Вы находитесь на странице: 1из 3

����� ������ � ��������� ���

������ ������ ������� ���������, ������ �� � ��������� �����[en]. ��������� ������


����� ���������� �� �������� ��������� ����������� ������ � �������������
���������� ��������, ���������� � �������[17]. ����������� ��������� ������
��������� ������ �������� � ��������� ����� ��������, ��� ��� �������� ���������
�������� � ����� ������� ��������� ���������� �������� ������ ���������, ��� ����
�� �������� ��������� ��������[18].

��������� ��� ��� ���������� �������� ���������� �� ��������� ����������� ������, �


��������� �� ���� ������������ ����������� ��������� �� ��������� ��������
������������[1].

����� ������� ���������� ��������� ����, ���������� � �������������� ��� ���������


������
��������� ����
����� �������� ��� ���������� �������� �� �� �������������� ��� (����) � ������
�������� ������������[6]. ����� ���� ���� ������������ ��� ������ ����������
���������������� ������ �������� ������������� ������ �������� ����� M-MuLV[19]. ��
��������� ������� ���������� ��������, ������ � ����� ������������������ �������,
������ ���������� ����������� ��������������[en] � ������������������, ����������
�������� ���������� ��� ������ ���. ������ ����� ��������� �� ���� � ����, �������
��������� �� 95 % ���������� ��������� ��� ������. ����� ����� �������, ��������
�������� � ����(dT)-��������, ��� �������� �������� ������������������ ������.
������ ��� ���� ������ �������������������� ��� (������� ����������� ��� � ������),
������� � ��� ����������, ��������, SUPeR-seq, � ������������������ ��������� �����
����(dT)-������� ��������� ��������� (5�6) ��������� �����������.

������ ������ ���� ���� ������������ ���������� ���������. ����� ����������� �����
����� �������[en] (����. template switching), ��������, � ���������� STRT, Smart-
seq � Smart-seq2. �� ������� �� �������� ��������� M-MuLV �������� �� 3�-�����
������������� ���� ����������� ������� ��������. ��������������, ��� ������
��������� ������ ������ ���� � ����(dG)-���������[19].

������� � ���������� ����������� ��������������


��������� ����������������������� ������������� ������������ ����������
�������������� ���������[en], ���������� �� ������ ������. ������� �� ���������
������������, ��������� �� ������ ���������� ������, ���������� ����������
��������� �������[7][10] . � ������������� �� ���������������� ���������� ������
�������� ���������� ��� ���������� ���������� ����������� �������������� (����.
unique molecular identifiers, UMIs). UMI ����������� ����� ������������������ ��
4�8 ��������� ����������� (��������, 5 ����������� ��� 45=1024 ����������
������������������). ��������� UMI � ���������� ������� ������������� ���������
���������� �� ������� �����������, ��� �������� ���������� ������ ���������� �����
�� ���������� UMI, ��������� � ������������ ������������ ����. ������� � ����������
����������� �������������� ������ � ������� �� ����� �������� ������������, ��� ���
��������� ����� �������� �� ������� ������ ���� ����[7].

����� ������������ � �������������� ������������ ���������� � ������������ �


����������������� ����������, � ������������������ ������� ����������� ���������
������� � ���������� ����������� �������������� (UMI)[7].
����������� ����
� �� ����������, ����� ��� MARS-seq, CEL-seq � CEL-seq2, �� ������������ ����
����������� in vitro ����������� (����. in vitro transcription, IVT)[6]. ��� ������
������� �� ������������ ���� ������� ����������� �7[en] � ���������� ����� ��������
������������. �� ������������ in vitro ������������ � ����(dT)-������� �������
�������� �7. ���������� ���������� ���� � ������ ������ ���������� �������[6].
����������� ���� ����� ����� ������������ � ������ ������������ ������ �������
(���), ��������, � Drop-seq, SCRB-seq, SMART-seq � SMART-seq2. ������ ���� �����
����� ������ �������� � ��������� ���������� ������������. � ����� ����������
�������� ������� ������������� ���������� ����������� ���������������[7].

�� ������ � ����������������� �������� ���������� ����� ����������� ������, �����


��� ����������� �� ���� �������� ������[18].

���������� �������� ���������� � ��������������


� ����������� �� ������� ���������� ���������� ���������� ��������������
�������������� ������������, ��� �������, ����������� 3�- ��� 5�-�����������[6][7].
���������� ��������������� ������������� (���������� SMART-seq, SMART-seq2)
�������� ��� �������� ��������������� ���������� � ���������������� �������������,
����� ��� �������������� 3�-���������� (���������� CEL- seq, CEL-seq2, MARS-seq) �
5�-���������� (��������� STRT) ������� �� ������� ���������������� ����������. ���
������, ��� �������, ��������� ���������� ����������� ��������������.
�������������� ���������� ����������� �������� ������������� ������ �������� (����.
next generation sequencing, NGS), ����� ����������� �������������� �� ���������
Illumina. ���������� ������ �������� ����������� �������� ��������������[20].

������ ������

��������� ����� ����������� ��� ��������� ������, �� ������� ��������� ������


��������������[20]
�. �������� �������� ����������� ������������
�. ������� ����������� ������������ �������� ������: ������ ��������� ����, ������
�������� ������ � �����, ������ �������� ������ ��� �������� ��� ���� �������������
��������
�. ������ ���������� � ����� ����: �������������� � ������������
�������������� ������� ��� ������������������ ������� ����������� ������������� ���
��������� ������ ������ ��������� ������� ���������� ����� �� ���������
�����������. ����� �������� ����� ������� ���� ����� ��������� �����������
�������[20]:

������ �� ��������� ������: ������������, ������������ � ����������� ���������


����������;
������ �� ������ �����: ����������� ��������������� ��������������� �����,
����������� �����.
��������� ������� ���������� �����
����������� �������� ��������� ���������, ���������� ��� ��������������, ������� �
��� ��������� ����� (� ������� ��������� ���������, ������������ �� ������ �����)
[21]:

�������� �������� ��������� (FastQC, Kraken);


������������ ��������� �� ����������� �����[en] (TopHat2[22], HISAT[23] � ������);
������ ���������� ������������ ����������� ����� �� ������ �� ������ (��������
�������������� ������� FPKM/TPM[en] ��� ����� ���������� �����������
���������������);
��� ������������� (��������, ���� ��� ������ ������ ���� �������� � ������ ������ �
������� ������) � �������� ��������������� ������ (kBET[24]);
� ������, ���� ������������ �������� ��� ���������� ����������� ���������������,
���������� ����������� ������� (SCnorm[25], SAMstrt[26]);
�������������� ����������� ������ (��������[en]) (MAGIC[27], Autoimpute[28]).

������������ � ������������� ������� ������ ����������. ������ � ��� �������������


����, ������� � ��� ������������� ������. ������ ������� ��������� �������
���������� ���� � ������

������������ ������������ ������ �� ������� ���������� �����


�������� �������� ���������
��� ������������ ������������� �������� �������� �������� ������������� ������
������, ������ � ������ ��������� �������� �������� �� ����������� �������[29]. ��
������� �������� ����� ������������� ������ �������:

���������� ��������� �� ������;


���������� ��������� �����;
��������� ���������� ���� ��������� � ���������� ��������� ���������������� ���
(������� ��������� ����� �������� ������ ������������������ ��� ��� ����������
�������� � ������);
���������� ���������� ���� ��������� � ���, ���������� � ������������������ �������
�������� RNA spike-in[en];
������������� UMI (���������� ����������� ���������������).
��������� ������ � ����������� UMI � ��������� ��������
��������������� ��������� �������� ����[30]:

��������� ������� �����������, UMI � ��������� ������� ������� �� �������� � �����


� ������ ����;
�������� ��������� �� UMI � ��������� ��������, ������� ���-���������: �������� �
���������� ��������� �������� � UMI;
�� ������ ������ ������� �������, ������������� ���������� ��������� (� �������
���������� �������� ���������� ��������� ���������� ������ + UMI�) �������
���������� ����.

�������� ����� ������� ������ scRNA-seq � �������������� UMI � ����������


�������������
������ �� ��������� ������
������������
� ���� ������� ��������� ����������� ������ ��������� ������������ ������ ��
�������� �� �������� ���������� �����[31]. ��� ������������ ����� ����������
������� ���������: ������� k-�������[32], � �������������� ����� ���������
�������[33], ������������� ��������������[34] � ���������� �������. ������� ��
������ ��������, ������������ ��������� �� ������: ��������� ������ ����� ���������
�� ����������� ����� ��� ���������������� ��������[35][36]; ����� ������ ����������
��-�� ������� �����������. �� ���������� ���� �������� ����������� ����������������
������������, ���������� �������� ������ ������, ���������[31].

������� ����������� ������� ����������� � �������������� ������ ������� ���������


(�����) � ��������� t-SNE (������) �� ���������� ������
���������� �����������
��� ���������� ���������� �������������� �������� �������������, ������ ���������
����������,

Вам также может понравиться

  • 1
    1
    Документ1 страница
    1
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 4
    4
    Документ1 страница
    4
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 2
    2
    Документ1 страница
    2
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 5
    5
    Документ2 страницы
    5
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 5
    5
    Документ2 страницы
    5
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 3
    3
    Документ2 страницы
    3
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 5
    5
    Документ2 страницы
    5
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 3
    3
    Документ2 страницы
    3
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 4
    4
    Документ1 страница
    4
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 2
    2
    Документ1 страница
    2
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 4
    4
    Документ2 страницы
    4
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • FEWIFWENI
    FEWIFWENI
    Документ1 страница
    FEWIFWENI
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 1
    1
    Документ1 страница
    1
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 2
    2
    Документ1 страница
    2
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • Новый текстовый документ
    Новый текстовый документ
    Документ1 страница
    Новый текстовый документ
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 1
    1
    Документ1 страница
    1
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • 3
    3
    Документ1 страница
    3
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • FEWIFWENI
    FEWIFWENI
    Документ2 страницы
    FEWIFWENI
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • AFGAE
    AFGAE
    Документ2 страницы
    AFGAE
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • ISTORIE
    ISTORIE
    Документ2 страницы
    ISTORIE
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • Ef
    Ef
    Документ1 страница
    Ef
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • AFGAE
    AFGAE
    Документ1 страница
    AFGAE
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • DSBEF
    DSBEF
    Документ1 страница
    DSBEF
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • Ef
    Ef
    Документ1 страница
    Ef
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • Новый текстовый документ
    Новый текстовый документ
    Документ1 страница
    Новый текстовый документ
    Cristi Saviuc
    Оценок пока нет
  • Tapak Offline Saps Asal
    Tapak Offline Saps Asal
    Документ49 страниц
    Tapak Offline Saps Asal
    Anonymous JhaDCw
    Оценок пока нет
  • (Taller de Lutheria) - Tiros para La Construccion de Instrumentos de Cuerda PDF
    (Taller de Lutheria) - Tiros para La Construccion de Instrumentos de Cuerda PDF
    Документ78 страниц
    (Taller de Lutheria) - Tiros para La Construccion de Instrumentos de Cuerda PDF
    FernandoMalosetti
    Оценок пока нет
  • Pin List
    Pin List
    Документ1 страница
    Pin List
    Esteban Daviid
    Оценок пока нет
  • Corazon Partio - Partitura Completa
    Corazon Partio - Partitura Completa
    Документ3 страницы
    Corazon Partio - Partitura Completa
    javi5cuerdas
    Оценок пока нет
  • Bach BWV 1002
    Bach BWV 1002
    Документ10 страниц
    Bach BWV 1002
    guillermo
    Оценок пока нет
  • Eg Avance 48.8 Ru
    Eg Avance 48.8 Ru
    Документ1 страница
    Eg Avance 48.8 Ru
    DenisSukharev
    Оценок пока нет
  • Универсальные Контроллеры Серии Ir
    Универсальные Контроллеры Серии Ir
    Документ65 страниц
    Универсальные Контроллеры Серии Ir
    elshan_asgarov
    Оценок пока нет
  • Overture To Candide For Clarinet Quartet - MSCZ PDF
    Overture To Candide For Clarinet Quartet - MSCZ PDF
    Документ18 страниц
    Overture To Candide For Clarinet Quartet - MSCZ PDF
    Francesco Abate
    Оценок пока нет
  • Articles-380051 Recurso 1 PDF
    Articles-380051 Recurso 1 PDF
    Документ126 страниц
    Articles-380051 Recurso 1 PDF
    Käthä Várgäs
    Оценок пока нет
  • Shop Manual d6d
    Shop Manual d6d
    Документ144 страницы
    Shop Manual d6d
    Roland s
    Оценок пока нет
  • Pin List
    Pin List
    Документ1 страница
    Pin List
    Jay Mannaga
    Оценок пока нет
  • Ayt Fizik MSB
    Ayt Fizik MSB
    Документ232 страницы
    Ayt Fizik MSB
    maksimuks
    Оценок пока нет
  • ППР - образец
    ППР - образец
    Документ2 страницы
    ППР - образец
    Tanja Apostolovska Gorgievska
    Оценок пока нет
  • MAZ - УБКА МПОВТ
    MAZ - УБКА МПОВТ
    Документ7 страниц
    MAZ - УБКА МПОВТ
    nikita
    Оценок пока нет
  • Canta Corazón
    Canta Corazón
    Документ2 страницы
    Canta Corazón
    lfpalacios
    Оценок пока нет
  • Catur
    Catur
    Документ10 страниц
    Catur
    Balya Bastomi
    Оценок пока нет
  • Список Книг По Шахматам
    Список Книг По Шахматам
    Документ8 страниц
    Список Книг По Шахматам
    Украинский студент
    Оценок пока нет
  • Akron1216912969 PDF
    Akron1216912969 PDF
    Документ208 страниц
    Akron1216912969 PDF
    Jhonatan Román Román
    Оценок пока нет
  • Греков Н, Ненароков В - Руководство к Изучению Шахматной Игры. Вып. 4 (1924)
    Греков Н, Ненароков В - Руководство к Изучению Шахматной Игры. Вып. 4 (1924)
    Документ11 страниц
    Греков Н, Ненароков В - Руководство к Изучению Шахматной Игры. Вып. 4 (1924)
    Nikolaos Konstantine
    Оценок пока нет
  • Amnesia José Lugo Orchestra - Mus PDF
    Amnesia José Lugo Orchestra - Mus PDF
    Документ4 страницы
    Amnesia José Lugo Orchestra - Mus PDF
    Moises Anglas
    Оценок пока нет
  • Alehin A Chess Lekzii Fragment
    Alehin A Chess Lekzii Fragment
    Документ15 страниц
    Alehin A Chess Lekzii Fragment
    dr_vuja
    Оценок пока нет
  • Table Financiere
    Table Financiere
    Документ1 страница
    Table Financiere
    Abder Him
    91% (11)
  • 1-Negdsen Tulkhuur2018
    1-Negdsen Tulkhuur2018
    Документ21 страница
    1-Negdsen Tulkhuur2018
    Энхманлай Манлай
    Оценок пока нет
  • Soal Notasi Sigma Kelas 11 Wajib
    Soal Notasi Sigma Kelas 11 Wajib
    Документ1 страница
    Soal Notasi Sigma Kelas 11 Wajib
    zahra safitri
    0% (1)
  • Secuencias de Figuras PDF
    Secuencias de Figuras PDF
    Документ5 страниц
    Secuencias de Figuras PDF
    EstherSalgado
    Оценок пока нет
  • Шахматы РБ - 2008-02
    Шахматы РБ - 2008-02
    Документ24 страницы
    Шахматы РБ - 2008-02
    SergeyGalkin
    Оценок пока нет
  • Чемпионы Логических Игр. Volume a. Chess, Xiangqi, Shogi, Go
    Чемпионы Логических Игр. Volume a. Chess, Xiangqi, Shogi, Go
    Документ10 страниц
    Чемпионы Логических Игр. Volume a. Chess, Xiangqi, Shogi, Go
    Leo Chagaum
    Оценок пока нет
  • Contoh File Xyz
    Contoh File Xyz
    Документ1 страница
    Contoh File Xyz
    pradika
    Оценок пока нет
  • Caro-Kann h4 PDF
    Caro-Kann h4 PDF
    Документ2 страницы
    Caro-Kann h4 PDF
    Stanciu Georgiana
    Оценок пока нет
  • Принципы, законы, правила
    Принципы, законы, правила
    Документ2 страницы
    Принципы, законы, правила
    markordel
    Оценок пока нет