ уже полу
перпендикулярно плоскости гема. О д чен, так как м етодом рентгеноструктур
на из них связана с R -группой остатка ного анализа установлена третичная
ib
гистидина 93, а другая служит для структура целого ряда других, неболь
связывания молекулы О 2. ших по размеру белков, состоящих из
одной полипептидной цепи. Особенно
8.3. Мио) лобииы, выделенные интересны результаты, полученные при
r-l
nt разных видов, имеют изучении митохондриального белка ци
е \о ш у т конформацию тохрома с, который служит переносчи
ком электронов. Аминокислотная после
М ы уже видели, что в гомологичных довательность цитохрома с была опреде
белках из разных видов, например в ряду лена более чем для 60 видов (разд. 6 . 1 0 ).
e
цитохромов с, в определенных положе Как и миоглобин, цитохром с - э т о не
ниях полипептидных цепей находятся ин больш ой гемсодержащий белок (мол.
вариантные, т. е. всегда одни и те же, ам и
sh
конец
.ru
ib
r-l
С-конец
e
sh
|Ю»«й
u
ak
Ми ОГЛ о б и н 153 78 0
Цитохром с 104 39 0
.ru
Лизоцим 129 40 12
Рибонуклеаза 124 26 35
Химотропсин 241 14 45
Карбоксипепти- 307 38 17
даза
ib
А) Участки полипептидных цепей, не относя
щ иеся ни к а-спиралям, ни к ß-структуре, предста
вляю т собой изгибы или обратны е повороты цепи,
а такж е нерегулярно скрученные или вытянутые ее
r-l
отрезки. а-С пиральны е и ß-структурные сегменты Рис. 8 -6 . Пространственная модель молекулы
иногда им ею т слегка искаженные разм еры и гео лизоцима, с которой прочно связана молекула
м етрию , отличаю щ иеся от соответствую щ их нор полисахаридного субстрата (показана красным
м альных параметров. Д анны е взяты из книги цветом). О братите внимание на очень
C antor C. R. and Schimmel Р. R., Biophysical компактную форму молекулы лизоцима, внутри
Chemistry, pt. I, p. 100, Freem an, San Francisco, которой почти не остается свободного
e
1980. пространства. Другое изображение молекулы
лизоцима см. на рис. 1 к дополнению 9-4 в гл. 9.
sh
зывает лизис, т.е. растворение, бакте ствует лизоцим, располагается в этой по
риальных клеточных стенок и, следова лости, плотно прилегая к ее внутренней
тельно, может служить бактерицидным поверхности. Н а рис. 8 - 6 представлена
агентом. П одобно миоглобину и цито пространственная структура лизоцима,
хрому с, лизоцим имеет компактно свер иллюстрирую щ ая компактность струк
нутую конформацию, причем больш ая туры глобулярных белков.
u
N -конец
.ru
С -кон ец
ib
e r-l
Рис. 8-7. Конформация молекулы ß-конформацию; поэтому они раз
рибонуклеазы, установленная методом
рентгеноструктурного анализа. Пунктирными
личным образом свертываю тся в про
sh
линиями показаны водородные связи между странстве. Эти белки различаю тся также
петлями полипептидной цепи, уложенными по аминокислотным последовательно
в виде складчатого ß-слоя. П олость в середине стям и выполняю т совершенно разные
верхней части молекулы служит центром
связывания субстрата. Расположение
биологические функции. Из данных, по
внутрицепочечных дисульфидных поперечных лученных при рентгеноструктурных ис
следованиях и определении аминокис
u
содержит четыре остатка цистина, обра хорошо известно, что каждый тип белков
зующих ковалентные дисульфидные свя имеет характерную для него трехмерную
зи между петлями полипептидной цепи. конформацию, специально приспосо
Это придает прочность всей нативной бленную для выполнения определенной
третичной структуре фермента (рис. 8-7). биологической функции.
Такие внутрицепочечные дисульфидные
связи имеются во многих белках, особен 8.5. Аминокислотная
но в тех, которые функционируют вне последовательность белка
клетки. определяет его третичную
Совершенно очевидно, что эти четыре структуру
одноцепочечных глобулярных белка не
больших размеров существенно отли Как мы уже поняли из рассмотрения ос-
чаются друг от друга (см. табл. 8 -2 ). спирали и ß-конформации, вторичная
В них содержится разное число а-спи- структура полипептидной цепи, характе
ральных участков и сегментов, имеющих ризующ ая взаимное расположение сосед
7'
196 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
них аминокислотных остатков, опреде ство того, что третичная структура гло
ляется ее аминокислотной последова булярного белка определяется его ами
тельностью. а-Спираль и ß-конформация нокислотной последовательностью, по
возникают самопроизвольно и остаю тся лучено в экспериментах, в которых было
устойчивыми лиш ь в том случае, если на показано, что денатурация некоторых
бор расположенных по соседству амино белков это обратимый процесс. У боль
кислотных остатков в полипептидной це шинства глобулярных белков при нагре
пи имеет соответствующую последова вании или под воздействием экстре
тельность R -групп. Третичная структура мальных значений pH происходит раз
глобулярных белков тоже обусловлена вертывание цепей и утрата биологиче
их аминокислотной последователь ской активности без разрыва кова
ностью. Н о если вторичная структура лентных связей полипептидного остова.
определяется последовательностью Многие годы процесс денатурации бел
.ru
R-групп в близких участках цепи (т.е. ков считался необратимым; например,
ближним порядком), то третичная струк белок, свернувшийся при варке яиц, после
тура зависит от аминокислотной после охлаждения уже не возвращ ается в ис
довательности далеко расположенных ходное растворимое состояние. Однако
друг от друга участков цепи (т. е. от даль было обнаружено, что у некоторых гло
него порядка). Образование изгибов по булярных белков, денатурированных пу
ib
липептидной цепи, а также направление тем нагревания или под воздействием эк
и угол поворота цепи в этих изгибах стремальных значений pH, нативная
обусловлены числом и положением опре структура и биологическая активность
деленных аминокислотных остатков, та восстанавливаются при медленном охла
r-l
ких, как пролин, треонин и серин, ко ждении раствора белка или медленном
торы е способствуют образованию изги изменении его pH до нормального значе
бов. Более того, как мы увидим дальше, ния; такой процесс называется ренату ра
петли плотно свернутой полипептидной цией.
e
цепи сохраняю т характерное для них по Классический пример ренатурации
ложение в пространстве также благодаря представляет ренатурация рибонуклеазы,
разного рода взаимодействиям между R- одноцепочечного белка с четырьмя вну-
sh
.ru
сти свертывания рибонуклеазы при ее ре-
Р азвернутая натурации. О казалось, что восемь остат
молекула в
неактивном
ков цистеина, образовавш ихся в реакции
состоянии. восстановления остатков цистина в пол
В результате ностью развернутой рибонуклеазе, по
восстановления степенно окисляются под действием ат
ib
дисульфидных
поперечных мосферного кислорода, в результате чего
связей обра образуются четыре внутрицепочечные
зовались о стат дисульфидные связи точно в тех же поло
ки цистеина
жениях, что и в исходной нативной рибо
r-l
нуклеазе. Это замечательное явление.
Случайная комбинация восьми остатков
цистеина с образованием остатков цис
Удаление тина теоретически может дать 105 раз
мочевины и
e
личных вариантов, однако в ходе ренату-
ß -м еркапто-
этанола
рации реализуется один-единственный
специфический набор дисульфидных по
Нативная м о
sh
цистина
выполненный Кристианом Анфинсеном
в 50-х годах, доказал, что аминокислот
Рис. 8 -8 . Ренатурация развернутой ная последовательность полипептидной
(денатурированной) рибонуклеазы цепи содержит всю информацию, необхо
с воссозданием правильно расположенных
димую для того, чтобы цепь свернулась
дисульфидных поперечных связей. При
добавлении мочевины в молекуле рибонуклеазы в нативную трехмерную структуру.
разруш аю тся водородные связи, а последую щ ая
обработка белка м еркаптоэтанолом 8.6. Силы, стабилизирующие
(CH 3C H 2 SH) приводит к восстановлению и тем
самы м к разрыву дисульфидных связей четырех
третичную структуру
остатков цистина, которые при этом глобулярных белков
превращ аю тся в восемь остатков цистеина.
М ы уже знаем, каким образом форми
руется и поддерживается вторичная
структура полипептидов. Внутрицепо-
198 ЧА СТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
четыре типа взаимодействий, сочетание нием и стремятся собраться вместе
которых обеспечивает правильное взаим внутри глобулярной структуры, где
ное расположение всех витков и петель они защищены от соприкосновения
в глобулярных белках (рис. 8-9) при со с водой.
блюдении нормальных биологических 4. Ковалентные поперечные связи. Сосед
условий (температура, pH, концентрация ние петли полипептидной цепи в неко
ib
ионов). торых белках, например в рибонуклеа-
зе, содержат остатки цистина, которые
1. Водородные связи меж ду R -группами образую т внутрицепочечные кова
остатков, расположенных в соседних лентные поперечные связи между со
r-l
пет лях полипептидной цепи. Н апри седними петлями. Такие ковалентные
мер, гидроксильная группа остатка поперечные связи, конечно, намного
серина в одном участке полипептид прочнее, чем перечисленные выше не
ной цепи может образовать водород ковалентные взаимодействия, однако
ную связь с атомом азота в кольце
e
они встречаются не во всех белках.
остатка гистидина, находящегося в со Следовательно, те белки, у которых
седней петле той же цепи. нет дисульфидных поперечных связей,
sh
Гидрофобные R-группы
поддерживают свойственную им тре
Э лектроста
скрыты внутри молекулы, тическое
тичную структуру при помощи множе
где они защищены от притяжение ства слабых нековалентных взаим о
соприкосновения с водой \ действий и разного рода контактов,
в совокупности придающих структуре
достаточную прочность.
u
.ru
8.7. Свертывание мерном белке можно установить по
по.шпептидных цепей числу аминоконцевых остатков, приходя
происходи! с очень высокой щихся на одну молекулу белка. С этой
скоростью целью к N -концевым остаткам присоеди
няю т какую-нибудь подходящую хими
В живых клетках белки образуются из ческую метку, например 2,4-динитро-
ib
аминокислот с очень высокой скоростью. фторбензол (разд. 6.7,6). Олигомерный
Например, в клетках E. coli полная био белок, состоящий из четырех полипеп
логически активная молекула белка, со тидных цепей, скажем гемоглобин, дол
держащая 1 0 0 аминокислотных остатков, жен иметь четыре N -концевых остатка,
r-l
может быть построена за 5 с при 37°С. по одному на каждую цепь. В молекуле
Однако расчеты показывают, что если инсулина имеется две цепи, связанные
полипептидная цепь из 1 0 0 аминокис друг с другом ковалентными поперечны
лотных остатков будет беспорядочно ми связями.
«перебирать» все возможные углы вра Олигомерные белки превосходят одно
e
щения вокруг каждой одинарной связи цепочечные белки по молекулярным мас
остова, пока не «найдет» свойственную сам и по сравнению с ними выполняют
sh
.ru
ни крысы) 18 0 0 0 3 скую активность олигомерных белков.
Г ексокиназа
(из дрожжей) 1 0 2 0 0 0 2
8.9. Метод
Лактатдегид-
рентгеноструктурного анализа
рогеназа (из
сердца быка) 140 0 0 0 4
позволил установить как
Ц итохромокси- третичную, так и четвертичную струк
ib
даза 2 0 0 0 0 0 7 туру гемоглобина
Г лутаматде-
гидрогеназа П ервым олигомерным белком, став
(из печени ш им объектом рентгеноструктурного
r-l
быка) 320000 6 анализа, был гемоглобин (мол. масса
F j -А ТРаза 380000 9 или 10 64 500), содержащий четыре полипеп
РН К-полиме- тидные цепи и четыре простетические ге-
раза (из могруппы, в которых атомы железа нахо
E. coli) 400 000 5 дятся в закисной форме [Fe (II)]. Белко
e
А спартат-кар-
вая часть молекулы, называемая глоби
бамоилтран-
сфераза (из ном, состоит из двух a -цепей (по 141
sh
E. coli) 310000 12
остатку в каждой) и двух ß-цепей (по 146
Изоцитратде-
гидрогеназа Рис. 8-10. Трехмерная структура окси-
(из сердца бы и дезоксигемоглобина, установленная методом
ка) 1 0 0 0 0 0 0 10
рентгеноструктурного анализа. Показана
четвертичная структура молекулы, т. е. способ
Глутаминсин-
совместной укладки четырех субъединиц.
u
.ru
ib IRuiAtf
сS t 'S
r-l
Оксигемоглобин
e
sh
u
ak
Дезоксигемоглобин
202 ЧА СТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
ну, а- и ß-цепи гемоглобина содержат не ковы по длине и образую т в местах изги
сколько а-спиральных сегментов, разде бов примерно одни и те же углы.
ленных участками, образую щ ими изгибы Вторая закономерность состоит в том,
цепи. Четыре полипептидные цепи уло что гемоглобины у разных видов позво
жены относительно друг друга приблизи ночных характеризуются приблизитель
тельно в виде тетраэдра, в результате че но одинаковой третичной структурой их
ib
го возникает характерная четвертичная полипептидных цепей. Более того, они
структура гемоглобина (рис. 8-10). С ка очень сходны и по четвертичной структу
ждой цепью связана одна гемогруппа. ре.
Гемы разных цепей сравнительно далеко Третий важный вывод заключается
r-l
(на расстоянии около 2,5 нм) располо в том, что третичная структура а- и ß-це-
жены друг от друга и имею т разный угол пей гемоглобина имеет много общего
наклона. Каждый гем частично погружен с третичной структурой миоглобина.
в «карман», выстланный гидрофобными Сходство третичной структуры этих двух
e
R -группами, и соединен с полипептидной белков можно сопоставить с присущей
цепью координационной связью между обоим белкам способностью связывать
атом ом железа и R-группой остатка ги кислород, лежащей в основе их биологи
sh
м ало прямых контактов, тогда как между эквивалентных положений, в которых на
а- и ß-цепями возникаю т многочис ходятся идентичные аминокислотные
ленные контакты типа a jß j и a 2 ß2. остатки; кроме того, в других 40 положе
В образовании таких контактов прини ниях обнаруживаются близкие по своим
м аю т участие в основном гидрофобные свойствам остатки аминокислот, напри
R -группы аминокислотных остатков. мер аспарагиновая и глутаминовая кис
Вследствие нерегулярной формы поли лоты, или изолейцин и валин. Таким
пептидных цепей две пары субъединиц образом, и здесь мы видим, что в амино
aj ß j и a 2 ß 2 не могут плотно прилегать кислотных последовательностях гом оло
друг к другу, так что в центре между ни гичных белков имеется ряд инвари
ми остается канал (или полость), прохо антных аминокислотных остатков и что
дящий сквозь всю молекулу гемоглоби для гомологичных белков характерно
на, что хорошо видно, если смотреть на сходство их трехмерной структуры.
молекулу сверху (рис. 8-10). Ниже мы Из структурных данных по миоглоби-
еще вернемся к вопросу об этом канале. ну и гемоглобину вытекает еще один вы-
ГЛ. 8. Г Л О Б У Л Я Р Н Ы Е Б Е Л К И : Г Е М О Г Л О Б И Н 203
Цепи гем огло- Цепь миогло- пликации. Образовавш иеся при этом две
бина лошади бина кашалота копии гена далее стали мутировать неза
N -концы а р висимо друг от друга, так что одна из них
постепенно превратилась в ген, кодирую
щий белок миоглобинового типа, при
способленный для запасания кислорода
в клетках, а вторая, изменившись в ре
20
зультате другой серии мутаций, стала ко
дировать ос- и ß-цепи гемоглобина, при
способленные для переноса кислорода,
40 осуществляемого эритроцитами. М ы еще
встретим немало других примеров функ
ционально и структурно сходных белков,
.ru
происшедших в процессе эволюции от
60 общих предшественников.
80
100
ib
r-l
120
(fife
e
sh
140
.ru
Дупликация гена
независимым мутациям. Гемоглобиновый ген
м ог в какой-то м омент еще раз подвергнуться
дупликации, в результате чего образовались
а-Цепь ß -Цепь современные гены а- и ß-цепей.
Современный
К ром е генов, кодирующих а- и ß-цепи
миоглобин норм ального гемоглобина, присутствующего
(одноцепочечный) в крови взрослого человека, существует ген,
ib
кодирую щ ий у-цепь, которая входит в состав
Современный гемоглобин гемоглобина плода. Э тот гемоглобин, имеющий
(2а-цепи + 2(5-цепи) состав а 2у 2, обладает более высоким сродством
к кислороду, чем гемоглобин взрослого
человека. В эритроцитах взрослого организма
r-l
содержится также очень небольш ое количество
гемоглобина с 8 -цепями, имеющ его состав а 28 2.
Вид сверху
.ru
Молекула глюкозы
ib
Рис. 8-13. Структура олигомерного белка Рис. 8-14. Субъединичная структура
гексокиназы, выделенного из дрожжей. Две • глутаминсинтетазы E. coli. Э тот регуляторный
субъединицы белка связаны винтовой осью фермент состоит из 12 субъединиц, взаимное
симметрии. Если повернуть молекулу на 180° расположение которых показано на рисунке.
r-l
вокруг вертикальной оси и одновременно
поднять ее вверх, то нижняя субъединица
совместится с контуром верхней субъединицы.
Гексокиназа - регуляторный фермент,
8 Л 2. Эритроциты-
контролирующ ий скорость вовлечения глю козы специализированные клетки,
в процессы клеточного метаболизм а. Правая переносящие кислород
e
субъединица содержит молекулу глю козы,
связанную с каталитическим центром фермента. В организме взрослого человека содер
Другое изображение гексокиназы представлено
жится 5-6 литров крови. Примерно от
sh
.ru
Рис. 8-15. Ф отография нормальных
ib
эритроцитов человека, полученная при помощи
2 мкм сканирую щ его электронного микроскопа.
же крови, возвращ ающ ейся в сердце, ге дом имеет вид простой гиперболы, как
моглобин насыщен кислородом лиш ь на и следует ожидать из закона действую
64%. Таким образом, каждые 100 м л кро щих масс применительно к равновесной
ви, проходящие через ткань, оставляю т реакции:
в ней около одной трети содержащегося
М иоглобин + О 2 Оксимиоглобин
u
ловеческого тела.
вается насыщенным кислородом более
8.13. Для миоглобина чем на 95%. В отличие от миоглобина ге
и гемоглобина характерны моглобин характеризуется значительно
разные кривые связывания более низким сродством к кислороду;
кислорода кроме того, кривая насыщения гемогло
бина кислородом имеет сигмоидную, т.е.
Особые свойства молекулы гемогло S-образную, форму (рис. 8-16). Это озна
бина, которые делаю т его столь эффек чает, что при связывании первой моле
тивным переносчиком кислорода в кро кулы кислорода (нижняя часть S-образ
ви, легче всего уяснить из сравнения ной кривой, соответствующая пар
миоглобина и гемоглобина в отношении циальным давлениям кислорода ниже
их сродства к кислороду. На рис. 8-16 по 1 0 мм рт. ст.), гемоглобин имеет очень
казаны кривые насыщения кислородом низкое сродство к кислороду, тогда как
для гемоглобина и миоглобина, характе- при связывании следующих молекул кис-
ГЛ. 8. Г Л О Б У Л Я Р Н Ы Е БЕ Л К И : Г Е М О Г Л О Б И Н 207
.ru
гемоглобина обусловлен кооперативным
взаимодействием между субъединицами.
Поскольку связывание первой молекулы
кислорода одной из субъединиц гемо
глобина увеличивает вероятность связы
Парциальное давление 0 2 , мм рт. ст. вания следующих молекул кислорода
ib
остальными субъединицами, мы гово
Рис. 8-16. Кривые насыщения кислородом для рим, что гемоглобин имеет положитель
миоглобина и гемоглобина. М иоглобин
обладает намного более высоким сродством
ную кооперативность. Д ля положитель
к кислороду, чем гемоглобин. 50%-ное ной кооперативности характерны сиг
r-l
насыщение миоглобина кислородом моидные кривые связывания, подобные
достигается уже тогда, когда парциальное кривой насыщения гемоглобина кисло
давление 0 2 составляет всего 1 - 2 м м рт. ст.,
тогда как для гемоглобина такое насыщение
родом. П ри связывании кислорода мио-
кислородом наступает лишь при парциальном глобином, содержащим одну гемогруп-
давлении кислорода около 26 мм рт. ст. пу, молекула белка может присоединить
e
О братите внимание, что в артериальной крови, только одну молекулу кислорода; в этом
вытекающей из легких (при парциальном
давлении кислорода около 1 0 0 м м рт. ст.) оба
случае кооперативного связывания не на
блюдается и кривая насыщения имеет
sh
.ru
очень быстро расходуют кислород и его парциальных давлениях кислорода дает
локальная концентрация соответственно ему возможность более эффективно
снижается. По мере протекания крови че связывать и запасать кислород. Таким
рез капилляры в мышцах кислород из со образом, гемоглобин и миоглобин спе
держащегося в эритроцитах гемоглоби циально приспособлены для выполнения
на, почти полностью насыщенного кис различных киелород-связывающих функ
ib
лородом, поступает в плазму крови ций. Вместе с тем, как мы сейчас увидим,
и далее в мышечные клетки. Из кривой гемоглобину свойственна еще и другая
насыщения гемоглобина кислородом, по функция.
казанной на рис. 8-16, видно, что при
r-l
прохождении крови через капилляры 8.15. Гемоглобин служит
мышц высвобождается примерно одна также переносчиком СО
треть связанного кислорода, так что вы и ионов Н +
ходящий из мышечной ткани гемоглобин К роме переноса кислорода от легких
насыщен кислородом только на 64%.
e
к тканям гемоглобин осуществляет пере
К огда кровь снова поступает в легкие, нос двух конечных продуктов тканевого
где парциальное давление кислорода на дыхания, H + и С О 2, доставляемых из
sh
.ru
С О 2 на связывание и освобождение кис
лорода гемоглобином называю т эффек
том Бора в честь датского физиолога
Христиана Бора, впервые открывшего
Рис. 8-17. Влияние pH на кривую насыщения
этот эффект.
гемоглобина кислородом. При низком значении
Эффект Бора обусловлен реакцией,
ib
pH, характерном дл я тканей (pH 7,2), кислород
в которой помимо кислорода участвуют освобож дается легче, чем при более высоком
еще два лиганда, способные связываться значении (pH 7,6), характерном для легких, где
кислород легче связывается.
с гемоглобином, а именно ионы Н + и
С О 2. Реакция связывания кислорода ге
r-l
лорода, что имеет место в тканях, связы-
моглобином в том виде, в каком мы ее до
сих пор записывали: ваться с гемоглобином будут ионы H + .
Однако ионы H + и кислород связываю т
НЬ + О 2 Н ЬО 2, ся с разными участками молекулы гемо
в действительности отражает неполную глобина. Кислород связывается с атома
e
картину. Ч тобы объяснить влияние кон ми железа в гемах, а ионы H + - с
центрации ионов Н + на связывание кис R-группами остатков гистидина-146 в ß-
лорода гемоглобином, мы должны запи
sh
н+
О н Н Н
I °;с — N — С— С—
С + h 2n — с — с -
II I I V i ii
О R О О r о
Аминоконцевой остаток Карбаминоконцевой
остаток
210 Ч АСТЬ I. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
гой, дает организму больш ие преимуще конформации (рис. 8-10 и 8-18). При ок-
ства. В тканях при низких pH и высоких сигенации дезоксигемоглобина третич
концентрациях С О 2 кислород обычно ос ная структура а- и ß-цепей практически
вобождается из гемоглобина, тогда как не изменяется, поскольку они остаются
в Легких высокая концентрация кислоро плотно пригнанными друг к другу
да способствует выделению С О 2 и ионов и образую т димеры ot,ßj и a 2 ß2. Однако,
ib
H + . Таким образом, благодаря способ как только кислород присоединяется
ности молекулы гемоглобина передавать к гемогруппам дезоксигемоглобина, по
информацию о связывании лигандов от ловинки молекулы ocjß,ä и oc2 ß2, сохраняя
одной полипептидной субъединицы свойственную им жесткую конформа
r-l
к другой эта молекула оказывается вели цию, изменяю т свое положение относи
колепно приспособленной к осуществле тельно друг друга и теснее сближаются
нию совместного переноса эритроцита между собой. Иными словами, оксигена-
ми О 2, С О 2 и ионов H + . ция гемоглобина вызывает изменение его
четвертичной структуры, т.е. упаковки
e
Но теперь снова возникает ряд вопро
сов. В чем состоит особенность струк субъединиц. В результате молекула окси-
туры гемоглобина, обеспечивающая эти гемоглобина приобретает несколько бо
sh
глобин нет?
из относительно гидрофильного окруже
8.16. Оксигенация ния в более гидрофобное, что облегчает
гемоглобина вызывает отщепление ионов Н + от протониро-
изменение его пространственной ванных групп; иначе говоря, при оксиге-
конформации нации гемоглобина протонированные
группы приобретаю т свойства более
Ответ на эти вопросы был получен по сильных кислот, чем и объясняется эф
сле того, как выяснилось, что молекула фект Бора. Таким образом, изменение
дезоксигемоглобина при связывании кис четвертичной структуры гемоглобина
лорода претерпевает конформационные в результате его оксигенации находится
изменения. Первое указание на существо в прямой связи с существованием обрат
вание таких изменений относится к тому ного соотношения между сродством ге
времени, когда было обнаружено, что моглобина к кислороду и его сродством
кристаллы дезоксигемоглобина, вы ра к С О , и ионам Н + .
ГЛ. 8. Г Л О Б У Л Я Р Н Ы Е Б Е Л К И : Г Е М О Г Л О Б И Н 211
Оксигемоглобин Дезоксигемоглобин
.ru
ib
e r-l
sh
Наконец, еще одну особенность регу Рис. 8-18. Схематическое изображение (в виде
u
НЬ-ДФ Г + О 2 ^ Н ЬО 2 + Д Ф Г.
Таким образом, наблюдается обратная зависимость между двумя
процессам и-связы ванием кислорода и Д Ф Г (присоединяющихся
к разным участкам молекулы гемоглобина).
О О
.ru
II
Н — с — О — Р— О~
Н — С— н ü
'О — Р = О
ib
r-l
1
О~
А
e
sh
.ru
(рис. 1); напомним, что он может связывать по четыре молекулы О 2
или С О 2 и примерно четыре иона H + .
2
О
=t
о
О
Q.
чо
ib нормальной
крови, кон
центрация
ДФГ = 5 мМ
r-l
Гемоглобин,
очищенный
я от ДФГ
ш
S?
Кровь на больших
e
высотах, концен
трация ДФГ = 8 мМ
sh
50 100
Парциальное давление 0 2 , мм рт. ст.
_ □ □ Форма с низким
сродством к Oj
□ □
-О*'] [о2
□ □
-0*1 Io,
.ru
@ 0 Промежуточные
формы
□ □ о о
-О* О. ■Ok||p2
■11<
о 2щ
ib о ®
-О а1|о*
r-l
Ог 0 2 оа Форма с высоким
Ог Ог 0 2 0 2 СР°ДСТВ0М к 0 2
e
А Б
Рис. 8-19. Симметричная («все или ничего») равновесие сдвигается вправо и вероятность
и последовательная (индуцированное связывания с гемоглобином оставшегося
sh
.ru
Насколько важную роль играет амино
из них, которые обладаю т как каталити
кислотная последовательность в форми
ческой, так и регуляторной активностью.
ровании вторичной, третичной и четвер
Многие белки, наделенные такими регу
тичной структур глобулярных белков,
а следовательно, и в возникновении у них
биологической активности, было особен
ib
но наглядно показано на примере серпо
видноклеточной анемии - наследственно
го заболевания, связанного с генетиче
ской аномалией гемоглобина. У таких
r-l
больных периодически (чаще под влия
нием физической нагрузки) возникают
приступы резкой слабости, тош ноты
и одышки; эти симптомы сопровож
даю тся тахикардией и появлением шу
e
мов в сердце. Содержание гемоглобина
в крови таких больных резко снижено -
sh
----------1
5 мкм
216 ЧА СТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
нии крови таких больных обращ ает на се жны избегать больших физических на
бя внимание не только резкое уменьше грузок и всякого рода неблагоприятных
ние числа эритроцитов, но и неправиль воздействий на систему кровообращ е
ная их форма. Наряду с необычно ния.
больш им количеством незрелых эри Необычная форма эритроцитов
троцитов часто попадаю тся удлинен у больных серповидноклеточной анемией
ные и то н ки е-серп овидны е-клетки обусловлена присутствием в них ано
(рис. 8-20). Число таких эритроцитов мального гемоглобина. Гемоглобин сер
сильно возрастает при недостатке кисло повидных клеток получил название гемо
рода в крови. Серповидные клетки очень глобина S, тогда как гемоглобин, содер
хрупки, легко разрываются, чем и объяс жащийся в эритроцитах нормальных
няется низкий уровень гемоглобина у та взрослых людей, называется гемоглоби
ких больных. Н аблю даю тся и еще более ном А. При дезоксигенации гемоглобин
.ru
серьезные последствия: кровеносные ка S становится нерастворимым и образует
пилляры там, где они особенно узки, бло пучки трубчатых волокон (рис. 8 -2 1 ), что
кируются удлиненными эритроцитами совершенно несвойственно гемоглобину
неправильной формы, что и служит глав А, сохраняющему растворимость и после
ной причиной ранней смерти во многих освобождения кислорода. Именно нера
случаях этой болезни. створимые волокна дезоксигемоглобина
ib
Серповидноклеточная а н е м и я -эт о ге S приводят к деформации эритроцитов,
нетическая болезнь, при которой боль принимающих серповидную форму.
ной наследует мутантные гены от обоих
родителей. В тех случаях, когда му 8.18. Гемоглобин больных
r-l
тантный ген унаследован только от одно серповидноклеточной анемией
го из родителей, его обладатель стано имеет измененную аминокислотную
вится носителем признака серповиднокле- последовательность
точности без явных патологических
e
симптомов. При такой форме серповид- В конце 40-х годов Лайнус Полинг и
ноклеточности (ею поражено примерно Гарвей Итано обнаружили, что серповид
8 % негритянского населения Соеди ноклеточный и нормальный гемоглоби
sh
^
метод пептидных карт и поныне широко
используется для выявления генетиче
ских разновидностей не только гемогло- о о
бинов, но и других белков. И нграм обра О
.ru
ботал оба гемоглобина, S и А, трипси
Гемоглобин А
ном, который разрывает только те
пептидные связи, в которых карбоксиль
ная группа принадлежит остаткам арги
нина или лизина (разд. 6.7, в). Это привело
к образованию пептидных фрагментов 28
ib
сортов, поскольку в а- и ß-цепях содер
жится в общей сложности 27 остатков л О О 0
лизина и аргинина. Смесь пептидов, по
лученных при расщеплении каждого ге
оО р
D с?
go ^
r-l
моглобина, была нанесена на фильтро
вальную бумагу, смоченную буферным
раствором, и подвергнута электрофоре .О )
зу, в результате чего пептидные фраг
e
менты разделились, хотя и не полностью,
на отдельные зоны. После того как фильт . 8 0 - « ° ^
ровальная бумага была высушена, через Гемоглобин S
sh
.ru
Рис. 8-23. А. Генетическое нарушение
в серповидноклеточном гемоглобине.
1 2 3 4 5 6 7 8 В результате мутации гена, кодирующ его
Val-His Leu T h r-P ro -G iu G lu Lys •( гемоглобинА) ß-цепь, остаток глутаминовой кислоты,
присутствующий в положении 6 ß-цепи
V al-H is-L e u -T h r-P ro -V al'O lu -L y s • ( гемоглобин S) норм ального гемоглобина А, замещен на
остаток валина. Такая зам ена приводит к утрате
одного отрицательного заряда в каждой из двух
ib
ß-цепей. Б. Расположение 163 мутаций (кружки,
обведенные черной линией), зарегистриро
Н:,С СН, ванных в гемоглобинах человека к 1979 г. 105
Н СН мутаций находится в ß-цепях и 58 м у тац и й -в
a -цепях. И нвариантные для обеих цепей остатки
r-l
I I
—N—С—С— обозначены красными кружками. Мутации,
I II локализованные в окрестности гемогруппы,
н о с больш ой степенью вероятности приводят
О статок валина к серьезным функциональным нарушениям
А гемоглобина.
e
u sh
ak
ГЛ. 8. Г Л О Б У Л Я Р Н Ы Е Б Е Л К И : Г Е М О Г Л О Б И Н 219
.ru
8.20. «Неправильные» 1 16 Lys Glu
аминокислоты появляются О го н о л у л у 30 Glu Gin
в белках в результате Норфолк 57 Gly Asp
генных мутаций ^Б остон 58 His Tyr
^Ф и л ад ел ьф и я 6 8 Asn Lys
У людей, страдающ их серповиднокле ^И н д о н е зи я 116 Glu Lys
ib
точной анемией, ген, ответственный за
синтез ß-цепи гемоглобина, вследствие ß -ц еп ь
необратимой мутации кодирует включе
ние остатка валина в положение, где
6Glu Lys
r-l
в нормальном гемоглобине находится С
остаток глутаминовой кислоты; при s 6Glu Val
этом все остальные аминокислоты ß-це C'Cair-Xoce 7Glu Gly
E 26Glu Lys
пи занимаю т свои обычные положения.
^С аскатун 63His Tyr
Серповидноклеточный гемоглобин - это Цюрих 63His Arg
e
результат только одной из более 300 раз ^М илуоки 67Val Glu
личных мутаций, обнаруженных в гемо- ^П ен д ж а б 121 Glu Gin
глобиновых генах человека, причем
sh
торых эритроциты имели те или иные от небольших проб крови, взятых для ана
клонения от нормы. лиза. М утации, ведущие к изменениям
Гемоглобин - не единственный белок, в аминокислотной последовательности,
содержащийся в организме человека, ко обнаружены и во многих других белках
торый претерпевает генетические измене человека, включая разного рода фер
ния, обусловленные мутациями. Все бел менты, участвующие в процессах обмена,
ки, глобулярные и фибриллярные, под а также фибриллярные белки, например
вержены мутациям. Гемоглобину уде коллаген.
ляю т значительно больш е внимания Хотя мутации, вызывающие те или
просто потому, что многие изменения иные изменения в молекулах белка, рас
молекулярной структуры гемоглобина сматриваю тся обычно как генетические
вызывают у людей выраженные наруше «дефекты», в генах, содержащих инфор
ния кровообращения или дыхания. Кро мацию о структуре белковых молекул,
ме того, гемоглобин легко выделить из могут происходить и такие мутации, ко-
220 ЧАСТЬ 1. БИОМОЛЕКУЛЫ
.ru
Хотя ген серповидноклеточности, по
всей вероятности, давал определенные
преимущества его носителям в тех рай
онах Африки, в которых свирепствовала
малярия, в настоящее время он, безуслов
ib
но, «вреден» для его обладателей, осо
бенно для негров, переселившихся из
Рис. 8-24. О тносительная ч а с т о т а , Африки в другие районы мира, где м аля
распространения гена серповидноклеточности рия редко встречается и средняя продол
в различных частях Африки. Зоны,
r-l
соответствую щ ие наибольш ему
жительность жизни намного выше. На
распространению этого гена, находятся в тех основе полученных сведений о структуре
областях, где когда-то основной причиной и конформации гемоглобина предприни
смертности бы ла малярия. маю тся попытки найти способ рацио
нального лечения серповидноклеточной
e
торы е «улучшают» белок, т. е. способ анемии. Они сводятся к поиску таких ле
ствуют более эффективному выполне карственных веществ или химических со
нию им его функции, вследствие чего единений, которые не оказывали бы не
sh
СН 3 СН, СН3 С Н :,
СН СН о
I + I II
Н — С — N H , + N = C — О " ------- * Н — С — N — С — N H 2
0 = с Цианат О— С Н Карбамоильная
группа
N -концевой Остаток N - карбамоилва-
остаток валина лина
Рис. 8-25. О бразование водного окружения. Третичная структура
N-карбамоилпроизводного N -концевого свернутой полипептидной цепи стабили
.ru
остатка валина в ß-цепи гемоглобина S при
обработке его in vitro цианатом калия. После
зируется целым рядом нековалентных
такой химической модификации только одного взаимодействий (особенно гидрофобны
аминокислотного остатка эритроциты больных ми взаимодействиями между неполярны
серповидноклеточной анемией при ми R -группами), электростатическим
дезоксигенации уже не принимаю т серповидной
формы.
притяжением между противоположно за
ряженными R-группами и водородными
ib
нее поиски эффективных средств против связями. Все эти взаимодействия, будучи
серповидноклеточной анемии вселяют слабыми по своей природе, в совокупно
некоторую надежду на то, что в конце сти оказываю тся очень прочными. В не
концов методы биохимической инжене которых глобулярных белках определен
r-l
рии позволят сконструировать соедине ную роль в формировании и стабилиза
ние, которое не только предотвратит ции третичной структуры играю т дисуль
вредное влияние гемоглобина S, но и не фидные поперечные связи. Информация,
будет оказывать никаких неблаго определяющая третичную структуру бел
ков, заложена в аминокислотной после
e
приятных воздействий на другие белки
организма. довательности их полипептидных цепей,
о чем свидетельствует тот факт, что го
sh
.ru
G luskerJ.P ., Trueblood K .N . Crystal Structure
моидную форму, поэтому гемоглобин
Analysis: A Primer, Oxford University Press,
хорош о приспособлен для связывания New York, 1972.
кислорода в легких и его освобождения Haschemeyer R., Haschemeyer A. H. Proteins:
в периферических тканях. М иоглобин A G uide to Study by Physical and Chemical
в отличие от гемоглобина обладает зна M ethods, Wiley, New York, 1973.
чительно более высоким сродством Schultz G. E., Schirmer R. H. Principles of Protein
ib
к кислороду и характеризуется гипербо Structure, Springer-Verlag, New York, 1979.
лической кривой насыщения кислородом, Статьи
благодаря чему он наделен способ
Anfmsen C.B. Principles T hat Govern the Fol
ностью запасать кислород в мышцах.
r-l
ding of Polypeptide Chains, Science, 181,
Кислород легче связывается гем оглоби 223-230 (1973).
ном при более высоких значениях pH Cerami A ., Peterson C .M . Cyanate and Sickle
и низкой концентрации С 0 2; освобожде Cell Disease, Sei. Am., 232, 44, April (1975)
нию же кислорода из гемоглобина благо (offprint 1319).
e
приятствуют более низкие значения pH Dickerson R .E . Cytochrom e С and the Evolution
и высокие концентрации С 0 2. Эти соот of Energy M etabolism, Sei. Am. 242, 236,
M arch (1980).
ношения, равно как и регулирующее воз
sh
Укажите, где в изображенном ниже поли рации), можно вычислить долю белковых
пептиде возможно образование изгибов молекул, вернувшихся в нативное состоя
или поворотов цепи. Где могут образовать ние. Например, рибонуклеаза полностью
ся внутрицепочечные дисульфидные попе развертывается после разры ва ее четырех
речные связи? дисульфидных поперечных связей и после-
7 8 9 ю 11
Ile • Ala • His ■ T hr • Туг • Gly Pro • Phe • Glu • Ala • Ala •
12 13 14 15 i6 17 18 19 20 21 22
Met • Cys • Lys • Trp • Glu • Ala • Gin • Pro • Asp • Gly M et
.ru
затем удалить мочевину путем диализа
Glu • Cys • Ala • Phe • His • Arg и создать подходящие условия для образо
вания новых дисульфидных поперечных
2. Расположение специфических аминокислот связей, то активность рибонуклеазы восста
в глобулярных белках. По данным рентге навливается на 95-100%. Схема этого экс
ноструктурного анализа миоглобина и дру
перимента показана на рис. 8 -8 . Ниже при
гих одноцепочечных глобулярных белков
ведены результаты аналогичных опытов по
ib
небольших размеров был сделан ряд обо ренатурации других белков:
бщений, касающихся укладки полипеп
тидных цепей растворимых белков. Исходя
Белок Число Активность, %
из этих обобщений, укажите наиболее ве
дисуль
роятное расположение (внутри или на по
r-l
фидных наблюда предска
верхности молекулы нативного глобуляр связей емая занная1’
ного белка) аминокислотных остатков
аспарагиновой кислоты, лейцина, серина,
валина, глутамина и лизина. Поясните свой Рибонуклеаза 4 95-100 ~ 1
всех других. Н аблю даемая активность тя каждый эритроцит имеет форму двояко
инсулина после его ренатурации оказы вогнутого диска, для простоты расчетов
вается очень низкой и практически совпа мы будем рассматривать их просто как ци
дает с активностью, предсказанной исхо линдры следующих размеров:
дя из предположения о случайном обра
зовании дисульфидных связей. Ч то м ож L--------------- 8 . 0 M K M --------------- ^
но сказать о нативной структуре инсу
лина на основе этого наблюдения?
П опробуйте представить себе, как фор
мируется нативная структура инсулина. 1,8 мкм
Число полипептидных цепей в олигомерном
белке. Н екоторое количество (660 мг) оли
гомерного белка с молекулярной массой
132 ООО обрабаты вали избы тком 2,4-дини-
а) Рассчитайте, какое количество гемо
.ru
троф торбензола в слабощелочной среде
глобина (по весу) содержится в одном
вплоть до завершения химической реакции.
эритроците.
Затем пептидные связи белка были под
б) Сколько молекул гемоглобина содер
вергнуты полному гидролизу путем нагре
жится в одном эритроците?
вания белка в присутствии концентриро
в) Рассчитайте объем одного эритроцита.
ванной НС1. В гидролизате содержалось
г) Г ем оглобин -глобулярн ы й белок, моле
5,5 мг следующего соединения:
кула которого имеет диаметр 6 , 8 нм. К а
ib
кую долю объема всех эритроцитов зани
СН, СН, мает гемоглобин?
no 2
а) Объясните, почему эти данные можно упакован в виде кубической решетки, как
использовать для определения числа по показано на рисунке
липептидных цепей в олигомерном бел
ке.
б) Рассчитайте число полипептидных це
пей в этом белке.
u
лорода.
а) Ткани животных содержат около 70%
(по весу) воды. Концентрация кислорода
в тканевой воде в норме составляет
3 ,5 -1 0 ” 5 М. Рассчитайте, какое количе
ство кислорода мож ет быть запасено
в 1 кг ткани в виде растворенного в воде
газа.
.ru
б) В большинстве тканей млекопитаю щих
содержится миоглобин, предназна
ченный для запасания кислорода. У чело
века наибольшее количество миоглобина
содержится в ткани сердца, где он соста
вляет 0,7% (по весу) всей массы ткани. F тщ ательно удалить весь 2,3-дифосфо-
Рассчитайте, какое количество кислорода глицерат (ДФГ), кривые их насыщения
ib
(в граммах) может быть запасено в I кг кислородом сместятся влево (т.е. срод
сердечной мышечной ткани человека. ство гемоглобинов к кислороду повысит
Сравните полученное значение с ответом ся). Однако у гемоглобина А сродство
на вопрос, поставленный в пункте а. к кислороду при этом становится выше,
чем у гемоглобина F. Если в препараты
r-l
в) В скелетных мышцах морских млекопи
тающих, способных длительно находить гемоглобина вновь добавить ДФ Г, то
ся под водой, содержится намного боль кривые насыщения кислородом примут
ше миоглобина, чем у всех остальных прежний вид, показанный на рисунке. К а
позвоночных, причем его концентрация кое влияние оказывает Д Ф Г на сродство
гемоглобина к кислороду? Как на основе
e
пропорциональна длительности погру
жения животного в воду. В свежем тю приведенной выше информации можно
леньем мясе, находившемся какое-то вре объяснить различие в сродстве к кисло
мя на воздухе, оказалось 0,15 г кислоро роду у гемоглобинов матери и плода?
sh
ременных самок было показано, что А тем, что содержит в одном из пептидов
кривые насыщения гемоглобина кислоро вместо остатка аспарагина остаток ли
дом в крови матери и плода, полученные зина.
ak
.ru
В этой главе речь пойдет о самых зам е новесие между различными метаболиче
чательных и наиболее специализиро скими процессами, необходимыми для
ванных белках-ф ерм ентах, т. е. белках, поддержания жизнеспособности от
обладающ их каталитической актив дельных клеток и целых организмов.
ib
ностью. Ферменты являются необычайно Некоторые болезни человека, особенно
мощ ными катализаторами, как правило, генетически обусловленные наслед
намного превосходящими по своей эф ственные заболевания, связаны с недо
фективности синтетические катализа статочностью или полным отсутствием
r-l
торы. Они высокоспецифичны по отно одного или нескольких ферментов в тка
шению к своим субстратам и ускоряют нях. С другой стороны, патологические
строго определенные химические реак состояния могут быть вызваны избыточ
ции без образования побочных продук ной ак i ивностью того или иного фермен
e
тов; ферменты функционируют в разбав та; в таких случаях иногда удается подо
ленных водных растворах при физиоло брать лекарственный препарат, ингиби
гических значениях температуры и pH. рующий активность этого фермента.
sh
.ru
женный в кристаллах уреазы б ел о к -эт о
были зарегистрированы и другие случаи просто загрязнение. И только в 30-е
биологического катализа, который те годы, после того как Джон Н ортроп и его
перь называется ферментативным. В 50-х сотрудники получили в кристаллическом
годах прош лого века Луи Пастер пришел виде пепсин и трипсин и установили, что
к выводу, что сбраживание дрожжами са эти ферменты тоже представляют собой
хара в спирт катализируется «фермента
ib
белки, точка зрения о белковой природе
ми». Он считал, что эти ферменты (впос ферментов получила всеобщее призна
ледствии для их обозначения был введен ние. Вслед за этим наступил период ак
еще один терм ин-энзим ы , что в переводе тивного изучения ферментов, катализи
означает «в дрожжах») неотделимы от
r-l
рующих различные реакции клеточного
структуры живой клетки дрожжей. Эта метаболизма. К настоящему времени
точка зрения господствовала в науке в те идентифицировано около 2 0 0 0 раз
чение длительного времени. П оэтому личных ферментов, каждый из которых
важной вехой в истории биохимии стало катализирует какую-то одну определен
e
открытие, которое сделал в 1897 г. ную химическую реакцию. Сотни фер
Эдвард Бухнер; ему удалось экстрагиро ментов получены в чистом кристалличе
вать из дрожжевых клеток в водный рас ском виде (рис. 9-1).
sh
.ru
9.2. Ферменты обнаруживают
все свойства белков
Все известные в настоящее время фер
менты представляют собой белки, при
ib
чем их каталитическая активность зави
сит от степени сохранности нативной
структуры белка. Например, разрушение
полипептидных цепей в результате кипя
r-l
чения фермента в растворе сильной кис Рис. 9-2. Относительные разм еры молекулы
лоты или обработки трипсином обычно фермента (мол. масса 100 ООО, диам етр 7 нм)
приводит к потере его каталитической и типичной молекулы субстрата (мол. масса 250,
активности. Это свидетельствует о том, длина 0,8 нм). Активный центр занимает лишь
незначительную часть поверхности молекулы
что первичная структура белка необходи
e
фермента. Д ля сравнения показана также
м а для проявления его ферментативной молекула воды.
активности. Более того, стоит нам толь
sh
фермента исчезает. Таким образом, для или сложные органические вещества, ко
ферментативной активности белков важ торые в этом случае носят названия ко-
ное значение имеет сохранение их пер ферментов (табл. 9-2). Для каталитиче
ak
.ru
Глю козо- 6 -фосфатаза
Случается также, что один и тот же фер
M n2 + Аргиназа
к+ Пируваткиназа (нуждает мент имеет по меньшей мере два назва
ся также в ионах M g 2 + ) ния или же два разных фермента носят
N i2 + Уреаза одно и то же название. И з-за этих и дру
Mo Н итратредуктаза гих затруднений терминологического ха
Se Г лутатионпероксидаза рактера, а также вследствие все возра
ib
стаю щ его числа вновь открываемых
ферментов было принято международ
ч а с ть ф е р м ен та, н а з ы в а е м а я ап о ф ер м ен- ное соглашение о создании систематиче
т ом , д е н а т у р и р у е т п р и н а гр е в а н и и . К о - ской номенклатуры и классификации
r-l
ф е р м е н т ы , к о т о р ы е м ы р а с с м о т р и м в гл. ферментов. В соответствии с этой систе
1 0 , ф у н к ц и о н и р у ю т к ак п ер ен о сч и к и с п е мой все ферменты в зависимости от типа
ц иф и ческих ф у н к ц и о н ал ь н ы х гр у п п катализируемых ими реакций делятся на
(таб л . 9-2). шесть основных классов, каждый из ко
e
торых включает ряд подклассов
(табл. 9-3). Каждый фермент имеет четы
рехзначный кодовый номер (шифр) и си
sh
акцию:
Кофермент Переносимые группы
АТР + D -глюкоза ADP +
+ D -глюкозо-б-фосфат.
ak
Тиаминпирофосфа- Альдегиды
таза Ф ормальное систематическое название
Флавинадениндинук- Атомы водорода этого ф ер м ен та- А 7Р: гексоза 6-фосфо-
леотид трансфераза, из которого следует, что
Никотинамидаде- Гидрид-ионы (Н ) этот фермент катализирует перенос фос
ниндинуклеотид
фатной группы с АТР на гексозу. Соглас
Кофермент А Ацильные группы
но табл. 9-3, этот фермент относится
Пиридоксальфосфат Аминогруппы
5'-дезоксиадено- Атомы водорода и к классу 2 ; ему присвоен кодовый номер
зилкобаламин алкильные группы 2.7.1.1, где первая цифра (2) обозначает
Биоцитин СО2 класс (трансферазы), вторая (7) - подкласс
Т етраги дрофолат Другие одноуглерод (фосфотрансферазы), третья ( 1 )-п о д п о д -
ные группы класс (фосфотрансферазы с гидроксиль
ной группой в качестве акцептора) и чет
11 Их структура и механизм действия описаны вертая цифра ( 1 ) - порядковый номер
в гл. 10.
фермента в его подподклассе; она по-
230 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
акции
держащейся в них энергии и что распре
деление общей энергии между молекула
ми описывается колоколообразной кри
1. Оксидоре- Перенос электронов вой. Одни молекулы обладаю т высокой
дуктазы энергией, а другие более низкой, но
2. Трансферазы Реакции с переносом
в большинстве из них содержится коли
групп
ib
3. Гидролазы Реакции гидролиза
чество энергии, близкое к среднему зна
(перенос функцио чению. Химическая реакция типа А -> Р
нальных групп на м о протекает потому, что в любой момент
лекулу воды) времени некоторая доля молекул А обла
r-l
4. Л иазы Присоединение групп дает большей внутренней энергией по
по двойным связям сравнению с другими молекулами дан
и обратные реакции ной популяции, и этой энергии оказы
5. И зомеразы Перенос групп внутри вается достаточно для достижения ими
молекулы с образова
вершины энергетического барьера
e
нием изомерных форм
6 . Л игазы О бразование С — С-,
(рис. 9-3) и перехода в активную форму,
С — S-, С— О- и С — N- называемую переходным состоянием.
связей за счет реакций Энергией активации называется количе
sh
.ru
ib
e r-l
Рис. 9-3. К атализаторы сниж аю т энергию кая энергия активации по сравнению
активации (энергетический, или активационный, с переходным состоянием реагента А
барьер) химических реакций, не влияя при этом
sh
.ru
начальную скорость катализируемой
ферментом реакции. Из такого графика можно
акции с образованием продукта реакции
определить величину Утах только путем
Р и свободного фермента Е
аппроксимирования. Точное определение этой
величины в данном случае невозможно, так как ES <=► Е + Р .
по мере повышения концентрации субстрата
начальная скорость реакции лиш ь приближается Поскольку эта вторая, более медленная
ib
кV
max’
, но никогда ее не достигает. реакция представляет собой стадию, ли
Концентрация субстрата, при которой скорость митирую щ ую скорость всего процесса,
реакции составляет половину максимальной, общая скорость катализируемой фермен
численно равна константе
том реакции должна быть пропорцио
М и хаэли са- Ментен.
r-l
нальна концентрации фермент-субстрат-
(рис. 9-4). При очень низких концентра ного комплекса ES. В ходе каталитиче
ци ях субстрата скорость реакции очень ской реакции в любой момент времени
мала, но постепенно возрастает по мере фермент существует в двух формах:
повышения концентрации субстрата. Ес в свободной, или несвязанной, форме и
e
ли мы будем измерять начальную ско в связанном виде, т. е. в составе комплек
рость каталитической реакции при раз са ES. Скорость каталитической реакции,
очевидно, будет максимальной, когда
sh
.ru
кривой, которая только приближается ная скорость и К м -к о н с т а н т а М ихаэли
к точке, соответствующей максимальной са-М ентен для данного фермента, со
скорости реакции, но никогда ее не до ответствующ ая определенному субстра
стигнет, трудно определить точно, при ту.
какой концентрации субстрата устана Э то уравнение было выведено Михаэ-
вливается Vmax. Однако благодаря тому, лисом и Ментен исходя из основного
ib
что эта кривая, представляющ ая собой предположения о том, что стадией, лим и
гиперболу, имеет одинаковую форму для тирующей скорость ферментативных ре
большинства ферментов, Михаэлис акций, является распад комплекса ES на
и М еш ен определили константу, обозна продукт и свободный фермент. В допол
r-l
чаемую в настоящее время через К м , при нении 9 - 1 представлен современный ва
помощ и которой удобно выражать точ риант вывода уравнения М ихаэлиса-
ное соотношение между концентрацией Ментен. Э то уравнение составляет осно
субстрата и скоростью катализируемой ву для анализа кинетики всех фермента
ферментом реакции. Величину К м , иначе тивных реакций. Если известны величины
e
константу М ихаэлиса-М ентен, можно К м и Кшах, то можно рассчитать ско
определить просто как концентрацию рость ферментативной реакции при л ю
бой заданной концентрации субстрата.
sh
ES ** Е + Р . (б)
.ru
Введем следующие обозначения: [Е(] общая концентрация фермента
(суммарное количество свободного и связанного фермента), [ES] - кон
центрация фермент-субстратного комплекса и [Ег] -
- [ES] - концентрация свободного, т. е. несвязанного, фермента. П о
скольку концентрация субстрата [S] обычно гораздо больше, чем [Ef],
ib
количество субстрата S, связанного с ферментом Е в любой момент
времени, можно считать пренебрежимо малы м по сравнению с общим
количеством субстрата S. Вывод уравнения начинается с определения
скоростей образования и распада фермент-субстратного комплекса ES.
r-l
1. Скорость образования ES. Скорость образования ES в реакции (а)
равна
Скорость образования = k x ([Ef] - [ES]) [S] (в)
где к i - константа скорости реакции (а). Скорость образования ES из
e
Е + Р в обратной реакции (б) очень м ала по сравнению со скоростью
прямой реакции и поэтому ею можно пренебречь.
sh
.ru
хаэлиса-М ентен, начальная скорость определяется как скорость
распада фермент-субстратного комплекса, т.е. скорость реакции (б),
константа скорости которой равна к2. Таким образом, мы можем
написать
»о = к2 [ES] .
ib
Поскольку, однако, величина [ES] равна правой части уравнения (д),
мы имеем:
fcz [Er] [S]
D° [ S ] + ( k 2 + k . l )/k1 -
r-l
Полученное уравнение можно упростить, если (к 2 + к 1)/к1 обозна
чить через К м (константа М ихаэлиса-Ментен), а к2 [Е ,] -ч ер ез
Vmax ■Knax- э т о максимальная скорость реакции, наблю даемая в ус
ловиях, когда весь фермент Е находится в форме фермент-субстрат
e
ного комплекса ES. Подставив эти две величины в уравнение (е),
получим:
sh
Ипах [S]
[S] + К м
1 [S]
2 К М + [S] '
236 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
Теория М ихаэлиса-М ентен позволяет зультате чего снижается энергия актива
количественно описать большинство ции всей реакции в целом. Образование
ферментативных реакций, включая реак фермент-субстратных комплексов можно
ции с участием двух или более субстра доказать с помощ ью прямых физико-хи
тов. Это служит еще одним убеди мических методов, например по харак
тельным подтверждением того, что фер терным изменениям спектра поглоще
ib
менты катализирую т реакции, временно ния фермента при добавлении суб
присоединяясь к своим субстратам, в ре страта.
1 _ X M + [ S]
V0 ^ max [S ]
ak
J _ = _ K m ____ 1 _ 1
vo ^шах [S ] Ктах ^ ^
мость 1/и0 от 1 [S] выражается прямой линией (рис. 1). Тангенс угла
наклона этой линии численно равен величине К м / Vтах, отрезок, отсе
каемый на оси ординат,- величине 1/V max, а отрезок, отсекаемый на оси
абсцисс,-1/Км- График, построенный в двойных обратных координа
тах (график Лайнуивера - Бэрка) имеет то преимущество, что позво
ляет более точно определить величину F max, которая на графике
зависимости v0 от [S] может быть лишь аппроксимирована (как пока
зано на рис. 2). Существуют и другие способы преобразования уравне
ния М ихаэлиса - Ментен. Каждый из них имеет свои преимущества при
исследовании кинетики ферментативных реакций.
.ru
ib
e r-l
u sh
ферментативных реакций.
.ru
Ферменты, имеющие два или более суб Мы уже рассмотрели вопрос о том, как
страта, такие, как гексокиназа или аспар- концентрация субстрата влияет на ско
татаминотрансфераза, катализирую щ ая рость простой ферментативной реакции
обратимую реакцию типа А -> Р, в которой участвует одна
молекула субстрата. Однако на самом
Аспартат + а-К етоглутараг деле во многих ферментативных реак
<=s О ксалоацетат + Г л у там ат,
ib
циях м етаболизма принимаю т участие
могут иметь различные значения К м и связываются с ферментом две (а иногда
для разных субстратов. Если фермент, даже и три) молекулы разных субстратов.
например химотрипсин, действует на не Например, в реакции, катализируемой
r-l
сколько разных субстратов, имеющих ка- гексокиназой, АТР и г л ю к о за -это суб
кую-то общую структурную особен страты, a A D P и глюкозо- 6 -ф о сф а т -про
ность, то величины К м для всех этих дукты :
субстратов могут значительно разли
АТР + Глю коза -> A D P +
чаться (табл. 9-4).
e
+ Глюкозо- 6 -фосфат.
sh
К аталаза Н2О2 25
Г ексокиназа АТР 0,4 от одного субстрата к другому. Такие ре
(мозг) D -глю коза 0,05 акции могут протекать по двум раз
D -фруктоза 1,5 личным механизмам (рис. 9-5). В реак
Карбоан- Н СО з 9 циях первого типа, называемых реакция
гидраза ми единичного замещения, два субстрата
Химотрипсин Глицил-тирози- 108 А и В связываются с ферментом Е либо
нил-глицин специфическим, либо случайным обра
N -бензоил- 2,5 зом с образованием комплекса ЕАВ, ко
тирозинамид
торый затем распадается на продукты
ß-Г алактозида- D-лактоза 4,0
за С и D. Второй класс двухсубстратных ре
Треониндегид- L-треонин 5,0 акций составляю т реакции, протекающие
ратаза по механизму двойного замещения (меха
низм типа «пинг-понг»), В этих реакциях
ГЛ. 9. Ф ЕРМ Е Н Т Ы 239
Активный
центр
.ru
Таблица 9-5. О птимальны е значения pH для
некоторых ферментов
Ф ермент Оптим ум pH
ib
Рис. 9-5. Схематическое изображение
двухсубстратных реакций, относящихся к двум Пепсин 1,5
разным классам. А. Реакция единичного Трипсин 7,7
замещения. В одних реакциях этого типа К атал аз а 7,6
субстраты А и В м огут связываться с ферментом Аргиназа 9,7
r-l
в любой последовательности, в других - Ф умараза 7,8
существует определенный порядок присоеди
Рибонуклеаза 7,8
нения А и В. Б. Реакция двойного замещ ения
(механизм типа «пинг-понг»). Первый
субстрат АХ передает г руппу X ферменту. важных для данного фермента протон-
Затем, после того как А высвобождается, донорных или протон-акцепторных
e
субстрат В (акцептор группы X) связывается с
ферментом.
групп в каталитическом центре фермента
переходить при определенных значениях
sh
молекулу фермента. Только после удале и ниже оптимума pH. Таким образом, ка
ния продукта, образовавш егося из перво талитическую активность фермента
го субстрата, второй субстрат может свя в клетках можно в какой-то мере регули
ak
.ru
А
та, которое катализирует превращение
1 м км оля субстрата (1 мкмоль = 10~6
м о ля ) в 1 мин при 25°С в оптимальных ус
ловиях действия фермента. Удельной ак
тивностью называется число единиц фер
ментативной активности в расчете на
.ru
А взаимодействуют даже с очень близкими
Зависимость начальной скорости от по строению молекулами. Хорош им при
ферментативной активности мером этого может служить фермент ас-
партаза, обнаруживаемый во многих
растениях и бактериях. Он катализирует
ib
обратимое присоединение аммиака по
двойной связи фумаровой кислоты
с образованием L-аспартата (рис. 9-8).
Однако под действием аспартазы ам
r-l
миак не присоединяется ни к какой дру
гой ненасыщенной кислоте. Аспартаза
обладает также строгой специфичностью
по отношению к оптическим и геометри
ческим изомерам: она не действует на
e
D -аспартат и не присоединяет аммиак
Активность фермента, единицы
к м алеату-геом етрическом у цис-изоме
Б
ру фумарата.
sh
субстрата, близкой к насыщ ающ ей, например мер, химотрипсин катализирует гидро
при концентрации, равной 1 0 ■К м , лиз многих пептидов и полипептидов, но
3) построение графика (Б), по оси абсцисс разрывает только те пептидные связи,
ak
СОО-
Аспартаза не действует
на следующие изомеры:
С и Фумарат
{транс- изомер)
Н— С СОО*
р ____ I I
СО О * V Малеат
+ Q н (ц ис-нзом ер)
ын/
СОО-
Аспартаза
СОО- СОО-
+ I
.ru
H3 N — С — Н Н — С — NH3+
I
СН2 L -аспартат D-аспартат
сосг coo-
ib
Рис. 9-8. Реакция, катализируемая аспартазой, проверке десятков различных синтетиче
и субстратная специфичность фермента. ских субстратов выяснилось, что химо
Аспартаза абсолютно специфична по
отношению к фумарату в прямой реакции и трипсин может расщеплять также прос
тые амидные и сложно-эфирные связи.
r-l
к L-аспартату - в обратной. Она не атакует ни
малеат {цис-изомер фумарата), ни D-аспартат. Более того, оказалось, что ароматиче
ские R-группы тирозина, триптофана
ку, называемому активным, или катали и фенилаланина, по отношению к ко
тическим, центром присоединяется мо- торы м химотрипсин проявляет специ
e
лекула субстрата, претерпевающая пре фичность в полипептидах, служат только
вращение в ходе каталитического акта. гидрофобными связывающ ими группа
При исследовании специфичности фер ми. Это подтверждается тем, что химо
sh
.ru
_ _ _ _ _ _ _ >
зу, играющий важную роль в передаче
А ктивны й центр
нервных импульсов. Ацетилхолинэстера-
за катализирует гидролиз ацетилхолина
М олекула химотрипсина (рис. 9-10), функционирующего в каче
стве нейтромедиатора в определенных
отделах нервной системы. Ацетилхолин
ib
выделяется стимулированной нервной
NH3 клеткой (нейроном) в синапс, т. е. место
^ С Н ;С Н С — N H C H C O Q - П е п т и д соединения одного нейрона с другим.
В синапсе ацетилхолин связывается с ре
r-l
О цепторами следующего нейрона, выну
ждая его проводить нервный импульс.
а
NH3
Однако, прежде чем второй импульс бу
сн2снс— n h 2 А м и д дет передан через синапс следующему
II
e
о нейрону, ацетилхолин, выделившийся
после первого импульса, должен быть ги-
NH3 дролизован ацетилхолинэстеразой в м е
sh
О сн2снс—осн.,
о
Сложный
эф ир
сте соединения нервных клеток. П ро
дукты его р ас п ад а-ац ета т и х о л и н -н е
способны действовать как нейромедиа-
торы (рис. 9-10). Н еобратимый ингиби
тор ДФФ, обладаю щ ий высокой реак
Рис. 9-9. Субстратная специфичность
u
R- группа о с т а т к а
сери н а в активном
ц ен тре
СН;!
.ru
j Ацетилхолинэстераза
CHjCOü" Ацетат ^ HF
V
НОСН2СН2— N +— СНа Холин
СНа
ib
r-l
Диизопропил-
Рис. 9-10. Н еобратим ое ингибирование фосфатный
ацетилхолинэстеразы
\ I
НС— О — Р — эфир холин-
диизопропилф торф осфатом. А. Реакция, эстеразы (ка
катализируемая ацетилхолинэстеразой. Н3С/ о талитически
Б. Реакция между диизопропилф торф осфатом неактивный)
e
и гидроксильной группой серина. Б
.ru
С—О
Классическим примером конкурентно
NH* го ингибирования служит ингибирование
сукцинатдегидрогеназы анионом м ало
V ,HI новой кислоты (рис. 9-12). Сукцинатдеги-
дрогеназа входит в состав группы фер
ментов, катализирующ их реакции цикла
ib
трикарбоновых кислот - конечный м ета
болический путь окислительного разру
шения углеводов и жиров в митохон
дриях. Э тот фермент катализирует отщ е
r-l
пление двух атомов водорода от сук-
ц и н а т а -п о одному от каждой из двух
Химически мо
дифицирован метиленовых (— С Н 2—) групп. Сукци-
ный фермент натдегидрогеназа ингибируется мало-
e
(неактивный) натом, который напоминает сукцинат
тем, что он также содержит две карбок
сильные группы, принимающие при pH
sh
.ru
СОО- са о том, по какому типу-конкурентно
му или неконкурентному-происходит
Активный центр сукци обратимое ингибирование фермента (до
н атдегидрогеназы полнение 9-3), весьма удобно преобразо
вать уравнение М ихаэлиса-М ентен в ли
нейную форму. Чаще всего для этой цели
ib
используют метод двойных обратных ве
С— О личин. Из графиков, построенных
в двойных обратных координатах, мож
Сукцинат но определить также значение константы
r-l
диссоциации комплекса фермент - инги
С—О битор. Д ля реакции диссоциации
EI Е + I
константа диссоциации равна
e
И Р ]
Ki
[EI]
sh
СОО"
COO“
I
I СОО- С=О
СН 2
I 9.14. Неконкурентное ингибирование
I I
сн 2 СН 2 СН 2 тоже обратимо, но не может
быть ослаблено или устранено
СОО- СОО-
повышением концентрации субстрата
u
COO“
Сукцинат
Малонат Оксалоацетат
В случае неконкурентного ингибирова
Субстрат Конкурентные ингибиторы
ния ингибитор присоединяется к фермен
ak
.ru
скорость реакции v0. В другой серии, наоборот, концентрация ингиби
тора поддерживается постоянной, но используются разные концентра
ции субстрата. Н а основе данных, полученных в опытах той и другой
серии, строят графики в координатах {1/[S ]; \/v 0}.
Н а рис. 1 представлены такие графики, полученные в отсутствие ин
гибитора и при двух разных концентрациях конкурентного ингибито
ib
ра. В случае конкурентных ингибиторов получается семейство прямых
с разными углами наклона, пересекающихся в одной точке на оси \/v 0.
Поскольку отрезок, отсекаемый на оси 1/v0, численно равен величине
l/Kmax* ясно, что Vmax не изменяется в присутствии конкурентных инги
r-l
биторов. Это означает, что независимо от концентрации конкурентно
го ингибитора всегда можно подобрать достаточно высокую концен
трацию субстрата, при которой субстрат вытеснит конкурентный
ингибитор из активного центра.
e
sh
Н еконкурентное
ингибирование
u
Б е з ингибитора
ak
Наклон =
Рис. 1. Рис. 2.
.ru
и изменять при этом активность их ката
литических центров. П римером может том связь оказывается не только распо
служить ингибирование L -треониндеги- ложенной в непосредственной близости
дратазы L-изолейцином, обсуждаемое от каталитической группы, но и правиль
в разд. 9.18. но ориентированной по отношению
к ней. В результате вероятность того, что
ib
9Л5. Факторы, определяющие комплекс ES достигнет переходного со
каталитическую стояния, сильно увеличивается
эффективность ферментов (рис. 9-13).
Напряжение и деформация: индуциро
r-l
Ферменты повы ш аю т скорости ката ванное соответствие. Присоединение
лизируемых ими реакций в 1 0 8 —1 0 2 0 раз. субстрата может вызывать конформа-
Например, уреаза ускоряет гидролиз м о ционные изменения в молекуле фермен
чевины в 101 4 раз при pH 8 и 20°С. Как же та, которые приводят к напряжению
удается ферментам проявлять такую не
e
структуры активного центра, а также не
обычайно высокую каталитическую ак сколько деформирую т связанный суб
тивность в столь мягких условиях? страт, облегчая тем самым достижение
Существуют четыре основных фактора
sh
— СООН
— NH 3
— SH
—С = С Н
/ \+
H N \ ^ NH
С\
Н
.ru
Некоторые протон-ак-
Конформационное цепторные группы
изменение
— СОО-
—n h 2
—S-
.ru
го фермента пока не известно точного иболее важных успехах в этой области,
механизма, обеспечивающего ускорение достигнутых благодаря рентгенострук
той или иной специфической для него турному анализу, речь пойдет в дополне
реакции. нии 9-4, в котором представлена целая
«галерея» структур ферментов.
ib
Дополнение 9-4. Структура некоторых ферментов, определенная с по
м ощ ью дифракции рентгеновских лучей.
r-l
М етодом рентгеноструктурного анализа было исследовано большое
число кристаллических ферментов. Результаты таких исследований ча
сто сопоставляю тся с данными, полученными химическими методами
e
при 1 ) определении аминокислотной последовательности ферментов,
2 ) изучении их субстратной специфичности, 3) исследовании действия
.ru
ib
r-l
ми в Оксфордском университете. Полипептидная цепь, включая
R-группы и атомы Н, показана красным цветом. Участок молекулы
e
субстрата, обозначенный черными линиями, лежит в канале (или щели)
молекулы лизоцима и удерживается в этом положении специфически
ми водородными связями (изображены ярко-красными линиями) м е
sh
ной линией.
Фермент
u sh
ak
Молекула
воды Промежуточный
комплекс
ГЛ. 9. Ф Е Р М Е Н Т Ы 253
.ru
пептидов хим от рипсином
ib
тивным центром так, что ее гидрофобная ориентирующ ая группа
плотно прилегает к внутренней поверхности гидрофобного «кармана»
активного центра (рис. 4; разд. 9.11). При этом расщ епляемая пептид
r-l
ная связь оказывается рядом с гидроксильной группой Ser-195 (рис. 5).
Рис. 10. Ацильная связь между субстратом Рис. 11. Второй продукт уходит из активного
и ферментом разрывается. центра.
Комплекс
фермент - продукт
Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
дролизуется с образованием второго продукта, представляющего со
бой карбоксильную часть субстрата. П ри этом протон вновь присоеди
няется к серину (рис. 8 и 9) и образуется комплекс ф ерм ент-продукт
(рис. 10). Второй продукт уходит затем из активного центра, и катали
тический цикл завершается (рис. 11). Ацилфермент представляет собой
ключевой промежуточный комплекс в этом варианте ковалентного ка
ib
тализа. И м идазольная группа гистидина 57 участвует в перемещении
протона по механизму общего кислотно-основного катализа.
Было высказано предположение, что роль остатка аспарагиновой
кислоты 1 0 2 , несущего больш ой отрицательный заряд, заключается
r-l
в том, что он усиливает подвижность имидазольной группы гистиди
на 57, в результате чего последний становится способным притяги
вать атом водорода серина 195. Однако возникаю т сомнения относи
тельно того, существует ли на самом деле такая «эстафета»
электрических зарядов, поскольку аспарагиновая кислота 1 0 2 и ги
e
стидин 57 находятся слишком далеко друг от друга. Н о какова бы
ни бы ла функция остатка аспарагиновой кислоты 1 0 2 , ясно, что он
необходим для каталитического действия фермента.
sh
.ru
D -гл ю ко за
ib
r-l
К ом плекс г е к с о к и н а з а - г л ю к о з а
Г ек со ки н аза
e
своими специфическими центрами, после чего происходит каталити
sh
молекул различных ферментов, что дает тов. Активный центр часто представляет
возможность сравнивать их с соответ собой щель (или углубление) на поверх
ствующими структурами некаталитиче ности молекулы фермента; по своей ф ор
ских глобулярных белков. Такие сравне ме эта щель оказывается комплементар
ния не выявили никаких специфических ной входящей в нее молекуле субстрата.
особенностей в трехмерной структуре У одних ферментов активные центры вы
ферментов, по которым они отличались стланы петлями полипептидных цепей,
бы от некаталитических белков. Однако находящихся в ß-конформации, а у дру
ферменты, принадлежащие к одному гих они имеют форму «кармана», вну
классу (например, ферменты, катализи тренню ю поверхность которого обра
рующие перенос фосфатных групп от зую т аминокислотные остатки с заря
АТР на молекулы, играющие роль акцеп женными полярными группами. В неко
торов фосфата) могут обладать какими- торых случаях рентгеноструктурный м е
то общими для всех них структурными тод позволил определить структуру фер
особенностями. мент-субстратного комплекса. П риме
256 Ч АСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
пилфторфосфатом образуется ковалент и ее структура приближается к структуре
ное производное остатка серина в поло переходного состояния.
жении 195 полипептидной цепи; отсюда
следует, что этот остаток входит в состав
9.17. В ферментных системах
активного центра. П о данным других хи
есть «дирижер», роль которого
мических исследований, остаток гистиди
выполняет
ib
на в положении 57 и остаток аспарагино
pei у ли'горный фермент
вой кислоты в положении 1 0 2 также
участвуют в каталитическом процессе. Ферменты, осуществляющие в клетке
Хотя эти остатки заним аю т в полипеп- различные метаболические процессы,
r-l
1 идиом остове положения, находящиеся например превращение глюкозы в м о
далеко друг от друга, и даже в разных по лочную кислоту в скелетных мышцах
липептидных цепях, данные рентгено или синтез аминокислот из более про
структурного анализа свидетельствуют стых предшественников, организованы
о том, что в трехмерной структуре свер в виде последовательных цепей или си
e
нутой нативной молекулы химотрипсина стем, в которых они действуют согласо
(дополнение 9-4, Б) они расположены ванно. В таких ферментных системах
sh
тивного центра. Хотя до сих пор точно не роль «дирижера», который задает ско
известно во всех деталях, как функци рость всей последовательности реакций,
онирует химотрипсин, механизм его так как он катализирует лимитирую
действия мы понимаем лучше, чем меха щую стадию, т.е. самую медленную ре
низм действия лю бого другого фер акцию, определяющую скорость всего
мента. процесса в целом. Такие ферменты-«ди-
Рентгеноструктурные исследования рижеры» не только выполняют катали
выявили еще одну важную особенность тическую функцию, но и обладаю т спо
механизма действия ферментов, а имен собностью повыш ать или понижать
но возникновение конформационных из свою каталитическую активность в от
менений в молекуле фермента в процессе вет на определенные сигналы. Благода
присоединения к ней субстрата и после ря действию подобных ферментов ско
дующ его их взаимодействия. Яркий при рость каждой последовательности м ета
мер этого-гексоки наза (разд. 9-3), ката болических реакций постоянно изме-
ГЛ. 9. Ф ЕРМ Е Н Т Ы 257
9.18. Аллостерические
ферменты регулируются путем неко
валентного присоединения
к ним молекул модуляторов
.ru
нарную концентрацию, т.е. он будет
произведен в больш ем количестве, чем
нужно клетке, конечный продукт на
чинает действовать как специфический
В ингибитор первого, или регуляторного,
фермента. В результате функционирова
ib
Рис. 9-17. Схематическое изображение
мультиферментной системы, осуществляющей
ние всей ферментной системы в целом
превращение А в Р в ходе четырех замедляется, для того чтобы вновь при
последовательных ферментативных реакций. вести скорость выработки конечного
продукта в соответствие с потребностя
r-l
ми клетки. Регуляция такого типа назы
няется, почти мгновенно приспосабли
вается ингибированием по принципу
ваясь к изменяющимся потребностям
обратной связи или ретроингибирова
клетки в энергии и играющих роль нием. Классическим примером подобно
строительных блоков молекулах, необ го аллостерического ингибирования м о
e
ходимых для роста и обновления кле
жет служить бактериальная ферментная
ток. В большинстве мультиферментных система, катализирую щ ая превращение
систем фермент-«дирижер» катализи
sh
.ru
и «место» (или «участок»), Аллостериче
ские ф ер м ен ты -это ферменты, имею
Е, щие «другие центры».
П о своим свойствам аллостерические
D ферменты значительно отличаю тся от
простых нерегуляторных ферментов,
ib
1Е$
СОСГ
♦ I Каталитическая Регуляторная
H'jN—С—Н субъединица субъединица
r-l
I
'— н — С— СН3 L-изолей
цин
СН2
I
СН3
e
Рис. 9-18. Ингибирование по принципу
обратной связи процесса превращ ения
L-треонина в L-изолейцин, происходящего
sh
.ru
гично тому, как каталитический центр
специфичен по отношению к своему м олекулярным сигналом, означающ им,
субстрату. Во-вторых, молекулы алло что фермент должен «поспешить»
стерических ферментов обычно намного (рис. 9-20). Ч асто в роли активирующ е
крупнее и более сложно устроены по го м одулятора такого типа выступает
сравнению с молекулами простых фер сам а молекула субстрата. Аллостериче
ib
ментов. Больш инство из них состоит из ские ферменты этого класса, назы
двух или более полипептидных цепей, ваемые гомотропными (так как модуля
или субъединиц. И наконец, в-третьих, тором и субстратом служит одно и то
кинетика реакций, катализируемых ал- же соединение), имею т два или большее
r-l
лостерическими ферментами, обычно число центров связывания для субстра
значительно отклоняется от классиче та. Эти центры связывания нередко вы
ского уравнения М ихаэлиса-М ентен; полняю т двойную функцию, действуя
это один из признаков, по которому они и как каталитические, и как регуля
торные центры. Аллостерические фер
e
были впервые обнаружены.
менты этого типа реагируют на ситуа
9.19. Аллостерические ции, при которых субстрат накапливает
sh
.ru
Д ля аллостерических ферментов соот характерна гиперболическая кривая на
ношения между концентрацией субстра сыщения кислородом. П одобно миогло-
та и скоростью реакции отличаю тся от бину, многие нерегуляторные ферменты
соотношений, отвечающих классическо также имеют только один центр связы
му уравнению М ихаэлиса-М ентен, при вания для своих субстратов и одну по
чем характер этих различий зависит от липептидную цепь; их поведение описы
ib
того, подчиняется ли фермент действию вается гиперболической кривой насыще
ингибирующего или активирующего ния субстратом.
модулятора. У аллостерических фермен Гемоглобин же содержит четыре цен
тов гак же, как и у нерегуляторных фер тра связывания, по одному в каждой из
r-l
ментов, наблюдается «насыщение» суб четырех субъединиц, причем все эти
стратом, когда последний присутствует центры действуют кооперативно. Вспом
в достаточно больших концентрациях, ним, что когда один центр связывания ге
однако график зависимости начальной моглобина занят молекулой кислорода,
скорости реакции от концентрации суб
e
у других центров связывания сродство
страта для некоторых аллостерических к кислороду возрастает. Это проявляется
ферментов представляет собой сигмоид в том, что после связывания первой м о
ную кривую, а не классическую гипербо
sh
.ru
А fi
Рис. 9-21. Кривые зависимости активности
фермента от концентрации субстрата,
характерные для аллостерических ферментов.
ib
А. Сигмоидная кривая, полученная для
гом отропного фермента, субстрат которого
служит также положительным (активирующим)
модулятором . Величина К 0 5- э т о концентрация
субстрата, при которой скорость реакции равна
r-l
половине максимальной. О братите внимание,
что относительно небольш ое повышение
концентрации субстрата в крутой части кривой
может вы звать весьма значительное увеличение
скорости реакции. О братите внимание также на
то, что эта кривая напоминает кривую
e
насыщения гемоглобина кислородом.
Б. Влияние полож ительного (активирующего)
м одулятора ( + ), отрицательного
(ингибирующего) м одулятора ( - ) и отсутствия
sh
.ru
Э тот аллостерический регуляторный фермент (рис. 1) имеет два ка
талитических кластера, в каждом из которых находится по три свер
нутые в третичную структуру полипептидные цепи и три регуляторных
кластера (показаны красным цветом), содержащие по две полипеп
тидные цепи. Один каталитический кластер с тремя полипептидными
цепями в свернутой конформации обведен более жирной линией. За
ib
ним виден другой каталитический кластер. Структуру этого фермента
установили по данным рентгеноструктурного анализа Уильям Лип-
ском и его сотрудники в Гарвардском университете1. Вопросы, свя
занные с ролью этого фермента в синтезе нуклеотидов и с его регуля
r-l
цией, будут рассмотрены в гл. 2 2 .
Каталитический кластер,
содержащий три каталити
ческие цепи Регуляторный
кластер, содер
e
жащий две р е
Регуляторный гуляторные цепи
sh
кластер
u
ak
Второй каталити
ческий кластер,
расположенный
Рис. 1 . Три структуры, обведенные жирными
позади первого
линиями, представляю т собой три
полипептидные цепи одного из каталитических
кластеров. Второй каталитический кластер,
также содержащ ий три цепи, находится позади
Регуляторный первого. Регуляторные кластеры выделены
кластер красным цветом.
.ru
Некоторые аллостерические ферменты сильной группе. Эти остатки фосфосери-
имеют чрезвычайно сложную структуру на необходимы для максимальной актив
и содержат много полипептидных цепей. ности фермента. Фосфатные группы,
К ним относится, например, такой соединенные с остатками серина, м ож
важный фермент, как аспартат- карба- но удалить из фосфорилазы а с по
моилтрансфераза, которая состоит из 1 2 м ощ ью фермента, называемого фосфа-
ib
полипептидных цепей, образующих ка тазой фосфорилазы, который катализи
талитические и регуляторные субъеди рует гидролитический разрыв свя
ницы. В дополнении 9-5 показана очень зи между фосфатом и остатком се
сложная четвертичная структура этого рина.
r-l
фермента, установленная по данным
рентгеноструктурного анализа. Аспар Фосфатаза
л фосфорилазы
тат - карбамоилтрансфераза катализи Фосфорилаза а + 2Н 2О --------------- »
рует важную реакцию в биосинтезе ну (Более актив
e
клеотидов. Более подробно мы рассмо ная форма)
трим его действие и регуляторные свой -> Ф осфорилаза b + 2 P t
ства в гл. 2 2 . (Менее ак
sh
тивная фор
ма)
1>.22. Некоторые ферменты
В этой реакции фосфорилаза а превра
регулируются путем
щается в фосфорилазу Ь, гораздо менее
обратной
активно катализирую щ ую распад гли
u
ковалентной модификации
когена. Таким образом, активная ф ор
Еще один важный класс регуляторных м а гликогенфосфорилазы превращается
в относительно неактивную форму в
ak
2АТР + Фосфорилаза Ь ■
Киназа фосфоРида ^ , примере гликогенфосфорилазы, суще
(Менее актив ствуют и другие способы ковалентной
ная форма) модификации ферментов, такие, как ме
-* 2A DP .+ Фосфорилаза а тилирование определенных аминокис
(Более актив лотных остатков или присоединение
ная форма) к ним аденилатных групп. Другие при
меры ковалентной модификации регуля
Итак, распад гликогена в скелетных
торных ферментов будут рассмотрены
мышцах и печени регулируется путем из
в последующих главах.
менения количественных соотношений
Некоторые более сложные регуля
активной и неактивной форм фермента.
торные ферменты модулируются посред
Переход из одной формы в другую со
ством ковалентных и нековалентных м е
провождается изменениями четвертич
ханизмов. Такие ферменты катализи
ной структуры фермента, затрагиваю щ и
.ru
руют реакции, представляющие собой
ми и его каталитический центр. Есте
наиболее важные этапы м етаболизма;
ственно, что при этом каталитическая
поэтому они взаимодействуют со множе
активность фермента изменяется.
ством регуляторных метаболитов, осу
Хотя в большинстве известных случаев
ществляющих как аллостерическую, так
регуляция действия ферментов путем их
и ковалентную модификацию этих фер
ковалентной модификации осущест
ib
ментов. К подобным ферментам отно
вляется через фосфорилирование и де-
сится только что рассмотренная глико-
фосфорилирование специфических остат генфосфорилаза. Хотя регуляция этого
ков серина, как только что описано на
фермента осуществляется в основном че
r-l
рез ковалентную модификацию, как опи
R-группы специфических сано выше, возможно также и некова
остатков серина лентное (аллостерическое) взаимодей
ствие его с аденилатом, который являет
ся активирующ им м одулятором фосфо
e
рилазы b (гл. 2 0 ).
Другой пример - глутаминсинтетаза
sh
Катод
9.23. Многие ферменты
существуют в нескольких
формах Старт
Известно много ферментов, которые
существуют не менее чем в двух молеку Л Д Г,
лярных формах, встречающихся у одного
и того же вида, в одной и той же ткани, Л/1Г 2
и даже в одной и той же клетке. В таких
случаях все эти формы фермента катали ЛДГз
зируют одну и ту же реакцию, но, так как
они различаю тся по своим кинетическим ЛДГ4
свойствам, а также по аминокислотному
составу или последовательности амино
.ru
ЛДГ 5
кислотных остатков, их можно выделить
и охарактеризовать с помощ ью соответ
ствующих методов. Такие множе
ственные формы ферментов называю тся
изоферментами или изозимами. Одним
из первых ферментов, у которого были
ib
+
обнаружены такие формы, бы ла лактат- А нод
дегидрогеназа, катализирую щ ая обрати
мую окислительно-восстановительную Рис. 9-23. Электрофоретическое разделение
разных молекулярных форм
реакцию :
r-l
лактатдегидрогеназы (ЛДГ). Изоферменты
Л актат + NAD + Пируват + N A D H + обычно обозначаю тся цифровыми индексами,
указываю щ ими относительную скорость их
+ Н \
перемещения при электрофорезе
В ходе этой реакции лактат теряет два в полиакриламидном или крахм альном геле
в стандартных условиях.
e
атома водорода и в результате окисляет Разны е формы лактатдегидрогеназы
ся в пируват (NAD + и N A D H - э т о окис обозначаю тся также и буквами, как указано
ленная и восстановленная формы кофер- в тексте.
sh
.ru
ским модуляторам. Распространение правильных» аминокислот, появившихся
изомерных форм того или иного фермен в результате мутации участков Д Н К , ко
та в различных тканях и органах опреде дирующей этот фермент. Каталитиче
ляется по меньшей мере четырьмя ф акто ская активность фермента зависит не
рами. К ним относятся: только от наличия определенных амино
1. Различия в каких-либо особенностях кислотных остатков в каталитическом
ib
метаболизма в разных органах. Н а и регуляторном центрах, но и от общей
пример, наличие разных форм лактат трехмерной структуры фермента. П оэто
дегидрогеназы в сердечной и скелет му замена одного аминокислотного
ной мышцах отражает именно такие остатка в каком-либо важном месте цепи
r-l
различия. может привести к изменению или даже
2. Различия в локализации и метаболиче к полной утрате каталитической активно
ской роли данного фермента в клетках сти фермента, подобно тому как замена
одного и того ж е типа. Например, всего лиш ь одного аминокислотного
фермент малатдегидрогеназа суще
e
остатка в молекуле гемоглобина вызы
ствует в разных формах в м итохон вает появление серповидноклеточного
дриях и ш иозоле. где эти изофер- гемоглобина с нарушенной функцией
sh
.ru
Болезнь Т е я - Гексозаминидаза А мента максимальной скорости Vmm, при
Сакса которой практически весь фермент нахо
дится в форме комплекса ES и, следова
пливающиеся в организме вследствие тельно, насыщен субстратом. Такая зави
какого-либо генетического дефекта, бу симость между концентрацией субстрата
дут превращ аться в нормальны е про
ib
и скоростью ферментативной реакции
дукты при прохождении крови через кап описывается гиперболической кривой.
сулу, содержащую активный фермент. Концентрация субстрата, при которой
Генетические изменения в ферментах скорость реакции составляет половину
r-l
не всегда приводят к вредным послед величины Vmax, получила название кон
ствиям. Ч асто они проявляю тся в изме станты М ихаэли са-М ен тен (Км)- Эта
нении второстепенных признаков орга константа является характеристикой ка
низма, таких, как цвет глаз или волос талитического действия фермента приме
(рис. 9-24). И ногда в результате какого- нительно к какому-то определенному
e
либо генетического нарушения фермент субстрату. Уравнение М и хаэли са-М ен
начинает функционировать более эффек тен
тивно, что дает организму некоторое
sh
.ru
нельзя устранить путем добавления суб ное краткое введение в эту область науки.
[И меется перевод: Фёршт Э. Структура
страта. Ферменты ускоряют химические
и механизм действия ф е р м ен то в-М .: Мир
реакции благодаря тому, что обеспечи 1982.]
ваю т правильную ориентацию молекулы Friedmann H., H erbert (ed.). Benchmark Papers
субстрата в непосредственной близости in Biochemistry, vol. 1, Enzymes, Hutchinson
от каталитического центра, предоста Ross, Stroudsburg, Pa., 1981. Сборник класси
ib
вляю т для катализа протон-донорные ческих статей по химии ферментов с ком
и протон-акцепторные группы, образую т ментариями редактора. Чрезвычайно инте
при помощ и ковалентных связей неста ресная книга.
Newsholme Е. A., Start С. Regulation in
бильные промежуточные соединения
r-l
M etabolism, Wiley, New York, 1973. В главах
с субстратом и вы зы ваю т напряжение в
1 и 2 рассматриваю тся свойства регуля
молекуле субстрата или ее деформацию. торных ферментов.
Кром е каталитической активности не Segel L .H . Enzyme Kinetics: Behavior and
которы е ферменты обладаю т также и ре Analysis of Rapid Equilibrium and Steady
гуляторной активностью. Они служат
e
State Enzyme Systems. Wiley, New York, 1975.
как бы «дирижерами», задаю щ им и темп Для более подготовленных читателей.
метаболическим процессам. Некоторые Статьи
sh
.ru
(пептидов), состоит из одной полипептид
Вопросы и задачи ной цепи (307 аминокислотных остатков).
1. Сохранение сладкого вкуса кукурузы. С лад Три главные каталитические группы в ак
кий вкус зерен в свежесобранных початках тивном ц е н т р е -э т о аргинин 145, тирозин
кукурузы обусловлен высоким содерж а 248 и глутаминовая кислота 270 (номер
нием в них сахара. Кукуруза, которую про указывает положение аминокислоты в ам и
даю т через несколько дней после сбора,
ib
нокислотной последовательности фермен
имеет более низкую сахаристость, так как
та).
около 50% свободного сахара в зернах пре а) Если бы карбоксипептидаза представля
вращ аю тся в крахмал в течение одного дня л а собой идеальную а-спираль, то на ка
хранения. Ч тобы сохранить сладкий вкус ком расстоянии (в нм) друг от друга на
r-l
свежесобранной кукурузы, очищенные по ходились бы аргинин 145 и тирозин 248;
чатки помещ аю т на несколько минут в ки аргинин 145 и глутаминовая кислота 270?
пящую воду («бланшируют»), а затем охла (П одсказка: см. рис. 7-6).
ж даю т в холодной воде. Кукуруза, обрабо б) Объясните, каким образом эти три ами
танная таким образом и хранящаяся нокислоты, расположенные так далеко
e
в заморож енном виде, сохраняет свой слад л р у г o r друга в полипептидной цепи, м о
кий вкус. В чем биологическая основа этой гут катализировать реакцию, участники
обработки? которой заним аю т пространство разм е
sh
.ru
(см., например, дополнение 9-2), эти вели тивности пептидазы из тонкого кишечника,
чины мож но определить, измерив скорости гидролизую щей дипептид глицилглицин:
реакции при возрастаю щ их концентрациях Глицилглицин + Н 2О -» 2 Глицин,
субстрата. Исходя из определения Г^ах и
К м , оцените приблизительные значения были получены следующие эксперимен
этих величин для ферментативной реакции тальны е данные:
по следующим данным:
ib
[S], мМ 1,5 2,0 3,0 4,0 8,00 16,0
[S ], М К м к м о л ь/ л -м и н
Продукт, 0 ,2 1 0,24 0,28 0,33 0,40 0,45
2 ,5 -1 0 ” 6 28 м г /м и н
r-l
4 ,0 - 1 0 “ 6 40
1 •1 0 “ 5 70
2 -1 0 “ 5 95 П о этим данным определите графическим
4 - 10 ~ 5 112 путем (см. дополнение 9-2) величины К м и
М О " 4 128 Утзх для этого препарата фермента.
e
2 ' 1 0 “ 3 139 10. Число оборотов карбоангидразы. Карбоан-
М О ’ 2 140 гидраза эритроцитов, имеющ ая молеку
лярную массу 30 0 0 0 ,-один из самых ак
sh
ние пирувата до лактата. Фермент был по С О 2 из тканей в легкие. Рассчитайте число
лучен в виде концентрированного раствора. оборотов карбоангидразы, если при опти
Затем оба студента измерили ферментатив мальных условиях 1 0 мкг чистой карбоан
ak
.ru
тепловой энергии принимает конф орма страта. При проведении опыта в присут
цию беспорядочного клубка. При инкуба ствии ацетазолам ида получается нижняя
ции раствора гексокиназы в течение 1 2 кривая. Исходя из анализа кривых и ва
мин при 45°С фермент теряет 50% актив ших знаний о кинетических свойствах кон
ности, но если гексокиназа инкубируется курентных и неконкурентных ингибиторов
при 45°С в присутствии очень большой ферментов, определите природу ингиби
рования ацетазоламидом. Объясните, на
ib
концентрации одного из ее субстратов -
глю козы, то она утрачивает только 3% ак чем основано ваше утверждение.
тивности. Объясните, почему тепловая
денатурация гексокиназы замедляется
в присутствии одного из ее субстра
r-l
тов.
13. К л и н и ческ ое прим енение ди ф ф еренци ро
в а нного ингибирования ф ерм ент ов. В сы
воротке крови человека содержатся фер
менты, известные под названием кислых
e
фосфатаз, которые гидролизую т биологи
ческие фосфоэфиры в слабо кислой среде
(pH 5,0):
sh
R—О—РОз~ + Н2О -
- R—ОН + НО—РО|~
u
роцитах, печени, почках, селезенке и пред то использовался как антифриз для авто
стательной железе (простате). С медицин мобилей, очень токсичен; прием внутрь
ской точки зрения фермент из предста всего лиш ь 30 м л м етанола мож ет приве
тельной железы имеет весьма важное сти к смерти. Такая необычайно высокая
значение, так как повышение его концен токсичность м етанола обусловлена дей
трации в крови часто служит указанием на ствием не столько самого метанола,
рак простаты. Ф осфатаза из простаты сколько продукта его м е т а б о л и зм а -ф о р
сильно ингибируется тартрат-ионами, мальдегида. М етанол бы стро окисляется
тогда как кислые фосфатазы из других до формальдегида под действием фермен
тканей не ингибируются этими ионами. та печени алкогольдегидрогеназы:
Как можно использовать эти данные для
разработки метода специфического опре NAD+ + С Н 3— О Н -
деления активности кислой фосфатазы из метанол
предстательной железы в сыворотке крови -► N A D H + Н + + Н 2 С = О
человека? ф ормальдегид
272 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
вую кислоту в положении 52. Величины
рK ' карбоксильных групп боковых цепей
этих двух остатков равны соответственно приведенной на рисунке кривой, характе
5,9 и 4,5. В каком ионизированном состоя ризующей зависимость активности лизо
нии (протонированном или депротониро- цима от pH, исходя из того, что нам из
ванном) находится каждый из этих амино вестно, в каком состоянии ионизации
кислотных остатков в оптимуме pH
ib
находятся эти два аминокислотных остат
лизоцима? Как мож но объяснить форму ка?
e r-l
u sh
ak
Г Л А В А 10
.ru
Д ля каталитической активности м но ментов, поскольку это позволило понять,
гих ферментов требую тся те или иные ко что сохранение здоровья людей зависит
факторы небелковой природы. Такими от их правильного питания.
кофакторами могут бы ть органические В этой главе собрана информация
соединения (в этом случае их называю т о строении витаминов, коферментов и не
коферментами) или какие-либо неоргани которых необходимых для организма
ib
ческие вещества, например м еталлы (в минеральных веществ, а также об их
форме ионов). У одних ферментов кофак функционировании в качестве коф акто
торы непосредственно участвуют в ката ров различных ферментов; в связи с этим
литическом процессе, у других же они вы ее можно рассматривать как введение
r-l
полняю т функцию промежуточных пере к последующим главам, в которых речь
носчиков определенных функциональных пойдет о клеточном метаболизме. В них
групп от молекулы субстрата к фермен м ы вновь вернемся к коферментам и не
ту. Хотя такие кофакторы присутствуют органическим веществам и подробно
в клетках в крайне незначительных коли расскажем, каким образом недостаток
e
чествах, они необходимы для действия витаминов и минеральных солей может
многих ферментов и потому играю т жиз привести к серьезным нарушениям опре
sh
.ru
трациях. 10.2. Витамины являются
В настоящее время известно 13 раз важными компонентами
личных витаминов, которые вместе с ос коферментов и простетических
новными питательными веществами - групп ферментов
углеводами, жирами и б ел к ам и -до л ж н ы
содержаться в пищевом рационе людей
ib
О биохимической функции некоторых
и животных многих видов, чтобы обеспе витаминов впервые стало известно в 30-е
чить нормальный рост и жизнедеятель годы благодаря слиянию двух направле
ность организма. Термин «витамин» ний исследований, одно из которых име
r-l
впервые был использован для обозначе ло целью изучение химической струк
ния специфического микрокомпонента туры коферментов, а другое-изучение
пищи органической природы, предотвра строения витаминов. В 1935 г. немецкому
щ аю щ его обусловленную неполно биохимику О тто Варбургу удалось выде
ценным питанием болезнь бери-бери, рас лить и установить структуру кофермента
e
пространенную когда-то в странах, насе (сейчас его назы ваю т никотинамидаде-
ление которых употребляло в пищу ниндинуклеотидфосфатом), необходимо
много риса. Поскольку этот микроком- го для катализа определенных окис
sh
В дальнейшем, когда были открыты м но торое задолго до того было впервые вы
гие другие незаменимые органические делено из табака. Несколько позже аме
микрокомпоненты, оказалось, что далеко риканские биохимики Д. Уайн Улли и
ak
.ru
компонент кофермента, необходимого они выполняю т в качестве коферментов.
для ферментативного катализа ряда жиз Биохимические функции жирораство
ненно важных окислительных реакций римых витаминов A, D, Е и К, предста
Несмотря на очень простое строение вляющих собой маслянистые, плохо
молекулы никотинамида, больш инство растворимые в воде вещества, пока еще
животных не может синтезировать его не совсем понятны. К ром е этих, хорошо
ib
в достаточных количествах и поэтому известных витаминов, существуют и дру
должно получать его с пищей. гие вещества, которые необходимы опре
Вскоре после этого выяснилось, что деленным видам, но обычно не считаю т
другие витамины также функционируют ся витаминами. К ним относятся карни-
r-l
в качестве компонентов коферментов т ин (разд. 18.2), и н о зи т о л и л и п о ева я
и простетических групп ферментов. С о к и сло т а (гл. 26).
держание витаминов в пище может быть Сначала м ы рассмотрим природу
крайне незначительным, поскольку ко- и свойства водорастворимых витаминов,
ферменты, выполняющие функции ката их функционирование в качестве компо
e
лизаторов, необходимы клеткам в очень нентов тех или иных коферментов, а так
низких концентрациях. Например, мини же приведем примеры ферментативных
мальное количество витамина В6, кото реакций, в которых участвуют эти кофер
sh
Водорастворим ые
Тиамин Тиаминпирофосфат Декарбоксилирование
а-кетокислот
Рибофлавин Флавинмононуклеотид, Окислительно-восстано
флавинаденинднну- вительные реакции
клеотид
Н икотиновая кислота Никотинамидаденин- О кислительно-восстано
динуклеотид, никотин- вительные реакции
амид адениндинуклео-
тидфосфат
П антотеновая кислота Кофермент А Перенос ацильных
.ru
групп
Пиридоксин П иридоксальфосфат Перенос аминогрупп
Биотин Биоцитин Перенос С О 2
Фолиевая кислота Тетрагидрофолиевая Перенос одноуглерод
кислота ных групп
Витамин В ! 2 Дезоксиаденозилкобал- Перенос связанного
амин с углеродом атом а во
ib
дорода на соседний
атом углерода
Аскорбиновая кислота Не известна Кофактор реакций гид-
роксилирования
Жирорастворимые
r-l
Витамин А Ретиналь Зрительный процесс
Витамин D 1,25-дигид роксихоле- Регуляция обмена С а 2 +
кальциферол
Витамин Е Не известна Защита мембранных ли
пидов
Витамин К Не известна К офактор реакций кар-
e
боксилирования
sh
Н
nh2
I
„С с —S
N ^ ^ C — CHj — I ° H
C = C — СН,— СН,
Н3 С — С ^ /С Н
N СН,
NH, Н
I
С—S
о- о-
.ru
ЧС — СН,— N '
\ I I
С = С — СН2 — СН2 — О — Р — О — Р — О -
Н3 С— С ^ ,СИ
N I II II
СН, О О
а-Гидроксиэтилтиаминпирофосфат - промежуточная
ib
форма, переносящая "активную" ацетальдегидную группу
(выделена красным цветом)
Н
I
С Н .- С - О Н
r-l
NH2
С— S
\ ^ О- О-
N С — СН,— N
I II V
Н3 С— С ^ /С Н С = С — СН 2 — СН 2 — О — Р — О — Р — О
e
I II II
СН, О О
Суммарная реакция
Пируват де-
СНз— С— С О О -+ Н2О каРб-0-?си-л£ 1 асН з— С— Н + НСО,
u
О О
Пируват Ацетальдегид
ak
Отдельные стадии
Рибофлавин
О
н II
.с .С .
Н3С С^ ^С ' % NH Циклическая
I изоаллокса-
Н3 С— С С = О зиновая сис
"N ' тема
Флавинадениндинуклеотид (FAD).
Реакционноспособная группа выде -
СН, лена красным цветом
I '
НСОН
I
НСОН
I
НСОН
.ru
I
СН2ОН
Флавинмононуклеотид (FMN). Реак
ционноспособная группа выделена
красным цветом
ib
Н
н 3с— ^ Cy N^ y - N H
Н>С—С ^ С ч 1 с ^ ^ С = О
r-l
Н I
сн2
I I NH,
нсюн 0 I
НСОН 1
e
-О — Р = О N
I /
НСОН НС I
0
1
\ СН
sh
СНг СН2 о
I
0
т
О = Р— О"
1
О~ ОН ОН
u
циклической системы (рис. 10-4) он имеет Рис. 10-4. Рибофлавин (витамин В (2) и его
ярко-желтую окраску. В дальнейш ем бы коферментные формы.
ло показано, что рибофлавин входит
ak
О н О
Н и Н Т II
/ н СН3 — x 'C/ N ^ C / 'C' x NH СН3 — C ^ C^ C ^ N^ C / C ^ N H
s. + I II I I = s + I II II I
Чн СН- Ч - С^ Ч - С = 0 ^ " S ^ S ^ V * " 0
Н | н I I
R R h
Субстрат Флавиновый нуклеотид Дегидрированный Восстановленный флавиновый
субстрат нуклеотид
.ru
катализируемый флавиндегидрогеназой.
Символ R обозначает остальную часть
флавинового нуклеотида. Н едостаточное содержание в пище ни
котиновой кислоты (рис. 1 0 - 6 ) вызывает
FM N и FAD соединены с молекулами у людей заболевание, которое называет
ферментов не ковалентно. В состав ак ся пеллагрой (от итальянского слова, оз
тивного центра некоторых флавиндеги- начающего «ш ерш авая кожа»). П еллагра
ib
дрогеназ входят также ионы железа или распространена во многих районах мира,
других металлов. где лю ди питаю тся в основном кукуру
зой и едят м ало мяса, м олока и яиц. В це
Рис. 10-6. А. Две формы витамина,
лях профилактики и лечения пеллагры
r-l
предотвращ аю щ его пеллагру. Б. Строение
активных коферментных форм этого можно использовать как никотиновую
витамина - никотинамидадениндинуклеотида кислоту, так и ее а м и д - никотинамид.
(NAD +) и никотинамидадениндинуклеотидфосфата Ч тобы кому-нибудь не приш ла в голову
(N A D P + ). О ба этих соединения содержат по
два нуклеотидных остатка, каждый из мысль о возможности употребления
e
которых состоит из основания (никотинамида в пищу табака как источника этого ви-
или аденина), пятиуглеродного сахара
(D-рибозы) и фосфатной группы. Н а рисунке
изображены окисленные формы нуклеотидов.
sh
о- СН, О Никотинамид
u
О = Р —О" H \L J /H
ak
ОН ОН
Сгоон
Никотиновая кислота
(ниацин)
С—NH,
[н-] н Н н
Н X
/ + НС^ С — С— n h 2 s + НС С— С — n h 2 + н
s 4 I II II II I II
NH Н С ^ /С Н О Н С ^ /С Н О
N+ N
R R
NAI)+ NADH
Субстрат Дегидрированный
субстрат
тамина, никотиновой кислоте было дано Рис. 10-7. Общ ее уравнение, показывающее,
как N A D + действует в качестве кофермента
другое (условное) название-ни а ц и н.
.ru
в реакциях ф ерментативного дегидрирования.
Н икоти нам ид-ком пон ент двух близ М олекула субстрата и продукты реакции
ких по структуре коферментов -н и ко - выделены красным цветом. И зображ ена
тинамидадениндинуклеотида (NAD) и только никотинамидная часть молекулы
NAD + , остальная же ее часть обозначена
никотин амид ад ениндинуклеотидфосфата буквой R.
(NADP). Строение этих коферментов по
казано на рис. 10-6. N A D P отличается от
ib
NAD наличием в молекуле фосфатной ционировать с лю бы м из этих двух
группы. Эти коферменты м огут нахо коферментов. У больш инства дегидроге
диться как в окисленной (N A D + и наз N A D (или N ADP) связывается с бел
N A D P + ), так и в восстановленной ковой частью фермента только во время
r-l
(NADH и N A D PH ) формах. Никотина- каталитического цикла, однако известны
мидный компонент этих коферментов и такие ферменты, с которыми эти кофер
играет роль промежуточного переносчи менты связаны очень прочно и постоянно
ка гидрид-иона, который ферментативно присутствуют в активном центре.
e
отщепляется от молекулы субстрата под
действием специфических дегидрогеназ
10.7. Пантотеновая кислота -
(рис. 10-7). В качестве примера можно
компонент кофермента А
sh
Н СНз о н
I I I
С—СН,—СН,—NH—С—С— С— СНа
НО О ОН СНз
Пантотеновая кислота
NH,
Реакционноспо -
собная группа
/ - Л Аденин
о- о- не; II I
I I \ ^ с ^ ^сн
HS—СН,—СН, —NH —С—СН,— СН,— NH— С—С—С—СН,—О Р —О —Р —О —VCH, N N
р -Меркаптоэтиламин О О ОН СНа
Пантотеновая кислота
Рибозо-3' -фосфат
.ru
О—Р
Рис. 10-8. П антотеновая кислота и кофермент А. Кофермент А
ib
рокие функции: он участвует во многих В ходе первой реакции, изображенной на
ферментативных реакциях, в которые во рис. 10-9, окислительное декарбоксили-
влечены не только ацетильные, но рование пирувата под действием пиру-
и любые другие ацильные группы. К о ватдегидрогеназного комплекса приводит
r-l
фермент А (-С о А или CoA-SH) выпол к образованию ацетил-СоА. В ходе вто
няет функции промежуточного перено рой реакции ацильная группа ацетил-
счика ацильных групп. СоА под действием цитратсинтазы
М олекула кофермента А (рис. 10-8) со переносится на оксалоацетат, который
держит реакционноспособную тиоловую превращается при этом в цитрат. Этой
e
(— SH) группу, с которой ковалентно реакцией начинается лимонный цикл-
связываются переносимые коферментом центральный путь окислительного рас
sh
Обраэование ацетил-СоА
Пируватдегидро-
CHj— С—СОО- + NAD* + СоА— SH + Н ,0 •СН 9 С— s —СоА + НС03- + NADH + Н+
О
А
Коферментные формы витамина В6
.ru
О
ib
Пиридоке.альфосфат Пиридоксаминфосфат
(акцептор аминогрупп) (донор аминогрупп)
r-l
СОО- СОО"
I I
СН2 СН2
Глутамат а-Кетоглутарат
соо- СОО-
Н I
I СН2 СН 2
-С — н Е— ф— С— Н +
I С=О II H -C -N H
u
NH О I
СОО- С ОО -
Оксалоацетат Аспартат
Суммарная реакция: Глутамат + Оксалоацетат :
ak
а-Кетоглутарат + Аспартат
В
доксаль и пиридоксамин (рис. 1 0 - 1 0 ), ко Рис. 10-10. Активные формы витам ина В6 (А),
торые в биологических системах легко коферментные формы этого витам ина (Б)
и реакция переаминирования (В). В ходе этой
превращ аются друг в друга. Активной реакции пиродоксальфосфат переносит
формой витамина В 6 является пиридок- аминогруппу в активный центр фермента.
сальфосфат или его ам и н о ф о р м а-ш р и - П оказаны две стадии реакции. Т рансаминаза
с ее простетической группой изображена
доксаминфосфат. П иридоксальфосфат
в двух формах:
представляет собой прочно связанную Е—ф— С О — Н и Е— ф —C(NH2)—Н 2.
простетическую группу целого ряда фер
ментов, катализирующ их реакции с уча циям такого типа относятся реакции
стием аминокислот. К наиболее распро переаминирования, в которых аминогруп
страненным и хорош о изученным реак- па а-аминокислоты обратимо переносит
ГЛ. 10. ВИ ТА М И Н Ы и М И К Р О Э Л Е М Е Н Т Ы КАК К О Ф А К Т О Р Ы Ф Е Р М Е Н Т О В 283
.ru
этом аминопроизводное коф ерм ента- В биотин-зависимых ферментах м оле
пиридоксаминфосфат - передает затем кула биотина ковалентно присоединена
аминогруппу второму субстрату - а-ке- к ферментному белку при помощ и амид
токислоте и возвращ ается в исходную ной связи, в образовании которой уча
пиридоксальфосфатную форму. В по ствует е-аминогруппа реакционноспособ
добных реакциях переаминирования м о ного остатка лизина, находящегося
ib
гут участвовать самые разнообразные в активном центре фермента. Э тот био-
аминокислоты и а -кетоглутарат, ко тиниллизиновый остаток, называемый
торый играет роль универсального ак биоцитином, может бы ть выделен из био
цептора аминогрупп и в ходе реакции тинсодержащих ферментов после их кис
r-l
превращается в глутаминовую кислот у- лотного или ферментативного гидролиза
ключевой продукт м етаболизм а амино (рис. 10.11). Биотин играет роль пере
групп. носчика карбоксильных (— С О О “ ) групп
Трансаминазы обычно катализирую т во многих реакциях ферментативного
реакции двойного замещения (реакции ти карбоксилирования, протекающих с уча
e
па «пинг-понг»; разд. 9.8). В таких реак стием АТР. Карбоксильная группа кис
циях аминогруппа переносится сначала лоты обратим о связывается с атомом
sh
СООН R
I I Н
СН2 СН— С NH
I \
СН2 С= О
I /
СН2 СН2— С------- N
I Н I
СН2 СОО"
I Н в
СН— С- -NH
/ \
S С О
\ АТР
СН2 — С — -NH +
н
.ru
Биотин НСОГ
+
СН3
Биоцитин (остаток биотиниллизина).
Реакционноспособная группа С= =О Пируват
выделена красным цветом
I
О СОО"
ib
н II Пируваткар-
\ / X / N\ / " \ / \ / Полипептидная боксилаза
СН цепь фермента
I ,
СЙ2 ADP
r-l
+
СН2
Остаток лизина Р,
СН2
I СОО"
СН2
e
I
СН2
NH
С=О Оксалоацетат
sh
С=О
1
СОО-
СН2
СН2
Рис. 10-11. Биотин (А) и его активная
СН2 Молеку ф орм а-б и о ц и ти н (£), играю щ ий роль
u
карбоксилирования в качестве
/
S промежуточного соединения образуется
\
СН.— ( ;----- NjB»:
/ N -карбоксипроизводное биоцитина. П оказана
только циклическая система биоцитина. Г.
Н н Карбоксилирование пирувата с образованием
оксал о ац етата-важ н ая стадия биосинтеза
глю козы из пирувата. Реакцию катализирует
Реакционноспособная группа биотин-зависимый фермент
пируваткарбоксилаза.
Б
также под названием птероилглутамино- кислоту (FH 4), которая и является ак
вой кислоты, приводит к развитию ане тивным коферментом. Тетрагидрофолат
мии. С ам а по себе фолиевая кислота не играет роль промежуточного переносчи
обладает коферментной активностью ; ка одноуглеродных групп во многих
однако она ферментативно восстанавли сложных ферментативных реакциях.
вается в тканях в тетрагидрофолиевую К таким группам, переносимым от одной
ГЛ. 10. ВИ ТА М И Н Ы И М И К Р О Э Л Е М Е Н Т Ы КАК К О Ф А К Т О Р Ы Ф Е Р М Е Н Т О В 285
Фолиевая кислота
ОН
Ж
Х С ^ Ч С— СН2 С— N — С — СН 2 — СН2— СООН
H ‘N ~
I
( 4 /С
II
СН
I л /
СООН
'N N
Производное птеридина п-Аминобензой - Глутаминовая кислота
ная кислота
.ru
выделены красным цветом
ОН Н
6 9 Н
N^4
г н- С — СН2 -N — С— СН 2 -СН 2 — СОО-
\ /
ib
н, Н I
H2 N — С ^ , JC ^ ~ ^ С Н СОО-
N "Na
Na
i
r-l
N? N 10- метилентетрагидрофолат. Присоединенная
метиленовая группа выделена красным цветом
ОН
e
I 5
.C. н
N X Н> С — С Н -N- -С — СН2 -СН 2 — СОО-
Н
11 I
H2 N — С.^ ^ С “^сн
sh
СОО-
N N
н
Одноуглеродные группы, переносимые ферментами,
для функционирования которых необходим тетрагидрофолат
u
Н н
I I
-СН 3 —С— —С= —С—Н —С—Н
ak
I II II
н О NH
Метильная Метиленовая Метенцльная Формильная Формиминогруппа
Рис. 10-12. Фолиевая кислота, ее (рис. 10-12). Характерный пример такой
коферментная форма тетрагидрофолат
и метилентетрагидрофолат. Метиленовая реакции приведен на рис. 10-13.
группа-одна из пяти различных Восстановление фолиевой кислоты до
одноуглеродных групп, которые могут ее активной ф орм ы -тетраги дроф ол а
переноситься посредством тетрагидрофолата. та-п р о и сх о д и т в два этапа путем после
довательного присоединения к молекуле
двух пар водородных атомов. Второй
молекулы к другой, относятся метильная этап -р еакц и я, катализируемая дигидро-
(— С Н 3), метиленовая (— С Н 2—), мете- фолатредуктазой,- эффективно ингиби
нильная (— С Н = ) , формилъная (— СНО) руется лекарственными препаратами, ис
и формиминогруппа (— C H = N H ) пользуемыми при терапии некоторых
286 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
. №,ЛР°-метилентетра- таких бактерий. Это открытие оказалось
гидрофолат
очень ценным, потому что оно позволило
Дигидрофолат понять механизм действия сульфанила
м и д а - важного лекарственного препара
О
та, ингибирующего рост патогенных бак
II
.С . терий, нуждающихся в и-аминобензой-
ib
HN' 'С - С Н з ной кислоте. Н а рис. 10-14 показано, что
I II л-аминобензойная кислота и сульфанил
O=Cv д ;н
О" Дезокситимидилат амид очень сходны по своей структуре.
Благодаря такому сходству сульфанил
r-l
О — р — О — С Н 2 ,0
амид может конкурировать с п-амино-
О бензоатом в процессе ферментативного
н Ч ц /н синтеза фолиевой кислоты.
e
ОН Н 10.11. Витамин В ! 2 —
предшественник кофермента В 12
Рис. 10-13. Р оль N 5, Ы 10 -метилентетрагидрофо-
sh
л ата (рис. 1 0 - 1 2 ) как донора м етильной группы Витамин В 12-с а м ы й сложный из вита
в ф ерментативном синтезе тим идиловой кисло м и н о в -и м еет не совсем обычную исто
ты -стр о и тел ь н о го блока Д Н К . Вновь встроен
ная метильная группа выделена красным рию. В 1926 г. два американских врача
цветом. Джордж М ино и Уильям Мэрфи обнару
жили, что включение в пищевой рацион
больших количеств полусырой печени
u
.ru
группа, связанная с атом ом кобальта. анемии будет рассмотрена в гл. 26.
Сложная корриновая циклическая систе Все ферменты, нуждающиеся в кофер
ма витамина В 1 2 (рис. 10-15), с которой менте В 12, обладаю т способностью осу
координационно связан атом кобальта, щ ествлять обмен между связанным
по химическому строению сходна с пор- с углеродом атом ом водорода и какой-
ib
ОН ОН
Рис. 10-15. Витамин В 12 и его коферментная
форма, назы ваемая аденозилкобаламином
(или коферментом В12). Цианогруппа
(выделена красным цветом) заменена
r-l
в коферменте В 12 на 5'-дезоксиаденозильную
группу (изображена в верхней части рисунка).
e
,СН3
sh
n h .,c o c h 2
CH2 CH,C0NH 2
сн:; Циклическая
u
корриновая
Витамин В
(цианкобаламин)
Реакционноспо
ak
N H X OCB
собный участок
кофермента В 1 2
сн3
CHj 5 ,6 -диметилбензимид-
аэолрибонуклеотид
288 ЧА С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
— Ci Сг
НООС—
Г -Н
INHj
Глутаминовая кислота
№ Метиласпартатмутаза
1 Н Н
.ru
СООН
А
Рис. 10-16. Реакции, происходящ ие с участием в тканях всех животных и высших расте
коферментных форм витам ина В12. А.
Кофермент В 12-зависимые ферменты
ний. Только лю ди и некоторые другие
катализирую т перенос атом а водорода от позвоночные должны получать ее
с пищей; больш инство же животных и,
ib
ато м а С х к атом у С 2 в обмен на группу X.
Б. Кофермент В 12-зависим ая реакция, вероятно, все растения могут синтезиро
катализируемая м етиласпартатмутазой.
О братите внимание на то, что группы Н вать это соединение из глюкозы. М и
и X, присоединенные к соседним атом ам кроорганизмы не содержат аскорбино
углерода, обмениваю тся местами. вой кислоты и не нуждаются в ней.
r-l
Аскорбиновая кислота, по-видимому,
нибудь группой (алкильной, карбоксиль играет роль кофактора в реакции фер
ной, гидроксильной или аминогруппой), м ентативного гидроксилирования, при
связанной с соседним атом ом углерода котором остатки пролина в коллагене со
e
(рис. 10-16). Н а рис. 10-16 показана ти единительной ткани позвоночных пре
пичная реакция, для осуществления кото вращ аю тся в остатки 4-гидроксипролина
рой необходим кофермент В 1 2 (кобамид). (рис. 5-7). Гидроксипролиновые остатки
sh
10.12. Биохимическая
функция витамина С О =С О=С
(аскорбиновой кислоты) I
ak
НОС О =С
не известна О
II I О
НОС О =С
Хотя уже в 90-х годах XVIII в. знали I I
о том , что в плодах цитрусовых содер НС- НС-
I
жится какой-то фактор, предотвращ аю HOCH HOCH
щий возникновение у людей цинги, его не I I
удавалось получить в чистом виде СН,ОН сн,он
и идентифицировать до 1933 г., когда L-аскорбиновая L-дегидроаскорбиновая
американские исследователи С. Глен кислота кислота
Кинг и У. А. Во наконец выделили этот
противоцинготный фактор из лимонного Рис. 10-17. Аскорбиновая кислота (витамин С)
сока. Вскоре после этого бы ло установле и продукт ее окисления - дегидроаскорбиновая
кислота. Последняя, хотя и обладает
но его химическое строение (рис. 10-17). биологической активностью , очень
Аскорбиновая кислота присутствует неустойчива и легко распадается.
ГЛ. 10. В И ТА М И Н Ы и М И К Р О Э Л Е М Е Н Т Ы КАК К О Ф А К Т О Р Ы Ф Е Р М Е Н Т О В 289
.ru
(рис. 10-18), который играет роль строи I
СН сн
тельного блока при образовании раз -4 -
личных жиро- и каучукоподобных ве НС нс
I I
ществ растительного происхождения. с— СНз с— СНз
Натуральный каучук и гуттаперча, ис II II
НС НС
пользуемые, например, при изготовлении
ib
г
мячей для игры в гольф, представляют СН2ОН СН М есто
собой полимеры изопрена. Ч тобы пока НС
рас-
зать изопреноидное происхождение жи
рорастворимых витаминов, в их струк НС
r-l
турных формулах изопреновые единицы II
с- СНз
отделяют черточками друг от друга, как I
НС
СН2 сн
e
II I
С— СН3 НС
II
СН С — СНз
sh
II Н С
СН2
- f r -
Изопрен сн
I
СН,
V : - -сн3
Располож ен ие и зо п р ен о -
u
хво сту"
С
Рис. 10-19. Витамин A t и его
I I предшественник - ß-каротин. Изопреновые
С— С С— С
структурные единицы отделены друг от друга
красными пунктирными линиями. При
расщеплении ß-каротина образую тся две
С С молекулы витам ина A j. Э та реакция
4 - протекает в тонком кишечнике.
С С
I I
С— С С это сделано на рис. 10-19 в структурной
I формуле витамина А.
С— С
I П ока еще не совсем понятно, в чем за
С клю чаю тся биохимические или кофер
Рис. 10-18. И зоп рен -структурная единица
ментные функции жирорастворимых ви
изопреноидных соединений. таминов. О днако в их изучении уже
10-767
290 ЧА С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
Интенсивные биохимические и биофи
в 1915 г. Элмер М ак-К оллум. Позднее он зические исследования витамина А, нача
выделил этот витамин из жира, содержа ло которым положил Джордж Уолд
щегося в печени рыб. Известны две при в Гарвардском университете, позволили
родные формы витамина A -в и т а м и н A t, получить всестороннюю информацию
или ретинол, который получают из пе
чени морских рыб, и витамин А2, выде
ib
Рис. 10-20. Циклический процесс синтеза
ляемый из печени пресноводных рыб. и распада зрительного пигмента родопсина.
О ба этих витамина -20-ато м н ы е спирты, При возбуждении молекулы родопсина
состоящ ие из изопреновых единиц. В рас видимым светом его простетическая группа
1 1- 1<ис-ретиналь поглощ ает световую энергию
тениях витамин А, как таковой, не встре
r-l
и в результате изомеризации, состоящ ей из
чается, но многие растения содержат ве нескольких стадий, превращ ается
щ ества изопреноидной природы, назы в полностью транс-ретиналь. Э тот процесс
ваемые каротиноидами, которые в орга возбуждает нервный импульс. Поскольку
структура полностью транс-ретиналя не
низме больш инства животных могут
e
соответствует конформации активного центра
превращ аться ферментативным путем белка опсина, ретиналь отщ епляется от него.
в витамин А. Н а рис. 10-19 показано, как В ходе двух последовательных
в результате расщепления $-керотина из ф ерментативных реакций полностью
sh
Ци с-транс- изомеризация
u
11 чме-ретиналя
ak
Световая энергия
11 -цис-ретиналь
Родопсин
Световая
энергия
Опсин
.ru
мембранах палочек. П ри возбуждении ф е р о л ,получают в промышленных
родопсина видимым светом ретиналь, масш табах путем ультрафиолетового
у которого одна двойная связь в 1 1 -м по облучения эргостерола дрожжей. Д о тех
ложении находится в (/«с-конфигурации пор, пока человек получает достаточную
(остальные двойные связи имеют транс- дозу солнечных лучей, ему не нужны д о
конфигурацию), в результате очень слож полнительные количества витамина D.
ib
ных, но быстро протекающих внутри В последние годы активно изучается
молекулярных перестроек изомеризуется биохимическая роль витамина D. Сам по
в полностью транс-ретиналь. Считают, себе витамин D 3 не обладает биологиче
что эти изменения, влияющие на геоме ской активностью, но он служит предше
r-l
трическую конфигурацию ретиналя ственником 1 , 25-дигидроксихолекальци-
(рис. 1 0 -2 0 ), вы зываю т изменение формы ферола (рис. 10-22). Витамин D 3 гид рок-
всей молекулы родопсина. Такое конфор-
силируется в два эт ап а -с н ач ал а в печени,
мационное изменение служит молеку
а затем в почках. 1,25-дигидроксихоле-
лярным пусковым механизмом, воз
e
кальциферол образуется в почках, а отту
буждающим в окончаниях зрительного да переносится в другие органы и ткани,
нерва импульс, который затем передает главным образом в тонкий кишечник
ся в мозг. В ходе «темновых» фермента
sh
СИ,
Н С — С Н 2 — СН*— С Н 2
С Н ,| СН :, — СН
7-дегидрохолестерол
СН3
НО
Облучение
кожи
СН,
.ru
-С Н 2
-С Н
I Витамин D 3
С Н ,(холекальц иф ерол)
СН:, СН,
НС — СН = С Н — СН •
e
СН. -С Н
I
СН;,
sh
(облучение
, ультрафиолетом)
Рис. 10-22. Образование и функция активной Холекальциферол ( D 3 )
ak
25 -гидроксихолекальциферол
Почки (реакция уско
ряется под действием
-С Н , паратиреоидного гормона
и при низком содержании
ф осф ата в крови)
1 ,25-ди гидроксихо-
л екальциф ерол 1 ,2 5 -дигидроксихолекальциферол
.ru
известно, влияет ли витамин Е на способ К в механизме свертывания крови. Вита
ность к оплодотворению у людей. Н едо мин К необходим для нормального
статочность токоферола вызывает у че образования белка плазм ы крови про
ловека такие симптомы, как дегенерация тромбина, который является неактивным
печени и нарушение функции мембран. предшественником тромбина - фермента,
превращ ающ его белок плазм ы крови
ib
Молекулы токоферолов состоят из аро
матического кольца и длинной изопре- фибриноген в ф и б р и н -нерастворимый,
ноидной боковой цепи. Точная биологи волокнистый белок, спосрбствующий
ческая функция витамина Е пока не формированию кровяного сгустка.
Ч тобы протромбин мог активироваться
r-l
установлена; предполагают, что он уча
ствует в защ ите липидов клеточных м ем и превратиться в тромбин, он должен
бран от разруш аю щ его воздействия кис связать ионы С а 2 + . П ри недостатке ви
лорода (разд. 1 2 .2 ). тамина К в организме животных синте
зирую тся дефектные молекулы про
e
10.17. Витамин К -ком понент тромбина, неспособные правильно свя
карбоксилирующего фермента зывать ионы С а 2 + . В нормальной м оле
куле протромбина содержится несколь
sh
СНз СНз
.ru
Н требностью в витаминах. Известно, что
в пище животных обязательно должно
А ?"' Остаток содержаться около 15 микроэлементов.
i Больш инство незаменимых микроэле
<sCH2 у-карбокси-
глутамата ментов служит в качестве кофакторов
гСН
или простетических групп ферментов.
ib
-оос' COO“ При этом они выполняю т какую-нибудь
одну из трех (по меньшей мере) воз
Рис. 10-25. Функция витамина К как
кофактора при образовании остатков
можных функций. Во-первых, незаме
нимый микроэлемент сам по себе может
r-l
у-карбоксиглутаминовой кислоты
в протромбине и других белках. обладать каталитической активностью
по отношению к той или иной химиче
действия этого фермента необходим ви ской реакции, скорость которой в значи
тамин К (рис. 10-25). Н екоторые другие тельной степени возрастает в присут
e
С а 2 +-связывающие белки в организме ствии ферментного белка. Это особенно
также содержат остатки у-карбоксиглу- характерно для ионов железа и меди. Во-
таминовой кислоты. вторых, ион м еталла может образовать
sh
.ru
Рис. 10-26. Ж елезопорф ириновая группировка,
комплекс одновременно и с субстратом или гем. Гем служит простетической группой
и с активным центром фермента, в ре гемсодержащих ферментов, таких, как
хромоксидаза, каталаза и пероксидаза. (См.
зультате оба они сближаются друг с дру
также рис. 8-5.)
гом и переходят в активную форму. Н а
конец, в-третьих, ион м еталла может ментов относятся каталаза, осущест
ib
играть роль мощ ного акцептора электро вляю щ ая расщепление перекиси водоро-
нов на определенной стадии каталитиче да, и пероксидаза, катализирую щ ая окис
ского цикла. Ферменты, для активности ление различных органических веществ
которых необходимы ионы металлов, ча перекисями. Ион железа в молекуле ката-
r-l
сто называю тся металлоферментами. лазы активно участвует в каталитиче
ском цикле. Даже простые соли железа,
такие, как FeSO 4, способны проявлять
10.19. Для действия многих
некоторую каталитическую активность,
ферментов требуется железо
e
ускоряя разложение перекиси водорода
Ж елезо относится к тем микроэлемен на Н 2О и О 2. Возможно, что роль порфи-
там, биологические функции которых риновой группы и белковой части ката-
sh
изучены наиболее полно. Ж елезо входит лазы сводится к тому, что они лиш ь рез
в состав гемогрупп кислород-перенося- ко повыш аю т эту исходную каталитиче
щих белков гемоглобина и миоглобина, скую активность железа.
а также переносчика электронов м ито Железо-серные ферменты - э т о еще
хондриального белка цитрохрома с один важный класс железосодержащих
ферментов, участвующих в переносе
u
.ru
в цитохромоксидазе подвергаются ци 10.22. Некоторым ферментам
клическим изменениям валентности требуются ионы марганца
Cu (II)-С и (I) и таким образом участвуют
в переносе электронов, акцептором ко Фермент аргиназа, гидролизующий ар
торых служит кислород. М едь присут гинин с образованием м очевины -конеч
ствует также в активном центре лизилок- ного продукта м етаболизма аминогрупп
ib
сидазы - фермента, осуществляющего в организме человека, содержит прочно
формирование поперечных сшивок ме связанные с ним ионы М п2+, необхо
жду полипептидными цепями коллагена димые для его ферментативной активно
и эластина (разд. 7.16 и 7.17). Недостаток
r-l
сти. Ион М п2+ служит кофактором и не
меди в организме животных приводит которых фосфат-переносящих фермен
к образованию дефектного коллагена, тов, а также ферментов, обеспечивающих
в котором отсутствуют поперечные образование кислорода в хлоропластах
сшивки. В результате коллаген и эластин растений в процессе фотосинтеза.
e
в стенках артерий становятся менее проч
ными, что увеличивает вероятность их 10.23. В сослав витамина
разрыва. Медь необходима также для В ] 2 входит кобальт
sh
f
сутствуют соли селена. П оэтому совер
шенно неожиданными оказались резуль СН2
таты опытов, в которых было обнаруже
но, что селен, правда в значительно
меньших количествах, должен обязатель н
но содержаться в пище крыс и цыплят. Рис. 10-28. С еленоц и стеи н -ан ал ог цистеина,
Проведенные в последние годы исследо у которого сера заменена на селен. О статок
вания показали, что селен в комплексе селеноцистеин а присутствует в активном
с какой-либо аминокислотой входит в со центре глутатионпероксидазы и других
селен-зависимых ферментов.
став простетических групп нескольких
ферментов, в частности глутатионперок-
.ru
переносить кислород. Глутатионперокси-
сидазы, которая вместе с пептидом глу- даза предотвращ ает образование метге-
татионом (рис. 10-27) защ ищ ает клетки моглобина путем разложения перекиси
от разруш аю щ его действия перекиси во водорода в следующей реакции:
дорода. В эритроцитах железо, присут
ствующее в молекуле гемоглобина, 2GSH + Н 2О GSSG + 2Н 2О
Восстанов Окисленный
ib
обычно находится в ферроформе
ленный глутатион
[ F e (II)]. Однако под воздействием-пере
глутатион
киси водорода оно легко окисляется до
ферриформы (Fe (III)]; образующийся Активный центр глутатионперокси
дазы содержит остаток необычной ам и
r-l
при этом метгемоглобин не способен
нокислоты -селеноцистеина (рис. 10-28),
в которой атом серы цистеина заменен на
♦I
СОО'
атом селена. Возможно, что — SeH-rpyn-
H,N— С— Н па этого остатка обладает какими-то
' а,
e
«СН. преимуществами по сравнению с — SH -
öl группой в механизме действия этого
VCH,
и других селенсодержащих ферментов.
vl
sh
С=О
I
H—N 10.25. Д ля некоторых
I ферментов требуются
H — С— CH2— SH другие микроэлементы
C=O
u
.ru
вотных. Олово, без которого невозможно ником тетрагидрофолиевой кислоты -
правильное развитие скелета, требуется, кофермента, участвующего в фермента
вероятно, для процессов кальцификации. тивном переносе одноуглеродных фраг
Для некоторых растений оказались не ментов. Витамин В 1 2 в форме его
обходимыми еще два элем ента-б о р 5'-дезоксиаденозильного производного
и алюминий.
ib
участвует в ферментативном обмене ме
жду связанным с углеродом атомом во
Краткое содержание главы дорода и какой-либо группой, соединен
ной с соседним атомом углерода.
В и там и н ы -это органические веще
r-l
Ж ирорастворимые витамины выпол
ства, которые в следовых количествах няю т другие важные функции. Витамин
присутствуют в больш инстве живых ор А служит предшественником светочув
ганизмов и необходимы для их норм аль ствительного пигмента, претерпевающе
ной жизнедеятельности. Однако неко го цикл химических превращений в па
e
торые организмы не способны синтези лочках сетчатки у позвоночных. Витамин
ровать эти вещества и должны получать D 3, или холекальциферол, образующийся
их из внешних источников. Больш ая из 7-дегидрохолестерола под действием
sh
.ru
Статьи держащей витамины рибофлавин и пири
доксин и четыре аминокислоты. Если
Harris L .J. The Discovery of Vitamins. In:
в культуральную среду добавить полный
Joseph Needham (ed.), The Chemistry of Life,
набор аминокислот и рибофлавин, то коли
Cambridge University Press, New York, 1970,
чество пиридоксина, необходимого для оп
pp. 156-170.
тимального роста бактерий, сократится на
Hubbard R. 100 Years of Rhodopsin, Trends
90%. Объясните, почему это происходит.
ib
Biochem. Sei., 1, 154-158 (1976).
5. Яичные белки предохраняют желтки от
Simkiss K. Metal Iones in Cells, Endeavour, 3,
порчи. Я йца можно держ ать в холодиль
2-6 (1979).
Staudinger H .A . Ascorbic Acid, Trends Biochem. нике от четырех до шести недель, не опа
Sei., 3, 211-212 (1978). саясь, что они испортятся. Если же отде
r-l
лить яичные желтки от белков, то они
быстро испортятся даже при низкой тем
Вопросы и задачи пературе.
а) Почему портятся желтки?
1. Потребность в никотиновой кислоте. Н е б) Как вы объясните тот факт, что наличие
e
достаток никотиновой кислоты в пище яичных белков предотвращ ает порчу
приводит к заболеванию - пеллагре. желтков?
а) Суточная потребность взрослого чело в) Какую пользу с биологической точки
sh
века в никотиновой кислоте, составля зрения приносит птицам такой способ за
ю щ ая 7,5 мг, уменьшается, если в пище щиты яиц?
содержится больш ое количество амино 6 . Потребность бактерий Streptococcus
кислоты триптофана. Ч то можно ска faecalis в фолиевой кислоте. Бактерии
зать о взаимосвязи между никотино Steptococcus faecatis, обитаю щ ие в толстом
вой кислотой и триптоф аном на осно кишечнике, нуждаются в витамине фолие
u
.ru
витамины же группы В необходимо при Варфарин
ним ать значительно чаще. П очему?
9. Недостаточность витамина А. Н едоста а) Предложите молекулярный механизм
точность витамина А вызы вает ксеро- действия варфарина в качестве антаго
фтальм ию - заболевание, сопровож даю ниста витамина К.
щееся потерей зрения; для более ранних б) Почему скармливание грызунам вар
стадий характерны сухость и тусклость
ib
фарина приводит к их гибели?
роговицы глаза. Дети в значительно боль в) Если коров или лош адей кормить не
шей степени подвержены этому заболева правильно приготовленным клевером,
нию, чем взрослые. В тропических странах то у них развивается заболевание, со
от ксерофтальмии слепнут десятки тысяч провождаю щееся сильными внутренни
r-l
детей в возрасте от 18 до 36 месяцев. В то ми кровотечениями. Бы ло установлено,
же время у взрослых, добровольно нахо что причиной этого служит дикума-
дившихся в течение двух лет на диете без рол - вещество, образующееся в резуль
витамина А, отмечалось лиш ь ослабление тате действия микроорганизмов на ку
зрения в условиях пониженной освещенно марин - обычный компонент клевера.
e
сти. П осле введения витамина А этот де В клинической практике дикумарол ис
фект зрения бы стро исчезал. Объясните, пользую т для лечения больных
чем обусловлены различия в проявлении с острым тромбофлебитом (образова
sh
Кумарин Дикумарол
Н3С— с н сн2
О Р О з 2 О Р О . , 2-
СООН СООН
Метилм алоновая Янтарная О Р О з 2
кислота кислота
.ru
стока, главным образом в Иране и Египте,
у людей встречаются случаи недостаточ
ности цинка. Это объясняется тем, что на
Фитиновая кислота
селение в этих странах употребляет в пи
щу очень больш ое количество хлебных где лю ди пекут хлеб из пресного не
злаков, для которых характерно высокое дрожжевого теста. В городах, где в пи
содержание фитиновой кислоты (миоино- щу употребляю т хлеб из дрожжевого
ib
зитолгексафосфата), очень прочно связы теста, недостаточность цинка встречает
вающей катионы двухвалентных м етал ся значительно реже. Объясните эти
лов, особенно ионы Z n 2 + . наблюдения.
e r-l
u sh
ak
ГЛАВА 11
УГЛЕВОДЫ : СТРОЕНИЕ
И БИОЛОГИЧЕСКИЕ ФУНКЦИИ
.ru
Прежде чем приступить к изучению ходимыми компонентами клеточных по
м етаболизм а клеток, следует рассмо верхностей и внеклеточных опорных си
треть углеводы, поскольку их можно счи стем.
тать основой существования больш ин
ства организмов. В таких углеводах, как
11.1. Углеводы делятся
сахара и крахмал, заключено основное
на три класса в зависимости
ib
количество калорий, получаемых
от числа остатков сахаров
с пищей человеком, почти всеми жи
вотными и многими бактериями. Цен Углеводы являю тся полигидроксиаль-
тральное место углеводы заним аю т и дегидами или полигидроксикетонами ли
r-l
в м етаболизм е зеленых растений и дру бо образую т эти вещества в результате
гих фотосинтезирующих организмов, гидролиза. Происхождение названия
утилизирующих солнечную энергию для «углеводы» связано с тем, что, судя по
синтеза углеводов из С О 2 и Н 2 О. О бра эмпирическим формулам, большинство
e
зующиеся в результате фотосинтеза веществ этого класса представляют со
огромные количества крахм ала и других бой соединения углерода с водой, по
углеводов играю т роль главных источни скольку соотношение между числом ато
sh
.ru
входящим в состав гликопротеинов и про- называю т соответственно тетрозами,
теогликанов, что будет рассмотрено не пентозами, гексозами и гептозами.
сколько ниже. Каждый из таких моносахаридов может
Полисахариды представляют собой существовать в двух формах, образуя
длинные цепи, образованные сотнями
или тысячами моносахаридных единиц. н Н
i
ib
Некоторые полисахариды, например цел i;=o н—с —он
люлоза, имеют линейные цепи, тогда как I
н —с —он
другие, например гликоген,- развет I
н —с —он
н
н —с —он
вленные. Наиболее распространенные
I I
r-l
в растительном мире у г л е в о д ы -крахмал н н
и целлю лоза-образованы из повторяю Глицеральдегид (альдоза) Дигидроксиацетон (кетоза)
щихся остатков D -глюкозы; различие
Рис. 11-1. Две триозы. Карбонильны е группы
между ними состоит лиш ь в способах выделены красным цветом.
связи остатков D -глюкозы между собой.
e
Названия всех обычных моносахари Н н
I
дов и дисахаридов имею т окончание- и н- -с —он
оза. I
sh
н—с —он t —o
I I
но—с —н но—с —н
I I
11.2. Существует два н —с —он н—с —он
семейства моносахаридов: I • I
н—с —он н —с —он
альдозы и кетозы I I
u
СНгОН сн.он
Моносахариды - бесцветные, твердые 11-2. Д ве обычные гексозы (D-глю коза
кристаллические вещества, которые лег и D -фруктоза).
ak
.ru
Все моносахариды, за исключением ди- ризонтальными линиями, а связи, напра
гидроксиацетона, имеют один или не вленные за плоскость листа, показаны
сколько асимметрических, или хи
ральных (разд. 3.5), атомов углерода и, Рис. 11-4. Семейство D-альдоз, содержащих
следовательно, могут встречаться в виде от трех до шести атом ов углерода.
оптически активных изомеров. П ростей Приведены обычные структурные формулы,
ib
ш ая альдоза глицеральдегид содержит где ковалентные связи показаны черточками.
Н азвания наиболее распространенных альдоз
только один асимметрический центр и, обведены рамкой. Красным цветом выделены
таким образом, может существовать асимметрические атом ы углерода.
r-l
Н
I
с= о
e
СН2ОН
D -глицеральдегид
u sh
ak
Н - # —ОН
Н -# -О Н
I
СН2ОН сн2он СН,ОН СН2ОН
D-аллоза D-альтроза D-галактоза! D -талоза
ГЛ. 11. У Г Л Е В О Д Ы : С Т Р О Е Н И Е И Б И О Л О Г И Ч Е С К И Е Ф У Н К Ц И И 305
.ru
щей альдозы; так, например, альдопенто-
НО- i - Н
I I зе D -рибозе соответствует кетопентоза
СНгОН СН2ОН D -рибулоза. Некоторые кетозы, напри
D -глицеральдегид L -глицеральдегид мер фруктоза, имею т тривиальные назва
ния. Самые важные в биологическом от
Рис. 11-5. Стереоизомеры глицеральдегида.
ношении с а х а р а -э т о кетопентоза D-ри
ib
булоза, кетогексоза D-фруктоза и кето-
гептоза D-седогептулоза (рис. 11-6).
вертикальными линиями (рис. 11-5). В природе иногда встречаются L-аль-
В дальнейшем мы рассмотрим два дру дозы и L -кетозы, однако они м ало рас
r-l
гих способа изображения пространствен пространены.
ной структуры сахаров, а именно проек Д ва сахара, различающ иеся по конфи
ции Хеуорса и конформационные фор гурации вокруг только одного атома
мулы. углерода, представляют собой эпимеры
Практически все природные моносаха
e
риды (за исключением дигидроксиацето-
на) обладаю т оптической активностью. С Н 2О Н С Н 2О Н
Так, D -глюкоза в природе встречается
sh
11-767
306 ЧА С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
стичленных кольца (рис. 1 1 -8 ), а не пря
по отношению друг к другу. Так, D -глю- молинейные цепочки. Такие циклические
коза и D -м анноза-эп и м ер ы относитель формы сахаров из-за их сходства с ше
но 2-го углеродного атома, а D -глюкоза стичленным циклическим соединением
и D -г а л а к т о з а -эпимеры относительно пираном получили название пираноз. Две
циклические формы D -глюкозы назы
ib
4-го атом а (рис. 11-7).
ваются CL-D-глюкопиранозой и ß-D-глюко-
11.4. Типичные моносахариды пиранозой (рис. 1 1 -8 ).
имеют циклическую структуру При растворении a-D -глюкозы в воде
r-l
ее удельное вращение постепенно ме
Н а рис. 11-1 -1 1 -4 и 11-6 строение раз няется во времени, достигая в конце кон
личных альдоз и кетоз представлено в ви цов стабильного значения 52,7°; в анало
де прямолинейных цепочек. Такая форма гичных условиях удельное вращение
соответствует структуре лиш ь триоз и те- и ß-D-глюкозы достигает того же значе
e
троз; что касается моносахаридов, скелет ния. Это изменение оптической активно
которых состоит из 5 и более атомов сти, получившее название мутаротации,
углерода, то в растворах они существуют обусловлено тем, что как ос-, так и ß-D-
sh
в виде замкнутых циклических структур, глю коза образую т при 25°С равновесную
причем карбонильная группа находится смесь, состоящ ую примерно на 1 / 3 из
не в свободном состоянии, как это изо a-D -глюкозы и на 2 / 3 из ß-D-глюкозы
бражено на рисунках, а образует кова и содержащую лиш ь очень небольшое
лентную связь с одной из гидроксильных количество незамкнутой формы. Из этих
u
.ru
^HjOH углерода называется аномерным углеро
H t -ОН н дом. Устойчивые пиранозные кольца м о
V
гут образовы вать только альдозы, содер
J /н жащие пять или более атомов углерода.
|\?н
НО с ^ —
? / ‘V
-С , О Альдогексозы также существуют в виде
циклических соединений с пятичленными
ib
н ОН кольцами. И з-за сходства таких колец
/ \ с пятичленным циклическим соедине
нием фураном их называю т фуранозами
6 С Н ,О Н 6 С Н 2ОН
(рис. 11-10). Однако шестичленное аль-
r-l
H t— -О ОН допиранозное кольцо намного более
J /h
|\ ? н
lAн
4С
Г\?н
V устойчиво, чем альдофуранозное, и пото
му в растворах альдогексоз преобладает
Н О Г. - "Л*
г н альдопиранозная форма.
2|ОН
НО с —
1 2i Кетогексозы также существуют в виде
e
3|
н Н ОН
ос- и ß-аномеров. В этих соединениях ги
a- D -глю копираноза /3- D -глю копи ран оза
дроксильная группа пятого атом а угле
sh
Н О
Н OR3
Альдегид Спирт Н олуац еталь Кетон Спирт 11о л укетал ь
и*
308 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
и восстанавливается окислитель. (Н апом
XX ним, что восстановителями называю т до
НС—О
/ \ СН норы электронов, а оки сли телям и-ак
НС сн
\ ^ С—С цепторы электронов.) Глюкозу и другие
н,с—сн н н сахара, способные восстанавливать окис
Пиран Фурап
лители, называю т восстанавливающими
ib
Рис. 11-10. П иранозные формы D-глюкозы
( редуцирующими) сахарами. Это свой
и фуранозные формы D -фруктозы, ство используют при анализе сахаров.
изображенные с пом ощ ью проекционных И змеряя количество окислителя, восста
формул Хеуорса. новленное раствором сахара , можно вы-
e r-l
sh
D -глюкопирано щ
.ru
ненных гликозидной связью между
первым атомом углерода (аномерным
углеродом) одного остатка глюкозы
и четвертым атомом углерода второго
остатка (рис. 1 1 - 1 2 ). Аномерный атом
углерода в гликозидной связи между дву
ib
мя остатками D -глюкозы имеет «-конфи
Лактоза {р-форма) [О-р-П-галактопиранозил- (1 * 4)-р- 1)-глкжо-
гурацию, соответственно эта связь обо лираноза!
значается как сх(1 ->4). В этом обозначе
нии первая цифра, или локант, указывает СН2ОН
r-l
на моносахаридный остаток с ано
н? / ! г ~
мерным углеродом. О ба остатка глю
козы в молекуле м альтозы находятся Х и _
^ ....
н он н СИ
в пиранозной форме. М альтоза относит
ся к восстанавливающ им сахарам, по Сахаро й [И -р -|> -ф р ук тоф 1раио н и - ( 2 , 1)-а- П -глш ы ш ргш о'зид)
e
скольку она содержит одну потенциаль
но свободную карбонильную группу,
H O Ü tl. (1 . н
которая может быть окислена. Второй
sh
.ru
земией (разд. 15.9). постоянно возрастаю щ ей стоимости вво
Сахароза, или тростниковый сахар,— зимого в США тростникового сахара,
дисахарид, состоящий из глю козы сырьем для которого служит сахарный
и фруктозы. Сахарозу синтезируют м но тростник и сахарная свекла, а также бла
гие растения, у высших же животных она годаря доступности в США больших ко
отсутствует. В отличие от м альтозы личеств D -глюкозы, получаемой путем
ib
и лактозы у сахарозы нет свободного гидролиза кукурузного крахмала, в по
аномерного атом а углерода, поскольку следнее время была предложена новая
оба аномерных атом а моносахаридных промыш ленная технология, позволяю
остатков связаны друг с другом щ ая получать продукт, обладающ ий бо
r-l
(рис. 1 1 - 1 2 ); поэтому сахароза не являет лее сладким вкусом, чем глюкоза. По
ся восстанавливающ им сахаром. В био этой технологии крахмал сначала гидро
химии растений этот дисахарид - своего лизую т с образованием кукурузного си
рода загадка. Д ело в том , что если ропа - концентрированного нейтрально
D -глю коза служит основным строи го раствора D -глюкозы; далее полу
e
тельным блоком как крахмала, так и цел ченный раствор пропускают через боль
лю лозы , то сахар о за-о сн о вн о й проме шую колонку, заполненную инертным
жуточный продукт фотосинтеза. У мно носителем, к которому ковалентно при
sh
.ru
продукт можно потреблять в значитель рида может служить содержащаяся в со
но меньших количествах, чем сахарозу; единительной ткани гиалуроновая кисло
следовательно, его использование умень та, которая состоит из чередующихся
шает количество усваиваемых калорий. остатков двух разных моносахаридов.
С другой стороны, по питательной цен В отличие от белков полисахариды нель
ности фруктоза не отличается от саха зя характеризовать строго определенной
ib
розы, и поэтому более высокую стои молекулярной массой: как правило, они
мость нового продукта нельзя считать представлены смесями высокомолеку
оправданной. лярных соединений; в зависимости от ме
Главным образом для людей, стра таболических потребностей клеток моно-
r-l
дающих ожирением и диабетом, ко сахаридные остатки могут ферментатив
торым вредно избыточное употребление но присоединяться к полисахаридам или
сахара, были получены искусственные же отщепляться от них.
Сладкие вещества, не обладающ ие пита
тельной ценностью. Эти искусственные 11.8. Некоторые полисахариды
e
сладости стимулируют те же вкусовые представляют собой форму
рецепторы на языке, что и природные са запасания «клеточного топлива»
хара, но не усваиваются организмом (см.
sh
I---------1 ----------- 1
.ru
1 мкм 0 ,25 мкм
Рис. 11-14. К рахмал и гликоген запасаю тся долю приходится до 7% общего веса ор
в виде гранул в клетках соответственно
растений и животных. А. Крупные гранулы
гана; гликоген имеется также в ске
крахм ала в единичном хлоропласте. летных мышцах. В клетках печени глико
В клетках листьев больш инства растений ген присутствует в виде крупных гранул,
крахмал образуется из D -глюкозы,
ib
состоящих в свою очередь из меньших
синтезированной в процессе фотосинтеза. Б .
Э лектронная микрофотограф ия гранул гранул; последние образованы еди
гликогена в клетке печени хомяка. Эти ничными сильно разветвленными моле
гранулы намного мельче, чем гранулы кулами гликогена со средней молекуляр
крахмала, изображенные на соседнем рисунке.
r-l
ной массой в несколько миллионов
(рис. 11-14). С этими же гранулами про
-> 4)-связями. М олекулярная масса таких чно связаны ферменты, ответственные за
цепей колеблется от нескольких тысяч до синтез и распад гликогена.
500 ООО. Амилопектин также имеет высо В желудочно-кишечном тракте глико
e
кую молекулярную массу, но в отличие ген и крахмал расщепляются амилазами.
от а-ам илозы его цепи сильно развет Слюна и секрет поджелудочной железы
влены (рис. 11-15). В неразветвленных содержат а-амилазы, гидролизующие
sh
Невосстанавливающие
•_ концы
Ветвь
•V Ч •• Точка
ветвления
•• > ч •
.ru
Восстанавли
вающий конец
Основная
цепь
a(l—6 k
ib
Точка
ветвления *
Рис. 11-15. П олисахариды крахм ала ам илоза образом м альтозы и лиш ь небольших
r-l
и амилопектин. А . А м и лоза-ли н ей н ы й количеств глюкозы. Следует иметь в ви
полимер, состоящ ий из остатков D -глюкозы,
связанных друг с другом а(1 ->4)-связью. Б . ду, что индексы а и ß в названиях амилаз
Амилопектин. Каждый кружок соответствует не имеют никакого отношения к индек
остатку глю козы. Красными кружками сам а и ß в обозначениях гликозидных
обозначены остатки глю козы внешних цепей,
e
связей, а используются просто для разли
отщ епляемые под действием а-амилазы.
Черными кружками показано строение чения двух типов амилаз.
остаточного декстрина, образую щ егося после
sh
н он СН2ОН
.ru
Водородная связь,
образующая по
перечную сшивку
ib
r-l
В
e
u sh
ak
.ru
распространенный в природе биополи звоночных нет фермента, способного ги
мер. дролизовать целлюлозу, она не перева
Ц еллю лоза является линейным, нераз- ривается и ее D -глюкозные остатки не
ветвленным гомополисахаридом, состоя м огут служить пищей для больш инства
щ им из 10 000 и более остатков D -глю высших организмов. Ц еллю лозу хорошо
козы, связанных друг с другом ( 1 -> переваривают термиты, но лиш ь потому,
ib
-> 4)-гликозидными связями; в этом что в их кишечнике живут паразитиче
отношении она сходна с амилозой и ли ские м икроорганизмы Trichonympha
нейными участками цепей гликогена. Н о (рис. 11-17), секретирующие целлюла-
между этими полисахаридами суще зу,- гидролизующ ий целлю лозу фермент,
r-l
ствует одно очень важное различие: с помощ ью которого и происходит пере
в целлюлозе ( 1 ->4)-связи имеют ß-кон- варивание древесины у термитов. Цел-
фигурацию, а в амилозе, амилопектине лю лазу синтезируют также некоторые
и гликогене- ос-конфигурацию. Это, каза бактерии и грибы, вызывающ ие гниение
лось бы, незначительное различие древесины.
e
в строении целлюлозы и амилозы приво Среди позвоночных только крупный
дит к весьма существенным различиям рогатый скот и другие жвачные (овцы,
sh
в их свойствах (рис. 11-16). Благодаря козы, верблю ды, жирафы и т.д.) могут
геометрическим особенностям а ( 1 -> использовать целлю лозу в качестве пи
->4)-связей линейные участки поли щи. Однако делаю т они это весьма не
мерных цепей в молекулах гликогена обычным способом. Больш ая часть ки
и крахмала стремятся принять скручен шечника, составляю щ ая 15% общего веса
ную, спиральную конформацию, что спо коровы, приходится на долю четырех по
u
.ru
отрыжку. В остальных двух желудках строительный блок хитина и многих других
структурных полисахаридов. В молекуле
жвачных микроорганизмы, сделавшие
аминосахара D -глю козамина ко второму
свое дело, перевариваются ферментами, атом у углерода вместо гидроксильной
секретируемыми слизистой желудка; при группы присоединена аминогруппа (выделена
этом образую тся аминокислоты, сахара красным цветом).
и другие продукты, которые всасываются
ib
и используются в организме коровы в ка (рис. 11-18). Хитиновый каркас у омаров
честве питательных веществ. Таким и крабов усилен за счет включений кар
образом, между коровой и населяющими боната кальция.
ее рубец микроорганизмами устанавли
r-l
ваются отношения симбиоза, при кото 11.10. Клеточные стенки содержат
ром м икроорганизмы получают возм ож в больших количествах
ность насладиться короткой, но счастли структурные и защитные
вой жизнью в удобной и теплой среде; полисахариды
e
при этом целлю лоза из клевера и другой
травы служит основным источником Больш инство клеток растений окру
топлива и для «жильцов», и для организ- жены жесткой и очень прочной полисаха
sh
.ru
0 , 5 мкм
Рис. 11-19. Ц ел л ю л о за-гл ав н ы й компонент речными сшивками из коротких полипеп
клеточных стенок растений. А. Электронная тидных цепочек. Полисахаридные цепи
микрофотография клеточной стенки
водоросли (Chaetomorpha). К леточная стенка состоят из чередующихся моносаха-
состоит из перекрещивающихся слоев ридных остатков М-ацетил-И-г л юкоз ам и -
ib
волокон целлю лозы, импрегнированных на (рис. 11-18) и N -ацетилмурамовой кис
цементирующ ими полимерными веществами.
лоты (сложного девятиатом ного сахара),
Б. Поперечный срез ствола дерева
(псевдоакации), на котором отчетливо видны соединенных друг с другом ß(l -»
годичные кольца роста. Древесина, —►4)-связями (рис. 11 -20). К каждому
r-l
образовавш аяся весной, содержит крупные остатку N -ацетилмурамовой кислоты
клетки с тонкими стенками; в древесине, присоединена боковая тетрапептидная
образовавш ейся позднее, клетки мельче, зато
содержится больш е слоев целлюлозных цепочка. П араллельные полисахаридные
волокон. Светлая древесина вокруг цепи сшиваются короткими поперечны
стволового к ан ал а-заб о л о н ь . ми полипептидными цепочками, структу
e
ра которых различна у разных видов бак
нок больш инства бактерий служит про терий. У гноеродных бактерий
sh
N -ацетилмурамовая
ak
/— i— г
Тетрапептидная боковая
цепь; ее состав варьиру
ет от вида к виду
318 ЧАСТЬ 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
.ru
тельных бактерий (дающих окраску по
Граму, т.е. при обработке красителем
кристаллическим фиолетовым) пептидо
гликан образует вокруг клетки несколько
концентрических слоев, пронизываемых
другими макромолекулярными компо
ib
нентами. У грамотрицательных бакте
рий, например у E. coli, пептидоглика-
новый каркас покрыт богатой липидами
внешней оболочкой, содержащей гидро
r-l
фобные белки (см. гл. 12). Целостность
клеточных стенок имеет жизненно важ
ное значение для защ иты, роста и деле
ния бактерий. Действие пенициллина - о д
ного из наиболее ценных антибиотиков,
e
используемых для борьбы с бакте
риальными инфекциями, основано на
том, что он подавляет последний этап
sh
11.11. Гликопротеяны-
гибридные молекулы
ak
Строение боковой
пептидный скелет, образованный повто
цепи ряющ имся до 50 раз трипептидом
Ala-Ala-Thr (рис. 11-22). К каждому
Моносахарид
остатку треонина присоединен дисахарид
D-za.iciKmo3u.i-N-ацет ил-О -галакт озам ии.
Линейный Антифризные белки способны снижать
олигосахарид температуру замерзания воды, по-види-
мому подавляя образование кристаллов
льда. Наличие в крови рыб антифризных
белков в сочетании с очень высокой кон
Разветвленны й центрацией NaCl [которая также по
олигосахарид
нижает температуру замерзания воды
(разд. 4.4)] позволяет им переносить
столь низкие температуры полярных м о
.ru
рей, при которых кровь наземных позво
ночных неизбежно бы замерзла.
ib
гликопротеины
Клетки тканей животных окружены не
жесткой клеточной стенкой, а мягкой,
гибкой структурой, называемой иногда
r-l
клет очной оболочкой. В клеточной обо
Ala Ala Thr лочке содержатся олигосахаридные цепи
Б
различных типов. Клетки, выстилающие
Рис. 11-22. Строение некоторых
кишечник, окружены очень толстой, бо
e
гликопротеинов и протеогликана. А. Три гатой углеводами оболочкой, получив
типа гликопротеинов, различаю щ иеся р аз шей название гликокаликса, или пуши
м ером и составом боковых углеводных стой оболочки (fuzzy coat; рис. 11-23).
sh
.ru
ногликаны относятся таким образом
к гетерополисахаридам, поскольку они
состоят из чередующихся остатков моно
сахаридов двух разных типов
(табл. 11-2). В названии «мукополисаха-
риды» приставка лгуко-указывает на то,
ib
что эти полисахариды были получены
впервые из м уцина-сколъ зкого смазы
100 нм
вающ его протеогликана, содержащегося
Рис. 11-23. Гликокаликс на микроворсинках
(слева) эпителиальной клетки ки ш ечн и ка-это
в выделяемой слизи. Впоследствии тер
r-l
состоящ ая из нитей сетевидная структура, обра мин «кислые мукополисахариды» стал
зованная олигосахаридами. использоваться применительно к кислым
полисахаридам различных тканей позво
Считают, что фибронектин способствует ночных. Протеогликаны присутствуют
связыванию клеток друг с другом в гелеобразном основном веществе
e
(разд. 2.20). Эти и другие гликопротеины («межклеточном цементе»), заполняю
м ы рассмотрим подробнее в следующей щ ем в большинстве тканей пространство
главе в разделе, посвященном строению между клетками. К роме того, они содер
sh
вСОО"
.ru
Рис. 11-25. D -глюкуронат. К расны м выделена
ib
карбоксильная группа в положении 6 , диссоции
рую щ ая при pH, близких к 7.
держит чередующиеся остатки D-глюку ния крови в сосудах при различных пато
роновой кислоты и N -ацетил-О-галакто- логических состояниях, например после
замина. Дерматансульфат кожи также приступов стенокардии.
содержит чередующиеся остатки двух В протеогликанах хрящей молекулы
разных сахаров (табл. 1 1 -2 ). гликозаминогликанов ковалентно свя
.ru
или кегоны с эмпирической формулой действием а(1 -> 6 )-глюкозидазы. Ряд по
(СН 2 О)„. Они делятся на моносахариды, лисахаридов функционирует в качестве
или сахара (один альдегидный или ке- структурных элементов клеточных сте
тонный остаток); олигосахариды (не нок. В структурном полисахариде расте
сколько моносахаридных остатков) и по ний целлю лозе остатки D -глюкозы свя
лисахариды крупные линейные или раз заны друг с другом ß(l ->4)-связями.
ib
ветвленные молекулы, содержащие боль Ц еллю лоза устойчива к воздействию а-
шое число моносахаридных остатков. и ß-амилаз, и потому позвоночные не м о
М оносахариды, или простые сахара, гут переваривать клетчатку. Исключение
имеют одну альдегидную или кетонную составляю т жвачные животные, в желуд
r-l
группу. Они содержат по крайней мере ке которых имеются бактерии, секрети-
один асимметрический атом углерода рующие целлюлазу, под действием кото
и потому могут существовать в виде раз рой целлю лоза расщепляется на остатки
ных стереоизомеров. Наиболее распро D -глюкозы. В жестких пористых стенках
страненные в природе сахара, такие, как бактерий содержатся пептидогликаны,
e
рибоза, глюкоза, фруктоза и манноза, от в которых линейные полисахариды, со
носятся к D -ряду. Простые сахара, содер стоящие из чередующихся остатков N-
жащие пять или более атомов углерода, ацетилмурамовой кислоты и N -ацстил-
sh
.ru
в) Раствор сахарозы обрабатывают инвер-
Costerton J.W ., GeeseyG.G ., Cheng K .- J . How
тазой до тех пор, пока оптическое враще
Bacteria Stick, Sei. Am., 238, 86-95, January ние в системе не станет равным нулю.
(1978).
Какая часть сахарозы при этом оказы
Ja q u es L . B . Heparin: An Old Drug with a
вается гидролизованной? (В настоящее
New Paradigm, Science, 206, 528-533 (1979).
время инвертазу чаще называют сахара-
K retchm er N . Lactose and Lactase, Sei. Am., 227,
зой.)
70-78, October (1972); (offprint 1259).
ib
3. П роизводст во ш околада с ж ид к ой начи н
Points H. G. On the Scent of the Riddle of
кой. Производство шоколада с жидкой на
Sucrose, Trends Biochem. Sei., 3, 137-139
чинкой можно считать интересным приме
(1978).
Yam ada K .M ., Olden K . Fibronectins, Abhesive
ром использования ферментов в технике.
r-l
Glycoproteins of Cell Surface and Blood, Ароматная жидкая начинка представляет
Nature, 275, 179-184 (1978). собой в основном водный раствор сахаров,
обогащенный фруктозой, которая и при
дает ей сладкий вкус. Техническая пробле
Вопросы и задачи ма заключается в следующем: для пригото
вления шоколадной оболочки твердую
e
1, В за и м о превращ ен и е разли чны х ф орм D -га- центральную часть нужно окружить горя
лактозы. Свежеприготовленный раствор а- чим расплавленным шоколадом и в то же
формы галактозы (1 Г/мл в 10-сантиметро время конечный продукт должен содержать
sh
вой кювете) имеет величину оптического под застывшим шоколадом жидкую, бога
вращения + 150,7й. При длительном стоя тую фруктозой начинку. Предложите реше
нии оптическое вращение постепенно ние этой задачи. (Подсказка: сахароза рас
уменьшается, достигая равновесного значе творяется значительно хуже, чем глюкоза
ния + 80,2°. Свежеприготовленный раствор и фруктоза.)
ß-формы (1 г/мл) имеет величину оптиче 4. А н ом еры лакт озы. Дисахарид лактоза, со
u
ского вращения всего лишь + 52,8°. Более стоящий из галактозы и глюкозы, может
того, если этот раствор оставить постоять существовать в двух аномерных формах,
несколько часов, то оптическое вращение для обозначения которых используют
ak
.ru
ных группах замещ аю тся на метальные
правлению роста. Д лина каждого остатка группы (— О — Н -> — О ^ С Н з ). Далее
D -глюкозы в молекуле целлю лозы соста все гликозидные связи подвергаю т кис
вляет приблизительно 0,45 нм. лотном у гидролизу, после чего опреде
7. Сравнение целлюлозы и гликогена. П ракти ляю т количество остатков 2,3-диметил»
чески чистая целлю лоза, полученная из во глю козы.
локон, окружающих семена растений вида
ib
Gossypium (хлопчатник), представляет со
бой прочное, волокнистое, совершенно не Задача 9
растворимое в воде вещество. Гликоген СН2ОН
же, выделенный из мы ш ц или печени, на
против, легко диспергируется в горячей
r-l
воде, образуя мутный раствор. Несмотря
на различие в физических свойствах, оба
этих вещ ества-поли м еры , обладаю щ ие
близкими молекулярными массами и со Н ОСН3
стоящие из остатков D -глюкозы, соеди
e
2,3-диметилглюкоза
ненных 1,4-связями. К акими особенностя
ми строения обусловлены различия
в свойствах этих двух полисахаридов? К а а) Объясните, на чем основан этот способ
sh
.ru
и углеводы. Перед тем как перейти
к изучению метаболических процессов Существует несколько классов липи
в клетках, следует рассмотреть еще одну дов, каждый из которых выполняет спе
группу биомолекул -липиды . Липиды цифические биологические функции
представляют собой нерастворимые (табл. 12-1). М ы начнем рассмотрение
в воде маслянистые или жирные веще с ж ирных кислот-характерны х струк
ib
ства, которые могут быть экстрагиро турных компонентов больш инства липи
ваны из клеток неполярными раствори дов. Ж ирные к и с л о т ы -эт о длинноцепо
телями, такими, как эфир или хлоро чечные органические кислоты, содержа
форм. Наиболее распространенные ли щие от 4 до 24 углеродных атомов; они
r-l
п и ды -ж и ры или триацилглицеролы, содержат одну карбоксильную группу
играют роль топлива для больш инства и длинный неполярный углеводородный
организмов. Именно в них запасается
больш ая часть энергии, выделяющейся Таблица 12-1. Л ипиды основных типов, сгруп
в результате химических реакций.
e
пированные в соответствии с их химичес
Рассмотрение липидов в этой главе ким строением
уместно и еще по одной причине. Дело Известны липиды и некоторых других ти
sh
в том, что наряду с неполярными липида пов, но они менее распространены в ж ивот
ми существуют также полярные липиды. ных тканях
Они составляю т главные компоненты Т риацилглицеролы
клеточных мембран, т. е. тех «контейне Воска
ров», в которых протекаю т основные м е Фосфоглицериды
таболические процессы. М ембраны не Ф осфатидилэтаноламин
u
Кардиолипин
ческих процессов внутри клеток. Вместе
Сфинголипиды
с тем м ем б р а н ы -э то не просто кле Сфингомиелин
точный «покров»: в них локализованы Ц ереброзиды
многочисленные ферменты и транс Г англиозиды
портные системы. Более того, на внеш Стеролы и их эфиры с жирными кислотами
ней поверхности клеточной мембраны
располагаются разнообразные распоз «хвост» (рис. 1 2 - 1 ), из- за которого боль
нающие, или рецепторные, участки, ко шинство липидов нерастворимы в воде
торые способствуют узнаванию других и проявляю т свойства масел или жиров.
клеток, связывают определенные гор В клетках и тканях жирные кислоты
моны и воспринимают иные сигналы из встречаются не в свободном состоянии,
внешнего окружения. М ногие свойства а в ковалентно связанной форме в соста
клеточных мембран обусловлены нали ве липидов различных классов; в свобод
чием в них полярных липидов. ном виде жирные кислоты можно полу-
.ru
ib
e r-l
sh
u
ak
— С Н = С Н — СН2 — С Н = С Н —
HV °
I
CH2
СН2
СН,
I '
СН,
I
СН2
.ru
СН,
I
СН,
I
СН2
I
ib
СН2
I
СН2
СН2
r-l
СН2
СН2
СН2
e
СН2
^н2
sh
I
сн,
Стеариновая кислота
.ru
24 С Н 3 (С Н 2)22С О О Н . н-T етракозановая Лигноцериновая 8 6 ,0
ib
18 С Н 3 (С Н 2)4СН = С Н С Н 2СН = С Н (С Н 2)7С О О Н Линолевая - 5
18 С Н ,С Н 2СН = С Н С Н 2СН = С Н С Н 2СН = Л иноленовая - 11
= С Н (С Н 2)7С О О Н
2 0 С Н 3 (С Н 2)4СН = СНСН 2СН = С Н С Н 2 С Н = С Н С Н 2СН = : Арахидоновая - 4 9 ,5
= (С Н 2)3С О О Н
r-l
раза чаще, чем насыщенные. В больш ин жирные кислоты ряда от С 1 2 до С 2 4 нахо
стве жирных кислот имеющаяся двойная дятся в твердом воскоподобном состоя
e
связь расположена между 9-м и 10-м ато нии, а ненасыщенные жирные кислоты
мами углерода (она обозначается А4). представляют собой жидкости.
Дополнительные двойные связи обычно Обычные жирные кислоты нераство
sh
Двойные связи практически во всех при ния (разд. 4.3): их ионизированная кар
родных жирных кислотах находятся боксильная группа образует полярную
в цис-конформации, что приводит к силь голову, а углеводородная ц еп ь-н еп о
ному изгибу алифатической цепи лярный хвост. N a +- или К +-мыла спо
(рис. 12-1). Ж ирные кислоты с нескольки собны эмульгировать нерастворимые
ми двойными связями (такие, как, напри в воде масла и жиры. Углеводородные
мер, арахидоновая кислота, содержащая хвосты м ы ла при этом встраиваются
четыре двойные связи) имеют несколько в капли жира, а полярные головы взаи
изгибов цепи, и их молекулы обладаю т модействую т с водой. Таким образом,
большей жесткостью, чем молекулы на м ы ла формируют гидрофильную обо
сыщенных жирных кислот; последние лочку вокруг капель жира, образуя м ел
благодаря свободному вращению вокруг кодисперсную смесь или эмульсию
одинарных связей характеризуются (рис. 1 2 - 2 ).
большей гибкостью и большей длиной. С а 2 + - и M g 2 +-мыла жирных кислот
При температуре тела насыщенные растворяю тся очень плохо и потому не
ГЛ. 12. ЛИП И ДЫ и МЕМБРАНЫ 329
.ru
жирной кислоты. Так, например, три-
стеароилглицерол, трипальмитоилглице-
рол и триолеилглицерол содержат соот
ветственно остатки стеариновой, паль
митиновой и олеиновой кислот. Чащ е
пользую тся тривиальными названиями
ib
этих соединений, а именно: тристеарин,
трипальмитин, триолеин. Триацилглице
ролы, содержащие два разных либо все
три разных остатка жирных кислот,
r-l
Рис. 12-2. Эмульгирую щее действие м ы ла на
жир. М ыло разбивает жир на капли, окруженные называю т смешанными триацилглицеро-
оболочкой из гидрофильных, высокополярных лами. Больш инство природных жиров,
карбоксильных групп и таким путем образует таких, как оливковое или сливочное
стабильную эмульсию. О трицательный заряд масло и другие пищевые жиры, содер
карбоксильных групп компенсируется равным
жат сложные смеси простых и смеш ан
e
числом полож ительно заряженных ионов, на
пример N a + . ных триацилглицеролов, в состав кото
рых входят жирные кислоты, различаю
эмульгируют жиров. Именно этим
sh
растворяю тся в воде. По удельному таких, как хлороформ, бензол или эфир,
весу они легче воды, и именно поэто и этими растворителями обычно поль
му во всех подливках масло плавает зуются для экстракции жиров из тканей.
сверху. Триацилглицеролы гидролизуются при
Триацилглицеролы хорошо растворя кипячении с кислотами или основаниями
ю тся в неполярных растворителях, либо под действием л и п а зы -фермента,
поступающего в тонкий кишечник из
Таблица 12-3. Ж ирнокислотный состав трех поджелудочной железы. Гидролиз три-
натуральных пищевых ж иров1* ацилглицеролов в присутствии К О Н
или N aO H (этот процесс называю т омы
П роцент от общ его количества
жирных К И С Л О Т лением) приводит к образованию смеси
К +- или N a +-мыл и глицерола (рис.
насыщенные ненасы
щенные
.ru
Рис. 12-3. Глицерол и общ ая схема строения
триацилглицеролов. О братите внимание, что ес
С4—с 12 с 14 с 16 с 18 с 16+ с18 ли в молекуле глицерола в положениях 1 и 3 на
ходятся две разные жирные кислоты, то угле
Оливковое родный атом 2 становится асимметричным.
масло < 2 < 2 13 3 80 В живой материи такие триацилглицеролы
Сливочное имею т L-конфигурацию. Изображенный справа
масло И 1 0 26 И 40 трипальмитин, как и все триацилглицеролы с
ib
Г овяжий одинаковыми жирными кислотами в положениях
жир < 2 < 2 29 2 1 46 1 и 3, оптически не активен.
консистенцию.
Н Н Н
I, U 1з
Н — С— С — С — н
u
I I I
ОН ОН ОН
Глицерол
ak
н н H
It 1з ,,
-С
н—С----- 1 -С—H
1
(!) о i
^1==О с= о c==o
1
! i I
Rt Rs
Трипальмитин
ГЛ. 12. Л И П И Д Ы И М Е М Б Р А Н Ы 331
.ru
I ванию прочного смолистого покрытия.
Н — С — ОН
В клетках в обычных условиях сам о
Н — С — ОН Глицерол окисление ненасыщенных жиров пол
I ностью заторможено благодаря нали
Н — С — ОН
I чию витамина Е (разд. 10.16), различных
н ферментов, а также, по-видимому, ас
ib
+ корбиновой кислоты (разд. 10.12). О д
нако при некоторых заболеваниях оно
R ,— COOK
Может иметь место, вызывая в ряде
+ тканей образование аномальных липид
Кали евые
r-l
R2— CO O K мыла ных включений.
+
R3— C O O K j
12.3. Триацилглицеролы
форма запасания липилов
Рис. 12-4. Омыление (щелочной гидролиз) три-
e
ацил глицерол а. У потребляемое в быту м ы ло по
лучаю т путем гидролиза смеси триацилг лицеро Основная функция триацилглицеро
лов едким калием. Образую щ иеся К + -мыла лов -зап асан и е липидов. В большинстве
sh
.ru
ib
5 мкм 1 мкм
сания энергии: во-первых, они могут Рис. 12-5. Запасы ж ира в клетках. Л. Ж ировая
клетка (адипоцит) из жировой ткани свиньи.
r-l
накапливаться в очень больших коли
Огромны е капли жира заполняю т практически
чествах в практически чистом, негидра- весь объем клетки. Светлая продолговатая
тированном виде, а во-вторых, в расчете структура с правого к р а я -я д р о клетки. Б. Часть
на единицу веса в них запасается в два крупной капли жира в цитоплазме клетки печени
голодаю щ его хомячка. При хорош ем корм ле
раза больш е энергии, чем в углеводах
e
нии животных в их печени содержится лишь
(гл. 18 и 26). м алое количество мелких жировых капель. При
У некоторых животных запасы три- голодании, когда жир становится основным
ацилглицеролов под кожей выполняю т энергетическим ресурсом и транспортируется из
sh
и Антарктики снабжены мощ ными про секретом покрыты также волосы, шерсть
слойками из триацилглицеролов (рис. и мех. У птиц, особенно водоплаваю
12- 6 ). щих, вы деляемые копчиковой железой
воска придаю т перьевому покрову водо
12.4. Воска-эфиры жирных отталкиваю щ ие свойства. Листья м но
кислот и длинноцепочечных гих растений покрыты защ итным слоем
спиртов воска. Блеск листьев многих тропичес
ких растений, а также падуба, родо
В о ск а -это сложные эфиры, образуе дендронов и сумаха обусловлен отраже
мые длинноцепочечными насыщенными нием света от воскового покрытия.
или ненасыщенными жирными кислота Воска вы рабатываю тся и используют
ми (с числом углеродных атомов от 14 ся в очень больших количествах морски
до 36) и длинноцепочечными спиртами ми организмами, особенно планктонны
.ru
(с числом углеродных атомов от 16 до ми, у которых они служат основной
22) (рис. 12-7). У позвоночных секрети- формой накопления высококалорийного
руемые кожными железами воска вы клеточного топлива. Поскольку киты,
полняю т функцию защ итного покрытия, сельди, лососевые и многие другие виды
смазывающ его и смягчающ его кожу и морских животных питаю тся главным
предохраняющего ее от воды. Восковым образом планктоном, содержащиеся в
ib
нем воска играю т важную роль в м о р
О Сложно-эфир ских пищевых цепях в качестве основ
\\ ная связь ного источника липидов.
С—О
/ \
r-l
СН2 СН2
1 1 12.5. Фосфолипиды-основные
СН2 СН2 липидные компоненты мембран
1
СН2 СН2
ния, липиды этой группы содержат фос
фор (в виде остатков фосфорной кисло
СН2 СН2 ты). Роль основного фосфолипидного
1 1
СН2 СН2
компонента мембран играю т фосфогли-
1
цериды (рис. 1 2 -8 ), в состав которых вхо
СН2 СН2 дят два остатка жирных кислот, этери-
фицирующих первую и вторую гидро
СН2 СН2
1 ксильные группы глицерола. Третья
СНз СН2 гидроксильная группа глицерола обра
зует сложно-эфирную связь с фосфор
СНз
ной кислотой. К ром е того, фосфоглице-
Рис. 12-7. Структура воска; показан воск, пред
риды содержат остаток еще одного
ставляющ ий собой эфир олеиновой кислоты спирта, связанного сложно-эфирной
и олеинового спирта. связью с фосфорной кислотой. Э тот
334 ЧА С Т Ь 1. Б И О М О Л Е К У Л Ы
Полярные
головы
0 -
1
о== Р — 0 - о = р —о-
0 0
1 1
н сн* Н
1
сн* н
1
н
1
сн*
1
i гL1 сV~< Гнг ri U ъР н
п н
П г
С н —с ------ - с —н
1
I 1 1 1 1
О 0 0 0 0 0 0
1 1 1 1
с= о с= о с=о с=о с=< с=о с=о
1 1 1 1
.ru
сн2 сн* сн, сн* сн, сн, СН*
1 1
1
сн2 сн, сн, сн* сн, сн2 сн*
ib
сн2 сн* сн2 сн2 СН2 сн2 сн,
1 1
сн2 сн* сн2 сн2 сн2 сн, сн,
ОТ он Глицероловый
"мостик"
\
н н н
1 1 1
н —с ------ - с -------с — н
1 1 1
0 0 ОН О
-13 —
—(X-
1
0
н сн,
II
1
0
II
1
о
I I 1
н—с ---- с—н о О
I I
0 о н сн2 сн 2 н
1 I
с=о с=0 н —с —с — н н —с — с
I I 1 1 1 1
сн. ^н, 0 о 0 о
.ru
1 1 1 1
СН, сн,
-и —
-и —
о
о
I I о=с с=
II
II
сн, сн,
I I R R R R
сн, сн,
I I
сн, сн, Рис. 12-9. Кардиолипин («двойной» фосфогли-
I I
сн, сн, церид) содержится в больш их количествах
I I в мембранах митохондрий и бактерий. Буквой
ib
сн, сн, R обозначены углеводородные цепи длинноце
сн, сн почечных жирных кислот.
I I
сн, сн
I I
СН, сн, лярные гидрофобные хвосты. Вследствие
r-l
сн, сн, этого фосфоглицериды обладаю т амфи-
СН, сн, патическими свойствами (разд. 4.3). Как
I I правило, амфипатическими свойствами
СН, СН,
I I обладаю т мембранные липиды, тогда
сн, сн,
e
Г Г как откладываемые в запас липиды
CHj сн,
(триацилглицеролы и воска) таких
Фосфатидилиноэитол свойств лишены.
sh
.ru
цереброзиды и ганглиозиды. Сфинго и сн,
миелины содержат фосфор, тогда как в £н с|:н,
цереброзидах и ганглиозидах его нет.
СН2 сн,
Сфингомиелины (рис. 12-11)-самые
простые и самые распространенные сн* сн,
1
сфинголипиды. Их характеризует нали сн. сн,
ib
чие фосфохолина или фосфоэтаноламина СН, сн,
в полярной голове. Т от факт, что сфинго Сфингозин
снг сн,
миелины содержат фосфор, дает основа (выделен
серым СНг сн
ние отнести их вместе с фосфоглице- цветом) III
r-l
ридами к фосфолипидам. Действитель- снг сн
сн* сн,
он
I снг сн,
н сн,
сн* сн,
e
! I
н о —с -------- с — н
I сн сн,
сн ^н 2
II сн2 сн,
sh
НС сн,
I снг
СН, СН,
I
снг
СН,
C.H. Лва гидрофобных
I хвоста
u
сн,
I Рис. 12-11. Структура сфингомиелина. Впервые
сн, сфингомиелин был выделен из м и е л и н а -п о
I строенной из мембран оболочки определенных
сн,
ak
1 X
H -fO H -сьцон
D -галактоза (по -
лярная голова)
оX
и=^о
.ru
Сфингозин
(выделен
серым
цветом)
ib
e r-l
sh
.ru
ные полярные головы образованы не два основных класса неомыляемых липи
сколькими остатками сахаров. Д ля ганг- дов: стероиды и терпены. Здесь мы рас
лиозидов характерно наличие в край смотрим только те стероиды, которые
нем положении одного или нескольких вклю чаю тся в состав мембран.
остатков N -ацетилнейраминовой ( сиало- С тероиды -слож н ы е жирораствори
вой) кислоты (рис. 12-13), несущей при мые вещества, молекулы которых со
ib
pH 7,0 отрицательный заряд. Остатки держат четыре конденсированных кольца
N -ацетилнейраминовой кислоты встре (рис. 12-14). Наиболее ш ироко распрост
чаю тся также в олигосахаридных бо раненными стероидами являю тся стеро-
ковых цепях некоторых мембранных гли лы, т.е. стероидные спирты. Основной
r-l
копротеинов. В сером веществе м озга стерол в тканях животных -холест ерол.
ганглиозиды составляю т около 6 % м ем Холестерол и его эфиры с длинноце-
бранных липидов. Они обнаруживаю тся
также, хотя и в меньших количествах, Рис. 12-14. Х олестерол, стероидный спирт. А.
e
в мембранах клеток других (не нерв Принятое обозначение колец и нумерация угле
ных) тканей. Г ан глиози ды -важ н ы е ком родных атом ов стероидов. И з-за того что четы
ре конденсированных кольца создаю т жесткую
поненты расположенных на поверхности структуру, присутствие холестерола в м ембра
sh
СНз
I 27
S5 Н<у— С Н з
24сн*
23сн,
22 C H j
не—сн„
ГЛ. 12. Л И П И Д Ы и М Е М Б Р А Н Ы 339
.ru
тельно жестка и гидрофобна.
ib
специфическими белками; эти комплек
сы называю т липопротеинами. В плаз
Гидрофобная часть Молекулы ф осф оли-
ме крови имеются три основных класса полипептидной цепи пидов с обращен
липопротеинов плазмы, причем содержа ными к водной
r-l
ние липидов в них может составлять среде полярными
головами
от 50 до 90%. М олекулы липидов и
полипептидов в липопротеинах прочно
связаны друг с другом, хотя и не об Рис. 12-15. Схематическая м одель липопроте-
ина плазмы. Н а внешней поверхности располо
разую т ковалентных связей. Л ипопро
e
жены ф рагменты полипептидных цепей и по
теины плазмы содержат полярные ли лярные головы фосфолипидов, контактирую щ ие
пиды и триацилглицеролы, а также хо- с водной фазой. Н ерастворимы е в воде триацил
глицеролы и холестерол спрятаны от воды вну
sh
Липопротеины
0
очень низкой
плотности
(ЛПОНП) 0,95-1,00 10 60 18 15
.ru
Липопротеины
низкой плотнос
ти (Л П Н П ) 1,00-1,06 25 1 0 22 45
Липопротеины
ib
высокой плот
ности (ЛПВП) 1,06-1,21 50 30 18
11 И м ею тся три основных класса липопротеинов, различающ ихся по плотности (т.е. по содержа
r-l
нию липидов). К ром е них в плазме крови содержатся хилом и крон ы -значи тельн о более крупные
частицы с очень низкой плотностью (см. также гл. 24)._________________________________________________
и бислои
лены внутрь от обращенных к каждой
Как и м ы ла (разд. 12.1), полярные из фаз поверхностей и образуют внут
ренний непрерывный углеводородный
ak
Полярная голова
Неполярные Фосфоглицеридный бислой
хвосты
Фосфоглицеридные мицеллы
.ru
Вода
mil мА
Фосфоглицеридный монослой
Воздух
ib
r-l
Вода
e
Рис. 12-16. П олярные липиды, особенно фосфо селезенке; в этих клетках липиды липо-
глицериды, способны спонтанно образовы вать
мицеллы, монослои и бислои. Они м огут обра сом подвергаются метаболическим пре
sh
.ru
то же самое происходит и с поляр тав (табл. 12-5).
ными липидами: они способны к сам о
сборке в структуры, в которых непо
Таблица 12-5. Примерный липидный состав
лярные углеводородные цепи спрятаны, (в процентах) субклеточных мембран печени
а полярные группы обращ ены к воде. крысы
Сами по себе триацилглицеролы не м о О братите внимание на высокий уровень хо
ib
гут ф ормировать мицеллы, поскольку лестерола и его эфиров, а также гликолипи
они не имею т полярных голов; однако в дов (значительную часть которых составляю т
ганглиозиды) в плазматической мембране.
смеси с фосфоглицеридами они образу
ют мелкодисперсные эмульсии, в капель
r-l
Холе- Гли- Эфиры хо
ках которых молекулы фосфоглицеридов М ембрана Фос стерол коли- лестеро
располагаю тся на поверхности, а три фоли пиды л а и м ино
пиды рные ком
ацилглицеролы -внутри. П одобное стро поненты
ение имею т жировые капельки в клет
П лазматичес
e
ках (рис. 12-5), а также хиломикроны.
кая 57 15 6 2 2
А ппарата
12.10. Полярные липиды Г ольджи 57 9 34
sh
0
и белки основные Э ндоплазмати-
компоненты мембран ческого рети-
кулума 85 5 0 1 0
Внешние, или плазматические, м ем Внутренняя
браны многих клеток, а также м ем бра митохондри
ны ряда внутриклеточных органелл, на альная 92
u
0 0 8
.ru
В различных мембранах на долю бел
ков приходится от 2 0 до 80% массы.
В мембране эритроцита, например, со
держится около 2 0 различных белков,
а во внутренней митохондриальной м ем
бране их значительно больше. Н екото
ib
рые белки в мембранах обладаю т фер
ментативной активностью, другие обес
печивают связывание и перенос молекул
полярных веществ через мембраны. Рис. 12-17. М ембранные белки. Перифериче
r-l
Мембранные белки различаю тся по ха ские (внешние) белки легко отделяю тся от м ем
браны, тогда как интегральные мембранные
рактеру связи с мембранными структу белки плохо экстрагирую тся водными раство
рами. Одни белки, называемые внешни рами.
ми, или периферическими, непрочно свя
e
заны с поверхностью м ембраны; другие, тергентов или органических раствори
называемые внутренними, или интег телей.
ральными,- погружены внутрь мембраны Важную роль в изучении строения
sh
.ru
окружен наобычайно пышной оболочкой, тол
щина которой составляет около 140 нм. Она
образована олигосахаридными нитями диам е
Г ликолипид тром 1,5-2,5 нм.
М оликулы
белков
ib
e r-l
0 , 1 мк.м
sh
Рис. 3. Рис. 4.
слоя.
Н а рис. 3 и 4 показана внутренняя сторона мембраны эритро
цита; электронная микрофотография на рис. 4 получена с исполь
зованием метода замораж ивания-скалы вания. При приготовлении
препаратов этим м етодом клетки сначала замораживаю т, а затем
замороженный блок раскалывают. Иногда линия раскола проходит
в плоскости между двумя липидными слоями (рис. 3). С обеих
образующихся при этом поверхностей делаю т отпечатки, которые
затем исследуют в электронном микроскопе (рис. 4). Внутренняя
часть каждого из липидных слоев имеет гладкую поверхность; рас
положенные на ней ско п лен и я-это молекулы интегральных белков.
Стрелкой показан внешний край скола.
П ри исследовании других особенностей строения мембран при
меняются также методы сканирующей электронной микроскопии [на-
ГЛ. 12. Л И П И Д Ы И М Е М Б РА Н Ы 345
.ru
микроскопическими методами, а также ются в основном гидрофильные R-груп
учитывая сходство в свойствах синтети пы, которые притягиваю тся к гидро
ческих фосфолипидных бислоев и при фильным заряженным полярным голо
родных мембран, С. Д жонатан Сингер вам липидов за счет электростатиче
и Гарт Николсон сформулировали в ских сил. Интегральные белки, а к ним
1972 г. теорию строения мембран, полу относятся ферменты и транспортные
ib
чившую название жидкостно-мозаичной белки, обладаю т активностью только
модели (рис. 12-18). Согласно этой м оде в том случае, если находятся внутри
ли, основной непрерывной частью м ем гидрофобной части бислоя, где они при
браны, т.е. ее матриксом, служит по обретаю т необходимую для проявления
r-l
лярный липидный бислой. П ри обыч активности пространственную конфигу
ной для клетки температуре м ат рацию. Следует еще раз подчеркнуть,
рикс находится в жидком состоянии, что ни между молекулами липидов в би
что обеспечивается определенным соот слое, ни между белками и липидами
ношением между насыщенными и нена бислоя не образуется ковалентных свя
e
сыщенными жирными кислотами в гид зей.
рофобных хвостах полярных липидов. Далее, из жидкостно-мозаичной м о
Ж идкостно-мозаичная модель предпола дели следует, что мембранные белки
sh
гает также, что на поверхности распо могут свободно перемещ аться в лате
ложенных в мембране интегральных бел ральной плоскости. Периферические бел
Внешняя среда
Олигосахаридные
группы
u
ak
точная среда
Внутренний
белок
Периферический
белок
.ru
гаю т, что такие кластеры мембранных сахаридных группировок, представляю
белков могут латерально перемещаться щих собой головы гликолипидов и оли-
в бислое. Э тот процесс лежит, по-види- госахаридные боковые цепи гликопроте
мому, в основе так назы ваемого кэп- инов, тогда как на внутренней поверх
пинга, т.е. перемещения определенных ности плазматической мембраны олиго-
мембранных белков в специфические сахаридных группировок практически
ib
участки или зоны мембраны, происхо нет.
дящ его в клетках некоторых типов на Асимметричность биологических мем
протяжении их жизненного цикла. М о бран сохраняется главным образом за
дель С ин гер а-Н и ко л со н а позволяет счет того, что перенос индивидуальных
r-l
объяснить многие физические, химиче молекул фосфолипидов с одной сторо
ские и биологические свойства мембран; ны липидного бислоя на другую очень
она получила ш ирокое признание как затруднен (рис. 12-19). Препятствием для
наиболее вероятный способ м олекуляр такого переноса служит высокий уро
e
ной упаковки липидов и белков в м ем вень энергии, необходимой для протал
бранах. Однако, как м ы увидим д ал ь кивания полярных, заряженных голов
ше, некоторые структурные особенности молекул фосфолипидов через срединный
sh
mmaimim
ставления о строении мембран. Возник
ло, в частности, предположение о том,
что по крайней мере некоторые м ем бра
ны имеют «скелет». В мембране эритро
цита человека содержится пять главных
белков и больш ое число минорных.
Больш инство мембранных б е л к о в -г л и
шшйшшш
Полярный ко- —/ + \
.ru
нец полипеп- / - Неполярный а-сп и -
копротеины. К интегральным белкам тидной цепи \ ральный участок
в мембране эритроцита относится глико- гликофорина гликофорина
форин («переносчик сахара»). Его м оле
кулярная масса составляет 30000; гли-
Цитозоль
кофорин содержит 130 аминокислотных
остатков и множество остатков сахаров,
ib
на долю которых приходится около 60% Рис. 12-20. М олекула гликофорина в м ембране
эритроцита. Выступающ ие из м ембраны развет
всей молекулы. Н а одном из концов по вленные углеводные цепи несут специфические
липептидной цепи располагается гидро участки, определяющ ие группу крови, а также
фильная голова сложного строения, участки, ответственные за связывание неко
r-l
включающая в себя до 15 олигосахарид- торых вирусов.
ных цепей, каждая из которых состоит
приблизительно из 1 0 остатков сахаров. ков в мембране. Э тот периферический
Н а другом конце полипептидной цепи белок расположен на внутренней поверх
e
гликофорина находится больш ое число ности м ембраны; он легко поддается
остатков глутаминовой и аспарагиновой экстракции. М олекула спектрина состоит
кислот (рис. 12-20), которые при pH 7,0 из четырех полипептидных цепей, сум
sh
Гликолипиды
Молекула
ганглиози-
Поляр
ный
липид
mir
ный
i
.ru
бислой
Гликопротеин Белок
Цитозоль
Рис. 12-21. Схематическое изображение участка
ib
Полипептидная
цепь гликофорина
Молекулы
спектрина
.ru
клеток животных тканей. Именно из-за потенциалов на мембране. Это особен
этих гликопротеинов при пересадке кожи но важно в случае нервных клеток,
или какого-либо органа (например, по способных передавать импульсы в ф ор
чек или сердца) от одного человека ме очень быстрых волнообразных из
другому необходима идентичность тка менений электрических свойств м ем бра
ней донора и реципиента для успешно ны вдоль вытянутого тела клетки или
ib
го приживления трансплантируемой тка аксона. М ембраны клеток самопроиз
ни. вольно восстанавливают свою целост
У растений и беспозвоночных живот ность: если их проткнуть или механи
ных лектины, вероятно, функционируют чески разруш ить, они автоматически в
r-l
как защитные белки, предохраняя эти течение короткого времени вновь зам ы
лишенные иммунной системы, а следо каю тся («запечатываются»).
вательно, и антител организмы от втор Н а внешней поверхности мембран
жения паразитарных микроорганизмов. имею тся специфические распознающие
e
Считают, что лектины располагаю тся участки, функции которых состоят в рас
на поверхности клеток растений. познавании определенных молекулярных
сигналов. Например, именно посредст
sh
цифичные для данного индивидуума или кислот одна двойная связь находится
вида, которые получили название участ в Д 9 -положении. Натриевые или калие
ков тканевой совместимости. вые соли жирных кислот называются
Важными компонентами многих рас мылами. М олекулы триацилглицеролов
познающих или рецепторных участков содержат три молекулы жирных кислот,
мембраны животных клеток служат, по- которые образую т сложно-эфирные свя
видимому, ганглиозиды. Содержание зи с тремя гидроксильными группами
ганглиозидов по сравнению с другими глицерола. Простые триацилглицеролы
мембранны ми липидами очень невелико, содержат жирные кислоты только од
но, видимо, они могут концентрировать ного типа, а см еш ан н ы е-п о крайней
ся в определенных участках. Больш ое мере двух разных типов. Триацилгли
разнообразие ганглиозидов, каждый из церолы служат главным образом фор
которых несет свою олигосахаридную мой накопления жиров в организме.
.ru
голову, позволило предположить, что П олярны е липиды, состоящие из по
ганглиозиды наряду с гликопротеинами лярных голов и неполярных углеводо
формирую т на поверхности клеток спе родных хвостов, являются О С Н О В Н Ы М И
цифические мозаичные структуры, вы компонентами мембран. Из всех поляр
полняющие роль рецепторных участков. ных липидов наиболее ш ироко распрост
Отрицательно заряженные полярные ранены фосфоглицериды. Фосфоглице
ib
группы (головы) ганглиозидов м огут слу риды содержат две молекулы жирных
жить рецепторами, т.е. выступающ ими кислот, образующ ие сложно-эфирные
на поверхности клетки антеннами, рас связи с двумя свободными гидроксиль
познаю щ ими молекулы определенных ными группами глицерол-3-фосфата, и
r-l
сигнальных веществ, в частности горм о еще одну молекулу спирта, гидроксиль
нов. ная группа которого этерифицирована
Таким образом, м ембраны клеток фосфорной кислотой. Э тот остаток спир
представляю т собой очень сложные та представляет собой полярную голо
структуры; составляю щ ие их м олекуляр ву всей молекулы фосфоглицерида. Фос
e
ные комплексы образую т упорядочен фоглицериды отличаю тся друг от друга
ную двумерную мозаику, и это прида строением полярных голов. Наиболее
sh
.ru
харидных групп играю т важную роль в
процессах узнавания клетками друг дру 1. Температура плавления ж ирных кислот.
га и адгезии, а также определяю т тка Ж ирные кислоты с 18 углеродными ато
невую специфичность и входят в состав м ам и имею т следующие точки плавления:
стеариновая кислота +69,6°; олеиновая
рецепторных участков для гормонов.
кислота + 1 3,4°С; линолевая кислота —5°
Л И ТЕРА ТУ РА и линоленовая кислота —11 С. Какими
ib
структурными особенностями определяет
Книги ся та или иная температура плавления
этих кислот? Объясните, какова молеку
A nsellG .B ., Hawthorne J.N ., Dawson R. М. C. лярная основа определенной направлен
r-l
Form and Function of the Phospholipids, ности в изменении температуры плавле:
2d ed., Elsevier, New York, 1973. Всесто ния.
роннее обсуждение предмета. 2. Прогоркание кулинарных жиров. Н екото
Gurr A. L., James A. T. Lipid Biochemistry: An рые из применяемых в кулинарии жиров,
Introduction, 3d ed., Methuen, New York, например сливочное масло, быстро пор
e
1980. тятся при хранении на воздухе при ком
Hanson J .R . Introduction to Steroid Chemistry, натной температуре, тогда как свойства
Pergamon, New York, 1968. К раткая свод твердых жиров типа маргарина в анало
sh
Cell M embranes, Sei. Am., 240, 48-63, January таю щ ие в засушливых районах суккулен
(1979). ты обычно покрыты восковым налетом.
352 ЧАСТЬ 1. БИОМОЛЕКУЛЫ
.ru
рия составляет 8,2 мМ . П ри изучении располагаю тся на наружной поверхности
свойств мицелл было установлено, что их мем браны (см., например, рис. 12-18). О д
молекулярная масса в среднем составляет но из возможных объяснений этого яв
18 000. Рассчитайте, сколько молекул ления состоит в том, что именно остат
детергента содержится в одной мицелле. ки сахаров обеспечивают асимметричную
8 . Гидрофобные и гидрофильные группы м ем ориентацию гликопротеина в мембране
ib
бранных липидов. Все мембранны е липи а) П очему остатки сахаров локализу
ды представляю т собой амфипатические ю тся на наружной поверхности мем
соединения, т.е. содерж ат как гидрофоб браны, а не внутри нее?
ные, так и гидрофильные группы. Н а б) Объясните, каким образом остатки
пример, в молекуле фосфатидилхолина сахаров обеспечивают асимметрич
r-l
гидрофобную часть образую т две цепоч ность распределения гликопротеинов
ки жирных кислот, а гидроф и льную -ф ос- в мембране?
фохолиновая голова. Н азовите структур 13. Текучесть мембран и значение этой ха
ные компоненты, играю щ ие роль гидро рактеристики. Согласно основной гипо
фобных и гидрофильных групп в каждом тезе м ем бранологии {т.е. науки о м ем
e
из указанных ниже мембранных липидов: бранах), для нормального функциониро
а) фосфатидилэтаноламин, вания мембран составляю щ ие их липиды
б) сфингомиелин, долж ны быть в жидком (а не в «за
sh
ib
Глава 2 О
2 . а) 1 , 1 х 1 0 4 молекул; б) 1 х 1 0 " 4 М.
= Сч
/
r-l
3. а) 1 х 1 0 ~ 1 2 г ( 1 пикограмм); б) 5 ,9 %; — О-
Карбоксилат-ион
в) 4,6%. О
4. а) 1,3 м м ; длина Д Н К в 650 раз превы
ш ает размер клетки, поэтому Д Н К долж
на быть плотно скручена, б) 3156 белков. h 2n
V - c -
Карбоксильная гругща
e
5. а) Скорость метаболизм а лимитируется Н—С— он
диффузией, которая в свою очередь за СН3 Метильная
S группа
висит от площ ади поверхности, б) Для
“О О
sh
Глава 3 О Альдегидная
С группа
.ru
в) 10“ 2 л- г) pH - р К ' = - 2.
7. а) 0,1 M НС1; б) 0,1 M N aC l; в) 0,1 М
он н он
/н он он N aOH .
8 . П равильный о т в е т -г)
H^ - CV
V —он и - 'г Ч 9. В желудке.
н н 1 он I > -°н
он он н 10. 5,80 г N a H 2 P O 4 • Н 2О и 8,23 г N a 2 H P O 4.
1
11. а) pH крови регулируется С О 2 -б и к ар б о -
ib
натной буферной системой согласно сле
ОН пн ОН н н ОН 0 дующей суммарной реакции:
I / ОН I / I i
НО— С — С. НО— С— С ч Н—С— с —с С О 2 + Н 2О т Н + + Н С О 3 .
1 V * i С —он I ! он
Н /' Н / н Н
r-l
H н При слабом снабжении легких воздухом
концентрация С О 2 в них и в артериаль
ной крови возрастает, сдвигая равнове
сие вправо и повыш ая концентрацию
н—с—с—с Н— С—с —с . Н—С— с —с
водородных ионов, т.е. pH крови при
e
I I 4 I I х этом снижается, б) При усиленном ды ха
H н н он
нии (гипервенгиляции) концентрация С О 2
7 9
в легких и в артериальной крови снижа
sh
он С—н С Н 3 С Н О Н С О О Н <=►С Н 3 С Н О Н С О О ~ + Н + .
I Вследствие этого pH крови и мышеч
н ной ткани снижается. Усиленное дыхание
13 полезно, так как при этом удаляются
ионы водорода [см. пункт (б)] и в ре
зультате повышается pH крови и тканей
в) Это означает, что X содержит хираль
в преддверии будущего накопления кис
ный центр; все, кроме 6 , 7, 8 и 12,
лоты.
нестабильны и как таковые не встреча
ются.
г) Это означает, что X содержит функ
циональную группу с кислотными свой
ствами; мож но исключить 8 ; структура 6 Глава 5
согласуется со всеми полученными дан 1. + 17,9 град ■млДдм ■г); удельное вращение
ными. д) С труктура 6 ; м ы не можем не указывает на то, является ли цитрул-
различить два возможных энантиомера. лин D- или L -аминокислотой.
ПРИЛОЖЕНИЕ. ОТВЕТЫ 355
2. Определите абсолю тную конфигурацию г) 2S, 3R, 2S, 3S, 2R, 3R и 2R, 3S соот
а-углеродного атом а и сравните ее с ветственно.
D- и L -глицеральдегидом. 1 2 . а)
.ru
5. б) Одна десятимиллионная часть.
условия для взаимодействия между кар-
6 . а) н
рк; = 2.3 боксилатным анионом и протонирован
HN СН2—С—СООН ной аминогруппой. Поскольку протони-
^N H |Ч1Н3 н* рованная аминогруппа ближе к карбокси-
латном у аниону в Ala, чем в А1а-олиго-
пептиде, равновесие в первом случае
н
ib
I pKi - 6.0 сдвигается сильнее, на что указывает
HN — СН2— С — С 00~ ----------«г-* более низкое значение р К [. в) Ионизация
\\ Г i Л
NH NH3 H' второго протона и в Ala, и в Ala-оли
гопептиде нарушает условия, благоприят
ствовавшие взаимодействию заряженных
r-l
H группировок. Поскольку эти группировки
N ^ 4 — CH2— С — COO- ближе друг к другу в Ala, чем в Ala-
T олигопептиде, то в Ala труднее удалить
^ -N H NH3 H*
второй протон и соответственно р д л я
Ala выше, чем рК 2 для А1а-олигопепти-
e
да.
H
I
CH2— c - coo
sh
Глава (i
nh2
1. 3500 молекул.
2. а) 32 100 г/м оль; б) 2.
6) pH Структура Сум м ар- Направление 3. 1 2 0 0 ; 1 2 2 0 0 г/моль.
ный заряд движения
4. + 2 ; + 1 ; 0; - 2 ; p i = 7,8.
u
П унктирные линии показы ваю т плохо сшивок между белковыми цепями; эти
расщепляю щиеся связи; Т -тр и п си н , мостики повы ш аю т жесткость и механи
X - химотрипсин. ческую прочность белка.
9. Туг— G ly— G ly— P h e— Leu. 6 . Шерсть «садится» вследствие перехода по
.ru
12. П ром ойте колонку больш им избы т S — CHsCH,OH
ком свободного лиганда с тем, чтобы б) И з-за окисления на воздухе цистеина
вытеснить лиганд, связанный с поли- до цистина.
мером. 9. В слоях Gly уложен напротив Gly, а
13. Ala/Ser напротив Ala/Ser.
Огп Phe 10. 30 аминокислот; 89%.
ib
11. Данные о том, что 1 4 С-гидроксипролин
Val
/ \ р го не включается в коллаген, свидетельст
вуют против первого предположения и
f
Pro Val
i согласуются со вторым.
12. Способность бактерии проникать в ткань
r-l
объясняется тем, что она мож ет разру
Phe On\ ш ать соединительнотканный барьер хо
Leu зяина, секретируя фермент коллагеназу.
Глава 7 Бактерии коллагена не содержат.
e
1. а) К ороткие с в я зи -э т о сильные связи вы
сокого порядка, т.е. не одинарные, а Глава 8
двойные или тройные связи. Связь С— N
sh
нении взаимодействия соседних молекул 11. 29 000; нам следует предположить, что
форма клетки также долж на меняться каждая молекула фермента содержит все
При серповидноклеточной анемии гем о го одну способную титроваться сульф-
глобин находится в клетке не в куби гидрильную группу.
.ru
ческой упаковке, а в виде длинных па 12. Ф ермент-субстратный комплекс стабиль
раллельных нитей, В результате эритро нее, чем фермент и субстрат, взяты е по
цит также становится вытянутым в на отдельности.
правлении этих нитей. 13. И змерить суммарную активность кислой
8 . а) 7,8 х 10 ~ 4 г О 2 на 1 кг ткани; б) 1,3 х фосфатазы в присутствии и в отсутствие
х 10“ 2 г О 2 на 1 кг Ткани; 17/1; в) 7,8%. тартрат-иона.
ib
9. а) Гемоглобин F. б) Б лагодаря этому 14. Т от факт, что ацетазоламин понижает
обеспечивается поступление кислорода из Vm.dx фермента, но не изменяет его К м ,
материнской крови в кровь плода, в) Д Ф Г свидетельствует о том, что Этот ингиби
уменьшает сродство гемоглобина к кисло тор действует неконкурентным образом.
роду. Т от факт, что при связывании 15. Э танол конкурирует с м етанолом за ак
r-l
ДФ Г кривая насыщения гемоглобина А тивный центр алкогольдегидрогеназы.
сдвигается больше, чем кривая насыще 16. Glu-35 протонирован; Asp-52 депротони-
ния гемоглобина F, свидетельствует о рован.
том, что гемоглобин А связывает ДФ Г
Глава 10
прочнее, чем гемоглобин F.
e
10. а) Он расщепляет пептидные связи с кар 1. а) Н икотиновая кислота необходима для
боксильной стороны остатков Lys и Arg. биосинтеза Тгр и в то же время она
б) О филадельфия; в) электрофорезом ин- сама может синтезироваться из Тгр.
sh
.ru
кишечнике, б) Дрожжи разруш аю т фити межмолекулярные водородные связи, в
новую кислоту. результате чего формируются длинные
Глава 1 1 жесткие нерастворимые волокна. Глико
ген также состоит из остатков глюкозы,
но они соединены друг с другом а(1 -►4)-
связями. Такая a -связь между остатками
глю козы вызывает изгиб цепи и препят
ib
ствует образованию длинных нитей. К ро
ме того, гликоген сильно разветвлен (рис.
a-D -галактоза ß -D-галактоза 11-15). Эти структурные свойства обеспе
чиваю т высокую степень гидратации гли
r-l
б) В свежеприготовленном растворе а- когена, поскольку многие гидроксильные
D -галактозы происходит мутаротация, группы обращ ены к воде. П оэтому гли
приводящ ая к образованию равновесной коген можно экстрагировать в дисперги
смеси а- и ß-D -галактозы. В результате рованном виде горячей водой.
мутаротации чистой а- или ß-D -галакто- Физические свойства этих двух поли
e
зы образуется смесь обеих ф орм одного меров хорош о подходят для выполнения
и того же состава, в) 72% ß-формы и 28% ими их биологической функции. Ц еллю
а-формы. ло за служит структурным м атериалом в
sh
нозид.
Глава 12
родной цепи, затрудняя ее упаковку в фильные части обращ ены к воде, а гидро
кристаллической решетке. фобные расположены на внутренней сто
2. Ненасыщенные жиры (например, сливоч роне пленки. Более того, чтобы воспре
ное масло) легко окисляются молекуляр пятствовать взаимодействию гидрофоб
ным кислородом. ных краев такой пленки с водой, липид
3. Фосфатидилхолин превращ ает жир в ные бислои смыкаются. В силу тех же
эмульсию. причин образовавш ееся в пленке отверс
4. а) Н атриевые соли пальмитиновой и тие затягивается, поскольку мем брана
стеариновой кислот, а также глицерол; полужидкая.
б) в мягких условиях гидролиза - натри б) Из этих свойств липидов вытекают
евые соли пальмитиновой и олеиновой важные биологические следствия, а имен
кислоты и глицерол-3-фосфорилхолин; в но: липидные пленки образую т замкну-
жестких условиях гидрол и за-н атр и евы е . тые мембранны е поверхности, в результа
соли пальмитиновой, олеиновой и фос те чего возникаю т клетки и внутрикле
.ru
форной кислот, а также глицерол и холин. точные компартменты («отсеки») - орга-
5. а) 0; б) 0; в) - 1 . неллы.
6 . Воск предохраняет от потери воды. 10. И м приходится проходить сквозь непо
7. 63. лярную среду, составляю щ ую внутрен
8 . Гидрофобные группы: а) две жирные кис нюю часть мембраны.
лоты ; б, в, г) одна жирная кислота и 11. Додецилсульфат натрия и холат натрия
углеводородная цепь сфингозина; д) уг
ib
солю билизирую т гидрофобные части
леводородный остов. мембран, действуя как м ы ла или детер
Гидрофильные группы: а) фосфоэтанол- генты (рис. 1 2 -2 ).
амин; б) фосфохолин; в) D -галактоза; г) 12. а) Сахара представляю т собой гидро
несколько молекул сахаров; д) спиртовая фильные соединения, б) Гликопротеины
r-l
группа (— ОН). не могут перевернуться и оказаться на
9. а) Липиды, образую щ ие бимолекулярные внешней стороне мембраны.
слои, относятся к амфипатическим м о 13. а) Внутренние мембранны е белки должны
лекулам, т.е. они содерж ат гидрофиль находиться в жидкой среде, чтобы иметь
ную и гидрофобную части. Ч тобы умень возмож ность принять свою функциональ
e
шить соприкосновение гидрофобной час ную конформацию, б) Повышенный уро
ти молекулы с водой, липиды формиру вень ненасыщенных кислот снижает тем
ют двумерные пленки, в которых гидро пературу плавления мембраны.
sh
I
u
ak
.ru
ОГЛАВЛЕНИЕ
Предисловие редакторов перевода . . 5 2.5. Escherichia coli -с а м а я известная
П р е д и с л о в и е ............................................... 7 из прокариотических клеток . . 30
2.6. Эукариотические клетки крупнее
и сложнее прокариотических . . 33
ib
2.7. Я дро эу к а р и о т -э т о очень слож
Ч а с т ь I. Б И О М О Л Е К У Л Ы . . . . 11
ная с т р у к т у р а .................................... 34
Глава 1. Биохимия - молекулярная ло 2.8. М итохондрии - «силовые установ
гика живых организмов . . . 12
ки» эукариотических клеток, по
r-l
ставляю щ ие э н е р г и ю ..................... 36
1.1. Д ля живой материи характерны 2.9. Эндоплазматический ретикулум
некоторые отличительные особен образует каналы в цитоплазме . . 38
ности .................................................... 12
2.10. Тельца Г ольдж и-секреторны е
1.2. Биохимия стремится понять при о р г а н е л л ы ......................................... 39
роду живого состояния . . . . 13
e
2.11. Л изосом ы -кон тейн еры с гидро
1.3. Все живые организмы содержат литическими ферментами . . . 39
органические макромолекулы, по 2.12. П ероксисом ы -пузы рьки, разру
строенные по общ ему плану . . 14 шаю щие перекись водорода . . 40
sh
Глава 3. Состав живой материи: био 4.9. Слабые кислоты имею т характер
молекулы .................................... 55 ные кривые титрования . . . . 92
3.1. Химический состав живой м ате 4.10. Б у ф е р ы -это смеси слабых кис
рии отличается от химического л от и сопряженных с ними осно
состава земной к о р ы ..................... 55 ваний .................................................... 95
3.2. Большинство биомолекул содер 4.11. Фосфат и б и кар бо н ат-важ н ы е
жит у г л е р о д .................................... 57 биологические буферные системы 98
3.3. Биомолекулы имею т специфичес 4.12. Приспособленность живых орга
кую форму и определенные раз низмов к водной среде . . . . 1 0 2
.ru
р и ч н ы .................................................... 63
3.6. Основные классы биомолекул в 5.1. Общие структурные свойства ам и
клетках представлены очень круп н о ки сл о т............................................... 108
ными м о л е к у л а м и .......................... 65 5.2. Почти все аминокислоты содер
3.7. М акромолекулы образую тся из жат асимметрический атом угле
небольших молекул, играющих рода .................................................... 108
5.3. Стереоизомеры обозначаю тся в
ib
роль строительных блоков . . . 67
3.8. М олекулы, используемые в ка соответствии с их абсолю тной
честве строительных блоков, име к о н ф и г у р а ц и е й ............................... 1 1 0
ю т простую структуру . . . . 6 8
5.4. Оптически активные аминокисло
3.9. Структурная иерархия в молеку ты в белках представляю т собой
r-l
лярной организации клеток . . . 70 L- с т е р е о и з о м е р ы .......................... 114
3.10. Биомолекулы первыми возникли 5.5. Классификация аминокислот на
в процессе химической эволюции 72 основе их R- г р у п п .......................... 115
3.11. Химическую эволю цию можно 5.6. Восемь аминокислот содерж ат не
воспроизвести в лабораторных ус полярные R- г р у п п ы ..................... 115
e
ловиях ............................................... 73 5.7. Семь аминокислот содержат не
К раткое содержание главы . . . 75 заряженные полярные R-группы 115
Вопросы и з а д а ч и .......................... 76 5.8. Две аминокислоты содержат от
sh
.ru
высокой биологической актив ции пептидных г р у п п ..................... 168
ностью ............................................ 130 7.6. В а-кератине полипептидные цепи
К раткое содержание главы . . . 132 имею т форму а-спирали . . . . 169
Вопросы и з а д а ч и ....................... 133 7.7. Н екоторые аминокислотные ос
татки препятствую т образованию
Глава 6. Белки: ковалентная структура а - с п и р а л и ......................................... 171
и биологические функции . . 137
7.8. В а-кератинах содержится много
ib
6.1. Белки обладаю т множеством р аз аминокислот, способствующих
личных' биологических функций 138 образованию а-спиральной струк
6.2. Белки мож но классифицировать туры .................................................... 172
также по форме их молекул . . . 140 7.9. В нативных а-кератинах а-спи-
r-l
6.3. В ходе гидролиза белки распада ральные полипептидные цепи
ю тся на аминокислоты . . . . 141 скручены наподобие каната . . . 172
6.4. Н екоторые белки имею т в своем 7.10. а-К ератины нерастворимы в воде
составе не только аминокислоты, из-за преобладания в их составе
но и другие химические группы 142 аминокислот с неполярными R.-
e
6.5. Б е л к и - это очень крупные м оле группами ......................................... 173
кулы ................................................. 143 7.11. ß-Кератины имею т другую кон
6 .6 . Белки мож но выделить и под ф ормацию полипептидной цепи,
называемую ß-структурой . . . 174
sh
.ru
8.5. Аминокислотная последователь тельной мере история исследова
ность белка определяет его тре ния ф е р м е н т о в ............................... 227
тичную с т р у к т у р у ......................... 195 9.2. Ф ерменты обнаруж иваю т все
. .
8 6 Силы, стабилизирую щие третич свойства белков ............................... 228
ную структуру глобулярных бел 9.3. Ф ерменты классифицируются на
ков ........................................................ 197 основе реакций, которые они ка
ib
8.7. Свертывание полипептиды лх це тализирую т .................................... 229
пей происходит с очень высокой 9.4. Ф ерменты ускоряют химические
с к о р о с т ь ю ......................................... 199 реакции, снижая энергию актива
. .
8 8 О лигомерные белки имеют как ции ......................................................... 230
третичную, так и четвертичную 9.5. Концентрация субстрата оказы
r-l
с т р у к т у р у ......................................... 199 вает огромное влияние на ско
8.9. М етод рентгеноструктурного ана рость реакций, катализируемых
лиза позволил установить как тре ф е р м е н т а м и .................................... 231
тичную, так и четвертичную 9.6. Существует количественная связь
структуру гемоглобина . . . . 2 0 0 между концентрацией субстрата
e
8.10. П о своей третичной структуре и скоростью ферментативной
а- и ß-цепи гемоглобина очень р е а к ц и и ............................................... 233
сходны с миоглобином . . . . 2 0 2 9.7. Каждый фермент имеет характер
sh
.ru
нием М ихаэлиса-М ентен . . . 260 10.16. Витамин Е защ ищ ает клеточ
9.21. Субъединицы аллостерических ные мем браны от кислорода . . 291
ферментов сообщ аю тся между 10.17. Витамин К -к о м п о н е н т карбок-
собой .................................................... 261 силирующего фермента . . . . 293
9.22. Н екоторые ферменты регулиру 10.18. В пище животных должны со
ю тся путем обратной ковалент держ аться многочисленные не-
ib
ной м о д и ф и к а ц и и .......................... 263 органические вещества . . . . 294
9.23. М ногие ферменты существуют в 10.19. Д ля действия многих фермен-
нескольких ф о р м а х .......................... 265 тов требуется железо . . . . 295
9.24. Нарушение каталитической ак 10.20. В некоторых окислительных фер
тивности ферментов мож ет быть ментах содержится также медь 296
r-l
обусловлено мутациями . . . . 266 10.21. Д ля действия многих ферментов
К раткое содержание г л а в ы ..................... 267 необходим ц и н к ........................... 296
Вопросы и з а д а ч и .................................... 269 10.22. Н екоторы м ферментам требу
ю тся ионы м арганца . . . . 296
Глава 10. Витамины и микроэлементы: 10.23. В состав витамина В 1 2 входит
e
их роль в функционировании ферментов 273 к о б а л ь т ................................................ 296
10.24. Селен является и незаменимым
. 1 . ' В итам ин ы -незам ени м ы е орга
1 0
микроэлементом, и ядом . . . 296
sh
.ru
ных присутствуют гликопротеи новные компоненты мембран . . 342
н ы ......................................................... 319 12.11. М ембраны имею т жидкостно
11.13. Гликозаминогликаны и протео мозаичную структуру . . . . 345
гли каны -важ н ы е компоненты 12.12. М ембраны асимметричны, т.е.
соединительной ткани . . . . 320 имею т неравноценные стороны 346
К раткое содержание главы . . . . 322 12.13. М ембраны эритроцитов иссле
Вопросы и з а д а ч и .................................... 323 дованы очень подробно . . . 347
ib
12.14. Л ектины -специф ические белки,
Глава 12. Липиды и мембраны . . . 325 способные связываться с опре
деленными клетками и вызывать
12.1. Жирные кислоты -структурны е
компоненты больш инства липи их а г гл ю т и н а ц и ю ..........................348
r-l
дов .................................................... 325 12.15. М ембраны имею т очень слож
12.2. Т риац и лгли церолы -это глице- ные ф у н к ц и и .................................... 349
роловые эфиры жирных кислот 329 К раткое содержание г л а в ы ..................... 350
12.3. Т риац и лгли церолы -ф орм а за Вопросы и з а д а ч и .................................... 351
пасания л и п и д о в .......................... 331 Приложение. О т в е т ы ............................... 353
e
u sh
ak